3LBSA

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-bound form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lbsA01
2PBWA 2F36A 5DVJA 3V89B 1RYXA 1OIBA 2O51A 4MLQA 4FJPA 5I57A 1YPNA 4IO3A 3SEXA 4F18A 1LAXA 2V93A 1B40A 3I6VA 3EHUA 2CZLA 3IAZA 3L6GA 1ANFA 1M5CA 4ZEDA 3PUWE 2OLBA 1A55A 1N7WA 2RINA 2XXUA 4OYVA 1B32A 3W9WA 1MPCA 3K0VA 2UXAA 3TODA 4MLVA 1LB9A 1MQGA 2DWAA 3MP8A 4R72A 4G8HA 1N84A 4LVQA 5H8FA 4LATA 3FZVA 1B46A 2F34A 1PBQA 4H8JA 3R7XA 3K1MA 4FECA 4H8IA 3MPKA 1FTOA 1OVTA 4ZEIA 4ELOA 2DYXA 2I6EA 1CB6A 2Y7KA 2F7BA 4IO6A 2Z23A 2I3WA 1Y4TA 1P1QA 1B5IA 1MPBA 1MY2A 4YB7A 3KJTA 4LQ2A 3SKPA 3V5AA 4GVOA 3U94A 1O63A 3KZGA 2HAUA 4ONYA 1MM7A 4F1UA 4ZEFA 1WODA 2HAVA 4U4SA 2QSXA 3LSFB 4MF3A 5JK4A 1SYIA 1SDXA 3HPIA 5KZTA 1WVJA 4YZZA 2GH9A 3B7DA 4PFUA 3T66A 1MS7A 1IUDA 4U22A 1B1XA 3QK6A 3TPAA 3KOSA 2DXYA 3RPWA 3MVXA 5CMKA 1H44A 3OXNA 1JQFA 4HTGA 3T9UA 5H8HA 4U21A 4QHQA 1XHYA 4F3GA 1Q1KA 4XXUA 2ONRA 2REGA 2AYSA 5CRYA 2R9JA 2F6PA 1IXHA 4YU0A 1HSJA 1LCTA 3DM0A 2XXYA 3C34A 2P0SA 5I56A 3QIMA 3GBBA 4OETA 3PD9A 2H98A 3TCGA 1D9YA 2I4CA 3T9XB 2ZYKA 1EU8A 4G2ZA 1POY1 3OO7A 1I6BA 3TDJA 1JVYA 4GRKA 1NL5A 1H76A 3K6UA 4YICA 5A5XA 5CMCA 4YKIA 3PD8A 1TWYA 4GWOA 4G4PA 4TOZA 4LONB 4Z7EA 2QRYA 3PU5A 3N26A 3KN7A 2IA4A 3CSBA 2QJEA 3KOTA 3UK4A 3LBSA 3UP9A 1NKXA 1SW2A 3I5OA 1LFIA 3CFLA 3H06B 1M5FA 2OWSA 2VHAA 3B6TA 4BDRA 2PT1A 4F1YA 4Q0CA 3FXQA 4R75A 3SEUA 3F11A 1OVBA 2UYEA 3H3GA 3BFTA 2GRVA 1SQYA 4NF8B 2O69A 1LGBC 2ONSA 4RYAA 4XKRA 3C36A 1DTGA 3E13X 4DIGA 4C1UA 1PEBA 2DWHA 3K6VA 3Q25A 3MQ9A 1PBPA 1M5EA 2G29A 2O68A 5I58A 1LSTA 1B5HA 2HZLA 4KPTA 1AH5A 2QMXA 4F29A 1MH3A 2Q8JA 3RY3A 3FUZA 1J1NA 1ZJLA 3B6QA 2UVIA 4ISUA 2ANJA 3VVDA 2I49A 2B3BA 1T0KA 2O6AA 3Q28A 3QXMA 2WKYA 1SVXB 1HSLA 3CG3A 5J1DA 4ZE9A 3TEPA 1MDP1 4H5FA 2UVHA 1JNFA 3TCFA 2F78A 4FE8A 1QKAA 4OFJA 3OSQA 5L8DA 3IOUA 1FQFA 2F35A 4WEPA 4N07A 2ZYNA 4R6YA 3S2VA 4KCCA 2UVJA 4KYDA 1AOVA 2HZKA 1B3FA 3B6WA 4PETA 4N13A 4NF6A 3LSXA 1I69A 3K4UA 1XOCA 1TT1A 1YTVA 3S9MC 2OK2A 4JXIA 1P1NA 3U1OA 1A7LA 3BBRA 2QS2A 3HHFA 2ALUA 2I58A 4RK2A 3THIA 3RT8A 1Y9UA 3FXUA 2A5TB 1R9QA 1IZ1A 4R2BA 2W7YA 4ELRA 5IKBA 2QS1A 1ATGA 4C1TA 4GL8A 1DPEA 2PYYA 1LFGA 1NNPA 4JSOA 4I1DA 5CMBA 3TKDA 4G77A 4XIGQ 4O3BA 4GQOA 5CI5A 1US4A 3OEMA 1LAGE 4F31B 4KQPA 2VD3A 3KSJA 3OD7A 3IOVA 1NNTA 4NF6B 1GV8A 3VLVA 2FYIA 1FQBA 1BIYA 4GL0A 3MBPA 1R9LA 5I59A 3IOWA 4FORA 1MY4A 3T93B 2DVCA 1UTBA 1S7YA 3KG2A 1FCKA 3JYRA 4ELQA 5IAIA 1VR5A 3O2AA 1R6ZA 4IO2A 3IOTA 4QFOA 1JW1A 4Q5TA 3L6HA 1FQDA 2UYFA 2AIXA 3IO6A 3RTWB 3A3UA 3MVYA 1B3GA 3R26A 4WXJA 2NUVA 2ONKE 5DYHA 3IX1A 5ITPA 3PUYE 2DOJA 4C0RA 3SERA 4I62A 4KI0E 3ILUB 5I59B 2VP1A 2HXWA 5H8QB 2DE4A 1EZOA 2IEEA 4FATA 4YAHX 2RCAA 4F2QA 4LUBA 1A8FA 4QRZA 4G8MA 3G3KA 3CVGA 3C33A 1QUIA 4RY1A 3E9XA 1RKMA 2DXRA 3FATA 4H1XA 3I3VA 4OESA 3TELA 4YMBA 5CMMA 3WAFA 3G3HA 3CG1A 2O1LA 4ZEKA 4F3PA 4NF5A 2Z8EA 4THIA 2XXVA 2HFBA 4XKQA 3FVKA 4E0WA 2Q89A 2NXOA 4QSCA 4R6HA 4BDOA 3GBAA 4R6KA 2XXQA 3G3FA 4IO5A 5AA4B 1BLFA 1IXGA 4FIMA 1MDQA 2NVUB 3FVGA 3VE1B 3KEIA 3KN8A 4RNSA 3MUQA 5L9SA 4PFWA 5AE4A 2XXRA 5ICTA 4LQ5A 3MVZA 4KYEA 4F39A 3H6TA 3O6HA 3SEWA 1LBBA 1ZLQA 4ZEBA 3KN3A 2A5SA 1AIVA 1Y3QA 3RT6B 3MC2A 2X26A 4OFLA 4NF5B 4IGRA 2P2AA 3TMGA 3MZ9A 2Q2AA 3ECRA 2F6GA 3UA8A 4X48A 4TLLB 4P0GA 2XX9A 1NH8A 2XHDA 1DSNA 3PUXE 4ZS9A 2F8DA 1MQIA 4KHZE 3U93A 1MQDA 1UQWA 3Q26A 3KBRA 4PQJA 1SI0A 4QSEA 5TP9B 1FTMA 4ZECA 3AXFA 1UIUA 3N6UA 3HV1A 4NWDA 3H4ZA 4M4GA 4GOTA 1MY0A 3KSXA 1AMFA 1BP5A 4NE4A 4NF4B 1AL3A 5LOMA 3U72A 4EQ9A 3RGYA 1POTA 4MH5A 2Q88A 2ZNTA 4P11A 4EXKA 1B6HA 4JSDA 4OVJA 2DE2A 3A3CA 3VVFA 2QS3A 3GLBA 4IO4A 2DWIA 3PGFA 3S9LC 3VVEA 3MAMA 3D4CA 1SBPA 4OENA 4AB5A 1Y20A 2B65A 1O7TA 2E1SA 3QSLA 3DP8A 5B70A 2ZMBA 4PP0A 4G68B 4AQ4A 4NMYA 4EXLA 1MPDA 5H8SA 4DCXA 4F19A 4EUOA 4LZ7A 1Q35A 4NF8A 4IY5A 1B3EA 2I0BA 3MW0A 5EHSA 1MXVA 1FW0A 4LP2B 4PE5B 1QW0A 2Q9TA 1KWHA 4YKPA 1N7XA 1N04A 1MXUA 4F22A 3C4MA 3N6TA 1N3XA 2CMOA 3K00A 1QUKA 3EHSA 4R2FA 2I3VA 2HCAA 2E0SA 1SW4A 2ZNUA 1H45A 1TFAA 1TXFA 2PT2A 5HBCA 4ZZAA 3JV9A 3PV0E 5CBSA 5DEXB 4ESXA 1BTJA 3D4GA 3DP6A 1NH7A 1P99A 3FV1A 4HS7A 1D4NA 1FQAA 1ZIUA 4FAJA 1GTKA 1SW1A 3SEVA 1A99A 2HEUA 3H7MA 3T9HB 2XD3A 3TYHA 1IITA 3JZJA 2DP8A 3DLNA 5HM4B 2D5WA 4U4XA 2NWJA 3ILTB 3SESA 2ZNSA 1BKAA 2OWTA 4OWDA 1EH3A 1MH4A 3CRBA 2Q2CA 4QFLA 2PX1A 3SDFA 1GVCA 5ICQA 1GR2A 3GXAA 2Y7IA 4H6DA 4OERA 3PPNA 2D3IA 4IB2A 1SD3A 1LAFE 2V3TA 3O97A 3G3GA 1S50A 3IB2A 2REJA 2A5TA 2OJTA 1B0HA 3K1NA 3IL1B 3E3KA 4EQ7A 4DXBA 1M5DA 3FGSA 2Z8FA 4OFOA 1ELJA 4RA1A 5FHMA 5FHNA 4IO7A 3IR1A 1N76A 4KD5A 4RPNA 3IJXB 4OXVA 3KGCA 3N94A 2LAOA 3S9NC 4AB6A 4BDMA 1QUJA 2O1MA 2DE3A 1NMUA 3OMBA 4PFYA 1H43A 2D21A 4LA9A 1UTHA 3BFUA 4R73A 1MQHA 2RC7A 1A40A 4OHNA 1D3KA 2GFEA 2Y7RA 3T9VA 3MP6A 3OO8A 1RYOA 4BDQA 2Y7WA 1B5JA 3O29A 2ZYMA 3H6VA 5DVIA 3HO7A 5H8NA 2M8CA 1NNFA 4DDDA 3H6UA 3TQWA 4XTCQ 1IQ7A 1OQHA 1N3WA 4ND9A 4TQUQ 5L9OA 1XT8A 1OLCA 3W15C 4U1ZA 3CFZA 2VGQA 1YCJA 4BDNA 1SYHA 2V3QA 4R9FA 3TZAA 3LSLA 5H8QA 1UTHB 1Y4CA 1MXWA 1B51A 1ZTYA 3IK6B 1P1OA 3TTRA 3VLUA 4RPOA 5K2XA 5L9MA 1VE4A 2XX8A 5H8NB 1A8EA 3CFXA 2V3UA 3Q27A 3T96B 1IEJA 3C9HA 3S9EA 4EF1A 4H67A 1MRPA 3N5LA 4NTLA 4KR5A 4LZ8A 3CIJA 4F1VA 1YAEA 5AA4A 4R9GA 5EYFA 4OEVA 3TTLA 2UVGA 5TPAB 3TAJA 4JWYA 3K1PA 2PMSA 2QS4A 3MZ1A 5JTYB 1VFDA 2ESNA 4UA8A 4GLIA 3IB1A 2Y84A 3S4UA 3K6XA 1LCFA 4JWOA 3C31A 3MZBA 1B2HA 4QSDA 1XS5A 3TFLA 3VXCA 2I48A 4HCWA 5I2KB 3M3KA 3PPOA 4RK9A 3UIFA 3CR9A 1M5BA 3EN3A 4QFPA 4GD5A 4EF2A 3FV2A 4ZDMA 3KJ7A 4LZ5A 3VXBA 4U1OA 1B4ZA 1OQGA 3IJOB 3LC8A 1Z7ME 2XXTA 1IXCA 2B3FA 5CM6A 1QULA 2F5XA 4KCDA 1Y1ZA 2XXHA 2F7AA 3H6WA 4F2OA 4H65A 3CI8A 1N0TA 4OTEA 3RQTA 1SW5A 5TP9A 3G7WA 3TTKA 5KCJB 3H03A 1MY1A 3C32A 1HSEA 1JW4A 2RKMA 1UIVA 1DMBA 1B3HA 4O3CA 4NF4A 3K2DA 3HCQA 4ELPA 4EQBA 4IGTA 1L5TA 4L17A 1LB8A 1O64A 4POWA 2I4BA 4DXCA 3CSGA 3HN0A 4BLAA 3UORA 1OMPA 4BDLA 2F97A 3TTNA 2GHBA 4WEDA 4YKKA 3LR1A 4YMAA 4OZ9A 3E4RA 1CE2A 3RN8A 2FA7A 3OELA 4N6PA 5BUUA 5I57B 3PMVA 2G93A 1DPPA 1D9VA 4XKPA 4DXUA 4YKJA 1F9BA 4GF8A 1XVYA 2Z22A 4MFIA 3RUMA 4G68A 5FHOA 1USYE 2GHAA 4U2RA 5FTHA 2V25A 2YJPA 1VFEA 3HHGA 3USDA 1P1UA 5AA2D 5KDTA 2AL5A 1LAHE 3MVWA 3SEYA 3PPRA 2H5YA 4JWXA 3WAEA 1IXIA 2XXIA 1VSOA 5H8FB 4ESWA 1JW5A 4GIZA 3EPEA 2OZZA 5F1QA 3TCHA 3O9PA 3OOAA 4HW8A 4G68C 4JBZA 2F7CA 5CC2A 1QVSA 2XXXA 2XD2A 3W9VA 5DEXA 1PC3A 4Q30B 1JEUA 1Z7NE 3SETA 2VD2A 4G8NA 5AA1A 4F3BA 4H5GA 1LFHA 4DE8A 2FNCA 5DTBA 1JVXA 1FTJA 4GXAA 2RF1A 3FVOA 3ZKLA 2Y7PA 2QL3A 5KDTB 3O66A 1JEVA 1MM6A 3IB0A 4O3AA 2XX7A 4K3FA 4NWCA 1Y1MA 3PMXA 3U8QA 3M3LA 3UGWA 3K02A 2VOZA 2RC8A 2O7IA 5FTIA 3O28A 3EHTA 3G3JA 3PPPA 2ZYOA 3P7IA 1B1HA 2DVZA 4YB6A 2X7PA 3LUYA 3FJ7A 2THIA 1LLSA 1II5A 3ZKKA 2H99A 5H8HB 1NFTA 4Z0IA 2OCUA 1FTKA 4DLDA 4DCYA 2P1SA 1QJMA 3RLFE 4IY6A 4TLMB 1I6QA 4RJZA 3EF7A 2DQVA 5I2NA 3G3IA 1B52A 3DELB 3ZS6A 5I56B 1MXZA 3A09A 4OEUA 5ISUA 3PMWA 5AA3A 1B58A 3Q29A 3K6WA 1GGGA 4H0WA 1A54A 4I8CA 3DP4A 3QAXA 3KFMA 4M1VA 5A5XB 3MPLA 4QF9A 2YPNA 1OLAA 5HPQA 5JEIA 1ZBMA 2RC9A 3QYTA 1B0LA 3EQ1A 3FJMA 3V8XB 3FJGA 1B7ZA 2DS9A 3FD3A 5BWJA 2PVUA 2AL4A 2DSFA 5EHMA 1US5A 4JDFA 1Y3NA 5B7DA 5I2NB 5TU0A 1QKBA 5I84A 1Y3PA 1EZPA 5DVFA 3M8UA 4ZZEA 1URDA 3ONMA 4F3SA 1TFDA 5F7VA 3ODBA 1PB7A 1PB9A 3TQLA 4Q8RA 1JETA 1B7UA 2XXPA 1XC1A 3MJNA 4OMBA 4X1BA 1DOTA 5K2YA 2RCBA 3FVNA 3RNNA 2H4IA 2BJJX 4MBPA 2R6GE 3M3FA 1B4HA 1MQJA 5I58B 1P1WA 1FTLA 2R71A 2QPQA 2YLNA 4E0XA 5ITOA 4U23A 1ZMGA 1WDNA 3UN6A 2OBGA 4POXA 3TTMA 5ELVA 3K01A 3O6GA 5M2VA 1FQCA 1B9JA 2Z8DA 1MXXA 2ZXTA 4RXLA 3IO4A 5CBRA 1MY3A 4PFTA 1B3LA 4XKNA 2KLFA 4HCYA 4UACA 3U92A 4ZE8A 3FASA 1B7HA 2QMWA 1MG1A 3R6UA 4FEBA 5TPAA 4QFKA 2H9BA 5JTYA 4JB7A 1URGA 3V83A 3IORA 4P0IA 3VDFA 2HQ0A 2XXWA 3OENA 4KYSA 5AA2A 3OSRA 4OQOA 1H3DA 2V84A 5DT6A 3VV5A 4EDPA 3MP1A 1S9TA 3QUJA 1NNKA 5I2KA 1SI1A 3PUZE 1USYH 2X7QA 1PB8A 3OO6A 1ZKBA 4WKMA 3C35A 1ZU0A 4NEDA 2ABHA 3HSTA 1PDAA 4DZ1A 1LBCA 3BKIB 3TUSA 4R74A 1B05A 1IIWA 4KFQA 3LSWA 2O84X 3RTFB 4X9TA 2I0CA 4FEDA 3VFJA 1XVXA 1EZ9A 1URSA 4ECFA 4GFRA 5KCJA 3GZGA 4YB5A 3FIRA 2NOOA 3FXRA 3QUFA 3O6IA 1MXYA 5AA2B 2O7UA 2DWJA 4X1DA 1FQEA 3MWBA 1DTZA 3OEKA 1UTBB 4GXSB 3OO9A 4I9DA 3PUVE 1R1NA 4QFNA 3T22A 1I6AA 3ZSFA 2H25A 3VLWA 3PPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PBWA 5FBPA 2F36A 5DVJA 3V89B 1RYXA 1OIBA 4GWSA 4NAPA 2O51A 4MLQA 4FJPA 5I57A 4N4UA 1YPNA 4IO3A 3SEXA 4F18A 1LAXA 2V93A 1B40A 3I6VA 3EHUA 2CZLA 3IAZA 3L6GA 2FIXA 1ANFA 1M5CA 4ZEDA 3PUWE 2OLBA 1A55A 4P56A 1N7WA 2RINA 2XXUA 4OYVA 4N81A 1NV3A 1B32A 3W9WA 5IZ3A 1MPCA 3K0VA 2UXAA 3TODA 4MLVA 1LB9A 1FPIA 1MQGA 2DWAA 3MP8A 4R72A 4MMPA 4G8HA 1N84A 4LVQA 4PAFA 4OVQA 4PC9A 5H8FA 4LATA 3FZVA 2WYKA 4PFBA 1B46A 2F34A 1PBQA 4H8JA 3R7XA 3K1MA 4FECA 4H8IA 3MPKA 1FTOA 1OVTA 4ZEIA 4ELOA 1NI9A 2DYXA 2I6EA 1CB6A 2Y7KA 2F7BA 4IO6A 2Z23A 2XXKA 4N6KA 2I3WA 4HXVA 1Y4TA 1P1QA 1B5IA 1MPBA 1MY2A 2Y5LA 4PGPA 4YB7A 3KJTA 4LQ2A 3SKPA 3V5AA 4GVOA 3U94A 1O63A 3KZGA 2HAUA 4OANA 4PBQA 4ONYA 1MM7A 3LUZA 5IZ3B 5T3JA 4F1UA 4ZEFA 1WODA 2HAVA 4U4SA 1QGXA 2QSXA 3LSFB 4MF3A 5JK4A 1FBPA 1SYIA 2HXRA 1SDXA 3HPIA 5KZTA 1WVJA 2VPNA 4YZZA 5J16A 2GH9A 4X04A 3B7DA 3MYUA 4PFUA 3T66A 1MS7A 1IUDA 4U22A 4MIJA 1B1XA 3QK6A 3TPAA 3KOSA 1BK4A 2DXYA 3RPWA 3MVXA 5CMKA 1H44A 1FBCA 3OXNA 1JQFA 4HTGA 3T9UA 3T1BA 5H8HA 1CNQA 4U21A 4NG7A 4QHQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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