3T9VA

Cnqx bound to a reduced double cysteine mutant (a452c/s652c) of the ligand binding domain of glua2
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGCRDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDCGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of AMPA Receptor Activation by Partial Agonists: DISULFIDE TRAPPING OF CLOSED LOBE CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3t9vA02
1ELJA 1SYIA 2ESNA 3K2DA 4YB7A 5CRYA 4R75A 5DEXA 3N26A 3IL1B 5H8HB 5CMMA 1IXHA 3MJNA 2Z8DA 1OMPA 3V83A 3IOTA 1QUKA 3TQWA 3UN6A 4ZS9A 2XX9A 5AA1A 3RTFB 1R1NA 3VVEA 2Y7IA 3TKDA 3T66A 2ZYOA 3PMXA 5I59A 2HEUA 1LGBC 2RCAA 3OO7A 4F18A 4QFLA 3RTWB 3M3FA 4KPTA 4R72A 3TTRA 4KYEA 1OLAA 1YPNA 5IAIA 1P1QA 1M5CA 1MPBA 3W15C 1Y3NA 4QF9A 3DM0A 4Z0IA 3KSJA 2O68A 3LBSA 3CG1A 1Y20A 4NF5A 3VLUA 4NWCA 1Y9UA 1GV8A 4WEPA 1USYH 4YMBA 2NOOA 1YAEA 4LZ5A 2OWSA 4FEDA 4KCCA 1TT1A 4C0RA 3MZ9A 1ZBMA 3VVDA 1ANFA 3IOUA 1YTVA 4XKRA 2OLBA 1MPDA 3MWBA 4C1TA 4AQ4A 4IB2A 1UQWA 2O7UA 3CVGA 2OWTA 3MBPA 3M8UA 1N76A 2VOZA 5IKBA 2AYSA 4F3PA 1QKAA 4MBPA 2QMWA 3RN8A 1MH3A 3I5OA 2OK2A 3MP6A 1DPEA 1B0LA 1PBPA 3MAMA 3W9WA 1NH8A 4Q5TA 2IA4A 4U21A 4BDRA 3C4MA 4QSCA 1IIWA 1B6HA 1SW2A 4R6YA 1DMBA 1KWHA 2ZYNA 4UA8A 3G3JA 2H98A 2XXTA 2PX1A 1ZLQA 4QFKA 3H7MA 4O3AA 1LAXA 3MVYA 1TWYA 2HQ0A 1AL3A 4G2ZA 1S9TA 2RC9A 3IAZA 1Y4CA 2VHAA 2XX7A 3M3KA 4I62A 3VDFA 1A7LA 2QRYA 3RY3A 3S4UA 2DS9A 4IO4A 5DVFA 2I4BA 5CBRA 5L8DA 2KLFA 3VE1B 2DYXA 4EXKA 4LZ7A 4LUBA 4JBZA 3MPKA 1MDP1 2Z8FA 5H8FB 1FCKA 5I59B 2Y7RA 3CI8A 3MZ1A 1MXVA 4DXUA 4EF1A 3PU5A 4THIA 5I84A 2Q88A 4IGRA 4YKJA 5CC2A 1JEVA 2DSFA 1B4ZA 3O9PA 3AXFA 4YKKA 3BFTA 4HS7A 3DP4A 3QUFA 1MPCA 5TPAA 4ZZAA 3V89B 3ECRA 4RNSA 2E1SA 4NF5B 5FTHA 5B7DA 3RPWA 1UTHA 2GH9A 3OEKA 1NMUA 4IO5A 4GWOA 4H65A 2H9BA 4R9FA 1LFIA 1MQIA 3OSQA 3Q27A 2D21A 1EZPA 5AA2D 4ZEFA 2AL4A 3TTMA 3PPNA 1MQGA 1B5HA 4KR5A 4GOTA 2LAOA 4OQOA 2H99A 1PEBA 1MQHA 2XXRA 3PUXE 3SDFA 3ILUB 3F11A 3PUYE 4KHZE 4Q8RA 1JEUA 3FGSA 1SQYA 4QFPA 1MY2A 4EF2A 4ZE8A 1MY3A 5B70A 5FHOA 5ITOA 3C9HA 3OXNA 4ZECA 4F1UA 2DXRA 4EDPA 5AE4A 2QS4A 4IO6A 2Q9TA 2XD2A 1N3XA 4POWA 2V3QA 4FAJA 4ZEKA 5ELVA 2O7IA 3L6GA 1WODA 1JETA 3C31A 4PFYA 4NF4A 2O51A 4M1VA 3DLNA 3H6VA 3Q25A 4DXCA 1BP5A 4JDFA 3MW0A 4NEDA 4OHNA 1B7UA 2O6AA 3HV1A 3SETA 3TPAA 4NE4A 3Q28A 4FJPA 3U93A 1Y1ZA 5DVJA 2QS2A 4JWOA 4DCXA 3K6WA 4KYDA 2YJPA 4NTLA 3O6IA 2GHBA 2RCBA 5ICQA 1FTMA 2O69A 1AMFA 4I9DA 4O3CA 3KSXA 1I6QA 3KN3A 2F78A 1H44A 3VVFA 2A5SA 4R2FA 2PBWA 2UVHA 4Z7EA 3M3LA 1Z7NE 5TPAB 5HBCA 1P1UA 3FIRA 3LSXA 2XD3A 3PV0E 1AH5A 4N6PA 1OLCA 2DP8A 2ONKE 1FTOA 4YKPA 3VLWA 2QS1A 1HSJA 4TOZA 3U92A 1B5IA 3TCFA 1QUIA 2YLNA 3FJGA 2P0SA 4NF8A 4N07A 2UYFA 4OEUA 3SKPA 1LFGA 3Q29A 2Y7WA 5L9OA 3I3VA 5ITPA 1QJMA 2V25A 3RGYA 1EZOA 4JB7A 3H6TA 3T9VA 4ZEBA 3B6WA 1WDNA 3IR1A 3LSWA 3KJTA 5H8NA 3PUZE 3FVNA 1RYXA 4OERA 1JW5A 3LC8A 4LQ2A 1HSLA 1FTLA 1VSOA 1DSNA 5CI5A 3SEWA 3T96B 1LAHE 4H8IA 3KN8A 1IZ1A 5I57A 1VR5A 2DE4A 3ILTB 1VFDA 4NF4B 1JQFA 1MXXA 2I3VA 4XTCQ 1FTJA 3SESA 3ODBA 2DWAA 4TLLB 3TZAA 3EPEA 5F7VA 3FJMA 5I2KB 3K1MA 1LBBA 2QSXA 4HW8A 3KFMA 4OFJA 2DWHA 1D4NA 3TQLA 4KQPA 1BLFA 1ZU0A 2I0CA 4QSEA 3QSLA 4PQJA 5L9SA 4F39A 1H3DA 3HHFA 3FV2A 1I6AA 3FZVA 3H4ZA 4EQ9A 2NXOA 3KG2A 4FE8A 4P0IA 3IJOB 1B9JA 1XVYA 5EHMA 1R9LA 2XXYA 3IO4A 5I2NA 1MRPA 2UYEA 4M4GA 5A5XA 1N84A 4HTGA 5TU0A 4F2QA 3LR1A 4YB6A 4QHQA 1PB7A 1BKAA 4H5FA 1XVXA 1OQGA 5TP9A 4ESWA 3TYHA 2VGQA 3PMWA 4FECA 2XXXA 3UA8A 2V3UA 1NFTA 2ONRA 1MM7A 1H45A 4YB5A 4GF8A 3PPQA 4ZZEA 1IXCA 2PT2A 4OZ9A 4GFRA 4X9TA 1LB9A 4KYSA 4Q0CA 4DIGA 3S9MC 4H67A 5H8NB 2FYIA 4GVOA 3U72A 1B7ZA 4LONB 1B05A 4QRZA 5AA4A 2H25A 4XIGQ 1MQDA 3D4CA 1UIUA 1LB8A 4U4XA 2D5WA 2F7CA 2RC8A 4GD5A 2I4CA 4KD5A 1SVXB 4G68C 4F2OA 4F19A 4IO2A 1S7YA 1FQDA 1M5BA 3UGWA 1I6BA 3K1PA 4LA9A 4G4PA 1II5A 3O6HA 3T9UA 3C32A 5I57B 1B46A 1LAGE 3QXMA 1O63A 3H06B 1JVXA 2DWJA 3FXUA 3RT8A 3SERA 1B3HA 2F97A 4OYVA 1LLSA 2HFBA 2YPNA 3H3GA 1SYHA 5DEXB 1R9QA 1XT8A 2HAUA 1TFDA 3DP6A 3N6TA 4X1DA 4GXSB 4XKPA 3ZKKA 1SD3A 2O1MA 2I3WA 3I6VA 2XXIA 4JWXA 4NMYA 2GHAA 4ELRA 1B0HA 1Z7ME 5L9MA 3G3KA 2Z8EA 1ZMGA 2I49A 3KOSA 4G68A 3OD7A 5I58A 4BDMA 4ISUA 3A3CA 2DOJA 1PB9A 1TFAA 3T22A 3VLVA 4G8HA 3IO6A 4OFOA 4K3FA 2E0SA 1Y3QA 2CMOA 5I2NB 3V5AA 4OEVA 2HZKA 5A5XB 3QIMA 1PB8A 3K6XA 1MH4A 1UTBA 2OCUA 3G3HA 1N3WA 4U1OA 1ZTYA 2GFEA 2XXPA 1NL5A 2O84X 5TP9B 3K6UA 2I58A 4PE5B 1JW4A 2ZYMA 3TDJA 3CG3A 1B2HA 3O97A 5DTBA 2OBGA 1P99A 2QS3A 2XXUA 3IORA 1BTJA 2HXWA 4R73A 3CSBA 1B3EA 2QL3A 2QPQA 4OENA 1L5TA 3OMBA 2V84A 4TQUQ 3O66A 1BIYA 1MXZA 1OVBA 3N94A 4PFTA 5CBSA 2ONSA 4QFOA 2X26A 5F1QA 1GGGA 2FA7A 3TTKA 1SDXA 4DCYA 3PD8A 4U2RA 1LCFA 4GL0A 4BDNA 1MY0A 1OIBA 2XXHA 4F1VA 1JNFA 1D9VA 1Q35A 5JTYA 1US4A 2F7BA 1N0TA 3R26A 4PFWA 2UVGA 4YU0A 3R7XA 1M5FA 3IX1A 4KCDA 3C34A 3OO8A 3SEXA 1NNPA 2PT1A 1M5DA 1POY1 2DWIA 1OVTA 2RC7A 2HAVA 4JWYA 4EQ7A 3IOWA 4HCYA 4TLMB 2I0BA 5FHNA 4QFNA 2ZNTA 4MLVA 1GR2A 1A55A 5H8SA 3TCGA 3ONMA 4U23A 3EN3A 2THIA 3OO9A 2Q2AA 4Q30B 2W7YA 4WEDA 5KDTA 2F6PA 4XKQA 3QUJA 4G68B 1MY4A 2REGA 1IXGA 1US5A 4QSDA 1ZIUA 4XXUA 4OETA 4DXBA 4YZZA 5BWJA 5JEIA 1NKXA 3THIA 1SI1A 1QW0A 1B4HA 2RKMA 3E3KA 1FTKA 4N13A 3RT6B 3JZJA 4ESXA 3MQ9A 4JSDA 1UTBB 3O28A 1B32A 1UTHB 3HPIA 2QJEA 1Y3PA 5J1DA 3U94A 2V3TA 4OESA 1A8EA 5AA2A 1PDAA 2OJTA 1MY1A 1LCTA 3T93B 5K2YA 2A5TA 3MC2A 3TCHA 4YICA 3MVWA 4MLQA 5AA3A 4JXIA 2R6GE 3KEIA 3S9NC 3FV1A 1LSTA 5DT6A 1XOCA 2PMSA 3RNNA 4C1UA 2O1LA 3IB1A 3KN7A 3A3UA 2Q8JA 3H03A 3PMVA 3EQ1A 4P11A 3A09A 1J1NA 3CR9A 5EHSA 4RJZA 4R6HA 3D4GA 3HN0A 4OMBA 1SI0A 1DOTA 4MF3A 2DXYA 3OSRA 4G8NA 4PP0A 3MPLA 5JTYB 4IO3A 3C33A 3LSFB 3QK6A 1IEJA 3IK6B 1EZ9A 3FVOA 3PPRA 4DE8A 1P1WA 3FXQA 1USYE 1P1OA 3K6VA 2F8DA 3K01A 4NWDA 1P1NA 1URSA 3SEVA 3S2VA 2DQVA 2NWJA 4OVJA 3P7IA 4FORA 1XHYA 4GIZA 1MXYA 2AL5A 2ABHA 1DTZA 4BLAA 2DVZA 4PFUA 1N7XA 1B1HA 4AB6A 5KDTB 3E13X 3GXAA 3FUZA 1T0KA 5H8FA 3FATA 3KGCA 4ONYA 2RINA 5H8QA 2F7AA 3LSLA 3WAFA 1XC1A 1QULA 5JK4A 2I48A 1EH3A 1MDQA 1O64A 1NH7A 4LZ8A 2WKYA 3H6UA 2UVJA 1URDA 4RYAA 5KZTA 2F36A 4WKMA 4NF8B 4YAHX 3MZBA 2DE3A 2Y7KA 5AA2B 4R74A 3OENA 3GBAA 3T9XB 3KJ7A 3G3GA 3KZGA 4R6KA 4H1XA 2A5TB 3G3FA 3VV5A 2F5XA 3IB0A 2F6GA 1FQBA 3OO6A 2Y84A 3FASA 4GL8A 1POTA 1SW1A 1GTKA 3B7DA 2IEEA 1LBCA 4LP2B 4EXLA 2HZLA 3G7WA 1ZKBA 4BDLA 3QYTA 3FD3A 4BDQA 3HO7A 3UK4A 1DTGA 3PUWE 3RUMA 3EHSA 4U22A 3ZSFA 3PD9A 4RK2A 3K00A 5K2XA 1IXIA 1FQAA 4F31B 3CRBA 3TTLA 1A8FA 1S50A 2F35A 1EU8A 3CFXA 1CE2A 1QVSA 2DVCA 3BFUA 5EYFA 3MUQA 3CFLA 3JYRA 1B1XA 3UP9A 3TFLA 4MH5A 2B65A 3L6HA 2VD2A 3PPPA 4AB5A 5FHMA 1N04A 4ND9A 3TELA 3USDA 4KFQA 1Y1MA 3PPOA 4X1BA 4IO7A 4LQ5A 3EHUA 5CMBA 4ELPA 1URGA 4DDDA 5HM4B 2P2AA 1M5EA 3W9VA 3N5LA 4H6DA 3EF7A 2Z22A 1MG1A 1HSEA 4ECFA 2AIXA 1FQCA 4IGTA 2Q2CA 4U1ZA 1MXWA 2ZMBA 4F3BA 2ZXTA 5ICTA 5CM6A 5BUUA 3RLFE 3RQTA 2G29A 4RXLA 3EHTA 2B3FA 4E0WA 3H6WA 3UIFA 1AOVA 4RPNA 2XX8A 2REJA 2F34A 4EQBA 3PUVE 1B3GA 5H8QB 2D3IA 4R2BA 1RKMA 4ZEIA 1B40A 4U4SA 2Q89A 3K4UA 1O7TA 3OEMA 5I56A 4OWDA 3TEPA 1QUJA 1ZJLA 4I8CA 4DZ1A 4GQOA 4F29A 3TAJA 1AIVA 1CB6A 2PYYA 1FQEA 4YKIA 1B5JA 3CFZA 3SEYA 5CMKA 3U8QA 3FVKA 4EUOA 4F3GA 1A40A 2ZYKA 1RYOA 4BDOA 1MQJA 3CSGA 2ZNSA 4GLIA 5M2VA 2QMXA 4L17A 4H8JA 3HHGA 2ALUA 4P0GA 3OELA 4F3SA 5AA4B 5ISUA 2Z23A 3O2AA 3VXCA 2H5YA 3UORA 4G77A 3V8XB 2P1SA 3E9XA 5FTIA 4PETA 3WAEA 4NF6A 3E4RA 3GZGA 4ELOA 3DP8A 3IOVA 2H4IA 4R9GA 1JVYA 3S9EA 3SEUA 4ZDMA 3B6QA 1B3LA 4XKNA 2NUVA 3U1OA 5KCJA 3S9LC 1FW0A 5CMCA 4F22A 1VE4A 3O29A 1ATGA 2BJJX 3FXRA 1D9YA 2ZNUA 4F1YA 1YCJA 1NNFA 3LUYA 2X7QA 2XHDA 1I69A 3ZS6A 2VD3A 4YMAA 2XXQA 4ELQA 4RA1A 3K0VA 1PC3A 5DVIA 4RY1A 4RK9A 2FNCA 1VFEA 5LOMA 2R71A 1SBPA 4POXA 5H8HA 1NNTA 4I1DA 5I2KA 4HCWA 2RF1A 2UVIA 2UXAA 3Q26A 3MP1A 1B7HA 4MFIA 2CZLA 1D3KA 1Y4TA 3O6GA 1OQHA 4KI0E 3IJXB 3PGFA 2OZZA 3T9HB 4JSOA 1JW1A 5HPQA 4UACA 5I58B 3K1NA 3FJ7A 2V93A 1GVCA 2XXVA 4RPOA 1B3FA 3IB2A 4DLDA 3TODA 3QAXA 1FQFA 2R9JA 1R6ZA 5I56B 3VFJA 2XXWA 3GLBA 1F9BA 1TXFA 1N7WA 4OFLA 1B52A 3MVZA 4IY6A 2DE2A 1LAFE 1MXUA 3BKIB 1MS7A 1IITA 3TMGA 1UIVA 1B51A 4OXVA 1DPPA 2PVUA 3GBBA 4GRKA 3JV9A 4GXAA 1A54A 4OTEA 4FATA 3FVGA 4O3BA 4G8MA 3HCQA 1H76A 3C35A 4ZE9A 1LFHA 4FEBA 2NVUB 3KBRA 3BBRA 4H5GA 1SW4A 2VP1A 2X7PA 3G3IA 1XS5A 3CIJA 3OOAA 1NNKA 4IY5A 3TUSA 2G93A 3DELB 1MM6A 1Q1KA 2ANJA 1QKBA 4NF6B 4H0WA 4LVQA 1PBQA 3K02A 1B58A 3B6TA 1H43A 1IUDA 3MVXA 1IQ7A 5KCJB 2Y7PA 4E0XA 3R6UA 2I6EA 3VXBA 3KOTA 2B3BA 3MP8A 1A99A 3HSTA 3ZKLA 4FIMA 4ZEDA 2M8CA 3TTNA 4X48A 2HCAA 3N6UA 4LATA 4WXJA 1WVJA 2GRVA 3C36A 5DYHA 1SW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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