3QYTA

Diferric bound human serum transferrin
Total Genus 204
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
204
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
VPDKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFRRP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Iron and bismuth bound human serum transferrin reveals a partially-opened conformation in the N-lobe
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 204
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3qytA03
3M3KA 2H4IA 3KFMA 1MY0A 1LAGE 1B7ZA 4Q30B 5DYHA 3K6UA 1B3EA 4C1UA 1LGBC 1B2HA 2DWHA 4PETA 1GR2A 4FECA 3CR9A 4NF4A 1RYOA 2Z23A 4ONYA 1Y1MA 3O9PA 5L9OA 4LUBA 4M1VA 4I9DA 2R6GE 5A5XB 2A5TA 4OMBA 1T0KA 3VV5A 4KYSA 3K6WA 1VE4A 2XXXA 2WKYA 1MQDA 2X26A 3VXBA 2PX1A 1MY3A 2B3FA 3UORA 2XXWA 5I59B 1PB7A 4NWCA 3UA8A 2OJTA 4ESXA 4NF8B 2V84A 1BLFA 1M5FA 4DXUA 4FEBA 1MXUA 3KBRA 3N6TA 2HZLA 3FD3A 3IR1A 5H8SA 4KPTA 3LSFB 2I0BA 1R9QA 2THIA 3EHUA 1Y9UA 4FATA 4NMYA 2G93A 5I2KB 5B7DA 4F19A 4LZ5A 2P2AA 2VOZA 1MRPA 3KSJA 4UACA 2VHAA 1EU8A 4R75A 4G8HA 2ZMBA 5FHOA 1IZ1A 3O2AA 1FCKA 2V93A 4JSDA 5FTHA 1B51A 1OMPA 3TQLA 1RKMA 1MY1A 3W9VA 2GH9A 3CFLA 1O63A 3QUJA 3H3GA 3USDA 3VXCA 1MM7A 4H8JA 2F6GA 1MXZA 5FTIA 2O1MA 2KLFA 2OWTA 1Q35A 4WXJA 4H1XA 4R2BA 2RINA 1TWYA 2QS2A 4LVQA 4IO4A 4RA1A 4GF8A 3FGSA 4EF1A 2A5TB 5CMCA 1US5A 3O29A 4KQPA 3Q27A 1S50A 1IIWA 3RNNA 4N13A 3T66A 1SD3A 1B3FA 1GV8A 1NKXA 1BIYA 4BDNA 3RUMA 1LAFE 2AL4A 5CMKA 4QSEA 1LCTA 1LSTA 3PUZE 4ZEIA 5CBRA 4RPOA 1HSEA 3HN0A 2ONKE 3LSXA 4U1OA 4NF6A 1N3XA 5JTYA 3SEWA 2Q8JA 1PC3A 2RC9A 3K1PA 3N5LA 4HS7A 1SVXB 1CE2A 4IO6A 5M2VA 4GLIA 3PUXE 3HSTA 4C0RA 4F22A 4NE4A 5FHMA 1Y4TA 1F9BA 4OQOA 2GHBA 2D21A 3K1MA 1IXHA 3KJTA 1B7HA 3A3CA 3MZBA 4K3FA 2GHAA 3H03A 1ZIUA 1N0TA 4IB2A 4OXVA 2XX9A 3SETA 2Z8FA 1AOVA 2ZYKA 1DTZA 1B05A 4QSDA 3PV0E 3BBRA 3TTKA 2V3UA 3EPEA 3IK6B 2Q89A 4PQJA 4PFUA 4RY1A 4U23A 1JQFA 1PEBA 4R74A 4OERA 1NNFA 4F39A 4EQ9A 3GBBA 5AA1A 3PUWE 1JETA 1QUKA 3SEVA 4H5FA 1MXXA 1H43A 1MQHA 4GQOA 2OBGA 3OO7A 4BLAA 2O84X 3M3LA 4RPNA 5I2NA 3RT6B 3KEIA 3T22A 1MXYA 1PB8A 4DE8A 1ZTYA 3S2VA 1P1UA 5DVIA 1B1HA 5KDTB 1XOCA 4ELPA 3IAZA 2DE3A 3THIA 2FA7A 3V8XB 1MPCA 4YZZA 1FTJA 2ZNUA 1SW1A 4EDPA 1SW2A 4FJPA 4Q5TA 5JTYB 3K00A 3G3GA 2HQ0A 5ICQA 1BTJA 2DP8A 2XXUA 4GD5A 1OQGA 1OQHA 2M8CA 4R6YA 3MW0A 2QSXA 3FIRA 3L6HA 3O6IA 2Y7WA 1NL5A 4H0WA 3SERA 1B5JA 1B3LA 4EQ7A 1IUDA 1N76A 2ZYMA 1B52A 1USYE 3KJ7A 4F18A 2QL3A 1SW4A 5CC2A 3PU5A 4ZE9A 3TODA 2UVGA 1POTA 4N6PA 4KYEA 3TCGA 1LFHA 3H6WA 4YMBA 4JDFA 2VGQA 4MLVA 3MP6A 1D4NA 5A5XA 3OD7A 1LB8A 4L17A 3BFUA 1MH4A 4OFJA 1DSNA 3MJNA 1Z7NE 3UP9A 3KOSA 4IO5A 1ZKBA 2RKMA 4YKKA 3RY3A 3VE1B 3S9EA 4QHQA 2I49A 5I2NB 1MS7A 3KOTA 3QSLA 4POWA 3LC8A 3MWBA 3LR1A 1M5CA 4OESA 3B7DA 3I3VA 4TLLB 1JNFA 2O69A 3S9NC 4R72A 3G7WA 4MH5A 4PP0A 1ZU0A 1B6HA 3VVDA 5AA2D 5I2KA 3IO6A 2D5WA 2V3QA 4NTLA 2I4BA 4YB5A 4H67A 3ZKKA 3CG1A 1UTBA 1SI1A 2Y7IA 3JZJA 3TCFA 4OVJA 4ELRA 4YICA 1H45A 3TELA 3OEMA 4EXLA 2Z22A 4I8CA 1USYH 3UIFA 1CB6A 3K0VA 1SYHA 3SESA 1FTLA 5I56A 3TEPA 3O6GA 3IO4A 3OO9A 2HZKA 2O7UA 1MG1A 1URSA 4YB7A 1FW0A 4ZEFA 3LUYA 1OLCA 1TT1A 4YAHX 5DVJA 1VFDA 2F7BA 3C35A 3FJGA 3U94A 4OEUA 4ESWA 2Z8EA 1HSJA 1QUIA 1YTVA 4GOTA 1BKAA 4PE5B 1EZ9A 2GFEA 5ICTA 4ELQA 1XVXA 1B0HA 4ND9A 1MH3A 4R9GA 3TFLA 1B3GA 1EZOA 1PB9A 3DLNA 1NH7A 2AIXA 1IQ7A 4PFYA 4X1DA 3IX1A 1LBBA 2YPNA 3VLVA 4BDRA 4RNSA 2OWSA 3DP8A 1ZLQA 5DVFA 3IB1A 4EQBA 2AYSA 3FJMA 1SW5A 2XD3A 3T9UA 1SDXA 4R6HA 2XXYA 2V25A 1LFIA 3Q25A 3RPWA 2F6PA 2HAVA 3B6WA 3EN3A 4RK2A 3PD8A 2RF1A 5EHSA 1IITA 3TCHA 3HO7A 4P0IA 4KFQA 2XXQA 4ZDMA 2AL5A 1H76A 3I5OA 2I4CA 5ITPA 1UTBB 2F35A 3KN3A 3ZS6A 1XHYA 4KI0E 5ELVA 1M5EA 1AMFA 3SEUA 3VLUA 1VR5A 5TU0A 5I56B 3R7XA 1MQIA 3H06B 5H8FA 4LONB 3RGYA 3KSXA 5TPAA 1JW4A 4G68A 2HFBA 2Q9TA 3WAEA 2VD3A 1SYIA 2IA4A 4WKMA 3C9HA 3M8UA 4MFIA 3EQ1A 4O3CA 2H9BA 3L6GA 3O28A 3OSQA 2O68A 4OETA 2DXRA 4U21A 1MXWA 1VFEA 4JBZA 2CZLA 3U8QA 2GRVA 4FORA 3KZGA 4YU0A 4LA9A 1DPPA 3MZ1A 1OLAA 4U1ZA 2PT1A 1BP5A 4R9FA 3FVNA 1DTGA 1B40A 2H99A 2ONSA 2ZNSA 3HHGA 5KDTA 3C36A 3PMWA 4R6KA 4GRKA 4AB6A 4XKNA 4KR5A 4GXSB 3LSWA 1NH8A 1MDQA 1OIBA 2ANJA 3OOAA 2DWAA 1B1XA 4OFOA 5K2XA 3OO8A 3PPOA 1XT8A 3FXUA 5K2YA 2DE4A 1S9TA 4QFLA 1R6ZA 2XX8A 5H8HA 2IEEA 2QS3A 3VVEA 1D9VA 5HPQA 3ILTB 3O6HA 1URGA 4I1DA 1SI0A 1PBQA 4F1YA 2E1SA 3H7MA 1JW1A 4X1BA 1UQWA 4OYVA 3BFTA 2UVJA 3IOUA 4H8IA 5HBCA 4ELOA 4ZE8A 3JYRA 3VVFA 4MLQA 3T96B 5I84A 1TXFA 2UXAA 2ALUA 5CRYA 2Y7RA 5H8FB 2R71A 3DM0A 5TPAB 3PUVE 4G68B 2XX7A 4GWOA 3T9XB 3MPLA 3TTRA 1ZMGA 2ZYNA 3C31A 4KHZE 3RT8A 4ZS9A 4U4SA 4OTEA 2PVUA 1QKAA 1XVYA 3PD9A 4RK9A 3EHSA 4YKPA 3ODBA 1O7TA 2BJJX 3H6VA 4MF3A 1Y1ZA 2PMSA 1NNKA 4THIA 5L9MA 2F36A 3CI8A 3FV2A 5CM6A 1L5TA 1WDNA 2NXOA 5JK4A 1MM6A 1II5A 3B6QA 1Z7ME 4AQ4A 3GBAA 1HSLA 3N94A 4KD5A 5JEIA 2ZYOA 1GVCA 3PPPA 4IGRA 2F7CA 4OWDA 3IB2A 3A3UA 5L9SA 1ZBMA 2NUVA 1I69A 2F8DA 1XS5A 3SKPA 3QYTA 4GVOA 1IEJA 5H8HB 4H6DA 3PPQA 2I0CA 1A54A 1I6QA 3TQWA 4KCDA 2YLNA 3G3HA 4DLDA 3IJOB 5KCJA 4U2RA 1QKBA 1LBCA 4G68C 4XKQA 4C1TA 2XXPA 1N7XA 2F5XA 3T93B 3QXMA 4ZEKA 3C32A 3LSLA 3TDJA 2Y7PA 1LAXA 1DMBA 2I3WA 4DCYA 2XHDA 1UTHA 3ONMA 3Q28A 4PFWA 3HCQA 4I62A 1B46A 5I57A 2QMXA 1NFTA 3M3FA 3B6TA 4OFLA 4TLMB 4NF5A 1YAEA 1URDA 1Y3PA 2R9JA 3ZSFA 4DZ1A 2HEUA 4PFTA 3VFJA 4EUOA 4LQ2A 4GIZA 3FVKA 1B5IA 3G3FA 2CMOA 3U92A 2REGA 3S9MC 4OHNA 2O7IA 4GL0A 2UVHA 3RTFB 3C34A 3K2DA 4ECFA 4BDLA 1S7YA 1N7WA 2UYFA 2Z8DA 3D4GA 1LB9A 5CMBA 3O97A 2XXIA 1J1NA 1P1QA 3MQ9A 4JSOA 3MBPA 2DE2A 2DSFA 3H4ZA 4AB5A 4F3BA 5ITOA 3UK4A 5KZTA 3A09A 3MC2A 4ZZAA 4HW8A 5CMMA 4M4GA 2QS4A 1FQEA 2FNCA 4JWOA 4ZZEA 4DXBA 4ZEBA 5EYFA 5LOMA 3HHFA 3IL1B 1N84A 2YJPA 4G8MA 3N6UA 1Y3NA 4IGTA 4UA8A 3WAFA 1AL3A 2REJA 5TP9A 3FZVA 3OO6A 5H8NB 5KCJB 5AA3A 3MVYA 3G3IA 5AA2B 1FTMA 3OMBA 4YKJA 1B7UA 3T9HB 2PBWA 3N26A 5DT6A 1M5BA 1RYXA 3C4MA 3MUQA 5I58B 1Y4CA 3W15C 4JWXA 2O51A 1NMUA 4FAJA 4XXUA 3TYHA 1FTOA 1GGGA 5BUUA 4ZEDA 1B4HA 3OEKA 2XXTA 4POXA 1UTHB 1DPEA 1QVSA 2I6EA 4EXKA 3FXRA 3KGCA 1MPBA 1IXIA 2G29A 5I57B 4QFKA 2F34A 2Q2CA 4Z0IA 3E13X 2H5YA 2QRYA 2UVIA 4X9TA 2OK2A 2PYYA 3K6VA 4NF5B 4OENA 1B32A 1FQCA 3D4CA 1LFGA 1UIUA 4E0WA 4GFRA 1ATGA 2XXVA 3JV9A 3ECRA 2XXRA 1R9LA 4BDOA 4N07A 1OVTA 3CFZA 3MVXA 1B0LA 1Y20A 3TPAA 2OCUA 3MPKA 1FQBA 3UN6A 4F3GA 3TKDA 2O6AA 1I6AA 3ILUB 4QF9A 1DOTA 3TMGA 3EF7A 2DWIA 3VDFA 3OENA 4NEDA 4HTGA 4F31B 4QSCA 1MY4A 3ZKLA 2UYEA 1D9YA 3S9LC 4NWDA 3HPIA 3G3JA 3GLBA 3CIJA 3O66A 4P11A 1YCJA 5B70A 5H8QA 3DELB 2HAUA 4DXCA 2F97A 4EF2A 3G3KA 1Y3QA 1OVBA 5J1DA 5IAIA 1SQYA 1MQGA 5TP9B 3OSRA 1H44A 4ZECA 3MVZA 4GXAA 5AA4A 3CSBA 1QW0A 1B58A 4F2OA 1QUJA 3VLWA 2E0SA 4H5GA 3T9VA 4DDDA 4G4PA 4KYDA 2QS1A 3KG2A 2QPQA 3TZAA 4KCCA 3MVWA 3QIMA 3FVOA 3U93A 1A55A 4G77A 1FQAA 4NF4B 5BWJA 4R73A 2NWJA 1UIVA 2P1SA 3HV1A 4GL8A 2H98A 3PPNA 4MBPA 1A40A 2X7PA 1XC1A 3K02A 4QRZA 3QAXA 1LCFA 3TAJA 3MP8A 4LZ8A 4IY5A 5EHMA 1H3DA 1P1WA 1B5HA 1ELJA 2I48A 1US4A 3IB0A 4R2FA 3U72A 4IO2A 3H6TA 4XIGQ 1B4ZA 2PT2A 3CG3A 2DXYA 4YKIA 4LATA 1ZJLA 3SEXA 3OELA 1O64A 1IXGA 1JVYA 1I6BA 1P99A 3FV1A 4X48A 3TTNA 4F29A 3DP6A 3AXFA 3PGFA 5CI5A 2RCAA 4RJZA 5H8QB 1B9JA 4H65A 1JW5A 3UGWA 1B3HA 1N3WA 3FXQA 3V5AA 4Q8RA 2DOJA 4YMAA 4YB6A 1LLSA 3FJ7A 4IO3A 4O3BA 1FQFA 3K01A 4RYAA 3KN8A 1JEUA 1AIVA 3SEYA 2NVUB 4E0XA 3CVGA 4XKPA 5AA4B 3R6UA 4DCXA 1A8FA 4IY6A 2ESNA 3IOTA 2I3VA 3TTLA 2DVZA 1P1NA 4U4XA 3E9XA 5DTBA 2QMWA 1M5DA 3R26A 4F1UA 2ZXTA 2F7AA 2A5SA 4JB7A 5HM4B 1Q1KA 3W9WA 1QULA 3E4RA 3CSGA 1QJMA 5CBSA 3Q26A 2O1LA 1NNTA 3P7IA 4HCWA 1TFAA 3GZGA 5FHNA 1GTKA 3LBSA 4F1VA 1JVXA 1R1NA 2OLBA 2HXWA 3OXNA 4JXIA 4Q0CA 4F3PA 3IOWA 1A7LA 4F2QA 4RXLA 4WEDA 3I6VA 4XKRA 5F7VA 4G2ZA 4FE8A 3U1OA 2Q2AA 3PMVA 4WEPA 2RC7A 3KN7A 1JEVA 1AH5A 1POY1 1PBPA 3F11A 4IO7A 4LZ7A 1MXVA 4G8NA 4QFPA 4BDQA 4FEDA 3GXAA 2VD2A 4NF6B 1EH3A 3K6XA 2HCAA 3C33A 4QFNA 3MP1A 2FYIA 5DEXA 5H8NA 3FVGA 1WVJA 3V89B 3RTWB 2V3TA 5AA2A 1P1OA 1KWHA 2F78A 1IXCA 2W7YA 3PPRA 1N04A 2Y84A 3MZ9A 1FTKA 5I58A 5F1QA 5IKBA 2LAOA 4TQUQ 3SDFA 3E3KA 4HCYA 4OEVA 3RLFE 1ANFA 2XD2A 1SBPA 3IJXB 3S4UA 4QFOA 2B3BA 1WODA 1EZPA 4JWYA 3K1NA 2DS9A 2B65A 1D3KA 3IOVA 4P0GA 4LP2B 3FASA 4DIGA 3FUZA 4O3AA 1PDAA 1MQJA 5L8DA 2DQVA 1A99A 2ZNTA 4F3SA 2QJEA 5I59A 2Q88A 2ONRA 2RC8A 3TTMA 4NF8A 3CRBA 3PMXA 5ISUA 2OZZA 3K4UA 4FIMA 3BKIB 3QUFA 2DVCA 2DWJA 3RN8A 3DP4A 2RCBA 3V83A 3H6UA 3Q29A 3IORA 3FATA 4ISUA 1VSOA 3MAMA 1LAHE 4BDMA 2VP1A 4OZ9A 4TOZA 3RQTA 1MY2A 1TFDA 5AE4A 2D3IA 3TUSA 3EHTA 1A8EA 1FQDA 2XXHA 1YPNA 4U22A 1MDP1 5DEXB 3QK6A 2I58A 4Z7EA 2DYXA 1NNPA 2Y7KA 3CFXA 2H25A 2ABHA 4XTCQ 1MPDA 4LQ5A 2X7QA 3PUYE 2P0SA 2NOOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3KA 2H4IA 3KFMA 1MY0A 1IMEA 1LAGE 5ET5A 4GBWA 1B7ZA 4Q30B 5DYHA 1LBYA 3K6UA 1B3EA 4C1UA 4AS5A 1LGBC 1B2HA 1KA0A 2DWHA 4MJOA 4PETA 1GR2A 4FECA 3CR9A 4NF4A 1RYOA 2Z23A 4ONYA 1Y1MA 3O9PA 5L9OA 4LUBA 4M1VA 4I9DA 2R6GE 5A5XB 2A5TA 4OMBA 1T0KA 3VV5A 4KYSA 3K6WA 1VE4A 2XXXA 2WKYA 1MQDA 2X26A 3VXBA 2PX1A 1MY3A 2B3FA 4MAGA 2QVUA 3UORA 2XXWA 5I59B 1PB7A 2CZHA 4NWCA 3UA8A 2OJTA 4ESXA 4NF8B 4PFIA 2V84A 1BLFA 1M5FA 2FBPA 4DXUA 4FEBA 1MXUA 3KBRA 3N6TA 5IZZA 2HZLA 3FD3A 3GYYA 3IR1A 5H8SA 4KPTA 3LSFB 2I0BA 1R9QA 2THIA 3EHUA 1Y9UA 4FATA 4NMYA 2G93A 5I2KB 5B7DA 4F19A 4LZ5A 4MX6A 2P2AA 2VOZA 1MRPA 3KSJA 4UACA 2VHAA 1EU8A 4N8GA 1DBZA 4R75A 4G8HA 1NV3A 2ZMBA 5FHOA 1IZ1A 4PFRA 3O2AA 1FCKA 2V93A 4JSDA 5FTHA 1B51A 1OMPA 3TQLA 1RKMA 4OVRA 4PAFA 1NV7A 1MY1A 3W9VA 4MEVA 3T0JA 2GH9A 1FBGA 3CFLA 4PBQA 1O63A 3QUJA 3H3GA 3USDA 3VXCA 1MM7A 4H8JA 2F6GA 5A5LA 1MXZA 5FTIA 2O1MA 2KLFA 2OWTA 1Q35A 4WXJA 3IFCA 4LN5A 4H1XA 4R2BA 2RINA 1TWYA 4DI4B 2QS2A 4LVQA 4IO4A 4RA1A 4GF8A 3FGSA 4EF1A 2A5TB 5CMCA 1US5A 3O29A 4KQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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