3UGWA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with deoxycytidine at 1.87 a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with Deoxycytidine at 1.87 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Hydrolase
total genus 114
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2011-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ugwA02
2XX8A 2QMXA 4U4SA 5J1DA 5L9SA 1CB6A 1MY3A 4RK9A 5K2YA 2V25A 5DVFA 1GVCA 2XD2A 5TP9A 1MXZA 4EDPA 5DYHA 3FJ7A 1GV8A 4OVJA 2D5WA 2H9BA 2Q2CA 3IB2A 4POXA 2XXXA 1SYHA 4H8JA 1NNKA 2AYSA 3DM0A 3QUJA 1P1QA 1SYIA 1MH3A 3GLBA 1M5EA 2NXOA 3T9UA 5I59B 4GLIA 5CM6A 2F78A 4QHQA 1SDXA 1JETA 3KSJA 2NUVA 1TT1A 2P1SA 3K4UA 4X1BA 2E1SA 5A5XB 2HXWA 2ALUA 1SW4A 5AA2D 1NFTA 3EPEA 3M3FA 3KFMA 3M3KA 3IOVA 3U1OA 1MQGA 3M8UA 1QUIA 3CR9A 3KN7A 3TFLA 3C35A 5JTYB 1JQFA 4GRKA 5ITOA 3TDJA 5I2NB 3O29A 5AA4A 3VXBA 3DP6A 1Z7ME 2OBGA 4NF6B 2RKMA 4NF4A 1H45A 2FNCA 3LSFB 3UA8A 2I48A 3K01A 5I57A 3H6UA 3ECRA 3SKPA 3SETA 4PFUA 3LUYA 4LA9A 1R1NA 4H8IA 4HCYA 1BKAA 5HM4B 2QRYA 5CBRA 5TU0A 3VVDA 3KN8A 2DE4A 5FHOA 5DEXA 2ZMBA 1EZ9A 3ZSFA 2F7CA 4F19A 2F34A 4Q8RA 4H0WA 4QSDA 1IIWA 1ZIUA 4AQ4A 2PT1A 3N5LA 1LFHA 3N6UA 3MC2A 4EXKA 3I6VA 3TODA 2IA4A 1I69A 3H7MA 3T9HB 5F1QA 3UP9A 3C31A 1A99A 3SEVA 1B6HA 1EZOA 1S7YA 1CE2A 1QW0A 3G3HA 4G68C 5I58A 3PPNA 3EHTA 3C33A 2UVIA 2D3IA 2O68A 1P1NA 2G93A 2XXTA 5CC2A 1KWHA 4RPNA 1QVSA 2YPNA 4M1VA 3MZBA 4M4GA 4U22A 1HSJA 1A40A 1B3FA 1SI1A 2I3VA 4KPTA 4C0RA 3FV2A 4G68B 5CMCA 4ZEKA 1LSTA 3IJXB 1VFDA 3ZS6A 2PT2A 1MQIA 4LATA 2YLNA 1N3XA 4OETA 1BTJA 3FXQA 3KJ7A 3RLFE 3ODBA 1YCJA 1PBQA 1TXFA 3MAMA 3D4GA 4IO2A 4YICA 4N6PA 1D4NA 5AA1A 4ZEBA 2G29A 1USYH 4QFPA 1B58A 1URSA 3OEMA 1M5DA 3PUZE 2I6EA 3KG2A 3JZJA 3KOSA 5KCJB 4DCYA 1R9LA 4YU0A 3T9XB 4BDQA 3GZGA 2OZZA 2Z8DA 4DCXA 2QSXA 3IJOB 3TYHA 2YJPA 3IK6B 3KN3A 4RY1A 4BDOA 4F18A 1USYE 1FTOA 2H4IA 1ATGA 4GQOA 5H8QB 3IO4A 3S4UA 3MJNA 4F1VA 1O7TA 2UVGA 2H98A 1B3HA 3L6HA 4RJZA 3OSRA 1IQ7A 4HCWA 1YTVA 3Q27A 3FGSA 3O6GA 2CMOA 1DOTA 3KEIA 1XS5A 1MY1A 1MRPA 2Q8JA 1IXIA 2V84A 5DVIA 3TZAA 1LAXA 4QFOA 4EUOA 3VVFA 3QAXA 3PPPA 2LAOA 1A55A 1QULA 1OVBA 3RNNA 1FQFA 4RPOA 2F8DA 3TTLA 3HV1A 4GVOA 4KQPA 1A8EA 3MW0A 5H8NA 3K6XA 3S2VA 2HCAA 3SEUA 3OO7A 3UIFA 1B0HA 4X48A 2VD2A 3HSTA 3K0VA 4OENA 3ONMA 1PDAA 2QMWA 4KCCA 2DP8A 4FE8A 4PE5B 2DOJA 1IXGA 5CBSA 3RT8A 4X1DA 3GXAA 3FD3A 4YMBA 3EQ1A 2RC9A 3RT6B 4OMBA 1B1XA 4E0WA 4F3BA 3V83A 5ITPA 2RINA 5FHMA 1B05A 3THIA 1NL5A 2PMSA 4DLDA 4RK2A 2X26A 3MPLA 4IY5A 4PFTA 4IY6A 4NF8A 2ZYNA 4OEUA 4F1YA 1Q35A 3TTMA 2RC8A 3SESA 3TEPA 3FATA 2M8CA 1SW2A 3EF7A 1M5BA 3EHSA 4U23A 3IOWA 1D9YA 2QS2A 4ND9A 1NH8A 5IAIA 3VVEA 4LZ7A 5JK4A 4F2OA 4OERA 1B4ZA 5EHSA 3WAEA 3A3CA 1XVYA 5LOMA 1OQGA 1SW5A 3IAZA 3LBSA 4FEBA 4MLVA 4MBPA 1B32A 2QL3A 1EZPA 5ISUA 3OO9A 1Y4CA 4LZ5A 3T93B 3WAFA 4ZE8A 3LSLA 3S9EA 4P0GA 2R9JA 1LCFA 2REGA 3LR1A 1MQHA 3IOTA 1MH4A 3B6QA 2DE2A 1MXXA 2OCUA 1UTBB 3RQTA 1VSOA 2DYXA 3E13X 4XKPA 2O84X 3CIJA 4ESXA 4YB7A 2XXUA 3Q29A 4ZDMA 1FQCA 1AH5A 4R6KA 3MVZA 4LONB 5B70A 5AA2B 3H3GA 3K6UA 3CI8A 1POY1 2ZXTA 1HSLA 3E3KA 3KOTA 1H76A 3AXFA 1OMPA 3H06B 3PD8A 4OFOA 1LCTA 2F6GA 5L8DA 3K2DA 4OESA 1O64A 3IO6A 2I49A 5L9MA 3FUZA 5BWJA 4OFJA 1FW0A 4KYDA 3DELB 1FQBA 3FZVA 4BDNA 4IO4A 1N7XA 4LVQA 3VDFA 4F29A 4YKKA 4QSCA 5H8FA 2Y7KA 2DQVA 1LB9A 1WVJA 2THIA 5FTIA 5IKBA 1MXUA 3K00A 1LB8A 4MF3A 4DDDA 4I1DA 3MP1A 3KSXA 5TP9B 4H6DA 3TAJA 2XXRA 1Z7NE 3MZ1A 2VHAA 3HHFA 3U92A 3VV5A 4QFNA 2NVUB 1EU8A 4YMAA 2ZYOA 1O63A 4C1TA 5KDTB 1Q1KA 3RTWB 1VR5A 3FV1A 1Y3PA 4I9DA 1N84A 3EN3A 3IOUA 3VLVA 4NF5A 3PUXE 4KYEA 4H5FA 4KCDA 1PC3A 3G3JA 1OLAA 3D4CA 5HPQA 3OO6A 3TQWA 2VOZA 1DSNA 4G8NA 1UQWA 4F2QA 2AIXA 1ZKBA 1ZMGA 4ESWA 4Z7EA 2HEUA 1FTMA 4KD5A 3Q26A 1IITA 3O9PA 4IO7A 1Y1ZA 2Q2AA 4ISUA 2X7QA 3I3VA 3H4ZA 1Y4TA 4F3SA 2GRVA 4U1OA 1S9TA 4RYAA 2Y7PA 3G3FA 4KI0E 1JVYA 1SVXB 3P7IA 5FTHA 4JWOA 1JW1A 2ONRA 3C9HA 5TPAA 3KJTA 2CZLA 4NF4B 3PMXA 5I57B 1ANFA 1OQHA 3VLWA 3O6IA 3O28A 3G3KA 3H6WA 3PMWA 3W9VA 2GHBA 2F6PA 4LP2B 4G8HA 2VD3A 4I8CA 4P0IA 1EH3A 4OEVA 3IR1A 3MVWA 3K1NA 2QS3A 3U8QA 5DEXB 3VFJA 2D21A 1AOVA 1B7UA 4H67A 3V8XB 4ELOA 3FVGA 1B52A 2XX7A 2B3BA 1AMFA 4GOTA 4PFYA 3OO8A 5CMMA 3SEWA 5K2XA 1B7HA 1OLCA 5EHMA 2GFEA 1JVXA 4RNSA 1OIBA 2F7AA 1URDA 4O3AA 3VE1B 5JEIA 1SI0A 2V93A 4DXUA 4DIGA 1B51A 2ZNTA 1MY0A 1FTKA 1NH7A 3BKIB 5I2KA 2V3TA 3E4RA 5H8HA 1MPBA 4ZS9A 5CI5A 2UXAA 5I58B 3FJGA 2DXYA 1P1OA 4YKJA 4BLAA 2NWJA 1RKMA 1XC1A 3OD7A 3FVKA 4L17A 3SEYA 3MPKA 2V3UA 4KYSA 4XTCQ 3EHUA 3IB0A 3PUVE 3UGWA 4MFIA 3MVYA 2Z22A 2IEEA 1FQAA 1FQEA 4ZEFA 4NTLA 2I0BA 1Y9UA 3MQ9A 4DXBA 2Z8FA 1P99A 4ZECA 3C32A 2WKYA 3C4MA 3T22A 4OQOA 2ZYKA 4PQJA 1FTLA 1LAFE 4GL0A 3QK6A 3FXRA 2O6AA 4NWCA 1QKAA 2O7IA 4QFLA 1LFGA 3OMBA 3PPOA 3CSGA 3L6GA 1US4A 3QSLA 5EYFA 2X7PA 4JB7A 3TTRA 1J1NA 4EQBA 3PUYE 2O1MA 1R9QA 1SBPA 4ECFA 4RA1A 1UTHA 1B7ZA 1MDP1 2FA7A 3CVGA 2QJEA 3FASA 1LGBC 1MQDA 2DWJA 3JV9A 4MH5A 4FEDA 2PVUA 4F39A 4R73A 1UIVA 3HPIA 4XKNA 4UACA 1MQJA 2A5TA 4XXUA 2W7YA 1IXHA 4E0XA 1FCKA 3KZGA 2UVJA 3OXNA 5DTBA 4EXLA 2F97A 4JDFA 5I56A 3ILUB 4GD5A 4YAHX 1HSEA 3MBPA 1AL3A 4I62A 1DPPA 3OEKA 4IGTA 4JWXA 1POTA 1B40A 4R6YA 4U2RA 2Y7RA 5H8NB 3A09A 3K02A 4DXCA 3RPWA 2PX1A 2REJA 1B46A 1B0LA 1JW5A 1AIVA 4XIGQ 3RN8A 2QS4A 4ZE9A 5ICTA 2PBWA 4OWDA 2DWIA 1RYOA 4BDRA 1R6ZA 3KGCA 2F7BA 3HCQA 4GF8A 3FXUA 1Y20A 1B9JA 2XXIA 3QXMA 4G2ZA 1BLFA 2ONKE 3GBBA 2HZKA 4H1XA 3MP8A 3C36A 2RCAA 2O51A 4QRZA 3TCGA 2RF1A 4NMYA 5DT6A 3QIMA 1I6AA 4F3GA 3OENA 5CMKA 2HZLA 4NF8B 1NNPA 4ZEIA 3PUWE 2I3WA 1XOCA 1GTKA 4EF2A 4XKQA 1ZJLA 4WEPA 1B3LA 4IGRA 1TWYA 3Q25A 4F1UA 4QF9A 3G3GA 1N0TA 2Q9TA 3TTNA 1MXVA 4R2BA 4F31B 1QUJA 2OWSA 4TOZA 2DE3A 3SDFA 4EF1A 2OK2A 4YB6A 1IXCA 3PMVA 1LBCA 3SERA 4AB5A 3USDA 2ZNUA 2RC7A 1H3DA 3V89B 1PBPA 4DE8A 1NNTA 5CRYA 3QUFA 4HS7A 3IL1B 4OHNA 3GBAA 3O2AA 3G7WA 5HBCA 4JSDA 1H43A 2XXPA 1NKXA 1QJMA 4O3CA 3PPRA 3MWBA 5I59A 4NWDA 3U94A 2O69A 3Q28A 2F35A 4KFQA 3MUQA 5M2VA 3UN6A 3IORA 2ZYMA 1B3EA 2Y7WA 5A5XA 4KHZE 2GH9A 4QSEA 3IX1A 3CFLA 3PPQA 1US5A 2B65A 5KDTA 1PB7A 4TQUQ 2E0SA 4WXJA 2A5SA 4H65A 3OELA 1IUDA 1I6BA 2I58A 5FHNA 1IZ1A 5JTYA 3U72A 5H8FB 4R9FA 5I2NA 5B7DA 4EQ9A 1D9VA 1FTJA 1MY2A 1L5TA 1ZBMA 4NF6A 3FVNA 4JSOA 3B6WA 4GIZA 4U4XA 4C1UA 3K6WA 2GHAA 4K3FA 1A54A 1B3GA 3FJMA 3R26A 4TLLB 2HFBA 3DLNA 1N3WA 1UIUA 3TTKA 1RYXA 4OFLA 1QKBA 4GXAA 2OWTA 1SD3A 1VE4A 4R72A 2Q88A 4ONYA 3T66A 4UA8A 4GL8A 3TPAA 1NNFA 2I4CA 4KR5A 5ELVA 4HTGA 2Y7IA 3CRBA 4NF5B 3HN0A 2DS9A 5F7VA 3BBRA 2Y84A 3BFUA 3H03A 2RCBA 1QUKA 3HO7A 5AA4B 3V5AA 1XHYA 3O66A 3ILTB 4QFKA 2PYYA 1FQDA 2P0SA 3ZKKA 3S9LC 1N04A 3ZKLA 3N6TA 1MDQA 4X9TA 4YB5A 5KZTA 1MM6A 1MM7A 4OTEA 1S50A 3CG3A 3DP8A 2DXRA 2H99A 1Y3NA 2XXYA 2FYIA 1ELJA 4ZEDA 5TPAB 1ZTYA 2ABHA 4JWYA 1BP5A 4N13A 1ZLQA 3T9VA 3PU5A 2DVCA 1I6QA 5CMBA 2UYEA 1YAEA 3H6VA 1LAGE 1Y3QA 4G68A 2OJTA 3JYRA 3TCHA 3B6TA 1B2HA 1MG1A 1MXYA 3FVOA 4R9GA 2Q89A 4H5GA 4BDMA 4FORA 2R6GE 5AA3A 2QPQA 2ANJA 4OZ9A 3H6TA 3CFXA 4THIA 4WKMA 4G77A 2XXVA 4R75A 2ESNA 2Z23A 4YZZA 3K1PA 4U21A 5KCJA 3S9NC 4F3PA 4P11A 2AL4A 4TLMB 4LUBA 3VXCA 4OXVA 3MZ9A 3K1MA 1M5CA 2B3FA 1N76A 3RTFB 5I2KB 1H44A 5H8HB 3W15C 4Q0CA 3HHGA 4IO5A 1PEBA 1P1WA 4GFRA 3TKDA 2UVHA 4GWOA 5H8QA 4FIMA 3N94A 2ZNSA 1M5FA 1ZU0A 2XXQA 1T0KA 1JEUA 4PETA 4EQ7A 3I5OA 4U1ZA 4Q30B 3TELA 1BIYA 2HAUA 1XVXA 3FIRA 4RXLA 1B5HA 3BFTA 4MLQA 3SEXA 5H8SA 1LLSA 3U93A 3PD9A 1TFAA 4Z0IA 4ELQA 2BJJX 2ONSA 4LZ8A 2V3QA 5BUUA 4Q5TA 2DVZA 4FJPA 4FAJA 3CSBA 4AB6A 2OLBA 3S9MC 2I0CA 1A7LA 2I4BA 3TQLA 3O6HA 1IEJA 1MXWA 1B5JA 3K6VA 2KLFA 2NOOA 3F11A 4ELPA 4ZZEA 2XD3A 4ZZAA 2H5YA 5AE4A 4R74A 3CG1A 4NEDA 3OOAA 4JBZA 4DZ1A 2R71A 3N26A 1DPEA 2UYFA 1LBBA 4HW8A 3G3IA 1GGGA 3E9XA 1II5A 2DWAA 3LSWA 3B7DA 3O97A 4R6HA 2XHDA 2DSFA 4G8MA 2O1LA 1DTZA 2HAVA 1SQYA 3RY3A 5ICQA 4PFWA 1UTHB 3TCFA 2F36A 4YKPA 1YPNA 4IB2A 1SW1A 4YKIA 1PB8A 5DVJA 3PV0E 1JNFA 3VLUA 1XT8A 3T96B 4O3BA 2Z8EA 2XX9A 1P1UA 3UK4A 2A5TB 4JXIA 2QS1A 1DTGA 4F22A 3TUSA 1URGA 1WDNA 5L9OA 5I56B 1TFDA 1MY4A 4XKRA 2VGQA 3MVXA 1MPCA 4GXSB 1VFEA 1D3KA 1DMBA 1LAHE 3IB1A 4R2FA 1GR2A 4BDLA 1B4HA 3UORA 1NMUA 2O7UA 1WODA 1B5IA 2VP1A 3C34A 1A8FA 4POWA 2H25A 1OVTA 5I84A 3MP6A 1MPDA 4G4PA 3R7XA 3KBRA 3OSQA 1UTBA 4LQ5A 1F9BA 3W9WA 3PGFA 4FECA 3LC8A 1JEVA 4IO3A 3DP4A 4WEDA 5AA2A 4IO6A 2XXWA 1JW4A 2HQ0A 3RUMA 3R6UA 3CFZA 3LSXA 4PP0A 4LQ2A 2XXHA 4N07A 3QYTA 1N7WA 2F5XA 3TMGA 4ELRA 1B1HA 2P2AA 3A3UA 4FATA 4OYVA 1Y1MA 2AL5A 3RGYA 1PB9A 3M3LA 4NE4A 1MS7A 1LFIA 2DWHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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