3MUQA

The crystal structure of a conserved functionally unknown protein from vibrio parahaemolyticus rimd 2210633
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
233
structure length
233
Chain Sequence
EHVRLATTTSTYHSGLLDYLLPQFEKDTGYKVDVIAAGTGKALKMGENGDVDLVMTHAPKAEGTFVEKGYGVLPRKLMYNDFVIVGPKADPAKIKDDESVLDVFKEIANKNATFISRGDDSGTHKKEMGFWAQTKIEPNFGGYRSVGQGMGPTLNMASEMQGYTMSDRGTWLAYQNKLDLEILFQGDEKLFNPYQVILVNPERYPTINYQGAKAFSDWLVNPRGQELINGFRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure of a conserved functionally unknown protein from Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633
rcsb
molecule keywords uncharacterized conserved protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Vibrio parahaemolyticus
total genus 77
structure length 233
sequence length 233
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3muqA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3muqA02
2VOZA 3T9XB 3M8UA 1R9QA 1VFDA 1B5IA 5I2NB 4TLMB 3KG2A 4POWA 1LCFA 1SW1A 2PT2A 1EU8A 2F7AA 3ONMA 4FAJA 5I2KB 1JVXA 1B3FA 2FA7A 1FTKA 5CMCA 5I56B 3OEKA 1SW4A 5J1DA 4IGRA 5I58B 2HXWA 5ELVA 3WAEA 3QUFA 2UVGA 1DPPA 4LA9A 3TTLA 4OVJA 1I6QA 1MPBA 3USDA 4KYSA 1LAHE 3VVDA 4U22A 2R6GE 4E0XA 4KPTA 2ZXTA 4LZ5A 5FHOA 3QUJA 1KWHA 1LCTA 1A7LA 2DWJA 2F78A 2Q89A 1AIVA 1Z7NE 5L9MA 5CC2A 3IOWA 4ONYA 2XX9A 5B7DA 3E13X 3I6VA 5KZTA 3PPQA 3O6GA 2Z8EA 3UORA 5HPQA 4NF6A 2RC9A 3D4CA 4IO5A 5K2YA 3K6VA 1IQ7A 3JV9A 4DXUA 3TTMA 2XXTA 1RYOA 3K01A 5BWJA 1UQWA 1PB9A 1FCKA 1XS5A 3IOVA 2QL3A 4X48A 3THIA 3OO8A 1B3HA 1CE2A 3JZJA 1N76A 1Y1MA 1H76A 2DWHA 2YPNA 5CI5A 5CMBA 1ZLQA 5H8NB 3SERA 2I0BA 4THIA 5EHSA 4NF8A 3TYHA 4TOZA 3W15C 3CG3A 3OD7A 3RLFE 4DE8A 4OETA 1TXFA 2F8DA 4MH5A 2I3WA 4OMBA 1CB6A 5HM4B 4EQ9A 1QW0A 2DVZA 4NF4B 3G3JA 1AMFA 4I1DA 5DEXB 4QSEA 4BDMA 5I59B 3C31A 4YZZA 2H98A 3FJ7A 2M8CA 4R9FA 1LAGE 1ZMGA 3N26A 3OELA 3OMBA 4RPNA 1M5DA 4JWXA 4OERA 3BKIB 4R9GA 1AOVA 1FQAA 2F35A 3LBSA 4H6DA 1H43A 3QIMA 4BDQA 3C34A 4QSCA 3O66A 4FECA 2QS3A 1XOCA 4KI0E 3IK6B 3CR9A 3CG1A 4GF8A 2REGA 1SD3A 1N7WA 2HAUA 2P2AA 2A5TA 1SDXA 4E0WA 1QUKA 4EF1A 1FQEA 1Y1ZA 3LUYA 2ZYKA 3QAXA 4I8CA 3H03A 3K6WA 1URSA 4XKPA 1JETA 5CRYA 4R6HA 3MZ1A 4OYVA 3AXFA 4IY6A 3TFLA 3RQTA 3KN7A 3FJMA 2XXXA 4UACA 3V5AA 4RK2A 3TCGA 3A09A 4G68A 5CBRA 1B3GA 4WEDA 5H8FA 2F7BA 2Q8JA 2O7IA 3PD9A 1JW5A 4IO3A 3KBRA 1QJMA 3IB1A 2B65A 2GFEA 3B6TA 1Y4CA 3N6UA 4DXBA 5LOMA 5FHNA 1OQGA 4DLDA 1NH8A 4ELPA 1A8FA 2G29A 1I6BA 3KJ7A 1JVYA 1MY1A 2I4BA 3M3LA 2HAVA 4PE5B 3VDFA 1M5EA 3KSXA 1GGGA 3R7XA 2ANJA 4F2QA 4F1VA 4OHNA 3TCHA 2PBWA 4NF6B 3MVZA 4FEBA 4ZE8A 2CZLA 3UN6A 5I2KA 3E9XA 3C32A 2UYEA 1WODA 2THIA 4R75A 2FYIA 5CMMA 2DVCA 1DPEA 3S9NC 3GBAA 4DXCA 1PEBA 3C36A 4FATA 1B1HA 1DOTA 1RKMA 3SEXA 5K2XA 5ICQA 3PV0E 1LB8A 3G7WA 1EZOA 4HTGA 1FQDA 5TPAA 4NF8B 4QFPA 1IUDA 1TWYA 3LSFB 4RNSA 4YICA 2X7QA 3PMXA 2Q2CA 1P1UA 2F5XA 4G77A 2DWAA 5CM6A 1B52A 1R1NA 1VE4A 2ESNA 1US4A 4GL0A 1NL5A 5TU0A 1ZKBA 1N84A 1XVXA 3HN0A 3FXQA 2Z23A 1MPDA 3G3GA 3N6TA 1B1XA 1S9TA 3IB2A 5L9SA 3G3HA 3HHFA 4XTCQ 4ZEKA 1NNPA 3KEIA 3WAFA 3H06B 2OJTA 1VSOA 4HS7A 1TT1A 3LSWA 5F1QA 3IORA 4YB7A 1R9LA 3PUZE 2DWIA 3HHGA 3MW0A 3GXAA 2NXOA 2REJA 3T9HB 3TUSA 1LBCA 2F6GA 3K6XA 2HCAA 4QHQA 4MLVA 2A5TB 3EQ1A 5EHMA 1A40A 3GBBA 4F29A 1ATGA 3KN3A 4ND9A 4EF2A 4DCXA 3KSJA 5AA2D 1Y9UA 3G3FA 3H6TA 5DVJA 5JK4A 4F1UA 3MJNA 1PBQA 3DLNA 5AA1A 2PVUA 3KOSA 3S9MC 4U4XA 3EHUA 1EZPA 4DDDA 3N94A 4G68B 2RC7A 4MBPA 4H5GA 4PETA 3T93B 2Y84A 4OXVA 5H8FB 1OLAA 2NOOA 4JBZA 1S7YA 1SYHA 2Q88A 3PMVA 1YPNA 3ILUB 3MAMA 4O3CA 2O51A 5AA4A 4WXJA 4KR5A 3O6IA 1DMBA 3ZKKA 5KDTA 1MQGA 1NNKA 4IO7A 4NWCA 3TTNA 2RKMA 2NUVA 1B2HA 4ELOA 4TQUQ 1H45A 3S2VA 3TTKA 3OOAA 1P1QA 3U72A 4H67A 2V3TA 3OENA 3FIRA 2F34A 1L5TA 1IXCA 3CFZA 4R72A 4LATA 3HSTA 1B4HA 3VV5A 2UXAA 4H0WA 1URGA 5ITPA 1D3KA 3IL1B 1B6HA 3L6HA 3IOUA 4O3BA 2UYFA 4ESXA 1LFIA 2E1SA 2ONSA 1FTOA 3HCQA 1MH3A 1MRPA 2H4IA 3T22A 4XKRA 4EXKA 3RT6B 5FTHA 5TPAB 2V3QA 3E4RA 1QUJA 1IXGA 3PGFA 1MY0A 5AA2A 2OBGA 4R2BA 4ZEFA 1SW2A 3JYRA 2FNCA 4KCCA 1MXXA 1PDAA 3TDJA 2QPQA 4RPOA 3S4UA 3OO9A 4OEUA 3K1PA 1NKXA 4HCYA 1A55A 2XXVA 2RC8A 2VD2A 3OO6A 1MS7A 1OIBA 3G3KA 1YAEA 3DM0A 4ZZAA 3K1MA 3TTRA 2B3FA 1M5BA 2I0CA 5DVFA 1MXUA 5H8QA 3T96B 3K6UA 4GWOA 3ZSFA 2F7CA 1J1NA 3I3VA 3S9LC 4KFQA 1JW4A 2PYYA 2R9JA 1MQHA 3Q25A 4OQOA 2QMXA 3H4ZA 3TODA 3PPOA 4LZ8A 1ZTYA 3ILTB 1Z7ME 3VVFA 3Q27A 1QULA 1BP5A 1UIUA 3TMGA 1UIVA 1MY2A 1EZ9A 2OCUA 5IKBA 2AYSA 2O68A 4F22A 3IB0A 1WDNA 1BKAA 3VXCA 4LQ5A 3SETA 2Y7PA 3N5LA 3KZGA 2VD3A 1YCJA 3QK6A 4MLQA 4QRZA 2HZKA 2ZNTA 1A54A 1ANFA 4EQBA 1Q1KA 2Y7IA 4RY1A 1XT8A 1FQBA 1LAFE 4KYDA 1ZJLA 1H3DA 4FE8A 5ITOA 3CSBA 3R26A 1NMUA 3TELA 5BUUA 2O1MA 3KJTA 5AA4B 1II5A 2D21A 4FJPA 3VLVA 1LBBA 3FV2A 4PFUA 5KDTB 2Z8DA 5I84A 3PUVE 1OMPA 3LR1A 4PFYA 4JSOA 4NE4A 3O97A 4PQJA 4AB5A 4RYAA 4WEPA 4I9DA 3U93A 2O7UA 2I58A 3O28A 3PPRA 3HO7A 3Q28A 1FTLA 2PX1A 5AE4A 4RXLA 1IITA 1VFEA 4OZ9A 5KCJB 4LP2B 2PT1A 1MXZA 3U94A 4K3FA 3UA8A 4Z0IA 2XX7A 4BLAA 2I49A 2RINA 4U21A 1QUIA 1YTVA 1US5A 3UGWA 1B7ZA 2G93A 4U4SA 3PPPA 3DP6A 4H1XA 1TFAA 3GZGA 3V8XB 4C0RA 5A5XA 3SEYA 1MDQA 3C35A 5AA2B 4IO2A 3SDFA 4DIGA 1FQCA 3C33A 3D4GA 4R6KA 5JEIA 4EDPA 3K00A 1A99A 4G8MA 4JDFA 4QFOA 2ALUA 2DS9A 2OWTA 3T9VA 3V83A 3HPIA 3PUYE 4JSDA 2DP8A 1B05A 2BJJX 4QFKA 3T9UA 4BDLA 3UP9A 3VLUA 3IJOB 4MF3A 3VFJA 3W9VA 3VVEA 2W7YA 3K2DA 1Y3PA 5H8QB 1JEVA 2X7PA 2OWSA 4LVQA 2F36A 4ISUA 2LAOA 3SEWA 2A5SA 1WVJA 3KGCA 2ZMBA 2H99A 4GIZA 3TCFA 3EN3A 1NFTA 1MDP1 2RCAA 2RF1A 1EH3A 4ZE9A 3PPNA 4F19A 4IO6A 4F3PA 1B58A 1ZU0A 4EXLA 5JTYA 4OTEA 1JEUA 1DSNA 2H25A 3TKDA 4X1DA 3EHTA 1MXWA 5CBSA 1IZ1A 3EHSA 3MPLA 3QSLA 3CFXA 2CMOA 4ZEBA 5AA3A 4HCWA 4LUBA 2XXUA 5TP9A 4P11A 5I57A 4N6PA 4H65A 4R74A 3BFTA 4MFIA 2VHAA 1USYH 2E0SA 3HV1A 4IY5A 3MP8A 2ONKE 4G8HA 1FTMA 3KN8A 1Y3NA 4F39A 1SI0A 2UVHA 1LB9A 5DTBA 3LSXA 1DTZA 4GD5A 3O9PA 2YLNA 3IJXB 1XC1A 4QFNA 4U23A 4YKIA 4GQOA 3RN8A 3IAZA 1GV8A 3FVGA 3LC8A 1MQJA 1POY1 2B3BA 3RTWB 5EYFA 3CIJA 3TEPA 4GOTA 4DCYA 1FTJA 3MP6A 5CMKA 1B3LA 4Q0CA 3H6VA 1S50A 4UA8A 4JB7A 2UVJA 4OESA 5IAIA 4KD5A 4ZDMA 4ZEIA 1PBPA 3UIFA 1IXIA 1B7UA 1I6AA 3K1NA 4KCDA 3TPAA 1GR2A 1B7HA 1O63A 2QJEA 4GL8A 2OZZA 2IEEA 4OFOA 3C9HA 3CVGA 4RK9A 1FQFA 2V3UA 4YU0A 2NWJA 1URDA 3MUQA 2ZYNA 5A5XB 1P1NA 5H8SA 2QS4A 2HFBA 4H5FA 2XD2A 4XKNA 1N3XA 1VR5A 3IX1A 1SBPA 1LFHA 1MQDA 3CSGA 1NNFA 3SESA 2V93A 1GVCA 1B4ZA 4F1YA 3EF7A 4ZECA 4GVOA 3GLBA 5KCJA 1Y3QA 1Y20A 1OLCA 2F97A 3MZ9A 2I4CA 2DE3A 3CFLA 3FD3A 3IO6A 3OSRA 3RTFB 4ZEDA 4O3AA 3FXUA 3FZVA 3F11A 3IO4A 4EUOA 3OXNA 3TQWA 2GHAA 2DYXA 4N13A 4XXUA 3PUWE 4R6YA 4M1VA 5DT6A 1SVXB 4GRKA 2DSFA 1MY4A 2I3VA 3K0VA 4F3SA 4FORA 4X9TA 4R73A 3ZKLA 3RUMA 4LONB 3Q26A 2HQ0A 1MY3A 5JTYB 4LQ2A 4OFJA 1JNFA 4Q30B 3B6WA 5M2VA 1B5JA 3MVYA 4AB6A 2XXYA 2I48A 4L17A 3FASA 2HEUA 2Z22A 4OEVA 3MP1A 4ELRA 4Q8RA 5TP9B 3IR1A 5I57B 1GTKA 1TFDA 3K02A 1IXHA 3E3KA 1ELJA 3OSQA 2ZNUA 2VGQA 3S9EA 3UK4A 2XX8A 3U1OA 3A3UA 2I6EA 1H44A 1F9BA 1P1WA 4NEDA 1A8EA 4KYEA 3VE1B 2HZLA 4IB2A 3L6GA 1N3WA 3MVXA 2DQVA 4BDOA 1MH4A 2Y7WA 4OFLA 3OO7A 1OQHA 1AL3A 3FVNA 2R71A 4FIMA 1OVTA 4POXA 4YMBA 3TQLA 4NMYA 2V84A 2QRYA 4F2OA 2Y7RA 4R2FA 1MM7A 1I69A 1DTGA 1LGBC 1B51A 2DOJA 2XXHA 4QSDA 2ABHA 2Y7KA 4PFTA 4U1OA 3FVOA 4GXAA 1RYXA 1Y4TA 4QFLA 3C4MA 3DP8A 3B7DA 4OWDA 5DVIA 1UTBA 2KLFA 1B0HA 1QVSA 2GHBA 2AIXA 2V25A 4M4GA 4YMAA 2ZYOA 3PUXE 4IGTA 4H8JA 1JQFA 2DXYA 4YKPA 1PB8A 4NF5A 2RCBA 4C1TA 3G3IA 4ECFA 1QKBA 3TAJA 3T66A 2XXRA 3MWBA 1B5HA 1NH7A 4H8IA 1B32A 1OVBA 5L8DA 2Q2AA 4YAHX 3B6QA 3QYTA 4LZ7A 4OENA 1JW1A 3FUZA 4Q5TA 3U8QA 2AL4A 4YB5A 3VLWA 1P1OA 1UTHA 3A3CA 3MBPA 5FTIA 2Z8FA 4YKJA 3O29A 4G4PA 1HSLA 2QS2A 4XIGQ 1B9JA 4G68C 3PMWA 1IEJA 2ONRA 2XXWA 5ICTA 3MPKA 4BDRA 4F31B 4P0GA 4ESWA 3MC2A 2GH9A 3CI8A 3PD8A 3CRBA 3U92A 5H8HA 4JWOA 4F18A 3SEVA 4QF9A 2DE2A 1D9YA 1P99A 3H7MA 3MZBA 1SW5A 2YJPA 1HSEA 4YKKA 1O7TA 4GLIA 4EQ7A 5I2NA 1PB7A 4NTLA 3ODBA 4DZ1A 3KFMA 2WKYA 3H3GA 3FATA 4TLLB 2O84X 2AL5A 3TZAA 5L9OA 2UVIA 3PU5A 3O2AA 2P0SA 5I56A 4FEDA 4I62A 4PP0A 3O6HA 1MXVA 5I58A 2XXIA 4U1ZA 2DXRA 2ZNSA 4KQPA 2OLBA 3DELB 1N7XA 1LAXA 4NWDA 4AQ4A 4G2ZA 1BIYA 3DP4A 1R6ZA 2PMSA 3R6UA 4F3GA 4JXIA 1BLFA 1O64A 5F7VA 3FGSA 4ELQA 3M3KA 3K4UA 2ZYMA 2XHDA 1B0LA 1B40A 1SI1A 3OEMA 4BDNA 4P0IA 1D9VA 3FJGA 1ZIUA 3BBRA 1XVYA 1D4NA 3FXRA 4GFRA 1MXYA 1XHYA 3SEUA 4X1BA 1POTA 3QXMA 2DE4A 3Q29A 3M3FA 1BTJA 3H6WA 3LSLA 2O69A 4RJZA 1LFGA 1N04A 4KHZE 1USYE 1QKAA 2XD3A 3V89B 3FVKA 1LSTA 1T0KA 1B3EA 2H5YA 1N0TA 4G8NA 2XXPA 3EPEA 1UTBB 1LLSA 5H8NA 4JWYA 3ECRA 2D5WA 1HSJA 2F6PA 2QMWA 4C1UA 4U2RA 3KOTA 1NNTA 4NF5B 3P7IA 1M5CA 5B70A 4NF4A 3ZS6A 2OK2A 3MVWA 3SKPA 2Q9TA 5DEXA 4ZZEA 1FW0A 5I59A 5DYHA 4IO4A 2VP1A 1B46A 2O6AA 1IIWA 4Z7EA 1MQIA 3RGYA 3VXBA 3W9WA 1ZBMA 4WKMA 5FHMA 1UTHB 2GRVA 2NVUB 2IA4A 2X26A 2O1LA 3MQ9A 4HW8A 4ZS9A 1AH5A 1PC3A 2D3IA 3I5OA 2XXQA 1MPCA 1M5FA 4RA1A 1MG1A 3H6UA 4N07A 4PFWA 4F3BA 3RY3A 2H9BA 2QSXA 3RNNA 5ISUA 2P1SA 1SYIA 3FV1A 1SQYA 3RPWA 5H8HB 3BFUA 4GXSB 3RT8A 1MM6A 2QS1A 1Q35A 5HBCA 4XKQA 3IOTA 4YB6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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