3T9UA

Cnqx bound to an oxidized double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9uA02
1B3HA 5H8FA 2Q9TA 1XS5A 2O7IA 1UQWA 4OFLA 1VE4A 4IO3A 4POXA 3OSRA 3K2DA 3OO8A 2A5SA 2FNCA 1DSNA 2I58A 4OTEA 3V8XB 4QFKA 1CB6A 1IEJA 1IXHA 2ZNTA 4F18A 3TDJA 4BDMA 1BKAA 2DXRA 1QVSA 2DWHA 2ONRA 4OENA 4R73A 1AH5A 2HQ0A 3OELA 3WAEA 4OMBA 1BIYA 5B70A 2F7AA 3BBRA 3HV1A 4KCCA 3HSTA 1M5EA 3CIJA 4GWOA 1B4HA 4OXVA 3PMVA 4UA8A 1MXUA 4ESXA 3PGFA 4DXCA 1SD3A 4ZEIA 4P0GA 3HCQA 4R6KA 3O28A 1BP5A 1SI1A 4LATA 3RT8A 2Y84A 3C31A 3EPEA 1ZU0A 1B7UA 3O29A 3H3GA 3H6UA 2Y7IA 3Q29A 2XX8A 4MFIA 2NOOA 3K1PA 3PU5A 5CBSA 4GLIA 1YCJA 4MBPA 2UVGA 2DVZA 5DVJA 3DLNA 1N76A 1B5HA 3MWBA 2QS4A 4DCYA 2AL4A 4LP2B 3H6WA 4U22A 4RA1A 4ELRA 2NXOA 4H0WA 2ZNUA 4L17A 3FVOA 1ZJLA 4DIGA 3TYHA 1TXFA 2R9JA 2Y7RA 5L9OA 3I6VA 3DP8A 3HHFA 3C4MA 2O84X 3K1MA 4XTCQ 1JNFA 4OESA 4F31B 1JEVA 4FEBA 4DE8A 1LAXA 1B40A 4GD5A 3C36A 3CFXA 3S9LC 1DTZA 2AYSA 1ZKBA 4KD5A 3JZJA 3KSXA 3SEVA 2HAUA 4ZEDA 1XT8A 1MXWA 4JXIA 4FECA 4NF6B 1Y20A 2VD2A 1IXGA 3I3VA 4GRKA 4F1UA 4DZ1A 2PX1A 1WDNA 5FHNA 1UIUA 5CI5A 3FATA 3FZVA 4F2OA 1N0TA 2OBGA 3TPAA 4O3CA 4G68C 4ZZAA 5J1DA 1OLAA 4THIA 3CRBA 5KZTA 3IOTA 1Q35A 5DEXB 3UK4A 1NNFA 1B3EA 1FTJA 4ONYA 3S2VA 5IAIA 4BDRA 2OWSA 3MBPA 2I3VA 5A5XB 2NUVA 4KFQA 5I56B 3S9NC 3Q26A 1SYIA 3D4GA 3IOVA 3KN8A 3ZKLA 2XXYA 5FHOA 1MG1A 4ZDMA 2HZKA 4QFOA 3KN3A 1LAHE 1MRPA 3TODA 3PPOA 5DEXA 3MZBA 2THIA 3OO9A 3PUYE 5ITOA 4F3GA 1M5CA 4K3FA 2DWAA 3SDFA 3W9VA 5DT6A 3R6UA 2P2AA 3KOSA 1B0HA 1MXXA 4KYDA 4PFWA 4ZECA 1MY2A 1B1HA 3RPWA 4F39A 1YPNA 2DWJA 5I2KB 5H8QB 2CZLA 3N94A 4GXAA 5DTBA 3RTFB 3OENA 3MJNA 3UA8A 1GR2A 2P0SA 1FQCA 2B65A 1AOVA 2GRVA 1OVTA 3OD7A 2UVIA 3FGSA 1Y3QA 1USYH 1N3WA 4U4SA 1B4ZA 2DS9A 3R7XA 3T9HB 4ELQA 2O51A 3THIA 2QS2A 4YKPA 4KYEA 2QRYA 4RPOA 1B3FA 3T93B 2H98A 3T66A 1JEUA 2XX7A 1XC1A 5KCJA 5H8QA 1B7ZA 1R9QA 1YAEA 1Z7NE 4FE8A 3MPLA 4JB7A 2Y7PA 2B3BA 4TOZA 2QMWA 2HAVA 1LCTA 3CSBA 3K02A 4ZEFA 3T96B 1JW1A 5CBRA 2UVHA 4F29A 3OMBA 5CMMA 3PUZE 4C1TA 1EZPA 5CM6A 1XOCA 2DE4A 3KZGA 4QFNA 3FJGA 1JW4A 3GBBA 1S50A 3L6HA 5HPQA 1SBPA 2O1MA 4RXLA 4HW8A 1D4NA 4H8JA 1UTBA 4AQ4A 5EHMA 3EF7A 1BLFA 3P7IA 4E0XA 4Q0CA 1FQFA 2RC9A 2ESNA 4YB7A 4MLQA 5CMBA 2I4BA 2Z22A 4KYSA 4OYVA 4ELOA 3HO7A 1MM6A 1POTA 1B6HA 2HZLA 1A8EA 3GXAA 4F22A 4U21A 5I58B 4I62A 3FXQA 1LBBA 4GF8A 3LR1A 1SW4A 4FJPA 1CE2A 2YJPA 4TQUQ 4XKNA 1LFGA 2RC7A 2RKMA 5AA2D 2F7BA 2RCAA 4MF3A 4WEDA 4Z0IA 3H6VA 1MQJA 1LSTA 4LZ5A 3SKPA 3MP8A 4FEDA 1IUDA 1MQDA 1ATGA 1HSJA 1B7HA 3T9VA 1EZOA 3MVZA 1B05A 3PPRA 2DE2A 4M4GA 1BTJA 2I48A 1JQFA 4QFLA 4X1BA 3OO7A 3TQWA 3IJOB 4DXUA 2B3FA 4NWCA 1N84A 2ZYMA 3O6GA 1EU8A 1NL5A 4ISUA 3C34A 3HPIA 5HBCA 4LVQA 3QK6A 4F3SA 2I0BA 2GHAA 3W15C 1QUIA 2F97A 1VR5A 2HEUA 3KN7A 1ZMGA 4F1YA 4X1DA 1B46A 5ITPA 1B3LA 1NFTA 2XXIA 1R1NA 4OETA 2PT2A 3TTKA 1SQYA 3MP1A 3MUQA 5ELVA 4MH5A 1JW5A 1LGBC 1P1WA 4JWXA 2ZYKA 5H8SA 1UIVA 5FHMA 5I57A 1PB8A 4I1DA 5LOMA 2Q2AA 2P1SA 3TQLA 2ALUA 1Y9UA 3IB2A 2FA7A 4QF9A 3E4RA 3ZS6A 4F19A 2I3WA 4KHZE 3OO6A 4BLAA 2F78A 1ZBMA 3CG1A 1MY1A 2XD2A 2UYFA 5I84A 4IO5A 1J1NA 1PC3A 4NF8B 1PBQA 2AIXA 1JVXA 3VVEA 4PQJA 2O6AA 4FIMA 1OVBA 4IY5A 4XKPA 3SEUA 3Q25A 4GL8A 4IY6A 3RT6B 3E13X 2VD3A 3PUXE 4G8HA 1LFIA 1USYE 5JTYB 3LSFB 4O3BA 2F35A 5KDTA 1MPBA 5FTHA 2QMXA 4NF8A 3KGCA 1M5FA 1H76A 2RC8A 1Z7ME 1MM7A 3O9PA 4P11A 3G3HA 2H5YA 4U1OA 3FV2A 4KCDA 2V93A 3RLFE 1MXZA 3K6XA 3LBSA 5L9MA 1XVYA 5DYHA 3MZ9A 5JTYA 3VXBA 1Y3NA 3QXMA 4R72A 3EN3A 3F11A 5AA4A 1KWHA 4H1XA 4M1VA 4TLMB 3R26A 3ECRA 4OEUA 3KJ7A 1LB8A 1ELJA 2AL5A 2KLFA 2ZNSA 1FQBA 3PD8A 2H99A 3MC2A 3LUYA 1FTLA 1II5A 1ZLQA 4NMYA 3JYRA 1OLCA 4KI0E 4QSCA 4BDNA 1M5BA 3CSGA 1O64A 3H03A 2F5XA 2WKYA 1S9TA 4AB5A 3KEIA 2YPNA 4PETA 2HFBA 1Y4CA 1PBPA 5EHSA 1A7LA 4R75A 1NNTA 5F1QA 3G3FA 1M5DA 4OZ9A 3G3GA 3SEXA 3B6WA 3PPQA 3ZSFA 1EH3A 4YMBA 1F9BA 4NTLA 1SVXB 1MQIA 3N6UA 1MY0A 4I8CA 3T9XB 4LUBA 4EXLA 4PP0A 1A54A 4JDFA 5H8HA 3BFUA 3N5LA 2CMOA 5AA1A 2X26A 2Q89A 4KQPA 3FUZA 2ZXTA 3GLBA 3N6TA 3IOWA 4RK2A 4GOTA 4DDDA 3SETA 1LCFA 3K4UA 1LLSA 1ZTYA 2H4IA 5CC2A 3FD3A 3IB0A 1QKAA 4HCWA 1NNPA 1QULA 4RK9A 1MY3A 4GXSB 4R9FA 3O97A 4XXUA 1B2HA 3PUVE 3V89B 4IO6A 2W7YA 5B7DA 3VLUA 4NF5B 1HSEA 2D21A 3V83A 2DWIA 3TTMA 2VHAA 1MXYA 1D9VA 5HM4B 1FCKA 3UORA 3TUSA 3EQ1A 1SYHA 1US5A 3PPNA 1IQ7A 1RYOA 4JBZA 3SESA 5KCJB 2REGA 1I69A 2I4CA 4C0RA 1JVYA 2QS3A 3M8UA 3QUFA 3HN0A 2GFEA 1ANFA 3H6TA 3MAMA 4U1ZA 4G68B 4IGRA 3RN8A 4KR5A 1B9JA 4NF5A 4BDOA 5ICQA 3IB1A 3QUJA 2VGQA 3VLVA 1MPDA 3G3KA 3QYTA 3B6TA 2HCAA 5JK4A 1DMBA 2V3TA 3KG2A 3IX1A 1UTBB 5I59B 2UYEA 3OEMA 2OLBA 1DOTA 3SEYA 3FVNA 2ZMBA 4G68A 3ONMA 3MVWA 4RNSA 1IXIA 3IORA 3A3UA 4ZEKA 4C1UA 2DE3A 3RGYA 2I6EA 4G8MA 1L5TA 4OFJA 1VFEA 4NWDA 4G4PA 1WVJA 2O68A 4ECFA 4GL0A 1NH7A 1SI0A 2XXVA 3S4UA 5I59A 2F8DA 5F7VA 1N3XA 1YTVA 1TT1A 2IA4A 5DVFA 4HTGA 4PFYA 2E0SA 3Q28A 1URDA 3LC8A 1GTKA 2GHBA 4POWA 1SW5A 3T9UA 4OERA 2V3UA 4U2RA 2I0CA 4ESWA 3DELB 4JSOA 3GBAA 4GVOA 5AA2A 4IO7A 4YICA 4ELPA 1I6AA 1VFDA 2F34A 3C9HA 3ZKKA 1RKMA 5L8DA 2NVUB 1B5JA 2DOJA 2D3IA 3K6UA 2XXHA 4NEDA 4N13A 1B51A 3VVFA 3FIRA 4ZZEA 3TCFA 4H67A 4JWYA 3EHUA 2XXWA 3ODBA 2DSFA 3EHTA 3L6GA 3VE1B 2DVCA 2XD3A 3U93A 4BDQA 4DCXA 3FXRA 4LQ2A 2PVUA 3CG3A 3M3FA 2Z8EA 4LZ8A 2REJA 1H45A 2QL3A 1MDQA 3O66A 4U23A 5FTIA 2ABHA 3OOAA 4QRZA 4YAHX 3O6IA 4U4XA 3VXCA 3TKDA 1FTKA 5CMCA 3H06B 4H8IA 5I57B 3FJ7A 1OMPA 1TFAA 4KPTA 5AE4A 2DP8A 3TAJA 3E3KA 3VVDA 1QJMA 1N04A 5ISUA 1Y1MA 3LSWA 1O63A 2G93A 3OEKA 3VDFA 1MXVA 2RCBA 1FTOA 1D9YA 3AXFA 4G2ZA 3TCHA 1LFHA 1Y1ZA 4WXJA 3KJTA 2HXWA 3B7DA 1MQHA 4BDLA 2A5TA 1DPEA 1H43A 2QJEA 3U92A 3G3JA 2QSXA 4PE5B 1URGA 3E9XA 4YKIA 1QW0A 3I5OA 5H8NA 3IL1B 2F6PA 2VP1A 1FQAA 4R9GA 3FVGA 4X48A 1Q1KA 3TTNA 2DXYA 3TELA 5L9SA 3PPPA 4N07A 1PEBA 3IJXB 1SW1A 5KDTB 2OJTA 3U1OA 2XHDA 1QUKA 2QS1A 1SW2A 3K01A 3N26A 2D5WA 3IO4A 3KSJA 4PFTA 4YU0A 2UXAA 4EXKA 3M3KA 2ONSA 1LBCA 2X7QA 3Q27A 4Z7EA 1LAGE 3K00A 3H7MA 3H4ZA 2DYXA 4ZE8A 3O2AA 4H5GA 2PBWA 3LSLA 4XKRA 2F36A 2ZYOA 4H5FA 1RYXA 3V5AA 3IOUA 4DLDA 5AA4B 2UVJA 4NE4A 4IO4A 1HSLA 3TTRA 4EDPA 1NKXA 3D4CA 1IITA 1MPCA 1S7YA 3U94A 4R74A 3CFLA 4QSDA 3T22A 5CMKA 3IK6B 1D3KA 1IIWA 4YZZA 3K6WA 1MH3A 1MS7A 2ANJA 3CFZA 1A55A 4HCYA 3TTLA 2RINA 1B1XA 1PB7A 4YB6A 3GZGA 3VFJA 2ONKE 1JETA 2XXRA 1P1OA 1Y4TA 2Y7WA 2Z8DA 1A40A 1B52A 4R2FA 4R6HA 4RYAA 5H8HB 4LZ7A 3LSXA 4LONB 2FYIA 1SDXA 1UTHB 2X7PA 3B6QA 4OFOA 1FTMA 3UIFA 3KFMA 2XX9A 4I9DA 3RUMA 1B0LA 2H9BA 2O1LA 3SEWA 3WAFA 2XXQA 3FJMA 5EYFA 3OXNA 3O6HA 3BFTA 4P0IA 4YMAA 3MZ1A 4R6YA 4UACA 4ZEBA 1O7TA 5AA3A 1UTHA 3MPKA 4WKMA 3G3IA 4GFRA 1FQDA 1MQGA 1Y3PA 3EHSA 4NF4B 1US4A 4OHNA 3PD9A 4NF6A 2LAOA 4F3PA 3MW0A 5CRYA 3QSLA 3DM0A 2XXXA 2Y7KA 4QSEA 3C33A 1DPPA 1VSOA 3FVKA 2Z23A 1QKBA 5BWJA 3CR9A 3KOTA 4RY1A 3QIMA 3UN6A 1R9LA 4RPNA 1B5IA 4QFPA 5JEIA 2RF1A 4XKQA 2G29A 1XVXA 4NF4A 2OZZA 5IKBA 3JV9A 5I2NB 4Q5TA 4YKKA 4EQ7A 4WEPA 5A5XA 3K1NA 2O7UA 5I56A 4LA9A 4GQOA 5K2XA 1A8FA 1B32A 4OEVA 3A3CA 1GVCA 3USDA 3PMWA 3MQ9A 3A09A 2NWJA 4OWDA 3FXUA 1QUJA 2YLNA 3C32A 3TZAA 1AIVA 1NNKA 4JWOA 3RTWB 5M2VA 1H3DA 5I2NA 4G77A 4OQOA 5DVIA 1MH4A 4QHQA 3TCGA 2VOZA 4EF2A 3DP4A 4ND9A 3K0VA 4Q30B 5I2KA 2PYYA 4EQBA 1XHYA 1P1QA 3IAZA 1I6QA 4H65A 4Q8RA 3OSQA 1MDP1 2PMSA 1MY4A 3ILTB 4F2QA 5AA2B 4PFUA 4FORA 4O3AA 1P99A 4XIGQ 2H25A 4YKJA 2V25A 3FV1A 5TPAB 2XXPA 1IXCA 4JSDA 5K2YA 1TWYA 1FW0A 3M3LA 5BUUA 2OK2A 3VV5A 2Q8JA 4F3BA 4ZS9A 2R71A 4E0WA 2O69A 4TLLB 3CVGA 3RY3A 3SERA 1AMFA 4DXBA 2DQVA 1IZ1A 4H6DA 1P1UA 1P1NA 4IGTA 1AL3A 3IR1A 1N7XA 4R2BA 1I6BA 3PV0E 3IO6A 3W9WA 3TMGA 1LB9A 1OQHA 2XXUA 4OVJA 3PMXA 1URSA 1B58A 2PT1A 5TPAA 3U8QA 1T0KA 1PB9A 2XXTA 2F7CA 4GIZA 5TP9B 2V84A 4F1VA 5ICTA 1A99A 4AB6A 1ZIUA 3PUWE 3MVXA 2GH9A 3CI8A 3ILUB 4G8NA 3S9MC 3KBRA 3MP6A 1N7WA 1TFDA 2E1SA 3UGWA 4FAJA 3RNNA 3VLWA 1DTGA 1GGGA 4MLVA 1B3GA 5TP9A 5I58A 4N6PA 1OQGA 3TFLA 2M8CA 2Q2CA 1WODA 3DP6A 2OCUA 2F6GA 4HS7A 1FQEA 4EUOA 3U72A 2A5TB 1NMUA 3FASA 5H8FB 2BJJX 2V3QA 4X9TA 1H44A 2OWTA 3S9EA 3RQTA 1NH8A 2R6GE 4IB2A 5H8NB 3BKIB 4YB5A 3TEPA 4ZE9A 4LQ5A 2I49A 5TU0A 2QPQA 3K6VA 1POY1 3G7WA 4RJZA 4EQ9A 1R6ZA 4EF1A 3C35A 3UP9A 4FATA 3HHGA 1OIBA 3MVYA 2Z8FA 2Q88A 1GV8A 1EZ9A 3QAXA 2IEEA 2ZYNA 4IO2A 1PDAA 1LAFE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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