3QXMA

Crystal structure of human gluk2 ligand-binding core in complex with novel marine-derived toxins, neodysiherbaine a
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
250
structure length
250
Chain Sequence
RSLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, kainate 2
molecule tags Membrane protein
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 250
sequence length 250
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qxmA02
1GGGA 4MF3A 2XD2A 5CMCA 5BWJA 1P1OA 4G68C 4HW8A 3KBRA 1YPNA 4EQ9A 1IZ1A 3U92A 4XKPA 4NWDA 2GHAA 2DOJA 2DVCA 1LCTA 3MBPA 3O2AA 4WKMA 4KD5A 4RPOA 4H0WA 3OELA 2HAUA 3OEKA 3MZ1A 3A09A 4NF8B 1FTOA 1US4A 5H8QB 5CMBA 3N6UA 1JVXA 3LR1A 5EHMA 3CVGA 5JTYB 1B32A 4PFWA 4DXUA 3LBSA 4TOZA 2A5TA 5I57B 3RN8A 1O63A 4BDNA 3KN8A 4H8JA 3IR1A 4KI0E 3S9EA 1A54A 4X48A 4E0XA 4LP2B 3K6VA 2PT2A 3FIRA 4OMBA 3C34A 3TPAA 1SBPA 5H8SA 3VDFA 5A5XB 3IOTA 4NWCA 4XKNA 5FHNA 4OHNA 1N0TA 3S9LC 2B3FA 3EHTA 3KSXA 4RNSA 1A8FA 2H25A 4OQOA 4BLAA 1B1HA 3MW0A 4UACA 3W9WA 1XOCA 4R9FA 3LSFB 1D3KA 5AA2A 2BJJX 3K1NA 1UTHA 3CG1A 5F1QA 1IEJA 4YAHX 3JYRA 1SVXB 3UK4A 4OXVA 1F9BA 4MFIA 4U4SA 4F2OA 1B52A 3N6TA 1LAHE 2HEUA 2RC9A 1OQGA 2XX7A 3OEMA 2M8CA 1LGBC 1GTKA 1LB8A 1GVCA 1XVYA 1MPCA 1JNFA 1MXYA 1TWYA 2RINA 4OFOA 1D4NA 3ILTB 1OMPA 2YPNA 3SEXA 2DXYA 2I4BA 1XT8A 3L6HA 4ZEDA 3A3CA 4KR5A 2R9JA 3H3GA 4BDLA 2FA7A 1Q1KA 3KG2A 1IITA 1B5HA 1JW4A 3PUYE 4G77A 1KWHA 4XIGQ 4U2RA 2PBWA 1M5BA 2Q9TA 3FXRA 3Q26A 2Q2CA 1B7HA 3V83A 2Z8EA 1B3GA 5H8FB 4TLLB 5L9MA 5AA4A 4NF6B 2OK2A 3ZKKA 4C0RA 1EZOA 4BDQA 4AB5A 3K00A 2F8DA 1CB6A 4BDMA 4MBPA 3B6TA 3TELA 4U21A 3U72A 5I2NA 1IXCA 4Z7EA 1FQAA 2CMOA 4QFLA 1QKAA 4G68B 5CMMA 4H6DA 4ECFA 2XXXA 4LZ7A 2FYIA 5I2KA 4YU0A 3T66A 3UORA 3GBAA 3T22A 2HZLA 1O64A 4AQ4A 4LZ8A 1N76A 3FJGA 2ZNTA 3PD8A 4QSEA 4OEUA 1N3WA 4M4GA 2GH9A 1JEVA 2RCBA 4PFYA 3SERA 1ZKBA 4O3BA 3G3KA 3OOAA 4M1VA 3Q29A 4ZEKA 3V5AA 2QPQA 4RYAA 4HCYA 4R2FA 4QRZA 3IORA 1AOVA 3KZGA 3LSWA 1MM6A 3H6UA 3FXUA 4N13A 1QJMA 2XXHA 1URGA 1ZIUA 2F7CA 3BBRA 1FQCA 4JB7A 3MVZA 3W9VA 3G3GA 2VD2A 1B3FA 2ONKE 4RA1A 3MC2A 3RQTA 1MS7A 3AXFA 1ZMGA 2ABHA 4RPNA 4XKQA 3IB0A 4IO3A 3MP1A 3T9HB 5I58B 4R9GA 3C35A 2RC7A 2AL5A 5KZTA 2O68A 4IO5A 3E3KA 3FVKA 1B4HA 2V3TA 3DP8A 4RJZA 1LLSA 4PETA 2OJTA 2DWIA 1B1XA 5ITOA 3UN6A 3K0VA 5DVIA 1UTBA 2REGA 5L8DA 2DP8A 5HPQA 3OD7A 3IB1A 3R7XA 2THIA 3FV2A 3K6XA 3TCGA 3B6QA 1B0LA 5FTIA 2X7QA 4P0GA 2Y7KA 4QHQA 3VLUA 3MP6A 4GRKA 2I58A 1II5A 3ZKLA 3TDJA 1ZBMA 4I8CA 2R6GE 3M3FA 1FTJA 1N7WA 5HM4B 1PEBA 2UYEA 1EZPA 1MH3A 4EUOA 4H5GA 4GVOA 4KYSA 1IXGA 4NF8A 4WEPA 4R75A 3OO6A 5H8QA 3FVNA 4UA8A 5TP9B 5JTYA 3PUVE 2WKYA 4RXLA 1SDXA 2PT1A 1B3HA 4THIA 5I57A 1MQGA 3OO9A 4IGRA 4JSOA 1FQBA 2XD3A 1IUDA 4Z0IA 1MQDA 3OSQA 3CG3A 4RK9A 2PMSA 4QSDA 3SETA 1MPDA 5A5XA 2XXRA 1B7UA 1MG1A 5AE4A 1BLFA 3FVGA 2ANJA 3M3KA 3G3JA 2HXWA 4DIGA 1Y4TA 3KEIA 2P2AA 1AL3A 2OBGA 1URDA 3JZJA 3O9PA 3K4UA 2ZYKA 4Q30B 3IB2A 5H8HB 5IAIA 2AL4A 5AA3A 4G8NA 3BFUA 3QSLA 5FHOA 4GOTA 1RKMA 1PBPA 4F2QA 4Q5TA 2PVUA 3QYTA 1FTKA 1B2HA 2XXWA 5I56A 5ELVA 5K2YA 3E9XA 3TYHA 4H1XA 1MY0A 1QUIA 3Q25A 1BIYA 4FJPA 4DXCA 5CMKA 3TCHA 4HCWA 2P0SA 4R73A 1NNKA 3D4CA 1QW0A 2HQ0A 2QSXA 3TTRA 2F35A 3H4ZA 5EYFA 3MZ9A 2H5YA 4IB2A 3O6IA 3H6WA 4POWA 1M5DA 1DTZA 1PDAA 2Q8JA 3TTMA 4F1YA 1LBBA 1MXXA 2QRYA 1Z7ME 4NF4B 2Q88A 2F36A 3PGFA 4YB5A 4N6PA 1I6AA 2O51A 3PPPA 3K01A 2QS2A 4QFNA 1AIVA 4EF2A 4ZZEA 3C31A 3F11A 4DCXA 1OVBA 4TLMB 2DE2A 3N26A 2HCAA 2VHAA 1I6BA 1JEUA 2O7IA 3A3UA 4DLDA 2H4IA 2O69A 4F22A 1J1NA 2HZKA 3MVWA 1LAGE 2D3IA 1JW5A 3ECRA 3N5LA 5I56B 1YCJA 4GLIA 4ELOA 1WVJA 1SQYA 4KFQA 4R6KA 1QVSA 3RLFE 3VV5A 1R9LA 5H8FA 5IKBA 4XTCQ 3VVDA 4F3GA 2ZNSA 4NF6A 4JSDA 1ATGA 1MQJA 4YICA 3V89B 2AIXA 4F3PA 1Z7NE 1S50A 2I0BA 4H67A 2F5XA 3SESA 1B6HA 3KJTA 2DVZA 4ELPA 1NL5A 1YAEA 1H44A 3FXQA 4X1BA 1USYE 3FATA 4F19A 3TFLA 4YKPA 4FEDA 2REJA 1HSEA 4QSCA 4YKKA 3QAXA 3GXAA 3EPEA 1R1NA 1MM7A 4EXKA 4G68A 4GL8A 3C33A 3MQ9A 3MWBA 3RNNA 2XHDA 1OVTA 4DCYA 1GR2A 3O6HA 4LZ5A 2F6GA 3TTNA 4DZ1A 2I3WA 1A40A 3L6GA 5TPAA 1B5IA 3DLNA 1SD3A 4F1UA 3MP8A 5JEIA 3IO4A 4IO7A 4KPTA 1DPPA 1EZ9A 5B7DA 4ZECA 4QF9A 4FAJA 1B7ZA 1NNFA 4YZZA 3PUZE 1ZU0A 1MY3A 1LAXA 2O1LA 1FQFA 1OLCA 1AMFA 2UVIA 4LA9A 3FASA 1S7YA 2GHBA 1LFIA 4ND9A 1M5EA 1VR5A 3C32A 3T96B 1B3EA 3HPIA 5CBSA 4OESA 1POTA 4ZEIA 3PMXA 4NTLA 4XKRA 1A99A 1N3XA 3IOUA 2OWTA 1UIUA 3UIFA 1O7TA 4OZ9A 2Z23A 2I6EA 3E4RA 4ZDMA 1FCKA 3HCQA 2O7UA 2OCUA 2DS9A 2F97A 3B6WA 2O1MA 4F18A 1QUKA 1TFAA 3PPQA 1H76A 5I58A 1BKAA 3LUYA 2QS4A 2I4CA 5BUUA 5TPAB 1P1NA 3O28A 2VP1A 3TODA 4KYEA 5I59A 3QK6A 4GXSB 3IO6A 4ESXA 3DM0A 1Y3NA 3OXNA 4GFRA 4G4PA 3KOSA 3PUXE 1VFDA 5H8NB 4AB6A 4KYDA 2D21A 3LSLA 4LQ5A 3QIMA 4R72A 2XX8A 1PB9A 1HSJA 1XVXA 3K1PA 1Q35A 3FJMA 4GL0A 3T93B 3PPNA 2QMXA 1USYH 4NEDA 3TQWA 1US5A 4JWOA 4YKJA 1OLAA 3B7DA 1OQHA 1MXZA 1SI0A 4ONYA 4IO2A 3IJXB 2P1SA 4JWYA 5TP9A 4WXJA 3ILUB 3RGYA 3THIA 2DYXA 3MPLA 3N94A 4IY6A 3R26A 1SYHA 1MY4A 1B5JA 2I48A 3LSXA 3RY3A 1Y20A 1A7LA 1MPBA 3QUJA 3EHUA 2Z8FA 4HTGA 4ZEBA 3V8XB 3C4MA 3WAEA 5KCJA 1JQFA 2XXYA 3CFZA 4TQUQ 4FEBA 1BP5A 4IGTA 5CM6A 3TZAA 4F31B 3SEUA 4G2ZA 5I59B 1S9TA 4YMBA 1DMBA 4U1OA 4E0WA 3U1OA 4BDRA 1MXUA 3CSGA 1M5CA 4GD5A 4H5FA 5LOMA 2H98A 4OEVA 4ELRA 1Y4CA 4C1UA 5ICQA 2O84X 1A8EA 1MXWA 2PYYA 1MY2A 3T9XB 3O97A 1ELJA 1ZTYA 3DELB 2F6PA 3LC8A 2Y84A 5H8HA 4FECA 4DXBA 1NKXA 4P0IA 4O3CA 1P99A 3TAJA 1N04A 4F39A 1MQHA 2Y7PA 3CFLA 3EQ1A 4H65A 2V25A 3KN3A 4MH5A 2DE4A 3TQLA 4C1TA 3PV0E 1H43A 2Q89A 1NH8A 4ZE8A 4ZZAA 3CIJA 3Q28A 1FW0A 3H7MA 4O3AA 2G93A 4U4XA 1ANFA 4PFUA 1P1QA 3Q27A 4IY5A 1PB8A 2F7AA 3O66A 1A55A 1HSLA 2DE3A 3U8QA 5KCJB 4I1DA 3ZSFA 3MUQA 2F7BA 3KN7A 3IL1B 1B46A 4OTEA 1XS5A 3IX1A 3MJNA 2RCAA 1D9VA 4NF4A 1NFTA 3VVFA 3D4GA 3KFMA 3R6UA 4FE8A 3S2VA 4R6YA 3SKPA 4FIMA 3UGWA 3GBBA 3CI8A 4JDFA 4NMYA 3VLWA 2UVHA 2B3BA 2ONRA 3OSRA 1I6QA 1VSOA 1NNPA 4L17A 1DTGA 2UVJA 3K6WA 2X7PA 4JBZA 1NH7A 3CFXA 2QL3A 1GV8A 4MLQA 1PBQA 3K1MA 2DQVA 3H6TA 4X1DA 2RF1A 4LQ2A 2UXAA 1PC3A 4MLVA 4U1ZA 4K3FA 3O29A 1LCFA 2XXVA 1T0KA 3I5OA 1YTVA 3S4UA 2I0CA 3RT6B 4KCCA 3G3HA 4OETA 4OWDA 3VXBA 4EQ7A 3GZGA 1Y9UA 3PMVA 2O6AA 3FGSA 3FV1A 5EHSA 1P1UA 2R71A 3G3FA 4OYVA 3PPRA 1VFEA 3HSTA 4ISUA 4EDPA 2H99A 5DVJA 4NF5B 1B4ZA 3S9NC 4GQOA 4PP0A 5AA1A 3K02A 2FNCA 2VGQA 1M5FA 3ODBA 5DEXA 4KQPA 1IQ7A 1R9QA 4Q8RA 1FTLA 2VOZA 3M3LA 1MQIA 4GF8A 3EHSA 1RYXA 1ZJLA 1B3LA 4KHZE 3FD3A 4YKIA 2DWJA 1FQDA 1B9JA 1I69A 1ZLQA 5B70A 1MXVA 1DOTA 1EH3A 1R6ZA 3TTKA 3OMBA 4LONB 4F1VA 2G29A 3FZVA 1B0HA 2GFEA 3UP9A 3C9HA 3H03A 2QMWA 2OLBA 2Z22A 2NVUB 4ZE9A 3IOVA 2A5TB 2DWHA 1MDP1 3RT8A 4N07A 2PX1A 3I3VA 2XXTA 3HHGA 2ESNA 4DE8A 3O6GA 1AH5A 3PUWE 3VXCA 4IO6A 1DSNA 2B65A 3TTLA 1SW1A 5DEXB 4R2BA 3MVYA 5L9OA 3IAZA 1WDNA 3TEPA 1LFGA 2NOOA 2RC8A 1MH4A 4YB7A 2V3QA 1MY1A 2Q2AA 5CBRA 5FHMA 2IA4A 1NMUA 2E0SA 2ZXTA 5JK4A 1NNTA 2RKMA 4X9TA 1LFHA 2ZMBA 1XHYA 2ONSA 5J1DA 1JVYA 2GRVA 1IIWA 1IXHA 4PQJA 2UYFA 5H8NA 3GLBA 2QJEA 2XXUA 3MAMA 2NXOA 5DTBA 1B40A 5AA2B 5ITPA 4H8IA 3FJ7A 4JWXA 1UTHB 3ZS6A 4OFLA 5AA2D 4OVJA 2W7YA 1IXIA 5CC2A 2DSFA 1MRPA 5FTHA 3OO7A 2IEEA 4R6HA 2F78A 5TU0A 1TXFA 2ALUA 4LATA 3OENA 4QFKA 4F29A 1LB9A 1TFDA 3EN3A 1UQWA 5L9SA 4ZS9A 2Y7WA 5F7VA 2OZZA 1BTJA 1EU8A 1SYIA 2YJPA 3HO7A 4EXLA 3IOWA 2DWAA 3IJOB 4OENA 1LAFE 5DVFA 3KOTA 4PE5B 5M2VA 1Y1ZA 4G8HA 1RYOA 1UIVA 2XX9A 3MZBA 3E13X 4POXA 1FTMA 4BDOA 3CR9A 1TT1A 4GWOA 1LBCA 4JXIA 2I49A 1SW2A 1JW1A 2Y7IA 3FVOA 4HS7A 4ZEFA 3WAFA 4EF1A 4I9DA 4LVQA 3W15C 5CRYA 2H9BA 2ZYNA 1H3DA 3G7WA 3BFTA 2OWSA 2YLNA 4QFPA 2V3UA 5DYHA 5DT6A 5AA4B 2Z8DA 1PB7A 3I6VA 5ICTA 4Q0CA 3G3IA 1VE4A 3SEVA 1DPEA 1B51A 4F3BA 3DP4A 4I62A 2QS1A 5I2NB 2V84A 2Y7RA 1QULA 3SEWA 3S9MC 4EQBA 2I3VA 4DDDA 5KDTA 3T9UA 2ZYMA 2E1SA 4RY1A 3RTWB 3SDFA 3M8UA 3U93A 5I2KB 2XXIA 4R74A 2X26A 2ZYOA 1L5TA 4FATA 3SEYA 4F3SA 1WODA 1Y3PA 3USDA 1POY1 1XC1A 3K6UA 3UA8A 2CZLA 3MPKA 3PMWA 4U23A 2AYSA 2NUVA 1MDQA 3VE1B 3KGCA 4WEDA 3PPOA 1FQEA 1SW4A 2KLFA 4P11A 3RPWA 3HV1A 1CE2A 3VVEA 1B58A 3MVXA 3OO8A 3TKDA 4U22A 2ZNUA 3VFJA 3P7IA 2HFBA 3CSBA 2A5SA 2XXQA 3T9VA 4GIZA 3FUZA 1SW5A 1H45A 2UVGA 3HN0A 3KJ7A 4ESWA 3RUMA 2QS3A 3C36A 1B05A 3VLVA 4NE4A 2HAVA 2V93A 4IO4A 4YMAA 2NWJA 3JV9A 3KSJA 2VD3A 1D9YA 2D5WA 3EF7A 4LUBA 3TMGA 1Y1MA 5KDTB 4G8MA 3PU5A 4GXAA 3HHFA 3IK6B 3CRBA 5I84A 3U94A 4YB6A 2DXRA 4KCDA 5CI5A 5K2XA 3RTFB 4XXUA 1P1WA 3PD9A 1URSA 1Y3QA 4QFOA 4RK2A 1N84A 4PFTA 4ELQA 4OERA 5ISUA 1LSTA 3DP6A 2F34A 1N7XA 4NF5A 1SI1A 2XXPA 3ONMA 3QXMA 1JETA 3H6VA 1QKBA 1OIBA 1QUJA 3QUFA 3TCFA 4OFJA 1UTBB 5HBCA 3K2DA 2LAOA 3BKIB 4FORA 3H06B 3TUSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1XVYA 1MPCA 1JNFA 1MXYA 1TWYA 2RINA 4OFOA 1D4NA 3ILTB 1OMPA 2YPNA 4NN3A 3SEXA 2DXYA 2I4BA 1XT8A 3L6HA 3A3CA 4ZEDA 2Y5LA 4KR5A 2R9JA 3H3GA 4PC9A 5IGAA 4BDLA 2FA7A 1Q1KA 3KG2A 4PGNA 1IITA 1B5HA 1JW4A 2MKZA 4O94A 3PUYE 4G77A 1KWHA 4XIGQ 4U2RA 2PBWA 1M5BA 2Q9TA 3ISPA 3FXRA 3Q26A 2Q2CA 1B7HA 3V83A 1YXIA 2V4CA 2B4LA 2Z8EA 1B3GA 4MNCA 5H8FB 4TLLB 5L9MA 5AA4A 4NF6B 2OK2A 3RYDA 3ZKKA 4C0RA 1EZOA 4BDQA 4AB5A 3K00A 2F8DA 1CB6A 4BDMA 4MBPA 2FBPA 3B6TA 3TELA 4N4UA 4U21A 3U72A 4PTKA 2VPNA 5I2NA 4OVTA 1IXCA 4Z7EA 3GYYA 1FQAA 2CMOA 4QFLA 4PAIA 1QKAA 4G68B 4PDDA 5CMMA 4H6DA 2HHMA 4ECFA 2XXXA 1DK4A 4LZ7A 2FYIA 5I2KA 4YU0A 3T66A 3UORA 3GBAA 3T22A 2HZLA 1O64A 4AQ4A 4LZ8A 1N76A 3FJGA 2ZNTA 3PD8A 4QSEA 4OEUA 1N3WA 1FBCA 3E79A 4M4GA 2GH9A 1JEVA 2RCBA 4PFYA 3SERA 1ZKBA 4O3BA 3G3KA 3OOAA 4M1VA 1IMBA 3Q29A 4ZEKA 3V5AA 2QPQA 4RYAA 4HCYA 4R2FA 4QRZA 3IORA 1AOVA 3KZGA 3LSWA 1MM6A 3H6UA 3FXUA 4N13A 1QJMA 2XXHA 1URGA 1ZIUA 2F7CA 3BBRA 1FQCA 4JB7A 3MVZA 5EYGA 3W9VA 3G3GA 2VD2A 1B3FA 2ONKE 4RA1A 3MC2A 3RQTA 1MS7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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