3PV0E

Crystal structure of a pre-translocation state mbp-maltose transporter complex without nucleotide
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGCYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMCAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the maltose transporter in a pretranslocation intermediate state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose transporter subunit; periplasmic-binding component o
molecule tags Transport protein, membrane protein
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3pv0E01
1A54A 4R6HA 4R73A 5CC2A 4MLVA 1SI0A 3TTNA 5CMKA 1H43A 1PEBA 4HW8A 1Y1MA 1DTGA 4ELPA 3C34A 4G2ZA 1N7XA 2XXUA 4OQOA 1L5TA 2ZMBA 4F39A 4NF8B 3UIFA 3K6UA 1LAXA 1XT8A 2RC8A 2Z22A 4C0RA 1USYH 3EHSA 2QS4A 3M3KA 1B6HA 1FQEA 4QF9A 3VLVA 3ZKLA 3Q29A 4KCDA 5CRYA 4FAJA 2O1MA 5HM4B 2QMXA 1UTHA 1SD3A 5KDTB 3KN7A 1P1UA 3SEXA 1B7HA 2I0CA 5F1QA 4EF1A 1SW4A 4TOZA 2ZNTA 3B6WA 4G8NA 2Z8FA 1B51A 1CE2A 3OO8A 4FIMA 4RPOA 1FCKA 4O3AA 3H6WA 4DCXA 1Y9UA 1O7TA 3OXNA 3WAFA 3CI8A 3TPAA 1RYXA 3T9VA 4JWXA 3R7XA 3IOWA 4RK2A 3U72A 1US5A 2NUVA 4YB6A 5L9SA 3HHGA 4X48A 1EH3A 2H98A 5CBSA 4AB6A 2QSXA 1QJMA 3C35A 5JTYB 3LSXA 1JQFA 4EQ7A 1AIVA 1B3EA 1MXZA 3K02A 3QSLA 1B58A 2X7PA 1YAEA 4AQ4A 1MQHA 3B7DA 4G8HA 3QK6A 5ITOA 2XXWA 4NF4B 3T9UA 3OO7A 2D3IA 4YAHX 1HSLA 1A8FA 3Q28A 4NWCA 1OLAA 1DPEA 3WAEA 3S9MC 2OWSA 3LSLA 4YB5A 4YZZA 4F18A 3MQ9A 4M1VA 4QFKA 2VGQA 4EQ9A 1B0LA 1HSEA 2GHAA 3O2AA 3LSWA 3EN3A 3VE1B 3MUQA 3ILTB 4JSDA 3FV1A 1PC3A 3T22A 2O68A 5K2YA 4OVJA 1VSOA 3A09A 3FGSA 1XHYA 5A5XB 3SEUA 1ZKBA 3VFJA 1M5FA 3VV5A 1RYOA 1VFEA 1O63A 2XHDA 3MVYA 1XC1A 1IIWA 1MY3A 5TP9A 2DWIA 4EXLA 3CIJA 1GGGA 3QIMA 3PPNA 4GXAA 5L9OA 3H4ZA 1LBBA 4POXA 4HTGA 4C1TA 2PMSA 4PETA 2XX8A 3CG1A 3MC2A 1N04A 3T9XB 4DXUA 4FORA 1QUKA 2X7QA 4FE8A 2HQ0A 3PPOA 4E0XA 2ZNSA 3HSTA 3CFZA 3O97A 2DVCA 1B1XA 3H06B 4R6YA 1WVJA 5DYHA 2DXRA 3U93A 1B52A 3KFMA 2H99A 5AA4A 3OELA 1MM7A 4ZECA 1S50A 1Y3NA 2OK2A 3DELB 4F1YA 5ICTA 4NTLA 4LONB 2UVIA 3IJXB 4QFNA 3ZKKA 3I5OA 4QFOA 2OLBA 1IXIA 1OVTA 4POWA 4YKIA 1BKAA 3ONMA 2XXXA 4QHQA 3MVZA 3H6UA 1QUIA 2ZYNA 3RNNA 4LZ7A 3KEIA 2XXHA 4PP0A 1B5IA 1P1QA 3T96B 3K6WA 1TFAA 1VR5A 4H6DA 3LR1A 4XIGQ 3RUMA 3K1PA 4OYVA 1FQFA 4N07A 3SKPA 2OCUA 4IO3A 1BIYA 5CM6A 1N0TA 4XTCQ 2DYXA 4DXCA 4DZ1A 3EF7A 3SETA 5AA2D 2Y7RA 4MLQA 3MPKA 2THIA 1IEJA 5H8QA 4IO4A 3K00A 4FJPA 3AXFA 2ZXTA 3HHFA 4OEVA 2QS2A 1PB9A 1N84A 4TLLB 3KJ7A 4RA1A 2OZZA 1UQWA 3FJMA 5FHNA 5B70A 3CRBA 1B3GA 4PQJA 3IOUA 4IGRA 3JV9A 4OFLA 5DT6A 3IL1B 2RINA 4JBZA 3R26A 2ESNA 5CMMA 1MY1A 3PUXE 5AA2A 3K4UA 1DTZA 4Z0IA 4I1DA 5F7VA 1B32A 4U4SA 3EHUA 3K2DA 4ZEKA 4P0GA 2HFBA 4YKJA 1H44A 2XXIA 2I58A 4H5FA 2H4IA 4O3BA 1B1HA 1LFIA 4LQ5A 1JEVA 1B40A 3MBPA 2FNCA 3U94A 1PBPA 5LOMA 2R9JA 1MM6A 4H67A 3O6IA 2NVUB 3IJOB 4JWYA 4XKPA 1NNFA 3RQTA 1JW4A 4OFOA 3KG2A 4G77A 1Q1KA 4DLDA 3K0VA 4MBPA 1FQDA 3KOSA 3ECRA 3RGYA 1AOVA 1SW2A 3TQWA 3FJ7A 2O6AA 3KBRA 3O6GA 3IOVA 3A3UA 1PBQA 1MXVA 3PD9A 3IORA 3UGWA 3FVKA 3QUFA 3TCGA 2R6GE 2Y7PA 2Z8DA 4EF2A 2DE4A 3L6HA 4NF5B 1WODA 1MY0A 2DXYA 1OIBA 1IQ7A 4KQPA 1B46A 4X1BA 1YTVA 5ELVA 4GL0A 5I58B 3W9VA 1LSTA 4LZ5A 3OMBA 4E0WA 5JEIA 3UORA 2I49A 1ZTYA 1BTJA 1MDQA 1IXGA 1B5JA 3DM0A 3G3IA 5ISUA 2AL5A 2Q89A 4GOTA 5I59A 2OWTA 3DP8A 4NEDA 2I4BA 4F1UA 1NMUA 3FXQA 1FTKA 3R6UA 5AA4B 5BUUA 4F1VA 1MDP1 3MVXA 3P7IA 2AYSA 2X26A 5ITPA 2NXOA 5M2VA 4GQOA 5AA3A 4H65A 4JWOA 1SW1A 3TEPA 2F34A 3MP1A 3TODA 2O51A 2QJEA 4GL8A 3FVNA 3O66A 2PX1A 2XD2A 4LATA 4U2RA 3ZSFA 2KLFA 3Q25A 1LB9A 1SI1A 4LZ8A 4IO5A 1FTLA 1XVYA 1ATGA 2H5YA 4Q8RA 2HEUA 1LAHE 3FXUA 4ZE9A 4IY6A 4R2FA 4F3SA 4TLMB 2D21A 3IOTA 2QMWA 3ILUB 3FUZA 3PMXA 3GXAA 4WEPA 2UYEA 4AB5A 3CFXA 2ZYKA 4HS7A 3HV1A 4BDLA 3FD3A 3CR9A 1I6QA 3EHTA 4GD5A 2DWJA 3UN6A 5H8QB 3T9HB 4XKRA 2Q2CA 1S9TA 3H03A 1UIUA 1LGBC 1R9LA 4KFQA 2UVHA 4QSDA 3OO6A 4ELQA 2FA7A 3W15C 3O29A 1MG1A 2I3VA 4F19A 1TT1A 3CVGA 1N3WA 2CZLA 3VXCA 5H8FB 3FVGA 4OHNA 1B0HA 3LBSA 3PUVE 4Z7EA 5TPAA 1FTMA 4F3GA 3SEWA 3PUYE 2GHBA 3IB0A 1LBCA 5AA2B 1SQYA 2CMOA 3C36A 3Q27A 2REGA 4X1DA 2Q9TA 2XXRA 3FXRA 3M3LA 5H8HA 1VFDA 4RNSA 4EQBA 1N7WA 2QS1A 2G29A 3MZBA 1GVCA 3S2VA 1TFDA 2RC9A 5L8DA 4KI0E 2G93A 3U1OA 1Y3PA 4N6PA 1LLSA 4XXUA 4GRKA 3KZGA 1SYIA 1HSJA 4R75A 5DEXA 4WKMA 5H8NA 4BDMA 1ZJLA 2ALUA 3ODBA 3RTWB 5J1DA 4G68C 3TTLA 4GVOA 3RLFE 4BDNA 1DOTA 4GIZA 4OZ9A 3I3VA 5HPQA 4UA8A 4I9DA 1S7YA 3UK4A 2O84X 4BDOA 3G7WA 1M5DA 4R74A 2XXPA 3IAZA 3IX1A 1B9JA 3JYRA 3IR1A 1ZBMA 4F31B 3RT8A 4OMBA 3BFTA 1IXHA 3TTRA 4OEUA 4GF8A 3PGFA 1A99A 2HZKA 2ONKE 3DP4A 1UIVA 3KN8A 3OO9A 2XX7A 3MPLA 4Q5TA 2Y84A 4I8CA 1AH5A 2VD2A 1GV8A 4G8MA 4OERA 5FTIA 4XKNA 4LP2B 3EQ1A 1M5CA 3QYTA 4JXIA 3G3FA 4WXJA 3TFLA 4ESWA 2F97A 2I4CA 2OJTA 4THIA 1FW0A 2Q2AA 4RPNA 4WEDA 5I59B 1N3XA 3OOAA 3MP8A 4R6KA 1SYHA 2OBGA 1H76A 3MW0A 4RK9A 3S4UA 1QULA 4PFWA 1QKBA 2O1LA 3OENA 3RY3A 3Q26A 1NNPA 2H9BA 4P11A 3IO6A 3H6TA 4QFPA 4QRZA 1MRPA 2PYYA 3HN0A 4ZEBA 1N76A 3V89B 1UTHB 2QL3A 1LCFA 4KR5A 4QSEA 1P99A 1RKMA 1P1NA 3M3FA 2RKMA 1I69A 4H8JA 1Y1ZA 3C4MA 4RXLA 5EYFA 3N5LA 4DXBA 4YKKA 2F7BA 2XXTA 2F78A 4ELOA 4OFJA 5DVIA 1OMPA 4U1OA 4IO7A 4NF4A 2PT1A 4F2OA 4YICA 1CB6A 1MPDA 3SERA 3O9PA 1GTKA 4RJZA 4ISUA 4OTEA 1A40A 3C33A 3FIRA 3V5AA 1QVSA 1PB8A 2VD3A 2I48A 1USYE 5CMBA 1TXFA 1MXXA 1IITA 1JETA 3VVFA 1NH8A 4OXVA 5I2NA 2RF1A 5IKBA 4IY5A 1P1OA 4TQUQ 2Q8JA 2F7CA 1IZ1A 2Y7IA 5KCJA 3LC8A 2QPQA 2O7UA 3C9HA 1VE4A 4I62A 4ZE8A 4NMYA 3BKIB 2Z23A 4U1ZA 4F3BA 3PMWA 1MH4A 1OVBA 3HCQA 3V83A 5FHMA 2W7YA 2DS9A 2I3WA 2AL4A 4ONYA 4RY1A 3HO7A 2V25A 1NL5A 3KGCA 4NF6A 2F5XA 2UVJA 2VP1A 2QRYA 3DP6A 1R1NA 4BDQA 2DOJA 2IEEA 3MVWA 1LAFE 2IA4A 2D5WA 2DQVA 5FTHA 4H8IA 3CFLA 5H8HB 4YMAA 4EXKA 1B2HA 4PFTA 3VLWA 2B3BA 3SEVA 4GLIA 2XXQA 4IGTA 4GXSB 2RC7A 2NWJA 2AIXA 2YPNA 1FQCA 2RCBA 3OSRA 3GZGA 2O7IA 5TP9B 3H3GA 1LFGA 2PT2A 5I57A 2XXVA 4LUBA 3E4RA 5H8NB 2B3FA 1Y20A 1MXUA 1NH7A 2B65A 2QS3A 2ZYMA 1MY2A 3CSGA 4F2QA 1SVXB 2YJPA 4NE4A 1Y4CA 3FATA 3SESA 2PBWA 3FASA 2RCAA 4P0IA 4BLAA 3V8XB 2HZLA 3B6TA 2F6PA 4IO6A 2O69A 3W9WA 3K6VA 3PD8A 3TUSA 3G3GA 4Q30B 3G3JA 1Z7NE 3GLBA 3N6TA 1DPPA 1AL3A 1Z7ME 1BLFA 4DE8A 3UA8A 2DSFA 3VLUA 3GBAA 1JVYA 1URSA 3IK6B 1EU8A 2GRVA 1MY4A 2DWHA 4OWDA 3OEMA 1UTBA 3BBRA 4KD5A 2I6EA 3L6GA 1LAGE 1A8EA 2ONSA 1ZMGA 4ZEFA 3E9XA 4MFIA 3S9NC 2HXWA 1MH3A 4U21A 4F22A 3VVEA 2WKYA 3MZ1A 3PUWE 1SBPA 3G3HA 3TCHA 4YU0A 4LA9A 2HAVA 4PFYA 2P1SA 1NNKA 1MXWA 4EUOA 4R2BA 1ZIUA 1JW1A 3O28A 1YCJA 2ZNUA 1URGA 1H3DA 2DE3A 3FZVA 1O64A 1MPCA 3MAMA 1ZLQA 3QUJA 1IXCA 1XOCA 1OQHA 2HAUA 5L9MA 4PFUA 1OQGA 1YPNA 3VVDA 2A5SA 1D3KA 3TTMA 3MWBA 1D4NA 2GFEA 4H1XA 4KYDA 1FQBA 1LCTA 1XS5A 1B7UA 3KSXA 4DIGA 1KWHA 3D4CA 2V3TA 2ONRA 4FATA 4IB2A 1OLCA 1JNFA 4ZEDA 2DP8A 3RPWA 1MQJA 3GBBA 4N13A 3E3KA 1WDNA 4KPTA 2LAOA 4ESXA 2E0SA 4H0WA 5I56A 4LVQA 3KJTA 3PV0E 3PPRA 4KYSA 3N6UA 4ZZAA 1URDA 3TELA 4U23A 3HPIA 5ICQA 5I2NB 1IUDA 1JEUA 1DSNA 3FJGA 4G4PA 3RN8A 2ABHA 1TWYA 5I2KA 1EZOA 1SDXA 1ANFA 4G68A 5KCJB 1AMFA 4YMBA 4XKQA 4H5GA 2VHAA 2UXAA 1NKXA 1QKAA 1PB7A 5HBCA 3U8QA 3VXBA 5H8SA 4ELRA 3USDA 1DMBA 1F9BA 5CBRA 3IO4A 4MH5A 3LUYA 4RYAA 2DVZA 1M5BA 4NF6B 5AE4A 3TZAA 2A5TA 4QFLA 2VOZA 2F7AA 3IB1A 4NF5A 3KSJA 4OETA 1M5EA 1XVXA 1FQAA 3K1NA 1MQDA 3CG3A 5I58A 1I6BA 4FECA 2V3QA 5K2XA 3LSFB 3PPPA 3IB2A 1A7LA 1B5HA 3MZ9A 3PU5A 1US4A 1MQGA 1MPBA 4NF8A 3MP6A 3RT6B 4DCYA 3MJNA 4JDFA 1P1WA 1R6ZA 4JSOA 2H25A 1JVXA 1QUJA 3ZS6A 3JZJA 5I57B 1SW5A 4F29A 3KOTA 3QXMA 2BJJX 2FYIA 1MS7A 3S9LC 1T0KA 2Z8EA 4KYEA 4KHZE 1R9QA 3S9EA 2ANJA 4M4GA 1LB8A 3K6XA 4BDRA 1B4HA 2DWAA 5KDTA 3CSBA 3TTKA 4FEDA 5B7DA 3TAJA 3TKDA 2UVGA 3B6QA 4C1UA 2V3UA 2Y7WA 3C32A 3N26A 4OENA 2ZYOA 4YB7A 5DVFA 4NWDA 1NFTA 3TDJA 4L17A 3O6HA 4PE5B 3OD7A 1NNTA 2V93A 4OESA 4Q0CA 2P2AA 3U92A 1J1NA 1MQIA 4ECFA 1UTBB 2F35A 2E1SA 1QW0A 5JK4A 3SEYA 2R71A 1POY1 5EHMA 3M8UA 5JTYA 4U4XA 1ELJA 3PMVA 3K01A 3QAXA 4YKPA 3G3KA 4R9FA 5I84A 4GFRA 2F8DA 1JW5A 5DVJA 3SDFA 5BWJA 3C31A 4R72A 2V84A 4QSCA 5H8FA 3T93B 1B05A 3TQLA 1B3FA 1PDAA 4IO2A 2Q88A 3TMGA 3I6VA 5AA1A 4ZZEA 3TCFA 5CI5A 1II5A 1GR2A 1MXYA 2XD3A 1FTJA 4FEBA 1H45A 1POTA 4JB7A 3A3CA 1Y4TA 2NOOA 5EHSA 5DTBA 1B3LA 1EZ9A 4ND9A 4KCCA 4ZDMA 1Y3QA 1EZPA 3FVOA 4DDDA 5A5XA 3K1MA 4O3CA 3FV2A 3DLNA 4K3FA 1B7ZA 3PPQA 2XXYA 4GWOA 1B4ZA 5TPAB 2F6GA 2YLNA 4X9TA 2F36A 4F3PA 2PVUA 1D9VA 5I56B 4ZS9A 2M8CA 3THIA 3BFUA 2P0SA 4LQ2A 3UP9A 5CMCA 3N94A 4HCWA 2DE2A 5I2KB 3H7MA 3VDFA 4UACA 4G68B 4EDPA 5KZTA 3OEKA 4U22A 1FTOA 1Q35A 2REJA 2I0BA 2HCAA 3E13X 1A55A 3RTFB 5FHOA 2XX9A 1ZU0A 3PUZE 5DEXB 2UYFA 3KN3A 4MF3A 1LFHA 3TYHA 3D4GA 1BP5A 1B3HA 2Y7KA 2A5TB 1D9YA 4HCYA 3OSQA 3F11A 4R9GA 3H6VA 1I6AA 3T66A 4ZEIA 2GH9A 5IAIA 3EPEA 5TU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ISPA 3E79A 1A54A 1FBEA 4GWUA 4R6HA 4N8YA 4R73A 1LEVA 5CC2A 4MLVA 1SI0A 3TTNA 5CMKA 1H43A 1PEBA 4HW8A 1Y1MA 1DTGA 4ELPA 4N6DA 3C34A 4G2ZA 1N7XA 2XXUA 4OQOA 1L5TA 2ZMBA 4F39A 4NF8B 3UIFA 3K6UA 1LAXA 1XT8A 4I3EA 2RC8A 2Z22A 4C0RA 2FVZA 1USYH 3EHSA 2QS4A 4NQ8A 3M3KA 1B6HA 1FQEA 4QF9A 1NUYA 3VLVA 3ZKLA 3Q29A 4KCDA 3MSTA 4GBWA 5CRYA 4FAJA 2O1MA 5HM4B 2QMXA 1UTHA 1SD3A 5KDTB 3KN7A 3B8BA 1P1UA 4O8MA 3SEXA 1B7HA 2I0CA 5F1QA 4EF1A 1SW4A 4TOZA 2ZNTA 1D9QA 3B6WA 4G8NA 2Z8FA 1B51A 1CE2A 3OO8A 4FIMA 4RPOA 1FCKA 4O3AA 3H6WA 4DCXA 1Y9UA 1O7TA 3OXNA 3WAFA 1NUZA 2HXRA 3CI8A 3TPAA 1RYXA 3T9VA 4JWXA 3R7XA 3IOWA 4RK2A 4XEQA 3U72A 1US5A 2NUVA 3GYYA 4YB6A 5L9SA 3HHGA 4X48A 1EH3A 2H98A 5CBSA 4AB6A 2QSXA 1QJMA 3C35A 5JTYB 3LSXA 1JQFA 4EQ7A 1AIVA 1B3EA 2WBBA 1MXZA 3K02A 3QSLA 1B58A 4KXPA 2X7PA 1YAEA 4AQ4A 5I3SA 1MQHA 3B7DA 4G8HA 3QK6A 5ITOA 2XXWA 4NF4B 1FPIA 3T9UA 3OO7A 2D3IA 4YAHX 1HSLA 1A8FA 3Q28A 4NWCA 1OLAA 1DPEA 3WAEA 3S9MC 4XF5A 2WYKA 2OWSA 3LSLA 1NV0A 2B4MA 4YB5A 4YZZA 4F18A 3MQ9A 4M1VA 4QFKA 2VGQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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