3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
molecule tags Transport protein
source organism Chlamydophila pneumoniae
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
1OLAA 2R9JA 1TWYA 2O51A 2DOJA 4F18A 1PB7A 3RT8A 3VLWA 2F35A 2I3WA 2Q2CA 4POXA 4QFPA 5I2KB 4JDFA 1B0HA 1JEUA 2E0SA 1EZ9A 5B70A 3TTRA 3O6GA 3V5AA 2HZLA 3OD7A 2I58A 4KQPA 4AQ4A 4UACA 3VXBA 1LB8A 2REGA 4EQ9A 2RCAA 2Q89A 3CFLA 1SW5A 2DWIA 1IITA 5A5XB 3D4GA 2V3UA 2B3BA 1SI1A 4M4GA 3D4CA 3K1NA 1IQ7A 1D4NA 4ESWA 1SVXB 2I48A 3MWBA 3GXAA 2Z8DA 3EHTA 2HFBA 3P7IA 1ZIUA 2F6GA 3RGYA 1B46A 5CMCA 2FA7A 1LAFE 1Y9UA 4FATA 1URGA 3TZAA 4TLMB 3TQWA 1MXXA 5ITPA 4GVOA 3V89B 4IY5A 1XC1A 1OQHA 3FGSA 2XD3A 5JTYA 2CMOA 2XXIA 1A7LA 1LCTA 3G3JA 4ND9A 3EN3A 3E9XA 2ABHA 2XHDA 2V25A 3MVYA 4OVJA 1QULA 3LSFB 4FAJA 2UXAA 1UTHB 4X48A 2O7UA 1OQGA 3FVOA 4IO3A 1ZMGA 3VFJA 5KZTA 4P11A 3QUJA 3UA8A 4OEVA 3VV5A 1ZTYA 5AA2D 3TTMA 4ZEFA 2XXRA 4IO4A 5DVJA 3H6VA 4KYSA 3DLNA 2I3VA 1N3WA 1SYHA 2PBWA 3IL1B 3OELA 2H4IA 3QYTA 2PT2A 3MVXA 4YB6A 1JW1A 1A55A 3KGCA 2V3QA 3K6VA 3Q28A 1JEVA 1SYIA 3IR1A 2V84A 2Y84A 5TPAB 5I2KA 3TFLA 3ZKKA 3N6TA 3SDFA 5JEIA 4C1UA 1MRPA 3KSXA 2XXHA 4OQOA 1OVBA 1N04A 1JNFA 2Q88A 2CZLA 4LZ5A 1GTKA 4H8JA 4KPTA 3PPNA 1H76A 4R6YA 2OWSA 2E1SA 5A5XA 3IJXB 1M5EA 5FTHA 4C1TA 4NWCA 2QS3A 3MP6A 1TXFA 3TODA 3K01A 3E4RA 4MF3A 3PD8A 2O7IA 1ZLQA 3IJOB 4IO6A 3S4UA 4EXKA 1NMUA 4YB7A 5FHNA 3HPIA 2DE4A 3OO8A 4BDMA 3EF7A 1B7ZA 3K6XA 3GBAA 4U4XA 2DWAA 1B7UA 1IXIA 3U72A 4XKQA 1IUDA 3HHFA 2IA4A 2P1SA 2AL5A 2RF1A 4KCDA 1URSA 5CBSA 1UTHA 4DCYA 1M5DA 3HO7A 1POY1 2Z8EA 4PFTA 1Y3PA 4DCXA 4F31B 2NUVA 3LSWA 2QS2A 3IOUA 3LC8A 3DP6A 2I4BA 5ELVA 3PUYE 2RCBA 1BIYA 3FVGA 3RY3A 2R6GE 4QFKA 1MXVA 4BDRA 4QF9A 2NWJA 1MQGA 4EF1A 3K02A 5ICQA 5I59B 1AOVA 3MUQA 3M8UA 3PGFA 3T96B 2DE2A 4KCCA 3IB2A 2H9BA 3DM0A 2O68A 1JVXA 2ZYNA 5CMBA 5CI5A 1B3LA 3MZBA 4O3AA 3I6VA 1L5TA 4PE5B 2M8CA 3TTKA 1Q35A 1QKBA 3TMGA 1P1QA 1H43A 3FJ7A 2HAUA 1OIBA 2PMSA 4GL0A 4IO5A 4F1UA 1MXUA 3IOWA 2RKMA 2VD2A 1D3KA 1Q1KA 4G68A 1NL5A 3GBBA 2XXQA 2PVUA 3IO6A 4BDNA 1AH5A 4NF6B 4OZ9A 3IOTA 5H8FB 2AIXA 3EHSA 1P1NA 1US5A 3H3GA 1IEJA 2HAVA 1VE4A 2ZNTA 5CC2A 4XIGQ 3R26A 4WKMA 4YKKA 3B7DA 3PPPA 1ATGA 2KLFA 1B0LA 1MY2A 5HBCA 2XD2A 3TELA 4OXVA 1B32A 4R2BA 4N6PA 3OO7A 2OZZA 4IGTA 4LVQA 4DXCA 2RINA 3ILUB 4I1DA 5CBRA 4HCYA 1Z7ME 4ZZAA 4ZECA 2I49A 3TUSA 3S9MC 3T66A 3LBSA 3RTWB 2RC7A 3JYRA 4YMAA 4ESXA 1HSEA 1FQFA 4JWXA 1LFHA 3Q29A 1B5JA 1F9BA 2AYSA 1NFTA 1ZBMA 1WDNA 4YKPA 5I57B 3G7WA 2Q2AA 1MDQA 1LFIA 3L6GA 2F36A 2A5TB 3E3KA 3PMWA 1P1OA 1OMPA 3FIRA 4LUBA 2ZNSA 1P1UA 5I59A 4QFLA 3B6TA 3IB0A 4JBZA 3QUFA 1VFDA 3W15C 2OWTA 2G29A 4X9TA 3CSGA 4RPNA 1PEBA 1USYE 5H8NA 1LB9A 4M1VA 3THIA 1SQYA 2H98A 4ZEIA 3L6HA 1N0TA 4XKRA 2PT1A 3K6WA 1N84A 1QUIA 1D9YA 3TQLA 3IB1A 4RPOA 2OCUA 1B05A 3MW0A 2DWJA 5F7VA 4FE8A 3FXQA 3R6UA 2ZXTA 4ZE9A 3C35A 3C32A 5H8QB 2ALUA 1O63A 2O1LA 2QMWA 1R9QA 4NF6A 2XXVA 4EUOA 2HQ0A 3T93B 3PV0E 5H8FA 4KHZE 3EPEA 3TEPA 3UN6A 4OEUA 3QSLA 4JB7A 4I62A 3FZVA 2OLBA 2VHAA 2XX8A 3H03A 3OEKA 3BFTA 4PETA 1M5CA 4F3GA 1WVJA 2DE3A 1R6ZA 2YJPA 4O3BA 1QW0A 2DS9A 1TFDA 4U1OA 4QFOA 5J1DA 3T9VA 1BTJA 2XX9A 4ZS9A 3TAJA 4P0IA 2Y7WA 3SESA 5AE4A 2P0SA 5KDTB 1GR2A 4U2RA 3UGWA 3C34A 4Q0CA 4U23A 1IZ1A 2AL4A 4AB5A 4BDLA 4KD5A 4DIGA 1DTZA 5EYFA 3TTNA 2ZYMA 4OTEA 1MXZA 3B6QA 4IY6A 3KN8A 4DXUA 4JXIA 2Z22A 5I57A 5L9OA 2VD3A 1FTKA 1M5FA 2A5TA 4GWOA 4EDPA 1DPPA 3TKDA 1N7WA 3RT6B 3AXFA 5AA2B 1H3DA 4LP2B 1LAXA 2DYXA 3USDA 4ISUA 1RYOA 4QRZA 3WAFA 4MBPA 5I2NB 4L17A 1SW2A 4FORA 2H25A 4QSDA 2Q9TA 3H4ZA 5DT6A 4H0WA 2I6EA 1SBPA 4YMBA 3OSQA 1B9JA 1CB6A 3A09A 2ONSA 4JSOA 4IGRA 5L9SA 5H8QA 4ELRA 4RNSA 4RY1A 4R74A 1YAEA 4X1BA 3CRBA 4F1YA 3MBPA 4RA1A 4OYVA 5BWJA 4QFNA 3V8XB 4GXAA 1MXYA 4FJPA 4QHQA 3K1PA 2F7AA 3VXCA 2VOZA 5LOMA 3U1OA 5L8DA 4GIZA 4RJZA 2QRYA 3FXUA 4GFRA 3BBRA 2VP1A 5KDTA 3PUVE 2O6AA 4ZE8A 3CFXA 4F22A 4IO2A 4FEDA 3PUXE 2F8DA 2XXUA 5ISUA 3LUYA 5K2XA 1DTGA 1LGBC 4GL8A 3H6TA 4EXLA 1D9VA 4YU0A 3SEVA 1BLFA 1Y3QA 2NOOA 3LSXA 2X7QA 1H44A 4G68B 3GLBA 1TFAA 3FJGA 4EQBA 1UIUA 2LAOA 3G3GA 4R72A 1GVCA 1N76A 1YPNA 4NF5B 4LZ7A 2Y7PA 1B4HA 5AA2A 1FTOA 4DLDA 1ZKBA 2UYEA 3PMXA 5B7DA 1IXHA 4H6DA 4XTCQ 4F2QA 5I2NA 2F5XA 3DELB 5CMMA 2XXPA 1EU8A 1FQBA 2GH9A 3MC2A 3MQ9A 3O2AA 4F3BA 4U21A 3SKPA 3G3IA 1US4A 1YCJA 3CG3A 1YTVA 5H8HB 1B58A 1B7HA 3K4UA 4R6KA 2FNCA 3MVZA 4PFYA 3PD9A 2QMXA 4ZDMA 4Q8RA 3OMBA 3QAXA 1NNPA 2NVUB 3O66A 4GQOA 4U1ZA 5H8SA 3LR1A 3MJNA 4OFJA 1XHYA 4YKJA 3IAZA 4EQ7A 3OEMA 3K0VA 1GV8A 1I6BA 3G3HA 2X7PA 4RK9A 5L9MA 3HV1A 5HPQA 1MQDA 4QSEA 3CFZA 3KG2A 2B3FA 3CI8A 1UQWA 3FV2A 1T0KA 5TP9B 5H8NB 3B6WA 5JK4A 4GRKA 1FQEA 5EHMA 1MY4A 3QXMA 3FVNA 2A5SA 4OFLA 3RPWA 4Z0IA 1M5BA 1B51A 2UVJA 4ECFA 4GXSB 3KJ7A 1MPCA 5BUUA 3N26A 1MQIA 1ZJLA 1B3HA 3QIMA 3TCFA 2XX7A 4C0RA 4TLLB 4NF5A 5IKBA 4JWYA 1A40A 1SW4A 4E0XA 2GHAA 3TPAA 4ZEDA 4BDQA 3SETA 4F39A 1AL3A 2O1MA 3WAEA 4BDOA 5KCJB 3K00A 4F29A 4POWA 3MZ9A 3VLVA 1FW0A 1B1HA 3G3KA 1DPEA 4ELQA 1QJMA 3TYHA 3G3FA 4KFQA 2OBGA 2PYYA 5H8HA 2Y7IA 5FTIA 1XVXA 3HHGA 1URDA 5CMKA 1MY3A 1NH8A 1VSOA 2D5WA 4G68C 4GD5A 2YLNA 5M2VA 3FV1A 1POTA 4U4SA 5FHMA 2D3IA 2F7CA 4FECA 3E13X 5AA3A 3PPRA 1OLCA 4R9FA 4U22A 3TTLA 1XVYA 4G8HA 1Y1ZA 3M3KA 2BJJX 3ZSFA 4H1XA 4OFOA 3FJMA 3K1MA 3Q27A 5TP9A 3IK6B 3N94A 4UA8A 1QUKA 3O6IA 3RNNA 1GGGA 3ZS6A 3S9EA 4RYAA 5CRYA 3C9HA 4MFIA 1B5HA 1JW4A 1WODA 3W9VA 2UVIA 3EQ1A 4YB5A 1B2HA 3KEIA 5I58A 1JW5A 2ONKE 4F2OA 5AA4B 1XT8A 2FYIA 4F3SA 2UVHA 1SD3A 3U94A 1Y1MA 2DSFA 2V93A 1RYXA 3RN8A 1MDP1 1LBCA 1B1XA 2W7YA 4F1VA 3C4MA 3VLUA 2UYFA 3RTFB 4P0GA 3HSTA 1P1WA 3T9UA 5KCJA 1MY1A 2Z23A 1MH3A 3KN3A 4KI0E 3KN7A 5DEXB 4R75A 1IXGA 1JQFA 1PB9A 4KR5A 4DXBA 2DXYA 3UORA 4R6HA 1FQCA 1OVTA 1Y20A 2QPQA 5I84A 2ZNUA 4ELPA 1B6HA 4OENA 3H6UA 3C33A 3A3CA 4H5FA 5DTBA 2NXOA 3OXNA 3KBRA 2F78A 3OENA 3H06B 3MZ1A 3H6WA 3M3FA 1A54A 2PX1A 5CM6A 3KOSA 4F3PA 4X1DA 2RC9A 2F97A 3UIFA 3FD3A 4OETA 1MQHA 1FTLA 1LCFA 4H5GA 3KZGA 1MPDA 3LSLA 4YZZA 2GFEA 3I3VA 3MPLA 2VGQA 3KFMA 1A99A 3ZKLA 1DSNA 4I9DA 3EHUA 3T22A 5ITOA 1I69A 2ONRA 4HW8A 1Y3NA 1ELJA 3VE1B 3K6UA 4ONYA 2YPNA 2O84X 4ELOA 1QVSA 1IIWA 1N3XA 4LA9A 2G93A 2IEEA 1LSTA 2Y7RA 3FVKA 1Y4TA 1USYH 2I0BA 4PP0A 3UP9A 1BP5A 1II5A 3O6HA 4G8NA 3VVEA 5AA4A 3KOTA 4DE8A 4PFWA 4G77A 3N6UA 4Q5TA 4RK2A 3SEUA 4FIMA 1MQJA 5IAIA 4NMYA 1DOTA 1R1NA 3TCHA 1O7TA 1Z7NE 5FHOA 4THIA 3O28A 3S9LC 4YICA 5TU0A 1MG1A 1NNKA 3N5LA 4QSCA 1J1NA 3TCGA 4LQ5A 1ANFA 3Q25A 5DEXA 1JETA 1IXCA 3ILTB 4NTLA 3MP8A 4JWOA 2DP8A 2UVGA 4R2FA 1MM7A 3SERA 1N7XA 2GRVA 4WXJA 2OJTA 1AIVA 2HEUA 3KJTA 3CSBA 3F11A 4RXLA 5DVIA 4NE4A 1NNFA 4OMBA 3T9XB 2QSXA 3OSRA 4WEDA 2D21A 3S2VA 1UTBB 1TT1A 2ANJA 1S7YA 2HZKA 4DZ1A 5F1QA 1FQDA 3R7XA 1QUJA 1LAHE 1MY0A 1PDAA 2THIA 4NEDA 1MM6A 3S9NC 1A8FA 1MPBA 3IORA 1SI0A 5AA1A 1B3EA 3PPQA 2HCAA 4I8CA 1B4ZA 2QS1A 1BKAA 2B65A 4NF8B 1B3FA 1LLSA 2HXWA 4PFUA 1VR5A 1S50A 3FATA 2DVCA 3JZJA 3VVFA 4NF4B 1R9LA 3DP4A 4FEBA 1LFGA 2R71A 3TDJA 3BFUA 1PBQA 1DMBA 1NKXA 3IX1A 1S9TA 2ZYOA 4H8IA 2DXRA 4R73A 1Y4CA 3U8QA 3CG1A 5DVFA 3VDFA 1EZPA 4N07A 3SEYA 1XOCA 4N13A 3HN0A 3PPOA 3IOVA 2H5YA 3T9HB 4TOZA 4LQ2A 3RLFE 4BLAA 4TQUQ 2GHBA 4ZZEA 3MP1A 1MXWA 4MLVA 4DDDA 4GLIA 3MAMA 2QS4A 1I6AA 4MLQA 2DQVA 3HCQA 4GOTA 5TPAA 1NNTA 2WKYA 3DP8A 4YAHX 4WEPA 3IO4A 4NWDA 3MVWA 4OWDA 3I5OA 1A8EA 2Y7KA 1HSLA 1FTMA 3VVDA 1UTBA 2XXWA 4F19A 1P99A 5I58B 5DYHA 5I56B 3CIJA 4OESA 4HTGA 3ECRA 2QL3A 1FQAA 3O9PA 2F6PA 3QK6A 2H99A 3FXRA 1FCKA 4HS7A 1LAGE 4YKIA 3PU5A 3GZGA 1MH4A 2I4CA 4PQJA 3PUWE 4XXUA 1AMFA 3A3UA 3OO6A 5K2YA 1ZU0A 2DVZA 4G2ZA 3FUZA 3U92A 2Z8FA 2Q8JA 4EF2A 4XKNA 4NF8A 3H7MA 1KWHA 4KYDA 2I0CA 3C31A 1PC3A 3U93A 4NF4A 4OHNA 3V83A 4LATA 3K2DA 4JSDA 1CE2A 1HSJA 1FTJA 4IB2A 2QJEA 2X26A 1SW1A 1LBBA 1B5IA 3FASA 1XS5A 4KYEA 3RUMA 4LZ8A 3RQTA 4K3FA 3OOAA 3CR9A 3PMVA 1O64A 1VFEA 2XXTA 4OERA 3UK4A 1B52A 1UIVA 1I6QA 4Z7EA 2XXYA 2V3TA 4G4PA 1PB8A 2XXXA 2ESNA 4O3CA 1EZOA 3JV9A 3BKIB 4H65A 2O69A 1NH7A 3O29A 3SEWA 4IO7A 1RKMA 4ZEKA 1B3GA 4R9GA 1PBPA 1MS7A 2F34A 4Q30B 1SDXA 2F7BA 5HM4B 5ICTA 5JTYB 3O97A 3CVGA 3KSJA 3ONMA 4MH5A 2P2AA 4ZEBA 3MPKA 3ODBA 1EH3A 3C36A 3M3LA 3Q26A 4AB6A 2ZMBA 1JVYA 5EHSA 1H45A 4E0WA 5I56A 3SEXA 4LONB 3W9WA 3OO9A 2DWHA 4GF8A 4XKPA 1B40A 2ZYKA 2REJA 4HCWA 1QKAA 4G8MA 2OK2A 4H67A 2RC8A 3PUZE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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