3PUVE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-vo4
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puvE01
3MQ9A 2O84X 1Y9UA 2D5WA 3PUYE 4NWCA 4FAJA 2Q8JA 5AA2D 2OWTA 3ECRA 5H8QB 5KCJB 3S9EA 3MW0A 2XX9A 5I57B 3TCGA 3B6QA 3KSJA 3WAEA 4G8NA 3DP8A 2ESNA 4KYDA 1MXXA 2Y7PA 3PPOA 1B5IA 4OTEA 4M4GA 1Q35A 4EUOA 3V5AA 4DCXA 3PD8A 1UTBA 5I2NA 1Y4TA 1NL5A 2XXIA 3F11A 1XT8A 2B3BA 5HPQA 1LAFE 4RPOA 4Q5TA 1MPBA 4Z7EA 1J1NA 3FVOA 3DELB 1B7UA 3OO7A 1US5A 4NF6A 2X7QA 2HCAA 1P1WA 4OFLA 2O1LA 5B70A 1ANFA 3E4RA 3IO4A 4MF3A 1DMBA 1XVXA 4FE8A 2E1SA 3IB2A 3KBRA 4I8CA 1Z7ME 4XKRA 3LUYA 2UYEA 2HEUA 3PD9A 1R9QA 5BWJA 4IO5A 2Z23A 1XS5A 3OOAA 1YTVA 3ZKLA 4FIMA 3RT8A 1VR5A 4ZEDA 1LAHE 5IKBA 2DSFA 2GH9A 1PBQA 3CI8A 1B7ZA 4R72A 1Y3QA 4GIZA 1FQAA 3FATA 2Z8FA 3FVKA 4JDFA 4WKMA 1Y4CA 5K2XA 2NWJA 2D3IA 2PBWA 3BFTA 5TU0A 4ZZEA 4MLVA 4ZS9A 1URGA 2H9BA 3H6WA 1XOCA 2I6EA 2A5SA 5TPAB 4X9TA 2DVZA 3SEWA 5I59A 1LBCA 1EZPA 3B6TA 3O97A 2ZYNA 4YKIA 4P0GA 4F18A 2B3FA 4O3BA 2PVUA 3K01A 4IY5A 1PB9A 1MY4A 1MQGA 4C1TA 3LSFB 3TELA 1FQEA 1QJMA 1OIBA 1FTMA 2CMOA 4KR5A 4PQJA 4EQBA 2Z8EA 1IEJA 4BDMA 3CG3A 3MUQA 1M5CA 4QSDA 1JW1A 2QS3A 1LCFA 2F5XA 2H4IA 3SEUA 4KPTA 3FV2A 1Q1KA 3IO6A 3VLWA 3QXMA 3SKPA 2AIXA 2RF1A 1TFAA 4DXBA 4DZ1A 1FTJA 5ICTA 3QUFA 2VHAA 4C1UA 5AA2A 2RC7A 3FD3A 1PB7A 1UTBB 5I2NB 3VLUA 1QUJA 4ZE8A 2RCAA 1B51A 1B2HA 3T9HB 3OEKA 3PUVE 1N04A 1URDA 1BP5A 4NMYA 1LB8A 2XX7A 3VE1B 4NF6B 1Z7NE 3O6HA 2VOZA 4GF8A 4IO7A 4I1DA 1ZU0A 4H8IA 3EHSA 3SEYA 3ZSFA 4DE8A 1B52A 4U22A 2ZNTA 3CSGA 1WDNA 2HFBA 5CI5A 4R2BA 4H5GA 2O6AA 4JXIA 4ZEBA 1JQFA 3R6UA 1P1QA 2XXWA 2BJJX 2UVGA 3RUMA 4BDLA 5DVIA 1GVCA 1B5JA 3B7DA 5HM4B 2OWSA 1FQFA 3TKDA 2ZMBA 4YU0A 1MXUA 2ZYMA 3PGFA 1DSNA 3OO9A 3QUJA 2Y84A 3IOTA 3UORA 1USYE 4F3GA 4DXCA 1CB6A 5I59B 3MJNA 2OK2A 1IQ7A 2XX8A 5FHNA 4H65A 1SDXA 3N94A 2XXTA 1Y3NA 3CVGA 4AB6A 2QS4A 3FJGA 4EXLA 1SW2A 5L8DA 1MG1A 2QRYA 5H8HB 3C33A 4ISUA 4ZZAA 3K1NA 4YMAA 1MQIA 4FEBA 4PFYA 4FECA 4R9GA 3MAMA 3SDFA 3RN8A 1PBPA 3U72A 5ICQA 3K6UA 1B0HA 4PETA 5ISUA 4XTCQ 1S9TA 3FXRA 4YAHX 3TEPA 3BKIB 3OELA 3U93A 1XC1A 2QJEA 4IY6A 1O64A 1P1UA 3MVZA 4RNSA 2UVIA 1LB9A 4RYAA 2F6GA 2PYYA 4RY1A 1GV8A 5KDTA 1LLSA 2F35A 2XXRA 3VFJA 1A54A 5AA2B 1I6QA 1MH4A 1B4ZA 1SVXB 3OXNA 4R75A 1AL3A 3G3KA 5AA4A 4RPNA 1AH5A 2XD3A 1OMPA 4YKPA 4EF2A 4U4XA 4K3FA 1JNFA 3WAFA 2Y7WA 5DT6A 5CBSA 1MM7A 2VGQA 1YPNA 3RQTA 3RGYA 3QYTA 4ZE9A 5ELVA 2GFEA 5JTYA 2XD2A 3GXAA 3VVEA 4ZECA 4LA9A 1D3KA 3OSQA 3PPPA 3LR1A 3T96B 1MDQA 4EDPA 3TTMA 4F3PA 2UVHA 5F1QA 2Y7RA 3H3GA 3QSLA 5CMCA 4TOZA 4POWA 3EPEA 3GBAA 3C32A 5DYHA 5DTBA 4GXAA 3O29A 5H8SA 3IL1B 4TLMB 1SQYA 1JW5A 3UN6A 2ZYKA 1B58A 1OLAA 3FJMA 2LAOA 4IGRA 4LQ2A 3IOVA 1L5TA 3TODA 4AQ4A 5EYFA 3BBRA 2Q2AA 3PMXA 2WKYA 3V89B 2QPQA 3EN3A 4Q8RA 1MPCA 3CR9A 3K1MA 3OD7A 3TZAA 4L17A 1QVSA 1IITA 4ZEKA 1ZBMA 4FATA 3LSLA 1VFEA 3UA8A 3Q25A 3RT6B 4LP2B 2F7BA 2M8CA 3V83A 4N13A 2F7CA 2W7YA 3I3VA 3O6IA 4ELOA 5I2KA 2ZXTA 1NH8A 3Q26A 1MQHA 3IX1A 2DYXA 2DE4A 3T93B 1PEBA 1SW5A 3FV1A 4IO4A 3A3UA 4ZEIA 4X1DA 3JYRA 3G3JA 4ONYA 5KDTB 1EU8A 3N5LA 3CFZA 3MZ9A 2NVUB 5AA4B 4F1YA 3MC2A 3LSXA 2DE3A 5CMMA 2F97A 3PPNA 1A40A 1LBBA 3OEMA 2O7IA 4ND9A 4JBZA 2OJTA 1UQWA 1DPPA 4GOTA 4R9FA 4HS7A 3KOTA 1ZIUA 4OFOA 3JV9A 2GRVA 3M3FA 1N3WA 1B9JA 3E9XA 4H1XA 3HCQA 3UIFA 3RPWA 5JTYB 4ZEFA 1JEVA 4OENA 3PPRA 1YCJA 1M5FA 4OZ9A 1POTA 1VFDA 4YB7A 4DXUA 1NH7A 1TXFA 2IEEA 3OSRA 4R6YA 3TTKA 1DOTA 4OESA 3EHTA 1JW4A 4LZ8A 2Y7IA 1AIVA 1B4HA 2RC9A 1FTLA 2ZNSA 4YB6A 4KD5A 1Y20A 1BLFA 2DP8A 4GRKA 1KWHA 4R6KA 2V3QA 3ILUB 2IA4A 1MH3A 5A5XA 1R6ZA 2VP1A 4E0XA 4MBPA 2REJA 4QSCA 3FVGA 4OYVA 3N6TA 4ESXA 5CRYA 4PFTA 2H99A 1LFHA 1NKXA 5I56A 3MVXA 3IAZA 4I62A 1NNPA 2Q9TA 4G68C 1S7YA 1OVBA 1D9VA 2ONRA 3IB1A 3MP1A 1MQDA 4ELRA 5I58A 4DCYA 2FYIA 1B3FA 5I2KB 4YZZA 3M8UA 2X7PA 1PB8A 3Q27A 1DTZA 3GBBA 1H3DA 4NF8A 3KG2A 3KJ7A 3C34A 4H0WA 1B3GA 3GZGA 2DWJA 3S9MC 4X48A 3H4ZA 4NF4A 5M2VA 1XHYA 2Q2CA 2HAVA 3HPIA 1RYXA 2KLFA 1F9BA 1Y1MA 4RK2A 1POY1 3I6VA 1FTKA 3V8XB 3S9LC 3KGCA 2OCUA 1SYHA 1N7XA 4OQOA 4NF5A 2F34A 4EXKA 3DLNA 3RTFB 1XVYA 4RA1A 2R71A 1M5EA 3G7WA 4KI0E 2PT1A 4JSOA 2RCBA 3IJOB 3P7IA 3CG1A 4KHZE 5DVFA 2H25A 4LVQA 4IGTA 3U8QA 4QRZA 4JB7A 3TQLA 4LQ5A 5TP9A 1P1OA 1FQDA 3KSXA 1B6HA 4U21A 1R1NA 1B0LA 1S50A 3PUZE 1FQCA 3QIMA 5A5XB 1O7TA 2Q88A 3MZBA 3ILTB 5HBCA 1MXWA 3FASA 1PDAA 3G3GA 3IK6B 3USDA 2H98A 5I56B 1JVYA 3IORA 2R6GE 1MY1A 3QK6A 2QMXA 3FZVA 1IUDA 4F29A 1GTKA 1LGBC 1ZLQA 2I0BA 4WEPA 4OXVA 3LSWA 4N6PA 3K2DA 4WXJA 2AL5A 1PC3A 1GR2A 5I58B 4DLDA 1I69A 2VD2A 3TFLA 4QHQA 3N26A 4R74A 3FIRA 1MXZA 1JVXA 4KCCA 5IAIA 4NF8B 2F36A 4XKPA 1SBPA 1UIVA 5JK4A 3T9XB 2QMWA 4QSEA 1LAGE 3TPAA 4YKJA 3FXUA 4IB2A 4NF4B 5CC2A 4RK9A 4NE4A 4O3CA 4U23A 1A55A 4ELPA 3FVNA 3IOUA 1ZJLA 3T9UA 1QKBA 3TTLA 3W15C 5FTHA 3S2VA 4F3BA 3DM0A 4F1VA 3FUZA 2UYFA 4NF5B 4GVOA 3H7MA 3M3LA 4LONB 1WODA 1OVTA 4EQ9A 4DDDA 4EF1A 2B65A 2G93A 3G3FA 1RKMA 2Y7KA 3RTWB 2F78A 3E13X 2I4CA 2YPNA 4BDOA 4TLLB 4DIGA 4GQOA 1EZOA 2RC8A 1MRPA 4KFQA 5TP9B 4GWOA 3CFXA 3M3KA 1TFDA 4F2QA 1JEUA 1FCKA 4OEUA 1SI1A 2QS1A 4YB5A 3L6GA 2A5TA 1US4A 4ZDMA 4GL8A 2PT2A 2P0SA 1ZTYA 1Y3PA 3HHGA 4ECFA 1MS7A 1H45A 3JZJA 3C9HA 4RXLA 4OHNA 1LCTA 4G8HA 3C36A 3CRBA 2DWIA 5AE4A 4FEDA 4XIGQ 3HV1A 2OZZA 5EHMA 3ZS6A 4HCYA 1B46A 3MPLA 3VXCA 1ZKBA 1B1XA 1MY0A 4POXA 3LBSA 1IXIA 3AXFA 1VSOA 5I84A 5JEIA 2HZLA 3HN0A 3PUXE 4AB5A 2DXRA 3SERA 3PMWA 3O28A 4LUBA 2I0CA 4XKNA 3RLFE 1I6BA 3D4GA 2UXAA 4LZ5A 2ANJA 4FJPA 4NEDA 2P1SA 4U2RA 3U1OA 2OBGA 2XXVA 3MP8A 3CSBA 1N84A 4JWYA 1NNKA 1NFTA 4XXUA 1B40A 3R26A 5L9MA 1FTOA 3MPKA 2ALUA 3TAJA 3KN3A 1SW1A 2HAUA 2I58A 2H5YA 2AYSA 3TQWA 2V93A 4JSDA 2XXYA 3KEIA 1B05A 1UTHA 1MXVA 3MVWA 3K1PA 1SW4A 4R6HA 5DVJA 4KYEA 5H8NA 4QFPA 2I48A 3ONMA 3UGWA 5ITPA 4F31B 1T0KA 1R9LA 1P99A 3O6GA 5K2YA 3PV0E 4F22A 1RYOA 1LSTA 2I3WA 3KN8A 3K6WA 4G68A 3OENA 2ONKE 1QUKA 3SESA 2A5TB 2PMSA 1P1NA 4KYSA 3U92A 4F1UA 4KCDA 2V3UA 3KFMA 2F6PA 3FXQA 3W9VA 1YAEA 4IO6A 1QUIA 1A99A 2R9JA 5H8FA 3C31A 4LZ7A 3DP6A 3K4UA 4U4SA 5AA1A 4PE5B 1MPDA 1USYH 3IJXB 1VE4A 1GGGA 4EQ7A 2CZLA 2V3TA 3QAXA 2GHBA 1BKAA 4F2OA 1NMUA 3HO7A 2RKMA 3O9PA 4IO3A 4X1BA 1CE2A 3LC8A 1O63A 1B32A 1N0TA 3T22A 3DP4A 3IR1A 2I3VA 2XXPA 5FTIA 2V84A 1N76A 4THIA 4U1ZA 1B3EA 2XHDA 3RY3A 2YLNA 2O7UA 3B6WA 2Z22A 1LFIA 2D21A 4H6DA 1D9YA 4QFLA 4I9DA 1OQHA 3PMVA 3IB0A 4H67A 3MBPA 2DQVA 3TCHA 5H8HA 2VD3A 2FA7A 3O66A 1H44A 3R7XA 1I6AA 2QS2A 4H8JA 1MM6A 2HQ0A 2GHAA 3H6TA 2YJPA 4Q30B 2XXUA 5KZTA 3TMGA 3BFUA 3SEXA 4YICA 5AA3A 4QF9A 1II5A 4RJZA 3C35A 2O1MA 4M1VA 2DOJA 4F3SA 1B3LA 4QFKA 1H76A 3IOWA 3S4UA 4H5FA 2O68A 1ZMGA 4XKQA 5CMBA 4GD5A 2F8DA 2ABHA 1AOVA 1UTHB 5J1DA 3RNNA 3CIJA 4P11A 4GXSB 5H8NB 4HW8A 1LFGA 1WVJA 1BIYA 5DEXA 3PPQA 3VDFA 3GLBA 3TTRA 1MDP1 1B1HA 3TDJA 5EHSA 1EZ9A 1MY3A 3G3HA 4G68B 2O51A 3KJTA 3UK4A 1M5BA 3UP9A 1B3HA 4G8MA 4QFOA 3VVFA 4R2FA 3SEVA 2NUVA 3MP6A 1B7HA 1QW0A 2THIA 3D4CA 3L6HA 2FNCA 4JWXA 3FGSA 3K0VA 1SYIA 5H8FB 2QSXA 2PX1A 3VVDA 4JWOA 1DTGA 2OLBA 1IIWA 4MLQA 3HHFA 4F39A 2HXWA 4G4PA 3A09A 3K6XA 4GFRA 1Y1ZA 3K6VA 5LOMA 2G29A 1DPEA 3C4MA 3OO6A 2DVCA 3OMBA 2UVJA 3PUWE 4NTLA 4F19A 4OERA 3EQ1A 4MH5A 2P2AA 2V25A 4Q0CA 5FHOA 2ZYOA 3K02A 1AMFA 2DS9A 4TQUQ 4BDNA 2QL3A 3THIA 3TCFA 3Q29A 4KQPA 3H6VA 4PP0A 4OETA 3A3CA 1IXGA 2E0SA 5CMKA 3OO8A 4YKKA 1ATGA 1URSA 1IXHA 3ODBA 2XXQA 3G3IA 4QFNA 1MY2A 1SD3A 2REGA 2DXYA 4OFJA 3KOSA 4P0IA 2RINA 4FORA 3VLVA 5H8QA 5KCJA 4WEDA 1OLCA 5I57A 3Q28A 1FW0A 4PFWA 3H03A 2DE2A 4R73A 3MVYA 2NXOA 5FHMA 5BUUA 4BLAA 2AL4A 4MFIA 4BDRA 3ZKKA 4HTGA 4C0RA 4Z0IA 1NNFA 2Q89A 3KZGA 1EH3A 4UA8A 1A8EA 5DEXB 1MQJA 1MXYA 2F7AA 2ZNUA 1H43A 3H06B 5CM6A 2ONSA 3W9WA 1IXCA 2XXHA 5CBRA 4LATA 4OWDA 2Z8DA 4E0WA 2I4BA 5L9SA 4N07A 3T9VA 3E3KA 5F7VA 2O69A 3N6UA 4G77A 3VXBA 5B7DA 3TUSA 3U94A 4ESWA 4IO2A 2HZKA 1N3XA 1JETA 1SI0A 3CFLA 3SETA 2XXXA 1NNTA 2NOOA 3TTNA 1TT1A 1B5HA 3H6UA 1QULA 5L9OA 2DWHA 1UIUA 4GLIA 1TWYA 3MWBA 3KN7A 4GL0A 4YMBA 1A8FA 4G2ZA 3I5OA 3EHUA 1N7WA 3TYHA 3S9NC 2DWAA 1A7LA 5TPAA 1QKAA 1ELJA 1IZ1A 5ITOA 1HSEA 3MZ1A 3FJ7A 4ELQA 2I49A 4PFUA 4O3AA 1FQBA 4UACA 1HSJA 3EF7A 1BTJA 1M5DA 4HCWA 1OQGA 1D4NA 4OMBA 2X26A 3T66A 3K00A 3HSTA 4BDQA 4OEVA 3O2AA 4NWDA 1HSLA 1LAXA 4U1OA 4OVJA 3VV5A 3PU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWWA 3MQ9A 2O84X 1Y9UA 4MMPA 2D5WA 3PUYE 4NWCA 2Y5LA 4FAJA 2Q8JA 5AA2D 2OWTA 3ECRA 5H8QB 5KCJB 3S9EA 3MW0A 2XX9A 5I57B 3TCGA 3B6QA 3KSJA 3WAEA 5EYHA 4G8NA 4PBHA 3DP8A 2ESNA 4KYDA 1MXXA 2Y7PA 4N4UA 4HE0A 3PPOA 1B5IA 4OTEA 3T1BA 4M4GA 1Q35A 4EUOA 3V5AA 4DCXA 3PD8A 1UTBA 5I2NA 1Y4TA 1NL5A 2XXIA 3F11A 1XT8A 1FPFA 2B3BA 5HPQA 1LAFE 4RPOA 4LN5A 3ROJA 4Q5TA 5FBPA 3ISPA 1MPBA 4Z7EA 1J1NA 3FVOA 4PFIA 3DELB 1B7UA 3OO7A 1US5A 4NF6A 2X7QA 2HCAA 1P1WA 4OFLA 2O1LA 5B70A 1ANFA 3E4RA 3IO4A 4MF3A 1DMBA 1XVXA 4FE8A 2E1SA 3IB2A 3KBRA 4I8CA 1Z7ME 4XKRA 3LUYA 2UYEA 2HEUA 3PD9A 1R9QA 5T3JA 5BWJA 4IO5A 2Z23A 1XS5A 3OOAA 1YTVA 1NV4A 4JVDA 3ZKLA 4FIMA 3RT8A 1VR5A 4NHBA 4ZEDA 4N17A 1LAHE 5IKBA 2DSFA 2GH9A 1PBQA 3CI8A 1B7ZA 4R72A 2FVZA 1Y3QA 3LV0A 4GIZA 1FQAA 3FATA 2Z8FA 1FBFA 3FVKA 4JDFA 4WKMA 1Y4CA 5K2XA 2NWJA 2D3IA 2PBWA 3BFTA 5TU0A 4ZZEA 4MLVA 5IGAA 1URGA 4ZS9A 2H9BA 3H6WA 1XOCA 2I6EA 2A5SA 4P9KA 5TPAB 4X9TA 1IMDA 4N81A 4IR8A 2DVZA 3SEWA 5I59A 1LBCA 4O8MA 1EZPA 3B6TA 2B4MA 3O97A 2ZYNA 4YKIA 4P0GA 4F18A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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