3PMVA

Ligand-binding domain of glua2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure based evolution of a novel series of positive modulators of the AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 88
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmvA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pmvA02
3T66A 4EQ9A 2RF1A 1DTGA 3TDJA 1RYXA 1MXZA 3SESA 1URSA 3CFXA 2QRYA 4ZEIA 4H8IA 3RT6B 3HPIA 4TLLB 5I2KA 4LATA 3KSXA 2I6EA 2X26A 3LSFB 2NWJA 3TQWA 4QRZA 4PFTA 5DT6A 3KSJA 4XKRA 3TZAA 2FA7A 4ELPA 3CSBA 4OFJA 3E4RA 1B46A 3R6UA 3FIRA 2HXWA 3LR1A 1NL5A 2UVHA 5EYFA 3OMBA 3U8QA 5B7DA 2P0SA 1TFDA 4JSOA 1IEJA 4QSCA 5HPQA 1KWHA 1MQJA 4R6KA 4F18A 4FEDA 3IORA 3KN8A 5TPAA 2W7YA 2B65A 4PP0A 3C32A 3DM0A 1N84A 2F6GA 4OZ9A 1ZMGA 1B7HA 4RNSA 1ZU0A 3ILTB 2IA4A 4KYSA 4DCYA 4YMBA 3VVFA 4ZEKA 5HBCA 4G8HA 4KCCA 1QKAA 3G3KA 1AOVA 4H5FA 1MXXA 2I3WA 1B9JA 4POXA 1A40A 2F34A 2GHBA 2HZKA 1P1WA 1NNKA 2D3IA 3FASA 5I2NA 5FTIA 2H5YA 2XXUA 1LFHA 1P1UA 4JWXA 3C33A 3OXNA 3PPOA 1GR2A 4G8NA 2QS4A 3OO7A 2XXHA 1MXUA 1UIUA 4GXSB 1Y20A 5CMBA 1Z7NE 3H6UA 3FXUA 3RT8A 1N0TA 3E9XA 3VDFA 3QXMA 1EH3A 4BDRA 1H3DA 4NF6B 3L6GA 5TU0A 5BWJA 5DTBA 5ICTA 3MPLA 1OQHA 1JVYA 2F97A 3MP1A 1JEUA 5L9OA 2RINA 2ONSA 3K01A 4NF5A 4BDNA 3O6HA 4DE8A 2RCBA 3RNNA 3FGSA 4BDQA 4DIGA 4XKPA 3O6IA 3TTKA 3KN7A 5H8HA 2ESNA 1UTHA 3EF7A 4Z7EA 4PFYA 1LCTA 1B4HA 2OLBA 3O6GA 3SKPA 4KFQA 3N94A 4OMBA 3C31A 1IXCA 4RA1A 1JNFA 3MZBA 4O3AA 4KHZE 1JEVA 1LAFE 1XOCA 3EHTA 2ZYNA 5DEXA 1O7TA 3O29A 5BUUA 4R6YA 3RGYA 4F3SA 3KG2A 2PMSA 4ZZAA 2GFEA 1XVXA 3DP6A 3IK6B 3L6HA 4ZZEA 4I1DA 3TCFA 1MY4A 4HW8A 2DQVA 2UVJA 1B5IA 1B3EA 5H8SA 3I6VA 3RLFE 3RQTA 1IXIA 3GBBA 4F22A 5DYHA 3IO6A 3K2DA 3O28A 4R2FA 3Q29A 2XXPA 2V93A 3VE1B 1NH8A 3QUJA 3DP4A 3LUYA 1UTBA 3PUWE 2CMOA 4G2ZA 2V3QA 3N5LA 2AIXA 4TLMB 5I56A 4OEVA 1HSJA 1DOTA 1B52A 4NF4A 4JXIA 2HQ0A 5CM6A 3QIMA 4C1TA 5B70A 3MZ1A 3MAMA 1FQFA 2Q88A 3SEWA 3PPRA 3OD7A 1MG1A 1VE4A 4HTGA 2UXAA 4TOZA 2ALUA 5ITOA 3OSRA 1FTJA 4NWCA 4ELRA 2GHAA 2Z8FA 3K1PA 3U93A 4E0XA 2DXRA 3S9EA 4BDLA 2RC7A 4I8CA 2NVUB 1IQ7A 2CZLA 2DVCA 1LAXA 2YLNA 4EF2A 3N26A 3A3CA 3MPKA 1R9LA 4LP2B 4YB6A 1H43A 1QULA 1MPCA 2O69A 3S9MC 1BIYA 3TQLA 5CBRA 4X48A 3IJXB 1PB9A 3PPPA 1PBPA 3ONMA 5A5XA 5AA4B 4GOTA 4RY1A 1S50A 3IAZA 4H6DA 5TP9B 4ZEBA 1CE2A 4GF8A 5I58A 3FJMA 5H8NA 4RK9A 4NTLA 3FD3A 2XXWA 3A3UA 1A54A 1P1NA 4H8JA 1FQDA 5FTHA 1FTLA 2VOZA 3CG1A 2A5TA 4GD5A 5K2XA 2H4IA 1SW1A 4YMAA 1N04A 1NMUA 2I4BA 3RPWA 3UIFA 1SQYA 4Q30B 4NWDA 3U1OA 1B40A 2QS2A 3EN3A 1B5JA 4F2OA 5KCJB 1LBCA 4HCYA 4H0WA 4R2BA 3UP9A 4WKMA 4BDMA 1Y9UA 1XHYA 4OESA 1I69A 4WXJA 5I57B 2UYFA 4YKPA 4U1ZA 2DE3A 4QF9A 2F6PA 3MJNA 2H99A 1PBQA 4U21A 3RN8A 2QS3A 3H4ZA 3UK4A 2I49A 1WVJA 3CSGA 1NKXA 4RK2A 3KOTA 2VHAA 1SYHA 1B51A 3MUQA 4POWA 4Q5TA 3V5AA 5CC2A 3SEYA 1XS5A 3KN3A 2OWTA 3I5OA 4X1BA 4NEDA 4RYAA 2Y7PA 5JEIA 1DPPA 1OQGA 3K6WA 1MY1A 2NUVA 1SD3A 1B32A 5KDTB 4XKQA 3FXQA 3M3LA 1QW0A 3W9VA 1UIVA 4WEDA 3UA8A 3MW0A 4DZ1A 4F1VA 4AB6A 1LAHE 4IO6A 1PDAA 3MVXA 2Q8JA 2Z22A 4OFLA 3T9XB 4R6HA 1IZ1A 4LUBA 3KOSA 1P99A 2QMWA 1GV8A 4GL8A 3TAJA 1ELJA 1H45A 1FQCA 1MM6A 5L9SA 4EXKA 5AE4A 3SDFA 3SEVA 2PT2A 3FV1A 4OERA 5DVFA 4C0RA 1UQWA 1YTVA 3BBRA 3H06B 3LSLA 4ZEDA 3W9WA 3TCGA 2KLFA 4DLDA 4U1OA 3K00A 5CI5A 3G3HA 1ATGA 4KD5A 2XX8A 2WKYA 4QSDA 4THIA 2GH9A 3SEUA 3ZKKA 4GFRA 3CI8A 4P11A 3FJGA 1MQIA 2ONRA 3U72A 3O97A 3T9UA 1IXGA 1TFAA 3GBAA 2YPNA 1ZJLA 4Q0CA 3O66A 4NF6A 1MH4A 2F8DA 3KJTA 4ELOA 1B5HA 3E13X 3R26A 2Y7IA 3AXFA 4OWDA 3G3FA 4ZE9A 4QFNA 3W15C 3PU5A 4YU0A 4ISUA 1N3XA 5HM4B 1IIWA 1IITA 2X7QA 1Y3NA 1JVXA 4KYDA 4QFKA 3MQ9A 3N6TA 5H8FB 3K6XA 4H65A 3LSWA 2XD3A 2P1SA 4EDPA 3BFUA 1BTJA 4N6PA 4GL0A 3GZGA 4EQBA 1MPBA 2Z23A 4KYEA 3A09A 2DWHA 3MZ9A 3H3GA 4I62A 1SW4A 5H8QB 4LQ2A 1QUJA 1FQEA 1D9VA 1R9QA 4DCXA 1JQFA 2O7IA 4H5GA 1B2HA 4MBPA 2I4CA 2QL3A 5K2YA 3ZSFA 1LLSA 1LFGA 2O6AA 1MXWA 2I58A 3IL1B 4U2RA 4LVQA 3I3VA 1XT8A 2G29A 5F1QA 4LZ5A 1OVBA 1IUDA 2PBWA 3T9HB 3VLVA 2O1LA 1BP5A 1S9TA 3Q25A 1Y1ZA 3H6TA 1EZ9A 5FHOA 2E0SA 2ZNSA 3IB0A 2VP1A 3IO4A 5J1DA 1BKAA 2FNCA 3HHGA 2FYIA 2I0CA 4G77A 4OENA 5DVIA 2OJTA 1FCKA 3OSQA 1LB9A 1OVTA 3DLNA 1GGGA 2XXTA 4IY5A 3E3KA 2ANJA 4JSDA 4O3BA 3G3JA 2Q9TA 3QAXA 4H1XA 3HSTA 3B6TA 1LB8A 5FHNA 3TTNA 4EF1A 2F7CA 1JW1A 3U92A 4YB5A 1O63A 1ZBMA 1D3KA 1A55A 1NNFA 4TQUQ 1MM7A 2AYSA 3TTLA 4L17A 4MLQA 4GXAA 1II5A 3CFZA 5L9MA 4EQ7A 3TODA 5AA4A 2R71A 2Z8DA 3PMWA 3V89B 5TP9A 1N3WA 4ESXA 3IOUA 4GIZA 5CMMA 4PETA 1B4ZA 3JZJA 1URDA 3FVGA 3VLUA 1FTMA 3IOVA 4JBZA 5IAIA 3OENA 1OLAA 4KI0E 3TTRA 1YCJA 4RJZA 3LC8A 1ZIUA 4IGTA 4DXUA 2ONKE 3KJ7A 5L8DA 3K1MA 2DYXA 1MQGA 3S9LC 2F7BA 1Q1KA 2OZZA 3K02A 3N6UA 4ECFA 1GVCA 3O2AA 1UTBB 1B7UA 2O7UA 4JWOA 4DXCA 4KCDA 1AL3A 5I56B 1TXFA 1B05A 1P1QA 1YPNA 1I6QA 4ONYA 4QFPA 2DWIA 4DDDA 5CMCA 2DSFA 1EZPA 3TEPA 2H9BA 3G7WA 1N7XA 4NMYA 3B6QA 5I57A 3C34A 2DWJA 1R1NA 3IOTA 3TMGA 3FVOA 1JETA 3GXAA 4ZDMA 4IO4A 4XXUA 4F1UA 1M5BA 3BFTA 3G3IA 3Q28A 2QSXA 4PQJA 2F7AA 4MH5A 2XX9A 4XKNA 3HHFA 3EHSA 2OCUA 4P0GA 4E0WA 1US5A 1LSTA 2XD2A 1MY3A 1OLCA 2HAUA 5KZTA 4IGRA 4JWYA 2Q2CA 4FORA 4FATA 3MWBA 3TTMA 2REJA 3H03A 1FQBA 1MDP1 4R73A 4IB2A 4R9FA 3UORA 1JW4A 1DTZA 2F78A 3S4UA 2Y7WA 1PB7A 3MVZA 5JTYB 4GVOA 3FATA 2OWSA 4KPTA 1SVXB 3EPEA 2VD2A 2D5WA 2HEUA 3KFMA 3V8XB 2ZNTA 1MXYA 3SERA 5ISUA 3QYTA 1M5FA 3GLBA 2UVGA 1TWYA 5F7VA 1SI0A 2QJEA 3PMXA 5CBSA 1P1OA 4OTEA 1NNPA 2RCAA 1QVSA 4JDFA 4OXVA 5I59B 1MS7A 3OO6A 3TCHA 3UGWA 1MH3A 1QUKA 4IO7A 3BKIB 4ZS9A 2V3TA 1B3HA 1SW5A 1B7ZA 4LONB 4YAHX 3MC2A 1IXHA 2RC9A 3D4CA 1M5EA 3K0VA 1A8EA 2DE4A 2Y7RA 4F29A 4WEPA 2Q2AA 3VFJA 3OELA 3CVGA 4RPNA 1A99A 2REGA 2H98A 4IO5A 4OETA 1A8FA 3FZVA 4NF8B 3C35A 3FJ7A 2NXOA 2XXXA 4OHNA 3G3GA 3K4UA 4MFIA 1B3GA 4BLAA 3JYRA 4G4PA 1MRPA 1ANFA 2GRVA 2Y7KA 1S7YA 1MQDA 1Y3QA 2QS1A 4F39A 1LGBC 4EUOA 1GTKA 3PD8A 3LSXA 1QJMA 3D4GA 1PB8A 3FXRA 1B0LA 4I9DA 3DELB 1JW5A 3H7MA 4R74A 1YAEA 2DVZA 3TKDA 2UVIA 3CRBA 3EQ1A 4G68B 3ZKLA 3IOWA 3T93B 1M5CA 3HN0A 5CRYA 1VSOA 3IR1A 2Q89A 5AA2B 3T22A 3QK6A 5DVJA 5H8FA 2V84A 1FTOA 2QPQA 4G8MA 3Q27A 5CMKA 2HZLA 3B7DA 3KZGA 2RC8A 3RUMA 3PUZE 4F1YA 1LAGE 5I2KB 2HAVA 4RPOA 1T0KA 3ILUB 4U4SA 2I0BA 4YICA 3WAEA 4GLIA 2B3FA 5H8QA 3H6WA 4OQOA 4QFOA 2ABHA 1B3LA 3KEIA 1D4NA 4GWOA 3TUSA 3MBPA 4PFWA 1SDXA 1B1HA 3EHUA 1XC1A 3WAFA 4LQ5A 1LFIA 3OEMA 4OFOA 3PV0E 2YJPA 2I48A 3RY3A 3PUXE 3OOAA 1QUIA 1Z7ME 3LBSA 1NNTA 2BJJX 4YKJA 4UACA 3PUYE 3VVEA 4N07A 3TYHA 4X9TA 5TPAB 2AL4A 3K1NA 2PT1A 1SI1A 4F3GA 1SYIA 1Y4TA 1VFEA 1I6BA 4OEUA 4PFUA 2ZYMA 3RTFB 4DXBA 5M2VA 1FW0A 4IY6A 1BLFA 3QSLA 5EHMA 3M3KA 2DE2A 3RTWB 4R72A 5I2NB 3PGFA 5I84A 4IO3A 4ZE8A 2XHDA 1AH5A 2ZNUA 1I6AA 2E1SA 2F36A 3VLWA 1MDQA 2VD3A 3VXBA 3PUVE 2XXRA 3H6VA 4FEBA 4FJPA 4EXLA 1EZOA 4ZECA 4Q8RA 1WODA 2QMXA 4ND9A 1F9BA 4R9GA 3IB2A 1EU8A 1AMFA 5LOMA 2O51A 4NF5B 3V83A 2B3BA 2Y84A 2DOJA 2XX7A 2I3VA 3TPAA 4FE8A 2DP8A 4P0IA 3C4MA 4YZZA 3T96B 5H8HB 3CIJA 1UTHB 2M8CA 4FIMA 3VVDA 4R75A 4U4XA 1D9YA 1B58A 1B3FA 1MY0A 1Q35A 1RKMA 3F11A 2ZMBA 2V3UA 1H76A 4M1VA 3THIA 3PMVA 5ICQA 3O9PA 5AA3A 4G68C 2R9JA 2G93A 5DEXB 3TFLA 1N76A 4LZ8A 2X7PA 3M3FA 1ZTYA 1NH7A 4F19A 1Y4CA 3U94A 1B6HA 3KGCA 3IB1A 2HCAA 1NFTA 4OVJA 3C36A 2A5SA 3MVWA 4MF3A 4GRKA 1PEBA 3T9VA 3K6UA 5AA2D 2AL5A 2RKMA 3M8UA 4KQPA 1Y1MA 4LZ7A 4XTCQ 3HV1A 4NE4A 2DXYA 2OK2A 4RXLA 2OBGA 1USYE 3UN6A 4QSEA 4XIGQ 4GQOA 2O1MA 1ZLQA 1DPEA 4HS7A 4F2QA 3R7XA 5KCJA 4H67A 1HSEA 4YB7A 3HCQA 2O68A 5IKBA 3PD9A 4NF4B 1ZKBA 1DMBA 4OYVA 4HCWA 3MP8A 1A7LA 3PPNA 3VXCA 1MQHA 4U23A 2NOOA 2XXIA 4ZEFA 5JTYA 5EHSA 3MP6A 2DS9A 4MLVA 4BDOA 1MPDA 1OMPA 2PX1A 2THIA 1M5DA 3CR9A 3S9NC 1LBBA 2P2AA 3JV9A 4U22A 3ZS6A 4O3CA 1VFDA 1H44A 3KBRA 1TT1A 3IX1A 3OEKA 4AQ4A 1J1NA 1Y3PA 4KR5A 5AA1A 4ELQA 4LA9A 1US4A 1AIVA 5I59A 2F35A 2O84X 4K3FA 4X1DA 5ELVA 2ZYKA 3OO9A 5KDTA 1B0HA 4FAJA 4F3PA 2XXQA 3TELA 1URGA 4N13A 4JB7A 5A5XB 4QHQA 4Z0IA 3Q26A 5I58B 2H25A 5H8NB 4C1UA 3DP8A 1SW2A 3S2VA 3IJOB 3USDA 3SEXA 1QKBA 2PYYA 3OO8A 4F3BA 3MVYA 5JK4A 4NF8A 2IEEA 2A5TB 2Z8EA 1DSNA 3FUZA 3VV5A 3QUFA 1B1XA 2DWAA 3ODBA 3ECRA 3CFLA 1N7WA 2VGQA 4M4GA 1POY1 2HFBA 3HO7A 1WDNA 4ESWA 3FVNA 1FQAA 1XVYA 1RYOA 1PC3A 1MY2A 4FECA 1O64A 3FV2A 1FTKA 1SBPA 3SETA 2ZXTA 4YKKA 2ZYOA 5FHMA 5ITPA 3PPQA 4QFLA 1CB6A 3B6WA 2XXYA 4UA8A 1MXVA 3FVKA 3CG3A 4F31B 2UYEA 3C9HA 4G68A 1VR5A 1USYH 2LAOA 1POTA 3P7IA 1R6ZA 1HSLA 2V25A 5AA2A 4YKIA 3K6VA 4IO2A 1OIBA 4AB5A 4PE5B 1LCFA 2XXVA 1L5TA 2R6GE 2F5XA 2PVUA 2D21A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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