3TUSA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 a resolution
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Meta-hydroxy benzoic acid at 2.5 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 108
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tusA02
1GV8A 2M8CA 4QFPA 1JEVA 3U94A 4ZDMA 2XXWA 1IIWA 5DTBA 2REGA 4HCWA 1MM7A 2Y84A 2Y7WA 3KGCA 5AA3A 3MPKA 1XOCA 1IZ1A 2AYSA 2R6GE 3FZVA 1N3XA 4AB6A 4NWDA 4FEDA 4P0GA 3O66A 3E9XA 3FIRA 3EQ1A 1B5HA 4NF5B 2I49A 1XVXA 2UXAA 2G29A 2ZNTA 4RXLA 4U1ZA 3PMWA 4BDRA 1B1XA 4TLLB 4YKKA 2OJTA 4IO7A 4JBZA 2X26A 3KEIA 1Q35A 3TYHA 3VXBA 1FTLA 3VXCA 1UTHA 4THIA 1URGA 1M5FA 3FJ7A 3K2DA 5I58B 2XXQA 4YMBA 1A99A 3TTRA 3TTNA 1UTBB 2H25A 1H3DA 4R75A 2A5SA 1B4ZA 1US5A 2HQ0A 4I8CA 1A8FA 3SEXA 3EHTA 2FA7A 3G3JA 2ZYOA 1LFHA 4NF6B 5H8FB 3QIMA 4BDQA 3CRBA 3H03A 4OVJA 3SEYA 1UQWA 1MXZA 2VP1A 4ELPA 4R6YA 1MH3A 1LCTA 3IO6A 3FV2A 2XXTA 3TQLA 2X7QA 1A7LA 3K1PA 4O3AA 3IOUA 4MLQA 1MS7A 1SI1A 3IAZA 2O1LA 3EPEA 4WXJA 4G8HA 3RNNA 4KYEA 1Y9UA 4OESA 3GBBA 5KDTA 1A40A 3UIFA 5ITPA 4AB5A 3PUXE 1N84A 1SW1A 4GL0A 4RK9A 2XD2A 5JTYB 1N76A 4YKJA 2DWHA 3G7WA 2XXUA 4G68A 1MXUA 5TPAB 4FJPA 1XHYA 3LSWA 2PVUA 2UVHA 4HCYA 1IXGA 4OEVA 1PB8A 3VDFA 4H67A 4ZEIA 1SW5A 1TFAA 4RPOA 4QFNA 3W15C 3H4ZA 4ESWA 4OENA 3PPNA 1JQFA 4QHQA 4ZECA 3PMXA 4F22A 3JZJA 4H1XA 3MVYA 2DE3A 1S9TA 1B58A 3MP8A 4NF4B 1B3GA 4ECFA 4PETA 2HAVA 2WKYA 3SETA 3EN3A 5AA2B 4JWYA 4M4GA 1MPCA 2ONKE 4U4XA 2QRYA 2AL4A 3H6TA 1HSEA 2F78A 3R6UA 3EF7A 2QJEA 4K3FA 1MQGA 1NMUA 2IA4A 2E1SA 1Y4CA 3CIJA 3KFMA 3MJNA 4OHNA 5L9SA 2ZNUA 4N6PA 3CFZA 1LBBA 2ZNSA 1BIYA 4U4SA 4H8JA 3LSLA 3SEUA 5I56A 5A5XA 4R2BA 1P1NA 3U8QA 4OWDA 3R7XA 3RTWB 2Z8EA 1OQHA 3GZGA 3LUYA 2OCUA 4GD5A 5ISUA 1JNFA 5KCJB 1B05A 1FQCA 3USDA 3MVZA 4EDPA 4QSEA 1US4A 4WEDA 3FJGA 4E0XA 3TKDA 1TFDA 4F1YA 3UGWA 2DSFA 2F7CA 5BWJA 1L5TA 4LZ5A 4L17A 3TTKA 3HPIA 4OEUA 4PFYA 4IY5A 3LR1A 3MVXA 1O7TA 1WVJA 3JYRA 4OZ9A 1TT1A 3OO8A 1I6AA 2DE4A 1QULA 3FXRA 3FVGA 2I3WA 2V3TA 3OEKA 2QS4A 2V3QA 1PC3A 1DMBA 1CB6A 2O7IA 2ZYKA 3RLFE 4U22A 2QMXA 1MY4A 4E0WA 3LSFB 4U1OA 1NNTA 2XXRA 1N0TA 3SEWA 1PB7A 2B3BA 4Q8RA 3O28A 5K2XA 4N07A 5HM4B 4QSCA 3AXFA 4AQ4A 3WAFA 5TP9A 3ILUB 3VVEA 2ZXTA 4MFIA 3QK6A 1MDQA 1MXVA 3Q27A 3OD7A 1UIVA 3M8UA 1URSA 2AIXA 3TCHA 1P1QA 1B52A 3G3IA 2PX1A 3I3VA 3GXAA 3QUFA 1FTJA 2DXRA 3OOAA 4P11A 4BLAA 4XKQA 2P0SA 2Z8FA 3FXQA 2RCBA 3KJ7A 2I0BA 3TCGA 1EZPA 1HSJA 3V8XB 2XXHA 4YB6A 2F36A 1II5A 2F34A 3DLNA 4R9FA 1R9QA 2Z8DA 2ONRA 1FQBA 1LAFE 2DP8A 5IAIA 3WAEA 4F29A 4Q0CA 2HZKA 1PDAA 2A5TB 1LFGA 2CMOA 3U92A 3T9UA 3QUJA 2FNCA 4PFTA 4KPTA 3O9PA 3IOVA 3B7DA 4X48A 2QSXA 1UTHB 4OERA 2UVGA 1I69A 3T93B 4GVOA 4YKIA 2AL5A 5K2YA 2H99A 3O2AA 1FTMA 1M5CA 3H6WA 4R2FA 1OQGA 4QF9A 5FHMA 3KSJA 4OFOA 2YLNA 4GWOA 2DVZA 1LB8A 1SDXA 4KHZE 3FVOA 5CRYA 1MDP1 2V3UA 3VV5A 5EHSA 1AH5A 2GHBA 2XX9A 2QS1A 4H65A 4DZ1A 5CMKA 1ZU0A 1PBPA 3LSXA 1BKAA 3S9EA 4JDFA 1Y20A 3KN3A 4ZE8A 3OSQA 3C36A 2F7BA 2VD2A 3FXUA 4YKPA 4XXUA 1USYE 1LLSA 2F7AA 4U21A 3OEMA 4X1BA 3K1NA 3T9HB 1AL3A 1A8EA 4DXUA 4F1UA 3Q26A 1FTOA 3ILTB 3MW0A 2H5YA 4C1TA 5DVIA 2VHAA 3F11A 4F3PA 1B1HA 5KDTB 4OFJA 4FAJA 3CSBA 4H5FA 4DXBA 5JEIA 5I59A 2UYEA 2RF1A 2O7UA 4HW8A 4G68B 2H4IA 1Y1MA 4QFKA 4F3SA 2RC9A 4LA9A 3C9HA 1P1WA 1NH8A 2D5WA 3RN8A 3KZGA 2GH9A 4XKPA 3TQWA 5CC2A 1MM6A 4FEBA 5F7VA 1J1NA 4QRZA 1JW5A 4C1UA 3Q28A 3PPPA 3MZBA 4RPNA 3DP4A 4KQPA 3RT6B 2PBWA 4ISUA 3PMVA 5CBSA 3TDJA 3O29A 3CI8A 3D4CA 1MPBA 5H8HB 4XTCQ 5H8SA 1O64A 1JEUA 3IOWA 2P2AA 2O6AA 3IOTA 2XXVA 4LP2B 4Q30B 2OWSA 1MY2A 1MPDA 4G8NA 4FE8A 2ZYNA 4WKMA 3TEPA 2Q8JA 5I56B 1MQJA 4EF2A 4R74A 5A5XB 3PUVE 4QFOA 1SYHA 3IB1A 1UIUA 1D3KA 4UA8A 3CG1A 2B65A 4H5GA 2VOZA 1NKXA 1PEBA 1B3HA 1WODA 2Q89A 3SERA 3C4MA 2O68A 1NNFA 1Y4TA 4F3GA 5ICTA 3KSXA 3ONMA 3R26A 4FECA 4XKNA 1LB9A 4OETA 2DWIA 3N94A 5H8NA 3K6XA 4G68C 1D9YA 1A55A 1VR5A 5AE4A 3P7IA 2E0SA 3IORA 4YB7A 4ZS9A 2ZYMA 1B5IA 5L8DA 2HCAA 5EYFA 2QS2A 4U23A 2F6PA 4PP0A 1Y1ZA 3ZKKA 5DEXB 3DP8A 3HV1A 3KJTA 3I6VA 3O6IA 1B0LA 5FHOA 5FTHA 4QSDA 1M5BA 1I6BA 1M5EA 2DE2A 4JSDA 3TUSA 3VLVA 3K02A 3MPLA 1ZIUA 3T22A 5I58A 2ABHA 3V5AA 1B6HA 1H43A 1B7UA 3UK4A 2GFEA 2F35A 5DVJA 5M2VA 3U93A 2CZLA 2LAOA 1UTBA 4EQ9A 4QFLA 2HEUA 2PYYA 3E13X 5TP9B 3HCQA 2Z22A 1TWYA 4POXA 3H6VA 3PUWE 2I58A 2GHAA 2HAUA 2R71A 3K1MA 3S4UA 1S7YA 1SI0A 1EZOA 1GVCA 2RC8A 4NTLA 1IXIA 3ECRA 1FQDA 3T9VA 1P1UA 3L6GA 1LFIA 4KD5A 3PUYE 1TXFA 5B70A 4NWCA 3I5OA 2Y7IA 1MRPA 3KOTA 2D3IA 5I57A 2NXOA 1NH7A 2Y7RA 1R9LA 1MQHA 1QW0A 2OZZA 3C34A 1PBQA 4Q5TA 3BFUA 3PPRA 4DIGA 4XIGQ 2I48A 1H76A 4EUOA 2D21A 4PQJA 3OXNA 2UVIA 1B7ZA 5JTYA 3SESA 2FYIA 2Y7KA 3TTMA 3OSRA 2H98A 1IITA 1LBCA 3O97A 3L6HA 1FQFA 4GXAA 2H9BA 1YTVA 3H06B 3FVNA 1VFDA 1B4HA 1FCKA 4RNSA 4C0RA 4BDLA 4N13A 5I84A 1B2HA 4O3BA 4G2ZA 1POY1 1XC1A 2ONSA 3IJOB 4MF3A 4EXKA 2XXPA 4IO2A 2QPQA 1CE2A 2NOOA 3OELA 4KYSA 1KWHA 3IL1B 3HHGA 4I9DA 1B46A 2BJJX 3MZ9A 1N7XA 3MP6A 1JETA 2XXXA 4TOZA 3MC2A 3QYTA 5CMCA 2REJA 4IO3A 2KLFA 2XX8A 2I4BA 3G3HA 2ZMBA 4YICA 4BDOA 4F19A 3HO7A 1DPEA 1SW2A 4DCYA 1B51A 3LC8A 3KN7A 1GR2A 3K00A 4LVQA 2Q2AA 4OTEA 3N6TA 3O6GA 3IK6B 4RYAA 4R6HA 1B40A 1RYOA 3TELA 4KCCA 5DVFA 3OO9A 3SEVA 1MG1A 4PFWA 3IB2A 4GXSB 3OO7A 4OXVA 1LCFA 1QUJA 1S50A 3TAJA 3DM0A 4PE5B 3C32A 3A09A 4LATA 1OIBA 4NMYA 3FUZA 3VLWA 2P1SA 3VLUA 3O6HA 3N6UA 4LQ5A 4RK2A 2Q2CA 1QKAA 3MWBA 1OMPA 3U1OA 3EHSA 3M3KA 5TU0A 4GF8A 4XKRA 5JK4A 3T96B 3OMBA 1LAXA 4GFRA 1B3FA 4Z7EA 1POTA 5EHMA 3K6WA 4RY1A 1H44A 3S9NC 2B3FA 3KBRA 3N26A 1P99A 1DTZA 2O51A 3RGYA 1YPNA 3PU5A 3UA8A 4WEPA 2O1MA 3T66A 4DDDA 3K0VA 4NE4A 3FATA 2F8DA 3MAMA 2XXIA 3C33A 1USYH 3K6UA 4JWOA 3PPQA 1N04A 4MLVA 2W7YA 3GLBA 5I2KA 4KCDA 4YAHX 2YPNA 5H8QA 4OYVA 1MY0A 1DTGA 5B7DA 3CG3A 1ZBMA 3S9LC 3Q25A 1ELJA 1OLAA 5H8NB 1B9JA 3MVWA 2NWJA 2R9JA 1DSNA 4EQBA 3TODA 4H0WA 2DS9A 3TTLA 3IR1A 4IO4A 5CBRA 2RINA 5HPQA 1OLCA 2DWAA 3FJMA 2F6GA 3M3LA 1N3WA 1B0HA 1IQ7A 2HZLA 1SW4A 4NF8A 3H3GA 2Y7PA 2OK2A 3HHFA 1MQIA 2A5TA 5CMBA 4ND9A 1ZKBA 4P0IA 5I2NA 4IO5A 3D4GA 4R9GA 4ZE9A 2I6EA 3UP9A 4ONYA 4YB5A 3TMGA 5ICQA 3LBSA 5L9OA 1IXHA 3IJXB 5DYHA 4DE8A 1AIVA 1NNPA 3PV0E 2GRVA 3DELB 4NEDA 1YCJA 4I1DA 4ZEDA 3ZKLA 1ANFA 4M1VA 4O3CA 1DPPA 1VFEA 4OQOA 1QJMA 1ZJLA 1JVXA 4KR5A 3MP1A 4R6KA 1NNKA 4BDMA 4IB2A 2G93A 2RCAA 2PMSA 2XD3A 1QVSA 1BLFA 1P1OA 1FW0A 4YZZA 1T0KA 3FVKA 2OBGA 3TZAA 2UVJA 5AA4A 5IKBA 4ZEKA 4BDNA 4GRKA 3C31A 1NL5A 3M3FA 2PT1A 4I62A 4ZZAA 1IUDA 1NFTA 1BP5A 4HTGA 5I57B 1GTKA 4ELQA 3B6QA 2VGQA 1SVXB 1JW1A 3VVFA 5L9MA 1Y3PA 3PGFA 2I3VA 4RJZA 4F18A 1B7HA 2QMWA 1MY1A 3B6WA 4LQ2A 3A3CA 3SDFA 2DYXA 4JSOA 2XHDA 1QUKA 2ANJA 4ZZEA 1R6ZA 3E3KA 1D4NA 5CI5A 4NF5A 4RA1A 3V89B 3HN0A 1VE4A 3RTFB 2ALUA 4YU0A 2DOJA 5FHNA 3TCFA 4LUBA 3E4RA 3PD8A 3UORA 3UN6A 5AA2D 1QUIA 4ZEFA 5FTIA 1YAEA 1MXWA 4JWXA 1HSLA 2V25A 4MH5A 3TFLA 1Q1KA 3CSGA 1ATGA 4R73A 4KYDA 2Z23A 2THIA 1XT8A 3RT8A 1SQYA 3IX1A 3W9VA 3CFLA 3W9WA 4GLIA 5H8HA 4NF6A 3VVDA 5H8FA 4POWA 1FQEA 4FATA 4EXLA 1IXCA 3PPOA 4LONB 4IGRA 4ESXA 2RKMA 4UACA 1LAHE 3RPWA 1B3EA 4DXCA 4KFQA 1OVBA 4LZ7A 2VD3A 3H7MA 2UYFA 1ZMGA 2Q88A 4YMAA 3DP6A 3PUZE 4F39A 2DXYA 1FTKA 3QAXA 3RUMA 2DQVA 1N7WA 2ESNA 3A3UA 1M5DA 3C35A 1EH3A 3H6UA 3IO4A 1DOTA 3B6TA 3G3FA 1MQDA 2Q9TA 4F3BA 2PT2A 1ZTYA 5BUUA 4F1VA 5LOMA 3OO6A 1LGBC 3KG2A 4IO6A 3VE1B 1RKMA 5TPAA 3K6VA 4GQOA 1AOVA 2O84X 5J1DA 4U2RA 3U72A 3BBRA 4FORA 4LZ8A 1MXXA 3Q29A 3MZ1A 2DVCA 4MBPA 3QSLA 3CVGA 1RYXA 4ELOA 5DEXA 4JXIA 5AA1A 2O69A 1D9VA 3KN8A 1LAGE 1B32A 4HS7A 4NF4A 1Y3QA 1WDNA 5ITOA 4EQ7A 4IY6A 4F2OA 3MBPA 5AA2A 1B5JA 3CFXA 2HFBA 4X1DA 3N5LA 4GIZA 1ZLQA 3QXMA 4JB7A 3TPAA 1B3LA 2X7PA 4FIMA 3THIA 2V93A 4TLMB 4H6DA 3GBAA 4OMBA 1EU8A 5I2KB 2F5XA 3K4UA 1O63A 1H45A 4F2QA 1MXYA 3FD3A 5H8QB 3FGSA 1JVYA 1R1NA 3K01A 5I59B 4F31B 2IEEA 3RQTA 5F1QA 1AMFA 1I6QA 3ZS6A 2HXWA 5CM6A 1Z7ME 1OVTA 2NUVA 3SKPA 1MY3A 5CMMA 2I0CA 5KCJA 3CR9A 3FV1A 2QS3A 1QKBA 2I4CA 1MH4A 5ELVA 4G77A 4R72A 3MUQA 4NF8B 4DLDA 1SBPA 2OLBA 1URDA 3OENA 4ZEBA 4IGTA 3G3GA 1XVYA 3IB0A 2XX7A 1FQAA 3FASA 3RY3A 5I2NB 2NVUB 2RC7A 1Z7NE 1JW4A 1EZ9A 4GOTA 1XS5A 4H8IA 2V84A 3MQ9A 4Z0IA 3ZSFA 4OFLA 2OWTA 1PB9A 1IEJA 1F9BA 1SYIA 4X9TA 2QL3A 1A54A 4DCXA 3JV9A 3T9XB 5HBCA 4GL8A 4ELRA 3HSTA 3G3KA 2YJPA 3S2VA 3PD9A 1VSOA 2F97A 5KZTA 4G4PA 1LSTA 4G8MA 5AA4B 3BKIB 1BTJA 1Y3NA 3EHUA 3ODBA 3S9MC 5DT6A 1SD3A 4KI0E 4PFUA 4EF1A 3BFTA 3VFJA 2DWJA 3KOSA 2XXYA 1GGGA 3V83A 4TQUQ
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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