3N6UA

Effector binding domain of tsar in complex with its inducer p-toluenesulfonate
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
GHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies on the effector binding domain of TsaR
rcsb
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
molecule tags Transcription regulator
source organism Comamonas testosteroni
total genus 55
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3n6uA02
2Z8EA 5I2NA 4YICA 5A5XA 1QW0A 3IO6A 3K1PA 4THIA 1SQYA 1POTA 3RTFB 3U92A 3UK4A 2FA7A 2QS3A 3SEXA 4OEVA 3VVFA 2O84X 2GHAA 1URDA 3N94A 3CRBA 3TTMA 4FATA 1YCJA 5EHMA 1UQWA 2DE3A 2OLBA 5AA1A 4OFJA 2NVUB 1MQGA 2RC7A 1IIWA 4IO4A 4DXCA 3FVGA 2XD2A 4WXJA 5CRYA 3S4UA 5H8FA 2ZXTA 3K00A 4KYDA 2I3WA 4R6HA 3BKIB 4JB7A 4RXLA 1JW4A 1B2HA 3PU5A 4RPOA 3RGYA 4OTEA 4POWA 4O3AA 3JYRA 3PD9A 3H7MA 2I0BA 3ECRA 1L5TA 1ZKBA 2Q89A 3MUQA 1JW1A 3IB2A 5JTYB 3DELB 3CG3A 4G2ZA 1NNKA 3U94A 4GXAA 2V3TA 1M5DA 1QUKA 2I3VA 3Q28A 3S9LC 3CSBA 4BDOA 1BP5A 4O3CA 4F3SA 1QUJA 1FQAA 3KSXA 4G8HA 3O6IA 2QPQA 1OLAA 3KOTA 3U93A 1QULA 4IY5A 4NF4B 4NEDA 1EZ9A 3EPEA 2RCAA 2QS4A 1MH4A 3S2VA 3K6VA 3ZKLA 1N7XA 1PEBA 1ZJLA 3M3LA 4ZEBA 3F11A 4R73A 4ELQA 1USYH 4FJPA 1FCKA 2HQ0A 4C0RA 4H8IA 1SW5A 4EQBA 3RTWB 4C1UA 4Q8RA 5ICQA 3KEIA 3MP1A 3C34A 2HFBA 4DCXA 3B6WA 1H76A 5M2VA 4L17A 1JNFA 4ESXA 4MF3A 2AYSA 3I6VA 1MXWA 4FEDA 4N6PA 3VLUA 1ZLQA 3MC2A 3FJ7A 2DSFA 5TPAB 2ZYNA 1Y9UA 4R2FA 1S50A 3R7XA 3I3VA 4IB2A 1ATGA 3A3CA 2F36A 2DVCA 2OJTA 3GBBA 1MM6A 5KCJB 2O51A 4FE8A 3AXFA 4UA8A 2REJA 5DTBA 3PUZE 4LA9A 1BKAA 2PT1A 5FTIA 4FECA 1JEUA 5ISUA 4R74A 3SESA 1NNTA 3VE1B 3V8XB 5AA3A 1N04A 3ZS6A 4DXBA 2XXRA 1P1NA 2ZNTA 4G8NA 2HZLA 2P0SA 5H8HA 4IGRA 4JXIA 5DEXB 3H06B 1LCFA 3IX1A 4ZEFA 5AA4B 1DMBA 3DP6A 4EXLA 3KGCA 2X26A 4P0GA 3FJMA 5JEIA 3G3FA 2Z8FA 1D9VA 5DVJA 2QS2A 4H5FA 4YMAA 4ZDMA 5IAIA 1A8FA 2XXXA 1MXZA 3FVKA 1SVXB 2I6EA 3CG1A 3FVOA 2DWAA 3TCGA 5F7VA 4LONB 4AB5A 3SKPA 5DVFA 3RPWA 3PPPA 2XHDA 4U1OA 4R9GA 1FTOA 1PBPA 4O3BA 3Q26A 4R2BA 3OSQA 3HHFA 2Y7RA 3ILUB 4HW8A 3OELA 2F8DA 3QAXA 2OWTA 2H9BA 5F1QA 4ZEKA 3C33A 3R26A 1LAHE 5L8DA 2Y7PA 5KZTA 2XX7A 1FTLA 2OWSA 3RN8A 4F1YA 5ICTA 1AOVA 1Y4TA 4OERA 5I84A 4ZE9A 3CFZA 4R9FA 3WAFA 4E0XA 4OVJA 1B40A 4F1UA 1FTMA 4N07A 2XXUA 3M8UA 4XKPA 2UYEA 4JDFA 4ELOA 1MQJA 4U1ZA 3MVYA 1QKBA 1TFDA 5CM6A 4I62A 4F2OA 2QSXA 3FD3A 2Z23A 4KCDA 3Q25A 3SDFA 1DOTA 1XOCA 4AB6A 3RUMA 3EHSA 4RY1A 3V5AA 3CFXA 3MWBA 3MZ9A 1EZOA 4YB6A 3FGSA 1II5A 4N13A 3LSFB 5I2KA 5I56A 3E3KA 1LB9A 3PPNA 3ZKKA 1OQHA 5AA2B 1JEVA 1MM7A 4G4PA 2Q9TA 4MFIA 4Q0CA 1IQ7A 1I6BA 1VSOA 5FHOA 3B7DA 3C4MA 4QFKA 1DTGA 5DVIA 4BDQA 3MZ1A 1M5BA 4UACA 3C31A 4K3FA 4ND9A 4KCCA 3BBRA 4BDRA 5CBRA 1MDP1 3LUYA 4GIZA 2GRVA 4ONYA 4G68A 1H44A 1MY3A 3G3HA 1LSTA 4NF8B 4NTLA 4MH5A 3CIJA 4H67A 3HV1A 4YB5A 2PBWA 3E13X 3K6UA 2UVGA 1B1XA 4ZS9A 4F3GA 4F22A 2A5SA 3TDJA 4EXKA 1A40A 5TP9B 2GFEA 1FQBA 1LBBA 2O68A 5L9SA 1GGGA 1O7TA 2Y7WA 1MXYA 4IO3A 1US5A 2O69A 2Y7IA 4WKMA 4OWDA 3CI8A 2O6AA 4GF8A 4I1DA 2F97A 4RK9A 3T9HB 1OVBA 5L9MA 4F2QA 3G7WA 4YZZA 1JETA 3B6TA 1HSEA 1GV8A 3KOSA 4F19A 5LOMA 4OHNA 1MG1A 4QSEA 1D9YA 5L9OA 3VVEA 1J1NA 3S9MC 3TYHA 3SEYA 1UTBA 5CMBA 1JQFA 1AL3A 2A5TA 4JWOA 1LCTA 3C36A 3MAMA 3R6UA 1GTKA 1LAXA 1MY0A 4ZECA 3PV0E 4HCWA 4F1VA 4BDLA 2O1MA 3W9VA 1UTHB 1WDNA 2PMSA 3SEWA 5H8NB 1POY1 3U72A 1MQDA 1Y20A 1H43A 5K2YA 5I57A 2ONKE 4IO5A 3TTLA 5JK4A 1SYHA 4TQUQ 4XKNA 1B0LA 3KN8A 2V84A 3H6WA 2NOOA 1FQFA 2DXRA 4ELRA 4IO7A 2V3UA 4KFQA 2GH9A 3D4CA 3IR1A 4EDPA 2E0SA 1OMPA 3OD7A 5H8QB 3O29A 1VR5A 2B3FA 3MBPA 4F3BA 4AQ4A 3K4UA 1N84A 1XT8A 3SEUA 4LQ2A 4DZ1A 4LZ8A 2F5XA 3LC8A 4FEBA 1BTJA 2Y84A 3FATA 1SW1A 1MY4A 3N6TA 4TOZA 2DQVA 5CMMA 4GLIA 3PUYE 4XKRA 1ELJA 3W15C 3N5LA 4G68C 3M3KA 3OENA 1LGBC 2ESNA 4ZE8A 3RY3A 2Y7KA 3SERA 2DWHA 4PQJA 1Y1ZA 3O6GA 1B51A 2B3BA 5AA2D 2XXHA 4LQ5A 3EHUA 1B5HA 4NF5B 1FQCA 1N76A 3DLNA 1N0TA 2HCAA 4KD5A 3TTKA 3B6QA 1A55A 2Q2CA 5I2NB 3VLWA 2CZLA 1Z7ME 3T22A 2IA4A 1P1OA 1IXHA 3FV1A 2OBGA 3KSJA 2P1SA 3RNNA 5AE4A 1QUIA 3V89B 1MQHA 4H0WA 3KBRA 5I58A 1US4A 2QL3A 5DEXA 4KYEA 2ONSA 1PB8A 4FIMA 3QSLA 1MQIA 3TPAA 1UIUA 2HXWA 3O9PA 4YKKA 2O1LA 4P0IA 1OIBA 2NWJA 1MXVA 3T9UA 4X1DA 1B4ZA 3MP6A 3KN3A 4M1VA 2VP1A 2ZNSA 3C9HA 1UIVA 4PFWA 3OEKA 2Q2AA 4NWDA 1XS5A 1R9QA 3KG2A 4OFLA 1SI0A 1MPBA 3IO4A 1A54A 3K1NA 1B46A 3HHGA 4QF9A 4IGTA 3N6UA 1PB9A 2I58A 3OSRA 4QSDA 1HSJA 1LAGE 3VXCA 3UP9A 4IO6A 2F35A 1YAEA 3LSXA 4IY6A 5KDTB 4RYAA 1VFDA 3E4RA 3SEVA 1B7HA 3GLBA 2H5YA 3TQLA 3FV2A 2D21A 3M3FA 3PUVE 3OO6A 2P2AA 2QRYA 2RC8A 4GXSB 2FNCA 5CMCA 2QMWA 3OMBA 2WKYA 2ALUA 3PUWE 3MVZA 3IB1A 4Q30B 2OCUA 1B3FA 2DP8A 3IOUA 4MBPA 3UA8A 4Z7EA 1I6AA 2R71A 3PMXA 1B52A 4ELPA 1SD3A 4WEPA 3KJ7A 1KWHA 2X7QA 4PFTA 1FQDA 4R6KA 1IXIA 3I5OA 5HM4B 2D3IA 2ZYKA 5CBSA 3TTRA 4Q5TA 3JV9A 5BWJA 4YB7A 1CB6A 4R72A 2ANJA 2I4BA 3ONMA 4C1TA 3UIFA 2DOJA 3KJTA 5CI5A 4RK2A 4JSDA 3TMGA 1WVJA 4NF6A 4H8JA 5B7DA 1SI1A 1B0HA 4BDNA 3LSWA 1BIYA 3U8QA 4PFYA 3CSGA 1A7LA 2PX1A 4LVQA 1B3EA 3CR9A 4GL0A 1NNPA 4YKPA 4NF8A 3PGFA 4U21A 3H6VA 1MS7A 1NH8A 2VHAA 2H99A 1URGA 4H5GA 3H03A 2VD3A 1DSNA 3H6UA 4DIGA 2I0CA 2NUVA 4GD5A 1SW2A 3Q29A 1HSLA 2G29A 1PB7A 1B32A 4ECFA 3RT8A 3VXBA 1XC1A 1B5IA 5J1DA 3VVDA 3BFUA 4OESA 1Z7NE 3O28A 4P11A 1T0KA 4KI0E 4EQ9A 1H45A 1YPNA 2X7PA 3A3UA 1TFAA 1FTKA 2F7BA 4U23A 4DXUA 1RYOA 2ONRA 1A99A 3O97A 4QRZA 3ZSFA 1SYIA 1O63A 4DCYA 4QFLA 5H8SA 3IJXB 3OO9A 1UTHA 3O6HA 3V83A 2UVIA 4XXUA 2UXAA 1DPPA 4OEUA 5EYFA 2F6PA 3EF7A 3O2AA 1S9TA 4FAJA 4U2RA 3DP8A 4QHQA 1LLSA 4GWOA 3G3JA 5I59B 4EQ7A 4LP2B 3QYTA 3VDFA 1B7UA 2Z8DA 2M8CA 3Q27A 4ZEDA 1XHYA 4G77A 3UGWA 1M5FA 5CC2A 2F78A 3KN7A 1MDQA 2QJEA 5B70A 4H6DA 3IOWA 2V3QA 3CFLA 3QUJA 1P1WA 3C32A 1B7ZA 3OO8A 4LATA 3HO7A 3EN3A 1TXFA 5JTYA 2XD3A 4KQPA 5I2KB 4YKIA 5I56B 3OO7A 4OENA 2W7YA 1QKAA 1R1NA 4XKQA 3MPLA 3K6XA 4FORA 3N26A 1I69A 3UN6A 4XTCQ 4OMBA 1JVXA 3K0VA 1IUDA 1YTVA 2PVUA 3G3KA 2ZMBA 1NKXA 2YPNA 2D5WA 3HPIA 4NF4A 1LFGA 3LBSA 3L6HA 3T66A 1NMUA 2ZYMA 1MY2A 3PPOA 3KZGA 2Z22A 4MLQA 1A8EA 1Y1MA 4E0WA 4G68B 2DWIA 2VD2A 3RLFE 1RYXA 1D4NA 3OEMA 4YKJA 4PP0A 4KYSA 2DXYA 4KPTA 4R6YA 5DT6A 4QSCA 3MVXA 3W9WA 4NWCA 1MPCA 3ODBA 3LSLA 4ZZEA 4GVOA 1Y3PA 2DVZA 3PPQA 1Q35A 4HS7A 3QK6A 1LFHA 1B3HA 2XXYA 4DLDA 3THIA 4POXA 3GXAA 3T93B 1BLFA 1TT1A 5FHNA 4RA1A 3FZVA 3K01A 2QS1A 3TEPA 4F18A 2I48A 4RJZA 2F6GA 5TPAA 1UTBB 2O7UA 4X9TA 3C35A 2A5TB 3L6GA 3IORA 4I9DA 4Z0IA 5A5XB 1FQEA 1B58A 4OQOA 3U1OA 2XXQA 5KCJA 3O66A 1AIVA 2E1SA 3TCFA 3GBAA 3HSTA 2ZYOA 1QJMA 1DTZA 3FUZA 1FW0A 5KDTA 3LR1A 4F3PA 3G3GA 3KFMA 4JWYA 2VOZA 5I57B 5IKBA 4EUOA 4YMBA 2QMXA 3QXMA 2V25A 5AA4A 1XVXA 2UVJA 5EHSA 3K6WA 1TWYA 2F7CA 3HN0A 1ANFA 5TU0A 2O7IA 4QFOA 1DPEA 3TAJA 3EHTA 5H8FB 1H3DA 5FTHA 4F29A 2XX8A 3OOAA 4OFOA 4GOTA 1IXCA 4KR5A 2KLFA 2F34A 2V93A 4JWXA 4PETA 1GVCA 2XX9A 3QUFA 3IAZA 1EH3A 2RCBA 4YAHX 2IEEA 4PE5B 1B6HA 3A09A 2XXPA 1AMFA 1N7WA 2DYXA 1IZ1A 3FXRA 4YU0A 5DYHA 1VFEA 1B1HA 3PMWA 1MXXA 2R6GE 4OETA 1IITA 4DDDA 3CVGA 1NFTA 1P99A 2AIXA 3IL1B 3K1MA 4NE4A 4ZEIA 1MRPA 3MP8A 3SETA 4G8MA 1B3LA 3IB0A 3MVWA 1M5EA 4KHZE 3USDA 4M4GA 1ZU0A 3MZBA 3IJOB 4EF1A 5K2XA 3PPRA 2H25A 3OXNA 3H4ZA 3T9XB 4GQOA 2BJJX 4F39A 5FHMA 1LB8A 4ISUA 1P1UA 2AL4A 5I58B 1NL5A 1MPDA 5ELVA 4HTGA 1NH7A 3TELA 1LBCA 1R9LA 1WODA 4H65A 1LAFE 2HAUA 3MJNA 3MW0A 3TQWA 3PD8A 1ZIUA 2HZKA 4F31B 4OYVA 3PMVA 1VE4A 5AA2A 2G93A 3TZAA 1I6QA 2VGQA 4DE8A 1USYE 4GFRA 1N3WA 4BDMA 3G3IA 3IK6B 3FIRA 4RPNA 4ZZAA 2OK2A 3VV5A 3S9EA 4X48A 3FVNA 1P1QA 4ESWA 2HAVA 1D3KA 1N3XA 4I8CA 5HBCA 2NXOA 2H98A 4GRKA 4EF2A 1LFIA 2RINA 1AH5A 2DE2A 1PBQA 3FASA 2XXWA 3H3GA 4QFPA 5I59A 4JSOA 1GR2A 4BLAA 2ZNUA 2FYIA 3T9VA 3T96B 2YJPA 4XIGQ 5TP9A 2OZZA 2REGA 3VFJA 4HCYA 3IOVA 1ZMGA 1F9BA 5H8HB 1ZTYA 5ITOA 2Q8JA 2YLNA 1CE2A 5CMKA 3MPKA 3TKDA 1OLCA 1B4HA 1R6ZA 2DS9A 2DWJA 2RC9A 1NNFA 4X1BA 2UVHA 3K2DA 4TLLB 2PT2A 3FXUA 3EQ1A 3S9NC 1EZPA 3D4GA 2XXTA 1JW5A 1EU8A 1O64A 1S7YA 2XXIA 1MXUA 2F7AA 2RF1A 4LUBA 1Y3NA 1OQGA 1OVTA 2AL5A 1ZBMA 3RQTA 2R9JA 3K02A 1QVSA 2RKMA 5H8NA 3HCQA 1B5JA 3QIMA 2CMOA 3WAEA 4NMYA 3TCHA 4R75A 4U22A 1JVYA 4NF6B 2XXVA 2PYYA 1SDXA 4IO2A 3P7IA 1RKMA 3PUXE 1MH3A 1FTJA 3MQ9A 2LAOA 4LZ7A 3E9XA 4JBZA 2I4CA 3FXQA 1B05A 2UYFA 3VLVA 1PDAA 1XVYA 4TLMB 5H8QA 1MY1A 4OXVA 2THIA 3TODA 4RNSA 3IOTA 3DM0A 2GHBA 3JZJA 1IXGA 4U4SA 2H4IA 5BUUA 4QFNA 3TTNA 1IEJA 1M5CA 3ILTB 2HEUA 3BFTA 4OZ9A 1Y3QA 1URSA 3FJGA 3RT6B 2I49A 1B9JA 1SBPA 2ABHA 1PC3A 3H6TA 1Q1KA 3TFLA 4LZ5A 3UORA 1B3GA 4WEDA 4MLVA 1SW4A 2Q88A 4PFUA 4NF5A 2DE4A 3GZGA 4H1XA 4U4XA 5HPQA 4GL8A 5ITPA 1Y4CA 3DP4A 3TUSA 2B65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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