3RLFE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an outward-facing conformation bound to mgamppnp
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Hydrolase/transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 122
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rlfE01
3DP6A 2FYIA 2W7YA 3FGSA 2BJJX 3OELA 2DSFA 1Y1MA 1FTJA 4JSDA 2UVJA 2DVCA 1B58A 4RK2A 1FTMA 1R1NA 1VSOA 3IO4A 2V25A 2O6AA 4RNSA 1MPDA 1EZOA 4OERA 3JZJA 1RKMA 5CMCA 4U21A 2DXRA 3TTNA 1Z7NE 4NMYA 3V83A 4E0WA 5I59A 3FVKA 2H5YA 4EF1A 1NFTA 1XS5A 5IKBA 1VFDA 3FV1A 2XXXA 2HAVA 4QFOA 1H44A 3GXAA 4U22A 3MQ9A 3U72A 1MY2A 4OFOA 2V84A 3QAXA 2DWIA 4OQOA 4WEDA 4LVQA 2Z23A 1R9LA 1M5DA 3VXBA 3VLVA 2QS3A 3MW0A 4HS7A 3TQWA 1S7YA 3CFLA 3FXQA 1B2HA 2ESNA 3G3JA 1TWYA 3H06B 2RCAA 4F3BA 4LZ7A 3U1OA 3H03A 2PYYA 4IY5A 4GVOA 4ELPA 1QUKA 1Y4TA 4RJZA 1O7TA 4JBZA 3N6TA 1MM6A 4H5FA 1B3GA 1DTGA 4ISUA 1B5JA 1FTLA 2QS1A 3PU5A 3PD9A 3PUXE 2ZYNA 3TTRA 3V89B 4PE5B 1B5IA 1LAHE 1A8FA 2XXYA 3OXNA 2ONSA 4DIGA 3DP4A 3K6WA 3E13X 1QKAA 3H6VA 2XXWA 5CMBA 3LSLA 1MQIA 5AA1A 4XKRA 3G3KA 1HSEA 4WEPA 4LONB 2HCAA 4DXBA 5DVFA 1II5A 3WAEA 3QUJA 4R6HA 1OIBA 4PFTA 2XX7A 2DE4A 1MXUA 1D9VA 3RQTA 5CC2A 2I6EA 3E4RA 3O2AA 2GHBA 1XVXA 5BUUA 4OTEA 1SVXB 1Y3QA 4GRKA 1ZMGA 3UIFA 5DYHA 2X7PA 5H8FA 3OO6A 1EU8A 1SW5A 1LFIA 2Q2AA 3W15C 5ELVA 1VE4A 4ESXA 2UYFA 3USDA 1URGA 1MM7A 2I3VA 3A09A 4THIA 1MY0A 5HPQA 4XXUA 3CI8A 3C9HA 4R2BA 3T93B 1ZIUA 3TCGA 5KDTB 1N0TA 4H8JA 3DELB 4QFLA 1B46A 3G3HA 4OYVA 3ZS6A 4X1BA 1MDP1 3C4MA 5JTYA 3G3IA 4LQ5A 3KJTA 3CSGA 4MF3A 4OEUA 1FQBA 1LCTA 3QIMA 4Z0IA 2X7QA 3OMBA 3TTMA 1FTOA 3OO9A 2ONRA 1LB9A 3B6WA 3IL1B 2DYXA 5M2VA 4U1OA 4TLMB 5I2NA 5L9MA 4DXCA 1ZJLA 5CBSA 3TPAA 1QUIA 1OMPA 3H7MA 3HHGA 1FQCA 2DE3A 2AL5A 4FORA 4OVJA 4YB7A 5L8DA 3K1PA 3FUZA 2Y7PA 4FE8A 5TPAB 4NEDA 3OO8A 1LAFE 3TQLA 2ZNTA 3FVNA 3CR9A 3K01A 1US4A 4OXVA 4EQ7A 1QUJA 3ILUB 3T9XB 3T66A 5I57B 1TFAA 3IOWA 4GIZA 1FQDA 3MBPA 4I9DA 1NL5A 3QUFA 2Z8DA 1LAXA 3TAJA 3G7WA 5J1DA 3TCHA 4BDQA 1DPPA 3PUWE 3K4UA 4RY1A 1IXCA 5AA2D 1XOCA 1JW5A 3L6GA 5DTBA 1QKBA 3OD7A 3VE1B 4WKMA 1IZ1A 1LSTA 2F5XA 2DP8A 2ZYMA 4GOTA 1P1OA 3ECRA 1DPEA 4TQUQ 4PFUA 4M4GA 4KCCA 1J1NA 4BDMA 1SW1A 2IEEA 4AB6A 1XT8A 3H4ZA 3R26A 1SD3A 3B6QA 2HQ0A 3IB2A 4HCWA 4LATA 4ELOA 4EXLA 4F31B 4XKQA 3LC8A 4DCXA 3LR1A 5KDTA 4H8IA 1PDAA 1TFDA 2E1SA 4KQPA 3KBRA 3SEYA 2B3FA 4WXJA 2O1LA 2Y7WA 2XXPA 5JEIA 3RGYA 3IO6A 3T9HB 1URSA 3B6TA 3O6HA 4R9FA 5HBCA 1S9TA 2RKMA 4YICA 3AXFA 1B7HA 2F34A 2F78A 2XX8A 1DSNA 4MBPA 4ZEFA 1Y3PA 3Q29A 2XXTA 3A3UA 4X1DA 3FVGA 4RYAA 3FXRA 4YKPA 4NE4A 1B1XA 3OSQA 4G8HA 5FHNA 4YB5A 1XHYA 2XXVA 5TPAA 2ZNSA 5ITPA 1M5BA 1LLSA 2F6PA 3OSRA 2YJPA 4LP2B 4R74A 2PT1A 3C32A 2I3WA 1D9YA 3K1MA 3VLWA 4YU0A 3PPRA 3VVEA 4EDPA 4XIGQ 3TUSA 3O97A 2H9BA 2HZKA 2VP1A 5I57A 1HSLA 4I62A 2AYSA 5ISUA 4MFIA 1MH4A 1JW1A 2QL3A 4R2FA 4H1XA 4LQ2A 4F29A 1PBPA 3IB1A 1Y20A 3ZKLA 3W9VA 3TELA 4LZ8A 2M8CA 1PB9A 4JSOA 2ALUA 3PUVE 3QSLA 4IO4A 2O7UA 3I3VA 3N5LA 3MC2A 3U93A 4YZZA 2ZNUA 4P0IA 1GV8A 3KFMA 3RLFE 5AA2B 2VOZA 4F1VA 3MUQA 3MVYA 2OBGA 4XKPA 5I2KA 3PPOA 3H6WA 5CMMA 4GWOA 1MQJA 4NF4B 3MP6A 1UTHB 4NF8B 3EHSA 3C34A 1SW4A 2Y7KA 3S9LC 4PFWA 4ZEIA 1PB7A 1N7WA 5B70A 3S2VA 3H3GA 4G77A 3V8XB 3K6XA 4YKIA 1MXZA 3ZKKA 3GLBA 1Z7ME 5KCJB 1B3EA 5I58A 3EQ1A 5HM4B 5DEXB 3I6VA 4GD5A 1ZTYA 2I0BA 3IORA 4Q30B 5H8NA 1H45A 1Y4CA 3PGFA 2Q9TA 2HFBA 5JK4A 2GH9A 3P7IA 3QYTA 4JWOA 1H76A 2O84X 1MPBA 1H3DA 4DDDA 3K00A 3IJXB 3KSJA 1I6BA 4XTCQ 2XHDA 4P11A 1JVYA 3OEKA 1CE2A 4YAHX 4BDLA 2XXQA 3KGCA 3EHUA 3GZGA 1OQHA 4OESA 4ND9A 2UVHA 4HW8A 3MZ1A 3M3FA 4PFYA 1ELJA 3U8QA 1MY4A 1SBPA 1POTA 1A99A 4I1DA 4RPOA 2F6GA 3TDJA 4UACA 3M8UA 1IUDA 2F7BA 1QVSA 5CMKA 5F7VA 4EXKA 3EF7A 3TKDA 4IO6A 4YMBA 1CB6A 3MWBA 4RK9A 4F19A 1BKAA 3CSBA 4O3BA 3C31A 2XXRA 4IO3A 3IOTA 2AL4A 5H8HB 1B4ZA 3OO7A 1NH7A 2HAUA 4O3CA 2QMXA 1FTKA 1OQGA 1MQDA 3U94A 3U92A 2ONKE 1UTBB 3VFJA 3Q25A 2UXAA 2P1SA 1YCJA 3FJMA 1TT1A 1BIYA 1B05A 2Z22A 4U2RA 3VLUA 3QXMA 2WKYA 2X26A 3DLNA 3SEUA 1PC3A 1B4HA 2UVIA 1WODA 3PPQA 4N6PA 3TZAA 1WDNA 4EQBA 4ESWA 2RCBA 2XXIA 3CVGA 5ITOA 1UTHA 4Q5TA 1B1HA 4DXUA 2Z8EA 1S50A 1MXWA 3DM0A 4OZ9A 4MLQA 3KN3A 4M1VA 1GR2A 1A54A 3T9UA 4C0RA 3EN3A 3FATA 5H8QB 2VD3A 3LUYA 4IB2A 4KR5A 3ILTB 1TXFA 4GQOA 5KCJA 2V3QA 3K1NA 1AL3A 4N07A 1LB8A 5BWJA 1FCKA 5DEXA 3THIA 2HZLA 3CFXA 2CMOA 5TP9B 4NF6B 3HSTA 2RF1A 4OETA 4ZZAA 4YKJA 5CRYA 2PVUA 1M5EA 2RC9A 1H43A 1NNKA 3TFLA 1BTJA 1O63A 2GFEA 3SEVA 3OENA 2V3UA 4ELQA 1A55A 4ZEBA 4H67A 1LFHA 3IOUA 4RPNA 3HO7A 4ZECA 3GBBA 2PBWA 4EUOA 4QRZA 3RNNA 2Y7RA 2VD2A 3F11A 3A3CA 2I58A 1PB8A 1Q35A 4G68C 4R6YA 1JQFA 3WAFA 1US5A 1MQGA 1SQYA 4YKKA 1YPNA 1T0KA 3ONMA 3N94A 1FQEA 1R6ZA 1PBQA 4G4PA 4O3AA 3TTLA 2ZYOA 1B0LA 3PMWA 2QS2A 4Z7EA 3EPEA 4U4XA 3FV2A 3VXCA 3FJ7A 4JXIA 4QSCA 5H8HA 2D21A 3IX1A 2DE2A 1IIWA 4PETA 1I6QA 1UTBA 2YPNA 4F22A 3IB0A 1MXXA 4IO2A 2XD3A 2HEUA 1OVTA 4U23A 1B9JA 3TCFA 4GF8A 1N04A 3HCQA 2RINA 3K0VA 2G29A 1N84A 4F1YA 1Y3NA 2F35A 4R72A 1SI1A 1IEJA 2Q89A 4ZS9A 2QJEA 3O6IA 3SKPA 3LSFB 4POWA 3SEWA 4ONYA 3PD8A 4OFLA 1F9BA 1AMFA 1MXYA 5FTIA 3FD3A 3UORA 2NUVA 3S4UA 1ANFA 4U1ZA 2PMSA 2REGA 4TLLB 4ELRA 5TP9A 1ZBMA 4KPTA 2DXYA 1ZLQA 3C35A 4GFRA 3LSXA 4KCDA 2XD2A 3HN0A 4IGRA 1QW0A 3PV0E 4QSDA 3R7XA 3MPKA 1MG1A 1NNPA 2V93A 3CRBA 1JETA 1B32A 1O64A 3D4GA 5AE4A 2Q2CA 4G8NA 2I49A 2Y7IA 5DVIA 4KFQA 4POXA 2Q8JA 3RUMA 1ATGA 5I56B 4F1UA 3BKIB 4FECA 3Q27A 4QF9A 1FQAA 2R71A 3HPIA 2NXOA 2QS4A 4X48A 3UP9A 4QSEA 3C36A 1LAGE 1P99A 1UIVA 3O6GA 1HSJA 1AH5A 1D4NA 1MRPA 4DLDA 2OLBA 4BLAA 4JDFA 1P1UA 2ANJA 3SDFA 2OJTA 4HTGA 3O29A 2F36A 3KN8A 5K2XA 4MLVA 2I4CA 4OENA 2P0SA 3QK6A 2DOJA 4NWDA 3FZVA 3FVOA 1DOTA 1SW2A 2DWAA 1QJMA 2OCUA 2PT2A 3IAZA 2H99A 3MP1A 3LSWA 1GVCA 2DWJA 1IITA 3PPPA 1L5TA 2FA7A 3UGWA 3KSXA 2I4BA 3MVZA 2VGQA 4FEBA 1YAEA 4IGTA 5DVJA 1NH8A 2ZXTA 3CG3A 2XXHA 2D3IA 2ZYKA 1FQFA 1ZU0A 4KYEA 2NVUB 3RTFB 3W9WA 1JW4A 1A7LA 3PMVA 4KI0E 3MP8A 3G3GA 4FATA 4DE8A 2FNCA 4LZ5A 3FXUA 4MH5A 4ECFA 4ZE9A 2I48A 4BDOA 5I84A 5H8FB 3VVDA 3JYRA 5K2YA 3CIJA 1NKXA 1IXIA 1RYOA 4F39A 3RT8A 4C1TA 3GBAA 4OEVA 1UQWA 3KZGA 1B7UA 1B3HA 5FHMA 3O66A 2KLFA 3T9VA 1AOVA 3HV1A 4OHNA 4NTLA 3KG2A 4LA9A 1GGGA 1MY3A 3N26A 2A5TB 4IY6A 4RXLA 1MPCA 4KD5A 3M3KA 2IA4A 5IAIA 4JWXA 4LUBA 4YMAA 5I56A 3KN7A 2R6GE 5JTYB 3RPWA 3VDFA 4KHZE 4R9GA 1LCFA 4K3FA 2R9JA 1MQHA 2YLNA 3LBSA 4XKNA 1LGBC 2QSXA 2DWHA 2H98A 5I2NB 2D5WA 3FJGA 3CG1A 2GRVA 4R6KA 3VV5A 3JV9A 1A40A 4F2QA 3BFUA 4BDNA 2Z8FA 3KOSA 3MAMA 4H6DA 1KWHA 4NWCA 4I8CA 4ZE8A 1P1QA 1IXHA 4G68B 3UA8A 4H5GA 3MZ9A 1IQ7A 4H0WA 3BBRA 3OOAA 4AQ4A 1B51A 2A5SA 1M5FA 1RYXA 3O9PA 3FASA 2ZMBA 3IJOB 3SEXA 2O1MA 3PPNA 3DP8A 3TODA 1B3LA 3PUYE 4OFJA 4ZEDA 3MJNA 1IXGA 1JNFA 4Q8RA 4JWYA 3H6TA 4YB6A 2THIA 5AA2A 3OEMA 1N7XA 5DT6A 4GLIA 2RC7A 3IR1A 4ZZEA 3E9XA 1I6AA 4AB5A 2P2AA 4P0GA 4F18A 4NF4A 4F2OA 2OWTA 4NF8A 2DVZA 4IO7A 4Q0CA 3K2DA 5B7DA 1USYE 4GXSB 1P1WA 2CZLA 1FW0A 2OWSA 2DQVA 4KYDA 1Q1KA 3S9MC 3MVWA 5CM6A 5LOMA 3KJ7A 3BFTA 3B7DA 4E0XA 4F3SA 4TOZA 3TEPA 2E0SA 3T96B 2GHAA 1A8EA 4HCYA 4F3GA 2RC8A 2F7AA 3T22A 2I0CA 2A5TA 1VR5A 1B6HA 4OWDA 3UN6A 3TTKA 2NWJA 3KOTA 4PQJA 4PP0A 1GTKA 3TYHA 3PMXA 4FJPA 3Q26A 1DMBA 1MH3A 2G93A 2O51A 3SERA 2REJA 1NMUA 1ZKBA 3H6UA 1MDQA 1EH3A 1JVXA 2LAOA 5F1QA 3K02A 4U4SA 1MY1A 4FAJA 4QHQA 2QPQA 5EHMA 4DZ1A 4EQ9A 4NF5B 3G3FA 4QFKA 3S9EA 4ZDMA 3E3KA 1BP5A 3O28A 1I69A 2Q88A 3K6UA 1YTVA 3HHFA 4G68A 4L17A 2O7IA 5AA4B 1B40A 3ZSFA 1Y9UA 5A5XB 4GL0A 1P1NA 5EYFA 1XC1A 1MXVA 2B3BA 2DS9A 4RA1A 1N76A 4UA8A 2AIXA 4OMBA 2UVGA 5ICTA 3CFZA 1VFEA 1JEVA 3MZBA 2QRYA 5KZTA 4R73A 1PEBA 1BLFA 3MPLA 4X9TA 1LFGA 3SESA 2OK2A 2Y84A 3UK4A 5L9OA 5EHSA 4QFPA 4JB7A 1JEUA 2F8DA 4DCYA 1URDA 2HXWA 1B52A 1XVYA 5H8QA 1OLAA 2XX9A 4GL8A 4FEDA 2F7CA 5CBRA 3VVFA 1EZPA 3L6HA 5I59B 3IOVA 4QFNA 3R6UA 5CI5A 4G8MA 4IO5A 1D3KA 3C33A 3FIRA 5I2KB 1AIVA 1B0HA 4G2ZA 3MVXA 1N3WA 4NF6A 2ABHA 2OZZA 3SETA 1NNTA 4N13A 2XXUA 4ZEKA 1SDXA 5FHOA 1USYH 2NOOA 4KYSA 1Y1ZA 1SI0A 2H25A 2H4IA 1B7ZA 5I58B 2O69A 1LBCA 4GXAA 1DTZA 4F3PA 5TU0A 1SYHA 1SYIA 5H8NB 1MS7A 3IK6B 1LBBA 1N3XA 2O68A 1POY1 4H65A 1B3FA 3K6VA 3V5AA 3Q28A 1OVBA 5ICQA 2B65A 3ODBA 4NF5A 2VHAA 2PX1A 3RTWB 5H8SA 4BDRA 2F97A 3RY3A 4FIMA 3S9NC 3M3LA 1QULA 3N6UA 3KEIA 1M5CA 2QMWA 1OLCA 5AA4A 1R9QA 4R75A 3EHTA 3PUZE 5A5XA 5FTHA 2UYEA 5AA3A 4C1UA 3I5OA 3TMGA 3RN8A 5L9SA 2V3TA 1NNFA 1UIUA 1WVJA 1EZ9A 4EF2A 3RT6B 1B5HA 3D4CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OX3A 1IMDA 3DP6A 2FYIA 2W7YA 3FGSA 2BJJX 3OELA 2DSFA 1Y1MA 1FTJA 2P3VA 4JSDA 3MSTA 2UVJA 2DVCA 1B58A 4RK2A 1FTMA 1R1NA 1VSOA 5IZ3B 3IO4A 2V25A 2O6AA 4RNSA 1MPDA 4GX6A 1EZOA 4OERA 3JZJA 1RKMA 5CMCA 1D9QA 4U21A 2DXRA 3TTNA 1Z7NE 4NMYA 3V83A 4E0WA 5I59A 3FVKA 3NOHA 2H5YA 4EF1A 1NFTA 1XS5A 1IMEA 5IKBA 1VFDA 3FV1A 2XXXA 2HAVA 2PFZA 4QFOA 1H44A 3GXAA 4U22A 3MQ9A 3U72A 1NV6A 1MY2A 4OFOA 2V84A 3QAXA 4MMPA 3KC1A 3E79A 1IMAA 2DWIA 4OQOA 4WEDA 4LVQA 4XFEA 3KBZA 2Z23A 1R9LA 1M5DA 3VXBA 3VLVA 2QS3A 3MW0A 4HS7A 3RPLB 3TQWA 1S7YA 3CFLA 1DBZA 3FXQA 1B2HA 2ESNA 3G3JA 1TWYA 3H06B 2RCAA 4F3BA 4LZ7A 3U1OA 3H03A 2PYYA 4IY5A 4GVOA 4ELPA 1QUKA 4P1LA 4GWWA 1Y4TA 4RJZA 1O7TA 1NUZA 4JBZA 3N6TA 1MM6A 4H5FA 4MNPA 1B3GA 1DTGA 4ISUA 1B5JA 1FTLA 2QS1A 3PU5A 3T0JA 3PD9A 3PUXE 1IMCA 2ZYNA 3TTRA 3V89B 2Q74A 4PE5B 1B5IA 1LAHE 2XWIA 1A8FA 2XXYA 3OXNA 2ONSA 4DIGA 3DP4A 3K6WA 2HXRA 3E13X 3MYUA 1QKAA 3H6VA 2XXWA 5CMBA 3LSLA 1MQIA 5AA1A 4XKRA 4HXVA 3G3KA 1HSEA 4GX3A 4WEPA 4LONB 2HCAA 4DXBA 5IZ3A 5DVFA 1II5A 3WAEA 3QUJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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