3N6TA

Effector binding domain of tsar
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies on the effector binding domain of TsaR
rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 54
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6tA02
3UA8A 3MP8A 2I4CA 4DCXA 3CFZA 4ZS9A 1N3WA 3I6VA 2X26A 3TTKA 3OO8A 4I62A 5H8SA 4QFLA 1QKAA 2F97A 3KJTA 2V3TA 1SW2A 4N6PA 3T22A 3TEPA 2PBWA 2F6GA 1XOCA 3TFLA 1B6HA 1NNPA 4BDRA 4WXJA 2ZXTA 4ZE9A 2ONRA 1B46A 3H4ZA 3TMGA 1Y4CA 1B3LA 4PE5B 1LFHA 1UTHB 2DWAA 4THIA 5AA2D 2OZZA 3G3GA 1TXFA 3HSTA 2Q2AA 1PC3A 1B3FA 4P0GA 2VHAA 3Q28A 3R7XA 2XXXA 2I49A 3K6VA 4H6DA 3K1NA 1MY0A 1TFDA 5H8HB 1N84A 2DSFA 4YU0A 1A7LA 3PV0E 2D5WA 4EF2A 1D9YA 5FHNA 1MRPA 3TAJA 1BIYA 2DS9A 1BKAA 1SW1A 2QMWA 4YB5A 1MQIA 3TCGA 2GHAA 1LFIA 2HQ0A 4O3BA 1S50A 1LLSA 2F7AA 5I2KB 4DZ1A 1H45A 2VGQA 4OHNA 1ZBMA 4IO3A 1Y3NA 4DCYA 2Q2CA 2G29A 3KOTA 4U1OA 1JVYA 1FTJA 1NMUA 1Z7ME 3LR1A 2DWJA 3LSLA 1MH3A 5H8QB 2Z8FA 1P1OA 1LFGA 4R2FA 4IO6A 1FQDA 4IO4A 1JQFA 4R6KA 4M1VA 2DVZA 3H03A 3M3KA 4ZEFA 4RNSA 1B2HA 5I84A 1F9BA 2DXYA 3CG3A 3OSRA 2G93A 5I56B 1TWYA 2I0BA 5BWJA 4ELQA 4H0WA 3IORA 5EHMA 2QRYA 1Y4TA 4ZDMA 4DXBA 3CRBA 4C0RA 5DVFA 1T0KA 2Y7KA 2OJTA 4G2ZA 3DP4A 1VFEA 1ELJA 2I0CA 4O3AA 2HZLA 4U2RA 2NWJA 3OEKA 3LSFB 3PPQA 1JW1A 3CFLA 1MPDA 3N6TA 3B6TA 4IGRA 3MBPA 3R6UA 3GZGA 1DPPA 1GTKA 5I2KA 1ZTYA 3QYTA 1II5A 2ZMBA 4LA9A 4M4GA 2F7BA 1OLAA 3B6WA 4DE8A 3S9EA 4F3BA 2NXOA 5K2YA 5H8QA 3FZVA 2F36A 1M5FA 2Q9TA 1IIWA 4OYVA 2B65A 3PMVA 2UVGA 1MM7A 1MY4A 3SEXA 3E9XA 3ONMA 4YKKA 2THIA 2PYYA 3PUWE 4KR5A 4NWCA 2DVCA 1UIVA 1B7UA 4QHQA 4ESXA 5ITOA 4WEDA 1MQJA 5A5XB 3H6VA 1LAHE 3KG2A 3VLUA 1B0HA 4TLMB 3KFMA 5ITPA 2ZYMA 5I56A 4OETA 2QS1A 3K02A 1RYOA 1ZIUA 2R6GE 3DM0A 5AA4B 3TZAA 4XXUA 4YB6A 5JK4A 1OMPA 3RY3A 5F1QA 2OLBA 4YKPA 4BLAA 5TPAB 1R9LA 4BDQA 1JW5A 1UIUA 3IOUA 5EHSA 3FIRA 1XC1A 2F34A 3S2VA 4Q30B 1JW4A 1IITA 5KCJB 4YKIA 1MDP1 3LC8A 3MAMA 3CR9A 1LSTA 1SW5A 1ZU0A 4PFWA 4E0XA 1P99A 3D4GA 5DYHA 2DE3A 3SKPA 3IK6B 2GH9A 1Q1KA 2D21A 3JV9A 5L9MA 3RTFB 2RC8A 3BFTA 4QFOA 1N76A 4IO5A 3C36A 4WEPA 2I4BA 4IY5A 3N5LA 1ZJLA 1FTLA 3QUFA 2XXIA 3IO6A 2LAOA 1SI0A 2UVHA 4EDPA 1B9JA 1NNTA 3TYHA 1SYIA 4F3PA 3DLNA 4JWYA 1MY2A 4YMAA 1POTA 3GBAA 3OOAA 1N3XA 3T9VA 1B4HA 3H6WA 4GQOA 1AMFA 1FQFA 2Q89A 2P2AA 2A5TB 3RLFE 4C1TA 4YAHX 3PU5A 4NEDA 1VR5A 2I58A 3QAXA 2O6AA 4ELOA 3A09A 5AA4A 5I57B 4ZEKA 3S9LC 4XKQA 1HSLA 3FJMA 5TPAA 3VXBA 3UP9A 3VVFA 5AA2A 3D4CA 2AL5A 1LCFA 2HXWA 4OTEA 3T66A 3EQ1A 1TFAA 5KCJA 3DELB 3E3KA 4KYDA 4R74A 3OELA 4H67A 4LUBA 4G77A 3FD3A 2KLFA 3EF7A 2ONSA 5HBCA 3M3FA 4GOTA 3HN0A 5CMCA 4BDOA 2F35A 1I69A 3K6UA 3SEUA 4F19A 3IJOB 3IR1A 3IB0A 1FTKA 4H1XA 1B7ZA 2GFEA 3IOWA 4FEBA 4ZZEA 3OEMA 1H76A 1RKMA 3HPIA 4N07A 3KN7A 3VV5A 4YMBA 3AXFA 1URSA 2RC7A 2Y84A 3P7IA 1QUJA 4QFPA 5J1DA 4Q8RA 2H98A 3T96B 4YKJA 1NFTA 4DDDA 4R2BA 1D9VA 2A5TA 3VLWA 1MY3A 5HM4B 4Q0CA 4EUOA 2Q8JA 3KN8A 4ZECA 3CSGA 4JWOA 3FV2A 3O66A 1IXGA 1YPNA 5ELVA 4ZEIA 2I6EA 4GF8A 3T93B 5I57A 2YLNA 2D3IA 4OFLA 1US5A 2ALUA 1P1QA 1QULA 1B7HA 1R6ZA 4U4XA 5LOMA 4BDLA 1XVYA 3TCFA 5I2NB 3C31A 2ZYKA 1LAXA 4RYAA 3TDJA 4NMYA 3GXAA 1MY1A 4MFIA 4MF3A 4RK2A 4F29A 3K6XA 3HHGA 1XT8A 2XHDA 1MG1A 3G3KA 3BKIB 3MVYA 3R26A 1ANFA 1QVSA 4NF5B 2F5XA 1WVJA 5DVJA 3ILUB 3IAZA 4MH5A 1ATGA 1Y3QA 4U1ZA 4KYEA 2A5SA 1OLCA 4IO7A 1POY1 2XXYA 1SQYA 4FATA 3EPEA 3KSJA 3SDFA 5CBSA 4OQOA 4ELRA 3ODBA 3I5OA 3OENA 4EF1A 4G68A 1N0TA 1M5EA 2H25A 1OQGA 2PX1A 3CG1A 4KI0E 1PDAA 3BBRA 4R72A 5BUUA 3JYRA 4FECA 1KWHA 4GWOA 4QF9A 2I3VA 4L17A 3MUQA 4DIGA 3PUXE 2O1LA 4N13A 5I2NA 3O9PA 2ZNUA 1MXXA 1SW4A 1AL3A 3ECRA 5ISUA 1JEUA 3IB2A 3KOSA 1FCKA 3PUVE 2ANJA 4NE4A 1MXUA 3PPPA 4QFNA 1B32A 3ZSFA 4NF4B 3GLBA 4FEDA 1FTOA 4POXA 4XIGQ 4R9GA 4JB7A 1J1NA 3H7MA 1R9QA 1USYE 1EZOA 3DP6A 3RUMA 2NUVA 4KCCA 2DWHA 4EXLA 4NF5A 1B5IA 3MPKA 2Y7IA 4I8CA 5AA1A 3K2DA 2VD3A 2M8CA 1VSOA 3F11A 3UK4A 2O7IA 1NH8A 1Y3PA 1GVCA 3K6WA 1B0LA 2UYFA 2VD2A 1SDXA 2XXWA 3PUZE 3RTWB 1H44A 1SBPA 4R6HA 4U23A 2XXHA 1M5CA 2DP8A 2QS3A 3G3JA 4GIZA 1HSJA 4ONYA 2DE4A 4JWXA 2O7UA 3L6GA 4EXKA 2V93A 4OFOA 3CSBA 5ICQA 4X1BA 3OO6A 4F39A 2I3WA 3PPNA 1IXCA 4RA1A 1ZLQA 3TUSA 4U22A 5CBRA 5M2VA 4HCWA 1MXYA 1D3KA 1BTJA 2CMOA 4BDMA 1B5HA 2DE2A 2FA7A 3I3VA 3KGCA 3T9UA 1DTGA 2F8DA 4JDFA 2AL4A 3W9VA 4OEUA 1DMBA 1LB9A 2F7CA 2FYIA 1NL5A 2PT1A 2XXRA 3IL1B 3K0VA 4ZE8A 1N7XA 3VDFA 1OQHA 3M3LA 1LCTA 4LZ5A 4NF4A 3MVZA 4F31B 5FTIA 3FJGA 1B05A 1YTVA 4KPTA 4Q5TA 4TQUQ 2XXUA 3Q27A 4ZZAA 1O7TA 3OMBA 4GFRA 4QSDA 3MVWA 1S7YA 4JBZA 4JSOA 3H6TA 1B3GA 5AA2B 4OMBA 4EQBA 1MQHA 5FHOA 4R6YA 5I59B 3KZGA 3MPLA 4PETA 4R73A 2NOOA 3IJXB 1I6BA 4YB7A 4QSCA 3TKDA 2ZYNA 1FW0A 4QRZA 2H4IA 2VOZA 3VVEA 2Y7RA 4POWA 1VFDA 3IOVA 2O84X 5JEIA 2PT2A 3M8UA 4DLDA 3O6GA 3FVOA 3KEIA 2FNCA 2RCBA 4LQ2A 2ZYOA 4FORA 5DVIA 4G8NA 1UTBB 2Z8DA 4OERA 4P11A 2PVUA 4DXCA 4HS7A 4GVOA 1VE4A 1B52A 1FTMA 3O2AA 3WAFA 3DP8A 3ILTB 1EZ9A 4QSEA 1PEBA 3PD9A 3PD8A 3UGWA 2BJJX 1NNFA 1MDQA 4ESWA 3VVDA 3RQTA 4F18A 2V3QA 2H9BA 4FE8A 1B5JA 5FTHA 1MS7A 3TQWA 2XX8A 1Q35A 2HAVA 4F2OA 4LVQA 3ZKLA 4ECFA 5H8NB 3V89B 4ELPA 4LATA 4NWDA 1QUKA 2YJPA 4Z0IA 1OVBA 4YZZA 1AH5A 2GRVA 2R9JA 5HPQA 2ZNTA 4F1UA 4H5GA 3MW0A 3WAEA 5I59A 2V84A 1P1WA 3Q29A 2I48A 4RJZA 2UYEA 3LSXA 3MWBA 3RPWA 3FUZA 1SD3A 1B1XA 2RINA 3B6QA 1LAGE 3VXCA 5L9SA 1SI1A 3OO7A 4I9DA 1LBBA 1P1UA 5AA3A 1Z7NE 1A54A 5JTYA 3KBRA 3A3CA 2UXAA 4G68C 1RYXA 3TTLA 1XS5A 3B7DA 4FAJA 1M5DA 1DSNA 1JETA 2DWIA 1UTBA 3EHSA 5L8DA 4F22A 3Q26A 3MQ9A 2XXVA 2YPNA 3HO7A 2O51A 3KN3A 4PFYA 3FGSA 4JSDA 4KYSA 1DOTA 3L6HA 4FIMA 3SEVA 4EQ7A 1XHYA 4GXAA 3G3HA 1IEJA 1UQWA 4G68B 4R9FA 1MXVA 4TOZA 3U92A 4KQPA 5CMBA 1PB7A 3GBBA 3SEYA 2Z23A 4KHZE 1ZMGA 4LONB 5H8NA 3PPRA 1US4A 3FVGA 5K2XA 2VP1A 3C35A 4OEVA 5TP9A 2O68A 4E0WA 3FJ7A 1Y1ZA 3C32A 4G8HA 1QW0A 4RXLA 5L9OA 3TTMA 3K1PA 3HV1A 2DOJA 5H8FB 1PBPA 4RY1A 5IKBA 3N94A 3O6IA 1B3HA 4NF8A 2NVUB 1L5TA 1A40A 4HTGA 4IB2A 2Y7PA 5B7DA 1DPEA 5DTBA 3CIJA 1R1NA 1QUIA 3U1OA 4O3CA 4OZ9A 4P0IA 3MP6A 2OCUA 4RPOA 4XKRA 1PB9A 1ZKBA 4K3FA 3N6UA 3UN6A 1FQAA 3TQLA 2F6PA 1IXIA 4UACA 4H8IA 4OESA 3SESA 4IO2A 1A55A 3IOTA 2B3FA 2Z8EA 1S9TA 2X7QA 4G8MA 4ISUA 4AB5A 2RF1A 2QJEA 2HAUA 4NF6B 1EH3A 4DXUA 1IXHA 3QSLA 2QMXA 1B3EA 1FQCA 4HCYA 3U8QA 4H5FA 5DT6A 1MXWA 5CC2A 5KDTB 3RN8A 4RPNA 4GD5A 4RK9A 3EHTA 1B51A 1FQBA 3O28A 3HHFA 1IZ1A 3H3GA 3S4UA 2REGA 2F78A 2O1MA 4FJPA 1EU8A 1HSEA 3O29A 5CM6A 1B58A 3LSWA 4R75A 3TELA 4C1UA 1GGGA 2XD2A 3K4UA 3OSQA 4Z7EA 3HCQA 2OBGA 2UVIA 5ICTA 3CFXA 2XXTA 4BDNA 5H8FA 3U93A 3OO9A 3FXRA 4IY6A 4PP0A 3TPAA 1OVTA 3T9HB 3RT6B 4GL0A 1B4ZA 1MXZA 3G3FA 4PQJA 3U94A 2HFBA 4MLQA 1IQ7A 1MM6A 1PBQA 2IEEA 3RT8A 1A99A 1UTHA 1CE2A 3THIA 1MPCA 1GR2A 3EHUA 1Y9UA 2P1SA 4OVJA 3MJNA 2IA4A 3EN3A 5CI5A 2ZNSA 5CRYA 1LAFE 2XD3A 4WKMA 3PMWA 4U4SA 5H8HA 5AE4A 3TCHA 2REJA 3KSXA 4KCDA 4NF6A 3MZ9A 1LGBC 3ZKKA 3BFUA 3IB1A 4X1DA 4OENA 2OK2A 1CB6A 1URGA 1QJMA 5KDTA 2O69A 4HW8A 5TU0A 2Z22A 4OFJA 2HZKA 2XXPA 3E4RA 3USDA 3W9WA 4F1VA 3C4MA 3T9XB 3N26A 3U72A 3UORA 4F1YA 2OWSA 1WODA 1MPBA 2QL3A 3S9NC 3C9HA 1BLFA 4ZEDA 1USYH 5CMMA 4LZ8A 4ND9A 1D4NA 3PMXA 1O64A 3C33A 1LBCA 2ABHA 1MQGA 3MZ1A 2B3BA 3FXQA 3FATA 3ZS6A 3K1MA 4OXVA 3Q25A 3K01A 1LB8A 2ESNA 1EZPA 1Y20A 2V25A 5I58B 3G3IA 1SYHA 3A3UA 1OIBA 2Q88A 4X48A 1Y1MA 1NKXA 1M5BA 2CZLA 1YCJA 3PPOA 2ONKE 3RNNA 4AB6A 1B1HA 2QSXA 1A8FA 4LQ5A 3OXNA 3G7WA 1BP5A 3KJ7A 4I1DA 4XTCQ 1AIVA 3PUYE 3K00A 1MQDA 4NTLA 1JVXA 1WDNA 5JTYB 2QS2A 1IUDA 2P0SA 1MH4A 1I6AA 2WKYA 3FVKA 4U21A 4TLLB 3O97A 3V5AA 2H5YA 3QUJA 3QK6A 3V83A 1NH7A 1TT1A 1H3DA 3LUYA 5DEXB 3FV1A 2H99A 1SVXB 3SETA 5B70A 4JXIA 3MP1A 2RC9A 2DXRA 4F2QA 3H06B 4KFQA 5EYFA 4F3GA 2V3UA 1URDA 4KD5A 4XKPA 1AOVA 4GL8A 1O63A 1A8EA 4IGTA 1NNKA 4LZ7A 4GRKA 3MZBA 3IO4A 1N04A 3VFJA 4H65A 2XX9A 5A5XA 3W15C 2RCAA 2E1SA 3E13X 3VE1B 5IAIA 3LBSA 5I58A 1QKBA 1PB8A 3JZJA 5TP9B 4EQ9A 3TODA 2UVJA 4UA8A 3PGFA 4F3SA 3FVNA 3SEWA 3TTNA 4AQ4A 2Y7WA 3S9MC 1DTZA 3SERA 5FHMA 3QIMA 4X9TA 1XVXA 1N7WA 3CVGA 3QXMA 4NF8B 4XKNA 4G4PA 4OWDA 2AYSA 3C34A 4QFKA 3V8XB 3UIFA 1B40A 4MBPA 5KZTA 2QS4A 3OD7A 2HEUA 2DYXA 3VLVA 3FXUA 3H6UA 1JEVA 2E0SA 3IX1A 4YICA 1H43A 1I6QA 3MVXA 4MLVA 3CI8A 1GV8A 1P1NA 3RGYA 2RKMA 2OWTA 2AIXA 2DQVA 4GLIA 1JNFA 1FQEA 2GHBA 3MC2A 5DEXA 4GXSB 4LP2B 2XX7A 1YAEA 4PFUA 2X7PA 4PFTA 2XXQA 5CMKA 3O6HA 3TTRA 2HCAA 2W7YA 2R71A 3FASA 2QPQA 5F7VA 2PMSA 4ZEBA 4H8JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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