3RN8A

Crystal structure of iglur2 ligand binding domain and symmetrical carboxyl containing potentiator
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Structural and functional analysis of two new positive allosteric modulators of GluA2 desensitization and deactivation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 86
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rn8A02
1LLSA 4KCDA 4YKJA 4N07A 1MXZA 3KN8A 3FGSA 2I3WA 2Z8EA 3PUZE 1B3GA 1SQYA 4TQUQ 4POWA 2B3BA 3TCHA 2ZMBA 1O64A 1JQFA 4NF8B 4C1UA 3I6VA 2R6GE 3CFXA 4G68A 5AA1A 4WXJA 3P7IA 3N26A 1OLAA 4GXSB 3SESA 4X9TA 2I6EA 4H65A 1MDP1 3I5OA 2UVIA 3OEKA 1N7XA 3FZVA 4F1UA 4DZ1A 4EF1A 1MH4A 2DWHA 2HEUA 2GRVA 4ZE8A 1B7ZA 4LA9A 1HSJA 1N7WA 1T0KA 1YCJA 4PFYA 5IKBA 1MG1A 1TT1A 1A8FA 1B7UA 3MZBA 5L9SA 4KFQA 1RKMA 1SD3A 4F2QA 2V84A 5ELVA 1LAHE 4NEDA 1LFIA 4ESWA 3K6UA 2D21A 1HSLA 4POXA 5KCJA 3LSFB 2I3VA 4ZEBA 1XVXA 3BKIB 1B5IA 2V3QA 4BLAA 2HAVA 5H8FA 5I2NB 2XXXA 2ZYNA 1M5EA 1IXIA 1EZ9A 3DP8A 4IGRA 4YKPA 4JWYA 1R1NA 1MQIA 3VXCA 1GV8A 1MRPA 2Q2AA 2H99A 2P2AA 2PX1A 1N3WA 1URGA 1S9TA 3ILUB 3KBRA 3S9MC 2UYFA 3OO7A 1Q35A 2FA7A 3PMVA 3U8QA 4G68C 4DXBA 4U22A 2XHDA 2OJTA 3DM0A 2XXWA 2P0SA 2O51A 3T9UA 4KYDA 5JTYB 4OMBA 4Q5TA 4F29A 3C36A 1NNTA 4QFPA 4H5FA 2F5XA 1MH3A 2I0CA 4YKKA 5H8QA 2Z23A 3TKDA 4JSDA 3TTNA 1OQGA 3GXAA 1A55A 3B6WA 1N0TA 2Q8JA 2O7IA 2HCAA 3PPQA 5H8SA 1P99A 1ZMGA 3MWBA 4XXUA 4G2ZA 4GQOA 3QYTA 2RC9A 2F6GA 3H6UA 2DWIA 3D4CA 2Y84A 3FXRA 3C9HA 4DCYA 1OQHA 4NWDA 5J1DA 3T9HB 1JNFA 1PDAA 2I4CA 3SEUA 2H5YA 3TDJA 1MXYA 1QUJA 5F1QA 2OWTA 1FQAA 3QAXA 2FNCA 2R71A 3KG2A 4XKPA 1IIWA 3O29A 3O28A 3MZ9A 4P11A 3TUSA 4U21A 1FQFA 1HSEA 3MP1A 3ONMA 4WEPA 4R2BA 2H98A 3O9PA 3MVXA 1MY4A 2I0BA 4MFIA 1AOVA 3U72A 4IB2A 3H03A 4NF4A 4OYVA 2XXHA 3OENA 3G7WA 1A40A 3QXMA 2QSXA 1IXGA 5TP9B 5I56B 1H76A 3T93B 5CBRA 1B3FA 1URSA 2DYXA 3CFZA 4X1BA 5CBSA 3S9LC 4FEDA 2O1MA 3K2DA 5I59A 4JB7A 3VLUA 3KEIA 4QFOA 2NWJA 3OXNA 1DTZA 3E9XA 4WKMA 4RY1A 2DE4A 5ITOA 5I57B 2G93A 3VVFA 3A3CA 5HBCA 3R7XA 4GIZA 3B6QA 4IO4A 3QK6A 1ANFA 3TMGA 3IO4A 1RYXA 3MPLA 2PT1A 3THIA 3T22A 3VFJA 3U94A 3QUFA 1JVXA 5EHMA 4LZ8A 3FASA 2XXPA 4N6PA 5FTIA 2F78A 4H8JA 1POY1 2ZNTA 4O3BA 4RXLA 2IA4A 3L6HA 1B1XA 3IB0A 2F7BA 4YU0A 2Z8FA 1A99A 2CZLA 3LBSA 1OIBA 5DTBA 2IEEA 2E1SA 1SYIA 3BBRA 4IY6A 4KQPA 3VLVA 4ZZAA 2OLBA 3SEYA 5ICQA 3H4ZA 3PD9A 4R73A 2NVUB 4G68B 3KOSA 5M2VA 4BDQA 4H1XA 1Y3PA 3PMXA 4PETA 3N6TA 4FAJA 3PV0E 3RTFB 3H3GA 3TELA 5BUUA 1SW1A 3SKPA 4U4SA 1B7HA 4R75A 1AH5A 5K2YA 5I56A 2VGQA 2FYIA 4RPNA 3VE1B 2UYEA 4F2OA 3KSXA 4ELPA 4RPOA 3FVKA 2W7YA 3LSXA 3KJTA 3W9WA 4QSCA 2OWSA 3FV1A 2B3FA 3QSLA 1N3XA 3MP8A 5KCJB 3K6XA 5DEXA 1NFTA 5I57A 4U1ZA 5H8FB 5TPAB 3EF7A 2OCUA 1SI0A 2I4BA 2Z8DA 3MBPA 1II5A 3MVWA 2O7UA 1IXHA 4ZE9A 3SEXA 3FIRA 1NNPA 2X26A 1EZOA 1B5JA 1B51A 1D9YA 3OOAA 1WDNA 1MXXA 4M1VA 1AIVA 2XXQA 3CI8A 2XXYA 3WAFA 5CC2A 3ECRA 1LCTA 4GL0A 1LB8A 3M3FA 4I1DA 4UA8A 1PEBA 3SEWA 1FQEA 1N04A 3GLBA 5ISUA 1TWYA 4RA1A 3E4RA 2VHAA 4PP0A 1AMFA 2VP1A 3Q28A 4R74A 1ELJA 1B0LA 5I2KB 4YKIA 2AYSA 4X1DA 1Y4CA 4YB7A 4FORA 3UIFA 5I84A 2HZLA 3RPWA 3CFLA 4ZZEA 1LFHA 3BFUA 4NTLA 1QUKA 5H8QB 1VFEA 3HCQA 1KWHA 1JW4A 1ZIUA 1FQBA 2F7AA 1UTHB 4QHQA 2H25A 2RC8A 3JYRA 3TYHA 2AIXA 3IOVA 4IGTA 4EQBA 5B7DA 3TEPA 4G8NA 1D9VA 1I6BA 1MQGA 4ELOA 4EF2A 4G8HA 2YJPA 1URDA 3MC2A 4XTCQ 2DE2A 4QSEA 5F7VA 1NH8A 3C33A 1BKAA 5AA2D 1MXVA 1XC1A 3V89B 1OVBA 1WVJA 4GF8A 4ZEKA 3IOTA 3CRBA 4XIGQ 1B3HA 5KZTA 1JW1A 4F18A 1M5DA 1CE2A 4LZ7A 4MH5A 1USYH 3KGCA 3PPRA 2PYYA 3TTKA 1P1UA 2LAOA 5TPAA 1B1HA 2WKYA 2PT2A 1LAFE 4Q30B 4OERA 4U2RA 4OETA 4C0RA 1NNFA 2HXWA 3KN3A 1MQJA 1IZ1A 4X48A 2NUVA 4OEUA 2HFBA 4GVOA 4FECA 1WODA 4QRZA 4R6YA 2B65A 3ODBA 4TOZA 4OTEA 3RNNA 3MP6A 3FXUA 4NF4B 1R9QA 4ZEFA 3RUMA 4KCCA 1B6HA 5L9OA 1B9JA 4JWXA 4F3BA 1F9BA 3LUYA 3GZGA 3FJGA 5HPQA 3MUQA 3O2AA 2RC7A 4JSOA 1Y1MA 1AL3A 1JETA 4M4GA 1NNKA 2GFEA 3S2VA 1LGBC 1GTKA 1H44A 1B3EA 4YB6A 5I59B 5I2KA 3H6WA 4U23A 2XD2A 1OMPA 3IB1A 3M3LA 2Q2CA 1MY1A 4F39A 2F8DA 1XHYA 3FVNA 3W9VA 3C4MA 3VVEA 3T9XB 1UTBB 3K6WA 3VXBA 4RJZA 2VD3A 1UTHA 2V3UA 4I9DA 4ISUA 3K00A 3DELB 3IORA 1LB9A 2THIA 3OO9A 1US4A 2CMOA 5L9MA 2NXOA 2O68A 4LVQA 3UK4A 1MM7A 1LFGA 2XX9A 3ZS6A 4RK2A 3MW0A 1B52A 2ZXTA 2DE3A 4RK9A 4YICA 5L8DA 1DSNA 5CMBA 3TODA 4FJPA 1B32A 1VE4A 3FVGA 4HCWA 2X7QA 3G3GA 2DXYA 3G3HA 3HO7A 2QMWA 4R2FA 1UIUA 4AB6A 3Q29A 5AA2B 4I62A 3V83A 4IO5A 3HV1A 3K1MA 3OO8A 3LR1A 4ELRA 4I8CA 2RF1A 3TQLA 4OWDA 4F3SA 1SYHA 3USDA 3OSRA 2UVJA 3HHGA 3DLNA 1QVSA 4MBPA 4O3CA 4F1VA 2XD3A 2Q89A 2ONSA 2QS2A 1M5FA 3S9NC 1MQDA 1NL5A 3G3JA 1POTA 3PPPA 4N13A 2QL3A 1QKBA 3N6UA 4F31B 3EQ1A 1USYE 3V8XB 1UQWA 4LQ5A 1EH3A 2D3IA 2NOOA 4JBZA 3T9VA 3VDFA 3MVZA 3IO6A 3O6GA 3Q26A 3PUWE 2DP8A 1FCKA 5DEXB 4R6KA 3TTRA 5FHMA 1UTBA 4DCXA 1PB7A 1FTLA 3CVGA 2DOJA 4F19A 1JEUA 4BDNA 3FJ7A 2RKMA 3K01A 3U92A 4G77A 4Q8RA 2RCAA 4ZDMA 3G3KA 2PMSA 2GHBA 5CMCA 1FQCA 1Y3QA 4ND9A 5EYFA 1J1NA 4BDRA 3VV5A 3EPEA 3HPIA 3MQ9A 1XVYA 4RYAA 3A3UA 3OO6A 3MAMA 2V3TA 1MXWA 2M8CA 1QULA 2QMXA 3TFLA 3IAZA 2BJJX 2ESNA 3IR1A 4FE8A 1P1NA 1Y3NA 1PBPA 4OXVA 4ZS9A 1LCFA 5AA2A 5H8NB 4PE5B 2P1SA 2REJA 4F3PA 4ONYA 1Q1KA 2Y7RA 2DS9A 5A5XB 4YZZA 4HS7A 5FHNA 3K4UA 1ZTYA 1MPCA 1B3LA 2QS1A 4OFJA 3PD8A 2I49A 4YMAA 1OVTA 2DQVA 3O66A 3B7DA 1GGGA 4QFNA 4ECFA 3DP6A 1PB8A 3IB2A 3W15C 2AL5A 1N84A 1H43A 4Z7EA 5CM6A 1DOTA 1IQ7A 3UA8A 1VSOA 4AB5A 1MS7A 2R9JA 3ILTB 1IITA 4XKNA 3JZJA 1LBCA 3CIJA 2E0SA 2Z22A 4KPTA 4KYSA 2OBGA 4H67A 4NWCA 5ITPA 3IOUA 1B58A 3RT8A 2UXAA 3IOWA 4RNSA 3PMWA 5H8HB 2V25A 5ICTA 4AQ4A 3KOTA 2HAUA 1SW2A 3PUXE 4HTGA 3MJNA 2O6AA 4KR5A 4QFLA 3FXQA 2ZNUA 1GVCA 4R9FA 1SBPA 3C31A 1D3KA 3MPKA 3RT6B 5DT6A 2XX8A 5JK4A 1ZBMA 5FTHA 1B4ZA 5AE4A 3PPOA 5AA3A 1TFDA 3CG1A 1PB9A 4OENA 1BLFA 2REGA 1YAEA 2QPQA 4PFWA 2ZNSA 1NH7A 4IO2A 1JVYA 3FATA 2YLNA 5H8NA 4PQJA 4YAHX 2OK2A 4BDLA 4R9GA 1Y1ZA 3G3FA 3PUVE 2YPNA 3GBBA 3CSBA 4H0WA 5FHOA 3H06B 2A5TA 2ALUA 2RINA 5A5XA 4OVJA 2H4IA 3I3VA 5LOMA 4FATA 5AA4B 4R72A 1B4HA 2QS3A 4NF6A 3OD7A 4C1TA 4DE8A 1ZLQA 2O69A 4GRKA 3F11A 1O7TA 3HN0A 5I58A 2Q9TA 2I48A 1NKXA 3SEVA 1ZKBA 1VFDA 1MY2A 4IO6A 2A5SA 3GBAA 3E13X 3EHUA 1P1WA 3OEMA 1B05A 2O84X 3CR9A 1D4NA 1A54A 1FTKA 4EUOA 1Z7NE 3FVOA 2ABHA 4TLMB 1NMUA 4DIGA 1SI1A 3U93A 3VVDA 4BDOA 3EN3A 1ZU0A 4FEBA 3IX1A 5H8HA 5KDTB 4OFLA 3KSJA 3M3KA 2HQ0A 4E0XA 3O97A 1ZJLA 1MDQA 4DDDA 3K6VA 1FTJA 4UACA 5CI5A 4QF9A 3D4GA 1PBQA 2O1LA 3K0VA 5DYHA 3KJ7A 4FIMA 4L17A 5EHSA 3K1PA 1DPEA 3E3KA 2DXRA 3LSLA 2GHAA 3L6GA 4YMBA 1SW5A 1XOCA 2VOZA 3SDFA 3C35A 4P0IA 4OQOA 1ATGA 1QJMA 5BWJA 1LBBA 1I6QA 3TTLA 3RY3A 2UVGA 3MZ1A 2V93A 2F7CA 1JW5A 4ELQA 3B6TA 4MLVA 5AA4A 1S7YA 2Y7KA 1QUIA 1XS5A 2RCBA 3FJMA 4EXLA 4JWOA 2ANJA 1DTGA 2DWJA 1LAXA 4NF8A 5HM4B 4U4XA 4GFRA 1BTJA 3OMBA 3WAEA 2XXUA 4LATA 1B40A 5IAIA 3HSTA 3AXFA 4U1OA 1MM6A 4GD5A 2DSFA 4EDPA 4KHZE 2QS4A 1SDXA 1QW0A 2XX7A 1P1QA 1Y4TA 4GLIA 2QJEA 1FW0A 3SETA 3IJOB 4KI0E 3KZGA 2H9BA 4H6DA 4WEDA 2ZYKA 3TQWA 5KDTA 3TTMA 4THIA 2XXIA 4EQ9A 1N76A 2KLFA 3CSGA 3C32A 3C34A 3TZAA 2HZKA 1TXFA 3HHFA 5I2NA 2I58A 1FTOA 4ESXA 3TAJA 1RYOA 1M5BA 1US5A 3PGFA 4K3FA 2VD2A 4PFUA 1I69A 1XT8A 4OEVA 4KYEA 4QSDA 1A7LA 3PPNA 4QFKA 3RQTA 3FV2A 4GWOA 1H3DA 2DVCA 4OESA 2ONKE 1CB6A 3SERA 4ZEDA 2PVUA 3V5AA 2Y7PA 1A8EA 1FQDA 4F1YA 2DVZA 3RLFE 1JEVA 4HCYA 1SVXB 3QUJA 3QIMA 1R9LA 4NE4A 1FTMA 3U1OA 3CG3A 2DWAA 1DPPA 4O3AA 1YTVA 5JTYA 2F6PA 3TCFA 4G4PA 2G29A 3H6TA 3RN8A 4OFOA 4LQ2A 3EHSA 3VLWA 1R6ZA 3N94A 4LP2B 3JV9A 5B70A 3BFTA 4XKQA 3S9EA 4GOTA 4YB5A 3ZKKA 3IJXB 4R6HA 3T66A 1Y9UA 3EHTA 3FUZA 1M5CA 3MVYA 4OZ9A 4GXAA 1SW4A 4LONB 3ZSFA 1PC3A 4LZ5A 3UN6A 4EQ7A 3LC8A 4NF5B 4DLDA 5DVJA 3Q27A 1Z7ME 2Y7IA 3DP4A 5CMMA 4ZECA 2F36A 1B2HA 4XKRA 4MF3A 4KD5A 1O63A 3PUYE 4IO3A 2A5TB 1YPNA 2Y7WA 2Q88A 3IL1B 3RGYA 4TLLB 3O6IA 3A09A 1TFAA 5DVIA 3IK6B 5K2XA 3FD3A 3PU5A 1S50A 2F35A 4NF6B 4IO7A 2F34A 1MQHA 2ONRA 2X7PA 1L5TA 3KFMA 3KN7A 4F22A 3H7MA 1Y20A 1EU8A 3R26A 5I58B 4LUBA 4NMYA 1IUDA 1MPDA 1MY0A 3N5LA 1OLCA 1QKAA 4MLQA 3M8UA 4H8IA 4G8MA 4OHNA 5CMKA 1I6AA 4GL8A 3H6VA 1UIVA 5TP9A 2XXRA 3Q25A 5DVFA 3S4UA 4E0WA 1DMBA 2D5WA 1IXCA 3LSWA 4F3GA 5TU0A 4IY5A 4PFTA 4Q0CA 2UVHA 3K02A 2GH9A 1B46A 3O6HA 4JDFA 2PBWA 2AL4A 3TCGA 4Z0IA 1MY3A 3R6UA 3OELA 4HW8A 1BP5A 1LAGE 3TPAA 2ZYOA 4EXKA 3UGWA 4ZEIA 4DXUA 1GR2A 1MXUA 1P1OA 1IEJA 3G3IA 1B0HA 1VR5A 2ZYMA 2OZZA 1B5HA 4H5GA 5JEIA 2XXVA 2F97A 4P0GA 3UP9A 2XXTA 1LSTA 1H45A 3T96B 1BIYA 4BDMA 2QRYA 4DXCA 4JXIA 3OSQA 4NF5A 3ZKLA 3K1NA 3UORA 1EZPA 1MPBA 5CRYA 3RTWB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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