3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
4KCCA 3C34A 2XXHA 2Y7RA 2ZNUA 1M5EA 4GF8A 2PT1A 4FIMA 5AA1A 3TTMA 1OQGA 1P1NA 1MH4A 3VLUA 4JWOA 4QF9A 1LB9A 1B9JA 5AA4B 5JEIA 1OLAA 5TPAA 3PPNA 3G7WA 2I0BA 3K02A 3DELB 2BJJX 5HM4B 5BUUA 2F7BA 4F19A 3IK6B 1FW0A 1Q1KA 4XIGQ 1I6BA 3VV5A 4NF5A 1MM6A 1UTHB 3O2AA 1BP5A 1FTOA 2Q2AA 1YAEA 1JEUA 1TFAA 1MS7A 1SW2A 2FNCA 4F3SA 2D21A 5DYHA 3G3KA 1Y9UA 2I4BA 1JW1A 2DVCA 3T96B 3KSXA 4X48A 2QRYA 3H06B 3IO4A 1EZPA 4LA9A 3GBAA 3OENA 1MDP1 4AB6A 1OQHA 2VOZA 1H44A 2V3UA 4LUBA 1JVYA 2X26A 3TPAA 4G2ZA 2F5XA 2PYYA 1B3HA 4FEDA 2ONSA 4L17A 2QMWA 3ODBA 3FXUA 3EQ1A 5FTIA 3MPLA 3FVGA 3QSLA 4JWYA 2HZKA 2RC8A 4U4XA 1NMUA 5L9MA 1N7XA 3TQWA 4ND9A 1VSOA 3C31A 5FHMA 1A7LA 3T66A 5B70A 4FE8A 1P1QA 2RC9A 3QYTA 4X1DA 4ELOA 4N13A 1D3KA 3IOWA 1Y3QA 3GBBA 1AIVA 4F31B 3VDFA 4THIA 3OELA 4I1DA 4H8JA 3TCFA 3IAZA 1MQIA 3MAMA 3OO8A 3IORA 1MRPA 2D3IA 2CMOA 2VP1A 4K3FA 3CI8A 1Y4CA 1EZOA 5H8FB 1B3FA 4BDMA 4WXJA 4Z0IA 2XXTA 3B6QA 2XXWA 1NNTA 2NVUB 1LSTA 3H03A 3HSTA 4IGRA 2ZYMA 1DPPA 4F3PA 3FZVA 1GTKA 3RTFB 4KD5A 3K6VA 5CBSA 4WEDA 4NTLA 2O7UA 1PDAA 4NE4A 3BBRA 3K00A 3CG3A 1PEBA 1D9VA 3G3HA 3TQLA 4R2FA 4RYAA 1VE4A 4LZ7A 3U92A 1XVYA 4OZ9A 2V93A 3LC8A 2FA7A 2VD3A 5CBRA 4NF4A 1AH5A 1LB8A 2F8DA 3MZBA 4ZDMA 3HPIA 3H3GA 5L8DA 3BKIB 4HS7A 2OBGA 1PB8A 4U23A 3TYHA 2F97A 3KSJA 2F6PA 3LSLA 4TLLB 3TMGA 3K4UA 5DTBA 1EH3A 2YPNA 1M5DA 4R6YA 3KN8A 3H7MA 4E0WA 3I5OA 3FATA 2H98A 1ZBMA 3QK6A 1R6ZA 2REJA 4H65A 3PPOA 1VFEA 3PPQA 4GLIA 4PETA 3EN3A 3ZKLA 1L5TA 2O6AA 3HCQA 2XX7A 3IJXB 1SBPA 2I6EA 4OESA 4H8IA 3RT8A 2QJEA 1US4A 2IEEA 5F1QA 2O51A 1POTA 1DMBA 1VFDA 4PFUA 2H99A 3O6GA 2I58A 1CB6A 5IKBA 1QJMA 4F3BA 5I58A 4DDDA 4BDNA 4XKRA 5LOMA 1LBCA 3DP4A 5JTYA 2XD3A 3S9LC 1A8FA 5AA3A 4EQ9A 2XXPA 4FECA 3RT6B 2OJTA 4AB5A 4X9TA 4RY1A 4PE5B 1R9LA 4OWDA 3RQTA 1N3XA 3GZGA 4F1VA 4ONYA 3Q26A 4EXLA 2HFBA 4ZZEA 1P99A 3VLVA 1QW0A 2DP8A 4NF6A 4POWA 4R72A 1IUDA 4MLVA 1HSEA 4RK9A 3TAJA 4RXLA 4C1TA 5AE4A 1NH7A 3JZJA 3IR1A 5EYFA 3D4CA 1B1XA 2B65A 1Y4TA 3PD9A 5DEXA 4NMYA 3M3LA 1AMFA 2O7IA 4JXIA 2H5YA 4XKNA 3FGSA 1WVJA 3DLNA 4JWXA 4GXSB 4GRKA 3C33A 1ANFA 1P1WA 5DVJA 4ESWA 1IITA 2VD2A 3MVXA 4LQ2A 2UYEA 5AA4A 1P1OA 2XXUA 4POXA 2KLFA 1LAXA 2NXOA 2QSXA 1B52A 2Q8JA 4U4SA 3RNNA 1NNPA 1IXIA 3U72A 1B3EA 2GRVA 3A3UA 1MH3A 3KEIA 2Z22A 1O63A 3KG2A 4H67A 5JTYB 3K6WA 1ZIUA 2PX1A 1SDXA 1SYIA 1A55A 4LONB 4UACA 1RYXA 2HCAA 3ECRA 3FXQA 3LUYA 5I2KA 4JSDA 4QRZA 1SW5A 3H6TA 3MQ9A 3C36A 4YKPA 3PPRA 3FUZA 4NF6B 3B6WA 5M2VA 3LR1A 3KN7A 2GHBA 3D4GA 3V89B 4HTGA 1B32A 5KDTA 1FQDA 4G8MA 3BFUA 3PUXE 2DYXA 1WDNA 4IO3A 3R26A 5DEXB 1NNKA 1NH8A 3U94A 4U22A 2F7AA 1SVXB 4DE8A 4OEUA 4GXAA 4BLAA 1DTGA 4YAHX 3N6TA 1H76A 2ZMBA 1MG1A 4O3BA 2P1SA 4KI0E 4P0IA 3S9EA 1LBBA 1MY3A 1B7ZA 2QMXA 2R71A 3RGYA 3SESA 2QS1A 2UYFA 3MZ1A 2DS9A 4GQOA 5CMBA 3ZS6A 1B7UA 4XXUA 1S7YA 3S9MC 3DP8A 2UVHA 3JYRA 4PFYA 4FAJA 1YTVA 1MXXA 1JNFA 4C0RA 4BDRA 4F39A 2Y7KA 2ALUA 3U93A 4XKPA 4FATA 4R74A 4F1UA 2X7QA 4ELRA 3E3KA 3H6VA 2ZNSA 3V83A 4H1XA 3C32A 1MY1A 3OEMA 1MQDA 1R1NA 3O6HA 5I2KB 5TP9B 4F3GA 5ISUA 1URSA 1B4HA 1B0LA 1ELJA 2I4CA 3OXNA 3CFZA 5H8FA 2YLNA 4F22A 3ZSFA 5DVFA 1A54A 3TTLA 3O6IA 4RPNA 2W7YA 2DWHA 5KDTB 2XHDA 4ZEIA 1B40A 1B0HA 3SEUA 4QFKA 3K1MA 2Y7WA 3T9HB 3V8XB 1ZTYA 4H6DA 3KBRA 3KJ7A 4O3CA 3V5AA 3TDJA 3MWBA 2QPQA 2G93A 1N76A 1B5HA 1AL3A 2RCBA 4NEDA 1B5IA 3PPPA 3K6XA 2VHAA 2AIXA 3RUMA 5I56B 1B6HA 4OFJA 2VGQA 1B05A 1IEJA 5FTHA 1FQBA 4WKMA 4QSCA 2THIA 2IA4A 3W9VA 3IOTA 3R7XA 3OEKA 3FVNA 3IB2A 2ABHA 4OHNA 4Q5TA 5FHOA 2DE2A 1KWHA 4IO5A 4TQUQ 3EF7A 5I59A 3O29A 1OVBA 4G68A 1BTJA 1B3GA 1QUJA 1BLFA 1QUKA 2DSFA 4F2OA 1US5A 4YKIA 1ZMGA 3OMBA 4MBPA 5ELVA 3TODA 1HSLA 5FHNA 2Y84A 1UTBA 1PB9A 4XKQA 1YPNA 3B7DA 3I3VA 1SW4A 3A09A 2NOOA 4N07A 4LVQA 4O3AA 5K2YA 1B1HA 2DWAA 1SYHA 2B3BA 1IXCA 4JSOA 5B7DA 2PVUA 1OLCA 5AA2B 1HSJA 3O97A 5HPQA 3Q27A 3HN0A 5KCJA 2YJPA 3MJNA 4QFPA 4OXVA 3KOSA 3WAFA 3FJGA 2UVGA 2NWJA 4IO2A 1PC3A 1FTMA 4U1ZA 4KR5A 3QIMA 4M1VA 3I6VA 3S9NC 2ZYOA 1SI0A 5A5XA 4XTCQ 2AYSA 1MY2A 1GGGA 3GXAA 5H8SA 4U21A 1NKXA 2M8CA 2OCUA 4R6KA 3KZGA 1XOCA 3QUJA 4IB2A 1MXZA 3EHSA 2CZLA 3SEXA 1B51A 5I59B 4KYSA 3ILTB 4LZ8A 3VVDA 1XT8A 4G68B 4IO6A 3PUYE 3N6UA 3CSBA 3UGWA 2Z8EA 3O28A 4G77A 4YB5A 1DTZA 1UTBB 3TUSA 2GH9A 3N94A 3K01A 3G3FA 1S9TA 4DCXA 2DOJA 4DXBA 4QSEA 4EXKA 2ZNTA 4PP0A 1MPCA 4M4GA 1D4NA 2OLBA 4PQJA 3TFLA 3IB1A 2O1LA 4R2BA 3MC2A 2D5WA 5KCJB 1N7WA 3U8QA 3PUVE 5H8HA 3H6WA 2Z8DA 1DSNA 4GL0A 1BIYA 1DOTA 1URGA 4QFNA 3IB0A 3AXFA 2QS2A 3MW0A 3SDFA 1B46A 4KFQA 2AL4A 3TCHA 4KHZE 3Q29A 5A5XB 3FV1A 2ZYNA 3MVZA 4JB7A 3S4UA 3KN3A 1B3LA 3MBPA 1QKAA 5DT6A 2Q2CA 4QFOA 3K6UA 1N84A 3MP8A 4GIZA 5EHMA 4EQ7A 4GFRA 5ITOA 3UORA 3PUWE 3IL1B 3FV2A 1ATGA 3H4ZA 2H25A 4U1OA 1M5CA 1H43A 4I8CA 3UN6A 5I2NA 3T9VA 5H8NB 2A5TB 2XXVA 1EU8A 4OFLA 5CMKA 1M5BA 3CVGA 5HBCA 4LQ5A 3CIJA 4EUOA 1NL5A 2HQ0A 4GD5A 3C9HA 4ZEBA 4FEBA 3USDA 1BKAA 3FD3A 1PB7A 2HXWA 4ECFA 4QHQA 2HAVA 3MUQA 4TLMB 3UIFA 1IQ7A 3HHFA 4ZZAA 4JDFA 3IO6A 1N0TA 4LZ5A 1Q35A 3PGFA 1GR2A 1IZ1A 1A8EA 3SETA 3SEWA 2X7PA 2F7CA 2F6GA 1LFIA 4OQOA 1WODA 2DE4A 4G8NA 4GL8A 4HCWA 4IO7A 3TCGA 3VE1B 3LSWA 2HZLA 5H8HB 3MZ9A 2LAOA 2F34A 2HAUA 1FCKA 1OIBA 2I3VA 4AQ4A 1XHYA 3VXBA 3OO9A 5I57A 3EPEA 4KYDA 1JQFA 3OO6A 4RNSA 3ZKKA 3PMXA 1MXYA 2FYIA 2XXQA 1H3DA 3TEPA 5CMCA 1SW1A 2NUVA 2V3TA 5IAIA 2O1MA 5TP9A 2OWTA 2Y7PA 3SEVA 4NWCA 4EF1A 2RINA 2DVZA 1IXHA 4JBZA 3O66A 5I2NB 2F36A 1A99A 2RC7A 4ZS9A 1J1NA 1Y3PA 4DLDA 4R6HA 1IIWA 5TU0A 2PBWA 3DM0A 3E4RA 1MPBA 3G3JA 4R9GA 4YKJA 3A3CA 1CE2A 1OMPA 4GOTA 1TFDA 1MXWA 2R6GE 4G4PA 1FTKA 3CSGA 1URDA 3RTWB 1LFGA 2UVIA 1MDQA 3U1OA 4MFIA 3G3IA 1B5JA 4I9DA 1A40A 3UK4A 5CC2A 5I56A 1EZ9A 3CR9A 1XVXA 4ESXA 5DVIA 4F2QA 4LP2B 1QVSA 1DPEA 2GHAA 3UP9A 1UQWA 4YU0A 3EHTA 3C4MA 4EQBA 3MPKA 4X1BA 3EHUA 4RPOA 1Y1MA 5I57B 5ICTA 4MF3A 5H8QA 2OWSA 2DXRA 2I49A 2Z8FA 3OSQA 5JK4A 1LAFE 1N04A 4YB6A 4G8HA 2G29A 3T22A 2XXIA 3IOVA 3P7IA 4NF8B 1JW4A 2I3WA 1I6QA 3FASA 4MH5A 4BDLA 2V25A 2DXYA 2Z23A 4BDQA 4KYEA 3PV0E 4R73A 3O9PA 2QL3A 1AOVA 1RKMA 5L9OA 4GWOA 1QULA 4G68C 3KJTA 3FXRA 1USYH 2H4IA 4YZZA 2WKYA 3W9WA 5AA2A 4OEVA 4OYVA 5CI5A 3UA8A 1MM7A 1I6AA 1XS5A 3QXMA 5AA2D 1OVTA 3FJ7A 3PMVA 3KGCA 3IOUA 1FTLA 1MY0A 4TOZA 3IX1A 4FJPA 5EHSA 5L9SA 5K2XA 4HCYA 1NFTA 3K1PA 3T9XB 2Q89A 1JETA 1XC1A 4NWDA 3LSXA 3B6TA 3IJOB 2ONKE 3TTNA 4LATA 3MP1A 2I48A 3ILUB 5TPAB 1IXGA 4EF2A 4DXUA 3FVKA 3Q25A 3TTRA 5H8QB 2H9BA 3CFLA 1II5A 2A5SA 2O84X 3SEYA 4F1YA 1YCJA 4QSDA 4NF5B 3CRBA 2F35A 3QUFA 3T93B 4ZEKA 4H5FA 5J1DA 3H6UA 1MXVA 3MP6A 3HHGA 3N5LA 4MLQA 4P11A 1UIVA 3PMWA 4GVOA 3VXCA 1FQAA 1VR5A 4YMBA 2OK2A 4HW8A 3JV9A 3E13X 1LCTA 3THIA 4OVJA 2DE3A 4F29A 1R9QA 4R9FA 2AL5A 4H0WA 3OD7A 2DWJA 3KFMA 1MXUA 3M8UA 4RK2A 2ZXTA 3OO7A 1O7TA 1M5FA 4RA1A 4U2RA 2HEUA 4OMBA 1MQHA 2GFEA 3TKDA 4ZEDA 3N26A 4KQPA 1B58A 1UIUA 4ELQA 1NNFA 1RYOA 1QKBA 4ZECA 2DQVA 1TT1A 4UA8A 3C35A 2UXAA 5H8NA 2A5TA 2E0SA 2Q9TA 3G3GA 4DZ1A 1MPDA 4DXCA 1B4ZA 4DCYA 2XXRA 1Y1ZA 1JW5A 1H45A 5ITPA 2V84A 4N6PA 4Q0CA 4Z7EA 1QUIA 1Z7NE 3MVWA 1LCFA 2RCAA 1SI1A 3TELA 2ZYKA 2QS4A 2V3QA 4ZEFA 3ONMA 1ZU0A 3M3KA 3TTKA 4DIGA 4P0GA 5CRYA 1TWYA 1ZJLA 3K0VA 4IO4A 1I69A 3HV1A 4H5GA 3KOTA 2PT2A 2P0SA 2Y7IA 3DP6A 4ZE8A 1ZLQA 2PMSA 3SERA 2UVJA 2B3FA 2OZZA 5I84A 1Z7ME 1LFHA 4YMAA 3SKPA 4R75A 2DWIA 4I62A 3W15C 1Y20A 3LBSA 2ANJA 1LGBC 4EDPA 1PBPA 3PD8A 4F18A 2RF1A 4QFLA 4YICA 1FTJA 3L6GA 1B7HA 5CMMA 4OETA 1SD3A 3BFTA 3Q28A 1SQYA 3MVYA 3RLFE 2R9JA 5KZTA 2ESNA 1FQCA 3RPWA 4FORA 3R6UA 2O68A 1POY1 4IGTA 4NF4B 1LAGE 2ONRA 1N3WA 4KPTA 3VVEA 3PU5A 4RJZA 5CM6A 4IY5A 3VLWA 3VFJA 3E9XA 2XX8A 3FIRA 3OOAA 4YKKA 3L6HA 2XD2A 3T9UA 4C1UA 1P1UA 4E0XA 1MQJA 3TZAA 1PBQA 4PFWA 3RN8A 4PFTA 4YB7A 4BDOA 5ICQA 3CFXA 3K2DA 1T0KA 1Y3NA 3K1NA 4Q30B 1MY4A 1LAHE 1FQFA 3OSRA 1S50A 4ZE9A 3PUZE 3S2VA 2QS3A 3VVFA 2I0CA 3CG1A 1TXFA 3M3FA 4Q8RA 4ISUA 2XXXA 4IY6A 1ZKBA 1JEVA 1F9BA 2F78A 1D9YA 5I58B 1FQEA 3WAEA 3HO7A 4NF8A 3GLBA 1UTHA 4OENA 1GV8A 2Q88A 2XX9A 2E1SA 3FVOA 2XXYA 1B2HA 3QAXA 4OERA 3F11A 4ELPA 1USYE 2RKMA 1LLSA 1MQGA 1O64A 4WEPA 3RY3A 4OTEA 3FJMA 5BWJA 4OFOA 2REGA 2P2AA 2O69A 4KCDA 1JVXA 1GVCA 3LSFB 5F7VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ROJA 4KCCA 4H46A 3C34A 2XXHA 2Y7RA 2WX9A 2HXRA 2ZNUA 1M5EA 4GF8A 2PT1A 4FIMA 5AA1A 3TTMA 1LBVA 2PFYA 1OQGA 1P1NA 1MH4A 3VLUA 4PAFA 4JWOA 4QF9A 1LB9A 1B9JA 5AA4B 5JEIA 1OLAA 2KR0A 5TPAA 1NUZA 3PPNA 3G7WA 2I0BA 3K02A 1FBDA 3DELB 2BJJX 3EKIA 5HM4B 5BUUA 4I3YA 2F7BA 4F19A 3IK6B 2B4MA 1FW0A 1Q1KA 4XIGQ 1I6BA 3VV5A 4NF5A 5LTCA 1MM6A 1UTHB 3O2AA 1YZ0A 1BP5A 1FTOA 2Q2AA 1YAEA 1JEUA 1TFAA 1MS7A 1SW2A 2FNCA 4F3SA 2D21A 3ISPA 5DYHA 3G3KA 1Y9UA 2I4BA 1JW1A 2DVCA 3T96B 3KSXA 4NHBA 2CZIA 4X48A 2QRYA 4MAGA 3H06B 1CNQA 3IO4A 1EZPA 4LA9A 4NQ8A 3GBAA 3OENA 1MDP1 4AB6A 1OQHA 2VOZA 1H44A 2V3UA 4LUBA 4OANA 4GWUA 5EQAA 1JVYA 2X26A 3TPAA 4G2ZA 2F5XA 4AS4A 2FIEA 3FBPA 2PYYA 4PE3A 1B3HA 4FEDA 2ONSA 4L17A 2QMWA 3ODBA 3FXUA 3EQ1A 5FTIA 3MPLA 3FVGA 3QSLA 5EQ9A 1FJ6A 4JWYA 5I7IA 2HZKA 2RC8A 2F3BA 4U4XA 1NMUA 5L9MA 1N7XA 3TQWA 4ND9A 1VSOA 3C31A 2XWKA 5FHMA 1A7LA 3T66A 5B70A 4FE8A 1FBEA 1P1QA 2RC9A 3QYTA 4X1DA 4ELOA 1IMFA 4NG7A 4N13A 1D3KA 3IOWA 1Y3QA 3GBBA 1AIVA 4F31B 3VDFA 4THIA 2KQZA 3OELA 4I1DA 4H8JA 3TCFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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