3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
3PPQA 3R26A 4FIMA 2F5XA 2AIXA 3TZAA 3FVNA 2DS9A 3PUWE 3MVXA 5JTYB 1LFIA 1UTBB 3KG2A 1NH7A 3RT8A 3EPEA 4O3BA 1SW1A 3S4UA 4RPNA 1P1WA 3W9WA 4F3BA 3VXCA 3FZVA 2QS3A 3CFZA 4BDOA 2Q8JA 1R6ZA 1MXZA 3Q29A 4N6PA 5DVJA 4OESA 2DVCA 1B4ZA 4OHNA 2HXWA 5M2VA 4TOZA 3TTLA 1DSNA 3DELB 3GXAA 2UVJA 4G2ZA 5I59B 5CC2A 1QW0A 2VD3A 1NKXA 2Z22A 4AB5A 4RXLA 1MQJA 3IO4A 2CMOA 1AOVA 3IL1B 3DM0A 3UGWA 4R6HA 1P1NA 3FD3A 2ZNTA 2NUVA 4IO2A 1LAFE 4NF6A 2FA7A 4Z0IA 1FTOA 1OVTA 5CMBA 4F39A 2OWTA 1ZTYA 4MH5A 2O84X 4UACA 1NH8A 4BLAA 3VVFA 3ODBA 2OBGA 3L6HA 3H06B 1B2HA 4U23A 2I49A 4X9TA 4U4XA 4FE8A 5IKBA 2Y7WA 4GL0A 1NL5A 2VD2A 3UP9A 2QMXA 4I62A 5TP9A 3T93B 4NEDA 4LQ2A 3N6UA 2XXIA 2F6PA 4P0GA 4EDPA 3TELA 1NNPA 3V83A 4N13A 1O64A 2XXUA 2PX1A 2D5WA 3O29A 1P1QA 1R9QA 1JW1A 3S9NC 2O7IA 4XKNA 4FEBA 1ZMGA 3G3HA 1B6HA 1N76A 2OWSA 2HAUA 1LCTA 1US5A 4DCYA 1VFDA 5TP9B 1GVCA 3O28A 1B1HA 1OQHA 3VVEA 2E0SA 2O1MA 2H4IA 2A5TA 4G8NA 2D21A 2GH9A 1URSA 4OERA 3IR1A 3CR9A 2YJPA 4QSDA 3EHUA 1SYHA 2ZYKA 5AA2D 5I56B 1MQIA 3HPIA 2P1SA 4M4GA 4DLDA 1TFDA 1MPBA 3S9LC 4EQ7A 3RQTA 1R9LA 3ONMA 3CI8A 1EU8A 2Z8FA 4NF8A 4NF5B 3MZ1A 5BUUA 3OENA 2A5TB 4PFYA 2OK2A 4YKJA 3TTNA 4F1UA 1N04A 3FJGA 5J1DA 4XKPA 1DPEA 5B7DA 4IY5A 3T22A 5AA1A 4ZEFA 1YTVA 1B1XA 2YLNA 3TPAA 4EQ9A 2ZYOA 1FW0A 5CMKA 2XHDA 4F19A 3TQLA 3EHTA 3U93A 4NF8B 1LAHE 4RNSA 2F35A 2AL4A 4OQOA 1OQGA 5A5XB 2DQVA 5ICQA 3VE1B 4MLQA 3GBAA 3K1NA 3RT6B 3K00A 1IQ7A 3QUJA 4WEDA 2H9BA 5KDTB 1USYE 4I9DA 4OENA 3N6TA 3WAEA 1LFGA 1LBCA 3CSBA 1SW2A 3OXNA 3G3IA 3SEWA 1OMPA 2DWAA 4F29A 1M5CA 4O3CA 1SVXB 1MDQA 1FQAA 4F22A 1QVSA 2ZNUA 3EF7A 5ITOA 2OCUA 1QKAA 1RYOA 4ESXA 1PDAA 2X7QA 1NNKA 1QULA 4PFUA 3T9VA 4FAJA 3CG1A 3PUYE 5FHOA 3RLFE 2F34A 3M3LA 4U21A 3RGYA 4JBZA 4C1UA 4QFPA 4QFOA 5DEXB 1XOCA 5LOMA 4PFWA 1MY3A 3FIRA 4G68B 1Y4CA 3UIFA 3D4CA 5I2NB 2Q2AA 4ZE8A 3FVKA 3W15C 2GRVA 3BKIB 2AYSA 2XXXA 3RN8A 3KN8A 1SBPA 4OETA 3ZS6A 2GFEA 1B4HA 1IIWA 1B5HA 4Q0CA 4NF4B 1MXVA 3PPRA 1MY0A 2QSXA 4OEUA 1B5JA 3I5OA 3FV2A 1B3GA 1SI1A 4HS7A 4R6YA 2O1LA 1A40A 1MPDA 1M5FA 1S7YA 1A55A 3OO7A 4TQUQ 4GXAA 1EZ9A 4KR5A 5H8SA 3TTMA 3WAFA 3VFJA 5AA2A 4IGTA 3IB1A 1MXWA 1B5IA 3HV1A 2PBWA 3PD8A 3TKDA 3MPKA 1PEBA 4ZZAA 1QUJA 2Z8EA 2I4CA 4ELOA 1RYXA 3Q27A 4R9GA 3PUZE 3MVYA 4YZZA 3DLNA 3GLBA 2I4BA 1CE2A 1D9VA 4GVOA 1R1NA 2G93A 5FHNA 5H8QB 5AA2B 2O6AA 4LVQA 3U8QA 4E0WA 1B7UA 4DXUA 4U1OA 2M8CA 3OEKA 1O7TA 2PMSA 3MZ9A 3M8UA 2Y84A 5CM6A 1TFAA 2Y7KA 3VLWA 2V84A 4R73A 3V89B 5FTHA 3FJMA 1MM7A 2F6GA 4RA1A 3FUZA 1XS5A 2W7YA 1HSEA 1LGBC 1N3XA 4FECA 3QSLA 2ZMBA 1UIVA 5ICTA 1GGGA 2RCBA 1OVBA 1H3DA 2DE3A 3G7WA 4P11A 4HTGA 2VGQA 2UYFA 3CFXA 1I6BA 2Q2CA 5I58B 1SQYA 3C33A 3O66A 3PMVA 4MF3A 2VOZA 4DZ1A 4FEDA 1F9BA 1I69A 4G8HA 1JEVA 1YAEA 4DXBA 3V5AA 3HO7A 4IO4A 3UA8A 3SEXA 1MXXA 3VLUA 1BLFA 2HZLA 4JSOA 1MQHA 3K6VA 3KN7A 1LBBA 2Q9TA 3CVGA 3N94A 4GXSB 3TTRA 1SW4A 1B3EA 4MFIA 4C0RA 4LUBA 5FHMA 3IX1A 1LCFA 3ECRA 4Q5TA 1POY1 4Q8RA 1I6AA 4EF2A 1NNFA 1BIYA 2I48A 2XXTA 1JEUA 1B32A 1B3HA 4PE5B 1Y1MA 2UVHA 1EZOA 1QUIA 3K1PA 4QF9A 4HCYA 1D9YA 4X1DA 1SYIA 3H03A 3E13X 3CIJA 3A3UA 3JV9A 2HCAA 4QRZA 3VXBA 1N3WA 1BTJA 4KPTA 4DIGA 4ZZEA 4QSEA 1NFTA 3MC2A 3P7IA 4ZDMA 2DOJA 3PPPA 2DE2A 1FTMA 1KWHA 3G3FA 3TUSA 2X7PA 4R75A 3PD9A 4JSDA 3C31A 3OMBA 3QIMA 1DOTA 1M5DA 2QS2A 4G8MA 3KOSA 3CRBA 2DWJA 4NWCA 4IO3A 1VR5A 1IXGA 3C34A 3F11A 3U92A 1N84A 5F7VA 1B9JA 3OOAA 3JZJA 2R6GE 4JB7A 1A7LA 1L5TA 3PV0E 1B46A 3W9VA 4NF6B 1MQDA 3H6WA 4GD5A 2A5SA 1Y3NA 4JDFA 4GOTA 2XXYA 4EXLA 1XT8A 1SDXA 1US4A 3Q25A 4H65A 4LQ5A 1ZKBA 4LA9A 1MH4A 3HHGA 1FTJA 1JETA 2OLBA 2Y7PA 3EN3A 4KYSA 4F2QA 4EQBA 5I57A 4P0IA 4YICA 3TCGA 2PT2A 5CRYA 2OJTA 3PU5A 2I58A 5HM4B 1LAXA 2RINA 3QYTA 3FATA 4ECFA 2XXHA 2PVUA 1MS7A 3S2VA 1OLAA 2NXOA 1OLCA 2DE4A 5ELVA 1NMUA 1JNFA 5CMCA 1MDP1 4WKMA 5I57B 2UVIA 2B65A 1FQEA 4H8JA 1TXFA 2FNCA 3S9EA 3PMXA 2H99A 3N26A 3K6WA 5AE4A 3GZGA 2X26A 3MP8A 4ISUA 5JK4A 4JXIA 5F1QA 4RK2A 2RC8A 1SW5A 3SEUA 1HSLA 4ELQA 3BFTA 3IOTA 3OD7A 4YB7A 3PMWA 3TEPA 3O97A 2PT1A 1N7WA 4EF1A 2F78A 3HCQA 4YKPA 3TMGA 4WEPA 1D4NA 2QS1A 4AB6A 1ZIUA 4DXCA 1ELJA 4ESWA 2V25A 5KCJA 1QUKA 1IXHA 4RYAA 3MQ9A 3C36A 3FGSA 3USDA 2O51A 4RPOA 3PPOA 4FATA 4M1VA 4H5GA 3JYRA 1H43A 2YPNA 3KN3A 2ZXTA 1JVYA 4N07A 5K2XA 4PETA 3LC8A 3THIA 5KCJB 1PBPA 4BDMA 3IK6B 1PB8A 1AIVA 4XKQA 1IUDA 1XVYA 3TAJA 2RC7A 3IOUA 2XXPA 5CMMA 2B3BA 1H45A 5BWJA 2DVZA 4PP0A 1EZPA 1XC1A 2V3TA 3IAZA 4R6KA 4R72A 4G4PA 2QRYA 4KCCA 3IJOB 3MWBA 1BKAA 3RTFB 4F3PA 3ILUB 3RY3A 3RTWB 1Z7ME 3O9PA 4OVJA 4XXUA 1ZJLA 4POWA 3IOVA 2DWIA 3MVWA 5DTBA 1POTA 1LLSA 4H8IA 3IB0A 5EHMA 3B6TA 4H6DA 3QAXA 3PUXE 3RNNA 2KLFA 4IO5A 3K0VA 2H98A 3M3KA 2R9JA 3KZGA 4QSCA 4F18A 1AH5A 4DE8A 4KD5A 1GV8A 1HSJA 3O6HA 1N0TA 3C4MA 4NMYA 4XIGQ 2O69A 2DWHA 4YB5A 1ZU0A 1UQWA 4KYEA 4TLMB 3KJTA 4H0WA 4AQ4A 4NWDA 2R71A 3OO9A 3LBSA 3TTKA 3KGCA 4THIA 5I2KA 4ND9A 2Z8DA 4I1DA 2ONKE 4ZS9A 5H8FA 4BDRA 3B6QA 1MM6A 2XX8A 1MG1A 1JVXA 3IORA 3IB2A 3BBRA 4E0XA 4H1XA 3UORA 3KEIA 5HBCA 1IXCA 4H67A 3CFLA 4O3AA 5I2KB 1MXYA 5L9OA 1LFHA 1Z7NE 1PB9A 3ILTB 3R7XA 1CB6A 2XXRA 2I0BA 3VLVA 2RKMA 4DCXA 3MBPA 2UXAA 1XHYA 2O7UA 4TLLB 4MBPA 4G68C 4YMBA 4LZ5A 2HQ0A 3KJ7A 1VE4A 4ZEBA 3G3JA 2I3VA 1Q1KA 2Y7RA 5EHSA 3H3GA 1H76A 4ELRA 4C1TA 4X48A 3E9XA 1QKBA 4BDNA 1AMFA 3ZKKA 5JTYA 2ONSA 1UTBA 1J1NA 1DTGA 3DP6A 3E4RA 4F1YA 2P2AA 3MVZA 3K6UA 4F3SA 1UIUA 3A09A 1P1UA 2F97A 2ONRA 3C32A 3LSXA 5AA4A 4Z7EA 4I8CA 4Q30B 3C35A 1YCJA 4JWOA 1VFEA 3H4ZA 4F2OA 3VV5A 3QXMA 3OEMA 3FJ7A 2VHAA 5I84A 4RJZA 5I59A 4U2RA 3I3VA 4FJPA 5H8HA 4X1BA 3K1MA 3G3GA 1DTZA 4YMAA 5AA4B 4BDQA 4IY6A 3LSWA 2PYYA 1LB8A 3MP6A 2XD3A 3T96B 5H8NA 5AA3A 4R2FA 4FORA 1EH3A 1JW4A 2QMWA 3FV1A 3FXQA 2F8DA 1SD3A 5H8HB 3G3KA 3T9UA 4RY1A 2V93A 4YAHX 4IO7A 5L9SA 1TWYA 3LR1A 4JWYA 2F7CA 2V3UA 3FVOA 3U1OA 3H6UA 5DYHA 4ZE9A 2AL5A 5FTIA 5H8NB 2I0CA 4HW8A 4XKRA 2DXYA 4KYDA 3OSQA 2XXWA 2GHBA 2REGA 1B3LA 3GBBA 2B3FA 4UA8A 1UTHA 2V3QA 1ATGA 3S9MC 1H44A 3UN6A 3HN0A 4ZEIA 3EHSA 1OIBA 2ZYMA 4EXKA 1XVXA 3FXUA 3B6WA 3U72A 3PPNA 1FQCA 3OO8A 4OTEA 5I56A 4XTCQ 2NOOA 3IOWA 3TFLA 3LSLA 1Y9UA 2IEEA 2LAOA 2ANJA 1UTHB 3DP4A 1Y3PA 1PB7A 4NF5A 2HZKA 4QFKA 3KOTA 1IEJA 1IITA 2GHAA 3SERA 1PBQA 2DYXA 1WDNA 2RF1A 4GL8A 4PQJA 1S9TA 4ZEKA 2Y7IA 1LAGE 2UVGA 1B05A 1MY2A 5KZTA 4IO6A 4LATA 1DMBA 2REJA 4IGRA 4KCDA 2BJJX 4KQPA 2F7BA 3SKPA 3OELA 1RKMA 4GWOA 3C9HA 4F31B 3U94A 3HSTA 4R2BA 5A5XA 2RC9A 1ZBMA 1URGA 3K2DA 3IO6A 5CI5A 5JEIA 5KDTA 1NNTA 1B52A 1B58A 3RPWA 4G77A 4LZ7A 4RK9A 3SDFA 4IB2A 3SESA 4OZ9A 4ZEDA 4U1ZA 1FTKA 1A54A 3M3FA 3KBRA 2HAVA 1GR2A 1B51A 5CBRA 5L9MA 3RUMA 4OFOA 1JW5A 2NWJA 1FCKA 1DPPA 1PC3A 2QJEA 4R9FA 3BFUA 3H6TA 5EYFA 4H5FA 2XX7A 1Q35A 4KHZE 1GTKA 3MZBA 4OWDA 3N5LA 1B7HA 3TODA 4GLIA 1A8EA 2I3WA 4YKKA 2QL3A 2WKYA 3O2AA 3MPLA 4YU0A 3SEYA 1T0KA 1WVJA 1MQGA 4QFNA 1Y3QA 4F3GA 1O63A 4POXA 5L8DA 5TU0A 1SI0A 2Q89A 4GF8A 3VDFA 3T9XB 1I6QA 1FQBA 2QPQA 3R6UA 2VP1A 4R74A 5DEXA 3QK6A 2IA4A 2NVUB 1A8FA 3MP1A 1N7XA 4G68A 1VSOA 3PGFA 5I2NA 5B70A 3FASA 1A99A 5TPAA 1MH3A 3HHFA 5CBSA 4OEVA 4QHQA 1D3KA 3L6GA 1B3FA 2XXVA 4LP2B 3ZKLA 4ELPA 1BP5A 3IJXB 3H6VA 1MPCA 2DSFA 1FQDA 3TQWA 2DP8A 5DVFA 1IZ1A 4WXJA 3FXRA 4NF4A 4LONB 1MXUA 4LZ8A 3I6VA 4NE4A 2ALUA 5TPAB 2XXQA 3K02A 3K4UA 4ONYA 1B0HA 1YPNA 3O6GA 4NTLA 4OXVA 3KSJA 3T9HB 4YB6A 4OFJA 1ZLQA 4GRKA 4L17A 2ZYNA 3KFMA 3SETA 3LSFB 1B40A 4QFLA 2XD2A 2D3IA 2F36A 2Q88A 1USYH 3TDJA 2E1SA 1QJMA 3CSGA 4KI0E 2HFBA 1M5BA 3K6XA 2UYEA 3B7DA 3TYHA 3H7MA 2ABHA 3SEVA 1WODA 3T66A 2CZLA 4OMBA 5H8QA 4GQOA 2DXRA 2H5YA 2O68A 2P0SA 4OFLA 1FQFA 2G29A 4DDDA 3MAMA 4F1VA 4BDLA 5ITPA 4U4SA 2THIA 3Q26A 1URDA 3K01A 2ZNSA 1MY1A 1Y4TA 1B0LA 1B7ZA 3MW0A 2H25A 4OYVA 4JWXA 3DP8A 2FYIA 1LB9A 1ANFA 1MRPA 5DT6A 2F7AA 4MLVA 2ESNA 3OO6A 1II5A 1Y20A 4U22A 5K2YA 3VVDA 3ZSFA 4K3FA 1P99A 3OSRA 1MY4A 2XX9A 2I6EA 5H8FB 1FTLA 5I58A 1AL3A 1Y1ZA 4GFRA 3PUVE 2Z23A 5HPQA 3CG3A 3LUYA 1JQFA 3D4GA 3E3KA 5DVIA 1LSTA 1IXIA 3FVGA 5ISUA 1TT1A 1S50A 3MJNA 3A3CA 3KSXA 4ZECA 3TCHA 3EQ1A 4EUOA 3AXFA 3MUQA 3O6IA 2OZZA 3QUFA 3V8XB 2QS4A 3TCFA 4HCWA 1P1OA 2HEUA 3UK4A 4YKIA 5IAIA 2RCAA 3Q28A 4PFTA 1M5EA 4KFQA 4GIZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PPQA 3R26A 4FIMA 2F5XA 2AIXA 2KQZA 3TZAA 3FVNA 2DS9A 3PUWE 3MVXA 5JTYB 1LFIA 4MCOA 1UTBB 3KG2A 1NH7A 3RT8A 3EPEA 4O3BA 1SW1A 3S4UA 4RPNA 1P1WA 4PC9A 3W9WA 4F3BA 3VXCA 3FZVA 2QS3A 5ET8A 3CFZA 1KA1A 4BDOA 2Q8JA 1R6ZA 3A29A 1MXZA 2PFYA 4H45A 3Q29A 4N6PA 5DVJA 2CZHA 4OESA 2DVCA 1B4ZA 4OHNA 2HXWA 5M2VA 4TOZA 3TTLA 1DSNA 3DELB 3GXAA 2UVJA 4G2ZA 5I59B 5CC2A 1QW0A 2VD3A 1FPBA 1NKXA 2Z22A 4AB5A 4RXLA 1MQJA 3IO4A 2CMOA 1AOVA 3IL1B 3DM0A 3UGWA 4R6HA 1P1NA 3FD3A 4P9KA 2ZNTA 2NUVA 4IO2A 1LAFE 4NF6A 2FA7A 4Z0IA 1FTOA 1OVTA 5CMBA 4F39A 2OWTA 1ZTYA 4MH5A 2O84X 4DI4B 4UACA 1NH8A 4BLAA 3VVFA 3ODBA 2OBGA 3L6HA 4OA4A 5I3SA 3H06B 5EQ7A 1B2HA 4U23A 2I49A 4X9TA 4U4XA 4FE8A 5IKBA 2Y7WA 4GL0A 4P47A 1NL5A 2VD2A 3UP9A 2QMXA 4I62A 5TP9A 3T93B 1FBPA 1QGXA 2XA5A 4NEDA 4LQ2A 3N6UA 2XXIA 2F6PA 4P0GA 4EDPA 3TELA 4NG7A 1NNPA 3V83A 4N13A 1O64A 2ZZVA 2XXUA 2PX1A 2D5WA 3O29A 1P1QA 3B50A 1R9QA 5IM2A 1JW1A 3S9NC 2O7IA 2P3VA 3KC0A 4XKNA 4FEBA 1ZMGA 3G3HA 2F3DA 1B6HA 1N76A 2OWSA 2HAUA 1LCTA 1US5A 4DCYA 1VFDA 5TP9B 1GVCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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