3RTFB

Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rtfB02
3DELB 4BLAA 2QRYA 3UP9A 1NNKA 2YLNA 1AIVA 5FHMA 3MJNA 3T22A 1QW0A 2F7AA 1S7YA 5I58A 2G93A 4GLIA 1B6HA 2I4CA 3EN3A 4QSCA 4X1BA 3GZGA 3SESA 3BKIB 3QYTA 4LVQA 5JK4A 3RN8A 2RKMA 2ONRA 1IZ1A 4H6DA 4DCYA 3PMVA 1S50A 3ZKKA 3W9VA 2QS3A 3CSGA 4WEPA 1SI0A 4ZEBA 1FCKA 4RK9A 4C1TA 3BBRA 4WEDA 4THIA 2F7BA 1NNPA 3R26A 1LGBC 4ZE8A 1XVYA 3IB1A 4Q30B 1VFDA 2XXRA 1JVYA 1POTA 1HSJA 4QHQA 1MH3A 1DOTA 4EQ9A 4ISUA 1LLSA 1NL5A 1H76A 3U1OA 3IJXB 4NE4A 4IO6A 3U93A 2ALUA 4H1XA 2UYFA 1USYH 4YKIA 4JWXA 3DP8A 3LSLA 2Z22A 4O3CA 4F3PA 2XD2A 5AA2D 2F36A 3FUZA 3FJGA 2AL4A 3QXMA 3QK6A 3UGWA 5DEXA 4ECFA 4RJZA 4Q0CA 1QUKA 2CZLA 5AA2A 3FXRA 3K00A 4OQOA 3U72A 3FGSA 4NMYA 4IO4A 4F3GA 4FORA 1B4HA 3TZAA 3JV9A 2HAVA 1MQGA 4IO7A 3W9WA 3SEWA 2D3IA 3PUYE 3TCHA 5BWJA 4FE8A 4FEBA 1Y1MA 4N13A 3H6VA 3G3JA 3C34A 1UIUA 2NWJA 4F22A 4O3AA 3KOTA 4OWDA 1TT1A 2DWHA 1IUDA 2UVGA 3UORA 1B52A 1MM6A 3THIA 3IK6B 3H06B 4RY1A 3VVDA 1MXYA 1J1NA 4M4GA 1B32A 4R72A 4ZZAA 4IB2A 3V83A 4Q8RA 4EQ7A 2Y7WA 1UTBB 3K0VA 3K6WA 1FTOA 2F78A 1B3FA 3MVYA 3TODA 3BFTA 3FV1A 4YB5A 4IY6A 1A8FA 5HBCA 1NMUA 3TTLA 3H6TA 2QMWA 4U4SA 2R71A 1B7ZA 3CVGA 4OFOA 4E0WA 4KR5A 5L8DA 3WAFA 5AA4B 3N6TA 4G2ZA 3VLVA 3FVKA 4OZ9A 2R9JA 1A54A 3EHSA 3PU5A 2A5SA 3C9HA 1MM7A 4O3BA 2RF1A 1B2HA 4H5FA 5ELVA 1MQJA 4GL8A 3D4CA 1ELJA 3OEMA 3QIMA 3G3FA 5CRYA 1II5A 3RGYA 3H03A 4R6YA 2QJEA 4U1OA 3ZS6A 2I6EA 1VSOA 3E13X 1L5TA 2ZYMA 5EYFA 1D4NA 4MLQA 4ELOA 1P1WA 2LAOA 3FD3A 3K1NA 2OJTA 3Q25A 1AMFA 1QVSA 2OK2A 3E4RA 5ICQA 4L17A 4IY5A 3TCFA 3LBSA 5EHMA 3UK4A 4ONYA 3U94A 1BLFA 1QKAA 4LP2B 4G8HA 1XT8A 3OO8A 1OQHA 1US5A 4OENA 3M3KA 1P1OA 4TQUQ 3IOVA 1MDP1 1M5CA 4YKKA 1QULA 4NEDA 3P7IA 2UVJA 5H8FA 4PFWA 1LBCA 2HFBA 1AL3A 2D5WA 2GFEA 2DQVA 5H8HA 4R9FA 1B3EA 2REJA 4FECA 1TWYA 4PQJA 3FV2A 1PEBA 4QFKA 4DXCA 3IL1B 5IKBA 4JXIA 2GHBA 4XKQA 4N07A 3KBRA 4U23A 4RK2A 2F8DA 1GR2A 3T96B 4QFNA 1IXCA 1I69A 2M8CA 1VFEA 1NKXA 4DZ1A 2NUVA 1A7LA 3G3HA 1MQHA 4MF3A 3S2VA 4G68B 5IAIA 1N7WA 4DCXA 1Y1ZA 1QUIA 4EF2A 3MVWA 4R2FA 3O2AA 4ZECA 1MDQA 4G77A 4JSDA 3CIJA 3TEPA 3QSLA 4YAHX 1R1NA 4QSEA 4GD5A 3OO6A 3HHGA 5KDTB 3CG1A 4TLLB 4HS7A 1P1NA 3TCGA 1B51A 4F31B 1Q35A 3DP6A 3H6WA 3C4MA 4ESWA 3QUFA 4DIGA 2IEEA 3MZ1A 5I2KA 2X7PA 1H3DA 3Q28A 1B7HA 4R6KA 4Q5TA 3KN7A 1JETA 4EQBA 5A5XB 1Y3PA 2AYSA 4AB5A 3RY3A 3USDA 3H6UA 1FW0A 3HO7A 4NF6B 5DVJA 3SERA 3UA8A 3N94A 2Y7IA 1MPDA 3Q27A 2A5TA 3G3IA 4OFJA 1HSEA 4R2BA 3KN8A 3MC2A 3VLWA 1F9BA 4KYDA 1FQAA 3K2DA 2FNCA 2ABHA 3K1MA 1LB9A 4YB6A 4LONB 3C32A 3CI8A 2XX9A 3U8QA 5I2NA 1QKBA 1ZTYA 2QPQA 3TTMA 3MZ9A 3EF7A 1NFTA 4XKRA 3O6IA 2UXAA 1ANFA 3VXCA 2KLFA 1LFIA 3K6XA 1MPBA 3OXNA 3G3KA 4LZ5A 2OWTA 4HCWA 5JTYB 2QS4A 4FATA 1BP5A 3B6TA 5AA3A 1B0LA 4XXUA 5I56B 4DXUA 4P0IA 3VLUA 5F7VA 3MPKA 4POXA 5KCJA 4GVOA 4F3SA 4BDRA 3PUZE 1XC1A 4YKPA 4OTEA 3B6WA 4LZ8A 4M1VA 3SEXA 1LSTA 1P99A 4G8MA 3KGCA 1M5DA 2F34A 3Q26A 4ZEIA 5ICTA 1DMBA 1P1UA 1M5BA 3OMBA 1DTZA 4YMBA 1A99A 2CMOA 1XHYA 4F3BA 1OVTA 3MVXA 3H3GA 2R6GE 3QAXA 5I57B 4H0WA 2ZNTA 2Y7KA 4XKPA 4TOZA 1RYOA 1YPNA 1DSNA 2THIA 3IB2A 2ANJA 1OLAA 1IQ7A 2O51A 3KSJA 4RPNA 3D4GA 4QFLA 3VVFA 3FXUA 1IIWA 2I48A 3FVOA 1FQBA 1TXFA 3JYRA 3DM0A 3ONMA 4I9DA 1EU8A 1SD3A 3MP6A 3O28A 4KYEA 2I0CA 4ZDMA 1MY0A 4RPOA 4MFIA 3A09A 3FIRA 4JWYA 3VE1B 2QSXA 2RCAA 1US4A 4KCCA 3HV1A 4JWOA 2WKYA 4MH5A 1MQDA 5I59B 4F18A 5HM4B 1PB8A 2QL3A 2B3BA 2VHAA 3TELA 4OHNA 4OESA 2P1SA 1ZBMA 5FTIA 2V3QA 3KSXA 3CFLA 1Y20A 3AXFA 2DXRA 4NWCA 1ATGA 3RUMA 3CFXA 5DT6A 4Z0IA 1PB7A 3KZGA 4IO5A 4GIZA 1P1QA 1PBQA 4LZ7A 5DYHA 4FEDA 2XX8A 3VDFA 3S9MC 3MP8A 5J1DA 3MZBA 5FTHA 3PD8A 4ELRA 4OMBA 2DXYA 2I49A 1R9LA 3IORA 4RA1A 1JW4A 3S9NC 5DTBA 1QUJA 4BDOA 4OEVA 1LAGE 1DTGA 3ECRA 2QMXA 4U22A 4R9GA 2F6PA 2PT1A 1MG1A 1N0TA 1Z7NE 2B3FA 3TPAA 1D3KA 4F39A 2DWIA 3LSWA 2XXUA 4EXKA 3FVGA 2H5YA 2PBWA 3TYHA 4LATA 1IXIA 4GQOA 3T66A 1SYHA 5K2YA 2H25A 1B9JA 1YTVA 5CBSA 2XHDA 1UTBA 1H44A 2VOZA 2HZLA 3TTRA 4GWOA 4HW8A 4NF5B 4PFYA 5TPAB 4JSOA 1QJMA 2DS9A 1Z7ME 1OLCA 3TMGA 2PX1A 1EZOA 3K02A 4EUOA 2QS2A 3HHFA 1LCTA 4I1DA 3V5AA 1OMPA 2O69A 4PE5B 4X48A 5AA4A 1UTHB 3SDFA 1Y4CA 3G7WA 5B7DA 1EZ9A 3OOAA 1MXUA 2DE3A 2ZYOA 4YKJA 4H8JA 2IA4A 3IAZA 4U1ZA 4RYAA 1JEVA 1MY2A 1NNTA 2X7QA 3LSXA 1GTKA 1PDAA 3M3LA 1B5JA 1PB9A 1UIVA 1O64A 2O1MA 3K01A 2H9BA 3CFZA 3T93B 4LA9A 4U2RA 1T0KA 4C1UA 1TFAA 3OO7A 1LBBA 3PV0E 1MPCA 2X26A 1OIBA 4PP0A 1AH5A 4ZEDA 1R9QA 3T9HB 1BTJA 4BDLA 1SW4A 3S4UA 3VV5A 2XXHA 3CSBA 2OCUA 1ZU0A 2RC8A 4H67A 1N84A 4IGTA 3M3FA 4NF8B 3FZVA 3IOTA 2DE4A 1WDNA 4NF4A 2Y7RA 1LCFA 2GH9A 2V3TA 2Z8DA 2OWSA 3LR1A 1B3GA 5I84A 2D21A 3MUQA 1RKMA 1N76A 3K1PA 1BKAA 4YZZA 3KJ7A 2VD3A 5DVIA 4QFOA 2ZMBA 3ILTB 2Z8FA 4N6PA 1GGGA 1MY1A 1PC3A 1UQWA 5H8QB 4DLDA 4Z7EA 1URSA 1B3LA 3I5OA 1XVXA 3EPEA 3DP4A 4TLMB 1JQFA 3MPLA 2XXIA 1A8EA 3T9VA 4U21A 1FTKA 3TAJA 5TP9B 4F2OA 4G68A 4JBZA 4G8NA 3JZJA 3CG3A 3FASA 2BJJX 2O7IA 1JW1A 2GRVA 4WXJA 3O97A 3CRBA 3KEIA 2ZXTA 4R74A 3TTKA 3V8XB 4YMAA 4F19A 1JVXA 2REGA 5K2XA 1ZIUA 3SEYA 3IX1A 2UVIA 3B6QA 2XXWA 4IO3A 3PGFA 5KDTA 3H4ZA 4K3FA 3PPRA 1LAXA 3IOUA 2PMSA 3ZKLA 4QFPA 3DLNA 3IO4A 1N7XA 1ZLQA 2H99A 1OVBA 1NH7A 4KPTA 4H8IA 3RLFE 5CMKA 1LFGA 3MW0A 1LAHE 3ODBA 5A5XA 4XKNA 2O84X 1LB8A 2HZKA 4NF6A 1Y9UA 3K6VA 3KN3A 3M8UA 3F11A 5HPQA 1HSLA 3FXQA 1A55A 1MY3A 2GHAA 1IXGA 5CMCA 1USYE 3VFJA 4I8CA 5JEIA 4KQPA 4UACA 1D9VA 3MQ9A 2VGQA 3I3VA 2DSFA 5BUUA 3FVNA 3PPOA 3N6UA 3LSFB 2V93A 1NH8A 3VVEA 1R6ZA 2VP1A 4GRKA 3O9PA 1MXZA 5H8NB 2E0SA 4QSDA 1O63A 4OEUA 2Z8EA 2QS1A 2P0SA 4ESXA 1GVCA 3U92A 3S9LC 5I58B 3C35A 2ZNSA 5JTYA 2XXTA 4YU0A 1SQYA 4BDNA 1B1HA 3BFUA 1I6QA 3KG2A 5I56A 4YB7A 1IEJA 3OSQA 1JEUA 2ZYKA 2I0BA 4OXVA 4LQ2A 4H5GA 1BIYA 1S9TA 1B46A 1MH4A 2Q89A 4E0XA 4F29A 2XXXA 4U4XA 1OQGA 4RNSA 3E9XA 3EQ1A 5ISUA 3PUWE 4X1DA 3I6VA 3EHTA 2I3WA 2Q9TA 1GV8A 1N04A 4GOTA 1XOCA 3IR1A 3PD9A 2Y7PA 1D9YA 3MWBA 1B1XA 3SEVA 2I58A 5I57A 1B40A 4IGRA 4F1VA 1JNFA 2OBGA 3RPWA 1SVXB 2B65A 3C31A 2DWAA 2O1LA 3G3GA 4R73A 1B05A 1I6AA 1TFDA 3PUXE 3TDJA 5B70A 5AE4A 3IOWA 5DEXB 1MS7A 4H65A 1B0HA 4HCYA 1CE2A 2FYIA 4JDFA 4ND9A 5AA2B 1URGA 1RYXA 4EDPA 3W15C 3RTFB 1EH3A 4ELQA 2V84A 4BDQA 3TUSA 1B3HA 3N5LA 2F5XA 5L9OA 3OD7A 5CI5A 5EHSA 2H4IA 3OEKA 5CC2A 5I59A 3ILUB 4PETA 1IITA 3TKDA 1ZJLA 3SKPA 3OSRA 3PMWA 4R6HA 1POY1 1M5EA 4FIMA 1NNFA 1H43A 4KCDA 2Y84A 2F35A 2XX7A 4P11A 3TFLA 2XXPA 3OENA 4OVJA 3PUVE 4RXLA 3UIFA 3O6GA 3RT8A 3IJOB 1SW5A 3PPPA 4OFLA 5M2VA 4F2QA 3MVZA 3GLBA 1PBPA 1B4ZA 2Q8JA 4DXBA 4EXLA 4LUBA 2YJPA 1SDXA 5ITOA 3R7XA 3N26A 3EHUA 3LC8A 4GF8A 4ZZEA 2Q2AA 3H7MA 4X9TA 3T9UA 1WVJA 4OETA 5CM6A 5L9SA 2RINA 3K6UA 1WODA 4KFQA 2ONSA 2RC7A 3B7DA 3MAMA 1B5HA 1M5FA 3PPQA 4ELPA 4NF5A 4ZE9A 4JB7A 5TPAA 5KZTA 4PFTA 3E3KA 4FJPA 4AB6A 4NWDA 4FAJA 2DWJA 1FQEA 3A3CA 3HN0A 3UN6A 1IXHA 4YICA 1UTHA 2XXYA 2ZNUA 3CR9A 4XIGQ 1MY4A 3ZSFA 3IO6A 1MQIA 5TU0A 4ZEKA 4R75A 3PPNA 5DVFA 1MXXA 4F1YA 3HCQA 3OELA 5FHOA 4IO2A 2P2AA 1A40A 3L6HA 2FA7A 1SBPA 1FQFA 2AL5A 2O68A 1B58A 2Z23A 3KFMA 1MXVA 1FQDA 4I62A 5H8FB 1Q1KA 1XS5A 2NVUB 4MBPA 3TTNA 2DVZA 1Y4TA 5H8HB 1I6BA 4KHZE 3C33A 5F1QA 3LUYA 1DPPA 4GL0A 4NF4B 1FQCA 3MP1A 1FTLA 3Q29A 3KOSA 5H8SA 4QRZA 2PT2A 4MLVA 4POWA 2V25A 1URDA 2RCBA 2PVUA 3L6GA 1B7UA 4G4PA 2DYXA 2XXVA 2DP8A 4NF8A 5AA1A 3WAEA 1AOVA 2HCAA 4NTLA 4UA8A 1VE4A 1LFHA 3C36A 3FJ7A 2DVCA 1MRPA 3RT6B 4PFUA 1VR5A 2HQ0A 2Q88A 4AQ4A 4XTCQ 5ITPA 2G29A 1YCJA 2O6AA 1B5IA 4LQ5A 1SYIA 4DE8A 3S9EA 3O6HA 1DPEA 2HXWA 3OO9A 3QUJA 5H8QA 2F6GA 1JW5A 1ZMGA 4GFRA 3GBAA 5LOMA 1KWHA 3SETA 2I3VA 4ZS9A 2V3UA 4GXAA 4KI0E 3SEUA 4F1UA 1SW2A 2UYEA 1FTMA 5TP9A 5I2KB 3V89B 3KJTA 3A3UA 2VD2A 2DOJA 4KD5A 4OERA 1SW1A 2F97A 3O66A 4BDMA 2OLBA 2DE2A 2ZYNA 5L9MA 3R6UA 2HAUA 1YAEA 3O29A 3T9XB 2UVHA 4DDDA 4OYVA 3GXAA 2I4BA 2XXQA 3VXBA 3RNNA 3TQWA 2ONKE 3IB0A 2A5TB 4EF1A 1Y3NA 2OZZA 2NXOA 4QF9A 1SI1A 4C0RA 1MXWA 4ZEFA 1FTJA 2F7CA 1H45A 3TQLA 3FATA 3PMXA 5CBRA 1N3XA 3HPIA 1EZPA 3GBBA 2Q2CA 5CMMA 5I2NB 2AIXA 4P0GA 2W7YA 2E1SA 1ZKBA 2NOOA 3K4UA 5CMBA 2HEUA 2RC9A 1CB6A 1Y3QA 4G68C 4KYSA 2H98A 4WKMA 3FJMA 4HTGA 5FHNA 1N3WA 3MBPA 2ESNA 2YPNA 2XD3A 3RQTA 1O7TA 5KCJB 3RTWB 2O7UA 4GXSB 2PYYA 1LAFE 3HSTA 5H8NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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