3TZAA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(2-(2-carboxyethyl)-5-chloro-4-nitrophenyl)propionic acid at 1.9a resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A new phenylalanine derivative acts as an antagonist at the AMPA receptor GluA2 and introduces partial domain closure: synthesis, resolution, pharmacology, and crystal structure
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tzaA02
2B3BA 1NL5A 4FECA 3BBRA 2Y84A 2UVJA 2XX8A 1EZ9A 5CRYA 3ZS6A 2RCBA 1OQHA 1LBBA 3PUXE 3OSQA 4QFKA 4O3BA 1R6ZA 1FCKA 1Q35A 5L9SA 3KFMA 3MVYA 1TXFA 4LP2B 1AOVA 5H8QA 2OK2A 1MXUA 1USYE 3CG3A 3MVXA 3KZGA 3N6UA 4WKMA 4G8NA 1VFDA 1LAHE 2F78A 4JBZA 1QUKA 2QRYA 1MQDA 2X7PA 1JW5A 3H6UA 1O63A 1J1NA 4R9FA 4FATA 3TELA 2F34A 4GL8A 3KN8A 3JZJA 4IO5A 1B0HA 1LCFA 1GR2A 4FEDA 3TQWA 3OO9A 4IGRA 3IK6B 4RPNA 4WEPA 2F6PA 4RJZA 4G77A 1FTOA 3GZGA 2H25A 3CFXA 5M2VA 3O6IA 2RC9A 5BUUA 3IB0A 1LCTA 3K00A 4X48A 1PB7A 4ELQA 2H98A 4ZEIA 4LONB 2ZNTA 1B0LA 2UYEA 2DWAA 3OEMA 5JEIA 3HN0A 1MQIA 5LOMA 2QMWA 1HSJA 5ICTA 2H99A 4U4XA 1BTJA 3PU5A 3RT6B 3PPRA 4LA9A 4XXUA 2GRVA 1B58A 1DTZA 1N84A 1ZIUA 3IB2A 4JB7A 3UK4A 4KHZE 2AIXA 5KZTA 3R7XA 2OZZA 3B6QA 3WAFA 1NNPA 5DEXB 4U22A 3SETA 3Q25A 2IA4A 3KBRA 3FJ7A 1A99A 3LC8A 3CFLA 2Q9TA 1JNFA 4F3GA 4U1ZA 2Y7PA 4X1BA 1PDAA 3K4UA 4BDOA 1FTLA 4IO6A 1M5DA 3E3KA 1Z7NE 5I57B 3DELB 5CM6A 1B3HA 1URGA 1SQYA 4R9GA 2AL4A 1B46A 4H5GA 3G3FA 1Y9UA 3PV0E 4OXVA 3I6VA 4BDLA 4GL0A 5CMMA 2F35A 2Z23A 2XXYA 3QUFA 3MQ9A 4YKKA 1NMUA 2OCUA 5BWJA 1Y1ZA 2FNCA 3IB1A 5FHOA 2O68A 4PQJA 2V93A 4R6YA 2HFBA 4F2OA 3I3VA 5FHMA 4WXJA 2E1SA 1EH3A 1D9VA 5H8SA 1Q1KA 1S7YA 2I0CA 4KR5A 1UTHB 3S9LC 2VD2A 1R9QA 3RY3A 3LSWA 5AA2A 4BDRA 5B70A 4NF4B 1B7ZA 4JWOA 1N7WA 1NNFA 3MZ1A 2I6EA 4OVJA 3OO6A 4TOZA 3S9EA 2R71A 1B3FA 1JETA 1UTHA 4GIZA 2OWTA 4L17A 3S9MC 4OEUA 1MPBA 3VFJA 3QUJA 1POY1 3CG1A 4NF4A 3OO7A 3OEKA 4EQBA 4EUOA 3EF7A 2Q2AA 2O7IA 3C32A 3KOTA 2NXOA 2F36A 1SI0A 3N26A 4IO7A 5CI5A 1P99A 2B65A 3QIMA 1PB9A 1I6BA 4HW8A 2VP1A 1S9TA 3FGSA 2P0SA 2Z8EA 3FJMA 3JYRA 2XXTA 4U4SA 1SD3A 1FTMA 3OELA 4RY1A 1DOTA 2QS1A 3IR1A 4XKPA 3SESA 3CSBA 3OXNA 5TP9B 4GXAA 4G2ZA 4ESWA 2PYYA 4POWA 3K0VA 4H8JA 4GRKA 4OQOA 3K6UA 3K2DA 1DPPA 1SDXA 5IKBA 4OESA 1FQAA 5I84A 2P2AA 4EXLA 4NWDA 1SW1A 2XXVA 5TP9A 4G68A 1JVXA 5EHMA 4YB7A 4H5FA 1II5A 2CZLA 2H5YA 3PMWA 4K3FA 2Q88A 1CB6A 4C1UA 2PBWA 1Y20A 4IB2A 3MC2A 4EF2A 3V89B 2OWSA 2GHBA 4R2BA 3PD8A 3LSFB 3O97A 5ICQA 3B6WA 4JSOA 5TU0A 3K02A 3S2VA 1USYH 3RUMA 3S9NC 2NUVA 1NNKA 1OMPA 2GH9A 5I59B 1MDP1 2HCAA 1B52A 1LSTA 2FA7A 3ECRA 5IAIA 4G68C 5CC2A 3PPOA 4R73A 2DE4A 1SW2A 2Y7RA 1Y3NA 3FJGA 5I59A 4Z7EA 5K2YA 1ELJA 3E9XA 3M3LA 4AQ4A 2DE3A 1M5CA 4POXA 1OIBA 2HZLA 3RQTA 3TTKA 2REGA 2IEEA 4ZEBA 2BJJX 2QSXA 1LAXA 3G3IA 1SVXB 3K01A 2RC8A 3D4CA 3Q28A 4EQ9A 1B51A 2F97A 4QRZA 1VFEA 3KSXA 3EQ1A 3SEYA 2QS4A 1FQDA 3BKIB 3HO7A 1A8EA 3GBBA 1B2HA 2XHDA 3H6TA 2VGQA 1EZPA 1JW4A 4OMBA 4HTGA 4ONYA 1SBPA 2VD3A 1FTKA 3RGYA 3U1OA 1P1NA 2PVUA 3H3GA 3H6VA 4LZ7A 4EQ7A 2WKYA 4OERA 1B9JA 2UVIA 3LBSA 4UACA 4H1XA 1D3KA 4R75A 3QSLA 4F18A 1T0KA 1MG1A 3FZVA 4PFYA 3N94A 3PMXA 1NH7A 1RYXA 4ZECA 2ZNSA 3CFZA 4IGTA 5JK4A 3W9WA 3FV2A 2YJPA 5ISUA 1TT1A 3M8UA 1HSEA 3QYTA 2E0SA 4PFWA 1MXVA 3MJNA 1ZTYA 1URSA 1DMBA 1B1HA 3T9VA 3FXUA 4THIA 3HHFA 2DSFA 4GLIA 1HSLA 3IJOB 1OVTA 3E13X 4LZ5A 3I5OA 1B5HA 2QS3A 1ZLQA 2XXXA 4ZE8A 5DVFA 4R6HA 2X26A 1ZBMA 1B5JA 1FQEA 3FXQA 4FE8A 3C9HA 2DOJA 2R9JA 5I56B 3VV5A 1IZ1A 5AA2D 2Y7IA 2DWHA 3MUQA 4YAHX 1DPEA 3O29A 5FTIA 1A8FA 4JDFA 3MP6A 2UYFA 3TFLA 3V83A 1POTA 3UP9A 1XHYA 3TCFA 3IJXB 3RPWA 5I56A 3THIA 4F1YA 3KN7A 4R74A 4KCCA 1B3EA 3PUVE 1MPCA 1GV8A 3SERA 5J1DA 4LVQA 1B3GA 3HSTA 1QULA 1YPNA 4DCYA 4GQOA 4QSDA 3TQLA 1IIWA 1MY1A 1O7TA 4KYSA 3MZ9A 1IEJA 1LFIA 4H67A 3G3KA 3O6HA 3H06B 1TFAA 4RA1A 1JEUA 5HBCA 4KYEA 2ONSA 1H44A 1ZMGA 3L6GA 5DEXA 2R6GE 4F3SA 3C33A 4NMYA 2HAVA 3ZSFA 1VR5A 1JVYA 3H6WA 5DYHA 3T9XB 4ZZAA 4MFIA 1B7UA 1H45A 4Q0CA 1IQ7A 1YTVA 3FVNA 4MLVA 5CMCA 1UIVA 2HQ0A 4JSDA 4MF3A 5EHSA 1ZU0A 4GXSB 4QFPA 5I57A 4BLAA 5H8NB 1R9LA 4RPOA 2XXUA 1FTJA 1XVXA 3C36A 4FJPA 3TCGA 1ANFA 3U94A 5HPQA 3CVGA 3WAEA 2ANJA 3E4RA 1M5EA 4GF8A 1BIYA 3MW0A 1JEVA 1XVYA 3TKDA 3W9VA 3UORA 3EN3A 5H8NA 5FHNA 3G3JA 4LQ2A 4KCDA 4IO4A 1P1UA 1MDQA 3ONMA 2QS2A 2G93A 1I69A 1N76A 2I3VA 3IOWA 4HCWA 4IY6A 5H8HB 3TTRA 1JQFA 3TMGA 3VDFA 3M3KA 1EZOA 4F3PA 1I6QA 3IO6A 2DE2A 3TZAA 1F9BA 2F6GA 3PPPA 4X1DA 2XXRA 4YKPA 2O1MA 4BDQA 1OLCA 1P1OA 3OOAA 3T22A 3CI8A 4GVOA 1MXZA 5FTHA 3RTWB 4F19A 3P7IA 5H8HA 3C35A 4F1VA 1GTKA 4OFJA 3W15C 2XXIA 3VLUA 3PGFA 1MY4A 1MY2A 3C34A 4OFLA 2RINA 2Z8DA 4FEBA 4KFQA 3MP1A 1MQJA 4F2QA 3BFTA 3G3HA 3LSLA 3FXRA 2DVZA 3JV9A 4PE5B 3GBAA 4LATA 4M4GA 4N07A 5F7VA 2Z8FA 3OMBA 4KYDA 4QSCA 5DVIA 4WEDA 4PFTA 1US5A 3QAXA 3HV1A 4LQ5A 1A54A 3EHTA 3QK6A 3UIFA 3TYHA 2B3FA 1M5BA 2H9BA 5F1QA 3S4UA 3EPEA 2Y7WA 2NVUB 1MXYA 3MPLA 4F3BA 1WDNA 3ZKLA 4GOTA 4YMAA 2YLNA 2D5WA 3KGCA 2PMSA 4PP0A 5ITOA 1Y3PA 1IXHA 3MVWA 1P1QA 1B40A 5L9MA 4ZEDA 2XD3A 4ECFA 2AYSA 3FVOA 1MQHA 4U23A 3RTFB 4OWDA 4GWOA 4AB6A 2V3TA 3OD7A 3UGWA 2OBGA 3TEPA 1OVBA 1N04A 4U1OA 4R2FA 3Q29A 1ZKBA 4I9DA 5CMBA 2PX1A 1I6AA 1QVSA 1LGBC 2OLBA 5A5XB 2DWJA 3AXFA 3GXAA 1PB8A 2ABHA 3TCHA 4OENA 2RF1A 3ILUB 4H8IA 3FD3A 5L8DA 3EHUA 2UXAA 3TPAA 1YAEA 1Y4CA 4NEDA 4X9TA 1Y4TA 5CBRA 3T93B 1LB9A 4R72A 4LZ8A 2F5XA 4BDNA 1QJMA 1B32A 5A5XA 1LFGA 3H4ZA 1MPDA 5KCJB 1CE2A 5DT6A 1UQWA 3KSJA 3D4GA 3RLFE 3IX1A 3TDJA 4RK2A 2DXYA 3MBPA 3SEVA 2F8DA 4OYVA 3U72A 1MXWA 2I3WA 4ZEFA 2HEUA 4NE4A 2HZKA 1IXCA 3ILTB 4NF8B 3CIJA 3TTLA 2CMOA 1H43A 3O6GA 4Q5TA 1FQCA 1WODA 3SKPA 3A3UA 3B6TA 5KCJA 5EYFA 4DCXA 2GFEA 4KD5A 2KLFA 5DVJA 3UN6A 1ATGA 3Q26A 4JXIA 4ZDMA 4R6KA 4NF8A 3PD9A 4HCYA 1MM6A 2F7AA 2I58A 4P11A 1PBQA 4RK9A 2AL5A 3SEUA 3VXBA 1URDA 2F7CA 1AL3A 3FASA 3DM0A 2ZNUA 3IL1B 4N13A 3TAJA 2I4CA 3C31A 4PFUA 5H8QB 4OHNA 1B6HA 1FQFA 3DP6A 4QFLA 4H6DA 4OETA 1LBCA 3VLVA 4U21A 3T96B 4KQPA 5AA4B 4FORA 1B05A 2A5TB 3OSRA 4XKQA 2M8CA 3RT8A 3K1MA 1MH4A 5I2KB 1B1XA 3EHSA 1QUIA 3BFUA 1S50A 4OFOA 3KEIA 3MP8A 3T66A 5ELVA 5AA4A 1B4HA 2A5TA 2F7BA 4IO2A 5KDTB 4MLQA 2I48A 1YCJA 4RNSA 3LUYA 5I2KA 4RYAA 1ZJLA 4XTCQ 4E0WA 3FIRA 4DXUA 3C4MA 3IOTA 3PUYE 2V84A 3G7WA 4HS7A 5AE4A 3CSGA 1XS5A 5KDTA 1LFHA 4NTLA 4ELPA 3U92A 1VE4A 2G29A 3K1PA 2DYXA 1PC3A 1N3XA 4H65A 2GHAA 1LLSA 3DP8A 4FIMA 1LB8A 2I4BA 5JTYB 2O6AA 4ESXA 2O7UA 5DTBA 3H7MA 3MVZA 2QJEA 4YZZA 1OLAA 4ZS9A 4NF5B 4YICA 4DIGA 1OQGA 1NH8A 2O84X 1R1NA 1SI1A 2QL3A 4GD5A 2ZYMA 1KWHA 2X7QA 4EF1A 3ODBA 1N7XA 3HCQA 2RKMA 5AA3A 5JTYA 2ZXTA 2XXQA 4IY5A 4UA8A 5TPAB 1D9YA 3O66A 3KG2A 1H3DA 4OEVA 4O3CA 1QKBA 3KOSA 4Z0IA 2HXWA 4MBPA 4PETA 4NF5A 2THIA 2PT2A 1VSOA 2QPQA 4OZ9A 3KN3A 3A09A 4TLMB 4O3AA 4BDMA 5TPAA 5H8FB 3SEWA 3MZBA 4ELOA 4DDDA 4F22A 2DS9A 1A55A 2PT1A 4U2RA 3FVGA 3FV1A 4FAJA 4DLDA 4QFOA 2D21A 3PPQA 4IO3A 3LSXA 4DZ1A 1B5IA 4Q30B 4AB5A 4DE8A 5H8FA 4QHQA 3TODA 4Q8RA 5CMKA 1MXXA 2OJTA 2REJA 1XOCA 5AA2B 3GLBA 2FYIA 4XKNA 3FUZA 2DQVA 4NF6B 3K6VA 1PBPA 4QFNA 3IO4A 2V3UA 5I58B 3VVDA 4RXLA 1GVCA 3MPKA 3LR1A 2O51A 1NNTA 4ZE9A 1H76A 1MQGA 2QMXA 1RYOA 1SW5A 3DP4A 1L5TA 5ITPA 3MWBA 3MAMA 4YKIA 3K6WA 1N0TA 5AA1A 3SEXA 4NF6A 2UVGA 5I58A 4YMBA 5I2NB 4F29A 4NWCA 1IITA 3VXCA 3VVFA 1EU8A 4H0WA 1NKXA 1QKAA 4M1VA 1A7LA 4N6PA 3OO8A 4YU0A 3KJ7A 3IORA 4TQUQ 1MY0A 1MY3A 5L9OA 2DWIA 2XX9A 1B7HA 1BKAA 1BP5A 4I62A 4F31B 1RKMA 5K2XA 2XXHA 5I2NA 2NWJA 2XX7A 4ND9A 1LAFE 1MS7A 3CRBA 2V3QA 3F11A 3QXMA 3R26A 3FATA 4I8CA 1SYHA 1XC1A 1JW1A 2NOOA 4ELRA 2VHAA 4KPTA 3G3GA 1AH5A 2HAUA 3HHGA 1FW0A 3OENA 3Q27A 2Q2CA 2I0BA 3TTMA 1AMFA 4LUBA 4JWYA 2RCAA 3U93A 4ISUA 3VVEA 1MRPA 4P0IA 1O64A 4ZEKA 3PUWE 3DLNA 4G68B 3RNNA 3O28A 4G4PA 2ZYOA 3T9UA 1IXIA 3IOVA 2V25A 1TWYA 1SYIA 4XKRA 4EXKA 1XT8A 1SW4A 4G8MA 2VOZA 1A40A 3O2AA 1UIUA 3M3FA 1GGGA 3TTNA 1NFTA 4YB6A 5CBSA 3ZKKA 4XIGQ 1BLFA 2DXRA 4C0RA 2Q8JA 1MM7A 4YB5A 1Z7ME 5B7DA 1UTBB 1B3LA 3N5LA 2RC7A 3TUSA 3V5AA 1DSNA 4I1DA 4JWXA 2UVHA 2W7YA 4E0XA 1Y1MA 2Y7KA 3U8QA 3CR9A 4F1UA 1AIVA 3H03A 4YKJA 2ESNA 1N3WA 1B4ZA 1IXGA 2A5SA 4MH5A 4OTEA 1UTBA 3B7DA 2ONRA 3VE1B 2XXPA 2YPNA 4F39A 1WVJA 2I49A 3VLWA 1LAGE 4QSEA 3K1NA 3V8XB 4ZZEA 3PMVA 1D4NA 2P1SA 2O69A 2D3IA 4G8HA 3IAZA 1US4A 3O9PA 3UA8A 2XXWA 4DXBA 2XD2A 1MH3A 1IUDA 4KI0E 3T9HB 2Z22A 3PUZE 2O1LA 3FVKA 3HPIA 3N6TA 5HM4B 4TLLB 2ZYKA 2Q89A 3L6HA 2ZYNA 1DTGA 2ONKE 2DP8A 4DXCA 3PPNA 1QW0A 3A3CA 2LAOA 4P0GA 2DVCA 4C1TA 3K6XA 4QF9A 3USDA 1PEBA 3IOUA 1TFDA 3RN8A 2ALUA 1QUJA 2ZMBA 3SDFA 3KJTA 2H4IA 1Y3QA 3R6UA 4EDPA 1P1WA 1FQBA 4GFRA 1M5FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B3BA 1NL5A 2XWKA 4FECA 5EQ9A 3BBRA 2Y84A 2UVJA 2XX8A 4IR8A 2XWIA 1EZ9A 5CRYA 3ZS6A 2RCBA 1OQHA 1LBBA 2HXRA 3PUXE 3OSQA 4QFKA 4O3BA 4X8RA 1R6ZA 1FCKA 1Q35A 5L9SA 3KFMA 3MVYA 1TXFA 4NF0A 4LP2B 1AOVA 5H8QA 5ET5A 2OK2A 1MXUA 4MNCA 2FHYA 1USYE 3CG3A 3MVXA 3KBZA 3KZGA 3N6UA 4WKMA 4G8NA 1VFDA 1LAHE 1YZ0A 2F78A 4JBZA 1QUKA 1LBVA 2QRYA 5EQ7A 1FBHA 1MQDA 2X7PA 1JW5A 1FPKA 3H6UA 1O63A 1J1NA 3GYYA 4R9FA 4FATA 3TELA 3A29A 2F34A 4PAFA 4GL8A 4OVTA 3KN8A 3NOHA 3ISPA 3JZJA 4FBPA 4IO5A 1B0HA 1LCFA 1GR2A 4FEDA 3TQWA 3OO9A 4IGRA 3IK6B 4RPNA 4WEPA 2F6PA 4RJZA 4G77A 1FTOA 3GZGA 2H25A 3CFXA 5M2VA 3O6IA 1FPFA 2RC9A 5BUUA 3IB0A 5I5PA 1LCTA 3K00A 4X48A 1PB7A 4ELQA 2H98A 4O94A 2B4LA 4ZEIA 2PCRA 3IFCA 4LONB 4KXPA 2ZNTA 1B0LA 2UYEA 1KZ8A 2DWAA 3OEMA 5JEIA 3HN0A 1MQIA 5LOMA 2QMWA 1HSJA 1NUWA 5ICTA 2H99A 4PCDA 4U4XA 1BTJA 1IMDA 3PU5A 4DI4B 3RT6B 3PPRA 4LA9A 4XXUA 2GRVA 1B58A 3RYDA 1DTZA 1N84A 1ZIUA 3IB2A 4JB7A 3UK4A 4KHZE 2AIXA 5KZTA 3R7XA 2OZZA 3B6QA 3WAFA 1NNPA 2XWVA 5DEXB 2QVUA 4U22A 4PFIA 3SETA 1FBFA 3Q25A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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