3OEMA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with n-methyl-d-aspartate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
281
structure length
268
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 86
structure length 268
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA02
1SW4A 4ESXA 2Z8FA 2NUVA 1Y3QA 3O97A 4EQ9A 3H7MA 4RK9A 2DWIA 3QXMA 3IO4A 5A5XA 4C0RA 3OOAA 4H6DA 1Q35A 4GWOA 2PVUA 5DEXB 4H5GA 1OMPA 1O7TA 3TDJA 4AB6A 4PFTA 3UP9A 3PPRA 1OVBA 3UA8A 1ZTYA 2DVCA 1Y4CA 2VP1A 1R1NA 4ESWA 3GBAA 3G3IA 1JNFA 1LBCA 2NOOA 1P1UA 4R73A 3I5OA 2THIA 1S9TA 4BDNA 1B7UA 1CE2A 1HSJA 2UYFA 3DP4A 1ELJA 2D3IA 1TXFA 2NXOA 4G68A 4PFWA 5ELVA 2AL5A 2ANJA 3KFMA 4THIA 1KWHA 4NWCA 1FTMA 3A3UA 3MP8A 3O29A 4FE8A 3H6UA 1PEBA 4ZECA 2XXQA 3PD9A 2HAVA 3LSWA 4JWOA 4P0GA 3TTLA 4DXCA 3IK6B 5I2NA 3SETA 4OYVA 4Q30B 1RYOA 1JQFA 3MPLA 3BFUA 4WEPA 1UTBA 4ISUA 3TQWA 1I6AA 5TPAA 1IUDA 3CVGA 4H5FA 2REJA 3MWBA 3V8XB 4U1ZA 3B6TA 2ONRA 2I48A 3K6XA 1MXUA 2HQ0A 4LP2B 2F8DA 2AL4A 4IO2A 3ZS6A 3PV0E 4QSEA 3MPKA 1A54A 2OBGA 5I2NB 4FORA 2DOJA 3IOTA 3RT6B 3W15C 4O3CA 3ECRA 1UTBB 5TPAB 4IY5A 1B7HA 3KN7A 3PUVE 2YPNA 4JB7A 3TTKA 3K00A 3V5AA 3HPIA 1LAFE 3IJOB 3C4MA 5L9SA 4RY1A 1Y1ZA 4KQPA 1MQGA 1IITA 1EZPA 3MJNA 1URDA 3OELA 3E3KA 1N84A 2QS4A 1OVTA 4R72A 2OWTA 3DLNA 5L9MA 3TODA 4ZEDA 1TFAA 1B6HA 3CI8A 4F1VA 5ITOA 1OLCA 3RTWB 2E1SA 2HZLA 1XVYA 4F19A 2IEEA 1B5HA 3DP8A 2Q9TA 4OEVA 2RKMA 1NFTA 2P0SA 1B51A 2B3BA 1MS7A 3WAEA 1FTOA 1NNFA 3FV1A 4TQUQ 4RA1A 5F1QA 1HSEA 3U72A 3KBRA 1B0HA 3N94A 4GOTA 3RY3A 3PMXA 2VHAA 4YKIA 5DT6A 1LAXA 1ZJLA 2ESNA 3A09A 4OFOA 3L6GA 3KEIA 1Y4TA 2FNCA 3PUXE 4LQ2A 3QUJA 3MC2A 3BKIB 3SEWA 1Y9UA 4F3BA 2DS9A 1M5EA 2F5XA 3V83A 3OO9A 3VXCA 4NF4A 2OWSA 1M5CA 3MP1A 1XC1A 1B3HA 1Y20A 3EHTA 2VGQA 3S9MC 4PFUA 3ZKKA 1D9YA 4LA9A 4GF8A 1N76A 1POY1 2NWJA 3L6HA 1B3FA 5AA2B 1ATGA 3H3GA 4U22A 2F7BA 4F2QA 1SDXA 5LOMA 3MVXA 3O6GA 1J1NA 1DPPA 4N6PA 4O3AA 2YJPA 3FASA 4IGRA 3LSFB 1QVSA 1H45A 4NMYA 3PUWE 4OFJA 2DQVA 3FXUA 1PB8A 2HZKA 2OCUA 1AMFA 4H8JA 5KDTB 2RC9A 3SDFA 5FHOA 4U4SA 1AL3A 3N6TA 4NE4A 4EXKA 4H1XA 3GBBA 1LAHE 1UIVA 2B3FA 3FGSA 1QJMA 4RPOA 3LBSA 5AA4A 1A7LA 4LQ5A 4POWA 4XKNA 3EF7A 1A99A 1MDP1 3LR1A 3ODBA 1HSLA 4WEDA 1LCTA 3JYRA 4LZ8A 4OENA 2ZNTA 4DZ1A 5CMKA 3U1OA 1USYH 1B32A 5B70A 3VVEA 1IQ7A 3F11A 1GR2A 3PPNA 4TLLB 2Y7RA 4JWXA 4KYDA 1B4ZA 4NF8A 2Q2AA 4H8IA 1IEJA 3OEMA 3K6VA 4KCDA 4YMBA 4RYAA 5I58A 5I2KB 4JDFA 2GFEA 3EHUA 3IAZA 3CFLA 2V25A 5CBSA 3S4UA 3D4GA 4GLIA 1JVXA 1IIWA 4DXUA 1LCFA 2QJEA 3FVNA 1N7XA 3P7IA 4QFNA 1PB9A 2DWAA 3VLWA 3Q27A 3ILTB 1N3WA 3KG2A 3IB2A 1JW1A 1MPDA 2CZLA 2F36A 4XKRA 5DVJA 1MXWA 4L17A 4U2RA 1BIYA 5I58B 5TU0A 3O28A 1PDAA 1PC3A 3Q29A 2UYEA 1LB8A 3S9LC 4QHQA 1SD3A 5KCJA 2IA4A 1DTZA 4XTCQ 5ICTA 3OO6A 2GHBA 3K02A 2AIXA 1WDNA 5BWJA 3TEPA 4ZEBA 2I49A 4GL0A 2F7CA 1SYHA 1ZIUA 2ALUA 1H43A 4FATA 3MUQA 1LFGA 1MQHA 2RINA 1OIBA 5IKBA 2QPQA 3IB1A 3H6VA 5KCJB 2ZYOA 1Y1MA 1NH7A 3FD3A 1DOTA 4IGTA 2XXIA 2XXPA 3TKDA 4G8NA 2Q88A 4BDMA 3CSBA 2Y7PA 4MLQA 5HBCA 1B1HA 4FECA 3PPOA 3B6WA 4FEDA 4BDLA 5DVIA 1TWYA 2NVUB 4RXLA 4OFLA 5AA1A 4KYSA 4N07A 3RTFB 1Z7ME 1TT1A 1ZKBA 1MRPA 3KSJA 1OLAA 3FVGA 4UA8A 3FJ7A 1LSTA 4XKPA 4DXBA 2ONKE 1QUJA 1PBQA 1LBBA 1P99A 2PMSA 3GZGA 3E13X 3OO8A 2H98A 4ELQA 4K3FA 1Z7NE 5H8FB 2LAOA 2O7UA 4I62A 1MDQA 5K2XA 3TPAA 1ZLQA 3Q26A 2Z8EA 1AH5A 1OQHA 2VD3A 2XXTA 5I57B 3IL1B 3UIFA 4U4XA 4BLAA 1IXHA 2P2AA 3H06B 4GL8A 4GRKA 3M3LA 2ZNUA 4O3BA 1IZ1A 2H5YA 2UVIA 4RK2A 2Z8DA 3B7DA 3KZGA 1EZ9A 3N6UA 1NNPA 1H76A 3QSLA 3EN3A 1YCJA 3S9NC 3TAJA 4OERA 5I59A 4X1BA 5IAIA 4QRZA 2XX8A 4MF3A 2XXHA 4IO6A 4ECFA 4X48A 3FVKA 3SEUA 2PYYA 1MY3A 1NNKA 3FATA 1GV8A 3H6WA 3IOWA 3IOUA 4GQOA 3N5LA 2ONSA 3K01A 1MM7A 1ZBMA 1I6QA 2G29A 2V3QA 1FTLA 4AB5A 2HFBA 2X26A 5I59B 4OHNA 4YAHX 2DE4A 3RGYA 1WVJA 3RNNA 4EDPA 1MH3A 1PBPA 3VDFA 4FIMA 3TELA 3CG1A 4NF6A 1VSOA 2D5WA 1LFIA 2DP8A 1MQJA 2I0CA 2R71A 4AQ4A 3G7WA 5ISUA 3FVOA 1FQEA 4YKKA 1B5JA 4DIGA 2H9BA 4KI0E 3O66A 2H99A 3RPWA 3RUMA 4JSOA 3MAMA 3KOSA 4HTGA 4IO4A 4NF6B 4ZS9A 4Z7EA 1S50A 5AA2D 2FA7A 4MFIA 2Q89A 1H44A 1SW2A 1QUIA 3OD7A 1D4NA 3FJMA 3LC8A 4QFKA 4ND9A 1P1QA 3Q25A 4XXUA 1FTJA 4OEUA 3UK4A 4OZ9A 2VD2A 5AA2A 2QMWA 3M8UA 3B6QA 4KFQA 4POXA 2I4BA 3FV2A 1FQBA 4E0WA 2O1LA 3OEKA 3U93A 1R9QA 3U92A 1N04A 3G3KA 1P1NA 1POTA 2R9JA 5H8QB 1MQDA 2REGA 2I3VA 3TMGA 5I56B 2WKYA 3PMWA 5KDTA 2Z22A 5FTIA 3VFJA 2VOZA 3JZJA 4YB7A 2UXAA 3MP6A 5ITPA 3H4ZA 2FYIA 1NH8A 2XXUA 1QKAA 3C32A 4MH5A 2B65A 2DWJA 3FZVA 4RNSA 5CRYA 4NWDA 3G3JA 2A5TB 1B0LA 1MPBA 1MY1A 2XXXA 1IXCA 2HEUA 2O69A 1A8FA 3JV9A 4JSDA 4F1UA 2OLBA 3G3HA 5JEIA 1OQGA 3OSRA 2F34A 2V93A 3TTNA 5H8HA 3G3GA 4PFYA 2BJJX 3MVZA 3LUYA 5K2YA 1Q1KA 3EQ1A 1ZU0A 3K1PA 1URSA 1RYXA 4ZZEA 4OETA 3C31A 1MM6A 2GH9A 4WKMA 3SKPA 3A3CA 1FQAA 2O51A 3C33A 5I2KA 4G68C 1R9LA 3K1NA 2XD2A 4GVOA 1RKMA 3E9XA 4LONB 1B4HA 3U94A 4ZE8A 1NMUA 1N3XA 2YLNA 3HSTA 5H8HB 2D21A 3MW0A 4ONYA 5EHMA 3R6UA 4LATA 5CMCA 3MVWA 4XIGQ 4RJZA 4R6YA 4QF9A 3V89B 2XXWA 1WODA 4LZ5A 1SI0A 4F18A 1IXIA 4NF5A 3CR9A 3HN0A 4C1TA 4EUOA 3M3KA 3O6IA 5H8NB 3KN3A 3VE1B 1MY0A 1B1XA 1II5A 4Q8RA 4OQOA 3C36A 1JVYA 4DDDA 1QULA 4U1OA 2Y7WA 3T66A 3TYHA 2O84X 1DPEA 4OESA 2PT1A 4R2BA 2I58A 5CI5A 5JTYA 4NTLA 1M5DA 4QFOA 2Z23A 1USYE 4NF5B 4BDOA 1B3GA 3K1MA 3OO7A 4ZDMA 2XX7A 1SW1A 3IO6A 3O2AA 1MPCA 4R9FA 3OSQA 5L8DA 4ZEFA 1SBPA 5M2VA 3PMVA 4JWYA 1QKBA 3K2DA 5JTYB 5TP9B 1B05A 5DVFA 4JXIA 5HPQA 4BDQA 2V84A 3KSXA 3T9XB 3TFLA 1GTKA 5ICQA 3Q28A 4DE8A 4KCCA 4YB5A 4H67A 3PGFA 4F31B 2I0BA 2DVZA 2RC7A 3CIJA 3T9VA 4HCYA 3T9UA 2ZYKA 3RLFE 1MY4A 4I8CA 2QRYA 2V3UA 5H8FA 1GGGA 4PQJA 1US5A 3TQLA 4Z0IA 1I69A 1VFEA 4KPTA 2E0SA 4YMAA 3MZ1A 3EHSA 2OZZA 4ELRA 2O1MA 3OENA 3FUZA 3IX1A 5FHMA 5I57A 3VVFA 1N0TA 3S2VA 2DYXA 3S9EA 3CG3A 3MVYA 4Q5TA 1MXYA 1MXXA 1ZMGA 4G8MA 1LLSA 3UORA 1B58A 4I1DA 4ZE9A 4KHZE 3CSGA 2XXYA 4U21A 4LUBA 1M5BA 3LSLA 3PU5A 4DLDA 2X7QA 2I4CA 4YZZA 1VE4A 2UVGA 3QK6A 1JETA 3VLVA 1FQCA 4N13A 3RT8A 4RPNA 4X1DA 2GRVA 2GHAA 3QIMA 1H3DA 3KGCA 1GVCA 4H0WA 4NEDA 2QMXA 4R74A 2R6GE 2UVHA 4GXAA 1DMBA 5A5XB 4MBPA 1S7YA 2PX1A 1N7WA 2HCAA 2O6AA 5KZTA 5CBRA 3IOVA 1R6ZA 3OXNA 5DTBA 1B9JA 3GXAA 3G3FA 3RN8A 4C1UA 4KR5A 1EZOA 1EH3A 4F22A 3PD8A 5FTHA 4LZ7A 2XXRA 1FQDA 3LSXA 2RF1A 4G68B 1B40A 1JW4A 3MZ9A 4OMBA 4GD5A 2ABHA 3BFTA 4DCXA 3VV5A 2RC8A 2A5SA 3USDA 3HHFA 4R6KA 2X7PA 3VVDA 2F35A 1B5IA 1TFDA 1IXGA 4YB6A 2H4IA 1MH4A 3SEYA 3W9VA 3O6HA 3D4CA 3R7XA 2HXWA 5CC2A 4HS7A 4OXVA 4M4GA 2KLFA 2ZXTA 1YTVA 4FEBA 1NKXA 1BTJA 4R2FA 3AXFA 3QYTA 2V3TA 1LB9A 2RCBA 2F6PA 3CRBA 3KN8A 3DM0A 3MBPA 2QL3A 2QS1A 5CM6A 4ZEKA 3PPPA 1VFDA 1LFHA 4UACA 2XX9A 3H03A 2F7AA 4OWDA 4XKQA 3OMBA 4Q0CA 4ELOA 3MZBA 1EU8A 2I3WA 4IY6A 4YU0A 5H8QA 3K6UA 4EQBA 5I56A 3BBRA 1DTGA 4EXLA 4GXSB 5AA3A 2XXVA 1A40A 5EHSA 5CMBA 4GFRA 3FXRA 3WAFA 3GLBA 4QFPA 2Y7IA 3I6VA 4I9DA 2F6GA 5JK4A 4F2OA 4FJPA 1AIVA 1B3LA 2O68A 2QSXA 2A5TA 3HO7A 3UGWA 1SVXB 4P11A 1SI1A 3C34A 2O7IA 2G93A 1UQWA 3ZKLA 4QSDA 4ZEIA 3DP6A 2P1SA 1CB6A 1BP5A 1NL5A 1O63A 1SYIA 5CMMA 1YAEA 4G2ZA 3ONMA 3VXBA 3HCQA 3IR1A 3K0VA 4MLVA 3C35A 2XD3A 3ZSFA 4HW8A 5HM4B 1JW5A 4ZZAA 4PP0A 2DE2A 1B3EA 4R9GA 1Y3NA 5H8SA 1D9VA 4F39A 4IO7A 1D3KA 3IORA 2Q2CA 2RCAA 3T93B 1QUKA 4ELPA 2F97A 3E4RA 4F3PA 3SERA 2ZYNA 4NF4B 3TCGA 3QUFA 4OVJA 3CFXA 4PE5B 1BLFA 5L9OA 3IB0A 3MQ9A 3TTRA 1UTHA 3IJXB 2CMOA 2QS2A 5DYHA 3K6WA 4YICA 2ZYMA 2OJTA 4F3GA 3PPQA 1MG1A 5H8NA 2Q8JA 2OK2A 4QFLA 1QW0A 4TLMB 1BKAA 4E0XA 2PBWA 1T0KA 1NNTA 1JEVA 2QS3A 2DWHA 3FIRA 1UTHB 3TCFA 1URGA 1L5TA 4F1YA 2Y7KA 3N26A 3KJTA 4G4PA 5EYFA 4PETA 3TUSA 1O64A 4IB2A 3PUYE 1A55A 4KD5A 1B7ZA 3KOTA 4H65A 1SW5A 3FJGA 2Y84A 3C9HA 1VR5A 4F29A 1P1OA 1ANFA 5AA4B 4P0IA 3DELB 3QAXA 1MQIA 4GIZA 1B46A 1UIUA 2I6EA 4EQ7A 3TZAA 1F9BA 4G8HA 4FAJA 3R26A 3HHGA 2DSFA 4M1VA 5TP9A 3CFZA 4U23A 4YKJA 2ZMBA 4EF1A 3T96B 2DXRA 3FXQA 3T9HB 3HV1A 1YPNA 5FHNA 2XHDA 4BDRA 4NF8B 3TCHA 4IO5A 4F3SA 3U8QA 4KYEA 5B7DA 1P1WA 2ZNSA 4G77A 4HCWA 1XVXA 5F7VA 4X9TA 2W7YA 1XHYA 1B52A 1MXVA 2HAUA 3T22A 5I84A 2AYSA 3ILUB 4DCYA 3THIA 1MY2A 1AOVA 3RQTA 3UN6A 3I3VA 1DSNA 4QSCA 1A8EA 1MXZA 4OTEA 1I6BA 1B2HA 5J1DA 2PT2A 1FW0A 1M5FA 3K4UA 4LVQA 4R75A 1Y3PA 1XOCA 5BUUA 4R6HA 1FQFA 3SEVA 4IO3A 4JBZA 4YKPA 3W9WA 1XT8A 3PUZE 2H25A 3KJ7A 4WXJA 1LGBC 1FCKA 2M8CA 4EF2A 3TTMA 3SESA 1SQYA 3SEXA 1US4A 2F78A 4TOZA 5DEXA 1XS5A 2DE3A 3M3FA 1FTKA 1LAGE 1PB7A 5AE4A 2DXYA 1JEUA 3O9PA 3EPEA 3H6TA 2UVJA 3VLUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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