3LC8A

Crystal structure of the cytoplasmic tail of (pro)renin receptor as a mbp fusion (maltose-free form)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDRELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAADPGYDSIIY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the intracellular domain of (pro)renin receptor fused to maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Renin receptor
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 120
structure length 372
sequence length 372
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lc8A01
2AYSA 3G3KA 1MPBA 1MS7A 4GWOA 2QJEA 2D3IA 3B6WA 2X7QA 3PUZE 3OO8A 3PD8A 2OWSA 2QS1A 4U4SA 1US4A 2OJTA 3B6TA 1B3HA 4DXCA 5I2NB 1QULA 3MP6A 3K4UA 4DDDA 1SW5A 2XX8A 1JW1A 3P7IA 1PBPA 5FTIA 3PMWA 4LATA 3N6UA 1B5HA 2UXAA 3C35A 1LBCA 4R6YA 3TCGA 4GXSB 3SEUA 5I58A 4GQOA 4IO4A 1R9LA 1B0HA 4RNSA 3I5OA 4YKIA 3UIFA 4HTGA 3T96B 4OFLA 1SW2A 2CZLA 4ZECA 4RA1A 2F6PA 3QUJA 1QJMA 3LUYA 5FHNA 3UK4A 1LSTA 2VP1A 4R9GA 3G3IA 4KD5A 1DSNA 1O64A 1LCTA 3MVYA 5I2KA 4XKNA 2E1SA 3TTKA 2I49A 2HAVA 1OMPA 1L5TA 3V5AA 3FZVA 4YKPA 2H5YA 2DP8A 4N13A 4R6HA 2IA4A 5AA2A 1LFHA 4EXKA 5AA1A 1BIYA 3T93B 2AL5A 4YICA 1S7YA 2QS4A 1SD3A 4F3SA 2RINA 1AL3A 3IO4A 4P11A 2Y7WA 3JYRA 1B05A 2ONSA 3CFZA 4KQPA 1R6ZA 1I69A 4IO2A 3QIMA 3PPRA 4ISUA 4BDQA 1H43A 4KPTA 4NWCA 1MXXA 4KCCA 4LZ7A 4H65A 3CG3A 1MY1A 4FEDA 4QFLA 3WAFA 3HHFA 4U23A 3QSLA 4MBPA 3K1PA 4H5GA 3MP8A 1LGBC 4EQ9A 4RYAA 4X9TA 2QSXA 4OFOA 3PUXE 2V84A 1LCFA 1Y4TA 1LB9A 4OWDA 3V83A 2R71A 2XHDA 1SW4A 4NE4A 3KN7A 4F22A 1JQFA 1SYIA 2HCAA 5TP9A 1UQWA 1RYXA 1TWYA 1Q35A 4YZZA 1EZPA 3K6XA 2VD2A 2VOZA 2Q89A 4ZE9A 1OLAA 1HSEA 3W9VA 1B46A 2RC8A 2DXRA 4BDLA 3THIA 2UVJA 3GXAA 2RC9A 3RTWB 5H8HA 5I56B 3TZAA 5TPAB 4WEDA 4NTLA 2W7YA 3E13X 1S50A 3LR1A 3O9PA 2HFBA 1SBPA 3TTRA 2F36A 1TFDA 4ZEFA 3FUZA 3SETA 1US5A 5L9MA 1JVYA 3OO7A 1P1NA 1A8EA 4LZ8A 1FW0A 3CR9A 2QS2A 4PETA 5H8QA 1IIWA 3M3FA 3CI8A 4KCDA 4XKQA 3OELA 1B40A 2RF1A 2H98A 4MH5A 3N26A 4R73A 3T9VA 1VR5A 2R9JA 1GVCA 3R7XA 3HN0A 2XXWA 4MFIA 3A09A 4P0GA 4MLVA 4I62A 3D4GA 3C36A 4ZZAA 5J1DA 4JBZA 1JEVA 1WDNA 1FQDA 3KOTA 1NNFA 1HSJA 1EZ9A 5H8NA 3PPQA 4NF5B 1B5JA 5DEXA 3KEIA 1H44A 3IJXB 4N07A 4P0IA 4YB5A 2B3FA 5FTHA 2ANJA 3RY3A 4O3BA 3U1OA 2R6GE 1JW5A 3QK6A 1SI1A 3OO9A 1OVBA 1M5EA 2UVHA 2P1SA 4UA8A 2Q2CA 1MXUA 1B0LA 5CMCA 4F19A 1B1XA 5H8FB 1B51A 4U1ZA 1P1OA 3L6GA 5EHMA 1IXCA 3VDFA 3CRBA 2Y84A 3OEMA 4G68A 4POXA 2HZKA 4F3BA 5KCJA 3G3GA 3KN3A 3F11A 4YMAA 4IO7A 1LAHE 3G3JA 1N76A 4N6PA 3HSTA 1B2HA 2HQ0A 5HBCA 5L9SA 1A7LA 2DWAA 2Q2AA 3QXMA 1PC3A 3SEWA 1N04A 2H25A 3EN3A 3O66A 1YTVA 3QAXA 4NF4A 4FIMA 4EDPA 3TKDA 1QVSA 4H8JA 5JTYA 4U2RA 3KJTA 3CIJA 1UTBB 4IGTA 3IB2A 4NF6A 4F3GA 1OQGA 1PBQA 3IO6A 1ZTYA 4OEUA 5F7VA 5EYFA 4FECA 4F1VA 5ITPA 3FJ7A 1JVXA 2ZNTA 1IXIA 1B3EA 1CB6A 3MUQA 4EXLA 1ANFA 2XXUA 3IAZA 3G3FA 5IAIA 3VVDA 5F1QA 3Q25A 4HS7A 3VFJA 3MZ9A 3PPNA 2GHBA 1YCJA 4AQ4A 4KYDA 1B4ZA 1DPEA 3GZGA 2VGQA 3MW0A 3BKIB 3CFXA 1H45A 2Z8FA 4NEDA 4XTCQ 1Y3PA 5A5XB 4ND9A 1LAGE 4OEVA 2DS9A 4NMYA 1IZ1A 3H4ZA 3TQLA 5BWJA 1IEJA 4LP2B 1MY3A 3TODA 5IKBA 4H5FA 2D21A 4R6KA 1PDAA 2DVCA 1YAEA 3Q28A 4PFWA 4TLMB 3FXRA 3KOSA 3SESA 1J1NA 5ITOA 1RKMA 1ZBMA 2YLNA 1DPPA 1N84A 1OIBA 4KR5A 4H1XA 1USYE 1MXVA 3A3UA 2ZYKA 1Y20A 3C4MA 4OERA 4RPOA 3PPOA 4RJZA 1URSA 5B70A 2XXPA 4R74A 3K2DA 4O3AA 1XVYA 1NNPA 4ZS9A 4PFTA 5I57A 1P1UA 4XKPA 2F7BA 3G3HA 3PV0E 1USYH 1QUKA 4ELPA 3H7MA 3K0VA 3DELB 4TQUQ 2ZYMA 4GVOA 1SI0A 3OOAA 1A40A 3MPKA 4LQ5A 1XT8A 1NMUA 1II5A 1NH8A 1DTZA 3IB0A 1UTHB 1R1NA 1Z7NE 3HHGA 2DXYA 2HEUA 2A5TB 1LAFE 4C1UA 1D4NA 3FJGA 3RQTA 4OYVA 3K1MA 4R72A 2ZNSA 5CI5A 2RKMA 1MPDA 5CMKA 1B7UA 4HCWA 5EHSA 4Q5TA 4XIGQ 2XXVA 3TYHA 1ATGA 3C32A 3LC8A 3K6WA 5ICQA 1XHYA 3VLWA 3VXBA 3OSRA 1OLCA 3FATA 3GBBA 3FXUA 4OHNA 3KGCA 5H8SA 1PB8A 2O6AA 4YB7A 4NF8A 3A3CA 4ESXA 4ELOA 2UYEA 2ONKE 3FVNA 2DE2A 4GFRA 3B7DA 1A55A 2GRVA 4OTEA 2F34A 4OVJA 1MH4A 4F18A 5LOMA 4X48A 4ZEIA 1LLSA 3QUFA 2PT1A 2V3UA 3TDJA 5K2YA 1IXHA 4G68C 1WVJA 2O1LA 3CVGA 3IOWA 2XXXA 4TOZA 1MM7A 3TUSA 4DE8A 1SW1A 5AA2D 2QS3A 2I3VA 5DTBA 5DVIA 1A8FA 4OENA 1I6AA 3VLUA 1YPNA 5AA4B 2ZNUA 3H06B 1MH3A 1XOCA 3SEYA 3UGWA 1OVTA 4RY1A 2NOOA 3LSFB 4KYEA 1MDP1 2O69A 5I2NA 3G7WA 2XXQA 3UA8A 1XVXA 3USDA 3MZBA 4RK9A 1MY2A 1B7ZA 1ZMGA 2O1MA 4IO3A 3TMGA 3SEVA 4OXVA 3VXCA 5KDTB 1VFDA 1B5IA 4UACA 1FCKA 1BLFA 4F2QA 2I0BA 2PX1A 4F31B 5DT6A 3UORA 3O6IA 1UIUA 2HAUA 3C31A 4H0WA 1NH7A 1R9QA 3E9XA 1MG1A 4ELQA 3KN8A 3FVOA 1FTMA 1A54A 1ZIUA 3OD7A 1Y3NA 3DLNA 3RGYA 3MVZA 1NKXA 1RYOA 2PYYA 1B9JA 3U94A 3TCFA 1MXYA 3ODBA 3T9HB 5I59B 3O97A 4QSEA 3HV1A 4Z7EA 3IL1B 4FATA 4RK2A 1MRPA 4GL0A 2Q9TA 1MQDA 4POWA 5CBRA 2V25A 4RPNA 4QFKA 4GD5A 2UVIA 2VHAA 3FASA 3VE1B 1HSLA 1P99A 3HPIA 2H99A 5DYHA 1B3GA 2QPQA 4PFUA 1H76A 5CC2A 2O68A 4JWYA 4DZ1A 4GL8A 3GLBA 1ELJA 2GHAA 4OZ9A 2AIXA 2I58A 3QYTA 1AOVA 3EHTA 5KZTA 4QHQA 3PUYE 2NVUB 3ONMA 1NFTA 3Q26A 2PT2A 1MQJA 4PE5B 4ZEBA 1JETA 3VVFA 2PBWA 4AB5A 1S9TA 2ZYOA 2UVGA 2REGA 4GRKA 3IOTA 2XXTA 4G2ZA 4R2BA 4C1TA 3LSXA 3TTMA 3FIRA 2ONRA 2ESNA 4F1YA 2NUVA 2Q8JA 1KWHA 1FTJA 4H8IA 1GGGA 2Y7RA 1N0TA 3R26A 4G8MA 4TLLB 2Z23A 3S4UA 1FQBA 1MM6A 4OFJA 4XKRA 2HXWA 4H6DA 2FYIA 3MC2A 3T66A 3K6UA 3T9UA 2YJPA 1FQEA 1M5CA 3HO7A 3TQWA 2UYFA 2WKYA 1LBBA 2LAOA 2YPNA 3PUWE 4PP0A 1MDQA 4EUOA 3RN8A 3SEXA 3U72A 1AMFA 3BFUA 3EQ1A 4U21A 3MJNA 1B32A 2Z8EA 3R6UA 1GTKA 3ILUB 3LSLA 3S9LC 2Y7PA 5I58B 4DLDA 2V3QA 5I56A 3M8UA 3ZSFA 5TPAA 1BKAA 4AB6A 1QKBA 3TAJA 2ABHA 2Q88A 3S2VA 3Q29A 2O7IA 3KJ7A 4FEBA 4E0WA 1BP5A 3O2AA 2VD3A 4F39A 3VV5A 4JDFA 1QUJA 3JZJA 4OESA 3PPPA 2QL3A 1VE4A 3N94A 1D3KA 3PUVE 3TEPA 2I3WA 4HCYA 4BDOA 1N3XA 3KBRA 2F97A 5I2KB 4M4GA 4ZDMA 1EZOA 3VLVA 4LUBA 2X26A 1B3FA 3FD3A 5AA2B 1MY0A 3TTLA 4LZ5A 3PMXA 2F6GA 4GIZA 4IY5A 1B58A 3DP4A 3WAEA 5B7DA 4IB2A 5CMMA 4GF8A 2ZYNA 1LB8A 3K1NA 3SDFA 4KFQA 1JNFA 2QMWA 1AIVA 3IK6B 4F2OA 1EH3A 3IB1A 3OSQA 4WXJA 4NF5A 3K01A 1A99A 1P1WA 3UP9A 5I84A 4EF2A 1TT1A 4PFYA 4QFOA 5ICTA 4NWDA 1Y9UA 3SKPA 1OQHA 3TCHA 4JSDA 4DXBA 4LA9A 4ONYA 3PD9A 2RC7A 1M5BA 3OMBA 1B4HA 4BDRA 2DSFA 2QMXA 5H8FA 1FTLA 2A5SA 3W15C 3MVXA 2XXRA 3EHUA 4R75A 2NWJA 3L6HA 1MXZA 2ZMBA 4R9FA 5TP9B 3M3KA 3IJOB 4BLAA 3FV2A 4YMBA 2OWTA 3MP1A 3RUMA 3RTFB 3FJMA 4IO5A 2XX9A 4F29A 4FJPA 4YKKA 4Q8RA 2OBGA 2V3TA 1ZU0A 2DE4A 1MQHA 1MPCA 5FHMA 3BBRA 3U8QA 2DYXA 4OQOA 3DM0A 2XXYA 2DVZA 3MVWA 5H8HB 3O6HA 5HPQA 1TFAA 1AH5A 1O63A 1B7HA 2B3BA 3S9EA 2ZXTA 1UTBA 4Z0IA 4JWOA 4ZEDA 4L17A 3H6TA 2GH9A 3MAMA 4YU0A 4H67A 2V93A 3H3GA 4QSDA 4ESWA 3RNNA 4DCXA 3FXQA 1D9YA 2GFEA 2DWIA 5H8QB 4ZEKA 1PEBA 4EF1A 4O3CA 5JK4A 2B65A 4FE8A 5JEIA 5CRYA 2PMSA 3RLFE 3B6QA 3C9HA 2OCUA 2DOJA 3SERA 3GBAA 2Z22A 2D5WA 4G8NA 2IEEA 1JW4A 1Y4CA 1LFIA 5A5XA 3KG2A 2I0CA 4Q0CA 3EF7A 1EU8A 1URDA 4BDMA 4U4XA 1LFGA 3V8XB 1M5FA 1H3DA 2F35A 5H8NB 5DEXB 1SDXA 4G4PA 4QFNA 1IUDA 1NNTA 4MLQA 3N6TA 3LSWA 2DWHA 3MBPA 3RT6B 3JV9A 1PB9A 2HZLA 3C33A 3LBSA 2REJA 3IR1A 1ZJLA 3KSJA 4IO6A 4WKMA 2I48A 1FQAA 4X1BA 1QUIA 3T22A 1UIVA 1FTKA 2OLBA 3UN6A 1MQIA 4LVQA 5AE4A 2F7AA 4I8CA 4G68B 4GLIA 1FQCA 2RCBA 2XX7A 3OO6A 5KCJB 2G93A 1O7TA 2O51A 4IGRA 4KHZE 1B52A 2I4BA 4X1DA 1QKAA 5BUUA 4RXLA 2XXHA 4BDNA 3PGFA 3OXNA 1UTHA 1FQFA 4YB6A 3S9NC 2A5TA 3KZGA 4KI0E 4NF4B 1GV8A 4JWXA 4FORA 1NL5A 5JTYB 3E3KA 5CMBA 4OMBA 4JB7A 5DVFA 2P2AA 3EPEA 4QSCA 2PVUA 1POTA 3I6VA 4NF6B 5L8DA 3ZKKA 4QF9A 2NXOA 2P0SA 3ILTB 3M3LA 3H6VA 1ZKBA 1Y1MA 2KLFA 2CMOA 4DCYA 3D4CA 1ZLQA 4C0RA 1DMBA 5ELVA 2RCAA 4I1DA 4GOTA 2FA7A 3RPWA 3ECRA 1NNKA 3O28A 4HW8A 4ZZEA 1SYHA 1DOTA 1IQ7A 1IITA 4ELRA 1XC1A 2X7PA 3TPAA 4F1UA 3IOVA 3AXFA 2O84X 3O6GA 1URGA 3KSXA 1BTJA 2H4IA 5DVJA 1POY1 1SQYA 4THIA 1FTOA 1DTGA 1MQGA 4LQ2A 1MXWA 4GXAA 1LAXA 2BJJX 4ZE8A 3EHSA 3MPLA 2E0SA 4IY6A 2QRYA 3V89B 2OK2A 3IOUA 2XD3A 5AA4A 3H03A 1P1QA 3S9MC 3H6WA 1B3LA 3Q27A 3U93A 4DIGA 3W9WA 1Y3QA 4WEPA 1N3WA 2ALUA 5AA3A 1XS5A 3DP6A 1Z7ME 4Q30B 5KDTA 3K02A 1QW0A 4FAJA 2G29A 1M5DA 2M8CA 4U1OA 3MQ9A 5I57B 1CE2A 4EQBA 4JSOA 1B1HA 3U92A 1I6QA 3PU5A 2DWJA 3MZ1A 2Y7IA 3VVEA 3OENA 5FHOA 3H6UA 4K3FA 4ECFA 3TFLA 4DXUA 3PMVA 4QFPA 5CBSA 3RT8A 1IXGA 3HCQA 1TXFA 3I3VA 5TU0A 2F7CA 1F9BA 1N7WA 1N7XA 4MF3A 3TELA 4E0XA 4JXIA 1WODA 3TTNA 2DQVA 3O29A 1I6BA 3CFLA 3FVKA 4U22A 3K6VA 2Y7KA 1MY4A 2AL4A 4XXUA 3DP8A 4I9DA 3K00A 3FGSA 2DE3A 2O7UA 3MWBA 3C34A 3N5LA 5I59A 4G77A 2H9BA 4QRZA 2F5XA 3IORA 4PQJA 1PB7A 3IX1A 1B6HA 4G8HA 2I6EA 4KYSA 2THIA 3CSBA 3FV1A 3CG1A 2F78A 2XXIA 5K2XA 4EQ7A 4R2FA 5L9OA 3OEKA 3BFTA 1T0KA 4NF8B 4M1VA 2FNCA 2OZZA 5CM6A 1SVXB 4YAHX 2I4CA 3E4RA 1D9VA 3FVGA 4LONB 1Q1KA 1GR2A 3T9XB 1JEUA 5HM4B 4F3PA 2XD2A 4YKJA 1VSOA 1VFEA 2Z8DA 4OETA 1Y1ZA 3CSGA 3KFMA 3ZS6A 5M2VA 2F8DA 3ZKLA 5ISUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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