3LSLA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua2 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lslA02
5KDTA 1IQ7A 3G3KA 5AA3A 1YPNA 2LAOA 1R6ZA 2I6EA 3MPKA 3VLVA 4OQOA 3IB2A 2DWJA 4H67A 5L9OA 4F29A 2OK2A 1MM6A 3MQ9A 4KYEA 3TEPA 4YICA 3VXCA 4DXCA 2HAUA 4KYSA 3KN8A 3LBSA 3G3GA 3VLWA 1BKAA 3H6TA 4EUOA 4GL0A 3C35A 4RXLA 1LLSA 1S7YA 3QXMA 1H3DA 5B70A 4OYVA 2HZLA 4NF5A 3S4UA 1B5JA 5L9SA 3O6GA 2H99A 1PB8A 3FVNA 4X9TA 1YCJA 3RTWB 3BKIB 3H6WA 5I84A 1N04A 3UORA 4RK9A 1B52A 1JNFA 3T9UA 1ZKBA 2X26A 1FTMA 5HM4B 4PQJA 1B3EA 4G8NA 3VVEA 3B7DA 3KJTA 3CSGA 1QJMA 2DWHA 4NF6A 4K3FA 1UIUA 4ZS9A 2XXTA 4NF4A 5CI5A 4I1DA 1B9JA 5JK4A 4DLDA 1B4HA 1VSOA 1US4A 5F1QA 2RC8A 3MC2A 4Z7EA 4EQ7A 3U72A 4U1ZA 1EH3A 4OXVA 3CRBA 5LOMA 4WKMA 3S9MC 3HHGA 3IR1A 2FA7A 4ZEFA 2AIXA 4KCDA 1QUJA 4FAJA 4LQ2A 3GZGA 2M8CA 4YB7A 4H65A 1JEVA 4EQ9A 2V84A 4OFOA 2I4CA 4QFPA 3KBRA 3OSQA 2AYSA 4F2QA 2ZNUA 3EHSA 2O6AA 1FQAA 5JTYB 4GLIA 1MM7A 1TFAA 2ZYMA 1RKMA 3K6WA 2ZNTA 4HS7A 3E13X 3KSJA 4KYDA 2RCAA 5ICTA 4RPOA 5L8DA 4JWXA 1ZBMA 4FJPA 3IOWA 4TQUQ 1MH4A 3FV1A 3TTLA 4EF1A 3OO9A 4U2RA 1GVCA 4PFUA 1OIBA 3KJ7A 2ZNSA 1LFHA 1BIYA 2Y7WA 2Q2CA 2XX9A 3UK4A 4DXBA 1Y3PA 1IXHA 3C31A 3I6VA 2GHBA 1QKAA 4G77A 3H3GA 2H5YA 1EZOA 4OHNA 5AA2D 3U93A 1H44A 2WKYA 1LAXA 4R75A 1LBBA 2VD2A 1OVBA 2F7CA 2A5TB 4DXUA 5K2YA 4OERA 1MPCA 2RCBA 1SI1A 3EQ1A 3VVFA 4GXAA 1SW4A 3ONMA 3RTFB 3RT8A 4H8IA 1XOCA 1MXZA 1XVYA 4GD5A 5CBRA 3D4CA 4RA1A 1MQGA 5ITPA 4F2OA 1M5EA 3F11A 3UP9A 5KCJA 5I59B 1B51A 3FUZA 1MDQA 4P0GA 3K4UA 3OENA 4ZEDA 1LCTA 4ELRA 1JW5A 4G2ZA 4JSDA 3CI8A 2PYYA 1O64A 2H25A 4YB5A 1R1NA 4E0XA 3RNNA 3CR9A 2ONRA 1NNFA 1LGBC 1SW2A 2KLFA 3IO6A 4THIA 2H98A 2DWIA 3GLBA 1D9VA 4O3CA 1ZLQA 3MP8A 3A3CA 3ILUB 1DTZA 3N26A 3T93B 1JW4A 3PPOA 3LUYA 5CMMA 2XXYA 1QVSA 4QHQA 4C1TA 1II5A 3UGWA 4ZDMA 3MP6A 3ZKLA 4F39A 1D4NA 5IKBA 3WAFA 3ODBA 1JQFA 5I58B 3USDA 3VE1B 3I5OA 3MZBA 3P7IA 2F6PA 5J1DA 3TQLA 3G3FA 3KOSA 5FTHA 1Y4TA 1M5FA 1LSTA 3C36A 3CVGA 3OO6A 1MXWA 2Z8DA 1H76A 1MXVA 1I6AA 3K1PA 4BDOA 3Q27A 2V3TA 4QFNA 5AA4A 4C0RA 4R6HA 1XC1A 2DE4A 3RY3A 1LAGE 2ANJA 2XHDA 2XXXA 1DMBA 2NOOA 3SEWA 3CFXA 2REJA 3TYHA 4KI0E 5FTIA 5ICQA 4YKJA 3EF7A 4IY5A 1P99A 2DXYA 2GRVA 4HCWA 3MZ1A 3CFLA 2HQ0A 1US5A 3RUMA 1SW5A 3LSXA 5DVIA 4POWA 1P1WA 1M5DA 4I62A 1ANFA 3THIA 4POXA 4OZ9A 3PPQA 4FATA 2W7YA 3LSWA 2HCAA 3O97A 1RYXA 2F5XA 2G93A 5H8HA 4OFLA 3R7XA 3MZ9A 3RQTA 4IB2A 3BFTA 1N84A 1Y3NA 2QS4A 2P1SA 4FEDA 4YB6A 2F7BA 1B0HA 3IB0A 4OENA 1L5TA 1PBQA 3TTNA 4C1UA 3E3KA 5BUUA 2DVZA 2I4BA 2QPQA 4F1YA 1PC3A 2IA4A 4Q30B 3H6VA 3JZJA 4RPNA 4GIZA 2Y7KA 1B7UA 1QW0A 3ECRA 5CRYA 3Q29A 3A3UA 4NF8B 4U22A 1BP5A 2HZKA 3IOVA 1NH7A 2RKMA 3KN3A 1MDP1 3TZAA 5EHMA 2XXVA 3CSBA 4HW8A 1MXUA 1AOVA 1OQGA 1ZMGA 3MVYA 4KPTA 2QJEA 5TP9A 2YPNA 3IAZA 5H8NA 3PD9A 3GBAA 4LZ7A 3U1OA 3LC8A 2QS3A 4ZEBA 4G8MA 2THIA 3CG1A 1LAFE 3JV9A 1FQEA 2Z22A 3O28A 3VV5A 1NL5A 3QIMA 2O1MA 1A99A 1D9YA 2PVUA 3G7WA 2UVIA 2RC9A 2G29A 4DIGA 1DOTA 3HO7A 4H5GA 2CMOA 3OD7A 3W9WA 4LVQA 3FXRA 4NEDA 3DLNA 3K1MA 2OLBA 3O2AA 3IOTA 2Z8FA 4MLVA 1A8FA 2VHAA 1B5HA 2HFBA 3M8UA 4KCCA 2B3BA 5TPAA 1SDXA 2GH9A 3SERA 4IO3A 1N7WA 5H8FB 3CIJA 1JVYA 3KOTA 2QMXA 5FHOA 3PUXE 2REGA 3PV0E 2BJJX 4OETA 5TU0A 4XIGQ 4O3AA 2AL4A 4G4PA 3FV2A 3T9XB 4IO4A 1GGGA 3C34A 2Y7PA 5I56B 2YLNA 1PB7A 3MAMA 1N76A 5I57A 3UN6A 1NH8A 5B7DA 4H5FA 2I58A 3VFJA 5BWJA 4Z0IA 4DZ1A 4Q5TA 3QK6A 1UTHA 5DEXA 4G68B 2O68A 2I0BA 4JB7A 1BTJA 2GFEA 3OELA 3T9VA 5CC2A 1FW0A 1Y1MA 3E4RA 4UACA 1POTA 1QUKA 2XX7A 4RY1A 4ESWA 4KR5A 4N13A 1TXFA 3PGFA 4F31B 4NF5B 1F9BA 1A7LA 4NMYA 4OMBA 4MLQA 2YJPA 3LSFB 1Y20A 2PT1A 2VP1A 3KFMA 2X7QA 5CMBA 4UA8A 2ONSA 5HPQA 2CZLA 2F78A 4R2BA 3ZKKA 3K1NA 2ZYNA 4X1DA 4X1BA 3TPAA 1CB6A 4LP2B 1XHYA 1SVXB 5DT6A 4ZECA 2Y84A 4IGTA 4NF6B 1IUDA 4FIMA 4GQOA 5H8QB 1MH3A 4QFKA 3VXBA 4QSDA 3SEXA 4X48A 1GR2A 3MVZA 2PBWA 2D5WA 4WEPA 4PE5B 3OOAA 1UTBA 4IO6A 4OTEA 1SYIA 1NNKA 4YKKA 1MQHA 5F7VA 3VVDA 1AMFA 3OEMA 2O7IA 2HXWA 1KWHA 2ZMBA 5I2KA 4U4SA 1XT8A 4H6DA 4P0IA 1B3LA 3U8QA 5A5XA 4EF2A 1N7XA 3PUYE 1CE2A 4GF8A 3K6XA 1B3GA 3N6TA 1LFGA 1QULA 1MXYA 1IXGA 2RINA 5EHSA 3O9PA 3TQWA 2NVUB 1I6BA 3IOUA 3MVXA 3PU5A 1SQYA 4FEBA 5AE4A 4R72A 4XTCQ 3C33A 3Q25A 1P1UA 2NUVA 4N07A 4ELOA 2NWJA 1AIVA 2HEUA 1MQDA 2VGQA 2F34A 3O66A 1XS5A 1OLCA 4MBPA 5ELVA 4DCXA 1DPEA 5I2NA 3KZGA 1ZTYA 4WXJA 1I6QA 4LZ5A 3FIRA 4M4GA 1YTVA 1MPDA 2O1LA 3S9NC 5CMCA 5AA2A 4QSCA 1BLFA 1B1XA 4GL8A 4JBZA 3EHUA 3MBPA 1DSNA 4U4XA 1VR5A 3RPWA 1IZ1A 2E1SA 2UVHA 1RYOA 3OSRA 2F8DA 4R9FA 4MFIA 3O6HA 1SBPA 3TODA 3RLFE 3FXQA 3FVOA 1Y1ZA 2R71A 3TTKA 1AH5A 1MY3A 5FHNA 3FJMA 2ONKE 3TCGA 3FGSA 4Q8RA 1YAEA 2RF1A 3ZSFA 1EU8A 3DM0A 3FJGA 5AA1A 3IX1A 5KCJB 1B05A 3TKDA 3B6TA 1Q1KA 4R6KA 4ECFA 3T96B 4MH5A 3FVKA 3MVWA 1MRPA 4H8JA 4ELQA 1XVXA 2OZZA 1ZIUA 3CG3A 2I3WA 4F22A 3IO4A 1URDA 4FE8A 2D3IA 3R26A 4PFYA 4U1OA 2GHAA 2ZYOA 4F3GA 3U94A 4YKPA 3KN7A 4TLMB 3K01A 2V3UA 4R74A 3LR1A 4R6YA 1B40A 4MF3A 5DYHA 3HPIA 3PMWA 2XXRA 3TAJA 4E0WA 3T22A 2AL5A 3IB1A 3V8XB 2X7PA 1TWYA 4BLAA 2UVJA 1PEBA 4KFQA 3BFUA 4FORA 1WODA 4IO7A 1B6HA 2OWSA 4OEUA 4RNSA 4HCYA 5ISUA 1UIVA 1SYHA 3H6UA 2Q89A 5L9MA 4GOTA 1NNPA 2O69A 4M1VA 3H7MA 4RJZA 3PMXA 3PUWE 3U92A 1MQJA 4YZZA 3IJXB 2DWAA 2Z8EA 3TCHA 5DVFA 1IITA 3HCQA 4JWYA 4ZEKA 1WVJA 4JWOA 4ZZAA 1USYE 3KGCA 1N0TA 4FECA 4JDFA 1B4ZA 3FJ7A 4TOZA 2VOZA 2DOJA 4DE8A 1OLAA 4OESA 1JEUA 3PPNA 4TLLB 2F97A 1NNTA 1PBPA 1VE4A 3EHTA 1T0KA 2PX1A 3DP8A 4EQBA 3PPPA 1B3HA 2VD3A 2I49A 3TTRA 3WAEA 3N5LA 3GBBA 4F3PA 1A40A 4U23A 1VFEA 3OXNA 1B3FA 2PMSA 4G68C 2V93A 3PUVE 4EDPA 4G68A 1B0LA 3VLUA 2H9BA 3QYTA 3S2VA 1MY4A 4NWCA 5H8HB 3OMBA 1HSLA 4BDRA 5JTYA 1MY1A 1MY2A 3FATA 2Y7RA 4EXKA 2XXWA 3RN8A 3ILTB 1O7TA 2DE2A 4XKPA 1USYH 4LA9A 4HTGA 2F35A 1URGA 3T66A 1HSJA 4ND9A 2QS1A 4KD5A 2O7UA 2O51A 2QSXA 3M3LA 2XXQA 1IXCA 3IL1B 4OWDA 3SEYA 1IEJA 3C9HA 5TP9B 4QRZA 5H8QA 3QUFA 3QSLA 5H8NB 1N3WA 5KDTB 3E9XA 3KEIA 3BBRA 4AB5A 1MG1A 1EZ9A 1GV8A 2DS9A 2QRYA 2UYFA 4H0WA 1ZU0A 3PPRA 5DVJA 3IORA 4QFLA 2QMWA 5DTBA 4ONYA 2I48A 3M3FA 4LATA 2A5TA 3L6HA 2QL3A 1FQFA 4PETA 4PFWA 1P1NA 3QAXA 1ZJLA 1MY0A 3SDFA 1FQCA 3OO8A 1ELJA 2DXRA 4IO2A 5CMKA 1Q35A 1GTKA 4YMBA 4O3BA 2Q88A 1Y3QA 3C4MA 2DSFA 1H43A 4PP0A 1LFIA 2XXPA 3W9VA 3K00A 3VDFA 5KZTA 4R2FA 3G3HA 4GVOA 1SW1A 5I59A 4BDNA 1N3XA 1JVXA 5TPAB 2DP8A 3SEVA 1LAHE 1B7ZA 2IEEA 1B2HA 4PFTA 4NF4B 1Z7NE 3D4GA 4GXSB 1WDNA 4KQPA 3V83A 4WEDA 1JW1A 4IO5A 1DTGA 2PT2A 4Q0CA 3UA8A 2D21A 2OWTA 4R9GA 3B6WA 4OEVA 4XKNA 4RK2A 4YU0A 5HBCA 5IAIA 3KSXA 2UXAA 2DYXA 2ALUA 1M5BA 3IK6B 4LUBA 3TFLA 4F1VA 2XD2A 4ESXA 1NMUA 1B7HA 4JXIA 5I57B 1B46A 3Q28A 3W15C 1IIWA 3H06B 4GWOA 4R73A 1PB9A 3O6IA 2A5SA 2DQVA 3A09A 3V89B 1LB9A 4L17A 1B32A 4N6PA 1UTHB 1B58A 3EPEA 5DEXB 1UQWA 3MPLA 3ZS6A 3B6QA 3MP1A 3RT6B 5I58A 5ITOA 4XKRA 1MXXA 3V5AA 1B5IA 1LB8A 3S9EA 5H8SA 2XXIA 3S9LC 1TT1A 4ELPA 1EZPA 3HV1A 2OJTA 4F3BA 5FHMA 3EN3A 1LBCA 1SI0A 5EYFA 3K6VA 3SESA 3FASA 2UVGA 3K6UA 4ZEIA 1R9LA 2XXUA 2Z23A 1TFDA 4F19A 3MW0A 1D3KA 1MS7A 2P0SA 3CFZA 1R9QA 3HSTA 3FD3A 3C32A 2Q8JA 4AQ4A 5M2VA 4BDQA 3AXFA 3TUSA 2B3FA 1UTBB 5CM6A 1Y9UA 3MUQA 2OCUA 2V25A 1HSEA 1P1OA 4H1XA 5I2KB 1J1NA 3TCFA 3DP6A 2DE3A 2ESNA 3DP4A 4NWDA 3UIFA 5A5XB 2Q2AA 4ZZEA 4IGRA 2F36A 1A8EA 2O84X 2HAVA 3SETA 1AL3A 4ZE8A 3MWBA 3SKPA 4BDLA 3FVGA 1S50A 4LZ8A 2F6GA 3OO7A 2Q9TA 1OMPA 2FNCA 2UYEA 4BDMA 1ATGA 1DPPA 1FQBA 2I0CA 3O29A 3FZVA 4NF8A 3H03A 5JEIA 2H4IA 3TMGA 5K2XA 4DDDA 1OVTA 4F1UA 3PMVA 4F3SA 4DCYA 2P2AA 4AB6A 2XXHA 1NKXA 5I2NB 3SEUA 2R6GE 1QUIA 2QS2A 2ZXTA 3MJNA 4G8HA 4RYAA 4IY6A 4NTLA 1MQIA 1IXIA 2ABHA 1S9TA 1FTKA 3TDJA 1A54A 4OVJA 3HN0A 5AA2B 3PD8A 1URSA 3KG2A 4GRKA 2I3VA 4YMAA 3FXUA 4ISUA 1MPBA 3K0VA 4P11A 2DVCA 2RC7A 2B65A 1SD3A 4QF9A 5CBSA 4F18A 1Y4CA 1P1QA 3K02A 1H45A 1FTLA 4XKQA 4OFJA 4EXLA 2OBGA 3RGYA 1QKBA 3G3IA 4QFOA 3DELB 3TTMA 3TELA 4KHZE 2XX8A 4NE4A 1A55A 1LCFA 3K2DA 3G3JA 4QSEA 1I69A 4U21A 1FTOA 4LQ5A 2R9JA 3PUZE 1FCKA 3I3VA 1OQHA 1FQDA 1VFDA 3IJOB 2NXOA 3QUJA 3Q26A 2Y7IA 3OEKA 3M3KA 4XXUA 1POY1 4I9DA 3GXAA 3N94A 2V3QA 2XD3A 1Z7ME 2E0SA 1PDAA 5H8FA 1JETA 1NFTA 5AA4B 1M5CA 3L6GA 4I8CA 3HHFA 4GFRA 2F7AA 4YAHX 3N6UA 4LONB 4YKIA 4ZE9A 3H4ZA 1O63A 3JYRA 3LSLA 3T9HB 2FYIA 2ZYKA 3R6UA 1B1HA 5I56A 1FTJA 4JSOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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