3U93A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with glutamate and zinc: p2221 form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
254
structure length
252
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 252
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u93A02
2HEUA 4POWA 5K2YA 1FQDA 1A8EA 3HV1A 3E3KA 2D3IA 5DEXB 1WDNA 4N13A 2OWSA 4NF5B 4ZEFA 1SI0A 3O9PA 3OMBA 1POTA 4WXJA 3CRBA 5FTIA 5A5XA 4O3CA 3CSGA 2HFBA 1P1UA 2XXUA 1URDA 3C34A 1N0TA 4G77A 1POY1 2F78A 4YKKA 1LAXA 4FE8A 3CG3A 5JK4A 1N76A 3ECRA 5DVFA 4NF6B 3SEYA 5I58B 4F3PA 2V84A 3H7MA 1O64A 3CIJA 1D9YA 2Q89A 1FCKA 4KCCA 2YPNA 3RQTA 1SW1A 3KFMA 2ZNTA 5M2VA 3GBAA 1B58A 5CMBA 4OETA 1N7XA 4F2QA 1VR5A 2DWHA 1UIVA 3UK4A 1TFAA 2ZYMA 1P1OA 4F3GA 4K3FA 4M1VA 3TCFA 5AE4A 5H8FA 2XD3A 2XXPA 2Y84A 3USDA 3IL1B 1A55A 2XX7A 1QJMA 2F5XA 1A54A 1H45A 3FGSA 5IAIA 1MY1A 3S9LC 2QS2A 1Q35A 1SDXA 1UTHA 3RTWB 4XKNA 3O28A 1MQGA 1UTBA 3HO7A 4YMAA 1Q1KA 2NOOA 4JXIA 4BDLA 4OFJA 3C31A 1LAGE 3S4UA 5FHMA 5AA4B 4MLQA 1GTKA 5ICQA 3CI8A 3GXAA 1TT1A 1N3XA 1DOTA 3VVEA 2R9JA 3C36A 5IKBA 3SETA 4JSOA 4YMBA 2XXIA 3TTLA 4GD5A 4JWYA 2AIXA 3Q26A 2F7BA 4PETA 2D21A 3H4ZA 2G29A 3G7WA 3SEVA 3CVGA 3M3FA 3G3IA 3IJOB 5TP9A 3RY3A 2VP1A 3DP6A 3CG1A 1FQEA 3RGYA 1QUKA 2YLNA 1ATGA 1ZBMA 4H65A 1MG1A 1S7YA 2NXOA 3EPEA 1LLSA 1LFIA 2F97A 4KI0E 1R1NA 4M4GA 2PX1A 3T9VA 4PFTA 1USYE 3IAZA 1PB8A 1FTKA 3V83A 2XXWA 3O6HA 3MZ9A 3KG2A 4ZE8A 4YB5A 4LQ5A 2Z22A 5HPQA 2DWAA 4KYEA 2OJTA 3MBPA 2H98A 5AA2A 3PV0E 4OMBA 1B51A 5H8QB 1B3EA 1FQAA 3IOUA 1IZ1A 3KJ7A 4U21A 3MPKA 3I3VA 5H8NB 3FZVA 5I57A 1B6HA 1R9LA 2ZYKA 1M5CA 2H99A 4OWDA 1EZOA 4ZEKA 2QS1A 4FEDA 2H25A 2QMWA 1MPCA 1URGA 3C4MA 5CM6A 3TCHA 4OEVA 5TPAA 1SW5A 3IB2A 4MF3A 3K1MA 3MZBA 3HHGA 2IA4A 1ANFA 1UQWA 1YTVA 2GFEA 5EHMA 4ELPA 4R6HA 2H9BA 2I3VA 4DXUA 5I2KA 2ZYOA 4F22A 2Y7RA 1ZKBA 2DWJA 4C1TA 4H1XA 1AIVA 1UIUA 3KSJA 4OQOA 2UVHA 4ONYA 2CMOA 5DYHA 4H8IA 2IEEA 1QW0A 3VXBA 3BFTA 1AL3A 1AH5A 4LA9A 4G68C 3IO6A 4OFOA 3FV2A 3HHFA 2F36A 4YZZA 3LR1A 5JEIA 3EN3A 4WKMA 3B6QA 1QKAA 5AA1A 3T96B 3FJ7A 2DS9A 3TAJA 3RT8A 4MBPA 1B1HA 4IO4A 3UN6A 1H43A 1GGGA 1H3DA 1VE4A 4Q0CA 3TFLA 4RJZA 1XOCA 4Z0IA 1B4ZA 3OEMA 4IO6A 2REJA 3ILUB 3PUYE 1SW2A 2GRVA 3FV1A 3UGWA 1VSOA 1MY4A 4OENA 3PUVE 2XD2A 4EXLA 2Y7IA 1SYIA 4F31B 4BDMA 3PGFA 3OXNA 1JETA 4RY1A 1M5DA 4U1ZA 3ILTB 4KYSA 3GZGA 3VLUA 1MQJA 4QFPA 3D4CA 2GH9A 1JW1A 2V3UA 4RYAA 3UORA 3OSRA 4U22A 4H5GA 2HAUA 1NL5A 1I6AA 3IK6B 1US4A 2OK2A 4QSDA 2DQVA 5CRYA 1Y4TA 5ITOA 4IO7A 3QSLA 4NWDA 1OQHA 3IOTA 5CC2A 5DEXA 4U2RA 1N84A 4NF5A 1XVXA 3UP9A 2CZLA 3MVYA 3SEWA 4P11A 4G68B 4Q30B 3OEKA 2Q2CA 2PT1A 3U92A 5ICTA 1IQ7A 1LAHE 4P0GA 3P7IA 4H6DA 3EF7A 4OERA 4XKPA 4YAHX 5KCJB 1ZTYA 3R6UA 2AL5A 4OFLA 1ZLQA 2LAOA 1SVXB 1B3LA 4NF6A 2I4BA 3N5LA 5I58A 1B05A 3K0VA 2HZKA 5J1DA 4EDPA 3O6IA 1A99A 5L8DA 4DDDA 4WEDA 3TUSA 3QK6A 4OESA 2REGA 5KDTB 2A5TB 2UYEA 1Y1MA 4JWOA 4F3BA 1GR2A 1MM6A 4I8CA 1BKAA 4ZDMA 1NFTA 3BBRA 2Z8EA 1RKMA 4PQJA 1QKBA 4QFLA 3TMGA 3B7DA 4H5FA 2H4IA 3R7XA 3B6WA 4FEBA 3G3HA 3IB1A 4JSDA 4GL0A 2QL3A 5AA4A 4R9GA 1TWYA 3N94A 4MH5A 3OENA 3E13X 3T9XB 2RKMA 3FJGA 4R74A 4NEDA 1MPBA 1M5BA 3M8UA 3B6TA 3CFLA 1LGBC 1D9VA 3KN7A 3VLVA 2O7IA 2I6EA 3CFXA 3IORA 1B2HA 3QIMA 5F7VA 1VFEA 3EHSA 1N7WA 2DXRA 1IITA 3EQ1A 2NUVA 2XXVA 4TOZA 3C33A 3K6VA 1LSTA 2PYYA 5HM4B 4R72A 4QRZA 4IY5A 5B70A 3TQWA 1BP5A 2V93A 3O66A 3Q25A 2F6GA 1VFDA 1EU8A 1PB7A 1P1QA 4ELOA 1A40A 3H06B 2DOJA 4PP0A 3RLFE 4TLMB 1JW4A 3Q28A 4IY6A 5FHOA 1PC3A 2UVJA 2H5YA 4XXUA 4BDOA 3S9MC 3G3KA 3VV5A 2HXWA 1H44A 4HS7A 2XXTA 5CMMA 1XC1A 3FVGA 3OO9A 4NWCA 3OO7A 2ZNUA 4BDRA 4GWOA 2HAVA 2ONSA 1NNKA 2THIA 5BWJA 2P1SA 1MY0A 4KQPA 3MZ1A 1MXXA 4U4SA 5H8QA 3U72A 3MQ9A 4ELQA 2PT2A 3IB0A 5H8NA 3K00A 3PPOA 4KHZE 1LFGA 2M8CA 2RC8A 3PPQA 2XXRA 2GHAA 2RINA 3FJMA 4OZ9A 1DTGA 1KWHA 4EF2A 1A7LA 4X9TA 1IUDA 3U94A 3K01A 4N07A 1M5FA 4RPOA 3TQLA 1IEJA 3TDJA 2X7QA 4FAJA 5DT6A 3SESA 4ZZEA 1OLAA 3KN8A 2GHBA 4G2ZA 2OBGA 3RN8A 1B32A 1MXZA 4TLLB 3C32A 1OVTA 2QSXA 4R2BA 5H8HB 1HSLA 4X48A 5H8SA 4OEUA 4C0RA 1PDAA 1D4NA 1QUJA 1D3KA 4N6PA 3FUZA 1P1NA 4LZ7A 1B40A 4JB7A 4O3AA 1QUIA 2ZXTA 4QHQA 3TTRA 3ZKLA 3O29A 5LOMA 4X1DA 3E4RA 2QRYA 2NVUB 4XKQA 4R6YA 4OYVA 3FXQA 3GLBA 3K6UA 2Q88A 2E0SA 1XT8A 1JNFA 4QSEA 4EQ9A 3DM0A 3FATA 2F6PA 5L9OA 3AXFA 2RC7A 3FASA 4NF4B 4ZEDA 3PMVA 2I48A 3UIFA 5AA3A 4G8MA 1DMBA 4NMYA 1EZPA 1Y3NA 2B3BA 5DVJA 4MFIA 4LZ5A 1MH4A 4HTGA 3WAEA 1MY2A 1FQBA 1ZU0A 4PFWA 5FHNA 3H6TA 1DSNA 3PPPA 2QPQA 3KZGA 3O2AA 1SYHA 1CE2A 4P0IA 3T22A 3SEXA 3G3FA 1OLCA 3F11A 2FNCA 1OIBA 1N3WA 2XXHA 2RC9A 3A09A 3TEPA 4GFRA 3PU5A 1IXHA 2DP8A 3RTFB 2DSFA 1DPPA 3LSFB 3TTMA 3S9NC 2X26A 4I62A 3JYRA 4LQ2A 4NF8B 1LB8A 4OVJA 2F7AA 1MY3A 2V3QA 1Z7NE 3QUFA 1GV8A 4G68A 3T93B 1PBPA 1FTMA 2X7PA 5I2NB 2O7UA 1BLFA 2O1LA 4FATA 1B1XA 3KEIA 5KCJA 1TFDA 3IOWA 4EXKA 1M5EA 2XXXA 3QXMA 1PB9A 1FTLA 1FTOA 2DVZA 2R71A 4ESXA 4R73A 3K1NA 3FXRA 5KZTA 3N6TA 3KOTA 4YKPA 2DYXA 2AL4A 3K1PA 2ZNSA 2O6AA 3TELA 4TQUQ 3MC2A 1RYXA 1O63A 2DE3A 1LFHA 4UACA 3D4GA 5KDTA 4QSCA 2A5TA 1B7HA 4KYDA 4LONB 1BTJA 2QMXA 1ELJA 4BDQA 3PPNA 5I56B 3K4UA 3KGCA 1NKXA 3K6XA 1FQFA 3EHUA 1PBQA 2ANJA 3PUZE 4QF9A 1OMPA 1MDP1 4KD5A 3I6VA 1S9TA 4THIA 1II5A 4C1UA 1MQDA 3N6UA 3SEUA 4LZ8A 4I9DA 1IIWA 2PMSA 1B5HA 4F3SA 4JBZA 2HQ0A 4F29A 3MUQA 4GXSB 3K02A 4KR5A 3QAXA 2ONKE 1HSEA 3KBRA 4FIMA 3IR1A 3FIRA 2Q9TA 1LBCA 3OOAA 2VGQA 4HW8A 1MXYA 3ZKKA 1B7UA 1MH3A 4EQBA 3U1OA 3ODBA 3LSLA 4ZEIA 4DIGA 1SD3A 3TPAA 1YCJA 4KCDA 4RK2A 3W9WA 1OQGA 1ZJLA 3TKDA 1JVXA 5ISUA 2PVUA 4FJPA 3E9XA 3MVWA 3ZSFA 2VOZA 3G3GA 5I59B 5I84A 4F18A 4IO5A 3ZS6A 5HBCA 3RPWA 1TXFA 1P99A 1Y3QA 5CI5A 5DTBA 3W15C 3MPLA 4G8HA 1WVJA 3PPRA 3UA8A 5F1QA 1DPEA 2Z8FA 1S50A 2I4CA 3CFZA 3FXUA 4ISUA 3TZAA 1XS5A 2UYFA 1B3GA 2B65A 3M3LA 2D5WA 4WEPA 4GXAA 2I58A 3VFJA 4EF1A 4E0WA 5TU0A 1MXVA 3MWBA 3LBSA 3FD3A 1EH3A 4EUOA 2Q2AA 1HSJA 1NMUA 1SW4A 1A8FA 2DXYA 3VVFA 4JWXA 1JW5A 2Y7PA 2O84X 4YKIA 3C35A 2XXYA 4IB2A 3DP4A 3BFUA 1L5TA 3PMWA 2ONRA 1O7TA 1BIYA 2O68A 1SBPA 4ECFA 5JTYB 2F34A 3VVDA 4YU0A 3WAFA 2XHDA 3G3JA 4DXBA 3IJXB 2V3TA 2NWJA 4DCXA 3OELA 4GVOA 2O1MA 4FORA 4GL8A 4Q8RA 4LUBA 2OLBA 2QS3A 3LSWA 3SDFA 4GOTA 3KJTA 4U23A 1GVCA 3FVKA 1IXCA 4L17A 1MRPA 3S2VA 4IO2A 5H8HA 1EZ9A 3VDFA 4AB6A 5ITPA 4RXLA 2P2AA 4YICA 1Y9UA 3PD8A 4GQOA 3IX1A 2O69A 1JVYA 3O97A 3OO6A 1J1NA 3KOSA 1PEBA 1I6QA 5A5XB 3FVOA 3H6WA 4JDFA 1ZMGA 4U1OA 1FQCA 4IO3A 1QVSA 3RNNA 2RCBA 1JEUA 2XX9A 3PMXA 3FVNA 4ESWA 3DLNA 2BJJX 4H8JA 2F7CA 2DWIA 3SERA 5CMKA 1FW0A 4XKRA 4R6KA 4R2FA 3L6GA 3KSXA 1P1WA 3MJNA 3TODA 3MW0A 1B7ZA 3THIA 3GBBA 3RT6B 3TYHA 1SQYA 3KN3A 4QFNA 4NF4A 4KFQA 5H8FB 2P0SA 4ZEBA 2V25A 1ZIUA 5L9MA 3K2DA 2HZLA 3OO8A 1Y1ZA 3DP8A 4LVQA 2XXQA 4R9FA 4DXCA 1XVYA 4G4PA 5FTHA 3RUMA 4F1VA 4YKJA 2OCUA 3OD7A 1AOVA 3VE1B 4QFKA 2YJPA 2ESNA 1UTHB 4NE4A 3DELB 3IO4A 1UTBB 3V89B 2RF1A 3CR9A 2FYIA 2DE2A 2OZZA 2VHAA 2WKYA 3PD9A 3Q29A 1DTZA 4OTEA 1N04A 3H6VA 1USYH 2KLFA 4YB6A 4DZ1A 2B3FA 3U8QA 1NNTA 2E1SA 2OWTA 3HN0A 4X1BA 3T66A 3H03A 3W9VA 4KPTA 4U4XA 4NF8A 4POXA 1R9QA 3MP8A 4PE5B 5CBSA 1LB9A 2I0BA 4H0WA 4PFYA 3U93A 2G93A 2UVGA 2PBWA 5I2NA 2I0CA 4F19A 5TP9B 1CB6A 3A3UA 1NNFA 3MP6A 2VD3A 4R75A 4Q5TA 1WODA 2O51A 1H76A 3HSTA 2I3WA 3PUXE 4RPNA 3LSXA 3QUJA 2Y7WA 4ND9A 4AQ4A 4UA8A 1QULA 3TTNA 4AB5A 3O6GA 1T0KA 4H67A 1I69A 3MP1A 4O3BA 2F35A 3MVZA 4GF8A 3M3KA 5BUUA 1RYOA 2R6GE 1JEVA 1Y3PA 4HCWA 3TTKA 1MXUA 4G8NA 5AA2B 4RA1A 5I56A 2ABHA 5B7DA 1Y4CA 1SI1A 4GRKA 5I57B 3VLWA 1LAFE 4OXVA 1AMFA 1YAEA 2A5SA 2DVCA 5K2XA 1US5A 1MQIA 1MQHA 2FA7A 2I49A 5DVIA 1Z7ME 3JV9A 3PUWE 1URSA 4HCYA 3TCGA 4ELRA 4F2OA 3N26A 5TPAB 4XIGQ 2XX8A 3I5OA 4ZS9A 4DCYA 1B4HA 3H3GA 4E0XA 2W7YA 3HPIA 3T9UA 4Z7EA 1MXWA 4LATA 3EHTA 5I2KB 3Q27A 2QS4A 1LBBA 3LC8A 1YPNA 3H6UA 4PFUA 4GLIA 3LUYA 3JZJA 1B46A 4ZECA 1B9JA 2DE4A 4DLDA 4OHNA 5CMCA 1NNPA 4ZZAA 2Y7KA 5I59A 4YB7A 4GIZA 4I1DA 3BKIB 4FECA 1JQFA 4RK9A 4BLAA 1MDQA 1FTJA 5CBRA 4XTCQ 5EYFA 4LP2B 2HCAA 3SKPA 2QJEA 3IOVA 4IGRA 4NTLA 2ALUA 1Y20A 3QYTA 5AA2D 3CSBA 1XHYA 3HCQA 1B0HA 3MVXA 1I6BA 1IXIA 1LCTA 1B3HA 1IXGA 2Z23A 4MLVA 1NH7A 2VD2A 3VXCA 4BDNA 1B3FA 2F8DA 3L6HA 4QFOA 1B5JA 5EHSA 4F1YA 1R6ZA 4F1UA 1NH8A 3OSQA 3A3CA 3V8XB 1MM7A 3V5AA 1OVBA 3ONMA 4IGTA 3S9EA 1MS7A 1B5IA 3C9HA 1MPDA 2Q8JA 2ZMBA 2ZYNA 4ZE9A 2Z8DA 2UVIA 2AYSA 1F9BA 3T9HB 4F39A 3R26A 5JTYA 4DE8A 5L9SA 4EQ7A 5ELVA 1B52A 3MAMA 1B0LA 3K6WA 1LCFA 4RNSA 2UXAA 2RCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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