3O6HA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A novel series of positive modulators of the AMPA receptor: structure-based lead optimization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-07-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3o6hA02
4QFLA 4RPNA 3RN8A 4F39A 2PYYA 5F7VA 3DP4A 1H44A 1A55A 3R6UA 1M5FA 3Q28A 2F5XA 3H06B 3TTNA 1DSNA 4L17A 5ITPA 2XXYA 2PX1A 4IO6A 4NF5B 4H6DA 1OQHA 3IX1A 4ZEBA 1H76A 4U4SA 3QAXA 3EF7A 2OK2A 4QFPA 1QKAA 3HHGA 4HTGA 4YZZA 1B46A 1A54A 4POXA 1CB6A 4U22A 3BKIB 2CZLA 4QRZA 1YPNA 1B4ZA 2H4IA 2RKMA 1VR5A 2F6GA 1R6ZA 3N6TA 4ZECA 2I4BA 3VVDA 2H98A 2Z8DA 3MUQA 4Q5TA 3UGWA 2DWJA 1B3FA 1SYIA 5H8NB 4H0WA 3KBRA 2Q89A 3KJ7A 1B9JA 5TP9B 1MY2A 4F3BA 5IAIA 4EXLA 4BDOA 5AA2B 4TOZA 1QUJA 3CFZA 5H8FA 4LQ2A 3CIJA 4NWCA 3MWBA 1R9LA 1QULA 1N84A 5I2NA 4OZ9A 1Y3QA 4XTCQ 3UIFA 3TKDA 5L9MA 1N0TA 1P1QA 2XXTA 2VP1A 1GVCA 4JXIA 1M5BA 3QYTA 4WXJA 3M3FA 4ELPA 1B2HA 2R9JA 5I84A 5KCJB 4GL0A 4LZ8A 4PFWA 3FXUA 5I57B 3S9MC 3LC8A 4OENA 1B3LA 1Y1ZA 4DCXA 1N7WA 4LUBA 1D9VA 2Y7RA 2F78A 4O3CA 2RC9A 2VHAA 3IOVA 2G93A 4KI0E 4OVJA 3LR1A 2NOOA 1MH3A 1UTHB 4TLMB 1T0KA 3S9NC 4GD5A 5I2KA 4IO3A 3KN3A 2NVUB 3IO4A 3EHSA 4ZDMA 1USYE 1UQWA 3VV5A 1LGBC 1FQDA 3IOUA 4O3BA 3CFLA 2V25A 3IB0A 2QPQA 4GFRA 3M8UA 1Y4CA 3EPEA 2OCUA 4KYDA 4C1TA 3PPNA 2OWSA 2F35A 5DTBA 3CFXA 2XX9A 3OOAA 4NF6B 4I62A 4U2RA 1VSOA 2XXRA 5DYHA 1MS7A 3L6HA 2D21A 1EZ9A 3FXRA 4G8NA 1FQBA 3PMWA 3MQ9A 3IK6B 3G3IA 1B3GA 3K00A 3P7IA 4N6PA 3RTWB 1MQHA 4IO7A 4U1ZA 3VXCA 1FQFA 5H8NA 2ONSA 1JW5A 4U1OA 1A8FA 4FEBA 1JEUA 4RPOA 5TP9A 5ITOA 3KSXA 3MVZA 1SI0A 1QVSA 2ONKE 1ZMGA 3A3UA 1B32A 4FEDA 3UP9A 1MQIA 2H9BA 4F3GA 2F8DA 1XC1A 3U8QA 3QUJA 5CMBA 3TUSA 3KN7A 2DVZA 2Q88A 2B65A 1IXCA 3MC2A 2QS2A 1BKAA 4P0GA 1LAFE 3OO9A 3IB1A 4OHNA 5KCJA 1AL3A 1ZU0A 2ZNTA 4HS7A 3H6VA 3A09A 5JEIA 2ABHA 4EQ7A 3TPAA 3G3JA 2ANJA 4C1UA 2BJJX 1B5IA 2I3WA 4ZEFA 4XIGQ 1UTHA 1I69A 2DWHA 4R74A 3RQTA 2I0CA 5I58A 3N5LA 1M5EA 1EZPA 5H8HB 3H6WA 5ICQA 3LBSA 5BUUA 4JDFA 3OO8A 5H8QB 1LSTA 3IO6A 1JVYA 2VD2A 2V3QA 4M1VA 4RNSA 3EHUA 5HPQA 3H7MA 1MPDA 4OYVA 4E0WA 3PPPA 2DYXA 3RGYA 4AB6A 3FVNA 1SI1A 1PB9A 4PP0A 3TDJA 1PC3A 3DELB 3U93A 4EQ9A 1WODA 4GL8A 4H1XA 1AH5A 2RCBA 4RA1A 2Z23A 1B6HA 1FW0A 3MBPA 1FTMA 3RY3A 4QSDA 3S2VA 4BDMA 3Q26A 5TPAB 3GBBA 3FJ7A 4NEDA 5FHNA 3U94A 3ONMA 1MY4A 4I9DA 1HSEA 4UA8A 4RK9A 4F18A 2HFBA 2HZKA 2RC8A 4XKRA 1NMUA 2Z8FA 3LSFB 2X26A 4NTLA 4MLQA 4ECFA 4F19A 4RJZA 2RCAA 4R72A 1OLCA 1SDXA 3LSWA 1IXGA 1N76A 3E9XA 3OO6A 1TT1A 4DCYA 3CSGA 5H8FB 2F7CA 5CMMA 4U21A 1ZTYA 1JEVA 3G3KA 4R9FA 1DTZA 1MY1A 1MXWA 2YJPA 2DE2A 3S4UA 2XXUA 1B40A 1QJMA 3RT8A 3WAEA 1TFDA 3PUVE 4GXSB 3D4GA 1DOTA 4GQOA 1PEBA 3QIMA 3UK4A 4MH5A 4O3AA 3R7XA 1YCJA 3PD9A 3H6TA 4JWYA 4QF9A 4NMYA 1O63A 5EYFA 3KFMA 5AA1A 1P1UA 1B5JA 4Z7EA 3MVYA 2GHBA 2O1LA 2PMSA 2Y84A 2AL4A 2OZZA 3TEPA 4N13A 3ILUB 4KD5A 1POY1 3T22A 4ND9A 5I2KB 1VFEA 1MH4A 4KCCA 2V3TA 3K02A 1N04A 2DWIA 4MBPA 3SKPA 3VLUA 3IORA 4TLLB 3T96B 3FGSA 3C32A 1ZKBA 1ATGA 2HAUA 3H3GA 4OFJA 3T9UA 4N07A 4GLIA 1NL5A 2QS3A 1XHYA 2ZYNA 4KQPA 3PPRA 3I6VA 1GTKA 3PD8A 2O68A 3UN6A 1NFTA 3V5AA 1TXFA 4EDPA 4P0IA 3QXMA 5KZTA 5K2YA 1D9YA 5TPAA 3OO7A 3K6VA 2GH9A 4I1DA 3T93B 3O2AA 1FQAA 2F7AA 3K1MA 2FA7A 1MRPA 4BDNA 5LOMA 1PB8A 5B70A 1Z7NE 4YKKA 5AA4B 4BLAA 3TTLA 1TFAA 1DPEA 2B3BA 4EXKA 4RY1A 3B6WA 4H8JA 4QFKA 4R2FA 4F2OA 2OLBA 4GF8A 4ZZEA 1URSA 1SYHA 5FHMA 4OTEA 1XVXA 3B6QA 4ONYA 1WDNA 5ISUA 3IJOB 4YB7A 3H6UA 5HBCA 5AA3A 3FJMA 4DE8A 5A5XB 3CVGA 4K3FA 1JQFA 3HN0A 2KLFA 4MF3A 3OXNA 1A8EA 4F1YA 1NKXA 5KDTA 4H5FA 4QSCA 1B51A 1S50A 1FTJA 1B5HA 3EQ1A 1URDA 2Y7WA 4IO2A 2NXOA 3THIA 2DOJA 4HCYA 1QKBA 3D4CA 4E0XA 4LA9A 3GLBA 2HXWA 3HO7A 4X9TA 1H3DA 5I58B 1LB9A 3C35A 4G8MA 1NH8A 4FIMA 3IL1B 1Y4TA 2FYIA 2ZYKA 4DXBA 4GOTA 3VLVA 1B7HA 3E3KA 2D5WA 1XOCA 3R26A 2F36A 3I3VA 2QMXA 3TODA 2GRVA 2XXXA 2E1SA 3O97A 3CI8A 2ZNUA 2I0BA 4OEVA 3TTKA 1ANFA 2RINA 4YB5A 4I8CA 2IEEA 3IOWA 5AE4A 4GVOA 5I56A 1B7UA 2UXAA 3SEUA 4ZS9A 1NNPA 1L5TA 4R9GA 3O9PA 4NE4A 1Y20A 1IUDA 1F9BA 3V89B 3TQWA 4DIGA 1QUKA 2Q8JA 3Q27A 5AA4A 5CM6A 2V84A 3S9LC 1Y3PA 3W9WA 1S7YA 3F11A 3JYRA 1AOVA 1VE4A 2UVGA 2DE4A 3TTRA 1R1NA 1MXXA 1OVTA 3CG3A 3ODBA 1HSLA 2VOZA 1B7ZA 3PPOA 3OSRA 3K6XA 2XXPA 1MM7A 1SW1A 1O64A 4YB6A 4F22A 2QS1A 3UA8A 4OEUA 3VDFA 3PUYE 3M3LA 5A5XA 1LAHE 5TU0A 2ZYMA 3CR9A 4YMBA 2ALUA 4R2BA 1Z7ME 1H45A 4PFTA 4Z0IA 3GXAA 1LLSA 2RC7A 3KG2A 4WEDA 4DXUA 1TWYA 4P11A 1SW5A 2Y7PA 1MQGA 5I59A 1PBQA 3LUYA 5CC2A 1WVJA 1MXYA 5DT6A 2V3UA 3A3CA 2AL5A 5DVIA 1IXHA 1M5DA 1MG1A 2DVCA 2HCAA 3QSLA 4FATA 2AIXA 2UVJA 1US4A 4H5GA 3O28A 4G2ZA 4IY6A 2G29A 2A5TA 2DP8A 4LVQA 3FD3A 2UYFA 3JZJA 4IGTA 1J1NA 3IR1A 2RF1A 3MZ9A 3RPWA 1P1NA 3V83A 2I6EA 4OETA 2PT2A 4OESA 1VFDA 2ZYOA 5CBRA 1LFHA 2H99A 3AXFA 4IGRA 3KOTA 3PMXA 2NWJA 1BP5A 4QSEA 1FQEA 1ZBMA 4GIZA 2O69A 2QL3A 4LP2B 4BDLA 4X1DA 1JW1A 3SEYA 3MP1A 4F3SA 4XKQA 3W15C 2XD2A 2Q2CA 3FV1A 1PB7A 2B3FA 2H5YA 2OWTA 1SW4A 2GHAA 2XX8A 5L9SA 2W7YA 4OFOA 1EH3A 3ZKKA 5ICTA 3IJXB 1JW4A 3QK6A 4UACA 4ELRA 1PBPA 2WKYA 3TCGA 3H03A 2UVIA 3Q25A 1SVXB 2I48A 2I4CA 3VFJA 3B6TA 1SBPA 4F31B 2Z22A 3SDFA 1N3WA 4F2QA 1A99A 4HW8A 4MFIA 4THIA 3IAZA 4KYSA 2HAVA 1IEJA 3LSLA 1FQCA 1OMPA 1USYH 1POTA 2Y7IA 4WEPA 3O6IA 1LCTA 3CRBA 3T9HB 2R71A 2F34A 2OJTA 4FJPA 4KR5A 5DVFA 1A7LA 3S9EA 4IY5A 1UIUA 4EF2A 3K1NA 4KFQA 1B3HA 3K01A 1XVYA 1CE2A 3VXBA 4ESXA 1ELJA 5KDTB 3SEXA 3PUXE 5CMKA 2DE3A 1NNKA 3L6GA 4JB7A 4H65A 4RYAA 2H25A 4ZZAA 3O29A 4GWOA 3K0VA 3TZAA 3FVOA 3JV9A 3OSQA 2VGQA 5F1QA 4PE5B 2DS9A 2P0SA 3W9VA 3E4RA 4XKNA 4NF4B 1QUIA 4JSOA 4PETA 3SEWA 4G68C 2CMOA 4JWXA 1GR2A 1SQYA 3MAMA 1DMBA 5EHSA 3PMVA 3N26A 2P2AA 2I58A 1XT8A 1SW2A 2ZNSA 4YKJA 1LFGA 4YAHX 3KEIA 1YAEA 1B4HA 3VVEA 3SESA 4NF8A 4WKMA 2PBWA 2QSXA 2X7PA 1ZJLA 3K4UA 1IIWA 1MY3A 4OWDA 4OXVA 1MDQA 4G8HA 4NWDA 1FTOA 5I56B 2M8CA 4C0RA 2DSFA 3BFTA 2HZLA 3QUFA 3K6UA 3DM0A 1M5CA 3TQLA 3FV2A 2O1MA 4YKPA 1LBBA 2I49A 4H8IA 4HCWA 3VLWA 3HV1A 1P1OA 2X7QA 3ILTB 3TAJA 1FCKA 4KHZE 5EHMA 3OEMA 5JTYB 3HSTA 3M3KA 4MLVA 1MXVA 1KWHA 4DXCA 2Z8EA 1NNTA 2DXRA 4F1VA 4Q8RA 5B7DA 4OQOA 3C9HA 2F97A 4G4PA 2XHDA 2XXHA 1N3XA 4Q30B 3G7WA 2V93A 2P1SA 4FAJA 3FATA 4R6YA 1LBCA 4G68A 1RYOA 3PUWE 3V8XB 4AB5A 2A5SA 1GGGA 2ONRA 3MP6A 2DXYA 3C4MA 4EQBA 3HPIA 3IOTA 4JSDA 4U4XA 4OERA 5I59B 2PT1A 4G77A 1URGA 5CRYA 3ZS6A 4NF4A 1MY0A 3SETA 1B0HA 3GZGA 3CG1A 4IB2A 3T9VA 3RUMA 3SEVA 2O7UA 1ZLQA 4LATA 2A5TB 4R75A 2LAOA 4YKIA 1MPCA 4YU0A 3VVFA 1A40A 1B1XA 3O6HA 1B05A 2YPNA 3KSJA 3G3HA 5H8SA 2O51A 1Y9UA 4FE8A 4POWA 4NF5A 2QS4A 1LFIA 5CMCA 2XXIA 4YMAA 3K1PA 1QW0A 3PUZE 1BLFA 1I6QA 3FASA 2R6GE 5CBSA 3OENA 1N7XA 3TCFA 1SD3A 4ZE9A 3C31A 3C33A 4LZ7A 1II5A 5FTHA 1YTVA 3LSXA 1GV8A 1MM6A 1DTGA 2REGA 1Q1KA 5JTYA 3N6UA 4R6KA 4M4GA 4LZ5A 4QFNA 1EU8A 3MW0A 2ESNA 1AIVA 3MP8A 2Q2AA 3EN3A 3RTFB 4LQ5A 1FTLA 2XX7A 1NNFA 1NH7A 1UIVA 5JK4A 2D3IA 1LAXA 4LONB 4ESWA 3O6GA 2ZMBA 5DEXB 5AA2A 3CSBA 1B52A 4FECA 1JETA 1LCFA 3TYHA 1MXZA 1RKMA 3DP8A 4EF1A 4R6HA 1UTBB 1ZIUA 2OBGA 1LAGE 4DZ1A 3HHFA 3OD7A 4ZEIA 3PV0E 4IO5A 3IB2A 2THIA 1BTJA 4BDQA 4ZEDA 3PU5A 3KOSA 3ZKLA 5I57A 3ECRA 1OQGA 3WAFA 4GRKA 2PVUA 4JBZA 1JVXA 4ELQA 3PGFA 3PPQA 4Q0CA 3K2DA 1I6BA 4PQJA 4X1BA 3MPLA 2XXQA 2F7BA 4DDDA 3O66A 4PFYA 3N94A 2FNCA 3T66A 1MQJA 4F3PA 1Y3NA 2GFEA 5K2XA 4QFOA 3SERA 3OMBA 3K6WA 3MPKA 5AA2D 3KN8A 2QMWA 3C34A 4F29A 4AQ4A 1US5A 3OEKA 5M2VA 2XD3A 3TCHA 1FTKA 1BIYA 1MXUA 5HM4B 2VD3A 3U72A 1D4NA 2E0SA 2HEUA 3TTMA 5CI5A 1PDAA 3Q29A 4ELOA 4DLDA 4NF8B 4ISUA 4NF6A 1B1HA 2UVHA 2IA4A 4R73A 4XXUA 1B0LA 1P99A 2O84X 1IQ7A 4OFLA 3VE1B 4RK2A 1IZ1A 3MZBA 1D3KA 3TELA 5FHOA 5L9OA 3E13X 4KYEA 1LB8A 2O6AA 3G3GA 1B3EA 3FVGA 3FUZA 3MVXA 1B58A 2YLNA 4U23A 1R9QA 3MZ1A 2DQVA 5J1DA 5DEXA 4OMBA 3I5OA 2Q9TA 4GXAA 2NUVA 1OIBA 1DPPA 3RLFE 5IKBA 1OLAA 3FIRA 3C36A 1H43A 2F6PA 1MDP1 3U1OA 1UTBA 4ZE8A 3TMGA 3EHTA 3HCQA 2QRYA 2XXVA 4JWOA 3KZGA 1S9TA 3DLNA 4IO4A 4EUOA 3MJNA 5FTIA 5ELVA 3FVKA 3BFUA 4TQUQ 3TFLA 1AMFA 3OELA 1HSJA 3BBRA 2ZXTA 3GBAA 3H4ZA 1XS5A 4X48A 4QHQA 5I2NB 1RYXA 3MVWA 3ZSFA 3FZVA 4F1UA 3T9XB 3UORA 5L8DA 2AYSA 4PFUA 4G68B 1P1WA 2O7IA 4YICA 3DP6A 4FORA 3FJGA 2Y7KA 2I3VA 1OVBA 3FXQA 2HQ0A 2DWAA 1I6AA 3USDA 2UYEA 3KGCA 3RT6B 1Y1MA 1JNFA 4BDRA 2QJEA 1MPBA 3G3FA 5H8HA 1O7TA 3RNNA 3KJTA 5BWJA 4KPTA 2REJA 5H8QA 4ZEKA 3B7DA 4RXLA 1IITA 4XKPA 2XXWA 5DVJA 1Q35A 3U92A 1MQDA 1EZOA 1IXIA 4H67A 4KCDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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