3M3FA

Pepa bound to the ligand binding domain of glua3 (flop form)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3fA02
3PU5A 4XTCQ 2YPNA 4DE8A 4G8MA 5I57B 1EZOA 3M3KA 1A55A 3O28A 1N0TA 1POY1 4R9FA 3L6GA 2YLNA 4RY1A 1XS5A 1A8EA 2PT1A 4KYEA 4RK9A 3ZSFA 2IA4A 4L17A 4F18A 2I48A 5AE4A 4PFYA 4R73A 5H8FB 2IEEA 1DPEA 5KDTB 4U1ZA 3SESA 1WDNA 2HAVA 3W15C 4R6HA 3S9EA 3C9HA 4F39A 3O29A 5EHSA 2GHBA 3HHGA 5CI5A 1EU8A 2DXRA 4BDQA 4PE5B 2XHDA 3K6XA 3VV5A 1B4ZA 3U94A 1CB6A 3KOSA 2I0BA 1B32A 1MY2A 1XVXA 4Q5TA 4N07A 2X26A 2UYFA 3T66A 3RT8A 3G3JA 4XIGQ 5EHMA 2G93A 2R9JA 3MAMA 4ZECA 3IX1A 5J1DA 1FTLA 1Y9UA 3UORA 2H99A 3Q25A 4GD5A 4O3AA 4P0GA 2ZXTA 2O68A 1R1NA 1JEVA 4JB7A 4LZ5A 3U1OA 3TCGA 1Y3PA 1QUJA 4OQOA 3K1NA 3EHUA 3KOTA 4LATA 1MPBA 4R6YA 2Z22A 5L9OA 3JZJA 4QFPA 3Q26A 1VFEA 3K4UA 3G3FA 2DOJA 3RQTA 2BJJX 3USDA 3DLNA 3RT6B 4WEPA 2XX9A 1MQIA 2OLBA 3UGWA 5H8NA 1MPDA 1XC1A 1MQJA 3R7XA 5AA1A 3RPWA 1H3DA 4POXA 1SI1A 3H6TA 4YKKA 3GBAA 3T9VA 1NNPA 4DCYA 3PPOA 3E3KA 3K1PA 2Z8DA 3PUWE 2HAUA 4OFLA 4YB5A 3KEIA 1LB8A 2F6GA 2NUVA 1LGBC 3GBBA 4U4SA 1TT1A 4ELOA 1N3XA 1TWYA 4X1BA 3PPNA 3K01A 1T0KA 1IIWA 3OO6A 3MWBA 4NF4B 4G8HA 4NEDA 4UA8A 1D3KA 2I58A 4H6DA 1UTBA 4KD5A 3VXCA 3SEVA 2O7IA 2THIA 1ZTYA 1FW0A 1Y4CA 1NH8A 4FE8A 3LSFB 1N84A 1Y20A 4MFIA 4OETA 4NTLA 4FAJA 1WODA 4THIA 4G68B 3DP8A 3FV2A 1I6BA 2DE3A 1DMBA 1MXZA 4M4GA 2DS9A 2M8CA 4Q30B 4QF9A 3BFUA 1RKMA 1RYOA 3TMGA 3OO8A 1ZBMA 4QFKA 2AL4A 1LCFA 4KFQA 3TQWA 4EQ9A 1US5A 3SEXA 5KCJB 1B51A 5CMBA 4GVOA 2AIXA 2PMSA 3IOVA 3MZBA 1ZU0A 3QK6A 1BKAA 1YTVA 2I6EA 3V83A 1EH3A 1BLFA 3ONMA 1UIVA 1SQYA 1JEUA 1HSEA 2LAOA 1I69A 5CMKA 3E9XA 5I84A 1B3HA 1VE4A 4RK2A 3KZGA 2RF1A 1B52A 4H8JA 4TLMB 2O6AA 1GGGA 3N6TA 1DSNA 4H5FA 4YMAA 2ZNTA 2D5WA 3LR1A 5DVJA 3TTRA 4E0WA 2P0SA 1QVSA 2Q88A 4QHQA 1B1XA 3PUYE 5AA2D 1A54A 3TTLA 4U4XA 2G29A 4RPOA 1XVYA 1QUKA 1VR5A 4HCWA 2O84X 3H3GA 3P7IA 3C31A 5ITPA 1IXGA 4LUBA 1PBQA 4QFNA 3I6VA 4EUOA 1B40A 3H4ZA 4Z0IA 3RLFE 2P1SA 1SW5A 3TDJA 3TUSA 1CE2A 2XXXA 4EF2A 5FHOA 4WXJA 2XXTA 3H6WA 2QL3A 3EHSA 2REJA 3HN0A 5K2YA 1NKXA 1SYIA 3Q27A 3FXQA 3T9HB 4NF5A 4JWOA 5CMMA 3VVDA 5DT6A 3U93A 3TCFA 4ZE9A 1QKBA 3O66A 3V89B 3K0VA 1MQDA 1B58A 1JETA 3VFJA 2DYXA 3OMBA 1LCTA 3MW0A 4NMYA 4ZEFA 4KCCA 3B6TA 3CSBA 1N7WA 2DVZA 4NF8A 1FQAA 3SERA 1RYXA 4GXSB 2NOOA 3MZ1A 2F7AA 1FTMA 3AXFA 1ZMGA 3ODBA 4XXUA 1VSOA 3A3CA 5H8NB 1LBBA 2B3BA 3PMXA 4IB2A 4F29A 3SEWA 1ANFA 3H7MA 1MDQA 3ILTB 4G4PA 4XKQA 2Z8FA 3TTNA 2ZYKA 3PPQA 4F1YA 4GRKA 2F34A 4DLDA 3T93B 1R6ZA 3PUZE 3F11A 4OENA 3ZS6A 1DOTA 3CRBA 4ELRA 3BKIB 2DXYA 2FA7A 4IO6A 4U2RA 5ELVA 2P2AA 1N7XA 3FVKA 3E4RA 4GOTA 1GR2A 3FJMA 4FORA 1Z7ME 2ALUA 3H6VA 1XOCA 3QUJA 1B5IA 3CSGA 4QFOA 1UTBB 4HTGA 2OK2A 4R72A 1QJMA 2UYEA 5I56B 5IKBA 3TTKA 2VOZA 4FEDA 3PD8A 1PEBA 4H5GA 1O63A 4H0WA 2RC8A 2Q9TA 2F6PA 2Q89A 3IB2A 5H8SA 3RGYA 2CZLA 2QS2A 3PGFA 3FD3A 5K2XA 5ITOA 3W9WA 1FQEA 2WKYA 1Y3NA 3KGCA 3E13X 2OWTA 5TP9A 4LZ8A 1FTOA 3MVYA 1P1NA 2AL5A 2DE2A 3ZKKA 5I2KA 5I2NA 1YCJA 3N94A 1QW0A 4WEDA 5A5XA 3KN3A 4IO3A 4JXIA 3G3HA 3EN3A 4NWCA 1MDP1 2I4CA 4GQOA 5F7VA 1MXVA 4I8CA 5LOMA 4FEBA 1PBPA 3MBPA 1MY4A 3DM0A 3KN7A 5AA4A 1IZ1A 4RXLA 3H6UA 3LSXA 2VD3A 4F1UA 4ESWA 5TPAA 1MG1A 2PX1A 4BLAA 2B65A 1Y4TA 2X7QA 2OJTA 4EF1A 2VP1A 3TKDA 1LB9A 5B70A 4QSDA 4KYSA 1FQFA 3C32A 3VLWA 2A5TB 2NVUB 1SVXB 1N04A 3CG1A 3M3LA 1SW1A 3PUXE 2O69A 1M5EA 4KCDA 2XD3A 3TAJA 4LONB 1B3GA 4R6KA 2XXHA 3IK6B 3IJXB 4ECFA 1S50A 4ND9A 4XKRA 4XKPA 4IY6A 3ZKLA 2OCUA 2R71A 1QULA 3OO9A 5ISUA 1P1UA 3B7DA 3U92A 1DTZA 4U1OA 1Q35A 2NXOA 1AIVA 1BIYA 3K2DA 3OEMA 4DXBA 2ZNUA 3IOWA 3IL1B 2Y7IA 1OVTA 4N13A 2DWAA 3KBRA 1B9JA 3N6UA 4X9TA 5AA2A 2F8DA 1A8FA 4M1VA 4Q0CA 1S9TA 5H8HA 4TLLB 4RYAA 3IB0A 4ZZEA 3WAEA 3O2AA 2ABHA 4UACA 2REGA 1B3FA 3PPPA 3FUZA 3G7WA 4G77A 4NF5B 1JNFA 1A40A 4ZDMA 4GFRA 3MVZA 3DELB 2F7BA 4OTEA 1B5HA 1LAGE 1VFDA 4TOZA 3PV0E 1A7LA 2RC7A 1FTKA 2Y84A 1OVBA 1OMPA 1B7ZA 1IXIA 4ESXA 3OXNA 2W7YA 2Y7KA 1MH3A 4R9GA 5DYHA 1ZKBA 5JEIA 4BDNA 1B6HA 2DWIA 4KPTA 2V3TA 5DEXA 4G8NA 4NF8B 4OWDA 3O9PA 2Y7RA 5HM4B 4I1DA 4BDLA 3CFXA 2XXWA 1OIBA 4JWYA 3HPIA 3IAZA 4OFOA 3U72A 3C35A 5KZTA 2V84A 1SW2A 3C36A 1H43A 2PYYA 3IJOB 2HZKA 2H9BA 1IQ7A 5CBRA 5DTBA 3ILUB 4DZ1A 2VD2A 1B46A 3QYTA 3VVFA 2DSFA 3QIMA 4OYVA 1M5FA 1UTHA 4MLVA 1D9VA 3K02A 3S4UA 3SDFA 4EXLA 3H03A 4LP2B 1QKAA 5L9SA 3FVGA 4GLIA 4O3BA 2VGQA 2HFBA 3FVNA 1ZIUA 2GFEA 1NNKA 3KSJA 1B7HA 2HXWA 1MH4A 3UA8A 1B05A 1H76A 2B3FA 3PD9A 1DPPA 2XXRA 1MQGA 2O51A 1US4A 1PB7A 1NNFA 5TP9B 4MBPA 2YJPA 5I2NB 5L8DA 5KDTA 1EZPA 3KG2A 4IO4A 4AQ4A 1R9QA 3U8QA 4R74A 2O1LA 1TXFA 2VHAA 5CMCA 4R2BA 1Y1MA 4PETA 5AA4B 5ICQA 4DCXA 4LQ5A 3FATA 1F9BA 3KFMA 1AOVA 1PDAA 1P1WA 3JV9A 4R2FA 1HSJA 5TPAB 5ICTA 3CVGA 1LFIA 3VE1B 1MXUA 4I62A 1BTJA 1USYH 3UK4A 2UXAA 3OOAA 3UN6A 1KWHA 3CFZA 1R9LA 2KLFA 5CM6A 4EDPA 1TFAA 1URDA 1LFHA 3OSQA 4E0XA 2D3IA 2UVIA 5BWJA 4ELPA 1XT8A 4FECA 1Y1ZA 2XX7A 4PFTA 3D4GA 4KQPA 1HSLA 2FNCA 1NL5A 5M2VA 3IOUA 1J1NA 1JVXA 1B3EA 4FIMA 5IAIA 3OSRA 1NMUA 3VDFA 5AA2B 4G2ZA 1H44A 3MPLA 4HW8A 4GIZA 3HV1A 1MPCA 5H8HB 4ZEDA 5JTYA 2QS1A 1LAXA 1JQFA 1Q1KA 1SDXA 3OENA 5CRYA 1MM6A 2H25A 3TFLA 2XXUA 2RINA 4F3GA 2FYIA 3MC2A 4QSEA 1II5A 2OWSA 4LQ2A 4IO7A 3UP9A 1SYHA 2X7PA 3OELA 3CR9A 1B0LA 1BP5A 5DEXB 3A3UA 4C1TA 2UVGA 4K3FA 2Q8JA 3L6HA 4JSDA 2ZYNA 4MF3A 1MXYA 2I4BA 4X48A 3B6WA 3LBSA 1FTJA 1EZ9A 3MUQA 4KI0E 4AB5A 4ZZAA 4OVJA 2F97A 4GL8A 1ATGA 4P0IA 3C34A 3VVEA 1MM7A 5HBCA 4F2OA 3IO4A 3N26A 1NFTA 3S9MC 3S2VA 1UTHB 3B6QA 5JK4A 5TU0A 3BFTA 1FQDA 2ZYOA 3FVOA 1GV8A 2DE4A 3LSWA 2Y7PA 1N76A 4AB6A 3G3KA 1QUIA 3TYHA 3HCQA 4JSOA 3MP8A 1LFGA 3ECRA 2RCBA 2AYSA 3WAFA 3VLVA 4FJPA 2V93A 1P99A 3RTWB 2PBWA 4EQBA 2R6GE 4OESA 2QJEA 2I49A 1B7UA 4P11A 1O64A 4YKIA 2F5XA 4BDMA 4ZEKA 2QMWA 3V8XB 4BDRA 2XXYA 2ESNA 1URSA 3IOTA 1M5DA 2ZNSA 5EYFA 2OBGA 3KSXA 2ZYMA 4PQJA 5CBSA 3QXMA 4JWXA 2RCAA 3MP1A 4NE4A 1L5TA 4IGRA 4ZS9A 5FHMA 3MP6A 3LC8A 4JDFA 5I58A 4GL0A 1OQHA 2RKMA 3I3VA 1N3WA 2XD2A 1IXHA 3M3FA 3KJTA 1JW1A 3HSTA 4GXAA 2NWJA 3R26A 4HS7A 4OFJA 1B2HA 3O6GA 2Z8EA 1YAEA 2UVJA 1AL3A 2XXPA 4DDDA 4RPNA 4N6PA 3SEYA 5I59A 3CIJA 2PT2A 3MQ9A 3W9VA 5DVFA 4BDOA 3TODA 4RNSA 3MVWA 3PMWA 1PB9A 3M8UA 3IR1A 3MZ9A 1O7TA 1PC3A 1ZJLA 1B3LA 1JW4A 3C33A 4OEVA 1POTA 4X1DA 1WVJA 4GWOA 1SW4A 3O97A 3TTMA 2DWJA 4ZE8A 1OLAA 3TQLA 5H8QA 3GZGA 4Z7EA 1S7YA 2QS4A 2I3VA 1LLSA 3RTFB 3THIA 3LUYA 3JYRA 2E0SA 2F78A 1YPNA 3SETA 1FCKA 3N5LA 3Q29A 2O1MA 1I6QA 1MRPA 4NF6A 4PFWA 3KJ7A 3MPKA 3EPEA 4H67A 5JTYB 3MVXA 3S9NC 1OLCA 3TELA 4QSCA 4WKMA 2DQVA 3V5AA 2QRYA 2D21A 2H4IA 3HHFA 5DVIA 3EHTA 1LAFE 2XXVA 3FXUA 4KR5A 4LA9A 1PB8A 2H98A 3TPAA 5FHNA 1IITA 2GHAA 2ONSA 4H65A 3C4MA 1LAHE 5BUUA 2XX8A 3PUVE 3T9UA 3HO7A 3CFLA 5I56A 4F3PA 3G3IA 3IB1A 3S9LC 1IEJA 4IO2A 2Q2AA 2HEUA 3K00A 3MJNA 2I0CA 2ANJA 3IO6A 4F3BA 4U21A 4TQUQ 3TEPA 2HQ0A 4C0RA 1I6AA 1AH5A 3DP4A 2V3UA 2XXIA 1Z7NE 4OXVA 4F1VA 3TCHA 3UIFA 2UVHA 1JW5A 2HZLA 1GVCA 5I57A 4C1UA 3FZVA 1MXWA 5FTHA 2F36A 3RUMA 1IXCA 4H1XA 4RJZA 4IGTA 3QAXA 1D9YA 4I9DA 4LZ7A 4FATA 4ONYA 3EF7A 4YAHX 5H8FA 4OMBA 2DWHA 2O7UA 3T9XB 5I2KB 5A5XB 1OQGA 4MH5A 4EQ7A 3FIRA 4PFUA 1USYE 4OERA 3CI8A 3FXRA 2ONRA 2XXQA 2Y7WA 4YZZA 3R6UA 4OZ9A 4NWDA 2H5YA 1B0HA 3PPRA 1URGA 3FASA 5FTIA 1H45A 4KYDA 1MY0A 3SKPA 1B4HA 1M5CA 2A5TA 1M5BA 4ZEIA 5B7DA 3G3GA 4O3CA 1P1OA 4IO5A 4POWA 2ONKE 4IY5A 4DXUA 3FV1A 1MY1A 1D4NA 3K1MA 4QRZA 2RC9A 4OEUA 3A09A 1NNTA 4F19A 3OD7A 5L9MA 4YKPA 5I58B 2QPQA 3VXBA 1ELJA 4DIGA 1SI0A 3TZAA 5HPQA 2OZZA 3I5OA 2V3QA 1ZLQA 4YMBA 3K6VA 5CC2A 1FQBA 3RNNA 3OEKA 2GH9A 1SD3A 1UIUA 1MQHA 4R75A 5I59B 4LVQA 3GLBA 4QFLA 3DP6A 2HCAA 2Q2CA 2DP8A 3O6HA 3CG3A 2QSXA 3O6IA 3BBRA 3T96B 4EXKA 3FGSA 1Y3QA 1IUDA 1MS7A 1GTKA 5F1QA 3RN8A 3RY3A 4DXCA 4YKJA 4ISUA 1AMFA 1MXXA 2QMXA 4GF8A 2GRVA 5H8QB 4XKNA 4F22A 1SBPA 4YB7A 3Q28A 2I3WA 1MY3A 2ZMBA 1A99A 3OO7A 1LSTA 4F2QA 1XHYA 4PP0A 4H8IA 4ELQA 2A5SA 4NF4A 3K6WA 2E1SA 2Z23A 4NF6B 3D4CA 4YICA 3PMVA 1FQCA 4F31B 1LBCA 4MLQA 4YB6A 4Q8RA 4U22A 2F7CA 3KN8A 4F3SA 2V25A 2PVUA 1TFDA 4G68A 1B1HA 4JBZA 3LSLA 3QSLA 3H06B 1NH7A 4KHZE 2DVCA 3FJGA 3GXAA 1JVYA 3SEUA 2F35A 1DTGA 4ZEBA 5KCJA 1B5JA 1P1QA 4RA1A 2CMOA 3IORA 4OHNA 4YU0A 5AA3A 3T22A 4HCYA 3QUFA 3VLUA 4U23A 4G68C 3K6UA 3FJ7A 3EQ1A 2QS3A 1UQWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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