3N26A

Cpn0482 : the arginine binding protein from the periplasm of chlamydia pneumoniae
Total Genus 65

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DRNRIWIVGTNATYPPFEYVDAQGEVVGFDIDLAKAISEKLGKQLEVREFAFDALILNLKKHRIDAILAGMSITPSRQKEIALLPYYGDEVQELMVVSKRSLETPVLPLTQHSSVAVQTGTFQEHYLLSQPGICVRSFDSTLEVIMEVRYGKSPVAVLEPSVGRVVLKDFPNLVATRLELPPECWVLGCGLGVAKDRPEEIQTIQQAITDLKSEGVIQSLTKKWQLSEVAY

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH2 (82-88)EMPTYS1 (32-37)TVIa1 (41-44)O1 (38-40)S12 (214-220)S2 (46-48)S3 (52-54)TI1 (48-51)AH1 (56-68)3H1 (79-81)AH6 (187-195)S4 (71-76)AH7 (225-241)TVIII2 (89-92)TVIII3 (178-181)S5 (93-100)TII2 (157-160)AH3 (102-106)S6 (109-114)TIV2 (133-136)AH4 (149-156)S7 (120-126)3H2 (136-138)TII1 (145-148)S8 (142-145)AH5 (168-177)S9 (162-165)S10 (182-185)TIV3 (195-198)S11 (200-206)TI3 (197-200)TI4 (221-224)TI2 (126-129)3H3 (209-211)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Transport protein
source organism Chlamydophila pneumoniae
publication title Exploiting antigenic diversity for vaccine design: the Chlamydia ArtJ paradigm.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding p
total genus 65
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n26A02
3UP9A 4RPOA 2ZYMA 1MXVA 2F78A 3UA8A 4H5GA 3FXUA 1AL3A 2F34A 3TKDA 3VFJA 2HAVA 2I58A 3H3GA 2VGQA 4H65A 4EQ7A 2ZYNA 3HV1A 4LP2B 2ONSA 1DTGA 4PE5B 1H76A 3SETA 1JQFA 5ELVA 2ZNTA 1P1QA 3KOTA 2OCUA 3H06B 5KDTB 3HO7A 2NWJA 3FIRA 4TQUQ 1NNTA 1Q35A 1PB7A 2ONKE 1B05A 4ZEFA 1XVXA 3RQTA 1O63A 2F5XA 4FIMA 1SW5A 5AA4A 1UTBB 3AXFA 5AA2B 3VLUA 2Q89A 1MQGA 4DDDA 4NF5B 3U72A 2BJJX 4C0RA 1URDA 1WDNA 5HM4B 1B46A 1US5A 1LCFA 2PVUA 5DEXA 3R7XA 4P11A 4G4PA 4H6DA 1SW4A 2F6PA 2F97A 1VE4A 3FXQA 3MPLA 3N6TA 4DZ1A 4JSOA 3CSGA 1GTKA 3K6VA 2RINA 3OO9A 4YICA 4LZ5A 4IO4A 3VVEA 3CRBA 2ZNUA 3PMXA 1WODA 4YB6A 3LSLA 5AE4A 1LSTA 2FNCA 2QJEA 3G3IA 1USYE 4I9DA 1F9BA 2XXYA 3KEIA 1SI0A 4QSCA 3MJNA 4Z0IA 4F2QA 4RK9A 2Y7RA 5EHMA 4OEUA 4YKJA 1N76A 2DVCA 1LCTA 4YB7A 4F1YA 3KSJA 4TLMB 5EYFA 1M5DA 5F7VA 3K1NA 3T93B 4F22A 4EXKA 1DSNA 4H8JA 1SW1A 1S7YA 2DSFA 1S9TA 2DWIA 1ZKBA 3W9VA 2Y7PA 3K1PA 3IK6B 4RJZA 3JV9A 3B6QA 4QFPA 5FHNA 4BDOA 3CIJA 5H8FB 2H9BA 4Q8RA 3UORA 1IXIA 4OHNA 4ZZEA 3K02A 3W9WA 1EZOA 1D9YA 1D3KA 3QXMA 3M3LA 2O1MA 3IOUA 3N6UA 1XVYA 3CFLA 1NNFA 4LZ8A 3TQWA 3HCQA 1M5FA 3S9LC 1NNPA 1XC1A 5I2KA 2QS2A 5AA4B 2XX8A 1B52A 3BBRA 3MZ1A 1JW5A 2DS9A 5ITOA 3K4UA 1ZU0A 3IJOB 1QKAA 4DXCA 2I6EA 3T9VA 4POWA 2ALUA 3FJGA 3Q27A 3TTNA 3C35A 4QSEA 2V3QA 2Y7KA 1UIVA 4MLQA 5I57A 1LBCA 5ICTA 3TDJA 3RT6B 4DXBA 4M1VA 5A5XA 4HTGA 3K00A 3FASA 2DYXA 3VXCA 1IQ7A 1PBQA 3L6GA 4IO2A 4F3GA 4JXIA 4U4XA 1ZLQA 4FEDA 3PUZE 3HSTA 3FVGA 3MVWA 4EDPA 1MXZA 3LUYA 3MVXA 3K6XA 1QKBA 4MLVA 2QS3A 4RYAA 2XD3A 1FTMA 2XX9A 4GVOA 5CBRA 3ZS6A 2UXAA 3CVGA 4YZZA 3C9HA 1WVJA 3EN3A 2Z22A 5B7DA 1QUJA 2NUVA 1M5CA 3RT8A 4DCXA 4OWDA 4QFKA 2XXIA 3R26A 4R75A 2XXTA 4FATA 4IO3A 3PPNA 3F11A 2AL4A 1TXFA 1MDQA 4YKKA 3BFTA 2UVJA 2O69A 3O2AA 2Y7WA 2X7PA 1XHYA 4P0IA 4GRKA 4M4GA 4ELRA 1Y1ZA 2M8CA 1XOCA 3MP1A 3MPKA 1OVTA 4OEVA 2UYFA 4I1DA 1I6AA 3N94A 3KGCA 1FTOA 2NXOA 1LFHA 2I0BA 1MH3A 2WKYA 5I2KB 1N84A 2XHDA 3EPEA 1OMPA 5CI5A 3TFLA 1BLFA 2RC9A 4HW8A 4F1VA 1B9JA 5I2NA 4BLAA 1AIVA 2XXUA 1JVYA 2Q88A 3B7DA 3RLFE 1Z7NE 1TFDA 1N7WA 4GFRA 3DP8A 2XXVA 1FQBA 5I57B 4KPTA 4EQ9A 1IZ1A 1P1OA 2QRYA 3HHFA 2VHAA 3FJMA 4PFUA 3OO8A 4AB5A 4AQ4A 4PFWA 3IX1A 1B1HA 3SEVA 1RYXA 3ILUB 3PPQA 4KFQA 1P1UA 4KCCA 4OXVA 1GV8A 1SI1A 2F8DA 1JW1A 2H98A 3S9NC 5IAIA 3QUJA 4C1TA 3KJTA 5I84A 2I3VA 1VFDA 4MF3A 4YKIA 2PX1A 1UTBA 5AA2A 1MQDA 2KLFA 1MXXA 2NVUB 3PUVE 3UN6A 2P2AA 3FV1A 3DELB 1B32A 2ZNSA 1B40A 1MXUA 1B0HA 3G3KA 4U4SA 2NOOA 3FXRA 2Z8EA 5AA2D 4KR5A 1N3XA 4UA8A 1CB6A 2Z8FA 2XXRA 1MG1A 2V84A 4QF9A 1EZPA 1O64A 4AB6A 4PFYA 4OVJA 3CSBA 4YB5A 4BDMA 1Q1KA 1SW2A 1ZBMA 5FHMA 1N7XA 3K01A 4YMBA 3EQ1A 1AOVA 3EHUA 3ONMA 3T96B 3HPIA 2RF1A 2F7BA 1B2HA 3D4GA 5B70A 4RXLA 2G29A 4GD5A 3C36A 3K1MA 1B4ZA 4FJPA 1BIYA 3RGYA 5KZTA 3SEUA 3FV2A 5H8FA 4RY1A 4BDRA 2V3UA 4KYEA 1PDAA 2F7CA 4MH5A 1IXHA 5I2NB 4KQPA 1P1NA 1P99A 2O7IA 1JETA 1JNFA 3N5LA 4F29A 3ZKLA 3TMGA 3MQ9A 5HBCA 4LQ5A 5DT6A 4GLIA 4WEPA 5DVJA 5AA1A 2DE4A 2ZXTA 2PT2A 3C31A 3VVFA 4TOZA 5TPAB 4RPNA 2HAUA 1FQCA 4F2OA 1PB9A 1UTHA 3A09A 4GQOA 2A5SA 4LUBA 4KI0E 2I49A 4X1BA 1VR5A 2UVIA 3MZ9A 4ONYA 4ZECA 2DE3A 4FE8A 2O51A 4IB2A 3JZJA 4ISUA 4JBZA 1POY1 3U8QA 1N04A 4WKMA 3QUFA 2Q8JA 1BP5A 3PD8A 1POTA 3K0VA 3O97A 4JDFA 2Y84A 4ELOA 4EUOA 2CMOA 3JYRA 5FHOA 4ZEKA 3IOWA 4ELQA 2ANJA 1I6QA 3Q26A 2QMXA 1UIUA 3R6UA 5CMMA 3H6WA 4PP0A 4IO6A 3CI8A 4R9GA 1A8EA 3G3GA 2F36A 4IY6A 3FGSA 3RNNA 2YJPA 1B3EA 3FVKA 4XKQA 3IO6A 1PBPA 4NE4A 4GL0A 4OENA 2ZYKA 4ZZAA 4E0XA 3PD9A 5H8NB 4HCWA 3V89B 3GBBA 3OEKA 1SQYA 1MXYA 3MC2A 4ELPA 2REGA 1R9QA 2OJTA 4Q0CA 1Y4CA 3T9XB 3USDA 3PPPA 1DOTA 3O29A 3OO6A 3VLWA 3PPOA 3I5OA 1DMBA 1MRPA 3O6IA 2Y7IA 1JEUA 3G3HA 3HHGA 3T9HB 2AYSA 1RYOA 2OK2A 2P1SA 1MDP1 2HZLA 4R73A 1DPEA 3DP6A 3MP6A 3WAFA 5DTBA 3OEMA 1UTHB 3IR1A 1URSA 4ECFA 1B0LA 4DIGA 4XKRA 4H5FA 2X7QA 1B3FA 1LB8A 1LFIA 1S50A 3Q28A 2D5WA 3TPAA 1TT1A 4RK2A 5K2YA 4BDNA 3PUXE 5H8QA 4RA1A 2B65A 4U1ZA 3A3CA 3O9PA 4QFOA 2VD2A 2XXQA 4Z7EA 3T9UA 1VFEA 3TELA 3VXBA 3PUWE 4DLDA 2IEEA 2H25A 2HQ0A 4R72A 1R1NA 1N0TA 3B6TA 1BTJA 3RTWB 4QFNA 2HCAA 4YKPA 4R9FA 4GOTA 3HN0A 3KN8A 4R2FA 3LSXA 1EU8A 2RCAA 4OZ9A 2DXYA 4NF6A 3D4CA 5H8HB 2P0SA 5JK4A 1JW4A 5DYHA 4F39A 4GL8A 3M3KA 1AH5A 3LSFB 2H4IA 3OSQA 3S9MC 3FVOA 1OIBA 2V93A 3G3FA 4LA9A 4LQ2A 4NTLA 4ZE9A 3CFXA 2Q2AA 4FEBA 3OOAA 1TFAA 2G93A 2YPNA 1B5HA 1OLAA 3TCHA 1IIWA 3UGWA 1H45A 4QSDA 5L8DA 5EHSA 3SDFA 2B3BA 2VD3A 4E0WA 3PGFA 1J1NA 1VSOA 4IY5A 1B1XA 3C33A 3SERA 4TLLB 2REJA 4YMAA 2H5YA 4LONB 3PMWA 3UK4A 3K6UA 3Q25A 3O6GA 4NWCA 5F1QA 4U2RA 5J1DA 3Q29A 3TZAA 1PB8A 5HPQA 5CBSA 1IUDA 5CM6A 1PC3A 1MQHA 1NH8A 2D21A 5H8QB 1JVXA 3ZSFA 3RPWA 3S4UA 2GHAA 5CMKA 2Z8DA 5DVIA 3TYHA 3VDFA 3DP4A 1LAXA 2OWTA 1ZIUA 1LAGE 2OZZA 2QMWA 3T66A 3L6HA 3RN8A 4ZEBA 4F3BA 2FA7A 1QJMA 3M3FA 5TPAA 3I6VA 2ABHA 4G68C 2R9JA 3PU5A 1ANFA 4YAHX 3VV5A 3TAJA 3LR1A 3IORA 1Z7ME 2DE2A 2FYIA 1LAHE 3FUZA 4DE8A 2DP8A 4JB7A 3IB1A 1XT8A 4NF6B 3OMBA 1OVBA 4F31B 3IJXB 2PBWA 1BKAA 1LB9A 3MZBA 2H99A 5FTHA 4BDLA 3QSLA 4X9TA 5I56A 4NF8A 3H6VA 1B3GA 1OQHA 2QS4A 4RNSA 3RY3A 2O68A 4JWYA 4G68A 1LLSA 3C34A 3DLNA 1NL5A 3LBSA 4F18A 4U1OA 2GH9A 1FTJA 4R6HA 1A54A 4QHQA 5JTYA 4C1UA 4FORA 4EF2A 3MVYA 1IXGA 2GRVA 1SBPA 2V25A 4Q5TA 4THIA 1B3HA 4U21A 2AL5A 5TU0A 5LOMA 4H8IA 1YPNA 3MW0A 5H8NA 3KJ7A 1MPBA 1T0KA 4ZEDA 2RKMA 4WXJA 3IB2A 3OSRA 3H03A 3TQLA 1DPPA 1FQDA 1A55A 1QULA 2GFEA 1B3LA 3CG3A 3E4RA 5L9OA 1EZ9A 1N3WA 3P7IA 1B51A 4ZE8A 4H0WA 1FW0A 4BDQA 4LZ7A 1M5EA 2DWAA 2QPQA 5L9SA 3SEWA 4QRZA 3SEYA 1ZTYA 1ATGA 4ESWA 4XTCQ 2DXRA 4HS7A 4LVQA 2I48A 2E1SA 3MAMA 2RC8A 2F35A 3QIMA 4QFLA 4K3FA 1MXWA 5ISUA 3TODA 4F19A 2F6GA 2OBGA 4H1XA 1GVCA 3OELA 3PMVA 3T22A 1MQJA 4O3BA 1O7TA 3ECRA 2PYYA 1Y3NA 2DWHA 4GXSB 4PFTA 3IOTA 5KCJA 5ITPA 1SVXB 2UVGA 4F1UA 3E13X 2I0CA 5I56B 1D4NA 4POXA 4NF8B 3VLVA 3C4MA 1SYHA 5CRYA 3G7WA 1MM6A 3KG2A 5I58A 1MY2A 4G68B 2E0SA 2O1LA 5CMBA 1B58A 3KBRA 4ND9A 2VOZA 2RC7A 1Y4TA 1D9VA 2PT1A 4FECA 1M5BA 1OLCA 3TTRA 5JTYB 1IXCA 3O66A 2Q2CA 3SKPA 4X1DA 5H8HA 3GBAA 2QL3A 3TCGA 2QSXA 3GLBA 2A5TA 3OENA 3U1OA 5L9MA 4IO7A 2XXXA 3C32A 1HSLA 1ELJA 4MFIA 3EHTA 2XXHA 1URGA 1PEBA 4R6KA 5TP9A 1MQIA 4I8CA 3KFMA 4XXUA 2IA4A 3N26A 4G8HA 1NFTA 4U23A 3VE1B 4R2BA 3IO4A 1YTVA 3CR9A 3QK6A 2B3FA 2UYEA 4OYVA 3PV0E 5AA3A 1NMUA 3PUYE 1Y20A 2F7AA 3W15C 5FTIA 3OXNA 4N6PA 4NEDA 2O84X 2UVHA 1QUKA 2LAOA 3TEPA 3EHSA 4WEDA 1MS7A 4F3PA 3K6WA 2OWSA 3B6WA 4R6YA 4JSDA 3VVDA 1DTZA 5M2VA 2ESNA 4XKNA 3GZGA 4OQOA 3UIFA 2THIA 1B5IA 4OERA 4P0GA 1FTKA 3G3JA 1EH3A 4G2ZA 5KCJB 3S9EA 1B7ZA 3RUMA 1IEJA 4OFOA 3I3VA 1B6HA 3H6TA 1FQEA 3FD3A 3H4ZA 1II5A 1HSJA 4JWOA 4MBPA 1B4HA 1B5JA 1MY1A 4OMBA 5CC2A 1L5TA 4OFLA 3TTMA 5I58B 4JWXA 3MUQA 4GIZA 4XKPA 4LATA 1Y3QA 5DEXB 1MY3A 3GXAA 3U94A 3V83A 1FCKA 1QVSA 2Q9TA 2OLBA 4OFJA 1CE2A 3KSXA 1NH7A 2XXWA 1SD3A 2ZYOA 2XXPA 4OESA 4Q30B 3QAXA 2A5TB 2HZKA 5I59A 3CG1A 2XD2A 3IAZA 4IGRA 1FQFA 3IL1B 4R74A 1I6BA 2HXWA 1MPDA 1UQWA 5TP9B 2HEUA 2O7UA 3SEXA 1KWHA 4ZS9A 3TTKA 4NF4A 4KYSA 3TTLA 3U92A 4U22A 5ICQA 3BFUA 4YU0A 3MWBA 2X26A 3FATA 4NMYA 4DCYA 1MY4A 1HSEA 1GGGA 1I69A 1A8FA 1TWYA 4G8MA 3MBPA 1SDXA 1GR2A 2DVZA 1NNKA 3MVZA 3E3KA 2DWJA 2I3WA 1ZMGA 3TUSA 1NKXA 3WAEA 4G8NA 2HFBA 3IB0A 2AIXA 4GWOA 3H6UA 4ESXA 3ODBA 3E9XA 1YAEA 1AMFA 2O6AA 4ZEIA 1USYH 3MP8A 3S2VA 5CMCA 5BUUA 2I4CA 3LC8A 3SESA 2Z23A 1Y3PA 2DQVA 3KZGA 4FAJA 3QYTA 2RCBA 2W7YA 1QUIA 4N13A 2R6GE 2DOJA 4IO5A 4DXUA 3H7MA 1MPCA 4OTEA 2XX7A 4G77A 2ONRA 2VP1A 4XIGQ 3IOVA 1LAFE 1IITA 5BWJA 4ZDMA 4KD5A 3PPRA 3V8XB 2R71A 5KDTA 1A40A 2GHBA 3KOSA 2QS1A 1B7UA 4O3AA 3LSWA 1FQAA 1US4A 4X48A 2V3TA 4H67A 3THIA 4EXLA 1OQGA 5A5XB 4EF1A 4L17A 1MM7A 3O28A 4KCDA 1MY0A 3K2DA 1P1WA 5I59B 3M8UA 1Y1MA 4OETA 1H44A 3U93A 1R9LA 3O6HA 4NF5A 4IGTA 1FTLA 2CZLA 3OD7A 4EQBA 1XS5A 4I62A 4GXAA 3OO7A 4PETA 4NF4B 1A7LA 1QW0A 1R6ZA 1LGBC 2D3IA 3EF7A 1B7HA 3FZVA 5DVFA 3ILTB 3KN7A 1ZJLA 1RKMA 1YCJA 1LBBA 3V5AA 1Y9UA 4HCYA 3FJ7A 1H43A 1A99A 2ZMBA 2I4BA 5K2XA 4O3CA 4NWDA 3BKIB 1JEVA 4F3SA 1LFGA 1MH4A 4KYDA 3DM0A 3TCFA 2YLNA 3KN3A 5H8SA 2PMSA 3FVNA 4UACA 3A3UA 3ZKKA 1SYIA 3RTFB 5IKBA 4KHZE 4N07A 4GF8A 5JEIA 1H3DA 4PQJA 3CFZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LBZA 3UP9A 4O94A 4RPOA 2ZYMA 1MXVA 2F78A 1FPJA 3UA8A 4H5GA 3FXUA 1AL3A 2F34A 3TKDA 3VFJA 4GWZA 2HAVA 2I58A 3H3GA 2VGQA 4H65A 4EQ7A 2ZYNA 3MSTA 3HV1A 4QBAA 4MJOA 4LP2B 2ONSA 1DTGA 4PE5B 1H76A 3SETA 1JQFA 5ELVA 2ZNTA 1P1QA 3KOTA 2OCUA 3H06B 5KDTB 3HO7A 2NWJA 3FIRA 4TQUQ 1NNTA 1Q35A 1PB7A 5I5PA 2ONKE 1B05A 4ZEFA 1RDZA 1XVXA 4P47A 3RQTA 1FSAA 1O63A 2F5XA 4FIMA 3B8BA 4NF0A 1SW5A 5AA4A 1UTBB 3AXFA 5AA2B 3VLUA 2Q89A 4PF8A 1MQGA 4DDDA 4N15A 4NF5B 3U72A 2BJJX 4C0RA 1URDA 1WDNA 5HM4B 1B46A 2ZZVA 1US5A 1LCFA 2PVUA 5DEXA 3R7XA 4P11A 3T1BA 4G4PA 4H6DA 1SW4A 2F6PA 2F97A 1VE4A 3FXQA 3MPLA 3N6TA 4DZ1A 1FJ9A 4JSOA 3CSGA 1GTKA 3K6VA 2RINA 3OO9A 4YICA 4LZ5A 4IO4A 3VVEA 3CRBA 2ZNUA 1IMCA 3PMXA 1WODA 4YB6A 3LSLA 5AE4A 1LSTA 1IMAA 2FNCA 1FBGA 2QJEA 1NV2A 1USYE 3G3IA 4I9DA 1F9BA 2XXYA 3KEIA 1SI0A 4QSCA 3MJNA 2QVUA 4Z0IA 4F2QA 4PE3A 4RK9A 2Y7RA 5EHMA 4OEUA 4YKJA 1N76A 2DVCA 1LCTA 4YB7A 4F1YA 3KSJA 4TLMB 5EYFA 1M5DA 5F7VA 3K1NA 3T93B 4F22A 4EXKA 2CEYA 1DSNA 2WYKA 1IMEA 4H8JA 1SW1A 1S7YA 2DSFA 1S9TA 2DWIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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