3LSFB

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence E, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsfB02
4H8IA 4DZ1A 4IO6A 2NVUB 3H6VA 1FTJA 3O29A 2ZYNA 2DWHA 2Z8FA 3MW0A 3LSXA 3JZJA 2ZXTA 1H45A 3PUXE 4EF2A 1LAXA 2ANJA 3N5LA 3C35A 1FCKA 4R6HA 3OELA 4PFUA 2P0SA 2I0CA 4NF4A 4ESXA 3VVFA 3N6TA 4WEPA 4GXSB 3TTLA 4LQ5A 4GXAA 3FVOA 1PEBA 1USYH 4XKQA 5H8FB 3MAMA 4P11A 4HW8A 4ZEDA 1JQFA 4U22A 4OTEA 2XXIA 4QSDA 4EUOA 4XXUA 2V3TA 1NKXA 1B5HA 4F3SA 5J1DA 4GVOA 3RPWA 4PFYA 3A3CA 3V89B 3FVKA 5CMBA 1QULA 2QS2A 4R6KA 3W9WA 1B9JA 3TCFA 1PB7A 4MFIA 3FIRA 5F7VA 3H4ZA 4RK9A 1AOVA 2O7UA 4QFKA 4TOZA 3OSRA 4GD5A 2GFEA 3UORA 1LFGA 3KSJA 3GBBA 3EF7A 5F1QA 2QPQA 3U92A 4LVQA 3OO8A 2PT1A 1B52A 5LOMA 4KHZE 1MDP1 3ZKLA 1FQCA 4QFNA 1N3XA 2IEEA 4K3FA 2O68A 4EDPA 1OQHA 4KCDA 1EZOA 3FXRA 3S9LC 2HFBA 5A5XB 5FTHA 2Z8EA 2AIXA 4YKKA 3SEUA 4OZ9A 1N3WA 4O3CA 4QSCA 3K2DA 4O3AA 5CRYA 4TQUQ 2XXHA 3K6WA 3O6IA 3QK6A 5BUUA 3IB1A 4Q8RA 4YKIA 4H1XA 3SDFA 1FTLA 3PUWE 1YCJA 4GWOA 5B70A 3MZBA 1Y3QA 1B7UA 2XXTA 4N13A 1LSTA 3SETA 2QMWA 2X7PA 1IQ7A 1ZJLA 3PPPA 1II5A 4NF5B 4AB5A 3QSLA 2B65A 1KWHA 2R6GE 1MQIA 1LB8A 1JW4A 3FV1A 5L9MA 3USDA 4BDQA 2H98A 5TPAA 4YKJA 3R7XA 2FYIA 1AL3A 1Y20A 3T22A 5H8NA 1B1HA 2DQVA 4EQBA 3PMVA 2B3FA 2UVGA 4IO4A 5I2NB 2H99A 4U2RA 1H44A 2F78A 1MY1A 3T9VA 5DTBA 1N7XA 3MBPA 3Q27A 4ONYA 3L6HA 3CSGA 5DEXA 3PUZE 2E1SA 4IB2A 4UACA 3OO9A 3OMBA 2XX7A 3VXBA 3OEKA 4YU0A 3H06B 1YAEA 2THIA 2P2AA 1IITA 3V83A 1QUKA 4UA8A 2P1SA 4EQ9A 3DP4A 4QFLA 3M3KA 3PD9A 5DVJA 3PU5A 4NF4B 2BJJX 1EH3A 3SEWA 3EHSA 3R26A 1S50A 3U72A 3SEXA 4DXCA 1B40A 3CFZA 3H6UA 2G93A 2I0BA 4H0WA 1DOTA 5AA2D 5IAIA 2ABHA 1D4NA 1FQAA 4OFLA 3OEMA 4ZZEA 3O6HA 3KJTA 2XXPA 3OSQA 1OIBA 3G3JA 4I1DA 4AB6A 4IO5A 4C1UA 4R9GA 2NXOA 2AL4A 3KOTA 2Q88A 4ZE8A 5KCJB 2W7YA 4LA9A 2I3WA 3CSBA 1MDQA 3LSFB 3MPKA 5DT6A 3N6UA 5HM4B 3PUYE 3V8XB 2XX9A 1A8FA 1ANFA 3Q25A 1PBQA 3H6WA 1B0LA 1LBBA 4QHQA 5AE4A 3E4RA 4PETA 4I9DA 2XD3A 3CIJA 1OVTA 4EQ7A 3MVZA 4JB7A 4PP0A 4G2ZA 1XVXA 4XIGQ 4H67A 4RPNA 5I58A 3IOVA 2G29A 3UN6A 4Z7EA 1MM6A 4GFRA 1L5TA 2DSFA 3FJMA 2VOZA 3K1PA 1URSA 3RN8A 2DE4A 1Y4CA 3PPRA 4R9FA 1Y1MA 2RC8A 4OESA 3T93B 3IORA 1UTHA 4IGTA 1P1NA 1FQDA 4DLDA 3C33A 3LR1A 4ZEIA 2VGQA 3EHUA 4F19A 2WKYA 4YMBA 3CRBA 4XKRA 4LATA 2Q8JA 3TYHA 4U1ZA 2REJA 3PD8A 4YMAA 4F39A 1VR5A 4OFJA 2Q9TA 2V84A 4ZEBA 3VLUA 3QUFA 4M1VA 4F3BA 3RTWB 2ZNSA 4PFWA 2OJTA 3A09A 1QVSA 3RY3A 1GVCA 4JBZA 5B7DA 4C0RA 1CE2A 2DE3A 3Q28A 4FORA 4H5FA 4MLQA 1LB9A 5FHOA 5TPAB 2DP8A 4PE5B 4ELQA 1MH3A 3FVNA 1LAHE 5H8NB 4ZDMA 3FUZA 3K4UA 3Q29A 1Y4TA 3IOWA 2PVUA 3U94A 3K0VA 5BWJA 4U21A 2DYXA 3KZGA 1XS5A 1BKAA 4OFOA 1MPDA 2GH9A 1MPBA 2NWJA 1D9VA 4QFOA 1N04A 3D4CA 5DEXB 4L17A 3ONMA 1I6QA 3TTKA 1IXCA 3DLNA 3RUMA 2XXYA 2VD3A 2DS9A 3TDJA 1BIYA 1RKMA 2GHAA 1A7LA 2X7QA 4X48A 3S9MC 3O66A 5DVIA 5CBSA 4ELOA 2QS4A 1SI1A 1QUJA 1OMPA 3RT6B 3MC2A 1JVYA 1DMBA 2XXVA 1B7HA 1MQGA 1QUIA 4R2BA 4LONB 1B6HA 2D5WA 1Q35A 4LZ7A 4P0IA 3TQWA 1UIVA 3G3FA 4ZE9A 1M5EA 1I6BA 3ODBA 2F7BA 1LFHA 1Y3NA 3KN7A 4OHNA 3A3UA 1Z7ME 2IA4A 4JWXA 1LCTA 4POXA 3VVDA 2V25A 1IEJA 1S9TA 4OVJA 3TTRA 1A54A 2VP1A 2DXRA 1M5DA 3C32A 1D3KA 3FJ7A 1IUDA 4R74A 4RXLA 4N07A 1FTMA 1PB8A 1B5JA 4DE8A 4F1UA 1MY3A 3TCHA 1TT1A 1B51A 3VXCA 3IX1A 4IO2A 1M5BA 1VSOA 3IK6B 4KYDA 4RJZA 3L6GA 2AYSA 4OEUA 4ELPA 5CBRA 1A40A 2QS1A 1D9YA 2HEUA 4C1TA 2H4IA 4JWOA 4FAJA 3TUSA 5H8SA 4OXVA 1SQYA 3BBRA 5I58B 4I8CA 3LBSA 3JYRA 1SW4A 3MZ1A 4I62A 3KG2A 5AA4A 1LBCA 2OK2A 1POY1 4OEVA 4G8NA 4ZECA 3G3KA 4YZZA 2I6EA 3MPLA 4RYAA 3TCGA 5EHSA 1UTHB 3JV9A 1AMFA 2V3QA 4GRKA 2V93A 3IOUA 5EHMA 1B5IA 1DPEA 5EYFA 3LUYA 1M5CA 3TMGA 1MH4A 3O9PA 5CMCA 1JEVA 5I56A 2D21A 2Y7PA 2DVCA 4NF6A 3HCQA 3UP9A 5TP9A 2PMSA 3QXMA 3OO7A 3ILTB 4NE4A 1DTZA 5M2VA 2ZNTA 4M4GA 3GXAA 2FNCA 2XXRA 1OQGA 2LAOA 3O28A 3R6UA 2I3VA 1Y9UA 2DWAA 4TLMB 1ZTYA 3MP8A 4OETA 5I59A 3MWBA 4F2OA 2OLBA 2XXQA 3CG1A 2QMXA 1EZ9A 5DVFA 2ONRA 1TXFA 1HSJA 1SW5A 2QSXA 5FTIA 1QW0A 1USYE 3OO6A 2Q2AA 1LAGE 4GQOA 1AIVA 3PPOA 3UK4A 4BDMA 1YTVA 3U93A 2Y7KA 2ZNUA 3MP6A 4N6PA 5ELVA 1VFEA 3SERA 1UTBA 4R72A 3PUVE 3HHGA 4ISUA 5HBCA 1FQEA 2H5YA 3M8UA 1P1QA 4GLIA 2A5TA 4OERA 4HTGA 2UVIA 1GV8A 4U4XA 3QYTA 2O7IA 4NF8A 4YB5A 1JW1A 1ATGA 2QS3A 1XC1A 3O2AA 3TEPA 3VFJA 1M5FA 3C4MA 1NNFA 1DSNA 1RYXA 4Q5TA 1SW2A 3EQ1A 3O97A 1FTKA 3FXQA 1I69A 2F35A 3F11A 4R6YA 3UIFA 4LZ8A 2RC9A 1MXYA 2UYFA 5TU0A 3EPEA 1ZLQA 3S4UA 3MUQA 2GHBA 2Z23A 2A5SA 3PPQA 2H9BA 1XT8A 3ECRA 4X1DA 1US4A 3I6VA 1FQBA 1LGBC 1SBPA 2XXWA 2HAVA 3U1OA 2AL5A 2VHAA 5ICTA 2Z8DA 1EU8A 4GOTA 5ITPA 4G68C 4YB7A 1VE4A 1IXHA 3FATA 3PV0E 4GF8A 5FHNA 2Q2CA 4FEDA 1MQJA 3IL1B 4MH5A 1A99A 1I6AA 1B7ZA 1R9QA 5FHMA 4YAHX 3OENA 1B3LA 2QJEA 3DM0A 4G8MA 3K1MA 3K6XA 2Y7IA 1Z7NE 1R6ZA 2I49A 1BTJA 1US5A 2Q89A 1OLAA 3HSTA 1R9LA 5AA4B 3IO6A 3FJGA 2ALUA 3AXFA 1A8EA 2F8DA 5KZTA 1LLSA 3B7DA 1HSLA 4ZEKA 1JNFA 1FTOA 5CMKA 1NH8A 1B3FA 4YB6A 1WDNA 1B4ZA 1B2HA 3RNNA 4KYEA 4DCYA 1P1OA 1MY2A 3VLWA 4H65A 3OD7A 4GL8A 1TFAA 1IXIA 3VV5A 2F7AA 1GTKA 4PQJA 4YICA 1MRPA 3W15C 2PYYA 1H76A 1WODA 2DE2A 2HAUA 1B3HA 1NH7A 5I56B 4PFTA 5H8HA 3E3KA 4H8JA 4NF6B 3T9HB 4O3BA 2XXUA 4RK2A 3FASA 1POTA 2OWSA 5TP9B 3GBAA 4X1BA 3PPNA 4NWDA 3K1NA 4LQ2A 1B4HA 1GGGA 2HZLA 1SYHA 3CG3A 3LSWA 3IJXB 1PDAA 2UVJA 5L8DA 4Z0IA 1B58A 3LC8A 4EXLA 5AA1A 3BFUA 1JETA 3C9HA 1P99A 2B3BA 1EZPA 4RNSA 3KGCA 5I59B 3ZSFA 4KR5A 3C34A 4G8HA 3KN8A 1JW5A 4TLLB 2HZKA 1SVXB 1NNPA 2R71A 3MP1A 2R9JA 3IAZA 2Y7WA 4F3GA 4KCCA 2OBGA 4U4SA 3TFLA 1O64A 5H8QA 1F9BA 4P0GA 3MVXA 4RY1A 1UTBB 1ELJA 1N7WA 1MXWA 5I57A 1XVYA 2HXWA 1B0HA 1QKBA 1J1NA 3D4GA 3QIMA 1MQHA 5K2YA 2A5TB 5JTYA 1ZBMA 1MY0A 3K00A 4X9TA 3RLFE 1GR2A 2RINA 3H7MA 4NF8B 1OLCA 4OMBA 3THIA 1ZIUA 3RQTA 3UA8A 3V5AA 3B6TA 5I2KA 4IGRA 3TZAA 2H25A 4F18A 4THIA 2O1MA 3KFMA 1PBPA 4G77A 1NNKA 4IY6A 4R2FA 2NUVA 3RT8A 3K01A 1VFDA 5KCJA 3IB2A 3VLVA 2F97A 4EXKA 4F1VA 4G4PA 1SI0A 4G68A 2F5XA 4KQPA 3FV2A 3K6VA 1JVXA 3CFLA 3HHFA 1PC3A 2ESNA 2F7CA 3WAEA 1SW1A 3T66A 3KJ7A 2VD2A 1H3DA 1ZU0A 4BDNA 4WKMA 3M3LA 3TPAA 2XXXA 5K2XA 2X26A 1MXVA 4BDOA 2D3IA 3KEIA 3M3FA 3MVYA 2XD2A 1R1NA 4QFPA 4E0XA 4FECA 3T9XB 3TQLA 1BP5A 5AA3A 3W9VA 2F34A 3HV1A 2DWIA 4Q30B 3TTMA 4KFQA 3G3GA 4R75A 5ISUA 1CB6A 2ONKE 3I5OA 1MXXA 3I3VA 1AH5A 3BFTA 4DCXA 3PMXA 5IKBA 4GL0A 1IZ1A 3LSLA 3B6WA 1NFTA 1MQDA 4BLAA 1N76A 2DWJA 2CMOA 1MM7A 4NMYA 3IR1A 5L9SA 4H5GA 5KDTA 2YLNA 4RA1A 1URDA 3OOAA 4XTCQ 4OWDA 4KI0E 3CVGA 5AA2A 2HQ0A 3G3HA 2XX8A 3C36A 5I84A 4BDRA 4KYSA 2Y84A 3O6GA 4FATA 3IB0A 4MBPA 3EN3A 2I4BA 5H8HB 3P7IA 2CZLA 4DXBA 3ILUB 4MF3A 2DXYA 3PGFA 2FA7A 4NEDA 2YPNA 2HCAA 1Y1ZA 3IOTA 1DTGA 1NNTA 1DPPA 2PT2A 1YPNA 3BKIB 2ZMBA 1Q1KA 2RCAA 3E9XA 3MJNA 4FE8A 3GZGA 2DOJA 3S2VA 5ICQA 3DELB 1S7YA 3C31A 1PB9A 2PX1A 2F6PA 1MG1A 1B1XA 3ZKKA 1QJMA 3G7WA 3G3IA 2PBWA 5HPQA 3S9NC 4KD5A 2UVHA 4F3PA 2DVZA 2NOOA 2OWTA 2O69A 2RCBA 5H8QB 3FD3A 1RYOA 4OQOA 2Y7RA 5DYHA 4LUBA 4QRZA 2ONSA 3S9EA 1FQFA 4FIMA 3TAJA 2I48A 5H8FA 5I57B 4OENA 4IY5A 3CI8A 5CI5A 2KLFA 3CR9A 5CC2A 4ZS9A 4ELRA 4MLVA 5JTYB 5CM6A 4F31B 2ZYKA 1MPCA 4Q0CA 1WVJA 1T0KA 2OZZA 1UIUA 3FXUA 1A55A 1TWYA 3H03A 1H43A 1HSEA 4DXUA 4WXJA 3SEVA 3QUJA 1NMUA 5I2KB 3H3GA 4FJPA 4HS7A 4YKPA 4E0WA 4NTLA 2GRVA 1B3GA 2ZYOA 1MY4A 3MQ9A 1LAFE 2I58A 2RC7A 3K6UA 4JSOA 4JDFA 3TODA 1UQWA 1B05A 1QKAA 3TTNA 3OXNA 1IIWA 4DIGA 4F22A 2O84X 4ESWA 4F1YA 3H6TA 5JEIA 3IJOB 3HPIA 4G68B 2O51A 1BLFA 4XKNA 3U8QA 5L9OA 2QL3A 3K02A 4OYVA 1B3EA 1B46A 3N26A 2M8CA 3Q26A 4U1OA 2F36A 1MS7A 1MXZA 4HCWA 2UXAA 4ND9A 4F2QA 3VVEA 3KN3A 3PMWA 3MVWA 2O6AA 1OVBA 2E0SA 2ZYMA 3SKPA 1JEUA 3HO7A 2O1LA 3SEYA 1IXGA 4XKPA 2F6GA 4DDDA 3QAXA 1FW0A 4ZEFA 3RTFB 3VE1B 5A5XA 2UYEA 4LP2B 3DP8A 4JXIA 1SDXA 4R73A 3T96B 1XHYA 3CFXA 5CMMA 1XOCA 4NWCA 3N94A 4EF1A 1MXUA 1O63A 2I4CA 3VDFA 1SD3A 1LCFA 4QF9A 3TELA 4JWYA 3T9UA 4ZZAA 4JSDA 3ZS6A 5KDTB 1O7TA 4U23A 3HN0A 4ECFA 4HCYA 3KOSA 5JK4A 4POWA 2Z22A 2QRYA 1N0TA 3KSXA 3FZVA 3MZ9A 3FGSA 4GIZA 3RGYA 5AA2B 2REGA 4NF5A 1TFDA 3GLBA 2RF1A 5ITOA 2OCUA 1ZKBA 1ZMGA 3TKDA 3B6QA 3DP6A 4LZ5A 2RKMA 3FVGA 4RPOA 3UGWA 3WAFA 4IO7A 2XHDA 1P1WA 5I2NA 4AQ4A 1P1UA 1LFIA 3SESA 1B32A 4BDLA 1N84A 3E13X 3KBRA 2YJPA 4KPTA 1SYIA 1Y3PA 4FEBA 4WEDA 3EHTA 1NL5A 4IO3A 3IO4A 4F29A 2V3UA 1URGA 4QSEA 4H6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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