3TUSA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA02
3FVGA 1JEUA 5I57A 4Z0IA 1GR2A 5DVIA 1S50A 2OCUA 4ZEFA 1US4A 2X7PA 1LFGA 1NKXA 3QYTA 4YMAA 3E13X 1B3FA 4KFQA 1VFDA 1AL3A 4ZEIA 3HCQA 4DIGA 2F35A 5I58B 4G68C 3U94A 3PMWA 2PVUA 2UYFA 1FQBA 1N3XA 2D21A 4YKJA 5KZTA 2Y7RA 4HCYA 3O97A 3U1OA 3MP8A 4H8IA 1DTGA 2UVGA 1IUDA 4H5GA 4DZ1A 5ISUA 3TZAA 3OOAA 2XXYA 1OLCA 3MUQA 2ONRA 3Q26A 4YU0A 1JQFA 1NNKA 2H99A 1B3LA 5L9OA 2IA4A 2FYIA 3HO7A 4PFUA 4BDLA 1ANFA 4R2FA 3FUZA 1IZ1A 4RPNA 3D4GA 1IXIA 3H4ZA 2B3BA 2WKYA 2QRYA 4NWDA 1M5EA 1SW1A 3PPNA 4GVOA 3TPAA 1Y3NA 2Z22A 1TWYA 2F6PA 1FTKA 1TFDA 2CMOA 1N76A 1URDA 3HV1A 1CB6A 1P1NA 3R26A 3KEIA 1R9QA 3B6WA 3LSLA 4H0WA 3C34A 4FECA 4Q0CA 3WAFA 3DP4A 1XVYA 3CSBA 3PPRA 3E9XA 1N0TA 3T9UA 1UQWA 1ZLQA 1XVXA 5DVFA 3I3VA 4OHNA 1MXYA 4OFLA 1OVTA 3G3HA 4YKPA 1Q1KA 5FHMA 5FHNA 3CG3A 5HPQA 3USDA 4DDDA 3LBSA 4FORA 3MJNA 5I2NB 1PB7A 3CFXA 3RY3A 3FV1A 2E1SA 3M3KA 5FTHA 4U2RA 1PC3A 2REJA 1SW4A 3I6VA 1QW0A 3TMGA 3EHSA 2I49A 3TODA 2FNCA 3FVKA 2ESNA 2HZLA 1B58A 4BDOA 3RTFB 2AIXA 3OELA 4G77A 5EHMA 2PBWA 2V84A 1YAEA 1RKMA 3OEMA 1JVYA 4ELQA 4H5FA 3QUFA 2X7QA 4ZEBA 4F3GA 4U23A 2O7IA 5DTBA 1SDXA 3MZ1A 3U92A 2ALUA 2DVZA 4MLQA 1B1XA 2A5SA 3TKDA 4H67A 1MQJA 1QJMA 1MXUA 1Y3PA 1MG1A 5CMCA 2NVUB 1LB9A 2ZYMA 4Q5TA 3OD7A 4MBPA 4G8HA 2Q88A 1MQHA 1H44A 1ZTYA 4QFPA 1N7XA 4U4XA 3PUWE 4YB6A 1H3DA 1NNTA 3U8QA 1EZOA 4WEDA 2G93A 2Z8DA 4AB5A 4F3BA 5JEIA 2ZNUA 4YKIA 3T96B 1MM6A 3FVNA 3PUZE 5I59B 2DXYA 4G8MA 4I62A 1PB8A 3TTNA 1QVSA 5AA2A 1B9JA 4U22A 3IOVA 4LONB 4WKMA 4X1DA 3S9LC 4O3AA 1AMFA 2B65A 3RQTA 3S9NC 3CSGA 2DVCA 2NUVA 3VXCA 1H43A 2F34A 4OENA 5CMBA 3CG1A 2OZZA 3GXAA 5J1DA 1BTJA 1P1WA 3K2DA 4R6HA 5EYFA 1LGBC 1O63A 5AA3A 2E0SA 3KZGA 1ZJLA 1B7HA 1B3HA 3PD8A 3G7WA 4ELPA 3DELB 2Q9TA 4N6PA 4YMBA 5I56B 2XXQA 1ATGA 4O3BA 3IK6B 3T9HB 3Q25A 3S4UA 1LFHA 1Y1MA 1POTA 1UTHA 4F1VA 4IB2A 4FE8A 4GL0A 2OWSA 3SDFA 2VD3A 5BWJA 3I5OA 5DT6A 5I84A 2X26A 4IY5A 1XT8A 4QFKA 3A09A 3G3JA 3IR1A 3MZ9A 3T9XB 3A3CA 4LZ8A 3H03A 4YICA 1AH5A 1HSEA 5ICTA 1B32A 1MRPA 1ZKBA 3B6QA 3MBPA 3PUYE 2AL5A 3SESA 4IO4A 1ZU0A 4EF1A 2XXVA 4X1BA 3K1NA 4XTCQ 2ABHA 4LVQA 1MY0A 3Q27A 2VOZA 1JEVA 3KG2A 1B5HA 4OFOA 4ZZEA 5A5XB 3JYRA 1EZPA 1YTVA 3K1MA 3TTKA 3K6UA 2GH9A 3FXRA 4F22A 3N6UA 2B3FA 4H65A 1AOVA 4R72A 2V3TA 4ZS9A 5FHOA 4G4PA 1NH7A 1TT1A 4EQBA 3KN8A 2PYYA 1JW1A 1JETA 1F9BA 3O2AA 3TTLA 3MC2A 2P1SA 3KOTA 4N07A 1IXGA 1I6BA 1R6ZA 3VXBA 5TP9A 4FJPA 2F7AA 1M5BA 2HZKA 4XKNA 1LB8A 3Q29A 4XXUA 5HBCA 4MFIA 1MY4A 4JDFA 4QFNA 2W7YA 3SEUA 2VHAA 1IXCA 4QRZA 4OEUA 3UA8A 2AYSA 2RCBA 4NWCA 5DEXA 3KN7A 4NE4A 2REGA 2KLFA 3MQ9A 4L17A 2Q8JA 1R1NA 4YAHX 4OQOA 1XHYA 4BDMA 1P1OA 1IEJA 4OMBA 3KFMA 4EQ7A 1LSTA 3TFLA 4OZ9A 5CBRA 4RJZA 3K0VA 1BIYA 4F39A 2I3WA 4C1UA 2ZYKA 3HPIA 1USYE 3C4MA 4GWOA 4KHZE 1LFIA 1HSJA 3MP6A 1QKAA 1LAGE 5I57B 1FTMA 3DP8A 4X48A 1IIWA 1SD3A 1O64A 2ZXTA 4YKKA 4PP0A 3GZGA 4EUOA 1B52A 4JB7A 3EF7A 3T9VA 1OQGA 4OYVA 3O28A 4PFTA 3FJ7A 1QUIA 5TPAA 4LZ7A 4NF4A 4NF5A 4IO5A 2Z23A 1EH3A 3EHTA 4QSCA 4GL8A 3TDJA 3IB0A 2DYXA 4FEBA 3N94A 3H6TA 3PPQA 3PUVE 4F2QA 2ZNTA 1EU8A 4MF3A 3U72A 2Y7PA 3JZJA 3RUMA 3ONMA 4OETA 1B7UA 4ZEKA 1ELJA 1VE4A 3QK6A 4POWA 1MQGA 1Y4TA 4GXAA 3IB2A 4RA1A 4IGTA 3TCGA 1XS5A 3MPKA 3ECRA 2ONSA 4R9GA 3KSXA 2OWTA 3N6TA 3TELA 3QXMA 1DOTA 1LBCA 2PX1A 4PFYA 1FQDA 1Y1ZA 2Q89A 4LATA 4UACA 4IO6A 1MPCA 1P1QA 4HTGA 4DCYA 1EZ9A 3TCFA 3W15C 1B3EA 3H3GA 2I0CA 4F1UA 4R2BA 4TOZA 1NH8A 1B51A 3SEWA 4ISUA 3OO6A 5ITPA 4F19A 1II5A 1B2HA 3PPOA 2O68A 4O3CA 3OMBA 4KPTA 4KCCA 3IB1A 5B7DA 3KN3A 3V89B 1SQYA 2Y7IA 1Y20A 1M5CA 3UP9A 3ZSFA 3G3KA 1TXFA 5DYHA 2UXAA 4ZE8A 3MAMA 3FVOA 2HQ0A 3CR9A 4HCWA 4UA8A 2VD2A 5H8FA 3K4UA 1A55A 4JSDA 4PE5B 1PBPA 2ZMBA 4KI0E 4EDPA 2XX9A 1IXHA 4GLIA 2O7UA 4F1YA 4N13A 2D3IA 2HAVA 5ITOA 3MVXA 5KDTA 3K6XA 3JV9A 2DOJA 2RC8A 5H8QA 4I9DA 4FIMA 4FEDA 3KJTA 3OO9A 2UYEA 1MY3A 3SKPA 2F8DA 3O66A 3C36A 4Z7EA 1S9TA 5KCJA 1BKAA 1J1NA 1XC1A 4F3SA 5KDTB 2Y7KA 2F5XA 2HEUA 3OSRA 2NOOA 4OXVA 3MZBA 2QS1A 4BDNA 1PEBA 3DM0A 4C1TA 1B4ZA 3KOSA 3HHFA 4EXKA 4IY6A 5TU0A 3V5AA 4RNSA 4TQUQ 3K00A 3HSTA 1SYHA 3KBRA 1FQFA 4MH5A 2HXWA 1A7LA 1DPEA 2OBGA 4PETA 5IAIA 4P0GA 2XX7A 2DXRA 2R6GE 3IORA 3S9MC 2DE2A 1KWHA 3THIA 3SEYA 5AA2B 3CI8A 4WXJA 3QSLA 2F97A 3DP6A 2QL3A 1YPNA 3TCHA 2A5TA 1SVXB 1CE2A 5H8HA 4NF6A 2QMXA 2DE3A 3G3GA 2P0SA 1YCJA 4U1OA 2I0BA 2LAOA 3MWBA 3MVYA 4U4SA 3VLVA 2XX8A 3IAZA 4HS7A 3BFTA 3MW0A 5JTYA 4JSOA 2DE4A 4KCDA 1N04A 2CZLA 2Z8EA 3VV5A 2A5TB 2XXXA 3E3KA 3HHGA 2O84X 3IL1B 1NMUA 4NF6B 4FAJA 1OLAA 5ICQA 5AA4A 3QUJA 2RC9A 1NNFA 3R7XA 4XIGQ 4LZ5A 1FQAA 3RTWB 3G3IA 3LUYA 1TFAA 1LBBA 1UTHB 2QS4A 3AXFA 5CBSA 3BKIB 4JXIA 1A54A 2YLNA 2YPNA 1UIVA 1QUJA 4G8NA 2XXWA 4RXLA 1JW4A 4EXLA 1P99A 2QMWA 1NNPA 1MXXA 3CRBA 4QFOA 5AA2D 3OENA 4XKQA 2OK2A 4R74A 4YB5A 5FTIA 3CFLA 1OVBA 5EHSA 4G2ZA 1NFTA 3QAXA 1JVXA 3C31A 4HW8A 3MVWA 3VVDA 2ZNSA 4OTEA 2QPQA 3CIJA 2FA7A 3PMXA 3F11A 3CFZA 3FV2A 3MVZA 4GF8A 4QFLA 1UIUA 3RT8A 3S9EA 3S2VA 1QKBA 2PT1A 3H6VA 3K01A 2XXRA 2H5YA 2O51A 3IOTA 3P7IA 3BFUA 1DSNA 3TTRA 4KYEA 1MDP1 2O1MA 1B46A 4DXBA 4OESA 4RY1A 1B3GA 3H7MA 1I6AA 1NL5A 3RLFE 4KD5A 2DQVA 4DLDA 5L9MA 3FJGA 2XD3A 1H76A 3T66A 1AIVA 5F1QA 1WODA 5LOMA 3PGFA 4DXCA 4DXUA 1UTBA 3FGSA 3W9WA 4LQ2A 1D9VA 1ZIUA 4ZDMA 3UORA 1LAFE 2XXUA 3O9PA 4PQJA 3RN8A 4KYSA 2O1LA 2IEEA 2Q2AA 4BDQA 2PMSA 5TP9B 2ZYOA 5L9SA 2XXIA 4ZE9A 2V3QA 3OSQA 4LA9A 3H6WA 1UTBB 3L6GA 1DMBA 1USYH 2H9BA 5I58A 1US5A 4AB6A 1LCFA 4TLLB 1N3WA 5DEXB 5CRYA 1MM7A 3WAEA 1DPPA 2UVIA 1MH4A 4ESXA 3KSJA 1MXZA 2V93A 2NWJA 2QJEA 4U1ZA 1S7YA 1B40A 3SEVA 3FZVA 3VVFA 3LSFB 3C33A 2DWHA 3MP1A 4GRKA 4QHQA 1Z7ME 2Y84A 1MY1A 3PMVA 5CM6A 1B05A 1B5JA 3TQLA 1M5DA 1Y9UA 4EF2A 4OERA 4QSEA 1MH3A 1A99A 2H25A 2GHBA 4F2OA 3RNNA 2BJJX 2F6GA 4IO3A 1Y4CA 4ELRA 1GVCA 2VGQA 1GV8A 4DCXA 4QF9A 3V8XB 4ECFA 4I1DA 3KGCA 4G68A 3H06B 1ZMGA 5ELVA 3SERA 4RYAA 2UVJA 1ZBMA 1SW2A 3TAJA 4NF8A 3OO7A 5TPAB 4IO2A 4NF4B 4NF5B 4THIA 4RK2A 2RKMA 5M2VA 3LC8A 3TQWA 3O6HA 2RC7A 1L5TA 4R75A 1SI1A 5CC2A 2RINA 4G68B 1IQ7A 4P11A 1PB9A 4EQ9A 3T22A 3CVGA 4E0WA 4KYDA 1SBPA 4NF8B 4GIZA 2XHDA 1MPBA 2HAUA 4BDRA 2OJTA 1MY2A 1D4NA 4DE8A 3EPEA 3FXQA 1B5IA 3VLUA 2ANJA 3UGWA 4AQ4A 1M5FA 3RGYA 3RT6B 5BUUA 4WEPA 1SI0A 1N84A 5I2NA 2I4BA 3GBBA 4Q8RA 1HSLA 2DWIA 4GOTA 4F31B 4NMYA 3OXNA 4ELOA 1MPDA 3D4CA 3VE1B 2F7BA 3LSWA 2I6EA 3B6TA 1GTKA 2GHAA 1BLFA 3IJOB 4GD5A 1MXVA 3EHUA 4E0XA 3ILUB 2DWAA 3FIRA 4FATA 1JNFA 4M4GA 1XOCA 2THIA 3FD3A 5H8SA 2I48A 2Y7WA 1B0HA 3VFJA 3BBRA 2P2AA 2GFEA 1MQIA 2DWJA 1Z7NE 3IOUA 2DP8A 2AL4A 1MQDA 2H98A 4R9FA 5H8FB 5I2KA 1LLSA 1H45A 4TLMB 1DTZA 5K2YA 3E4RA 3FXUA 3C35A 3SETA 4LUBA 4ESWA 1POY1 2RCAA 1R9LA 5DVJA 3DLNA 4C0RA 2R9JA 4YZZA 5CMKA 4GFRA 2QSXA 4OWDA 1I6QA 3G3FA 4M1VA 5H8QB 3ODBA 3C32A 5I2KB 1LAXA 2VP1A 5CI5A 3PPPA 1GGGA 2DS9A 4PFWA 3K1PA 2XXPA 5I59A 4IGRA 4ND9A 4F3PA 3UK4A 1VFEA 3MPLA 4ZEDA 3IJXB 5KCJB 1OQHA 3IOWA 1Y3QA 4H8JA 2YJPA 1URSA 1IITA 2GRVA 4JBZA 2XD2A 3C9HA 1N7WA 4XKPA 4YB7A 3ZS6A 3V83A 1A8FA 1FW0A 5JK4A 4GQOA 3TYHA 4ZZAA 1FCKA 2XXTA 1I69A 2Z8FA 3RPWA 2Q2CA 3A3UA 2M8CA 2R71A 1B1HA 1BP5A 3PD9A 2QS2A 4MLVA 3OO8A 3TUSA 2NXOA 1JW5A 2DSFA 5AE4A 3IX1A 4OEVA 2F7CA 3KJ7A 1FQCA 4U21A 1QUKA 5I56A 3GBAA 1PBQA 3N5LA 5K2XA 4P0IA 5B70A 2PT2A 1FTOA 1B7ZA 4POXA 4JWXA 4H1XA 2HFBA 4LP2B 3FJMA 1B4HA 2V25A 4F29A 3EN3A 3GLBA 4RK9A 4K3FA 4LQ5A 1B0LA 1VR5A 1D9YA 4QSDA 3M3LA 5H8HB 3EQ1A 1D3KA 1VSOA 3LSXA 4I8CA 3FATA 1Q35A 5H8NA 1WVJA 1QULA 4ONYA 1P1UA 3TEPA 5JTYB 4KR5A 2O6AA 3H6UA 1PDAA 4JWYA 4GXSB 3K02A 1SW5A 3K6WA 1FTLA 3O6GA 4H6DA 1A8EA 5IKBA 3K6VA 2XXHA 5F7VA 4IO7A 5AA4B 1MDQA 5A5XA 5H8NB 2UVHA 3ILTB 2RF1A 4ZECA 4F18A 3UN6A 2H4IA 4Q30B 3PV0E 3TTMA 1O7TA 3Q28A 4R6KA 1A40A 2ZYNA 4R73A 3VDFA 3HN0A 2G29A 4RPOA 3U93A 1RYXA 3UIFA 3M8UA 1LCTA 1MS7A 3M3FA 1OMPA 3L6HA 3O29A 3ZKKA 3IO4A 3VVEA 4JWOA 1FQEA 2F36A 4OVJA 1B6HA 3T93B 1OIBA 3FASA 5HM4B 1FTJA 5AA1A 4NEDA 4OFJA 3PU5A 4X9TA 1WDNA 1URGA 4R6YA 2QS3A 1SYIA 2I58A 3LR1A 3N26A 3PUXE 3B7DA 2OLBA 4BLAA 2I4CA 3QIMA 1MXWA 5L8DA 3VLWA 4XKRA 1T0KA 4KQPA 2I3VA 2ONKE 5CMMA 2HCAA 3IO6A 3OEKA 3R6UA 4NTLA 3O6IA 2F78A 1LAHE 2D5WA 2O69A 2V3UA 3ZKLA 3SEXA 3W9VA 1RYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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