3VV5A

Crystal structure of ttc0807 complexed with (s)-2-aminoethyl-l-cysteine (aec)
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
FQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
total genus 94
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vv5A02
4I1DA 5H8NA 1NNTA 4ELRA 3RT8A 1I6BA 3O66A 5A5XA 2ONKE 1A8FA 4F3PA 3OELA 3N6TA 4YMBA 4JWXA 1P1WA 3M3LA 4BDQA 1BKAA 3FJGA 4R9FA 3RGYA 3K02A 3LBSA 3PMVA 3U93A 2PT1A 2UYEA 1XC1A 3H03A 4OEVA 1IXCA 5I2NA 2H99A 1MQJA 2DXRA 4G2ZA 3FVKA 4OESA 4OENA 5FHOA 3IB2A 2OZZA 5AE4A 1NNPA 2UYFA 2Q2AA 2B65A 4G8HA 2ZYOA 2LAOA 4JWYA 2I49A 4EF1A 3I5OA 5I2KB 2QS1A 4F31B 4KCCA 1JETA 3OO8A 5ICTA 4LZ8A 1IQ7A 3PMXA 1SBPA 3PPRA 4R6KA 5H8NB 3A09A 5L9OA 2F5XA 3OMBA 5A5XB 3DP6A 4XKQA 3TELA 4F3SA 2QL3A 1B3LA 4BDMA 4U1OA 2AYSA 2GH9A 3G7WA 4U21A 4OYVA 5TU0A 3KBRA 1NKXA 4EXKA 2PBWA 3KGCA 1UIUA 3BKIB 4IO5A 2R6GE 3MVYA 5I2NB 1SD3A 1QKAA 4G77A 5IKBA 4G68A 1UIVA 4HTGA 5I59A 5K2XA 4U4XA 3MZ9A 1GVCA 5CM6A 3PMWA 1LAXA 4FORA 2FYIA 2XXXA 1N0TA 3OSQA 3T9UA 4OETA 2D3IA 3LC8A 1B7HA 1LAGE 2DWJA 3KJ7A 2OJTA 1A99A 3FATA 5M2VA 4ZEKA 2XXYA 5CMBA 3LSWA 5IAIA 2UVGA 3PPQA 4NF4A 4DDDA 3VXCA 1D9VA 3KSJA 1SW4A 1IIWA 1IXIA 1H43A 1NFTA 4QFPA 4L17A 4G68B 4FATA 4ELQA 1IITA 3VV5A 3MQ9A 1EU8A 5I59B 3QSLA 1GV8A 5KDTA 4QSEA 2H25A 4OFLA 3G3KA 1LB8A 1MG1A 4QSCA 3C9HA 5ITOA 4H0WA 1EZPA 1VSOA 1B1XA 4OQOA 3PU5A 4OVJA 4KYEA 3RY3A 2W7YA 3GZGA 4MFIA 1SI1A 2DVZA 3S9LC 4UACA 1CE2A 4NWDA 2REJA 4YB7A 4NF4B 3ZSFA 2NWJA 3IJXB 3G3HA 2Z22A 3EHSA 3H6TA 1GGGA 3SERA 4DE8A 1Q35A 3C34A 2E0SA 1MS7A 3N94A 5L9MA 5DEXB 1MH4A 4PFUA 3FVOA 2M8CA 4R9GA 4YB5A 3O9PA 3HN0A 5FHNA 1FQEA 4F29A 2NOOA 4KCDA 2O7UA 3ZKLA 3U8QA 4OTEA 1O64A 4KHZE 4NWCA 3UGWA 4R2BA 1B1HA 2OLBA 4DCXA 4IO3A 4NF6A 1B51A 4H6DA 3MPLA 1VFEA 4M4GA 1MRPA 2I0BA 1B32A 3N6UA 1B05A 4TQUQ 4H67A 4NTLA 4AB6A 3K01A 2ZYKA 3OOAA 5H8FA 2H98A 4AQ4A 2HAUA 2PT2A 2PMSA 4PFYA 3TTKA 2OWSA 3H4ZA 4DXBA 2QMWA 3HV1A 4MF3A 3T96B 4JSOA 4EDPA 3TFLA 1M5CA 3EHUA 1ZKBA 2GRVA 3BFTA 5FTHA 2DP8A 2I3VA 5KZTA 3IJOB 4R73A 4XKPA 4IGRA 1Z7ME 3PD9A 1DOTA 2A5TA 5B70A 3SEUA 3TUSA 1MXZA 4NF6B 1P1OA 4XTCQ 2I6EA 3TDJA 1B6HA 2RCAA 1JVXA 3LUYA 1NH8A 2Q8JA 4KYDA 4C0RA 3IAZA 3A3UA 1EZOA 3EF7A 1P1QA 2RKMA 3VFJA 2XXPA 4U2RA 2I0CA 3K4UA 4JBZA 1BP5A 4FEBA 2DQVA 1JEVA 3OO6A 1ZBMA 3HO7A 3KJTA 2ABHA 3WAFA 1MQGA 2RC9A 4TLLB 4POWA 4DXCA 3TEPA 3MBPA 3TMGA 5DVFA 4O3BA 2XXQA 2XHDA 3IR1A 4X48A 3PUVE 4JDFA 2DWHA 2A5TB 1JEUA 1SW5A 1B5HA 2V3UA 3R7XA 1ELJA 1B40A 1MY2A 4GOTA 3V89B 2P1SA 3PPOA 4RY1A 2AL5A 3IOUA 3SDFA 2UXAA 4IO4A 4FJPA 2DXYA 2RC8A 3O29A 4KFQA 2UVIA 4R72A 1WODA 5HM4B 4GL8A 3RUMA 3GBBA 1DPPA 3FXUA 3FUZA 3ILTB 3EQ1A 1EH3A 2GHBA 3U92A 3LSXA 2E1SA 4O3AA 5FHMA 4K3FA 2H5YA 4OZ9A 2ZNTA 2UVJA 1GR2A 1B5IA 3SEWA 3C35A 4MH5A 3IORA 1AMFA 2O68A 2OBGA 2I4CA 1OQHA 3TPAA 3ECRA 4QSDA 3EPEA 1P1NA 2FA7A 4ESXA 5CMCA 3AXFA 3FJMA 2XX9A 2RC7A 1URDA 4GLIA 4ZS9A 3TCFA 3VVFA 1PB8A 1AIVA 3KOSA 3UK4A 3N26A 4IGTA 4U23A 3VXBA 5I57A 3ODBA 3KEIA 1SQYA 3WAEA 1MY0A 4GRKA 4DIGA 1PDAA 1B7ZA 2ZMBA 3KN7A 2F97A 4HW8A 4KD5A 1MXWA 2XXVA 3I6VA 1LAFE 1LBCA 4R75A 4WEDA 3IOTA 1B3FA 1R9QA 4RPOA 2QSXA 1OMPA 2O69A 4R6YA 3RQTA 4YKJA 1A54A 4QF9A 3T9XB 2V84A 2B3FA 4ZZEA 1KWHA 1IEJA 2HZKA 4GL0A 4X9TA 2G29A 4IY6A 2P0SA 4Z7EA 3CG3A 1N7WA 4OWDA 1FTLA 4LVQA 3MZBA 4F3GA 4KR5A 5I57B 2DE3A 1QJMA 1Y9UA 1Y3PA 2DVCA 1UTBA 2Z23A 5H8QA 4XKNA 2DSFA 3SESA 3VVDA 3K6XA 1VE4A 2HAVA 4RK9A 3DP4A 5CBSA 1QUIA 2P2AA 1JNFA 1JW1A 1SW2A 3BBRA 3Q29A 4ISUA 1SW1A 3O6GA 4I62A 3ILUB 5AA2A 2DWIA 2R71A 4ZZAA 2V93A 5I56A 2QS4A 1MY3A 2V25A 4U1ZA 2R9JA 1M5FA 3SETA 3MPKA 4Q30B 4YKKA 3E13X 2X7PA 3H06B 3PPPA 1B46A 4YICA 2QMXA 3MP8A 5I58A 2Q9TA 1JVYA 3QXMA 4ZDMA 3RT6B 3S4UA 5TPAA 3DELB 4LP2B 5FTIA 1UTBB 2Y7PA 5H8QB 3FV1A 4ND9A 4EF2A 3R26A 2AL4A 4H5GA 4Q0CA 1A55A 3KSXA 5BUUA 1LGBC 1RYXA 3IOWA 2XD2A 1XVXA 3K2DA 4F1UA 2ZYNA 2XXWA 4P0GA 5AA2B 1FTJA 2X26A 5I56B 2F7AA 4N13A 2ZNSA 4RXLA 1B2HA 1BLFA 1FQAA 4ECFA 4HCWA 2PYYA 3UP9A 3PGFA 2HQ0A 2OCUA 4THIA 4U22A 5I58B 5H8HA 4E0XA 3TQLA 1FTKA 5TPAB 1P1UA 4EQ9A 1ANFA 1S50A 4GF8A 4ELPA 3M3KA 1TFDA 3W15C 3L6GA 5B7DA 5ISUA 4YU0A 3PUYE 2F8DA 4MBPA 3HHFA 3G3FA 2UVHA 3U1OA 4ZEIA 1P99A 1TT1A 1BTJA 4QFLA 3THIA 4QHQA 3IL1B 3FVNA 1OIBA 3FVGA 1ZTYA 1XHYA 3TCHA 2Y7WA 3OXNA 1QUKA 2I4BA 5KDTB 3MP6A 1B7UA 2X7QA 5HPQA 4GQOA 3P7IA 3O2AA 1GTKA 3TTRA 4KQPA 5ELVA 4QFNA 2F7CA 4DLDA 5H8HB 4OFJA 3KG2A 1LCTA 4EXLA 4JXIA 1USYE 1MQIA 3GXAA 3MVXA 1II5A 2RINA 4RA1A 1SYHA 2Z8DA 5L8DA 1D3KA 4PP0A 3TTLA 1IXGA 2HXWA 4F3BA 4H8IA 2D5WA 1J1NA 3USDA 1Z7NE 4E0WA 1SDXA 3TZAA 3V5AA 3TAJA 2HEUA 2IEEA 2Z8FA 4MLQA 5AA3A 1DSNA 1R1NA 4WKMA 4F19A 1BIYA 2O51A 4EQ7A 2YJPA 4X1DA 3G3GA 1OQGA 1JW5A 2F6PA 3HHGA 4G8NA 3TCGA 3TTMA 5L9SA 2V3TA 4F1YA 1URGA 5CI5A 4FIMA 2QPQA 3OEKA 5H8SA 2QS3A 4ZE9A 3D4CA 4LA9A 4F18A 2HFBA 1VFDA 1H45A 1LBBA 4XKRA 1A8EA 3SKPA 2ONRA 2ALUA 4C1TA 3U72A 3N5LA 5H8FB 3IB0A 3Q27A 4EQBA 1WVJA 1PB7A 2I58A 3LR1A 4RPNA 1AL3A 3C32A 4POXA 1H44A 2I3WA 3MVWA 1B3EA 1Y4CA 3PUZE 3B6WA 3A3CA 1POY1 1OVBA 2VD2A 4IB2A 2D21A 4H65A 2REGA 3SEXA 5K2YA 1FCKA 3QAXA 1B9JA 1LFGA 1SI0A 3B7DA 4R6HA 3FJ7A 4PE5B 4IO7A 1FQBA 3E4RA 1PBPA 2O84X 3FV2A 2DE4A 1US5A 1JW4A 1YAEA 1H76A 4EUOA 1FQCA 1N84A 5BWJA 3CVGA 1URSA 1LSTA 1YCJA 4U4SA 4R2FA 5CBRA 2Y7IA 1TWYA 5EYFA 4I8CA 1MY1A 3MWBA 3OO9A 4P11A 3PPNA 4BDLA 2IA4A 3S9MC 4GXSB 1EZ9A 3C33A 3S9EA 3QUFA 1POTA 3LSFB 3OO7A 4BLAA 3EN3A 3H3GA 5TP9A 3MC2A 3MVZA 5J1DA 4FECA 5F7VA 1XT8A 3ZKKA 4F22A 5ICQA 3O97A 1Y1MA 3RN8A 2H9BA 4LATA 1LB9A 1I69A 3S9NC 1T0KA 4NEDA 1ZJLA 3C4MA 3MUQA 1MH3A 3M8UA 1FTOA 1N04A 3FXRA 2OK2A 3KZGA 4ZE8A 1MM6A 4OMBA 3QUJA 3FZVA 2NUVA 1B0HA 3VVEA 1NMUA 3JYRA 3B6TA 2YLNA 3CRBA 1ATGA 2VHAA 4HS7A 4BDOA 3CG1A 1XVYA 5TP9B 3JV9A 1I6AA 2ZXTA 1Q1KA 3L6HA 1MPCA 4GFRA 2QRYA 1S7YA 3O6IA 3S2VA 3U94A 3T9HB 2V3QA 3MW0A 3DLNA 3FD3A 3OENA 3BFUA 1US4A 3CIJA 1MXXA 4LQ5A 5CMKA 2XD3A 4YKPA 1B58A 3PUXE 1MXVA 3PD8A 4IO2A 1OVTA 1A7LA 5I84A 4GXAA 3CFLA 4QFKA 4PQJA 2H4IA 4F2OA 1MDQA 1XS5A 3RTWB 1XOCA 3CSGA 4FE8A 3SEVA 1PC3A 1QUJA 3H6VA 3UN6A 1B4ZA 2DS9A 4RNSA 3ONMA 2DOJA 3CFXA 1PBQA 2XX7A 3G3IA 5F1QA 1D9YA 1AH5A 3C36A 1LFHA 3UORA 3VLUA 5CC2A 3HPIA 2GHAA 1FQDA 1FW0A 4LZ7A 1B5JA 1USYH 2WKYA 2VD3A 3K0VA 2XXTA 3G3JA 2O1MA 3D4GA 4AB5A 4YAHX 4Q5TA 2F7BA 3FXQA 5EHMA 3K1NA 4OEUA 1B3GA 1R9LA 1DTZA 1I6QA 3C31A 1N7XA 2ZYMA 2DE2A 5EHSA 1M5EA 3T93B 3GBAA 3TODA 1Y1ZA 4ONYA 3OSRA 3RNNA 3TQWA 1WDNA 4ZEFA 1A40A 3GLBA 4O3CA 4X1BA 4YZZA 4NMYA 1L5TA 1D4NA 4F1VA 3KFMA 1NNKA 1LCFA 1NL5A 1MXUA 2F35A 1H3DA 3Q28A 3OEMA 3K00A 2XX8A 2QJEA 3IK6B 4G68C 4H5FA 4YB6A 1YPNA 1LAHE 2O6AA 1Y3QA 1MY4A 1IUDA 3FIRA 3FGSA 5DEXA 1FQFA 4ZEDA 2ESNA 3EHTA 1OLAA 3I3VA 1YTVA 5DVIA 1UTHA 4OHNA 1HSLA 4JWOA 3V8XB 2HZLA 3KN3A 1DMBA 3UIFA 3DP8A 3MP1A 3KOTA 4QRZA 4HCYA 4H1XA 3JZJA 1B3HA 1NH7A 4XIGQ 4GVOA 4N6PA 5HBCA 1R6ZA 1PEBA 5JK4A 4ZECA 3IO6A 2XXHA 3K1MA 1IXHA 2ANJA 3IX1A 4OFOA 3RTFB 3KN8A 3VE1B 5AA4A 2GFEA 2I48A 1QW0A 3T66A 1Y20A 4H8JA 2O7IA 1N3XA 4ELOA 4F39A 3UA8A 1UTHB 4ZEBA 2NVUB 2A5SA 3SEYA 3K6VA 5KCJA 2ONSA 1LLSA 3K1PA 2NXOA 5LOMA 2YPNA 1B4HA 4RJZA 1MQHA 2HCAA 4LQ2A 4C1UA 1NNFA 2THIA 4KPTA 4TLMB 4GD5A 3FASA 1ZLQA 1SYIA 2CMOA 4RYAA 3CR9A 5DVJA 3TTNA 1N3WA 4BDRA 3IO4A 1Y4TA 4QFOA 2CZLA 3QK6A 1O7TA 5AA4B 4NE4A 1FTMA 1AOVA 3VDFA 2VGQA 3M3FA 1MQDA 2VOZA 4G4PA 3W9VA 3PV0E 1VR5A 2O1LA 4GWOA 2PX1A 4FAJA 4PETA 4FEDA 2Y7RA 2KLFA 4IY5A 1M5BA 1MPBA 4P0IA 5ITPA 2DYXA 2F78A 5KCJB 4F2QA 1QULA 5DT6A 1DPEA 2Y7KA 4IO6A 3CFZA 3Q25A 1ZU0A 3T9VA 3RPWA 4YMAA 1CB6A 3R6UA 2OWTA 3OD7A 3TYHA 5JTYA 4GIZA 4RK2A 4DZ1A 1MM7A 4Q8RA 3E9XA 4LUBA 3PUWE 1SVXB 5DYHA 3E3KA 1LFIA 3K6UA 1IZ1A 4N07A 4TOZA 5AA1A 1RKMA 3O6HA 4PFTA 4DCYA 1QVSA 3VLVA 2XXIA 3CI8A 2QS2A 4OERA 3TKDA 2BJJX 3MZ1A 5CRYA 1MDP1 1RYOA 4OXVA 1Y3NA 4R74A 4NF5A 2Z8EA 1PB9A 3CSBA 2F34A 3H6UA 1UQWA 2ZNUA 5DTBA 3IB1A 1B0LA 1O63A 3QYTA 3VLWA 4PFWA 3H7MA 5JTYB 2AIXA 3DM0A 1ZMGA 1B52A 5JEIA 4BDNA 1MPDA 2VP1A 3W9WA 1JQFA 1MXYA 2Q2CA 3HSTA 2XXUA 3IOVA 2Q89A 3V83A 2Y84A 1TXFA 3K6WA 2DWAA 4ESWA 2RF1A 4JSDA 4I9DA 3HCQA 4LONB 1ZIUA 4XXUA 1HSEA 4KI0E 2RCBA 3ZS6A 2XXRA 4NF8A 1HSJA 3MAMA 3Q26A 4WXJA 4M1VA 3H6WA 1S9TA 4NF5B 2FNCA 4YKIA 4G8MA 3B6QA 2Q88A 2F6GA 5AA2D 4MLVA 4UA8A 3F11A 1DTGA 2F36A 3O28A 4JB7A 5CMMA 1QKBA 1F9BA 1N76A 3RLFE 2B3BA 4Z0IA 4DXUA 3LSLA 3T22A 4LZ5A 1TFAA 1OLCA 4KYSA 2G93A 4WEPA 5I2KA 1M5DA 3MJNA 2PVUA 3QIMA 4NF8B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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