3OEKA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-aspartate
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
281
structure length
270
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNREKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 270
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oekA02
5HPQA 3W9WA 4GXAA 3RPWA 3D4CA 2F8DA 3SEXA 1A8EA 1ZBMA 3MWBA 4ZEFA 1D9YA 3OELA 5DT6A 1B2HA 1A7LA 4OXVA 3Q28A 1YPNA 4LP2B 4GL8A 3SEWA 3C36A 1US5A 3M3FA 1B9JA 3MVZA 3O28A 4OERA 3QAXA 4R73A 5H8NA 1YTVA 1FQCA 2XHDA 1A55A 1PC3A 4RPNA 5EHSA 1B05A 4ESWA 1Y3PA 2PX1A 4ZZEA 2HQ0A 3T22A 1JW1A 3R6UA 4KPTA 3MVXA 2KLFA 4LUBA 1UTHB 3BBRA 4IO3A 4NF4A 2DE4A 4O3AA 3B6QA 3OOAA 2RCAA 3LC8A 4ELPA 1B3LA 1FTMA 4X1DA 1IXHA 3KG2A 4JSDA 3MW0A 4NF5B 1MS7A 1D4NA 2F7CA 1POY1 3PUWE 3IK6B 1S50A 4AQ4A 5I2KB 2ALUA 2THIA 3F11A 3MZBA 2XXHA 1SVXB 3UK4A 5H8NB 3HPIA 2Y7IA 4P0IA 3RTWB 2CZLA 4IY6A 3VLWA 4GL0A 4G8MA 1PB9A 4FEBA 1WODA 2Z23A 4F2OA 4ZDMA 3B6TA 1MY0A 2I0BA 2FYIA 1B4ZA 4GFRA 3FJGA 5H8HA 4OFLA 2DYXA 4R6KA 1NNFA 4THIA 4JDFA 2A5TB 5H8FB 2RF1A 3VXBA 1B3GA 4QFLA 1FTJA 3S9EA 1P99A 4C0RA 1POTA 3C4MA 4F1VA 3T66A 2X7PA 1B32A 3SESA 2G29A 1MPBA 1QUJA 3RQTA 3O97A 3TKDA 1LGBC 1MXUA 4M1VA 3TMGA 4FAJA 3P7IA 5JTYA 2ZYMA 1PBPA 4LATA 4ONYA 2G93A 1MXYA 3UN6A 3T93B 4OTEA 3L6GA 4RA1A 2OBGA 1QULA 1LLSA 3E4RA 4EUOA 3A09A 2NWJA 5H8HB 1AOVA 3MAMA 4YB6A 3MUQA 1RYXA 5ELVA 4U21A 4Z0IA 3TTRA 1MXZA 4F29A 2XXQA 1P1UA 4N13A 4H5GA 4MH5A 2UYFA 1MM6A 4KHZE 3T9UA 3IR1A 1BTJA 4U4XA 4X9TA 4H8JA 5KDTA 3BKIB 3FXRA 3IOUA 4FEDA 2DS9A 5I2NA 4R2FA 4XXUA 1ZMGA 3O6IA 2PT2A 2E0SA 1LSTA 5I57B 4R74A 1ZKBA 5TP9A 1MDQA 4RXLA 2Z22A 2BJJX 3HSTA 4OWDA 1EZOA 3M3LA 1JNFA 4X48A 1B7HA 3O6GA 3IB2A 4YAHX 4FE8A 2I3VA 3PMWA 4YU0A 5ITPA 3BFUA 2HEUA 2B3FA 2VD3A 2YLNA 3N94A 1L5TA 1XOCA 4RK2A 3IB0A 4FIMA 3QSLA 3K02A 3THIA 3KEIA 2P2AA 4NF6B 3PUVE 4AB5A 4YB5A 4YKKA 3TODA 4IGRA 1P1WA 3EHTA 1ZLQA 1AL3A 3CVGA 5I2NB 1SD3A 4OHNA 5DVJA 2O84X 4QFOA 3MBPA 1IZ1A 1PEBA 2XD2A 3FIRA 3DP8A 5B70A 4DE8A 1M5BA 2UVHA 2P1SA 3G7WA 4H5FA 3ZKKA 3DM0A 3KN8A 1NKXA 1OQHA 3OO7A 5FHMA 5CBRA 1JVXA 5DYHA 4IB2A 1LCTA 2XX7A 3OEKA 1LAGE 4NWDA 4YZZA 4WXJA 4ZS9A 5FHOA 4KQPA 3Q27A 2H98A 4QHQA 1VFEA 2XXXA 3TTMA 3TTNA 3PPPA 3R26A 2RC9A 3N6UA 2P0SA 1IXIA 3IO4A 3TUSA 3OSRA 1DTZA 3W9VA 3VE1B 1UQWA 1R1NA 3IJOB 5LOMA 1B40A 2QSXA 4UA8A 5CMMA 3TDJA 4ESXA 1QUKA 4ISUA 2O1MA 3ILTB 3G3KA 4OFJA 3I6VA 1Y1MA 1MY1A 3TFLA 3EHSA 3H3GA 3IL1B 3U72A 2I6EA 3OO6A 3HV1A 4Q30B 3K6XA 2WKYA 3PMVA 2ONRA 3H4ZA 4DXBA 2VGQA 2ANJA 3IOVA 1GV8A 1YCJA 3U93A 5CMBA 2O7IA 4ND9A 1D3KA 4OETA 4PFUA 2V3TA 2E1SA 5ICTA 1MXXA 1R6ZA 3ILUB 3KJTA 4ZEDA 4BDOA 4XKNA 1FW0A 1A54A 2QMWA 3K2DA 2Z8DA 2B3BA 1OMPA 4C1TA 3H7MA 1FQFA 3FJ7A 5BWJA 1SW5A 4JSOA 3SEUA 3GBAA 4N07A 3B7DA 5I59B 3H6VA 4G68C 3EN3A 4Z7EA 1LAFE 4BDNA 2X7QA 3H06B 1BIYA 3MPLA 1I6QA 2H5YA 3UIFA 3IX1A 4LVQA 4OENA 3SERA 3QK6A 2DE2A 3PMXA 1EU8A 4AB6A 1NL5A 2H4IA 2XXTA 4XKRA 3TTKA 2ESNA 1OVTA 2DVZA 1XVYA 2B65A 4ELOA 4LA9A 1LB8A 2ONKE 4WKMA 2DP8A 3TZAA 5AA2A 2HFBA 2Y7KA 3SEVA 2DE3A 5K2YA 3VLUA 2NVUB 4KYDA 2QPQA 2OWTA 3DLNA 1T0KA 1DTGA 3UA8A 1P1OA 4EDPA 3ZSFA 2XD3A 3S2VA 3BFTA 1B52A 1XT8A 3CRBA 3G3GA 1ZJLA 3PPQA 1MRPA 4O3BA 4KD5A 2ABHA 3IB1A 2F36A 4PFYA 3FV1A 4YMBA 1ELJA 3K0VA 2I3WA 1MPCA 3O9PA 3PD8A 5JK4A 4NWCA 4IO7A 5CBSA 2Q9TA 1Q1KA 2F7AA 3O66A 5L9SA 4EF2A 5I56A 1Y9UA 1Z7ME 4QFKA 3Q29A 1FQDA 3CSBA 4QSEA 3LBSA 3MZ1A 3S9NC 4QRZA 2F6PA 5CMCA 3OO8A 3EPEA 1M5FA 2DWHA 3MP1A 4U1OA 4FECA 1PB7A 3TELA 2XXRA 3FASA 2ZNUA 3C35A 3K6VA 2Z8EA 1H3DA 1BLFA 1AMFA 2V3QA 3M8UA 4GXSB 2AIXA 3PUZE 4ZZAA 3W15C 4LONB 1VE4A 2QS3A 3HO7A 1I69A 4F3GA 2IEEA 1B1XA 3CFLA 2O51A 2QJEA 5H8QA 1IXCA 4NF4B 5DEXA 1B1HA 4UACA 1IUDA 4TQUQ 1Y20A 3MVYA 1FQEA 4BLAA 1EH3A 2XX9A 1QVSA 1VFDA 4POXA 3U94A 3FD3A 2F78A 1CB6A 2HAVA 3RLFE 1NNKA 1NNTA 4I8CA 5F1QA 3ONMA 4M4GA 3CFXA 1US4A 4DCXA 5J1DA 5DVIA 1IITA 4GVOA 4GD5A 1O63A 3LSWA 1FCKA 4HCYA 5JEIA 4YMAA 2REGA 2VP1A 3VVDA 5H8QB 4R6YA 3UORA 4HTGA 5DEXB 3VVFA 1DSNA 3KFMA 4GIZA 1N76A 1Z7NE 2V84A 2UYEA 4OEVA 3VVEA 1UIVA 3KOTA 2Z8FA 1M5CA 4E0XA 1SI1A 2ZYOA 4EQ9A 5AA4A 4C1UA 1VR5A 1M5EA 2LAOA 1R9QA 1BP5A 2O6AA 3V89B 2D5WA 1LFIA 2NOOA 1AH5A 2QMXA 4H67A 2O1LA 5JTYB 3H6TA 1XVXA 1A40A 1LCFA 3QYTA 1YAEA 3B6WA 4JWXA 4NF8A 4BDRA 4OQOA 3IJXB 1FTLA 4I62A 4LQ2A 1IXGA 3VLVA 1B3HA 4LZ8A 5HBCA 1WDNA 1HSLA 1N84A 4ZEIA 3TYHA 2DVCA 4U2RA 4YKJA 1XC1A 4G68A 1MH4A 1FTKA 1XHYA 4FJPA 3CIJA 1Q35A 4XIGQ 1II5A 4GRKA 5TPAA 1LBBA 4XKPA 1P1QA 1DPPA 3VXCA 1A8FA 1N3WA 1N7WA 3T9VA 5KDTB 4R6HA 5A5XA 3CFZA 2OZZA 3KZGA 4DIGA 5CC2A 1B3EA 1LB9A 5TP9B 2YPNA 1GR2A 1B0HA 1UIUA 5I84A 3TCHA 4ZE8A 5CI5A 4KR5A 1PB8A 2Q2CA 1DMBA 1DOTA 1MQJA 3QUJA 1O64A 3E9XA 1Y3QA 2DOJA 2FNCA 1ATGA 4YKIA 5BUUA 4R9FA 2RC8A 3O6HA 3C9HA 4IO6A 4MBPA 4TLMB 4QFPA 3FVNA 2H9BA 2OCUA 4PFWA 4NEDA 2W7YA 4DCYA 2O68A 3SETA 1URDA 1B3FA 3FV2A 4EQ7A 5AE4A 5A5XB 1JQFA 2GHAA 3G3IA 2D21A 1SBPA 2REJA 1S9TA 3FVGA 1NFTA 4YICA 4Q0CA 1H45A 2ZYKA 1N04A 1B4HA 3CSGA 3PPRA 3SEYA 4LZ5A 4O3CA 1MXVA 4XTCQ 1MPDA 1UTBA 4ZEKA 1S7YA 3K4UA 5HM4B 1TWYA 3C31A 3K6WA 3OD7A 4RJZA 2XXYA 4MLVA 4F19A 3S4UA 4P0GA 3TPAA 4DXUA 3PU5A 4U22A 5CRYA 4HCWA 1HSJA 1MY2A 1TXFA 3ZS6A 4TOZA 1I6AA 4MF3A 3V5AA 3LUYA 4KFQA 4QSDA 1JW5A 1MDP1 4ELQA 3FVOA 1NMUA 4TLLB 2ZMBA 1B5JA 2ZNTA 3LR1A 3FXUA 1B51A 5B7DA 2HZKA 1NNPA 1NH7A 3FGSA 3V83A 2Q8JA 1B5IA 1WVJA 1Y4TA 5CM6A 3EF7A 3KOSA 2Y7WA 4K3FA 1OLCA 3HHGA 4NTLA 2D3IA 2DWIA 3ECRA 2DQVA 2GFEA 4BDQA 4JWOA 4OVJA 3FATA 1N3XA 5L8DA 3E13X 1LAXA 3PUXE 1MM7A 3QIMA 2DXYA 4PFTA 4E0WA 4F31B 1B6HA 4QSCA 3RN8A 3DP4A 4F1UA 2R6GE 3RY3A 1FTOA 1B7UA 2AL4A 1UTHA 2I58A 4G77A 5KZTA 4G4PA 4DZ1A 3N26A 1URSA 4F3SA 4H1XA 4JBZA 1SYHA 4F2QA 4F3BA 1ZTYA 2NXOA 4EXLA 3RT6B 1VSOA 4NF5A 4JWYA 1F9BA 1Y1ZA 3V8XB 4R72A 3RTFB 4EF1A 5I2KA 2M8CA 4OYVA 2UVGA 1O7TA 3OO9A 4QF9A 2R71A 1GGGA 4Q5TA 4BDMA 2XXIA 5L9OA 2H99A 2RKMA 2R9JA 4LQ5A 5IKBA 3I5OA 4X1BA 1JEVA 2V25A 2I4BA 3TCGA 2HAUA 1SW4A 2F5XA 4HW8A 5AA2B 3KN7A 4F39A 1MY4A 5FHNA 1MQIA 3VFJA 4YKPA 4PE5B 2OLBA 1IIWA 3E3KA 3K01A 3T9XB 1URGA 2I4CA 1OQGA 5H8SA 1JEUA 2AYSA 2RC7A 2A5TA 5H8FA 4RY1A 4FORA 5TU0A 2QS4A 4OZ9A 2Q2AA 2OJTA 5FTIA 3VV5A 3OEMA 1J1NA 1I6BA 3IOTA 3JV9A 4L17A 3IOWA 1LBCA 1NH8A 5KCJA 2GHBA 4H6DA 1MQHA 3TCFA 4OESA 4GLIA 5I56B 1FQBA 1B7ZA 1ANFA 4U23A 3WAFA 3OENA 1MQGA 1M5DA 2GH9A 4F3PA 4FATA 4G2ZA 4U1ZA 2PT1A 3CR9A 1SW1A 2CMOA 3PUYE 4F18A 1CE2A 3RNNA 3CI8A 2XXUA 4GF8A 3RGYA 3D4GA 3C33A 1XS5A 3OXNA 1DPEA 1H43A 3HCQA 2UVIA 1RYOA 4JXIA 1H44A 5DVFA 1MY3A 2VOZA 1Y3NA 3DELB 1PBQA 3SKPA 1N0TA 4ZECA 4H0WA 4ECFA 3LSLA 1IQ7A 5KCJB 1N7XA 4NMYA 2QS2A 1Y4CA 1SW2A 4R2BA 3MZ9A 2Y7RA 5I57A 2DXRA 4IO5A 3N6TA 2PVUA 3USDA 2ZXTA 3K00A 4MLQA 2HZLA 2RINA 5I58A 1ZU0A 2F35A 4I9DA 1SDXA 1QW0A 3G3JA 3MJNA 2ZYNA 3JZJA 1P1NA 3C34A 4OEUA 2V3UA 1D9VA 3R7XA 1KWHA 4G8HA 5IAIA 4ZEBA 3TQWA 4NF6A 1QJMA 1GTKA 3LSXA 3C32A 2OWSA 2HCAA 5M2VA 3AXFA 1PDAA 1SI0A 4GOTA 2XXWA 1QKBA 1LFHA 5AA1A 5EHMA 2GRVA 5L9MA 4RK9A 2FA7A 4ELRA 1HSEA 3MC2A 3HHFA 3T96B 1QKAA 1MG1A 1FQAA 1USYH 2F6GA 4PQJA 3GBBA 3EHUA 5I58B 2Y7PA 2PBWA 3U8QA 3CG1A 3GXAA 2VD2A 5AA4B 2I49A 1B46A 3KGCA 3RUMA 2UXAA 3K6UA 3Q26A 1OVBA 3O2AA 3SDFA 1R9LA 4P11A 4NE4A 3PV0E 2NUVA 4RYAA 3ODBA 5ISUA 3WAEA 1JETA 3MP8A 4BDLA 3OSQA 2PYYA 4NF8B 3T9HB 2QS1A 4IO4A 1GVCA 1SYIA 3EQ1A 4WEPA 2ZNSA 2DSFA 4R9GA 3LSFB 2YJPA 4G68B 3GZGA 2OK2A 2ONSA 1LFGA 4EXKA 1B0LA 2PMSA 5CMKA 3GLBA 5EYFA 5TPAB 3TEPA 2QL3A 4N6PA 4KYSA 4RNSA 2X26A 2UVJA 1MXWA 1OLAA 3U92A 2F34A 4GWOA 4F1YA 2XXVA 1EZPA 3KN3A 3HN0A 5K2XA 4I1DA 3K1PA 4DDDA 4U4SA 1USYE 4IY5A 2Q89A 3KSXA 3O29A 1MH3A 2F7BA 5ICQA 1B5HA 4H65A 3MP6A 3TTLA 1OIBA 3MQ9A 4QFNA 1MQDA 4WEDA 4KI0E 1BKAA 4XKQA 3JYRA 3FJMA 1EZ9A 2XX8A 3A3UA 2XXPA 3A3CA 3QXMA 4LZ7A 5FTHA 3PPNA 1TFDA 1AIVA 2Y84A 3I3VA 3RT8A 4IO2A 1ZIUA 1SQYA 3MVWA 3TQLA 1A99A 3L6HA 2DWAA 4KCDA 3H6UA 4POWA 3IAZA 4HS7A 2O69A 4EQBA 5I59A 1JW4A 3K1MA 2A5SA 3QUFA 4DXCA 3UP9A 3G3FA 4MFIA 3U1OA 5AA3A 1TT1A 3PGFA 2DWJA 3FUZA 3PD9A 1H76A 3IO6A 3PPOA 2AL5A 3VDFA 1TFAA 3FZVA 4R75A 3KSJA 3G3HA 3H03A 4JB7A 2QRYA 3ZKLA 2VHAA 2HXWA 2Q88A 1LAHE 1JVYA 1UTBB 4KYEA 2F97A 5DTBA 3FVKA 4DLDA 3IORA 4RPOA 5AA2D 2IA4A 3OMBA 4KCCA 3S9MC 4F22A 3DP6A 1RKMA 4H8IA 3CG3A 4ZE9A 3UGWA 4PP0A 2V93A 4IGTA 4OMBA 3KBRA 5F7VA 3H6WA 3MPKA 4OFOA 4G8NA 1IEJA 4GQOA 3N5LA 2RCBA 3KJ7A 3K1NA 3Q25A 2H25A 1QUIA 2I48A 1B58A 2O7UA 3FXQA 4PETA 3S9LC 4Q8RA 2I0CA 4YB7A 3M3KA 5ITOA 3TAJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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