3KN7A

Crystal structure of haemophilus influenzae y195a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNAYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 108
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A02
4RPNA 3E9XA 4TLLB 4ESXA 2GHAA 3QSLA 1N04A 3TFLA 4LZ5A 3GBAA 4PP0A 2F7CA 3CSBA 1NMUA 1B0LA 3MAMA 3Q26A 4LATA 3U92A 3GXAA 2H98A 1R9QA 3S2VA 4U4SA 1HSLA 5B70A 1FQCA 4QSEA 3OEKA 1LCTA 2DXRA 3IR1A 3VFJA 2IEEA 1P1QA 1AIVA 4NTLA 4F31B 3TCHA 4FIMA 4FATA 5AA1A 3W15C 3IK6B 1MXXA 4KHZE 4WEDA 4KYDA 4F29A 4IB2A 1Y3NA 3K1PA 1DMBA 1MY4A 4QHQA 3FJ7A 5H8NB 2H5YA 4QFNA 3KOSA 1MXUA 1FTOA 1DTGA 1OLAA 4X48A 3CVGA 2F36A 4QRZA 3TQLA 4U23A 3IB0A 5BWJA 1S9TA 4GOTA 3Q28A 2FNCA 3FJGA 1P1UA 4OERA 3RGYA 3T93B 1RKMA 1CB6A 1SDXA 4K3FA 3QIMA 2XXHA 4G68C 5TP9A 3IOTA 3FATA 4TLMB 1IEJA 1XS5A 1OVBA 2I0BA 2XX8A 2PT1A 5H8QB 1MRPA 4ONYA 3LSFB 4GRKA 1OVTA 2D5WA 3OD7A 1DPEA 1LAGE 5DVFA 3ODBA 3FASA 4FAJA 1TWYA 3IO6A 3LSWA 1LSTA 3UK4A 1IXIA 3FGSA 2VD2A 1GR2A 3TKDA 2REJA 3FIRA 3Q27A 2UVGA 2NUVA 4ZDMA 4RK9A 3MWBA 3IB2A 1B3HA 4QFOA 4OTEA 2V3UA 3Q29A 3DP6A 1Q1KA 1JEVA 3ZKLA 1N7WA 3K02A 4NF4B 3RT8A 3UN6A 3C32A 4FECA 1H44A 3BBRA 4KCDA 4EXKA 2DWJA 4ELRA 5AA2D 1MY3A 3IJOB 3H6UA 3PMVA 4IGTA 3MP6A 5H8SA 1B5HA 3LR1A 1I6AA 4KCCA 3RY3A 4POWA 4IO2A 4YMAA 4KD5A 3HCQA 4RYAA 3I5OA 5K2XA 1IXGA 2XX7A 2IA4A 4OHNA 3SEWA 2F8DA 2XXVA 3VDFA 4YKPA 3SDFA 3H6WA 3K00A 1US5A 4Z0IA 5TU0A 3MP1A 2XXQA 4GVOA 4DLDA 3K2DA 2NVUB 3GBBA 2Y7RA 4R6KA 3VXCA 1MG1A 1MS7A 3C31A 4JSOA 4YB7A 3FXUA 3H6VA 3TYHA 1IUDA 5L9SA 4M4GA 4MLQA 2H4IA 2OWSA 3WAFA 4EQ9A 1H43A 2RF1A 3KFMA 1M5FA 3U8QA 3MVWA 1Y4CA 4QFPA 1AMFA 2XXWA 2ONKE 3ECRA 4QSCA 3PMWA 4F3GA 1XT8A 3IOVA 3IO4A 3VLWA 5HPQA 1ELJA 3FVGA 1B3LA 4JSDA 2VGQA 2F7AA 3R6UA 4M1VA 3RTFB 3TTNA 1MPDA 2RINA 4C1TA 2FA7A 3G3JA 4N13A 1XVYA 4OEUA 3U93A 2DSFA 1RYXA 3RLFE 1QKAA 1NNKA 1MY1A 4F1VA 1M5EA 3UA8A 1MY2A 2I58A 2X26A 4PFYA 2V3QA 3S9NC 4KPTA 3H6TA 3O6GA 4NWDA 4O3CA 3T96B 5DVIA 1B2HA 3P7IA 1M5DA 2QL3A 3DP4A 2PVUA 5KCJA 2ZXTA 4P11A 3N6TA 1XVXA 4R9GA 4LVQA 1PBQA 2GH9A 5ITOA 4ZEIA 3HHFA 3SEYA 2ZYMA 4NF5B 1BP5A 5I84A 5EHMA 1B5IA 2AIXA 4BDQA 2I3VA 1B1HA 3RT6B 3G3GA 2QS1A 5I57A 4DZ1A 3D4GA 2B3BA 4H5FA 4OMBA 2ESNA 3CRBA 4OENA 1Y1MA 3TPAA 3BFTA 4EF1A 4ZEFA 4PE5B 5HM4B 3G7WA 2VD3A 3M3LA 3UGWA 3KJTA 3JV9A 3VVEA 4KYEA 1P1NA 5H8HB 4ZZAA 3VXBA 3C35A 2DYXA 2UVHA 4ELOA 5DYHA 1N76A 2RC7A 3L6HA 3O2AA 4H67A 1NL5A 2Z22A 1UTBA 1Z7NE 5I2KA 1VSOA 1A8FA 1N3XA 1A8EA 4N07A 3T9VA 3MZBA 4XTCQ 2I4BA 3KN8A 4KI0E 3I3VA 3VLUA 4G68A 2QSXA 4H5GA 5CMCA 5I2NA 1D4NA 4GLIA 3C4MA 4I62A 2XD3A 2YLNA 2O51A 2O7IA 1XHYA 1FTLA 4WKMA 4GWOA 2ZNUA 2ZYOA 2GRVA 1B7HA 1B3GA 1EH3A 4JXIA 3T22A 2OK2A 4G8MA 3CFXA 1VE4A 4RA1A 4OFOA 4RXLA 3TTRA 1UTBB 1Y3QA 3FJMA 2F34A 2YPNA 2ONRA 4MH5A 1F9BA 1MQHA 3B7DA 1MDQA 2F97A 1VFDA 3UIFA 4QF9A 5I59B 3FV2A 4NEDA 3TCFA 3PGFA 5ELVA 3THIA 4R2BA 4HCYA 2M8CA 4LONB 4PQJA 1A40A 2NXOA 3OOAA 3TDJA 1BLFA 4GFRA 4U1ZA 4ZE9A 2Z23A 1B6HA 5ICTA 3PPQA 5L9MA 1URSA 2DE3A 5I56B 3KEIA 4KFQA 2QS3A 4C0RA 4NF6B 2HXWA 2A5TA 5CBSA 1D9VA 1LAFE 1N3WA 3PUXE 3QUFA 1BIYA 5AA2B 4JB7A 1JVYA 3O6IA 1A7LA 1SYIA 3USDA 1QW0A 4EXLA 2G93A 2E1SA 3C9HA 3TQWA 4BDLA 3K0VA 3LUYA 3TTMA 5ISUA 3MW0A 4U1OA 1PEBA 1GV8A 2RKMA 3K1MA 4IO6A 2Y7PA 3HSTA 1OQHA 3B6WA 3SKPA 1MQIA 4LA9A 3EHUA 3CIJA 4U21A 5CI5A 4YB6A 1MQJA 5CBRA 1KWHA 4R6HA 1LBBA 1MH4A 4MBPA 1WODA 2A5TB 1I69A 4ZEKA 3LBSA 2X7PA 1JEUA 1B32A 5KDTA 1JQFA 2YJPA 5JK4A 1B5JA 3PUVE 4G8NA 1WDNA 1JW1A 5DEXA 2F35A 1P1WA 3BFUA 4U4XA 1SW1A 2D3IA 4FORA 3FV1A 3N6UA 3TZAA 1II5A 4GL8A 5EHSA 1M5BA 4NF8A 3QYTA 1QULA 4GD5A 2UXAA 1QUJA 1M5CA 2RCAA 4F1UA 1R1NA 4GXSB 1BTJA 4G2ZA 3PUWE 3QK6A 3C33A 3KSXA 3S9LC 1B0HA 1SI1A 4PFUA 4RNSA 2O1MA 4YAHX 3OO9A 3D4CA 3MP8A 4AB6A 1EZPA 4XKRA 4H65A 1MM6A 3E4RA 5I58A 4NF8B 5TP9B 1B4ZA 3EHSA 3QXMA 3BKIB 4F3PA 4OZ9A 1LCFA 1I6QA 3CR9A 3IORA 4I9DA 5DVJA 5HBCA 1IXCA 4F18A 2UVIA 1B3FA 3HO7A 4MF3A 2R9JA 2Q2CA 4JWXA 4LZ8A 1USYH 3ILUB 1EZOA 5CC2A 3QUJA 4YMBA 1SI0A 1JNFA 2Y7KA 5LOMA 2DE2A 4C1UA 3B6QA 1XC1A 4RY1A 2PMSA 2UVJA 5CRYA 2DP8A 2O84X 3IJXB 3RNNA 3MPLA 2OWTA 1D3KA 4ISUA 5IKBA 3TAJA 4R72A 3PPNA 1MY0A 4P0GA 1FCKA 3PPPA 3HV1A 4R9FA 1YCJA 2F6GA 3VV5A 1Y20A 5DT6A 2P0SA 4I8CA 3C36A 1QKBA 1GTKA 1PBPA 4I1DA 3W9VA 3O28A 3PUYE 4TQUQ 1DOTA 4IO3A 4TOZA 5F7VA 3PD8A 3L6GA 3E3KA 1FTMA 4PETA 4F2OA 3V83A 2CZLA 4QFLA 2ZNTA 5JTYA 2F7BA 2V25A 1IZ1A 2I0CA 1ATGA 4THIA 3M8UA 3GLBA 1NNTA 1WVJA 3VVDA 1LFHA 3HHGA 1MXWA 4LQ2A 4LP2B 4EQBA 3K6XA 2QMWA 3F11A 3V8XB 1LFGA 2F5XA 5AA4A 2QS2A 4DIGA 1Q35A 1Z7ME 1P1OA 1I6BA 3HPIA 1LLSA 4GIZA 5TPAA 1LAXA 1URDA 3U72A 1QVSA 3CFLA 1LB9A 2O68A 1IITA 4HW8A 3CG3A 2V93A 3MC2A 1FQAA 2GHBA 1B40A 3A3UA 3PPOA 4X9TA 2DWAA 3SEXA 5ITPA 3OEMA 1H45A 5B7DA 4Q30B 4OESA 4RJZA 2D21A 4H8JA 2RCBA 3CSGA 1QUKA 2NWJA 1YAEA 4F3SA 2R6GE 1POTA 4H6DA 3RQTA 3CG1A 5A5XA 3RN8A 3AXFA 4LQ5A 1Y4TA 3TODA 3EHTA 4MFIA 4X1BA 4OQOA 4JDFA 2ZYKA 1MPCA 1MH3A 1TFAA 1OIBA 4GF8A 5KCJB 1IIWA 5K2YA 5ICQA 2RC9A 1SVXB 1PB8A 2I6EA 4RPOA 2H99A 4UA8A 1NH8A 2VHAA 3LSXA 2I3WA 2REGA 2H9BA 3OELA 5A5XB 1OQGA 5I57B 2XXXA 2I4CA 3KOTA 3Q25A 1FTKA 2OLBA 1UIVA 1US4A 1TFDA 3M3KA 4GXAA 5FTIA 2I48A 1NFTA 2F6PA 4ZE8A 4EDPA 1B05A 4ELQA 2AL5A 3ILTB 3FZVA 4P0IA 2DWIA 4AB5A 1MDP1 5H8FA 3OENA 3IL1B 4R74A 1YPNA 2CMOA 1D9YA 3PUZE 4BDOA 1CE2A 3SETA 3K4UA 4ESWA 4PFTA 3T9UA 4UACA 2XXUA 1GVCA 4XKNA 1TXFA 1MM7A 1PB9A 5I2KB 2O6AA 2DE4A 2DVCA 4WEPA 3OSQA 3H7MA 3FVOA 1B7UA 4U22A 5CMBA 3G3FA 3MVYA 3ONMA 4G68B 4YKIA 4JWOA 1QUIA 4GL0A 1PDAA 1POY1 2G29A 4YU0A 3T9XB 5I2NB 4NMYA 1LGBC 5H8FB 1MXVA 3FVNA 1A55A 2ABHA 3GZGA 4HS7A 4F3BA 1MXZA 5AE4A 1PC3A 3KG2A 4EF2A 3R7XA 2PX1A 2PYYA 2ZMBA 2ONSA 2Q9TA 1H3DA 1L5TA 1GGGA 3HN0A 5J1DA 2UYEA 4E0WA 4WXJA 1FTJA 5H8NA 4F1YA 3V5AA 2HEUA 1ANFA 1OLCA 4OXVA 4JBZA 1R6ZA 2WKYA 3DP8A 3UP9A 2DXYA 3FXQA 3ZSFA 3U94A 4BDRA 1AH5A 3U1OA 3K01A 2HZLA 3ZS6A 1O64A 4F2QA 3TELA 5DTBA 4F22A 2GFEA 1N7XA 5FHMA 4QSDA 1MQDA 3MBPA 1O63A 4DCYA 1VR5A 3O9PA 1B46A 3QAXA 5H8QA 1LAHE 3EPEA 3CFZA 2AYSA 4YB5A 3T9HB 1NNPA 3O29A 2Y7IA 4YKJA 2HAVA 2FYIA 2Y7WA 4FE8A 3C34A 5F1QA 4XXUA 2XD2A 1UQWA 3MZ1A 2HZKA 4GQOA 5CMKA 1N0TA 3S9EA 2Y84A 2Z8DA 5L8DA 1SW4A 4N6PA 1ZTYA 1AOVA 2XXIA 3JYRA 5KDTB 4ZEDA 3W9WA 4ECFA 1JW5A 3VLVA 1IXHA 4IO4A 4OYVA 5DEXB 1SW2A 4LZ7A 5FTHA 1O7TA 4NF4A 5FHOA 5L9OA 4BLAA 1ZKBA 2DVZA 1LB8A 1UTHA 3G3KA 1B58A 2OJTA 3G3IA 1MQGA 3EN3A 3IX1A 2A5SA 3H4ZA 4L17A 2ANJA 1SYHA 4O3AA 4MLVA 3R26A 4ZECA 1VFEA 4NWCA 3MPKA 4O3BA 3RTWB 3FVKA 2PT2A 3K6UA 3H03A 4ND9A 5IAIA 3V89B 2V3TA 1TT1A 2HCAA 4ZEBA 3SEVA 3S9MC 2OBGA 1QJMA 1UTHB 5EYFA 5I58B 4FEBA 4H0WA 2V84A 1JW4A 3KJ7A 3O97A 1H76A 4QFKA 3EQ1A 2RC8A 5AA3A 1S7YA 2ZNSA 4IY6A 4IGRA 3DM0A 5JEIA 1HSJA 1N84A 3TUSA 3O66A 5BUUA 1BKAA 2QPQA 1Y9UA 4ELPA 3JZJA 2HQ0A 3SEUA 3RPWA 3S4UA 2XXRA 3KN3A 1USYE 1HSEA 5M2VA 4OFLA 3FUZA 3K6VA 2ALUA 3OSRA 3SERA 2PBWA 3N5LA 3K6WA 4R73A 3FD3A 2B65A 1JETA 2DS9A 1Y3PA 2XX9A 4XIGQ 3A09A 2OCUA 4YKKA 2DWHA 4IO7A 3RUMA 4G4PA 1RYOA 1S50A 3VVFA 4KQPA 3OO7A 2LAOA 5CMMA 4F39A 3DELB 3PD9A 2KLFA 1ZLQA 4DXCA 3OMBA 4NF5A 4Q5TA 4YZZA 3CI8A 2QRYA 2O7UA 1B7ZA 3OO8A 2Q89A 5JTYB 4PFWA 1P99A 2O1LA 3N26A 2THIA 4XKPA 4BDNA 5KZTA 4POXA 2HAUA 1LBCA 2HFBA 3KN7A 1UIUA 3H3GA 2Q2AA 4HCWA 2QJEA 2P1SA 3TCGA 1SD3A 4OETA 1YTVA 1FW0A 4DXUA 1B52A 2P2AA 3TTKA 4KR5A 4H8IA 2Q8JA 4YICA 4G8HA 5H8HA 3IAZA 5AA4B 2Q88A 3O6HA 1DTZA 1ZBMA 3OXNA 4HTGA 4DDDA 4R75A 5TPAB 1B51A 2ZYNA 3IOUA 2Z8FA 2R71A 1XOCA 4KYSA 1J1NA 4NE4A 3KZGA 2VP1A 1IQ7A 3IB1A 1Y1ZA 3I6VA 2QS4A 1B4HA 4XKQA 4AQ4A 4FJPA 3B6TA 3SESA 3UORA 4OVJA 4BDMA 3EF7A 2I49A 4H1XA 2Z8EA 4X1DA 4IO5A 3M3FA 1EU8A 1DPPA 2AL4A 4ZS9A 2OZZA 2XXPA 3TTLA 1A54A 1ZMGA 3PMXA 1LFIA 3KSJA 3E13X 2W7YA 1OMPA 3N94A 3PV0E 4Z7EA 1ZIUA 2F78A 4FEDA 4Q0CA 4G77A 2NOOA 3MJNA 4EUOA 1T0KA 3MZ9A 1R9LA 1FQBA 4IY5A 3A3CA 4EQ7A 1NKXA 2H25A 1SW5A 2XXYA 3MQ9A 3PPRA 5I59A 1A99A 1FQFA 4RK2A 3T66A 1PB7A 1ZJLA 1FQDA 3TEPA 3H06B 3VE1B 3MVXA 1SBPA 4E0XA 2B3FA 3ZKKA 1NNFA 1AL3A 5I56A 2QMXA 4R2FA 4OWDA 3LC8A 2UYFA 4LUBA 2BJJX 3FXRA 3IOWA 3K1NA 2DQVA 5CM6A 3PU5A 2DOJA 4NF6A 1FQEA 1B9JA 2E0SA 1MPBA 1ZU0A 3MUQA 5AA2A 4OFJA 4JWYA 4Q8RA 2X7QA 4R6YA 4DE8A 5FHNA 4U2RA 4DXBA 2O69A 3TMGA 1URGA 1NH7A 3G3HA 1MXYA 4OEVA 3DLNA 3MVZA 3LSLA 2XXTA 4ZZEA 1DSNA 1EZ9A 2XHDA 1B3EA 2VOZA 3WAEA 3KGCA 4DCXA 1B1XA 4F19A 3OO6A 1SQYA 1JVXA 3KBRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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