3T93B

Glutamate bound to a double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t93B02
5ISUA 3ILUB 4NF8A 2H98A 2VD3A 2M8CA 2F97A 1LBCA 4OESA 1NNTA 3CG3A 1B3HA 5DTBA 2ZMBA 2QS3A 4DDDA 3PPRA 4K3FA 4LVQA 4XKNA 4GXSB 4MLVA 3PPPA 4F2OA 5I56B 2DWJA 2R71A 1TFDA 1T0KA 4OFOA 5FHMA 4EUOA 2FYIA 1A8FA 3TDJA 1IXIA 1FW0A 4EQBA 3FATA 1FTKA 1ZIUA 2F34A 1B40A 2AYSA 1JEVA 3SESA 1NMUA 4BDNA 4JWXA 4ZEBA 4U4SA 4GQOA 2GFEA 4R9GA 4G68C 4NEDA 1JW4A 3TPAA 3IO6A 1DSNA 1IUDA 4HCYA 3PU5A 3KFMA 4NF6B 5CBSA 4Q8RA 1UIVA 1JEUA 2ESNA 5TPAA 3OXNA 3TTRA 3CSGA 4RYAA 1MXXA 1TWYA 4F22A 4MF3A 4I9DA 1NL5A 1N04A 3PPNA 4E0WA 3O2AA 4BDRA 5A5XB 4F29A 3K02A 3FGSA 2D5WA 1I6AA 4JDFA 4Q30B 1UQWA 4GLIA 1QKBA 2X7QA 3PUYE 4QFLA 1ANFA 5DVJA 4LONB 2Y7IA 4ZECA 1FQDA 3B6WA 4F1UA 1JVYA 3HCQA 1B0LA 3MPKA 4OETA 2F36A 4GRKA 1UTBA 1M5CA 2D21A 3P7IA 5F7VA 3OEMA 3R6UA 3DP4A 3OO7A 4TOZA 4LZ8A 2XXXA 1FCKA 1OVBA 4OVJA 5H8HA 1GTKA 4O3AA 3TZAA 1FTOA 1MY4A 5ICTA 4LP2B 2O6AA 1II5A 5B70A 3ZKLA 4NF4B 1GV8A 4N07A 3FXUA 2OK2A 4X1BA 3FZVA 1ATGA 2QS4A 3ZSFA 3H6TA 4LUBA 3UIFA 3K4UA 3QIMA 4PFUA 3T9UA 1Q35A 4IO4A 4PP0A 3GBBA 5H8NA 4KYEA 2P1SA 2ZYMA 2Z8FA 4POWA 4OEVA 1AIVA 1B7HA 3KEIA 3I3VA 1P99A 5H8SA 3TELA 3N5LA 1A55A 4ECFA 4R73A 4OZ9A 4WEDA 4XXUA 3SERA 3DLNA 1B51A 4KD5A 2DP8A 5H8QA 4M1VA 3IX1A 4XTCQ 4H65A 4ZE9A 3SEXA 3MVXA 2O1MA 3G3JA 2AIXA 3QK6A 1OLCA 1SQYA 4KI0E 2Y7PA 1D9YA 3QUJA 1LB9A 1IIWA 2RC9A 1P1WA 4LZ7A 3MWBA 3EN3A 3IO4A 4QSDA 3VVEA 3VVDA 2G93A 2I6EA 2RCBA 2OJTA 3C32A 1SD3A 2DXYA 4RA1A 2Z8DA 1R9LA 3PMVA 1VFDA 1B5IA 2RINA 2XX7A 1ELJA 1MPDA 5IKBA 2B65A 2O68A 2A5TB 1OQHA 4H6DA 1FQFA 2BJJX 2GHAA 4PE5B 2ZNSA 3L6GA 4R2FA 1Z7ME 1N3XA 4QFKA 3OSRA 1DTZA 4QRZA 4IGTA 4FECA 5I59A 1POTA 1FQEA 3V83A 2GH9A 3LC8A 3TUSA 5AE4A 1MPBA 2DQVA 3DP8A 3IAZA 1FTMA 4ZS9A 3FUZA 5JTYB 4GIZA 3PMWA 3H6WA 3GXAA 1H45A 1ZJLA 4LZ5A 4QF9A 1Y3PA 2RF1A 3KN8A 3E4RA 3FIRA 2XXWA 4YU0A 1B7UA 2P0SA 3VVFA 1US5A 3C34A 4ESWA 1GGGA 1D3KA 5DEXB 2LAOA 3OSQA 3TCFA 5JEIA 1A40A 1PB8A 5HM4B 1MY0A 3O66A 4YKKA 2OCUA 2H5YA 4P0IA 3JYRA 2QS2A 1B3FA 3H03A 3MJNA 4G68B 3KSJA 1EZ9A 1FQBA 3SETA 4QFOA 3PUVE 3C4MA 5HPQA 3TCGA 1D9VA 1IITA 2VHAA 3C36A 3FVNA 2XD2A 3IK6B 4DCXA 1IXGA 5DVIA 3DELB 3TCHA 3DP6A 5I57B 1JW5A 1SVXB 3ODBA 4WEPA 4QFNA 4ZEIA 4NF6A 2ZNTA 1NH7A 4KCDA 3FJGA 3PV0E 3QUFA 4G2ZA 3CR9A 5AA2D 1D4NA 2GHBA 4XKQA 4LATA 3S2VA 1R9QA 2QL3A 3MAMA 2Y7KA 4RK2A 2P2AA 5A5XA 5CMCA 3K1PA 4UA8A 4AB5A 1LAXA 3HV1A 4IY5A 1MQHA 2FNCA 3IB0A 2Z8EA 1R1NA 1LCTA 3KN7A 2OLBA 3JZJA 1B5HA 3TAJA 1VSOA 4YB6A 1MRPA 3CI8A 4GL8A 5CMMA 3TQLA 2V3UA 4NF5B 4FEDA 1B3LA 3G3KA 2HCAA 2F7AA 5I58B 1LFIA 1POY1 4OFLA 2UYFA 3MP6A 3HO7A 3Q27A 4DXBA 3M3KA 1IEJA 4OFJA 4R75A 1VFEA 1M5FA 4GOTA 2DS9A 4N6PA 3VLUA 4GL0A 3E3KA 3VFJA 5KDTB 3F11A 3VLVA 4IY6A 1JETA 4H67A 2I4CA 2QMXA 4QFPA 2DXRA 3MUQA 2I0BA 2Q8JA 2IA4A 1Y20A 3PD8A 3PGFA 2I0CA 2V93A 3HN0A 1FTJA 2ZYOA 5I84A 3CSBA 1XVXA 3EHUA 4YZZA 3KOTA 3GBAA 2F8DA 2XXIA 3IOUA 2UXAA 3OMBA 4JWYA 3C33A 2XXVA 3LSXA 3I6VA 3MPLA 4OERA 5CMBA 3KZGA 3MZ1A 1B9JA 3FVGA 2REGA 1A7LA 1ZTYA 4ZZAA 2ABHA 3VV5A 2QS1A 1PBPA 1SI1A 3U8QA 1DTGA 1NNFA 3N26A 4R9FA 1SI0A 3QXMA 4YKIA 2W7YA 4I1DA 1NKXA 4OENA 4JBZA 3TTMA 4PFTA 2THIA 4U1OA 5AA4B 3H6VA 2A5TA 3T9XB 4ISUA 5EYFA 3OENA 3N6UA 1NH8A 5FHNA 3O6IA 3OOAA 2DOJA 3FJ7A 1UTHB 3U93A 3FASA 1MDQA 1MM6A 3E9XA 1B5JA 4FIMA 4ZEDA 3H7MA 2UVIA 1WDNA 3RN8A 4TLMB 5K2YA 1MQIA 1N7WA 1JQFA 4NMYA 1OMPA 5EHMA 1KWHA 1MQDA 1ZBMA 3T93B 1MS7A 2UVJA 2ZYNA 4LA9A 1BLFA 2XXYA 1BP5A 1FTLA 4FE8A 2XXQA 1US4A 4R74A 4NWCA 1S7YA 5CC2A 3IL1B 5DYHA 4QSCA 3PPQA 3OEKA 1MPCA 3EPEA 3TTLA 1Y1ZA 2O84X 5I2KB 1MM7A 1P1QA 2PVUA 5IAIA 1JNFA 2PYYA 2DVZA 1PB9A 4C1TA 3KG2A 1I6BA 1O63A 4G68A 3G3HA 1B4HA 4YKPA 3PPOA 3SDFA 1GVCA 3A3UA 1DMBA 1TXFA 4YKJA 4F1VA 5TP9A 2ALUA 3U92A 3T22A 3S9MC 4AB6A 3O6GA 1EZPA 2GRVA 2OZZA 1Y4CA 4F39A 1CB6A 4ZEFA 1XHYA 1PEBA 4U4XA 2NVUB 3S9NC 3U94A 3FD3A 1USYH 4F19A 1LAGE 3K1NA 2YLNA 3H4ZA 1Y9UA 2OWTA 3CVGA 3UORA 4GD5A 4EQ7A 3CG1A 2OWSA 3TMGA 3ONMA 4N13A 3MZBA 3VDFA 1P1NA 4ONYA 5CBRA 2QPQA 1LFGA 1FQAA 3K1MA 3M8UA 1H76A 1MXYA 2DWAA 3Q25A 4U23A 5CMKA 3UGWA 3PUWE 1QW0A 3IORA 3WAFA 5KCJB 4RK9A 4NF5A 1PDAA 4HCWA 4YMAA 1B05A 2I58A 2UVGA 5I58A 3FVKA 5J1DA 4ZE8A 3PD9A 1NNPA 4AQ4A 3LUYA 4ELPA 3O29A 4GFRA 3QSLA 5B7DA 4ELQA 2PT1A 2H99A 1UIUA 1FQCA 1BTJA 4GVOA 3UP9A 1Y1MA 3K01A 4GWOA 2HEUA 1MXVA 3A09A 3HPIA 1ZMGA 5BWJA 5KDTA 1A99A 3RT8A 4M4GA 4TQUQ 4E0XA 3TQWA 4XKRA 2RC7A 1BIYA 1MXWA 4UACA 2F7CA 2X26A 2YJPA 3SEUA 3ECRA 3RTFB 4F1YA 3B7DA 3W9VA 5ICQA 5H8HB 1OQGA 3MP1A 1F9BA 2Q2CA 1N7XA 1XS5A 1A8EA 4L17A 1I6QA 2KLFA 4NTLA 2V3QA 5JK4A 2DE2A 5I56A 2RKMA 4DIGA 2XXRA 3I5OA 3K0VA 4GF8A 1EZOA 4DCYA 4ND9A 2O1LA 1URDA 3S4UA 4ELRA 3IB1A 1CE2A 3VE1B 2O69A 5L9MA 2O7IA 1R6ZA 3CFLA 5H8NB 1M5EA 2XX9A 1HSJA 3G3IA 2HXWA 3E13X 1B0HA 2VD2A 4RPOA 4JSDA 4BDOA 5H8QB 2HAVA 5AA4A 1B3GA 1SBPA 5FHOA 3B6TA 3T66A 4G77A 3H3GA 4OTEA 3W9WA 3MVZA 3KBRA 3OD7A 4U2RA 4FAJA 4HS7A 1LAHE 1UTHA 3G3FA 4R2BA 2HZLA 4IO3A 4BDLA 4LQ5A 1OLAA 3IJXB 3KOSA 1Q1KA 1B7ZA 2ANJA 1AH5A 4HW8A 4FEBA 3RLFE 4O3BA 3FJMA 4DE8A 4ZDMA 1AL3A 3IJOB 2XXHA 4H1XA 2OBGA 4OEUA 1IXCA 2HQ0A 4F2QA 1PBQA 1QVSA 1LSTA 3HSTA 3BBRA 4OWDA 3D4CA 1N84A 2ONKE 4PETA 2QRYA 1MQJA 3LBSA 3O28A 3TKDA 3FXQA 2B3BA 3OO9A 1URGA 3JV9A 4F3BA 4IO2A 1ZKBA 4NF4A 3T9HB 4FATA 1M5DA 1YPNA 1QUKA 2CMOA 2NUVA 5ITOA 2VGQA 4JSOA 3L6HA 4BDQA 2ONRA 5DT6A 2HZKA 2RCAA 2NWJA 1LBBA 3Q26A 5AA2B 2I48A 3ZS6A 3G3GA 3MVYA 3CFXA 4X9TA 3WAEA 4RNSA 2DWHA 3MZ9A 2IEEA 3RNNA 3IB2A 3O6HA 1AOVA 4XIGQ 1MY1A 2ONSA 3PUZE 3S9LC 5I2NB 3MQ9A 5LOMA 3A3CA 3S9EA 1LB8A 1URSA 2XD3A 1IXHA 3O9PA 2DE3A 3IR1A 5TU0A 2QSXA 2UYEA 3M3FA 2F5XA 3OELA 1PB7A 3U1OA 3BFTA 2Q88A 2Y84A 3N6TA 3EHSA 1J1NA 3CRBA 3SEVA 3RY3A 4EDPA 3ZKKA 4KCCA 3ILTB 3LSWA 5CM6A 4R6KA 1HSEA 4YB5A 5EHSA 2XX8A 1GR2A 1MXZA 3VLWA 4R6YA 4WXJA 2I3WA 3U72A 4I62A 5H8FB 5M2VA 2Y7RA 3FXRA 2AL4A 2V25A 4WKMA 3IOVA 1XT8A 2G29A 1SW4A 3B6QA 3AXFA 1N76A 3BFUA 3KGCA 4IB2A 3K6WA 4KYDA 2V84A 1SW2A 1B46A 1QULA 3KN3A 2F6GA 5KCJA 3DM0A 3W15C 3V89B 4DXCA 3K2DA 1VE4A 3BKIB 2O51A 2PX1A 4RY1A 4PFYA 2NOOA 4YICA 1P1OA 5KZTA 2I49A 3IOWA 5JTYA 4KR5A 4P11A 4F3GA 5L9SA 4JXIA 1EH3A 2VP1A 3MW0A 5ELVA 3K6VA 3RUMA 1LFHA 2DVCA 5HBCA 2Z23A 3R7XA 1B6HA 5L9OA 4POXA 4H8IA 2F7BA 4C1UA 4QHQA 4O3CA 1LAFE 1MG1A 4KYSA 5CI5A 4THIA 3TFLA 4PFWA 3OO6A 3TTKA 1ZLQA 3Q29A 5DEXA 1B1XA 4EF2A 3H06B 3TTNA 4X1DA 3RPWA 4G8NA 3MC2A 2X7PA 3RGYA 4IGRA 3SEWA 1YTVA 2F6PA 1SDXA 4EXKA 3VXCA 1RYXA 4NF8B 3SKPA 4EQ9A 2DWIA 2PBWA 4RPNA 3V5AA 2I3VA 3O97A 1RYOA 4RXLA 1QUIA 3K6XA 3Q28A 3USDA 4OXVA 2R6GE 5I57A 1NNKA 1B32A 1Z7NE 3EHTA 5F1QA 3MVWA 2NXOA 4U21A 3TODA 4G8HA 3KJ7A 4H0WA 2B3FA 1O64A 4Z7EA 3IOTA 4P0GA 1Y4TA 3UK4A 4OMBA 2VOZA 2CZLA 4ZZEA 2I4BA 3VXBA 4U22A 4DXUA 4ESXA 3GZGA 1ZU0A 4IO5A 4Q5TA 1MH4A 3GLBA 3FVOA 2DSFA 4H5GA 3LSFB 5CRYA 3C31A 1HSLA 1L5TA 3HHGA 4F31B 4MLQA 2Z22A 4G8MA 4TLLB 1MDP1 3C9HA 2H4IA 4NE4A 2FA7A 5TPAB 3M3LA 5K2XA 4H8JA 1QJMA 3C35A 1OVTA 3QYTA 1XOCA 2XXPA 4JB7A 1M5BA 4DZ1A 3PMXA 1AMFA 2Y7WA 2H9BA 3KSXA 1USYE 3SEYA 3H6UA 5FTHA 1N3WA 3T96B 4ZEKA 2F78A 2O7UA 4MFIA 1B4ZA 1PC3A 1WODA 1B1HA 1EU8A 2HAUA 1DOTA 1JVXA 2A5SA 1NFTA 5AA2A 4ELOA 4HTGA 4DLDA 4QSEA 5ITPA 1UTBB 3V8XB 1WVJA 2R9JA 4G4PA 1TT1A 1DPEA 1N0TA 4KFQA 1LGBC 3THIA 1H44A 1YCJA 3FV1A 5I2NA 4KPTA 2WKYA 2DE4A 2H25A 2QJEA 1TFAA 2Q89A 3FV2A 3RT6B 2PT2A 4MH5A 2D3IA 2QMWA 2REJA 4KQPA 1YAEA 2F35A 4YMBA 1B52A 3D4GA 1VR5A 1SYHA 3KJTA 3HHFA 4OHNA 5FTIA 2UVHA 3G7WA 2XHDA 1A54A 4MBPA 2DYXA 4FJPA 2ZXTA 3RQTA 1MY3A 3RTWB 3K00A 4LQ2A 2XXUA 1LCFA 5H8FA 2Q9TA 1H3DA 1RKMA 1IQ7A 3MP8A 5DVFA 5TP9B 4C0RA 1Y3QA 3CIJA 3K6UA 1B58A 3PUXE 4Z0IA 3TYHA 3R26A 4F3SA 4JWOA 4KHZE 4X48A 1B2HA 4GXAA 2E1SA 1SW5A 5BUUA 2HFBA 1O7TA 1QUJA 5L8DA 1BKAA 3EQ1A 4EXLA 2XXTA 1JW1A 1MXUA 4EF1A 4R72A 4OYVA 1P1UA 1H43A 1IZ1A 1MY2A 4PQJA 2E0SA 4F18A 3TEPA 2RC8A 4H5FA 2PMSA 4NWDA 3QAXA 2YPNA 4XKPA 1XVYA 1MH3A 1SYIA 4F3PA 3N94A 3UN6A 3MBPA 2AL5A 4R6HA 3CFZA 2V3TA 4FORA 4IO7A 2ZNUA 1I69A 4BLAA 5AA1A 1QKAA 1B3EA 5I2KA 3LSLA 1OIBA 5I59B 4YAHX 1DPPA 3UA8A 4BDMA 4YB7A 3T9VA 1Y3NA 4IO6A 1SW1A 4RJZA 3LR1A 4OQOA 1LLSA 4Q0CA 4I8CA 1XC1A 1MQGA 1S50A 4U1ZA 2Q2AA 3EF7A 5AA3A 2ZYKA 3OO8A 1S9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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