3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
50100150200250300350020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
5010015020025030035035030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TII1 (3-6)EMPTYS1 (7-10)TVIII1 (57-60)AH1 (17-31)TI1 (12-15)O1 (15-17)AH12 (287-296)AH11 (273-284)TIV12 (270-273)AH3 (64-73)S3 (59-63)S15 (258-266)AH4 (83-88)AH5 (91-97)S4 (98-99)S5 (102-103)S6 (105-112)S16 (301-302)AH14 (315-326)S7 (114-118)TI2 (118-121)TI3 (119-122)AH6 (130-141)TIV11 (249-252)S8 (145-148)TVIII3 (220-223)TI4 (150-153)TIV10 (205-208)AH15 (335-352)AH7 (154-163)S17 (328-329)TIV4 (163-166)TIV8 (182-185)S9 (167-171)TIV6 (171-174)TIV7 (172-175)3H1 (229-231)AH9 (210-219)S11 (222-227)AH10 (232-238)S12 (242-245)S13 (249-250)S14 (253-254)TI6 (267-270)AH13 (305-312)TIV13 (299-302)TVIII5 (353-356)AH16 (357-373)S2 (35-38)AH2 (43-53)TIV9 (202-205)S10 (176-182)AH8 (186-201)O2 (284-286)TVIII4 (312-315)TIV1 (40-43)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
1LAGE 2DWHA 3MVYA 3K6WA 3T9VA 1FQAA 4ZZEA 3EN3A 3VXCA 1JQFA 2I4CA 2I49A 2XXUA 1H76A 2P0SA 1QUIA 3I6VA 4F1VA 1R1NA 4G4PA 2OK2A 2HCAA 1IZ1A 4TLMB 4NF6B 1N04A 2UXAA 2PT2A 3C34A 4PE5B 2QMXA 2G29A 3U1OA 2VGQA 1SW2A 4X1DA 3HPIA 4GOTA 3FJ7A 3FJGA 1RYXA 4GVOA 2NOOA 4NTLA 2NVUB 4N13A 4THIA 1MXUA 2XXHA 1OQHA 3O66A 4EF1A 3SERA 3MUQA 3MC2A 3T9UA 3MQ9A 3VVFA 3V8XB 4EXLA 2H25A 3B7DA 3SKPA 4BDOA 4PQJA 1Y9UA 1N3WA 3QYTA 4X1BA 4YICA 3TTKA 1QUJA 2Y84A 5CRYA 3PD9A 3EF7A 1M5DA 4ESWA 2ZYNA 4DCYA 2REJA 1DMBA 3K01A 4R73A 4BLAA 3DELB 4QFPA 1LBBA 1ZKBA 2F7BA 2QMWA 4XTCQ 1XHYA 1FQBA 4H8IA 1MDP1 1Z7ME 5H8FB 2PYYA 1MXZA 4KYDA 1ANFA 4F2OA 3IX1A 1YCJA 5AA1A 3Q28A 5CMCA 1POY1 4GXSB 4XIGQ 2NWJA 3IR1A 2A5SA 1R9QA 2XHDA 2A5TA 4GRKA 4QHQA 2DQVA 2I3WA 4TOZA 2Z22A 3KG2A 4XKPA 3RQTA 1B46A 2HAUA 4Q8RA 1AL3A 4GD5A 3O28A 4KPTA 1SW1A 1CE2A 4FE8A 5JK4A 4KHZE 3V89B 1N7WA 3V83A 2F34A 3SEVA 3FXUA 2FA7A 1MM6A 2H9BA 2D21A 3FVNA 3S4UA 3Q25A 2ZXTA 1LLSA 1MQIA 3UP9A 3VXBA 3RGYA 3TFLA 1N0TA 1NFTA 4ELOA 3CFXA 3FV1A 1NNFA 2ZMBA 4JB7A 4OMBA 2XX8A 2F5XA 4MLQA 1O63A 3ECRA 2DWAA 5DEXB 3H6VA 4Z7EA 3RPWA 5L9OA 1NH8A 4X48A 4KCDA 4FATA 4YB7A 1OQGA 4OTEA 5H8HB 3Q27A 1B40A 3PPOA 2KLFA 5AA4A 2PVUA 5ISUA 5JTYA 2QS2A 3OO6A 1A40A 1LFIA 4KYSA 3ILTB 4QFOA 4WKMA 1PBQA 3GBBA 4ZDMA 3H03A 3FIRA 3K2DA 4U22A 5TP9A 2I3VA 4JXIA 3G3KA 4RK9A 1B7HA 3PUZE 1H45A 3K6UA 4G68B 2F6PA 3VDFA 1NKXA 2O7UA 2X26A 1JEVA 1F9BA 3JZJA 3MZ1A 4OERA 3VLWA 1LAXA 1B4HA 4GLIA 4BDRA 4F31B 3FGSA 2XX7A 3B6QA 4NWDA 5H8NA 1URDA 1KWHA 3JV9A 5I59B 4YU0A 1H44A 2QS3A 1MY0A 4OQOA 2DP8A 3GBAA 4R9GA 4OETA 4HCWA 1P99A 3T96B 4F3BA 2F97A 3TCGA 1PBPA 3RT8A 4RY1A 2D5WA 4O3BA 3R6UA 3W9VA 5CBRA 4R74A 5LOMA 3MAMA 3U94A 3QIMA 1NH7A 5TPAB 1GR2A 1B3HA 4OXVA 1P1QA 5DT6A 3I5OA 3VV5A 2OLBA 1N84A 3C4MA 4EF2A 3MZBA 3PMXA 3C9HA 3T22A 1US5A 5CBSA 3H7MA 5AA2D 1GGGA 4IB2A 4G2ZA 1FQDA 2Z8FA 1EZ9A 3CFZA 1BP5A 1XT8A 1DSNA 1B51A 4C1TA 3O6HA 1H3DA 4F3SA 1M5FA 3DP6A 3HN0A 3MP6A 4IY5A 1AH5A 4U23A 2DOJA 3MZ9A 4H65A 4FIMA 1ELJA 3RLFE 3H6TA 3M3FA 1PB9A 2QL3A 3MP8A 1LFGA 1UTBB 3TPAA 2UVIA 3PD8A 4JDFA 1EU8A 2R9JA 3SEUA 2RF1A 1P1NA 2GFEA 4NF5A 5HBCA 5KZTA 4IO6A 2ZNTA 3G3FA 3GXAA 5B70A 1YAEA 4LZ8A 2BJJX 4ZEIA 3T93B 3FUZA 4UACA 4C0RA 4WEPA 3LUYA 4H67A 1LB9A 1MY1A 2DE4A 3QUJA 1MY2A 4ND9A 2O7IA 2CZLA 3RTFB 2ESNA 4F39A 3IB2A 1OVBA 3L6HA 2CMOA 3TUSA 1AIVA 3TQWA 4IGRA 5ITPA 4FECA 1O7TA 4DIGA 3E3KA 4OWDA 5KDTA 4H5FA 3ZKKA 3U92A 1MH4A 5HM4B 3LBSA 4YAHX 4UA8A 3KJ7A 1EZOA 4JWYA 3GLBA 2ALUA 3KOSA 4JSOA 4I9DA 3QSLA 2DXRA 4TQUQ 2UYEA 4QFNA 3IAZA 1IEJA 3KEIA 2F6GA 4NF8A 2VOZA 4KR5A 2PMSA 3DLNA 2ANJA 1MQHA 4RA1A 1ZU0A 2I0BA 5I2KA 4NE4A 1FW0A 3DP4A 3SDFA 4JWOA 4ZECA 5JEIA 1UTHA 1SW4A 4LUBA 3N94A 3RTWB 3K4UA 4DCXA 2Q2CA 4LQ2A 5DTBA 1A8FA 2YJPA 1SI0A 2O68A 2B3FA 3OSRA 1XVXA 3FVOA 1B3LA 1ZBMA 1ZJLA 3SESA 1B0LA 1IIWA 3K1PA 2W7YA 1J1NA 3IB0A 1LFHA 1RYOA 4G77A 3PMVA 1IITA 4GF8A 3EHTA 3MP1A 1GV8A 4YKPA 2P2AA 4KFQA 4I62A 1PB7A 5BWJA 1LAFE 4NF4A 3TTRA 1DPPA 1B5JA 1Q1KA 5TU0A 4LQ5A 2OCUA 1P1WA 4KD5A 3TZAA 5CM6A 4KCCA 4U21A 2GH9A 2I48A 3DP8A 4IO4A 4O3CA 4H0WA 1A54A 5ICQA 1B7UA 3C36A 5F1QA 3EHUA 3USDA 1Y4TA 1BTJA 3TELA 5I56A 2HXWA 2DS9A 3V5AA 1M5EA 2DWJA 4AB5A 2G93A 1FQEA 4FJPA 1B0HA 3EQ1A 4LP2B 4MF3A 2VD2A 4R2BA 4LZ7A 2AIXA 1LB8A 3TQLA 1B5HA 4H5GA 1O64A 5DVIA 1POTA 5I57A 1LAHE 2X7QA 2XXQA 4XXUA 2YLNA 2B3BA 1Y3PA 1D3KA 2E0SA 1OMPA 2GRVA 3C31A 3SETA 1FQFA 1AMFA 1P1UA 1EH3A 4G8MA 3OO9A 5I58A 1JW1A 2O6AA 3MWBA 5ICTA 4ZS9A 4LZ5A 4EUOA 2V93A 4PETA 1MQDA 4DXCA 3S2VA 1B05A 1URSA 5AA4B 3VVDA 1MXVA 2DE2A 4MLVA 5JTYB 1S9TA 2XXTA 4WXJA 4Q5TA 2V3QA 1ATGA 4OESA 5TP9B 3IJXB 3EHSA 5FTHA 2HZLA 2QJEA 1B1XA 3VE1B 1I69A 2DVCA 1B6HA 1OLCA 4PFUA 4OEVA 4R9FA 2QS4A 1FTMA 3FATA 1HSLA 3KN7A 5H8FA 3FXQA 5FHMA 1SQYA 2RINA 1IXGA 5H8NB 3MVWA 2O51A 1TT1A 2H4IA 5M2VA 1HSEA 1MPDA 1NMUA 1II5A 1B58A 3TTLA 2B65A 3MPKA 3PU5A 2OJTA 2V3UA 3TKDA 3LSWA 2Q2AA 3H6WA 3IOTA 3JYRA 3QAXA 4WEDA 1UIUA 1VFDA 4ZEFA 1VR5A 1Y4CA 1RKMA 3CRBA 5CMBA 2QRYA 1Z7NE 4GIZA 1LGBC 3CSBA 5BUUA 5CC2A 1SYIA 1JEUA 4BDQA 4RNSA 1QULA 3UIFA 1ZMGA 3PPPA 3K6VA 4I1DA 2O1LA 4NWCA 3I3VA 2ABHA 1LCTA 2F78A 3UA8A 4MH5A 3KGCA 1A7LA 4U1OA 1QKBA 3U72A 1Y3QA 3IORA 1PDAA 1LSTA 2QS1A 3TODA 4F18A 3RNNA 4RPNA 3M8UA 4U4XA 4TLLB 2OZZA 4ZE8A 2HZKA 4H8JA 3FVKA 3S9NC 2AYSA 5H8QB 3PPNA 3FXRA 4F22A 2GHBA 2HAVA 4OYVA 5L8DA 3H06B 1BIYA 4KQPA 3O29A 3HV1A 3OEKA 3MW0A 1ZIUA 1ZTYA 1QUKA 3Q26A 3MBPA 4NF5B 3ILUB 1SW5A 3N6TA 3SEWA 3VLVA 2E1SA 3KN3A 4YB5A 1SD3A 4ISUA 3IJOB 5AE4A 3FZVA 4E0XA 5B7DA 1WDNA 4DLDA 3KOTA 3IO6A 1MPCA 3HCQA 2PBWA 3OENA 1VSOA 3Q29A 3KZGA 3TCFA 3S9LC 1MG1A 4IO7A 4ZEBA 2RC9A 2XXIA 3FD3A 3P7IA 1JVYA 1R6ZA 3TTNA 3D4CA 4ONYA 2Y7IA 3OEMA 1MQGA 4OFOA 5KDTB 3IK6B 2Q9TA 1I6QA 4G68C 2O1MA 1MS7A 2H99A 1A55A 3KFMA 1VFEA 1XVYA 2Y7WA 4OHNA 1MRPA 3U8QA 1MY4A 1TXFA 3BKIB 4F29A 4NF8B 3OO8A 1CB6A 3T9HB 1XS5A 4R72A 4EQBA 2XXRA 3PUYE 4GQOA 4Q30B 3VVEA 1IXCA 4QF9A 3MVXA 2Y7PA 5I2KB 1T0KA 2V3TA 4HCYA 4IO5A 4QFLA 1A99A 1UTHB 3BBRA 1B2HA 1P1OA 5FTIA 5CI5A 3FVGA 1D4NA 1VE4A 5A5XA 3BFTA 2XXWA 1B9JA 1FQCA 4OFJA 2F7CA 4O3AA 2XX9A 2FNCA 4JWXA 3O6GA 3UGWA 2DWIA 3IOWA 4R6KA 2Z23A 3TTMA 4F3GA 1URGA 2UVGA 2Y7RA 3KBRA 5I2NA 4NF4B 1L5TA 2QPQA 4IY6A 1SDXA 2NUVA 3K0VA 4LATA 1Q35A 3EPEA 4AQ4A 1BLFA 1NL5A 4F3PA 4Z0IA 4DE8A 4EQ7A 3K02A 3OXNA 2VHAA 2D3IA 3D4GA 3LR1A 2XD3A 3T9XB 3C33A 4BDMA 2XXXA 4BDNA 1B5IA 1SBPA 1M5BA 2OWSA 2XXPA 3BFUA 5EHSA 3OSQA 5I56B 4POXA 1IXIA 2R6GE 1QW0A 4GWOA 1GTKA 5DVJA 4PP0A 1USYE 2NXOA 1IQ7A 3A3UA 4YB6A 2OWTA 2DE3A 3G7WA 3O97A 3SEXA 1FTJA 4QSDA 3TAJA 4RJZA 1UIVA 2XXYA 3H4ZA 2X7PA 1Y1MA 4ZZAA 2M8CA 4K3FA 2ZNSA 4R75A 4BDLA 5I57B 3E13X 4XKQA 1NNTA 3A09A 5KCJA 1OIBA 2V25A 1TFDA 4LVQA 3WAFA 4N07A 5IKBA 4IO2A 4QFKA 3TDJA 5I58B 2YPNA 2A5TB 3MPLA 4DXUA 4HS7A 1YPNA 4MFIA 4R2FA 2AL4A 1A8EA 4RK2A 3KN8A 3IO4A 3QXMA 5AA2A 2VP1A 2Q8JA 4YMBA 3H3GA 1MH3A 3CVGA 3FJMA 5ELVA 3CSGA 4OFLA 1GVCA 3G3JA 4MBPA 5EHMA 5F7VA 2UYFA 2R71A 3ZSFA 4ZEDA 4NF6A 4G8HA 1B3GA 2XD2A 3QK6A 5I84A 1LCFA 4U1ZA 5ITOA 3WAEA 4M1VA 4F1YA 2REGA 2LAOA 2Q89A 3K00A 2OBGA 3TCHA 1D9VA 3LSXA 4U2RA 3E9XA 3OMBA 3GZGA 2IA4A 3W15C 4NMYA 1MDQA 2UVHA 4GL8A 4IGTA 4ZE9A 3PUVE 4ELQA 3N5LA 3FV2A 4EXKA 4C1UA 3T66A 3KSXA 1S50A 2H98A 1DTZA 3R26A 1WODA 3PGFA 4QSEA 1PC3A 1QJMA 1B52A 4M4GA 1B3FA 4IO3A 1OVTA 1LBCA 5DYHA 1Y3NA 2I0CA 1DPEA 5FHNA 1S7YA 5AA3A 4KYEA 4F2QA 4DZ1A 1WVJA 1XC1A 3TYHA 3ZS6A 5EYFA 1DOTA 4XKRA 3DM0A 2I4BA 2ZYMA 2I6EA 2RKMA 1BKAA 2UVJA 5HPQA 3HHGA 3MVZA 4OVJA 1FTOA 4NEDA 3CG1A 1NNPA 5FHOA 1JW5A 2FYIA 3UORA 3IOUA 3E4RA 1R9LA 4R6YA 4F19A 4P0GA 1Y1ZA 2IEEA 4ELRA 1PB8A 3QUFA 4OENA 3K1NA 4YKJA 3G3IA 3RN8A 4FAJA 1AOVA 4P0IA 3PPRA 3UK4A 1I6AA 3TMGA 1JNFA 3R7XA 5IAIA 1IXHA 2RCBA 3G3HA 3K6XA 2Y7KA 2QSXA 2RC8A 3O2AA 1B4ZA 4LONB 1JVXA 4FORA 3TEPA 3U93A 3O9PA 4AB6A 5CMMA 3H6UA 2F35A 2VD3A 2ZNUA 5L9SA 3LC8A 3K1MA 4QRZA 2ONKE 1QVSA 3M3LA 2P1SA 4POWA 3MJNA 5DEXA 3S9EA 4XKNA 4HW8A 3B6WA 3PMWA 4R6HA 2F7AA 3G3GA 2RC7A 2V84A 5DVFA 4QSCA 4U4SA 2Z8DA 4P11A 5H8HA 2ZYOA 1FCKA 1D9YA 4N6PA 4ZEKA 2ONSA 3LSFB 3THIA 1TFAA 4X9TA 2HFBA 1MXWA 1I6BA 2Q88A 4OZ9A 3HHFA 4YKKA 3PUXE 1B1HA 2F8DA 3IL1B 4YMAA 4G68A 4RPOA 2WKYA 3VLUA 1EZPA 2HEUA 2Z8EA 2THIA 1ZLQA 4FEBA 1N3XA 5I59A 1MPBA 4Q0CA 1XOCA 1MXYA 4EDPA 4G8NA 4GXAA 1SVXB 2PX1A 3CIJA 5K2YA 3F11A 3OO7A 4GL0A 5K2XA 3PUWE 1TWYA 2HQ0A 5A5XB 1B7ZA 3SEYA 1N7XA 4PFYA 3W9WA 4F1UA 2AL5A 2H5YA 5H8QA 4LA9A 5TPAA 2DSFA 5L9MA 1SYHA 3N26A 1IUDA 1Y20A 2PT1A 2GHAA 3B6TA 5I2NB 3A3CA 1UQWA 3KSJA 1JW4A 3FASA 1MQJA 3IOVA 3S9MC 5J1DA 4ECFA 1FTKA 1SI1A 1USYH 1PEBA 4ELPA 3KJTA 4PFWA 3OOAA 4L17A 4H1XA 2RCAA 2F36A 1MM7A 4DDDA 1OLAA 2ONRA 3CI8A 3VFJA 1N76A 3L6GA 4HTGA 1US4A 4KI0E 3ZKLA 1B32A 3OELA 3CG3A 1H43A 4H6DA 1MXXA 3ONMA 1FTLA 1B3EA 2O84X 1UTBA 5CMKA 3HSTA 2DYXA 4RXLA 3AXFA 1MY3A 4YZZA 3RUMA 3IB1A 4E0WA 3CFLA 2DVZA 4JBZA 4DXBA 3N6UA 2ZYKA 3PV0E 3RT6B 4ESXA 4PFTA 5KCJB 2XXVA 3LSLA 2I58A 4GFRA 3C35A 3PPQA 4FEDA 4YKIA 3O6IA 3CR9A 3ODBA 1DTGA 1YTVA 4OEUA 3RY3A 3C32A 5H8SA 1QKAA 1JETA 3UN6A 3M3KA 1NNKA 1HSJA 4I8CA 2O69A 3HO7A 1M5CA 4RYAA 2DXYA 3OD7A 4EQ9A 5AA2B 4JSDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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