3M3KA

Ligand binding domain (s1s2) of glua3 (flop)
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of flop selectivity and subsite recognition for an AMPA receptor allosteric modulator: structures of GluA2 and GluA3 in complexes with PEPA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-03-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3kA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3m3kA02
4YB5A 5CRYA 5DEXA 3KOSA 3H6UA 3KGCA 2HFBA 2XX7A 3T9VA 3EF7A 5B7DA 4ZE9A 1MY4A 1L5TA 1PB7A 2O1LA 3OO9A 4RPNA 3I3VA 4EQ7A 1S50A 1YAEA 2D21A 4GXAA 4JB7A 5JK4A 3MPLA 5IAIA 3G3JA 3TKDA 2E1SA 5DVIA 3HSTA 2I58A 3QUFA 3TCGA 2QJEA 5I2NA 1MM7A 1MY0A 3KN8A 4EXLA 2O7IA 4THIA 2DXYA 4RPOA 2QS2A 2XHDA 4DXUA 1JVYA 3ZSFA 1DMBA 2E0SA 5EHMA 2VP1A 4ELQA 2I0BA 4JWXA 4DE8A 3N26A 3B7DA 1LLSA 4FEDA 3OXNA 3T93B 1IIWA 1GTKA 2XXWA 3FJMA 4DIGA 1OMPA 3FD3A 2F34A 4U1ZA 3SEUA 1IEJA 3M3KA 4OXVA 3U94A 4P0GA 4DCXA 3EHTA 3V5AA 1MM6A 2Q2AA 1P1QA 2RC8A 1Y4TA 1ELJA 4OZ9A 5CBRA 4FATA 2AIXA 4H0WA 3O9PA 2RCBA 5AA3A 1JQFA 4JWYA 4R2BA 4KR5A 1UTBA 3VE1B 3TEPA 1JW5A 4DDDA 2F5XA 3IB1A 3KN7A 3KJ7A 3Q28A 3P7IA 5H8QA 1B9JA 3HCQA 1BIYA 3TPAA 2XX8A 1A99A 3PD9A 1B4HA 3GBAA 5AA4A 1QKAA 4GD5A 3VFJA 3MZ1A 4ZEIA 4I9DA 4JWOA 4POXA 1AH5A 4O3CA 1XT8A 2H5YA 2DYXA 3H4ZA 4FEBA 4LQ2A 1B7HA 4UA8A 1ZMGA 3N6UA 3IOUA 1AMFA 5TP9A 3MAMA 1BLFA 1Q35A 3FXUA 3DP8A 1B46A 3EPEA 2O51A 4HCYA 5CMKA 2ZXTA 2UXAA 4MF3A 3O66A 4F18A 4XKQA 3T22A 1Y3QA 5FHMA 4JSDA 4H8IA 5I59A 3I6VA 4EF1A 3QUJA 3RT6B 3G7WA 1I6BA 4EF2A 2DP8A 2I4CA 1QJMA 1SD3A 3SESA 5BUUA 3IOTA 2DOJA 3KBRA 3B6WA 4OMBA 3SEXA 3VLUA 4JXIA 1H3DA 2IA4A 4ZECA 1XVXA 3H03A 1B3LA 3FUZA 3OO7A 1EZOA 1B40A 4FAJA 2REGA 4GOTA 4H67A 1N84A 3KJTA 5I57A 3C35A 5FTIA 4EQBA 4HW8A 2DE4A 2AYSA 3O29A 3N6TA 3MP1A 4G77A 2HZKA 5I2KA 4IB2A 5DTBA 1IZ1A 2XXUA 3UGWA 2A5TA 1QULA 1GV8A 2VGQA 2Q8JA 5L9MA 4Q30B 2THIA 4GL8A 3GXAA 4H65A 1QVSA 3RY3A 5L8DA 5AA2B 3QIMA 1B52A 4H5FA 2RC9A 4G8MA 3KFMA 4GWOA 4LATA 1NKXA 3KSXA 1T0KA 2RF1A 5B70A 3TZAA 4NF8A 1EZ9A 2REJA 3Q26A 3DP4A 3Q29A 2Z22A 3T9XB 1B6HA 3PUZE 5AA2D 2F6PA 3PPOA 1B7ZA 2UVGA 3RNNA 2P1SA 2KLFA 3LBSA 3RTFB 3RGYA 3C36A 3VVEA 4WEDA 2D3IA 3L6HA 4LUBA 1XOCA 4F29A 5TU0A 3HO7A 5DVFA 1ZKBA 4AB5A 3TFLA 4XXUA 2I6EA 3U72A 3MUQA 4IO7A 1Y1ZA 4XKNA 4RY1A 4LVQA 3K0VA 4AB6A 4NMYA 4RK9A 1IXGA 4C1UA 3IO6A 3V83A 4FORA 2HQ0A 1POY1 1D3KA 3LSXA 1B5IA 1S7YA 3FXQA 2QS1A 2RC7A 1SQYA 1SVXB 4G68B 2AL4A 1LSTA 5H8NB 2F7BA 3BKIB 4E0WA 1FQBA 1MDP1 1P1OA 1NL5A 3IB2A 1MH4A 4PETA 1MPCA 1MQJA 3MJNA 5H8FA 1Y3NA 2UYEA 1VE4A 4F31B 4ESXA 3JZJA 1A8EA 3O6GA 1B5HA 3K02A 3MZ9A 1QUIA 5TPAB 1LBBA 1SI0A 3G3FA 1O63A 1OQGA 2F8DA 3IR1A 3KOTA 4YAHX 1Y1MA 1SYHA 4OYVA 4NF6A 3K6UA 5KCJA 3SDFA 1SW4A 1DOTA 1EU8A 4KD5A 4X48A 4ZEBA 1FTMA 1LAHE 3KSJA 1Z7ME 5ITOA 1XVYA 1LAGE 1URSA 3ECRA 2H25A 4Z7EA 2R71A 2VOZA 4G68C 5M2VA 3GLBA 3IO4A 4DZ1A 2Q89A 4N13A 3C32A 4F39A 4OEVA 4ONYA 3MPKA 4YU0A 4QSEA 4R9GA 1UIVA 4YKKA 3WAEA 1EZPA 4LA9A 3MP8A 4H1XA 4F2OA 3EHSA 4R72A 5ICQA 2VHAA 4RJZA 2VD2A 1RYXA 3MQ9A 1FTKA 2I3VA 2P2AA 1MQDA 3FV2A 1J1NA 5I57B 2ZYKA 4U23A 3CG3A 3VV5A 1ZU0A 2CZLA 5H8HB 3HV1A 3DP6A 4BDNA 1NNTA 3MZBA 4QSDA 1QUJA 3PV0E 1WDNA 2A5TB 3KZGA 4XKRA 1FQFA 1FTLA 1LAXA 2HCAA 3MP6A 4F1VA 4TLMB 3S9NC 2XXIA 3GBBA 4U4SA 2NWJA 4R6KA 2V3QA 1UTHA 2XXYA 4QHQA 4XIGQ 1VFDA 5A5XB 2O68A 4GF8A 4O3AA 3RLFE 2PMSA 4PP0A 4U1OA 3RQTA 4M1VA 3OOAA 3IX1A 1KWHA 1MS7A 2Y7PA 3KG2A 4GRKA 1II5A 5K2YA 4ESWA 3LSFB 4MBPA 4F3SA 2I49A 1WVJA 5ELVA 5F7VA 4DCYA 1NNKA 2D5WA 3MVWA 3T9UA 4U22A 1JW4A 1BTJA 4YMAA 3S9MC 3CSBA 2Z23A 3A09A 3FATA 2ABHA 3CFLA 1LFGA 2Y7WA 3TUSA 3K1MA 1SYIA 5I56A 3S4UA 3FVOA 4JBZA 2XD3A 1PB9A 3U8QA 1PC3A 2DWHA 1QUKA 1MXVA 1B2HA 4R9FA 1ZIUA 1A55A 2OZZA 3U92A 2Q88A 4PFUA 3R7XA 3ILUB 4KCCA 3MC2A 3K1NA 4PQJA 1US4A 5CMCA 1TXFA 1P1WA 5I58B 2UVIA 4OQOA 2V3UA 1NH8A 2DE3A 1P1UA 4NF4B 4X1BA 4LONB 1JW1A 2OBGA 1EH3A 1ZLQA 3M3LA 4DXBA 2BJJX 4NWCA 1MQGA 1OLAA 4GXSB 2Z8FA 2X7PA 1GGGA 3DM0A 2H9BA 3BBRA 2QSXA 2GHAA 4QFNA 2W7YA 1M5BA 4LQ5A 3G3KA 3RUMA 1UIUA 3GZGA 2NVUB 1H76A 4TOZA 5JTYB 3SERA 1USYE 3PMXA 4RNSA 5IKBA 1F9BA 3CR9A 4RYAA 3ZS6A 1B5JA 3V8XB 1A54A 4NE4A 3UK4A 1NFTA 2OWTA 2OWSA 3UIFA 1PDAA 2Z8EA 5DEXB 4E0XA 4U2RA 4KYDA 4KI0E 1B0LA 2O1MA 1MXYA 3UN6A 3OELA 4OFJA 1JNFA 1MPBA 4OETA 3G3HA 2B65A 3R26A 4GFRA 4POWA 2ZYNA 2HZLA 3ZKLA 4N07A 2FYIA 2H99A 1VR5A 5I2NB 3RN8A 1URGA 2IEEA 3T66A 1UTHB 1XC1A 2I48A 3LC8A 3OEMA 4ZZAA 3A3CA 1OIBA 1B1XA 3TDJA 3H6VA 3IJOB 1Y9UA 3T9HB 3ODBA 3Q27A 2GHBA 1XHYA 2O69A 2XXRA 3IL1B 3MWBA 3UORA 1P99A 3N94A 3K01A 3B6QA 1B7UA 1ATGA 1B05A 3PUWE 4QSCA 4G4PA 1QKBA 1FTOA 3OEKA 1RYOA 3OO6A 4MLVA 3PGFA 3O6IA 1TFAA 1Z7NE 2OJTA 1M5CA 1NH7A 3C34A 1LCFA 1MRPA 3CVGA 2DWJA 3PU5A 3UA8A 1GR2A 3H3GA 2F78A 3E3KA 3K00A 3THIA 2NXOA 1OVTA 1M5FA 3PD8A 4WXJA 1HSLA 3SETA 4G8HA 3CI8A 1FTJA 1B0HA 2OK2A 2V25A 1UTBB 4RXLA 3S9EA 4HTGA 1D9YA 1N0TA 1IQ7A 3TCHA 1ANFA 3R6UA 5H8QB 3VVFA 3QK6A 4RA1A 2X7QA 2R6GE 4Q5TA 1GVCA 1LFHA 4IY6A 1B51A 5AA4B 4NTLA 1H44A 4FIMA 4R2FA 3QXMA 4F22A 4LZ5A 3H06B 2YLNA 2RCAA 1B58A 4PFYA 3IK6B 4KCDA 3K1PA 4ZEFA 3FXRA 1MY2A 2DSFA 4OFOA 1MPDA 3U93A 3H6TA 2XXQA 3W9WA 3CRBA 5TP9B 1LFIA 5AA1A 3ILTB 4NF5A 3BFUA 1N76A 1MH3A 4YICA 3K6WA 4JSOA 4DXCA 1POTA 4O3BA 1TFDA 2Q2CA 1RKMA 5I59B 4IGTA 3VXCA 1CB6A 2ZMBA 3VXBA 4YKIA 4GL0A 3ONMA 3I5OA 3MVZA 4PFTA 2DWAA 1I6QA 2F6GA 2V93A 1NNFA 2AL5A 4MLQA 2Q9TA 4F3BA 1LAFE 4LZ7A 1MXUA 1CE2A 4YB7A 3O6HA 2PVUA 2Z8DA 2DS9A 4ISUA 3G3GA 3E13X 5ISUA 3IJXB 4UACA 3SKPA 4BDLA 4GIZA 3PPQA 3VLVA 1AL3A 3IORA 1IITA 4OENA 3CIJA 2QS4A 4EUOA 2DE2A 2I4BA 1LCTA 4KHZE 2ZNTA 3TELA 3PPRA 1M5DA 2O84X 4QRZA 2XXHA 5CI5A 3WAFA 3O2AA 2PX1A 3TTRA 5LOMA 4QFOA 1FQDA 2GRVA 1TT1A 1MXWA 4OFLA 2QL3A 4GQOA 4HS7A 5I2KB 3PPPA 2PBWA 2O6AA 4HCWA 4EQ9A 4KYSA 3VVDA 3PUVE 4OVJA 1FW0A 4F3GA 3IAZA 5HBCA 3TCFA 5DYHA 1HSEA 4GVOA 3TMGA 3C4MA 1BKAA 4ELRA 4YB6A 3RPWA 5FHOA 4IO2A 2X26A 3RTWB 3S9LC 3CSGA 1FQAA 4IO4A 3HPIA 4C1TA 1M5EA 1MG1A 5JEIA 1N3XA 5KDTA 4H5GA 1IXHA 5L9SA 1PB8A 3TQLA 4BDQA 1ZBMA 1DTZA 1B32A 4I8CA 3CG1A 3K6VA 4IY5A 4NF8B 3N5LA 2B3FA 4IO3A 3TAJA 4U21A 2ONKE 1FCKA 1SBPA 2HAUA 5AA2A 2F7AA 4R73A 4NEDA 2QRYA 3FJ7A 5L9OA 2RKMA 4G2ZA 3RT8A 2F36A 3BFTA 3QYTA 1PBPA 1B1HA 3MVYA 4YKJA 2Y7IA 2PT1A 1SI1A 2QS3A 1FQEA 1SDXA 3MVXA 1B3FA 3W15C 4H6DA 1MXZA 1MY3A 4IGRA 1WODA 1S9TA 4IO5A 4F2QA 4N6PA 3CFZA 2DVZA 2HAVA 3FVKA 2XXXA 4QF9A 3EQ1A 3FV1A 3EN3A 3FVGA 5HPQA 2XX9A 4FE8A 3IOWA 4R74A 1LGBC 2H98A 2Y84A 4M4GA 2FA7A 3M8UA 5AE4A 1Y3PA 3KEIA 2QMWA 5H8FB 4EDPA 2G29A 4Q8RA 1PBQA 4P11A 4OWDA 3S2VA 3JV9A 4G68A 5H8NA 4OESA 2GFEA 5I84A 3PUYE 4PE5B 3G3IA 3TTKA 1YTVA 1YPNA 3HN0A 4NF5B 1YCJA 4ZEKA 5ITPA 3H6WA 4DLDA 4OERA 3TTLA 4NF6B 5TPAA 5KCJB 1A40A 4ZS9A 3A3UA 1OQHA 1D4NA 1XS5A 4P0IA 4ZEDA 2ZNSA 1JEVA 2QMXA 4Z0IA 1OLCA 4OEUA 2XXPA 3L6GA 4GLIA 2M8CA 5F1QA 1Y20A 1LB8A 2G93A 3B6TA 1O64A 5EHSA 3D4GA 3AXFA 2CMOA 4MFIA 5H8SA 3T96B 1NNPA 3USDA 1MQHA 4XKPA 2ALUA 1IXCA 2NOOA 3HHGA 2ANJA 1MDQA 1MY1A 1IXIA 3OO8A 2UVHA 3K4UA 3VDFA 5BWJA 3LSWA 4IO6A 2ESNA 4OTEA 3UP9A 5CBSA 5CMMA 3FASA 4QFLA 4F3PA 4FJPA 3TTMA 2DWIA 2I0CA 2V3TA 3LUYA 5CM6A 4XTCQ 3PUXE 4ELOA 5FTHA 3PMWA 1R9QA 2PYYA 3TQWA 1N7WA 2OLBA 4TQUQ 1DTGA 4I1DA 2LAOA 4YKPA 2H4IA 3H7MA 1ZTYA 2ONSA 2ZNUA 2NUVA 3E9XA 4K3FA 4X1DA 1R6ZA 2RINA 5H8HA 2Y7RA 3SEYA 1H43A 1DPEA 3JYRA 2UYFA 1QW0A 1MQIA 4YZZA 1MXXA 3VLWA 4WEPA 3DELB 4PFWA 2F35A 3F11A 3ZKKA 4F19A 1IUDA 2B3BA 5KDTB 2ZYOA 1B3HA 3FZVA 1P1NA 1JEUA 1LBCA 4FECA 3MW0A 1UQWA 2P0SA 1USYH 5DT6A 3HHFA 1A8FA 3TTNA 5A5XA 3FIRA 1DPPA 4ZDMA 4C0RA 3PPNA 4NWDA 4ZE8A 4BDMA 4G8NA 3KN3A 3K2DA 4R6YA 4U4XA 4Q0CA 4L17A 4ND9A 4X9TA 3Q25A 2HXWA 2F97A 2FNCA 3QAXA 1LB9A 3D4CA 1NMUA 3LR1A 2DVCA 1VSOA 1URDA 2DXRA 1I6AA 3C9HA 1D9VA 1DSNA 1JETA 1JVXA 2QPQA 3DLNA 1O7TA 4BDOA 4WKMA 3V89B 4I62A 5EYFA 3W9VA 5K2XA 2ONRA 1B4ZA 2PT2A 1AIVA 5I56B 3IOVA 3SEVA 3K6XA 4ZZEA 4AQ4A 1H45A 1OVBA 2ZYMA 3OSRA 4TLLB 3SEWA 3PMVA 4KQPA 1BP5A 3OMBA 5HM4B 3TODA 3E4RA 3OSQA 4BLAA 3OENA 4R75A 3C33A 1N04A 2YJPA 5FHNA 3O28A 3FJGA 1R1NA 2YPNA 2O7UA 5DVJA 1Y4CA 4EXKA 4QFPA 2R9JA 2V84A 3MBPA 2GH9A 1Q1KA 4KPTA 2I3WA 2UVJA 2Y7KA 2VD3A 3OD7A 4YMBA 3O97A 2XXVA 2XXTA 3LSLA 3QSLA 4MH5A 2HEUA 5I58A 4F1YA 3IB0A 4R6HA 4NF4A 1N3WA 1B3EA 3C31A 4KFQA 1I69A 3EHUA 4QFKA 1PEBA 1SW5A 2OCUA 2F7CA 5CC2A 1US5A 4LZ8A 1SW1A 4F1UA 1N7XA 2WKYA 1R9LA 5KZTA 4LP2B 4ECFA 1HSJA 4OHNA 3M3FA 3CFXA 2DQVA 3TYHA 3FVNA 1AOVA 3U1OA 1TWYA 1VFEA 1B3GA 3FGSA 5ICTA 5J1DA 4RK2A 2A5SA 4H8JA 5CMBA 1ZJLA 5JTYA 4BDRA 1SW2A 4KYEA 4ELPA 1FQCA 1A7LA 2XD2A 4JDFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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