3KN7A

Crystal structure of haemophilus influenzae y195a mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKNSVALQAVENGEVPAALINNAYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of vicinal tyrosine residues in the function of Haemophilus influenzae ferric binding protein A.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
total genus 108
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn7A02
3TEPA 2QMXA 4YKJA 3N5LA 3RGYA 1B40A 2XD2A 1JQFA 1URGA 4GL8A 2H25A 4KD5A 4R74A 1IIWA 2DE2A 3K1MA 5DVIA 4X48A 1SI0A 3O29A 4IGRA 4NWDA 2UYFA 4G68C 1MM6A 4NEDA 3LR1A 4H0WA 5DVFA 4M1VA 4XTCQ 2FNCA 5ICTA 5TU0A 4GRKA 4ONYA 3GXAA 4BDQA 1OIBA 3C31A 1D9VA 1A55A 3H7MA 4FJPA 3RNNA 4R9GA 5EHMA 5HM4B 4ZEKA 1AIVA 4MF3A 1XC1A 3ONMA 5KDTA 1B7HA 1M5FA 3KFMA 5FHNA 2XXIA 3VLUA 1QULA 1H76A 3DP8A 4Z7EA 4G68B 1B58A 2DWHA 3DP4A 4H8JA 3KBRA 2UVGA 1LBCA 3H06B 3SEWA 4F3BA 2ZYKA 1Y3QA 1NNFA 1NKXA 2XXQA 1USYH 2DQVA 1LCFA 2I4BA 1Y9UA 2HEUA 1GVCA 3N6TA 1MQHA 1US4A 3UP9A 2ZYMA 4THIA 2OZZA 1D3KA 1DOTA 3S2VA 3RT8A 1DSNA 1TFDA 3TMGA 3UN6A 3PUVE 3RLFE 3CSGA 4YZZA 3S9EA 1XHYA 4AB5A 1FTKA 1BTJA 4GIZA 4R9FA 2XX8A 1LAFE 1XVYA 4KQPA 5ISUA 2X7PA 3R7XA 3C9HA 1PB7A 2YJPA 4RXLA 4POWA 1IQ7A 2OWTA 2HQ0A 2REJA 3PPPA 3MPKA 1Q1KA 2I4CA 5ITOA 3FVGA 3LSFB 3MBPA 3KN8A 4H5GA 1OQGA 3S9NC 5JTYB 1B6HA 1M5CA 1Y1MA 3IOTA 1BLFA 3RY3A 4ZEDA 1II5A 3P7IA 2AL5A 2Z22A 2IA4A 3TCGA 4NF4B 3MJNA 3V5AA 4FECA 2LAOA 1SVXB 4YKPA 4PETA 2HZKA 4RPNA 2DVCA 2QS3A 4YB5A 3O9PA 3MZ9A 5M2VA 2FYIA 1ZKBA 5KCJB 4WEPA 2ZNUA 4R73A 3T66A 4YAHX 5H8HB 1MH3A 4GLIA 3PGFA 2Z8DA 1MXYA 4F39A 1LB9A 5H8QB 2XXPA 1B3LA 4KCCA 1I6AA 5B7DA 4F3SA 2XXUA 3R26A 3PPOA 3G3KA 4QFLA 2QMWA 4GVOA 3EHSA 2V3TA 4F1YA 3ZKKA 1LLSA 1KWHA 1Y4TA 4IO3A 5CBSA 3CR9A 4MLQA 4BLAA 3VDFA 3I6VA 4C0RA 3U1OA 1B4HA 5CM6A 2Z8FA 2B3FA 4NF4A 3PUZE 2IEEA 2RC9A 1B7UA 2CMOA 2Y7PA 3V8XB 4HW8A 1TT1A 3FV2A 1XOCA 3R6UA 2Q8JA 5AA4A 1SBPA 2E0SA 3M3FA 5I57B 3K02A 5AA2B 3K1NA 1VR5A 3TTRA 4R6YA 5AE4A 2REGA 3THIA 3FD3A 5HPQA 2RCAA 5DTBA 4PFWA 3RTWB 1NNPA 4U23A 3M8UA 5H8QA 1Q35A 2Y7WA 4ZECA 2XXVA 2PYYA 1Y3PA 2RC8A 1A7LA 3SEXA 2M8CA 3MWBA 1QKBA 3CRBA 1B51A 4I62A 2X7QA 1Z7ME 1GR2A 2XHDA 3VVDA 4EF1A 2WKYA 4BDOA 3K1PA 3DP6A 3OELA 2DSFA 4IB2A 1A8FA 4H5FA 3V83A 3MUQA 3EPEA 1FW0A 4I8CA 4FEBA 3TELA 4BDLA 2ONSA 1B1XA 3UGWA 4OFLA 3PD8A 4G4PA 4R2FA 1PB8A 4ECFA 2H9BA 1B0HA 1XVXA 2QS1A 3EF7A 1B52A 1MY1A 2THIA 1O7TA 1A54A 1ZJLA 3KJ7A 4G8HA 4QSDA 1QW0A 5FHOA 4G8NA 4YKKA 4OTEA 3CIJA 5I57A 1NL5A 5AA2A 2G93A 3LSWA 5I84A 4EQBA 3T22A 4OENA 2A5TB 3FUZA 3CFLA 3T9HB 3IL1B 4YMBA 5CC2A 3QXMA 4F3PA 1B7ZA 2D5WA 1F9BA 3AXFA 3D4CA 4ZEBA 1LAXA 3IB0A 4EQ7A 1B2HA 1ZTYA 2VD3A 4DXBA 2NXOA 2QS2A 3OD7A 4H8IA 1H44A 5I56B 2P0SA 4N6PA 1NH7A 1HSLA 4PE5B 5DT6A 4AQ4A 1B5JA 4Q5TA 4LATA 1JEVA 3O6HA 1L5TA 1SW1A 5DVJA 3LBSA 3L6GA 1IXIA 2GH9A 3QSLA 3TAJA 4ELOA 4G77A 3B6TA 3U72A 3IO6A 3QK6A 4E0WA 2O7UA 3BFUA 4JWYA 2NWJA 4F2OA 3EQ1A 4HTGA 3KSJA 5ELVA 3FASA 3OSRA 5KDTB 1B5HA 2O51A 2DE4A 3TODA 3PMVA 4E0XA 1N84A 2AL4A 1P1OA 2BJJX 5L8DA 2DVZA 1IITA 2W7YA 2Z8EA 2F5XA 1MY0A 1ZIUA 1LAHE 3Q25A 4DE8A 2A5TA 4F1VA 4RNSA 2HFBA 1IZ1A 2PT2A 1LAGE 2I49A 2H98A 1FQEA 1N76A 3IK6B 4NF5B 1WDNA 2I3VA 2H99A 1LFHA 1R1NA 3M3KA 3IOUA 3MQ9A 5I56A 1TWYA 1MDQA 5BWJA 3LSLA 4ISUA 4HCYA 3PPRA 3M3LA 1PBPA 3E4RA 1QUJA 1SW4A 3CG3A 1SYIA 4EF2A 1Y1ZA 1B05A 4AB6A 1M5BA 4ESWA 2ZMBA 4EXKA 3UA8A 1N04A 2HAVA 2VOZA 4LA9A 2NOOA 3SEUA 4JSOA 1UIVA 5CI5A 1TXFA 4JXIA 3FVNA 1JVXA 1D9YA 1MRPA 4JDFA 3K6VA 4MLVA 1TFAA 3QYTA 1Y4CA 5AA1A 3VLWA 2PBWA 3MP1A 4O3BA 2V3QA 3KOSA 2OJTA 1FCKA 1UTHB 3OO7A 2VGQA 4IGTA 3MW0A 4NF5A 2ESNA 3K6XA 5HBCA 3RUMA 3HHGA 4ZZEA 3C4MA 3KJTA 2GHAA 4QFNA 4O3AA 1MM7A 5KZTA 3JV9A 3D4GA 3PUXE 4EUOA 3UIFA 4HS7A 3FXRA 1LGBC 1SW2A 4JBZA 2DOJA 3PMWA 5IAIA 1Y20A 5CMKA 1JW4A 2O69A 4WKMA 5I2NA 2PT1A 4Q0CA 1PBQA 3VVEA 3ECRA 4DZ1A 1MDP1 2F6GA 1N7WA 2O84X 2AIXA 2X26A 4IY5A 2PMSA 2D3IA 4H67A 2V84A 4U4SA 3C36A 1H43A 4OHNA 3PV0E 5I2KA 5I58B 3TCHA 2KLFA 4U2RA 3GBBA 1AH5A 3FZVA 1LBBA 3VVFA 3JZJA 5TPAA 2Z23A 1UTHA 4NF8A 4MFIA 2NUVA 1A40A 2GFEA 2P1SA 4RA1A 1B3FA 4GXAA 1RKMA 2F36A 4NWCA 1MXZA 4F3GA 2XXRA 1HSEA 2UVJA 1PC3A 2ZYNA 3ZKLA 2UYEA 5BUUA 4H65A 3PUYE 3N94A 4C1UA 2ZNSA 2Y7IA 1MPCA 3WAEA 3H6UA 3W15C 1EZ9A 3HSTA 1QVSA 3OSQA 1B46A 4PQJA 3K4UA 2O1LA 5AA2D 3N26A 4OZ9A 1N3WA 3PUWE 2Q9TA 5AA4B 3PD9A 4BDNA 3K6UA 3QUJA 4TOZA 5JK4A 3H6WA 3RT6B 4OWDA 4KI0E 3U93A 4NF6B 4FATA 1OVTA 3FATA 3GLBA 3BKIB 3DLNA 5I58A 4NMYA 3TYHA 3B7DA 2DXRA 4PP0A 4DDDA 4QFKA 3SESA 2P2AA 4M4GA 1YCJA 4QRZA 3FIRA 1EZPA 4FIMA 1FTOA 4P0IA 3OXNA 2Y7KA 1IXGA 2R71A 3EHTA 3IORA 1JETA 3TPAA 2R9JA 2ALUA 2F8DA 4GWOA 1P1WA 4KCDA 1UTBB 2HAUA 4OFJA 3UK4A 3IOWA 5I59B 1B3GA 4KYEA 4ELPA 4POXA 2F7CA 3B6WA 3MVYA 4C1TA 2YPNA 2GHBA 4U21A 1MPDA 4JWOA 1ZBMA 4ESXA 5FTHA 2I3WA 4LZ5A 4NF6A 3QAXA 5ITPA 5DEXB 4IO4A 3CVGA 1FTLA 2UXAA 4DLDA 3I5OA 4LUBA 4H6DA 1B3HA 2QJEA 3OMBA 3K0VA 3IB1A 1NNKA 1B32A 4U4XA 4DCYA 3H4ZA 3KN7A 1URDA 2DXYA 1YPNA 1ZU0A 3W9VA 1S9TA 4JB7A 2PX1A 1H45A 3CFXA 1VSOA 4U22A 2Y84A 2V3UA 5IKBA 1LSTA 5LOMA 2RC7A 2QRYA 5H8FB 1SW5A 4GXSB 3Q27A 3K01A 1D4NA 3H3GA 3E13X 2OCUA 1UTBA 5I59A 3MP8A 1OVBA 3RQTA 4LQ2A 4RJZA 1PDAA 4G2ZA 4O3CA 3RTFB 2PVUA 2F6PA 2Y7RA 5B70A 2VD2A 1POY1 1QKAA 3GBAA 4GFRA 1IEJA 3KOTA 2ABHA 4U1OA 4GQOA 3GZGA 1LCTA 3HCQA 3T9VA 2XXHA 1P1NA 3C33A 5DEXA 2F97A 3ZSFA 3VE1B 2I58A 1B0LA 1BIYA 4NTLA 2XD3A 3MZ1A 1I6QA 1B3EA 4G8MA 3G3FA 4N13A 2OBGA 1DMBA 3S9MC 1I6BA 4HCWA 1PEBA 3TTLA 3EN3A 4IO2A 1ANFA 1MXXA 3FJ7A 2QSXA 3CG1A 3K00A 1MY3A 1CE2A 4F1UA 4H1XA 5ICQA 5H8FA 1JNFA 3CSBA 3FJGA 2CZLA 2F35A 4LQ5A 3ZS6A 3SDFA 1LB8A 2F7AA 4MBPA 2VHAA 2XXTA 4ELRA 5F1QA 1AMFA 1IXCA 3B6QA 5CRYA 3HO7A 3FJMA 2I0BA 1UQWA 5DYHA 4LONB 4P0GA 1A99A 1P99A 3ILTB 5A5XB 4K3FA 3IX1A 4IO7A 1OLAA 4R75A 3WAFA 4NE4A 4ZEIA 2HCAA 4EXLA 1ZMGA 3SEVA 3T93B 1FQAA 1H3DA 4JWXA 1GV8A 4ND9A 3TTKA 3KG2A 5AA3A 2F34A 5F7VA 1POTA 4XIGQ 4YU0A 2ONKE 4BDMA 4ELQA 5I2NB 2F78A 2UVIA 1MY2A 1QUKA 4F22A 1NH8A 5K2YA 1B4ZA 1M5EA 3LUYA 2QPQA 3CI8A 4DIGA 2XX9A 1FQDA 3T9XB 1GTKA 4YB7A 4R2BA 2RINA 1SYHA 2OLBA 4R72A 2ONRA 2G29A 1AOVA 4LZ8A 4KFQA 5FHMA 4JSDA 1MY4A 5I2KB 4TLLB 3MP6A 3MC2A 1Z7NE 4IO5A 4R6KA 4QF9A 1EH3A 4KYDA 3KN3A 5TPAB 4NF8B 5K2XA 3TZAA 2Q2CA 1OQHA 3SEYA 3QUFA 1RYOA 2O6AA 1MXWA 1N3XA 1O63A 5A5XA 2HZLA 1MQDA 1R9LA 1B1HA 5H8NB 1VFDA 3H6VA 4DCXA 3G3JA 4UA8A 1R9QA 3TCFA 3MVZA 3CFZA 4RYAA 3RPWA 3G7WA 2RCBA 4EDPA 3TQLA 5L9OA 1BP5A 2I6EA 1QJMA 3PU5A 1HSJA 3USDA 3F11A 1MPBA 3VLVA 3MVWA 3C35A 4OVJA 1S7YA 4U1ZA 4XKQA 1JEUA 3FXQA 1USYE 3O6GA 3JYRA 1OLCA 4MH5A 1ELJA 1LFIA 2FA7A 4I1DA 4GF8A 3K6WA 3SKPA 3OEKA 2DYXA 2H5YA 2DE3A 3VFJA 4UACA 1O64A 5CMBA 2A5SA 3G3GA 1JW5A 3HPIA 1B5IA 4FE8A 4RY1A 4LP2B 4QHQA 4TLMB 3BFTA 1EZOA 1BKAA 1PB9A 3TKDA 3IR1A 1NNTA 2B65A 1MQJA 4Q8RA 3HV1A 4G68A 5CBRA 1LFGA 1EU8A 4F31B 5J1DA 3O66A 1P1QA 1IUDA 5H8NA 5TP9B 2GRVA 2DP8A 4DXCA 3U92A 1FTJA 4GOTA 2ZNTA 1FTMA 3TTMA 2ANJA 5L9SA 1Y3NA 2XXYA 1FQCA 3IAZA 2E1SA 4YKIA 1GGGA 3HN0A 3KSXA 3A3UA 1CB6A 1YTVA 4YMAA 1I69A 4FORA 1T0KA 1SD3A 1XS5A 1DTGA 2OWSA 2OK2A 5H8SA 4PFUA 3FVOA 4OETA 2F7BA 2AYSA 3DELB 3IOVA 2DWAA 2NVUB 1DTZA 5CMMA 2DS9A 2V93A 3KEIA 3PPNA 3S4UA 2UVHA 4F29A 3N6UA 4YB6A 3FXUA 4OESA 2R6GE 3A3CA 3SETA 4FEDA 4KPTA 2Q89A 2I0CA 2B3BA 3FGSA 5TP9A 1QUIA 4OERA 5L9MA 1DPEA 1FQBA 2D21A 3MPLA 2RF1A 3E9XA 4ZS9A 3ILUB 3A09A 4X1BA 5JTYA 3FVKA 3T96B 3G3HA 4WXJA 3UORA 3DM0A 3LSXA 4GL0A 1VFEA 1MXVA 5CMCA 1MH4A 2XXWA 2VP1A 3LC8A 3EHUA 3OEMA 2RKMA 2DWJA 1J1NA 3RN8A 1ATGA 3W9WA 3Q26A 3TTNA 5EHSA 1XT8A 4OMBA 1WVJA 1IXHA 1MQGA 5KCJA 2ZYOA 3TQWA 3Q28A 4XXUA 3H6TA 3IJOB 1AL3A 2ZXTA 5H8HA 3OENA 3OO6A 3K2DA 1MQIA 4OQOA 1NFTA 4OEUA 2O1MA 3O28A 1SDXA 3S9LC 1S50A 4XKPA 1N0TA 1M5DA 4F18A 1JVYA 4XKRA 3BBRA 3T9UA 3KGCA 4YICA 4LVQA 4R6HA 4QFOA 3OO8A 2YLNA 3MAMA 4WEDA 3H03A 1N7XA 4ZEFA 3L6HA 3TDJA 3VV5A 1FQFA 1R6ZA 3KZGA 1DPPA 3OOAA 1UIUA 4QFPA 3O6IA 4ZDMA 1WODA 3I3VA 4ZE8A 3TUSA 1NMUA 4XKNA 3SERA 1A8EA 4ZZAA 3FV1A 4Q30B 3IB2A 1P1UA 3U8QA 4LZ7A 5JEIA 2XX7A 1B9JA 5FTIA 2I48A 1SQYA 3MVXA 2HXWA 4X1DA 4TQUQ 4PFTA 3G3IA 4ZE9A 4OFOA 4F2QA 2H4IA 3C32A 4DXUA 4OYVA 3O97A 4RPOA 3C34A 5EYFA 1VE4A 3HHFA 3O2AA 4BDRA 3VXBA 4L17A 3E3KA 2QS4A 2XXXA 1MS7A 4IO6A 1JW1A 3PMXA 3V89B 1US5A 3VXCA 1RYXA 3QIMA 1ZLQA 2QL3A 1YAEA 4RK9A 4N07A 3MZBA 4P11A 2O7IA 4RK2A 4OXVA 2O68A 1OMPA 2Q2AA 4QSEA 3TFLA 3OO9A 4EQ9A 4IY6A 1SI1A 2DWIA 4KHZE 3IO4A 4Z0IA 4KR5A 4F19A 3ODBA 4PFYA 4X9TA 3IJXB 3U94A 4GD5A 4OEVA 3PPQA 4QSCA 2Q88A 3Q29A 4I9DA 1MXUA 4FAJA 1URSA 2V25A 4KYSA 1MG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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