3V83A

The 2.1 angstrom crystal structure of diferric human transferrin
Total Genus 216
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
216
sequence length
674
structure length
674
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTCPEAPTDECKPVKWCALSHHERLKCDEWSVNSVGKIECVSAETTEDCIAKIMNGEADAMSLDGGFVYIAGKCGLVPVLAENYNKSDNCEDTPEAGYFAVAVVKKSASDLTWDNLKGKKSCHTAVGRTAGWNIPMGLLYNKINHCRFDEFFSEGCAPGSKKDSSLCKLCMGSGLNLCEPNNKEGYYGYTGAFRCLVEKGDVAFVKHQTVPQNTGGKNPDPWAKNLNEKDYELLCLDGTRKPVEEYANCHLARAPNHAVVTRKDKEACVHKILRQQQHLFGSNVTDCSGNFCLFRSETKDLLFRDDTVCLAKLHDRNTYEKYLGEEYVKAVGNLRKCSTSSLLEACTFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural basis for iron piracy by pathogenic Neisseria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
total genus 216
structure length 674
sequence length 674
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3v83A03
3V8XB 2HXWA 2I4CA 4KYSA 3K6VA 1VFEA 3LSFB 2VOZA 4L17A 2QS2A 4ZEKA 3E4RA 3PD8A 2FA7A 4NWCA 5CMBA 2Q88A 3HSTA 2ZYMA 1NNTA 1LFGA 2R71A 5CMCA 1H3DA 4H5GA 4OYVA 2THIA 4BDRA 3AXFA 1IUDA 3EQ1A 2XX9A 3O6HA 3A3CA 3Q26A 5H8QA 1A7LA 2DYXA 3K6UA 5B7DA 1AOVA 1MQGA 1LBBA 4H8JA 1IXGA 3A09A 2Q8JA 3VXBA 1LLSA 5LOMA 4R6HA 4ZE9A 1B58A 1B3HA 4ND9A 4ELOA 1UQWA 1SYIA 3TCGA 2DWIA 4FAJA 1MDP1 4R72A 1N04A 1WVJA 1EZPA 4IY5A 3FIRA 5H8SA 1DPPA 3T9XB 4ZEBA 3FJGA 3D4CA 1B9JA 3PPQA 1Y4TA 1ZIUA 3MVWA 1TT1A 3O2AA 1OVBA 4Q30B 4F3PA 5I2KA 2DS9A 1ANFA 5I59A 3CFXA 3K1PA 5ICQA 4Q5TA 3FUZA 1M5DA 3TTLA 4F2OA 3IJOB 1PBQA 2XX8A 2Z8DA 4MFIA 4NF6A 3SETA 2GFEA 5JTYA 2ESNA 1IITA 1OIBA 4PETA 1AMFA 3U94A 3JYRA 4IGTA 3R7XA 4P11A 3S9MC 1VSOA 5BUUA 2DVZA 5DTBA 4NTLA 3FVKA 4G8MA 4DZ1A 4I9DA 2NXOA 3VLUA 4UA8A 2V25A 1EZOA 1VR5A 5KDTA 2ONKE 1B3GA 2FYIA 1EU8A 4DXCA 5I2NA 3B6WA 2Z22A 3TUSA 3TKDA 3SESA 1XHYA 5AA1A 2E0SA 3D4GA 3B7DA 4WEDA 3FD3A 1OLAA 5JK4A 4F29A 1FQBA 2I3VA 3FXRA 2DQVA 1ZKBA 4RA1A 4BDLA 1MM7A 3CSBA 4GLIA 3MPLA 3VFJA 2I49A 4IO3A 1TFAA 5TP9B 3MZBA 4O3BA 2PT1A 2PX1A 4G4PA 3TTMA 4OERA 3MQ9A 4UACA 4XKPA 4YMBA 3JV9A 5FTIA 4YU0A 3OEMA 2QS1A 1QW0A 3B6TA 3OO6A 3MVZA 5ICTA 3H6WA 4MBPA 3H6UA 4JWXA 5AA4A 4F3GA 2ABHA 1GGGA 1LGBC 1US4A 2GHAA 3PUWE 5L8DA 4O3CA 1B5HA 1GV8A 2VD3A 4FE8A 4DE8A 3BFUA 3OENA 3HCQA 4GL8A 1NKXA 1H43A 1MY3A 2RF1A 1ZBMA 3N6TA 4IGRA 5TPAB 3QUFA 1MH4A 3CFLA 1XT8A 2XXRA 3KEIA 4E0WA 5I56B 4C1UA 3EF7A 2Y7WA 1P1WA 1Y3QA 2P0SA 3LC8A 2F8DA 1JW5A 4QSDA 4RXLA 4EF2A 4YAHX 2UVIA 1MM6A 4KYEA 3E3KA 3KSJA 4IY6A 1SI0A 4NF8A 1R6ZA 5L9OA 5AA2A 3IOUA 3T93B 4F22A 1HSLA 1JQFA 3G7WA 5I84A 3QSLA 4X1BA 2UXAA 2QRYA 1MPBA 3VXCA 1A8FA 5DEXB 3ZKLA 1DMBA 4DLDA 1N0TA 3IOWA 5AA2D 4JSOA 1NH8A 1SW2A 1Y20A 2HAVA 1CB6A 4FEDA 2NWJA 3SEVA 4R73A 3TZAA 1FQFA 5H8HB 4GXAA 1NH7A 4ECFA 1TFDA 3SKPA 3TMGA 2O84X 4HTGA 4F2QA 3VDFA 3LUYA 1LFIA 4QFOA 3KBRA 2AL4A 3KN7A 1B40A 1B4ZA 4RK2A 3T22A 4F18A 3UP9A 3IK6B 2Y84A 3RY3A 3MVXA 2D5WA 1XS5A 2O6AA 1GVCA 2B65A 3CI8A 1MY4A 4G68B 3H03A 2I4BA 2A5TB 3VV5A 5I57A 2F36A 5FTHA 1N3WA 1LAHE 4DIGA 4OEUA 3TAJA 1XOCA 1F9BA 1M5FA 1NNPA 5HM4B 4ZDMA 2G29A 2RC9A 3TCFA 4DDDA 3OO7A 4F1VA 4KI0E 1NFTA 1H45A 4GD5A 3DP8A 3K6WA 4LZ5A 2FNCA 3PD9A 2REGA 3VLWA 2NVUB 3H6TA 1QUIA 5IKBA 1GTKA 2O7IA 4F1YA 1I6AA 3TPAA 4ZEDA 1R9LA 3FVGA 1M5BA 3U92A 2H9BA 3BKIB 4U22A 2QL3A 3QXMA 1SVXB 3FV1A 1B1XA 4TLMB 5ITOA 5AA3A 3CVGA 4H1XA 2W7YA 4XKNA 4ISUA 3RT6B 1MXYA 3DLNA 4PFUA 1D3KA 2XXWA 4BDMA 1MPCA 2P2AA 3G3IA 3KJTA 3RTWB 1R1NA 3H06B 1S9TA 3MZ1A 1MQDA 2OCUA 5K2YA 2Q9TA 1JNFA 4NF5B 3W9WA 4EQBA 2O69A 3PV0E 1QKAA 3IORA 1P99A 3K4UA 4BDNA 4YKKA 4LVQA 3KJ7A 2VP1A 3G3JA 4QFNA 1URGA 3MP1A 5L9SA 3N5LA 4Z0IA 1UIUA 1PBPA 1IZ1A 2V3UA 2F7BA 3U72A 2XXYA 3UA8A 4IB2A 5H8NA 2REJA 1I6BA 4XKQA 4OZ9A 1Y3PA 3FGSA 5IAIA 1HSJA 3FVOA 5KCJB 1QULA 1B32A 4MH5A 4GWOA 4GQOA 3CRBA 3S9NC 4ZZAA 2QS4A 3DELB 1H76A 4OMBA 2IEEA 1S50A 1M5EA 3M8UA 2UVGA 4YMAA 4YB5A 5TPAA 4ONYA 4TLLB 4LZ7A 3W9VA 5I56A 5CC2A 3CIJA 1JVYA 1SW4A 1MS7A 3IOVA 2H98A 4KPTA 4R9FA 1URDA 5DVIA 5FHOA 4M1VA 1Z7ME 1FTMA 3HPIA 1QJMA 1P1NA 2ZYOA 2XXHA 4PFWA 4K3FA 1LCTA 1B3LA 1DOTA 1JEVA 1B0LA 3R6UA 4JBZA 4ELRA 2R6GE 3L6GA 1Q1KA 4LUBA 2I6EA 2QMWA 1LSTA 1FCKA 4JB7A 4KCCA 5H8FB 5M2VA 2I0BA 4RPNA 5DEXA 3USDA 1FTLA 3IAZA 3RUMA 1Z7NE 2XXXA 4N07A 3MC2A 4U1OA 2XXIA 4GVOA 1J1NA 1BLFA 3G3GA 3TDJA 3MWBA 1AH5A 2R9JA 4F19A 3C31A 3ILTB 5H8HA 1IQ7A 3BFTA 4YKJA 4ELPA 1P1OA 2F34A 2QSXA 3LBSA 3G3FA 3QK6A 4HS7A 2RCAA 1II5A 1A55A 4Z7EA 4JWYA 3KGCA 1SBPA 2UVHA 4KCDA 1UTBB 4OVJA 4ESXA 3OOAA 1DPEA 3SEWA 3KG2A 2F78A 1M5CA 1PB8A 3UN6A 3ZS6A 4U21A 4X48A 5A5XB 3E13X 4QF9A 3QAXA 3M3KA 4G68A 4YKIA 3O97A 2A5TA 4I8CA 4RYAA 1B52A 4IO4A 2NUVA 3TODA 3TTKA 4OXVA 1D4NA 3HO7A 3SEYA 1S7YA 4PP0A 5EHMA 2HAUA 3IOTA 2B3BA 5L9MA 4WXJA 4I62A 1SYHA 3FXUA 4LP2B 1B46A 4PE5B 1I69A 4F3BA 4RJZA 4RY1A 3Q27A 1JW4A 3MZ9A 4H67A 1MY0A 3RNNA 2DE4A 2Q89A 4QHQA 3SDFA 3UIFA 2OLBA 4EUOA 3N94A 2D3IA 2X7PA 2H4IA 2V93A 1FTKA 1CE2A 3S2VA 1LBCA 2DE3A 3P7IA 4H0WA 1A40A 3IJXB 2HCAA 3OD7A 2F97A 4FECA 3VLVA 3IL1B 3K01A 4H5FA 4FORA 1USYE 2ZXTA 5ITPA 4QFPA 1B4HA 1Y4CA 2HQ0A 3K0VA 1B05A 4TQUQ 3K00A 1AL3A 1US5A 1B51A 4IO2A 1OQHA 1RYOA 1USYH 4OWDA 4DXBA 2OWSA 2Y7IA 2ALUA 4QSCA 5HPQA 4NF5A 2O68A 4QFLA 5I58B 2VD2A 4N13A 4Q0CA 3IX1A 1UTHB 3V89B 5DT6A 4X1DA 1VFDA 3HHGA 4RK9A 1L5TA 1GR2A 4M4GA 1IEJA 3PUYE 2E1SA 3CG3A 4GXSB 5KCJA 3O6IA 4GFRA 1OQGA 2Q2AA 4HCWA 1QUJA 3CG1A 4TOZA 2A5SA 4NE4A 4G8NA 5B70A 3IO4A 1IIWA 3OO8A 1P1UA 2Y7KA 1Q35A 3QYTA 3V5AA 4U23A 2HZLA 3O66A 1QKBA 1PDAA 2RINA 2F7CA 3U1OA 3HHFA 1SI1A 2DWJA 1NL5A 3CSGA 4I1DA 3TQLA 4F1UA 1HSEA 3LSXA 2KLFA 1OMPA 1O64A 1B3FA 3DM0A 4PQJA 4IO5A 1TWYA 2QMXA 4RPOA 1ATGA 5AA4B 2O1LA 3TEPA 1DTZA 3S9EA 3T66A 3G3KA 2RKMA 3RLFE 3PUVE 4KHZE 4U1ZA 2O1MA 3B6QA 1TXFA 4F31B 3CR9A 1MG1A 4GRKA 1I6QA 5BWJA 5FHNA 2P1SA 2PT2A 1T0KA 3GLBA 1PC3A 1YTVA 3TCHA 2Z8EA 1P1QA 1YAEA 2CMOA 3TFLA 4NF4B 3HN0A 1B7HA 1IXIA 3GXAA 4LA9A 1MY2A 4BDOA 3PUZE 3RGYA 3WAFA 3EHTA 5FHMA 3RTFB 3RQTA 1MQHA 3OMBA 3BBRA 3C9HA 4YB6A 4O3AA 4P0IA 3FASA 1D9VA 1XVYA 1JW1A 3K2DA 1RYXA 4ZECA 4QSEA 3IB1A 5KZTA 3UORA 2V84A 3SEXA 3FATA 4F39A 3RPWA 3V83A 1AIVA 4H65A 1JEUA 1POY1 3TELA 2PVUA 3FVNA 1YCJA 4KQPA 3Q29A 4ESWA 4NWDA 4F3SA 1MXVA 1FQEA 1LCFA 4GOTA 3FV2A 4HCYA 5TP9A 2O51A 1UTBA 4IO6A 4DXUA 4H8IA 2RCBA 2I3WA 5DVFA 3T96B 2I58A 1B7ZA 3ILUB 3PMWA 3OEKA 4JWOA 5A5XA 1SW1A 4FJPA 1FQDA 3UK4A 4N6PA 4AB6A 2QPQA 2UVJA 4H6DA 5ISUA 1B1HA 2RC7A 1OVTA 4C1TA 3PUXE 4R6KA 1B5JA 4KD5A 1EH3A 1N3XA 4E0XA 1UIVA 2X26A 3IR1A 4Q8RA 4EDPA 1NNKA 2O7UA 2QS3A 2Z23A 4U2RA 2XD3A 3C34A 4DCYA 5K2XA 3SEUA 1SD3A 1B6HA 2DOJA 4XKRA 1LAFE 3GBBA 2XHDA 1A8EA 1MQIA 4LZ8A 3MVYA 3FZVA 3Q25A 3VVFA 2M8CA 1B0HA 3U8QA 3PGFA 3OO9A 2AYSA 2DP8A 2GRVA 5DYHA 4AB5A 4MLQA 4XXUA 2LAOA 4YZZA 2DSFA 5I57B 1SQYA 3K02A 3S4UA 4POWA 3GZGA 2H5YA 4LQ2A 4NEDA 4QFKA 2F5XA 3H3GA 2ZNTA 3PPPA 2XXPA 3MW0A 4LATA 1PB7A 2GH9A 3MP6A 2D21A 1A54A 4U4XA 1WDNA 1MDQA 1FTJA 4YICA 4GF8A 1LB9A 2V3TA 2UYFA 2XD2A 3DP6A 5CMKA 3E9XA 3PMVA 4POXA 1QUKA 3ONMA 3T9VA 2GHBA 3THIA 3Q28A 1FQCA 3FJ7A 4KYDA 4OFJA 3MBPA 4X9TA 4G68C 1N84A 3G3HA 1POTA 2F35A 4RNSA 3ECRA 5CBRA 4IO7A 3JZJA 3TQWA 3MUQA 3DP4A 5EYFA 3I3VA 3RT8A 5I58A 4NMYA 4LONB 1UTHA 2YLNA 3VE1B 3K1MA 1ZJLA 1QVSA 1XC1A 3IO6A 4EQ7A 1B3EA 4ZE8A 5DVJA 4G2ZA 1O63A 1VE4A 1PEBA 1FTOA 3I5OA 1LAXA 3WAEA 1B7UA 2YPNA 3IB2A 3MP8A 3C35A 2I0CA 1ZMGA 3PPRA 3R26A 2WKYA 3EHSA 3I6VA 3U93A 4JSDA 3K6XA 2XXVA 1Y3NA 4PFYA 1WODA 5CMMA 1KWHA 4R6YA 3OELA 4KR5A 2OWTA 3TTRA 3C33A 4WEPA 2XXQA 2DWHA 3FJMA 3M3LA 1IXCA 5H8NB 1D9YA 5JEIA 5H8QB 3K1NA 4XTCQ 4WKMA 4OHNA 4EQ9A 3KFMA 3ZKKA 4OEVA 4R2FA 2Y7RA 4R74A 1DTGA 1OLCA 2H99A 1YPNA 2H25A 4C0RA 5CRYA 3C4MA 4QRZA 4MF3A 4NF4A 1LB8A 3C36A 4R9GA 1LFHA 2DWAA 2Q2CA 2PYYA 1MRPA 2CZLA 3O9PA 2V3QA 1MXXA 3KN8A 5CM6A 3M3FA 1PB9A 5I2KB 4EXKA 3L6HA 2Z8FA 3QIMA 4OTEA 3H6VA 3SERA 3F11A 2DXRA 1ZU0A 3O29A 5CBSA 2PMSA 1ZLQA 3ZSFA 1MH3A 5I59B 4YB7A 1MXZA 2ZYNA 3OSRA 1N76A 1O7TA 1BIYA 1SW5A 4GIZA 4NF6B 4OFOA 2DVCA 5JTYB 1B2HA 2AL5A 1H44A 3H7MA 3ODBA 2VGQA 2PBWA 4G77A 2G93A 4BDQA 1A99A 3MAMA 4XIGQ 2HZKA 3KOSA 4OQOA 5EHSA 3T9HB 3PMXA 5KDTB 3TYHA 1DSNA 3GBAA 4ELQA 2F6GA 5J1DA 3KZGA 5I2NB 4KFQA 1NMUA 1ZTYA 4G8HA 2ANJA 4THIA 3H4ZA 3MPKA 3OSQA 1SDXA 2YJPA 2I48A 4P0GA 2XXTA 1URSA 1Y1ZA 1JETA 2XX7A 2OJTA 2OK2A 1FW0A 4ZZEA 3O6GA 2ONSA 3HV1A 4FATA 1MXWA 3C32A 2AIXA 3O28A 2HEUA 3PPNA 1MY1A 3N26A 3IB0A 5TU0A 4FEBA 4U4SA 5ELVA 4OENA 4EF1A 2OBGA 3CFZA 3KN3A 1BP5A 5F7VA 4EXLA 3A3UA 1JVXA 5AE4A 4AQ4A 2B3FA 2NOOA 2OZZA 4ZEFA 2HFBA 3LSWA 2IA4A 2X7QA 1FQAA 5HBCA 2BJJX 2ZYKA 4JXIA 1MQJA 1MXUA 4YKPA 1Y1MA 1N7XA 1XVXA 3W15C 3T9UA 5F1QA 2ZNUA 2DXYA 3KSXA 3FXQA 1IXHA 3RN8A 2UYEA 1N7WA 3S9LC 2ONRA 1Y9UA 4OETA 3TTNA 5CI5A 2F7AA 1B5IA 4OFLA 3PPOA 1BTJA 1BKAA 5H8FA 4ZEIA 4DCXA 1RKMA 3VVDA 3UGWA 2RC8A 4FIMA 3EPEA 4GL0A 4R75A 1MPDA 4PFTA 3EN3A 1R9QA 3OXNA 4ZS9A 4JDFA 1ELJA 2QJEA 2DE2A 3PU5A 4OESA 1NNFA 3MJNA 2ZNSA 4R2BA 4NF8B 3LR1A 3LSLA 1LAGE 1EZ9A 5AA2B 2F6PA 3N6UA 4MLVA 2Y7PA 2VHAA 3QUJA 4HW8A 4LQ5A 3EHUA 2XXUA 4BLAA 2ZMBA 3VVEA 3KOTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3V8XB 2HXWA 2I4CA 4KYSA 1FPGA 5EYGA 3K6VA 1VFEA 3LSFB 2VOZA 4L17A 2QS2A 4ZEKA 4GWYA 3E4RA 3PD8A 2FA7A 4PFBA 4NWCA 5CMBA 2Q88A 2VT5A 2Q74A 3HFUA 3HSTA 2ZYMA 1NNTA 4PBHA 1LFGA 2R71A 2QVVA 5CMCA 4NGUA 1H3DA 4H5GA 4OYVA 2THIA 4BDRA 3AXFA 4NG7A 1IUDA 3EQ1A 1K9ZA 2XX9A 3O6HA 3A3CA 3Q26A 5H8QA 1A7LA 2DYXA 3K6UA 4QXDA 5B7DA 1AOVA 1MQGA 1LBBA 4H8JA 1IXGA 3A09A 4N91A 2Q8JA 3VXBA 1LLSA 5LOMA 4R6HA 4ZE9A 1B58A 1B3HA 4ND9A 4ELOA 1UQWA 1SYIA 4N17A 3TCGA 2DWIA 4FAJA 2FVZA 1MDP1 4R72A 3T1BA 1N04A 1WVJA 1EZPA 2MKZA 1NV2A 4IY5A 3FIRA 5H8SA 1DPPA 3T9XB 4ZEBA 3FJGA 3D4CA 1B9JA 3PPQA 1Y4TA 1ZIUA 3MVWA 1TT1A 3O2AA 1OVBA 4Q30B 4F3PA 5I2KA 2DS9A 4X04A 4MNIA 3D1RA 1ANFA 5I59A 3CFXA 3K1PA 5ICQA 4Q5TA 3FUZA 1M5DA 3TTLA 4F2OA 3IJOB 1PBQA 2XX8A 2Z8DA 4MFIA 4NF6A 5ET8A 3SETA 2GFEA 5JTYA 2ESNA 1IITA 1LBYA 1OIBA 4PETA 1AMFA 3U94A 1EYJA 3JYRA 4IGTA 3R7XA 4P11A 3RPLA 3S9MC 1VSOA 5BUUA 2DVZA 3MSTA 4LN5A 2VPNA 5DTBA 4NTLA 3FVKA 4G8MA 4DZ1A 4I9DA 2NXOA 3VLUA 3BIGA 2V25A 4UA8A 1EZOA 1VR5A 5KDTA 1FPFA 1NV6A 2ONKE 1B3GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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