3TKDA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j-l483y-n754s) in complex with glutamate and cyclothiazide at 1.45 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Thermodynamics and structural analysis of positive allosteric modulation of the ionotropic glutamate receptor GluA2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 262
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tkdA02
4YMBA 1MXYA 5AA1A 1EH3A 5I2KA 3LR1A 4IO5A 4DZ1A 3PPNA 3KG2A 2F35A 3TTMA 3N6UA 3MBPA 5JTYA 2X26A 1MPBA 3TZAA 2VOZA 1SBPA 4ZDMA 2XXHA 3VDFA 3PMVA 3C4MA 2QL3A 2I3VA 4TOZA 2Z8FA 1QKAA 3C34A 3SEYA 4EQ9A 2DQVA 1POTA 3KEIA 1DOTA 1YTVA 2I49A 5AA2B 5H8FB 3R26A 2NOOA 4R75A 1NH7A 3FGSA 5I58A 4DXCA 2HFBA 4OETA 2O7IA 3C31A 1FCKA 1DSNA 3F11A 2UVJA 3CI8A 5AA4A 3QSLA 3PGFA 1N84A 3AXFA 1B3GA 2OCUA 4IO6A 4DCYA 2HCAA 5B70A 3SERA 4BDNA 1MXXA 2O6AA 3TQWA 3K6UA 4FEDA 2DWHA 3ZKLA 2O84X 3LSWA 2DWIA 4IGRA 4JWYA 4QRZA 4RK2A 1LB9A 2I6EA 3C33A 4JWXA 4F3BA 1MH3A 3S2VA 3CSGA 4GOTA 2Y7IA 3KN8A 5CC2A 3K6XA 4NF8B 4C1UA 4OESA 4YKPA 3TAJA 1LAGE 1NFTA 4KYEA 1BLFA 3C36A 2NVUB 1A40A 1DPPA 2H25A 1I6AA 5DEXB 3PPQA 2D3IA 4G68A 2G93A 2UVIA 4LATA 2XHDA 1YAEA 3PMXA 2UYEA 1A7LA 3TCHA 3OO7A 2HAVA 3O6IA 4G77A 4DLDA 3PUVE 3IK6B 1B52A 1ATGA 4GIZA 3VLWA 3LC8A 3DP8A 1NL5A 1Y3PA 2XX7A 3OEMA 5FTHA 1IXHA 1FTMA 4RJZA 3CG3A 3R6UA 1B2HA 4E0WA 3K01A 2W7YA 2GHAA 4OFJA 2NWJA 1B5HA 3PPPA 2UXAA 2ZXTA 4Q0CA 1JW1A 4PFUA 3T66A 1Y4TA 3N94A 3ZS6A 2Y7PA 1MQDA 3V83A 2E1SA 1B1XA 4F3PA 4WEDA 1FTLA 1BP5A 1N0TA 4R2FA 3FUZA 5HPQA 1RYOA 1B3EA 2DOJA 1B3LA 1AIVA 4FORA 4F3SA 1SI0A 4ECFA 4NF4B 4L17A 4F2QA 4R6KA 1B51A 1M5DA 1I69A 3RNNA 4NF6B 3TMGA 2V93A 4BDLA 3PU5A 4G8MA 1PEBA 4GWOA 4I1DA 3TFLA 4U21A 3ILUB 2UYFA 5H8QA 1TWYA 4N13A 5H8HA 4RNSA 3ECRA 3TPAA 2I48A 3EHTA 2ESNA 2RC9A 3D4GA 2QRYA 5TPAB 1O7TA 2DVZA 3A09A 2XD3A 2D21A 1IXIA 3BFTA 1JQFA 1Y1MA 1D3KA 1P1WA 2Z8EA 1B46A 1IZ1A 5F1QA 1UTHA 4F29A 3UGWA 4LONB 4NF5B 2VGQA 2NUVA 1NMUA 1XT8A 3IOUA 3O2AA 3FV1A 4YZZA 1URGA 1Y3QA 5H8SA 3IORA 1USYH 2RF1A 3MPLA 3W9WA 3SEXA 2A5SA 2ZYOA 1QVSA 1ELJA 1SDXA 4P0IA 4KCDA 2F7BA 2VD3A 3MP6A 3G3GA 3KBRA 4ZEBA 3E4RA 3OXNA 4HCWA 2OWTA 2ZNUA 4F3GA 1O64A 2DXYA 3KOTA 1PB9A 3S4UA 3DM0A 1D4NA 4FIMA 2NXOA 2G29A 3FVNA 3LSFB 1ZIUA 4GL8A 2YJPA 2VHAA 3MVWA 3ILTB 4M1VA 1TXFA 3ZKKA 3MZ1A 4ZEDA 3FJ7A 3TELA 1HSJA 4DE8A 3CR9A 1B4HA 1B58A 4ELRA 3FZVA 4QFOA 1ZJLA 1CE2A 4ND9A 2RC7A 3UIFA 1I6QA 1IITA 1H45A 4OZ9A 4R74A 2Z22A 4KR5A 3TODA 1MY3A 4ISUA 1B6HA 3U93A 4DXUA 5TU0A 4FE8A 1R6ZA 1SW2A 4F1UA 2YLNA 2F6GA 3RT6B 1B3FA 4HS7A 5CMMA 4QSEA 1PBPA 2Y84A 4XIGQ 5ELVA 4ZEFA 4FAJA 1A54A 4HTGA 4JSDA 3I3VA 3C9HA 1UIVA 4JWOA 4R2BA 4R9GA 1QUKA 4LVQA 4NMYA 4BLAA 3A3CA 3A3UA 2I4BA 1MPDA 2PVUA 4H8IA 3H06B 3QYTA 3VXBA 2P2AA 1MY0A 1MXUA 4NF8A 3MJNA 4OVJA 1MQGA 5ISUA 2DSFA 3FATA 3TUSA 5DEXA 1XVYA 3LBSA 4I8CA 4U23A 3ONMA 1EZOA 4RPNA 1MXZA 4IO7A 4G68C 1R1NA 1BTJA 4HCYA 4OFOA 3SESA 3K1MA 1ZLQA 5DVFA 1B05A 3MVXA 4YKKA 5CMKA 1CB6A 3MWBA 4RY1A 5I56A 2I58A 2O1MA 1JVYA 3TTKA 2AL5A 4E0XA 1B7UA 4H5GA 4BDOA 1M5CA 4F1VA 3FVKA 1B5IA 2Q88A 4R72A 1GGGA 4IO4A 1MQIA 3OEKA 3CVGA 1B1HA 3LUYA 3CFXA 3PUXE 1QJMA 4QFLA 2ZYKA 2A5TA 3BKIB 4C1TA 2O68A 2LAOA 2XXVA 4NE4A 4MFIA 1LLSA 1SW1A 3L6HA 4NWCA 1B32A 2QS3A 2H99A 2F34A 4FEBA 2ZYMA 4QSDA 4KFQA 3PUWE 3T9VA 1LAFE 3HHGA 1SVXB 1FQBA 1F9BA 3SETA 1O63A 2UVHA 3DP6A 1HSEA 4GQOA 1B5JA 2Y7RA 3TTNA 4GLIA 1MDP1 2ONSA 4NF4A 3BBRA 4LP2B 1TT1A 3B6TA 4EXKA 4NF6A 2Q8JA 3VVDA 2PT1A 2DE4A 4HW8A 5A5XA 3O28A 3QXMA 4ZE8A 4R9FA 2FA7A 4AB5A 5CMCA 1POY1 2M8CA 3S9EA 1IQ7A 3ZSFA 4X1DA 1MY1A 1M5BA 1N7XA 3Q29A 2R71A 1J1NA 3K4UA 4YB7A 1JNFA 1D9YA 1SYHA 4FATA 4OQOA 1MY4A 1MS7A 4ZECA 4PQJA 4GXSB 4JSOA 1LCTA 3H03A 2IEEA 1ZMGA 1KWHA 1LB8A 4EQBA 3N6TA 2H9BA 2DP8A 2WKYA 3MW0A 3SEWA 5I59A 4XXUA 1US5A 1P1UA 3S9MC 4G8HA 1FQDA 1IEJA 2AYSA 1GV8A 3W15C 1S9TA 1A8EA 3GBBA 3WAEA 4Z0IA 4YMAA 3U72A 2R9JA 2XXYA 4P0GA 4LQ2A 1MXWA 3GXAA 5I57B 2XXXA 2PBWA 4GXAA 1WODA 3VFJA 3PD9A 4JB7A 4I62A 4BDQA 4LZ7A 1ZU0A 1YPNA 2F7AA 3K1PA 5ICQA 2V25A 5I2KB 3HN0A 4YB6A 2VP1A 1NH8A 1DTGA 1UTBA 4JXIA 1EU8A 5FTIA 5JTYB 1II5A 3TQLA 2XXTA 4WEPA 4OHNA 2GH9A 3U92A 2X7QA 1H44A 1Z7NE 1NNPA 4ZZEA 4LQ5A 3OO9A 4OERA 1A8FA 1FQAA 1N04A 4Q8RA 1EZ9A 5CI5A 2XXUA 3FV2A 5I58B 4R6HA 3TTRA 1GR2A 5DVJA 1SW5A 3M8UA 4DXBA 1JEVA 3QUFA 1OMPA 5AA4B 1Y3NA 2OLBA 3RUMA 1AH5A 4Q30B 3MP1A 5K2XA 2H5YA 2XX8A 2OWSA 2AL4A 1SQYA 1RKMA 1A55A 1VSOA 1TFAA 2RCAA 1DTZA 3L6GA 2RKMA 1JVXA 5I2NA 3RTFB 4ELPA 3KSXA 3HV1A 4H1XA 4BDMA 1XC1A 1DPEA 4X48A 4U22A 1GVCA 4C0RA 3GLBA 3EPEA 3S9LC 2GFEA 4G68B 5M2VA 1B4ZA 3E13X 1P1NA 4OWDA 4M4GA 5DYHA 1AMFA 2QMWA 2V3UA 2H98A 1QUJA 2RC8A 1N3WA 4OENA 4ONYA 4U4SA 1B7ZA 4ZZAA 2PX1A 3OMBA 4GL0A 1Q35A 2I3WA 1S50A 3G3IA 3N5LA 2PMSA 1LSTA 3OSRA 3RT8A 3FXQA 3OENA 2ZNTA 4OXVA 2B65A 1ANFA 3FASA 4PETA 2QMXA 3UP9A 3VLVA 5ICTA 4G2ZA 3DP4A 3H6TA 2GHBA 1XS5A 4H6DA 4LZ8A 3S9NC 5JK4A 4U4XA 1B40A 3TCGA 2Q9TA 2P1SA 1B0HA 3P7IA 1OQHA 1VFEA 1PDAA 4R73A 3EHUA 1XVXA 1MQHA 3TDJA 1NNTA 4F22A 2AIXA 3U8QA 4ELOA 2H4IA 2XXPA 3CFZA 3IAZA 4NEDA 5AA2A 2XXWA 5H8FA 1IUDA 4KQPA 2E0SA 3KJTA 2DWAA 1YCJA 4ZEKA 3IX1A 1MM7A 1RYXA 2V3TA 3G3HA 4JDFA 3TYHA 3Q25A 2REJA 1FW0A 4XKNA 1XHYA 3USDA 2OK2A 4NWDA 4QFPA 3TTLA 1P1OA 3HHFA 2QS2A 1IXCA 3IJOB 3KSJA 5L9OA 3K02A 3SKPA 3HSTA 3JZJA 2QPQA 4MLVA 5H8NB 3O9PA 3VE1B 5H8QB 1VE4A 1H43A 5H8HB 3U94A 3M3FA 4YB5A 4Q5TA 3H6UA 1JEUA 2QS1A 2Y7WA 2B3FA 3U1OA 5TP9B 4JBZA 3SDFA 1PB7A 2I4CA 1B9JA 1N76A 1NKXA 2UVGA 3OO6A 2XD2A 3Q27A 4F19A 1QUIA 3V5AA 1OIBA 4POWA 1PC3A 5LOMA 3JV9A 3H6WA 2O69A 3GZGA 3IO6A 1LBBA 3MQ9A 3D4CA 2XX9A 4KHZE 1MRPA 1BKAA 4NTLA 3DLNA 2I0CA 5CM6A 4RPOA 3KOSA 1MDQA 2HAUA 2Z23A 4AQ4A 4IO3A 2QJEA 4P11A 3HCQA 3GBAA 2O7UA 3QUJA 2Q2CA 1SW4A 4OYVA 3KFMA 1OLAA 5L8DA 3LSLA 4PFWA 3EQ1A 1NNFA 5DT6A 2GRVA 4Z7EA 3MUQA 3O6HA 1VR5A 1PB8A 1LFGA 5J1DA 1N3XA 2Q2AA 3T22A 4RK9A 2X7PA 1OLCA 3G3JA 5FHOA 1Y9UA 1Y20A 3RLFE 5JEIA 1MH4A 2HZLA 3SEUA 1BIYA 4GD5A 4H8JA 4N6PA 5K2YA 1OVBA 3T9HB 4OTEA 4GFRA 5KCJB 3T93B 4XKQA 3G3FA 3E3KA 1SI1A 1OVTA 4F2OA 4BDRA 3CRBA 4KYSA 3FD3A 3IOVA 1ZBMA 1FTJA 1H3DA 3K6VA 2B3BA 4GVOA 1NNKA 2F5XA 5BUUA 3FIRA 2ZNSA 3W9VA 3IO4A 3UA8A 4XKPA 2XXIA 3EF7A 2RINA 3DELB 1D9VA 5FHMA 4IY6A 5TPAA 3RY3A 1M5EA 4YKJA 3JYRA 5ITOA 3V8XB 3QAXA 4QFKA 3N26A 3R7XA 3UORA 2Y7KA 4H67A 3PPRA 3K0VA 3MC2A 1FTOA 4R6YA 2ONRA 3I6VA 3LSXA 3EHSA 4NF5A 2BJJX 2YPNA 4PFTA 2ANJA 2HZKA 5L9SA 4N07A 1AL3A 4RA1A 3BFUA 3ODBA 4F39A 1JETA 2DS9A 4O3AA 1MY2A 4YAHX 5EHSA 3SEVA 3T96B 3FVOA 4U1ZA 3T9UA 1LGBC 3O97A 4FJPA 3O29A 5HM4B 4K3FA 4DCXA 5I56B 1LFIA 3RTWB 3OD7A 4LUBA 3KGCA 1A99A 3B7DA 3B6WA 1R9LA 1FQEA 2HQ0A 4RYAA 4ESXA 1URSA 5HBCA 5KDTB 4WKMA 2THIA 3MVZA 1I6BA 4F1YA 2XXRA 5CBSA 5EHMA 1GTKA 4F18A 4MBPA 3MZBA 2A5TB 4X1BA 1SYIA 4I9DA 4EXLA 1LBCA 2RCBA 3I5OA 1R9QA 2P0SA 3MP8A 5AA3A 2F36A 1FTKA 3RN8A 1P99A 2O1LA 4TQUQ 2CZLA 4XKRA 3CG1A 2DWJA 2F97A 4OEUA 3HPIA 2OBGA 4YKIA 3FJMA 3KJ7A 5KZTA 3VV5A 4F31B 1B3HA 1FQFA 3OOAA 1MQJA 2Q89A 3VVFA 4U1OA 3IJXB 3V89B 3RGYA 4IB2A 4XTCQ 3K2DA 1MM6A 2V84A 3T9XB 1US4A 4OFLA 4KI0E 4H0WA 4DIGA 2F6PA 5A5XB 5H8NA 3IB2A 2KLFA 3KN3A 1JW5A 3M3KA 4H65A 3Q26A 4TLMB 4GF8A 3QK6A 5TP9A 3K00A 1MPCA 4EQ7A 4QHQA 4U2RA 3OELA 3IB0A 1ZTYA 2D5WA 2QS4A 4KD5A 4O3CA 5IAIA 1DMBA 1L5TA 4G8NA 2HEUA 1Y4CA 1WDNA 3C35A 3OO8A 1HSLA 3PV0E 2PT2A 5IKBA 2ALUA 3PUZE 1WVJA 3MAMA 4KCCA 4ZEIA 4DDDA 3RPWA 4EDPA 1USYE 3RQTA 3O66A 1B0LA 4TLLB 5I59B 1ZKBA 4O3BA 2DXRA 1QKBA 4IO2A 4KYDA 3UK4A 5EYFA 4QF9A 4GRKA 4ESWA 1MG1A 4EF1A 4UA8A 1UIUA 3K6WA 4EF2A 2F78A 5I84A 1Z7ME 3H3GA 4X9TA 3PMWA 4FECA 1TFDA 4OEVA 2DE3A 3CSBA 4ZS9A 2R6GE 3IOWA 2ZMBA 1IXGA 3THIA 2HXWA 5L9MA 3CFLA 2PYYA 3FXRA 5CMBA 2XXQA 1URDA 3IL1B 1UTBB 4H5FA 3IOTA 4YU0A 3PPOA 3QIMA 4MLQA 1XOCA 3CIJA 2CMOA 2F8DA 1LFHA 3H4ZA 3FXUA 4THIA 2FYIA 5F7VA 2ABHA 4IY5A 5KCJA 1VFDA 3KN7A 3K1NA 4RXLA 3KZGA 3Q28A 1FQCA 1H76A 2I0BA 1OQGA 5AA2D 3FJGA 1LAXA 3M3LA 4LA9A 3MVYA 3HO7A 2QSXA 5DVIA 3PUYE 2V3QA 4G4PA 5ITPA 2REGA 1AOVA 1N7WA 3TKDA 4POXA 1T0KA 2O51A 3B6QA 4ZE9A 3G3KA 3IR1A 1M5FA 3IB1A 1QULA 1Q1KA 1QW0A 3VLUA 3TCFA 3WAFA 5CRYA 5B7DA 3E9XA 1EZPA 3H7MA 2DE2A 2DVCA 4PP0A 1Y1ZA 3O6GA 1LAHE 3G7WA 2IA4A 5CBRA 3C32A 3EN3A 5I2NB 1S7YA 1UTHB 1P1QA 4ELQA 5AE4A 2Z8DA 1SD3A 2ZYNA 2FNCA 2VD2A 3H6VA 3OSQA 2OZZA 4MH5A 1IIWA 2F7CA 3MZ9A 1UQWA 2DYXA 3UN6A 3FVGA 4LZ5A 5FHNA 4UACA 2OJTA 4PFYA 4MF3A 1JW4A 4QSCA 3PD8A 5DTBA 5BWJA 3VVEA 5I57A 1LCFA 2ONKE 4WXJA 4OMBA 4IGTA 4PE5B 1B7HA 4QFNA 1PBQA 4YICA 3MPKA 4KPTA 1MXVA 3VXCA 3TEPA 4EUOA 4AB6A 5KDTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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