3QSLA

Structure of cae31940 from bordetella bronchiseptica rb50
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
318
structure length
318
Chain Sequence
QKLEKAKVQIAVGGKPLIYYLPLTIAEVKGFFKDEGLDVSIADFAGGSKALQAVVGGSADVVSGAFEHTLSLQAKGQFYRAFALQGRAPMIGVGVSKKNLPGYKGPADLKGRKIGVTAPGSSTNMVVNFFLAKHGLKASDVSFIGVGAGAGAVTALRSGQIDAISNTDPVVSMLETSGDIQIIVDTRTLKDTKEIFGGNMPAGCLYAPQAFVDANPNTAQALTNAIVRADKWIQKAGADEIAKAVPEGYLLGDPAVYKAAIGKSMEGLSPDGVIPEDGAATALKALAAFVPDFDAAKVDPAKAWTNEYTRRANEKYPN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of CAE31940 from Bordetella bronchiseptica RB50
rcsb
molecule keywords Putative exported protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bordetella bronchiseptica
total genus 113
structure length 318
sequence length 318
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13379 NMT1_2 NMT1-like family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qslA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qslA01
1O64A 1JW4A 3OEMA 3KJ7A 1B2HA 2DQVA 3A3UA 2VHAA 5FHMA 1IXGA 3TYHA 1EZOA 3OOAA 4QFPA 5H8HA 4R2FA 3CIJA 2P1SA 4KYEA 4ELOA 1DOTA 2PT1A 4R73A 4EF2A 1MY0A 4LP2B 4OHNA 3GXAA 1A8EA 2V84A 4ZS9A 3TCFA 4NF5A 1RKMA 3PUVE 2QS1A 4X1BA 3FXUA 3D4GA 3PUXE 1HSEA 1B7UA 2F78A 1N04A 2ESNA 4BLAA 2HZKA 3UGWA 2REGA 1MY4A 4GL8A 3ZSFA 4F3PA 1QKBA 4MLVA 5AA4B 1JETA 2I6EA 5CBRA 4QFOA 4WEDA 2M8CA 2F35A 2Q9TA 3FXQA 5JK4A 1LAFE 5AA2A 1M5DA 4NEDA 3OENA 4GXSB 4BDMA 2ZXTA 4R9GA 4EQ9A 3A3CA 4YKIA 3S9NC 5CRYA 2B65A 3FD3A 4F1YA 1B3HA 1IIWA 2X7PA 1EH3A 4NTLA 3TELA 4Q0CA 4QFNA 2Z23A 4EDPA 4THIA 3P7IA 4F39A 3MW0A 4O3AA 1US4A 4YAHX 5TP9B 1MPBA 3PV0E 2XXRA 1B5IA 3KG2A 3W9WA 4IO4A 3QUFA 1I6AA 3IO6A 5TPAA 4OVJA 4TLMB 2DWAA 5H8QB 3QYTA 5DVFA 1M5BA 3N94A 1N76A 3G3JA 3WAEA 5H8FB 1LFIA 3KEIA 2XXXA 1ZIUA 4XKQA 3TCHA 2QS4A 4DXUA 5I59B 3C35A 3OO9A 1L5TA 5I2NA 3U94A 4WXJA 1OVTA 2RCBA 2CZLA 1MXWA 4RPOA 4R75A 3QSLA 4HTGA 3SERA 1P1UA 3PPPA 1NH8A 1B3EA 1UTBA 1M5FA 2HZLA 4QSCA 4PFTA 3MZ9A 2NVUB 3CI8A 2QPQA 1CE2A 3OO8A 1MDP1 1FQFA 2HAUA 1HSLA 1MRPA 3T9VA 2GH9A 3M3FA 4GD5A 3HN0A 1VSOA 3EF7A 2ZYOA 2Y7PA 2O6AA 4XTCQ 1PB9A 1POY1 1PBQA 4LQ2A 2KLFA 3G3KA 4JWOA 2RF1A 3Q29A 3QUJA 1DPPA 5FHOA 4ONYA 1H45A 4NWCA 1ELJA 5FHNA 4OENA 2R9JA 2ZNUA 3UN6A 4E0XA 4OFLA 4GLIA 1WVJA 1S7YA 2ZYNA 3VLVA 1FTMA 3E13X 4JB7A 1IXIA 4LONB 5DT6A 3DM0A 4LATA 2QS3A 4FE8A 1MXXA 1R6ZA 1N7WA 3O6IA 2DOJA 1JEVA 3H6UA 5H8NA 4C1UA 3ODBA 3O9PA 1ZTYA 3LUYA 3ZKKA 5CM6A 1JQFA 4P0GA 2Z8FA 3I6VA 3PPOA 2AYSA 3KSJA 4BDRA 3UP9A 3H7MA 3O28A 4FJPA 2BJJX 2HQ0A 3E3KA 3PUWE 5LOMA 4DDDA 1USYE 4F3BA 3MAMA 1POTA 3RLFE 5DEXB 2F7CA 4Q30B 1BLFA 4JBZA 4R72A 1QW0A 5ITPA 4YKJA 1B6HA 3V5AA 5KZTA 4DLDA 1A99A 2DE3A 3TQLA 1N0TA 3KSXA 1B0LA 2ABHA 1MXVA 5H8SA 1JW5A 2LAOA 4OWDA 3USDA 2DE2A 3VE1B 1ATGA 4F18A 2GHAA 3IB0A 3LBSA 3MP6A 3TCGA 2QMXA 3H06B 4ELRA 2Z8EA 1RYOA 2ONRA 3UIFA 2PMSA 2XXHA 5CMMA 2XXTA 1VR5A 1QVSA 4YB5A 4RA1A 3CFZA 3HV1A 3IK6B 3K00A 4MH5A 2ZNTA 3DELB 5AA4A 4F3SA 4ZEFA 4ZZAA 3RTWB 3FV1A 3TMGA 3S9EA 1YCJA 4JSDA 5BWJA 4EXKA 3RY3A 2GHBA 3LSLA 3CR9A 2F34A 3HSTA 2YPNA 1Q35A 3RGYA 4NF6B 4H8JA 3R7XA 1P1NA 1P1WA 1DMBA 2O1LA 4GWOA 2DXYA 2B3FA 4Z0IA 4E0WA 2O68A 3TTMA 3R26A 2V3QA 1DTGA 3EPEA 3O6HA 3BFUA 4F3GA 2XX7A 5CMKA 5CBSA 1B52A 1NKXA 2F97A 1LCFA 3U8QA 5A5XA 4MBPA 3H03A 5EYFA 3C34A 2A5SA 3M8UA 4JWYA 4NE4A 4G77A 3KZGA 1QKAA 4RXLA 1SDXA 1GTKA 2V93A 5I2KB 3UA8A 3IJXB 1B1HA 4ESWA 3QIMA 4PE5B 1B32A 4GVOA 3UK4A 4DCXA 3TUSA 2V3UA 3JZJA 5HBCA 1ZKBA 2IA4A 3T96B 1T0KA 1TXFA 2QSXA 3C33A 3S9LC 4F19A 2XD2A 2Z8DA 3TTLA 3HPIA 3IORA 1GGGA 1II5A 2XXIA 2F7BA 4N13A 3IB1A 3FJMA 2THIA 3MZ1A 1J1NA 3TEPA 4I62A 2Y7KA 4ZEKA 3AXFA 1XVYA 1NNFA 3S2VA 5FTHA 3VXBA 2V25A 2IEEA 1P99A 3TAJA 1A54A 2NWJA 3MJNA 1A8FA 2H9BA 4N07A 4YB7A 1TFDA 3FVKA 4F22A 1IXCA 1FQBA 2HFBA 2W7YA 4JWXA 3KJTA 1PC3A 3MZBA 3K0VA 4AB5A 3Q26A 2D3IA 3MP8A 3K6XA 1LB9A 4G68B 4ELPA 3U72A 1NH7A 4HW8A 1MXZA 2B3BA 3FV2A 4F29A 2QRYA 4NF8B 3PUZE 1MXYA 3TKDA 2XXYA 5JTYB 5M2VA 3PUYE 3CFXA 3JYRA 2VD2A 4X1DA 4KI0E 3M3KA 3T22A 4PETA 1B5HA 4LUBA 3K6UA 4O3CA 5DEXA 1IQ7A 3KN8A 4QSEA 1JW1A 3V83A 1BKAA 1MQDA 4Q5TA 3MVWA 1Z7ME 3KFMA 2F5XA 4G4PA 3FJGA 3Q28A 4AQ4A 4H5FA 3EHUA 3C9HA 3PU5A 4QSDA 2RKMA 1NNKA 4TOZA 1SW1A 1UIUA 4G68C 5KDTA 5IKBA 1PB7A 2Y7IA 2H4IA 4KYSA 1PEBA 3FIRA 4M1VA 2DVZA 2P2AA 4UA8A 1AL3A 5I56A 4KHZE 2UVGA 4FATA 2HAVA 3IOUA 4YU0A 2DWHA 2DP8A 2I48A 2A5TB 4GFRA 3O29A 1LFGA 3MWBA 3M3LA 4NF6A 4GIZA 1B51A 4EF1A 3CVGA 4OTEA 3CSBA 1HSJA 1B7ZA 3SEXA 2AL5A 3MUQA 1S9TA 3SESA 4OESA 4JSOA 3VLWA 4POWA 4IO6A 4L17A 3VVDA 1S50A 4LZ5A 3MVYA 3SEVA 2PT2A 3SETA 2PBWA 4MLQA 3OD7A 4IY6A 3VV5A 5AA2D 1Y9UA 1OQGA 3E4RA 4ZEIA 4F1VA 2I0CA 1SI1A 2OJTA 4NF4B 4F2QA 3IB2A 4DCYA 2E0SA 1IITA 2XXPA 4ZE8A 1B58A 2UYFA 4FAJA 5I2KA 3HHFA 3K1MA 3S4UA 3FUZA 4M4GA 3FJ7A 3GBBA 4HS7A 3TZAA 3VDFA 3I3VA 4YZZA 3RN8A 3MVZA 4R6HA 3PPQA 1BIYA 5IAIA 3MVXA 2UVIA 2OZZA 2DE4A 4IGTA 1FTJA 4PFYA 3IJOB 4LVQA 1EZPA 4P0IA 4NWDA 3C36A 1LSTA 1FTKA 1B46A 4LZ8A 2DVCA 5I84A 4IO2A 4BDQA 2D5WA 5F7VA 1B3LA 1MY1A 2OLBA 1YPNA 2Q2CA 3L6HA 4PQJA 4EQBA 1I6QA 4OMBA 5H8HB 3B6QA 4OFOA 4YKKA 2AL4A 1MH4A 3RQTA 1VFEA 1LBBA 4H65A 1USYH 5B7DA 5DVIA 3CG1A 1Y4TA 4NF5B 3G7WA 4OEUA 4RY1A 4U4SA 1B9JA 2QMWA 3T9XB 1FQEA 2Y7RA 3TDJA 3LSFB 4GOTA 5ITOA 1B4HA 1TFAA 3FATA 4G2ZA 1IUDA 3PGFA 4QFLA 2F36A 2H25A 3VLUA 3KN3A 4G68A 1D9YA 3LR1A 3OO6A 3W9VA 4ZE9A 4ZEBA 4X48A 1R1NA 3V89B 1Y1ZA 2UVHA 1UIVA 1Q1KA 3KOTA 5AA2B 1MS7A 5JTYA 1MY2A 2NUVA 2Q89A 5ICTA 2CMOA 2ALUA 2XXVA 1AH5A 1VFDA 1B3GA 1NFTA 1N3WA 3IL1B 3K6VA 3G3IA 2ANJA 3LC8A 3RT6B 4RJZA 2XXQA 3PPNA 5AA1A 3K6WA 1SYHA 3VVEA 2H5YA 3EQ1A 1D3KA 1EU8A 3MPKA 2UVJA 2Q88A 4H5GA 5EHMA 2I58A 1F9BA 4P11A 4OXVA 3DP8A 3ECRA 3RNNA 5KCJB 4QF9A 4MFIA 4IO5A 4YMBA 3K4UA 4FORA 4DXBA 4ISUA 3KN7A 3FVOA 3RTFB 3L6GA 3FXRA 3R6UA 1FCKA 1MPDA 3HCQA 4WEPA 4XXUA 3N26A 4ZECA 4KD5A 1AIVA 1BTJA 5TP9A 3G3GA 4GRKA 4OQOA 1MPCA 4RK9A 2FNCA 1XOCA 4GXAA 2A5TA 3OMBA 5I58B 4Z7EA 5H8QA 3IOWA 5H8FA 4O3BA 1LFHA 3C32A 4OETA 2I49A 3H3GA 1UTBB 1MM7A 1OMPA 5I59A 2H99A 1YAEA 3OXNA 3BKIB 1NL5A 5CMCA 1URDA 3N6TA 1Y20A 3MBPA 4U4XA 4IY5A 4RYAA 1URGA 1SI0A 2O7UA 1SD3A 4F31B 3H6VA 2I3WA 3ONMA 5K2XA 2DWJA 5AE4A 4RK2A 1A7LA 2RC7A 3QXMA 3CSGA 2R71A 2GFEA 2OWTA 4QRZA 3PPRA 1DTZA 1AOVA 2P0SA 2XHDA 1US5A 4DXCA 1M5EA 1B1XA 1Y4CA 4IO3A 2H98A 4EQ7A 1NNTA 4FEBA 1LCTA 2DXRA 1LAXA 1FTOA 3JV9A 5CC2A 3TTNA 2E1SA 4U21A 1QUJA 1FTLA 1B3FA 3N5LA 2AIXA 1MM6A 1OLCA 1SBPA 5H8NB 3MQ9A 1O63A 4EUOA 4DE8A 1H76A 4KCDA 3FASA 2QS2A 4OZ9A 4GQOA 4RPNA 3FGSA 2OBGA 5EHSA 3LSWA 3PMXA 4OERA 4HCYA 3CFLA 3KOSA 3TQWA 5L8DA 4ECFA 1DSNA 2Y7WA 4GF8A 3BFTA 1D4NA 2RC9A 3FZVA 1Z7NE 1H3DA 1B4ZA 2XXWA 4U23A 1XHYA 4KQPA 3G3HA 2OCUA 1IEJA 1PB8A 2YJPA 1FQAA 3B7DA 3I5OA 1WDNA 3IOTA 3N6UA 1XS5A 1JVXA 4G8MA 4ND9A 1B7HA 3QAXA 3Q27A 3OSQA 4IGRA 3IX1A 3U92A 4R6KA 2O51A 4GL0A 4ZZEA 3V8XB 4R6YA 4H0WA 1MY3A 4XIGQ 2F6PA 1NNPA 1TT1A 1FQDA 1LAGE 1YTVA 3T9UA 4U22A 2OK2A 1MQIA 4XKNA 1UQWA 3BBRA 2ZYKA 1P1QA 3GBAA 2GRVA 1XT8A 4NMYA 1AMFA 1MQJA 3ZS6A 4I1DA 3SEUA 1JEUA 3T93B 1MG1A 2UYEA 4FEDA 2PYYA 3IR1A 4H8IA 5HM4B 1B05A 3OSRA 1SW4A 2X26A 3RPWA 3SDFA 4LA9A 3K2DA 1R9QA 2HXWA 2O1MA 5ELVA 3TFLA 2Y84A 5KCJA 5A5XB 2DS9A 2FYIA 3ILTB 3TODA 5BUUA 1H43A 2I3VA 3EN3A 5B70A 2O84X 3IOVA 3OEKA 4R74A 5L9SA 2REJA 4U1ZA 4ESXA 1A55A 3O97A 3O6GA 4XKPA 2WKYA 5I58A 4H6DA 3O2AA 1VE4A 1SQYA 4I9DA 2HEUA 4BDNA 5I57B 3PMVA 1GR2A 1I6BA 1Y3PA 3B6TA 2ZNSA 1PBPA 2G29A 1Y1MA 1IZ1A 4G8HA 3O66A 1UTHB 3LSXA 4WKMA 2ZMBA 2F7AA 4POXA 2YLNA 3VXCA 1DPEA 3RUMA 2DYXA 2Z22A 4JDFA 4KPTA 3W15C 1OVBA 2X7QA 2Q2AA 2ZYMA 5HPQA 3K01A 3S9MC 3T66A 1TWYA 3OO7A 3VFJA 3RT8A 4LQ5A 3WAFA 1GV8A 1N84A 1SYIA 2XX8A 3DLNA 3GZGA 3GLBA 3IO4A 4KR5A 1IXHA 3PD8A 4U2RA 5CMBA 2ONKE 3EHTA 4X9TA 2QL3A 1QULA 4MF3A 1MQGA 1NMUA 1Y3QA 4TLLB 4YB6A 1ZMGA 4YICA 1R9LA 2RCAA 3FVNA 1OQHA 4N6PA 2VP1A 5JEIA 4ZDMA 3K1PA 4ELQA 1H44A 4OYVA 4DZ1A 3K02A 1OIBA 1QUIA 1B5JA 3SEWA 2G93A 1FW0A 4KYDA 3PMWA 4C1TA 1ANFA 3PD9A 3ZKLA 5ISUA 4UACA 2ONSA 4F1UA 4NF8A 3EHSA 3TTRA 1LAHE 2XX9A 4R9FA 1XC1A 1O7TA 5TU0A 3T9HB 2I0BA 4OEVA 1D9VA 4ZEDA 4YMAA 3H4ZA 5J1DA 1LB8A 3U93A 4TQUQ 5KDTB 2XD3A 4R2BA 4IB2A 2I4CA 1QUKA 3KBRA 2XXUA 3HO7A 4KFQA 2VGQA 4PFWA 4K3FA 1ZJLA 1MH3A 2F6GA 5I56B 1WODA 3DP4A 1QJMA 4RNSA 1ZBMA 3H6WA 1A40A 5TPAB 3DP6A 4F2OA 1P1OA 4H1XA 2O7IA 3SKPA 3THIA 1XVXA 3SEYA 5ICQA 2NOOA 5AA3A 3IAZA 2UXAA 2RINA 3MPLA 4QHQA 1MQHA 4KCCA 4PP0A 1N3XA 2D21A 1URSA 2RC8A 3U1OA 5I2NB 2OWSA 2V3TA 3CRBA 1MXUA 1PDAA 2PVUA 3MP1A 1ZLQA 2DWIA 3OELA 1MDQA 1B40A 1M5CA 3MC2A 3Q25A 4PFUA 2HCAA 5L9OA 1JVYA 2O69A 4H67A 4BDOA 5DYHA 1FQCA 1SW5A 3KGCA 3TPAA 4EXLA 3C4MA 4Q8RA 3TTKA 1BP5A 5K2YA 1ZU0A 5L9MA 5DVJA 4C0RA 3UORA 5F1QA 4QFKA 1RYXA 2QJEA 3ILUB 4BDLA 1GVCA 1LGBC 1SVXB 3A09A 4XKRA 1KWHA 2DSFA 1JNFA 1EZ9A 3H6TA 4IO7A 5DTBA 3F11A 3VVFA 4NF4A 3B6WA 2R6GE 5I57A 2FA7A 2VD3A 4I8CA 1LLSA 4AB6A 4JXIA 2F8DA 1N7XA 5FTIA 3QK6A 4YKPA 3C31A 4G8NA 1OLAA 2I4BA 4OFJA 1UTHA 3HHGA 1I69A 1Y3NA 2Q8JA 4HCWA 1CB6A 5CI5A 3CG3A 4FECA 4U1OA 3FVGA 3D4CA 1LBCA 1B0HA 3K1NA 2VOZA 2NXOA 2PX1A 4DIGA 4FIMA 3G3FA 3E9XA 4LZ7A 1SW2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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