3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
1MDP1 4H1XA 2AL4A 2RINA 4C0RA 4ZEFA 4F3SA 4R6YA 3DM0A 5K2XA 1M5DA 1XVXA 4H8IA 3G3GA 5FTIA 1MQJA 1NH8A 4OEUA 3LBSA 2I6EA 3FVOA 4XXUA 5TPAB 2W7YA 2O1MA 3FXUA 4E0XA 3S4UA 2DE4A 4KCDA 1JW4A 2NUVA 2RF1A 4UACA 2V3QA 1Q35A 2DYXA 3Q27A 4I62A 1SD3A 1UTBB 1GTKA 2V25A 3FATA 4FAJA 4YU0A 3O6GA 2DQVA 1B7HA 2H9BA 1MQHA 1NNFA 4YKPA 1NNTA 2QMXA 2ZNSA 4U4XA 1QUJA 1BKAA 3IORA 1QVSA 3KZGA 3RPWA 3TQLA 4IO6A 2D3IA 3IK6B 3BFTA 2I0BA 1AIVA 4F29A 5HM4B 3D4CA 4FORA 4U1ZA 1D4NA 2ZNUA 4F1UA 3O6IA 2DE2A 1XS5A 1S7YA 4KD5A 5KCJB 2NXOA 1Y1MA 2VD3A 3VV5A 3MVWA 3OEMA 3FUZA 2HEUA 2ZNTA 1LAFE 3PD9A 5I56A 1R1NA 1OQHA 2X7QA 3W15C 1HSJA 2PX1A 1MRPA 2Y7PA 5ITOA 4F39A 3HHGA 4TLLB 4OFOA 4XKNA 1I69A 1II5A 1O7TA 3K00A 3TTKA 3DP6A 4QFKA 3C34A 1QKBA 2F97A 2Y7KA 4LA9A 1LFGA 2ONRA 1PB7A 1N0TA 3G7WA 1YTVA 1H43A 4LQ5A 3MPKA 1PB8A 3RTFB 2HXWA 2GHAA 3MW0A 5EHSA 4QRZA 3FGSA 3RUMA 3TCGA 4KYSA 3N6UA 3TZAA 3PV0E 3IR1A 4YB5A 2DWAA 4MLVA 1UIVA 1DTGA 4RPNA 3I3VA 3ODBA 1M5EA 3LSLA 4IO4A 3O28A 1B0LA 3S9NC 3SERA 3FVNA 4GIZA 4OENA 3CRBA 5L9OA 1H44A 4DXUA 5I56B 1DOTA 3TEPA 3PU5A 1Q1KA 4U21A 3ECRA 2O68A 3T9UA 3VLUA 1H3DA 3GBAA 2QPQA 1JW1A 2OWTA 1LLSA 1IQ7A 3M3FA 3RNNA 1SW1A 3H4ZA 3ZS6A 1IEJA 1TFDA 3KN3A 1LFHA 3H03A 3V83A 4YAHX 5L8DA 4R2BA 4H8JA 2XD3A 1NNKA 3FXRA 1ZBMA 2I4CA 1SDXA 1TXFA 3OSRA 4NF5A 1B7ZA 4HS7A 4IY6A 1M5CA 3KOTA 4P11A 2Q9TA 3MP8A 5AA2A 4OWDA 3FJMA 4ESWA 1BLFA 3MUQA 4PFYA 4OEVA 3CG1A 4LVQA 3ONMA 1LBCA 4F2OA 2XXPA 4IGTA 3DP8A 1URGA 5DT6A 5JTYA 2I3VA 3EN3A 3LSFB 2YPNA 3EHUA 2I0CA 5FHOA 3DLNA 3MP1A 3TQWA 3V89B 3BFUA 1A7LA 3PUWE 4BLAA 2O6AA 3O97A 1VR5A 3VXBA 3SEVA 4POWA 3SEUA 4MH5A 1TFAA 4KYEA 4Z7EA 3N5LA 2GHBA 3KJ7A 3TMGA 1GR2A 1JW5A 3UGWA 2H4IA 4I8CA 3SDFA 1O63A 4IO2A 1URSA 2X7PA 4KYDA 2UVIA 2RC9A 2PMSA 1MM6A 1EU8A 3U1OA 4GQOA 3N6TA 2B3FA 3RGYA 4FECA 4EXKA 4F18A 1WDNA 1CB6A 3G3HA 4OXVA 4RXLA 3VVEA 5JK4A 5ITPA 4GL8A 1UIUA 2G29A 2IEEA 4OESA 4NF5B 1FTJA 4ZEKA 2QL3A 4TOZA 3UK4A 1LAHE 3RTWB 5DVFA 2QS1A 3SEYA 1RYOA 2Z8FA 1YPNA 4BDOA 3V8XB 3FV2A 4YB7A 1EH3A 4ELRA 4RY1A 2OCUA 2BJJX 3B6QA 1MM7A 3SESA 2HQ0A 2O84X 3G3KA 1Y4TA 5JTYB 3FJ7A 2DS9A 5H8FA 1IZ1A 2F34A 4NTLA 2XXWA 3LC8A 4LONB 4G68B 5AE4A 4NF8A 5DVJA 3T9HB 5I2KB 2I48A 3K1MA 3UORA 3R6UA 4F31B 2H98A 1JVXA 2Q89A 1MDQA 4BDQA 2PT2A 3HN0A 1LB9A 4NE4A 5TPAA 2F35A 4ZEBA 1B9JA 3PPQA 4RK9A 5ELVA 5AA4A 3PMXA 3OELA 3VFJA 2DOJA 5L9MA 3BBRA 1MY0A 2B3BA 1N84A 2RKMA 1B40A 1SI1A 1LAGE 3EHTA 2X26A 1B51A 1UTBA 4WEPA 2F7AA 3FXQA 3CI8A 4AQ4A 1B3HA 1ZMGA 4DE8A 1VFDA 4DZ1A 4MFIA 1JEVA 1B4HA 3T9XB 5H8HA 3C32A 2VHAA 1R9QA 4DXBA 1PC3A 1ZIUA 4JBZA 4QFOA 2NOOA 2REGA 4GXAA 3HO7A 3ZKKA 2ZXTA 1PB9A 2UVGA 1SI0A 4TQUQ 4ELPA 3FJGA 4K3FA 3LUYA 2UVJA 2CZLA 2OWSA 2UYFA 4MLQA 3TCHA 3T9VA 4TLMB 4MBPA 3WAFA 3MC2A 2I4BA 5H8FB 3T96B 1B1HA 3IX1A 3TELA 3D4GA 3EPEA 2P2AA 5B70A 5JEIA 3TTRA 1B7UA 4BDMA 3UA8A 4NF8B 4WXJA 3TODA 4IO3A 1B3EA 2R9JA 1LCTA 1ZLQA 4HCWA 4N07A 4DXCA 1PBPA 3MAMA 1GGGA 3IOTA 3QXMA 3KOSA 5AA4B 5H8SA 4LUBA 1A55A 2NVUB 3PUYE 5F7VA 5J1DA 1IUDA 4EQBA 2QS4A 1P1NA 4PFTA 2O69A 3G3FA 4H65A 3RT6B 4WKMA 1ELJA 4WEDA 4GD5A 3U93A 3VDFA 2A5TA 5H8HB 4ZECA 4QFLA 5TU0A 4F3GA 3K4UA 2QRYA 3RLFE 1POTA 2PVUA 1XOCA 4U4SA 3JV9A 1MPBA 1XT8A 3U92A 4AB6A 2F6GA 3TFLA 3F11A 1S9TA 4XKRA 5DYHA 4RA1A 2FNCA 5EYFA 3E13X 2D5WA 1IXCA 3CSBA 2O1LA 5EHMA 5IKBA 1MQDA 2ZYOA 4OETA 4G8NA 5I57A 3FVGA 4KI0E 1JVYA 2H25A 3A09A 3H6WA 2QS2A 4UA8A 3O2AA 1FTLA 1FQEA 1NFTA 1B1XA 3IB2A 1VFEA 1MS7A 4YKJA 3SETA 3E9XA 2HAUA 2DWHA 2DE3A 1US4A 4JSDA 4DLDA 2O7UA 4R75A 3CG3A 1DMBA 3I5OA 1OVTA 3PPNA 1DSNA 3B6WA 4X9TA 3K02A 1BTJA 2VP1A 4YMBA 3EQ1A 1OVBA 2XHDA 3MVXA 1GV8A 2KLFA 2A5TB 2VOZA 4XTCQ 2B65A 1I6BA 2QJEA 2QS3A 3QAXA 3OO7A 4YICA 1MY4A 4LP2B 4ND9A 2GH9A 1DPEA 1S50A 4AB5A 4DCXA 1MXVA 2AL5A 4GRKA 3THIA 3ILUB 1LGBC 2THIA 5BWJA 1QKAA 3B7DA 3OO6A 4OERA 3EF7A 1B32A 3U94A 1P1WA 5I57B 2RC8A 4H67A 4RJZA 2ONKE 5HBCA 2VGQA 3RT8A 3SEXA 1BP5A 1L5TA 3KN7A 1RYXA 3VXCA 4HTGA 4E0WA 3H7MA 4OMBA 5ISUA 1IXIA 4ZEIA 3VLWA 1JETA 1MXYA 1FTKA 3KSXA 4ISUA 2LAOA 3PD8A 1IXHA 1H45A 4GXSB 4F1VA 1B6HA 1MH4A 1SW5A 2R71A 1SW2A 3LSWA 2XXUA 3HHFA 2Z8EA 4RYAA 1NH7A 4OFJA 4KHZE 1B5HA 4IO5A 1LCFA 3K1NA 4G77A 4PE5B 3ZSFA 4R72A 2QMWA 4NMYA 4DDDA 2V84A 1OLAA 3DP4A 4KCCA 1P1UA 3H3GA 1B5IA 4PETA 4OZ9A 2DWJA 3T22A 4ZZAA 3H6UA 4N13A 1CE2A 2XXYA 3PGFA 1FQFA 4G68A 4R6KA 1J1NA 1Y4CA 1SYIA 4QSEA 1OMPA 1R6ZA 4XKPA 5I2KA 2F78A 3KG2A 2I58A 1IXGA 3ILTB 3SKPA 1VSOA 5AA3A 3C36A 5AA1A 4YKKA 4POXA 3MVYA 2Y84A 3ZKLA 3IL1B 4NF4A 1XHYA 2R6GE 1ZJLA 3PUZE 1T0KA 4G8MA 5ICQA 1FQAA 5KDTA 1N76A 3Q25A 4BDLA 4KQPA 4RK2A 4ZE8A 3PMVA 4X48A 3C9HA 1MPCA 4KFQA 4M4GA 5H8QA 4EQ7A 4QSCA 4ZDMA 2Q2AA 4Q30B 3A3UA 2OZZA 1IITA 5I59A 4GF8A 1QUKA 3BKIB 1HSEA 3G3IA 2OBGA 2D21A 1B46A 2ZMBA 4ONYA 2UVHA 3E4RA 5CM6A 4F19A 5A5XB 4FE8A 1M5BA 4JSOA 1LSTA 3QIMA 1B0HA 2Q2CA 5CC2A 3FVKA 2ZYNA 3QUJA 2A5SA 4OQOA 1MQIA 3T93B 1OQGA 4Q8RA 3MZ9A 1MG1A 3CSGA 4EF1A 3PUVE 2DWIA 2O7IA 4IB2A 3TUSA 4YB6A 1NMUA 1OLCA 3KN8A 1VE4A 4NF4B 3IOVA 1LB8A 3VVDA 4C1TA 3CFXA 4YMAA 3IOUA 2FYIA 4PFWA 4R73A 4FEBA 3KGCA 3P7IA 3CFLA 5KDTB 1FQCA 4JWYA 3S9LC 2XX9A 3RN8A 3MPLA 3MZ1A 1WVJA 2OLBA 3R7XA 3S2VA 1P1OA 3KBRA 4U23A 1XC1A 4R2FA 4GL0A 5H8QB 3Q28A 4GFRA 1EZ9A 4IGRA 4QF9A 3K2DA 4ZEDA 1D9YA 1WODA 5I59B 4ZZEA 3KFMA 3TCFA 1Z7ME 3MQ9A 3H6TA 3K6WA 1HSLA 1P99A 4FJPA 2O51A 4G4PA 2ABHA 2DVZA 3EHSA 4NWDA 2XX7A 1UQWA 1LFIA 3OEKA 2QSXA 4ZS9A 4EUOA 3OOAA 3O66A 4PQJA 3I6VA 4ELQA 3HSTA 2XD2A 5I84A 4NF6B 1AOVA 3CFZA 4YZZA 2F6PA 1MH3A 1US5A 4F22A 3JZJA 2XXRA 1MXZA 3IB0A 5KZTA 2P0SA 2ANJA 3K01A 4JWXA 1B3FA 1N3WA 1PDAA 2Z22A 1JQFA 2XXTA 3KEIA 1H76A 2GFEA 3CIJA 5AA2D 2XXVA 3WAEA 3UP9A 4OFLA 4NEDA 1MY1A 4C1UA 4P0GA 3W9WA 2NWJA 4ESXA 1QUIA 3OSQA 1B4ZA 1MPDA 2V3UA 1FTMA 2HZLA 5CMKA 5I58A 1Y20A 5H8NB 2OK2A 1BIYA 3OXNA 2Y7IA 1R9LA 5I2NA 2M8CA 3TTLA 3QSLA 2CMOA 2FA7A 3FZVA 1DTZA 4H5FA 4G68C 1URDA 2F7CA 2H99A 1B2HA 1TT1A 3GXAA 4U2RA 1ZU0A 3L6HA 4GWOA 2PYYA 3UN6A 4O3BA 2F7BA 3HV1A 4N6PA 4HW8A 4R6HA 1UTHA 1IIWA 4R9FA 1A40A 1QULA 4EF2A 4XIGQ 4OVJA 4LATA 5DEXA 1B05A 2ONSA 2G93A 1QJMA 2F8DA 3QK6A 1B3LA 4Q5TA 3KJTA 3USDA 3O9PA 4LZ7A 3KSJA 2F36A 2Y7RA 5CMBA 4U1OA 3GZGA 2ZYMA 4RNSA 1N3XA 3FV1A 3Q29A 3MZBA 1SW4A 5DVIA 3PPRA 2DSFA 1MXWA 3S9MC 1P1QA 3TAJA 4JXIA 2PT1A 3VLVA 2AYSA 5L9SA 4GLIA 3TKDA 2V93A 3IJOB 4OTEA 4KR5A 1FQBA 5I58B 5FTHA 3PUXE 1MXXA 3JYRA 4X1DA 1EZPA 5I2NB 1FTOA 4JWOA 4OYVA 2IA4A 1D9VA 3AXFA 1I6QA 1A54A 1POY1 1Y1ZA 3C35A 3T66A 3U8QA 1OIBA 2H5YA 3LR1A 4F3BA 3H06B 3RQTA 2I3WA 4JDFA 2YJPA 1PEBA 4IO7A 3C4MA 1AMFA 3MWBA 4L17A 3SEWA 1UTHB 3OMBA 5ICTA 2AIXA 1AH5A 3OO8A 3GBBA 1F9BA 1NNPA 4KPTA 5DEXB 2F5XA 1SBPA 1SQYA 3H6VA 4O3AA 4I9DA 1SVXB 1B3GA 2P1SA 1MQGA 3FD3A 1YCJA 3MP6A 4X1BA 3L6GA 4BDNA 4QFPA 2Z8DA 1I6AA 1EZOA 4QFNA 4RPOA 3R26A 4ELOA 4FEDA 1SYHA 3M8UA 1O64A 2PBWA 2ESNA 4BDRA 5CMCA 5FHNA 1MXUA 4P0IA 2VD2A 3FASA 1Z7NE 5CBSA 1A8EA 1FQDA 2ALUA 4F1YA 3B6TA 2WKYA 3TTMA 1NL5A 4M1VA 4H5GA 3TYHA 3TDJA 1USYH 4H6DA 5BUUA 2GRVA 3U72A 4HCYA 1M5FA 3K6UA 3CR9A 4G2ZA 5LOMA 3S9EA 5CRYA 3M3KA 5A5XA 3IO4A 3QYTA 1ATGA 4LQ2A 1MY2A 2HAVA 3HPIA 2OJTA 4QHQA 2E1SA 1RKMA 3O29A 4I1DA 1Y9UA 4F3PA 5HPQA 3HCQA 4Z0IA 1USYE 4OHNA 3N94A 4XKQA 5CI5A 4U22A 2HCAA 4Q0CA 2V3TA 3LSXA 5TP9A 1KWHA 4NWCA 3W9VA 4FATA 3OO9A 5IAIA 4ZE9A 3O6HA 4EDPA 2XXHA 1N7XA 1NKXA 4LZ8A 1ANFA 4EQ9A 3C33A 4F2QA 3IJXB 5DTBA 3RY3A 1ZKBA 3VVFA 3IOWA 4JB7A 1Y3QA 3PMWA 1A8FA 3PPPA 2Y7WA 3CVGA 4IY5A 4MF3A 5FHMA 1MY3A 4ECFA 4R9GA 2YLNA 3TTNA 3GLBA 2XX8A 1N7WA 3MJNA 3IAZA 1XVYA 3DELB 2XXQA 5AA2B 3FIRA 3K6XA 2Q88A 1AL3A 3MBPA 2DVCA 2DP8A 4THIA 2UXAA 5M2VA 4QSDA 3E3KA 3A3CA 2RCAA 4LZ5A 2HZKA 4O3CA 4NF6A 4DCYA 1B58A 5B7DA 3UIFA 5CBRA 2XXXA 5TP9B 2Q8JA 3M3LA 2Z23A 3OD7A 3PPOA 3Q26A 3VE1B 1QW0A 3K6VA 3N26A 3C31A 2DXRA 1JEUA 1LBBA 2E0SA 1Y3PA 1B5JA 5CMMA 5H8NA 2DXYA 2ZYKA 3QUFA 4PFUA 5F1QA 4EXLA 3OENA 3K1PA 1Y3NA 4G8HA 4FIMA 4H0WA 1PBQA 2HFBA 1D3KA 3V5AA 1YAEA 4YKIA 2I49A 2REJA 3MVZA 2XXIA 2UYEA 1GVCA 1DPPA 1A99A 3K0VA 1FW0A 2RC7A 5K2YA 3G3JA 1FCKA 4PP0A 4DIGA 4GVOA 1ZTYA 1TWYA 1LAXA 3IO6A 1B52A 4GOTA 3TPAA 1N04A 2RCBA 4R74A 1JNFA 5KCJA 3IB1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MDP1 4H1XA 2AL4A 2RINA 4C0RA 4ZEFA 4F3SA 4R6YA 4N81A 3DM0A 5K2XA 1M5DA 1XVXA 4H8IA 3ROJA 3G3GA 5FTIA 1MQJA 1NH8A 4OEUA 4MMPA 2ZZWA 1YYZA 3LBSA 2I6EA 3FVOA 4XXUA 5TPAB 2W7YA 2O1MA 3FXUA 4E0XA 2QVVA 3S4UA 2DE4A 4KCDA 1JW4A 2NUVA 1FSAA 5DW8A 2RF1A 4UACA 2V3QA 4MNPA 1Q35A 2DYXA 3Q27A 4I62A 1SD3A 1UTBB 1GTKA 2V25A 3FATA 4FAJA 4YU0A 3O6GA 2DQVA 2XA5A 1B7HA 2H9BA 1MQHA 1NNFA 4YKPA 1NNTA 5LDZA 5ET5A 2QMXA 2ZNSA 4U4XA 1QUJA 1BKAA 1EYIA 3IORA 1QVSA 3KZGA 3RPWA 3TQLA 4IO6A 2D3IA 3IK6B 3BFTA 4OVRA 2I0BA 1AIVA 4F29A 5HM4B 3D4CA 4FORA 4U1ZA 2XWOA 1D4NA 2ZNUA 4F1UA 3O6IA 2DE2A 1XS5A 1S7YA 4KD5A 5IM2A 5KCJB 2NXOA 1Y1MA 2VD3A 4NG7A 3VV5A 3MVWA 2QFLA 3OEMA 3FUZA 4N91A 2HEUA 2ZNTA 1LAFE 3PD9A 5I56A 1R1NA 1OQHA 3ISPA 2X7QA 3W15C 1INPA 1HSJA 2PX1A 4MNCA 1MRPA 2Y7PA 5ITOA 4F39A 3HHGA 4TLLB 5EQ7A 4P3LA 4GWUA 4OFOA 4XKNA 1I69A 1II5A 1O7TA 3K00A 3TTKA 3DP6A 4QFKA 4GBVA 3C34A 1QKBA 2F97A 2Y7KA 4LA9A 1LFGA 2ONRA 1PB7A 1N0TA 3G7WA 1YTVA 4I3YA 1H43A 4LQ5A 1IMAA 3MPKA 4PAKA 1PB8A 3RTFB 2HXWA 1G0HA 2GHAA 3MW0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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