3VVFA

Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA02
5EYFA 1PDAA 4YZZA 3HSTA 1FQFA 2DP8A 1XC1A 5H8NA 3Q27A 4ONYA 4IGTA 2OJTA 1AIVA 1JEVA 1MXVA 3DP6A 3FVKA 5AA2A 3H4ZA 4YAHX 4R75A 4F22A 4R6HA 2DWJA 1FQDA 1P1NA 4GFRA 4LUBA 2Q89A 3KJTA 2XXHA 2Y7WA 3HHFA 4NTLA 1MY4A 5KZTA 3PUWE 2YPNA 1OVBA 3RY3A 3FGSA 1H76A 1DPEA 2HZKA 4ESWA 5JTYB 1A8EA 3QYTA 4RJZA 1B32A 3VLUA 2AL4A 3Q28A 4AQ4A 2GRVA 3C36A 1BKAA 4C1UA 3S2VA 1MPCA 4G4PA 4G68B 1LAXA 1LSTA 3VVDA 3BFTA 4NMYA 4DCYA 3IB2A 3FV1A 3KEIA 2YJPA 3VVFA 1SW5A 4ZE9A 3RUMA 3H3GA 3KGCA 3B6WA 3G3GA 3HO7A 4F39A 4OEVA 4ELPA 3FVOA 3ZKLA 4KCDA 2O69A 4FORA 1LAHE 2V3UA 1B3EA 3K02A 4RPNA 1QW0A 3VV5A 2DWIA 3KN3A 4GL0A 2I0BA 3O6IA 4ZEBA 2QPQA 2HAVA 2XXUA 1FQBA 1AL3A 3JZJA 1SI0A 3ILTB 4WEPA 2XXIA 2Q2CA 1MY1A 4ND9A 4TQUQ 3IX1A 2Y7RA 1O7TA 2ZNUA 2PT2A 3K1NA 1SW4A 2ONRA 1Y1ZA 3FXUA 2E0SA 2OK2A 1MM6A 4F1YA 4U1ZA 4BDLA 1PB9A 3G3IA 5JK4A 2Y7IA 2VHAA 1NNTA 5EHSA 4R73A 3MVYA 2V3TA 1HSEA 3C33A 1US4A 1P1QA 4I9DA 2THIA 2OBGA 1B3HA 1NFTA 5A5XB 3IOUA 3MAMA 2F6PA 1LB8A 2V84A 5ICTA 5CMCA 1DSNA 1QKAA 1B4HA 3C9HA 3D4GA 5IAIA 4F1UA 1MPBA 4QF9A 4NF4A 4XTCQ 3K6WA 3FXQA 2ONSA 4DZ1A 3SEWA 1EZ9A 3DELB 5KCJA 3FD3A 3K6UA 1WODA 3DP8A 3VFJA 5ITPA 5F7VA 2ZYNA 3KN7A 2XXQA 4X9TA 1MXXA 3TUSA 1B52A 1Y3PA 1DTZA 4C0RA 2H5YA 1LFGA 1S50A 4BDMA 1HSLA 1MRPA 4POXA 1R6ZA 2CMOA 1QUIA 3HV1A 3QIMA 5I59A 5L8DA 3PPRA 4BDNA 1ZKBA 4JWOA 1MXYA 5CI5A 2I3WA 1UTBB 4XKRA 3LC8A 4P11A 4PE5B 1EZPA 3T66A 2XX7A 3TQWA 1TT1A 1P1OA 4G8MA 1JQFA 3UIFA 3UGWA 2PVUA 3G3FA 4QFPA 2X7PA 3F11A 4R6YA 2DOJA 1JETA 4RA1A 2DXYA 2E1SA 4KI0E 3C34A 2PMSA 1N7WA 1P1UA 1RKMA 2QMWA 2V93A 4GL8A 3VVEA 4R72A 1UTHA 1MH4A 3MZBA 4I8CA 2REGA 4X48A 3IAZA 1OLCA 1B05A 3OO9A 1B7UA 4Z7EA 3LUYA 4NF8B 1M5BA 3O2AA 2QJEA 3FV2A 5AA3A 3KSJA 4FIMA 3IORA 4HCWA 4NWCA 2F97A 1Y4CA 4KFQA 2O7UA 3THIA 2F6GA 2Q88A 5H8QA 5DEXB 3O6HA 5TP9B 5FHNA 3MJNA 2DYXA 2Z8EA 4OMBA 3H7MA 1EZOA 2F5XA 3SEYA 3OELA 5FHOA 4H67A 1SBPA 5J1DA 3VXBA 4EUOA 1II5A 4ELOA 5CMKA 3O28A 1NH8A 2GHAA 3MPKA 1AH5A 4U4XA 5I2KA 2ONKE 4NF5B 1N76A 3Q25A 2XXWA 4XKQA 4LP2B 4U23A 1OMPA 4OESA 4X1DA 2X26A 2V3QA 4FE8A 3OEKA 2ANJA 4ZEFA 3B6TA 1MXZA 3C35A 3TZAA 4YICA 2OWSA 2I49A 1NNKA 1JVYA 3V8XB 1LLSA 4DLDA 5DYHA 2ZNTA 1OIBA 3CSGA 1LFHA 3EHTA 3SEXA 1NL5A 4GWOA 4FATA 1N7XA 1PB7A 3TODA 5B70A 3M8UA 5CBRA 3P7IA 4IO6A 3G3HA 2QS1A 4U2RA 3D4CA 2RKMA 3R26A 4C1TA 4L17A 3T9HB 5EHMA 2F36A 3M3LA 4LVQA 1A7LA 4I62A 4FEBA 1OVTA 2Y7KA 2F8DA 2I0CA 1PEBA 5LOMA 3OEMA 2I48A 1B4ZA 3MWBA 3QUFA 2DWHA 1TFDA 3SEVA 1IEJA 1ZTYA 3USDA 3OXNA 2R9JA 2CZLA 4AB5A 3IOVA 4YKKA 1QULA 3E3KA 4FAJA 3GBBA 5DTBA 4LATA 4PFYA 4N07A 1Z7ME 3HPIA 3R6UA 3LSWA 1B0LA 3GLBA 4DE8A 3TPAA 1ZMGA 2NVUB 1B46A 3H6UA 4GLIA 3E13X 3G3JA 2QRYA 3A3CA 1ANFA 3PMXA 4RY1A 3SERA 4DIGA 5ICQA 3MW0A 3LBSA 3WAFA 2UVJA 1IIWA 2ZNSA 1NMUA 3RTWB 2A5TB 1O63A 2ESNA 3S9LC 5ISUA 4FEDA 1N04A 4YKJA 3N94A 3T9VA 5I56A 4GQOA 2O1LA 2O51A 2RCAA 1EH3A 3RNNA 4E0XA 1WDNA 1FQAA 2Z23A 2AL5A 4R74A 3ZSFA 1SVXB 1QUJA 3I6VA 2REJA 1OLAA 2W7YA 1MQGA 2Y7PA 4YB7A 5KDTB 1USYH 1M5EA 4H8IA 1D3KA 2ABHA 4QFNA 3RPWA 2F34A 3VLVA 1Y20A 1TXFA 3PU5A 3DP4A 4MFIA 4UA8A 1M5DA 1MDQA 2O7IA 1I6QA 3RLFE 1QKBA 3KN8A 4ZE8A 1US5A 2XXVA 3N6TA 4YMBA 4XIGQ 4JBZA 3FVNA 5I58B 1UTBA 2F7CA 5L9OA 3SESA 1DOTA 5TPAA 5CC2A 1B7ZA 1LBBA 4PFTA 4RXLA 2RC9A 5H8FB 4QRZA 3RTFB 4WEDA 4XKNA 3AXFA 1B9JA 1GTKA 4IO5A 4ZS9A 2QMXA 4POWA 1XOCA 3FXRA 3O9PA 3QAXA 4DXUA 1DPPA 3MQ9A 3SETA 3EHUA 4YB6A 3ILUB 1GV8A 3IR1A 4H0WA 3MVXA 4GRKA 3PUXE 5DVFA 3OSRA 1LAGE 3MZ9A 4JXIA 4DXCA 4KQPA 4U1OA 3S9EA 1RYOA 4R2BA 2G29A 3IL1B 4NF8A 3IK6B 3TTMA 1SQYA 3H6TA 3N26A 2UYEA 2O1MA 4IO4A 5DEXA 3U1OA 5TP9A 4KD5A 3RT8A 4QHQA 1DMBA 3ONMA 3MVWA 3PUVE 1DTGA 1CE2A 4M4GA 4ZEIA 2FA7A 2HAUA 3FZVA 1LAFE 5BUUA 4U22A 1TWYA 1IITA 1XHYA 3QK6A 4HS7A 5AA1A 3E9XA 2H99A 4JB7A 3BBRA 3S9NC 3FJGA 1B3LA 4RPOA 3TTLA 1YAEA 3T9XB 5H8NB 2ZYKA 1IQ7A 1WVJA 4I1DA 4QFLA 3CFLA 5AA2B 1N0TA 3I5OA 1B6HA 2PYYA 4HCYA 4F29A 4GF8A 4G8NA 4KCCA 1NH7A 3WAEA 3TKDA 2ZYMA 3PV0E 4IO3A 1SYHA 4ELRA 5CMBA 1M5FA 4WKMA 5I57B 4O3AA 3L6HA 4G2ZA 1MY2A 5AA4A 1MDP1 4R9GA 4PETA 3TTKA 4NEDA 3H6WA 4QFKA 4GIZA 4NE4A 3V89B 1H44A 3LSFB 4OHNA 1N3XA 1QJMA 2WKYA 2RC8A 3H6VA 2XHDA 3VDFA 4ESXA 5I84A 1P1WA 3ZKKA 3FIRA 1XT8A 3DLNA 2Z22A 3C31A 1OQHA 2OCUA 3N5LA 2KLFA 5I58A 4OZ9A 1IUDA 1MQHA 4OWDA 4QSCA 5K2XA 4OERA 3FJ7A 3O97A 4OVJA 1IZ1A 3K6VA 1TFAA 1LGBC 2DVCA 4UACA 5HM4B 1ZJLA 5H8SA 3TYHA 1UIUA 4YB5A 1LCFA 4F3SA 2P0SA 3PMWA 1H43A 3SEUA 1R9QA 3PD9A 5ITOA 2Z8FA 3OO8A 4GOTA 2H9BA 5IKBA 1B0HA 4IB2A 1Y4TA 3MPLA 2DS9A 1B51A 3PPQA 4P0GA 1HSJA 4F3PA 3KBRA 1MM7A 3EHSA 1B7HA 3A09A 3QUJA 3ODBA 5L9MA 2ZYOA 3U92A 1P99A 1IXIA 4F31B 3TMGA 5JTYA 2Y84A 3CI8A 1MXWA 2VD2A 5CM6A 1POTA 1ZU0A 1YTVA 4O3CA 4OQOA 4YMAA 4YKIA 3RN8A 5K2YA 5H8FA 1D9VA 2B65A 3U72A 1UQWA 3TCGA 4BDQA 1FTLA 4BDRA 5AE4A 3TTNA 3B7DA 4G68A 3MP1A 2ZMBA 2R71A 2QL3A 1Y9UA 4LZ7A 2AIXA 2UVHA 4NF4B 1B3FA 1VSOA 4PFUA 3KSXA 1M5CA 1B58A 4F3GA 5KCJB 2IA4A 2RF1A 2I4BA 2O84X 2HQ0A 3T96B 2OZZA 1JW4A 1RYXA 4NF6B 2F7BA 4IO7A 2XXRA 1LBCA 3FVGA 3W9WA 1R9LA 3UA8A 3K0VA 3CSBA 1IXCA 5I59B 2UVIA 4O3BA 3O6GA 2NXOA 3LR1A 4Z0IA 3K1PA 2F78A 3HCQA 4M1VA 1B5JA 2BJJX 3T93B 2GHBA 3PMVA 2RC7A 1VR5A 3V5AA 1VFDA 4OFOA 1ATGA 4YKPA 3IOTA 1SI1A 4F19A 2GFEA 3A3UA 4G68C 1H3DA 1B1HA 3KOSA 3JYRA 4DCXA 3K4UA 3TELA 2XXXA 5A5XA 4TLMB 1MQIA 2VD3A 3PD8A 3S9MC 1I6BA 1UTHB 4R9FA 4IY5A 3ECRA 2NWJA 4JSOA 1A40A 3OO6A 1MPDA 1SW2A 2QSXA 4TLLB 4QSDA 3I3VA 1EU8A 3MP6A 5I2NB 1MQJA 4F2QA 1LCTA 5L9SA 2A5SA 4JSDA 3IB1A 3K00A 3PGFA 2VOZA 2P1SA 2OWTA 1H45A 2D5WA 5H8QB 1XVXA 4Q5TA 4EF2A 1GGGA 3MUQA 4OYVA 4MF3A 1SYIA 4DXBA 3BFUA 4FJPA 4OENA 1SD3A 3CG1A 3FASA 4DDDA 1S9TA 1D4NA 5I57A 3IO4A 4OFLA 5I2KB 3S4UA 3MBPA 5CBSA 5HBCA 1BLFA 3LSLA 5FHMA 3PPNA 4QFOA 1Y3QA 1B3GA 3Q29A 4ZEKA 1D9YA 1YCJA 5JEIA 1LFIA 2F7AA 2DVZA 3W15C 1O64A 2Z8DA 2H4IA 1JVXA 1Y1MA 3TTRA 4ZECA 2B3FA 4IO2A 3C4MA 1JEUA 2X7QA 4EXLA 4PQJA 3O29A 1BIYA 3U93A 3FUZA 2DE3A 4K3FA 2R6GE 4JDFA 3PPPA 1ELJA 4BDOA 1URDA 2Q9TA 2DWAA 4F1VA 3OO7A 1URGA 4OFJA 2DQVA 2VGQA 1PC3A 4X1BA 4U4SA 4RNSA 5M2VA 3EQ1A 1NNFA 2D21A 5DVIA 3UORA 4THIA 1ZLQA 1CB6A 3VLWA 3OENA 3PPOA 5H8HB 1QVSA 2GH9A 4MLVA 4XXUA 3RT6B 1JW5A 1GVCA 2I58A 4LQ2A 4OXVA 5B7DA 2P2AA 3MP8A 4GXAA 3CFXA 4MLQA 4EQ7A 5CMMA 3KZGA 3V83A 1A55A 3QXMA 3OSQA 3EPEA 3H06B 3MZ1A 4G8HA 3HN0A 4Q30B 1L5TA 3T9UA 1N84A 4NF5A 4E0WA 1S7YA 4ZDMA 4KHZE 1Q35A 4KPTA 3TQLA 4F3BA 3UN6A 4EDPA 1MY3A 3M3FA 1FTOA 4IY6A 1B5IA 5DVJA 1I69A 3BKIB 2QS4A 4HW8A 1PBQA 1Z7NE 1NNPA 3LSXA 4ISUA 2XXYA 4TOZA 2UVGA 1FTJA 2PT1A 3G7WA 5I56B 3CFZA 4F2OA 3PUZE 2XD3A 1UIVA 5AA2D 3C32A 3IJXB 3RGYA 1JNFA 3CVGA 1J1NA 5DT6A 2XXTA 2F35A 4NWDA 4P0IA 4R2FA 3GZGA 3T22A 3CR9A 3U8QA 3KOTA 1R1NA 4LZ5A 4ZZEA 4RK9A 3CIJA 4NF6A 3E4RA 1VFEA 2DSFA 1B5HA 1FQEA 4GD5A 1I6AA 4JWXA 1KWHA 3FJMA 3L6GA 1B40A 1OQGA 4XKPA 3RQTA 2FYIA 4YU0A 1IXHA 4KYDA 4MBPA 1PBPA 5CRYA 2DXRA 3TCFA 4EXKA 4FECA 3TAJA 3K6XA 5TPAB 2HXWA 1MQDA 1ZIUA 2B3BA 1BP5A 1JW1A 2XX9A 2PX1A 3TCHA 3UK4A 2AYSA 4OTEA 3QSLA 3ZS6A 2M8CA 2XD2A 2HFBA 2PBWA 2O6AA 4H5FA 2RINA 2I6EA 2H98A 5TU0A 2A5TA 1Q1KA 1NKXA 1FTMA 4PFWA 3K1MA 3M3KA 1F9BA 1VE4A 2YLNA 3KFMA 1BTJA 5HPQA 4KYSA 3KG2A 2UXAA 1ZBMA 4LZ8A 3HHGA 1QUKA 3EN3A 1FQCA 4F18A 2HCAA 4LQ5A 2Q8JA 4H8JA 3VXCA 5KDTA 3TFLA 1FW0A 1GR2A 3MVZA 2FNCA 5I2NA 2OLBA 3IO6A 3JV9A 2XXPA 4PP0A 2I3VA 3B6QA 1FTKA 4KYEA 2NOOA 4GVOA 4H5GA 3OMBA 1MY0A 1XS5A 3W9VA 1SW1A 3Q26A 1YPNA 3DM0A 4BLAA 3VE1B 3O66A 4RYAA 1SDXA 5BWJA 3TDJA 1Y3NA 3G3KA 2RCBA 4OEUA 3GBAA 3U94A 4H6DA 1AMFA 2V25A 4ECFA 4R6KA 4AB6A 3K2DA 1MG1A 5FTIA 3K01A 3TEPA 4HTGA 1A8FA 2NUVA 2UYFA 1B1XA 1MXUA 4OETA 1IXGA 2HEUA 2G93A 4RK2A 1POY1 4G77A 1N3WA 2ZXTA 3GXAA 4LONB 1T0KA 2O68A 4MH5A 3PUYE 1USYE 2LAOA 4GXSB 1A54A 1FCKA 2H25A 1LB9A 3N6UA 5F1QA 4ELQA 4EF1A 4LA9A 4N6PA 2ALUA 4ZZAA 1AOVA 4ZEDA 4EQBA 4JWYA 5ELVA 3MC2A 4QSEA 3EF7A 4U21A 1URSA 4WXJA 4N13A 2QS2A 1A99A 5H8HA 4H1XA 3SDFA 2D3IA 2HZLA 3FATA 2DE2A 3CG3A 2DE4A 1MH3A 2Q2AA 5AA4B 3IJOB 2QS3A 4Q0CA 2XX8A 3IOWA 3IB0A 1MS7A 2IEEA 1B2HA 5FTHA 3CRBA 3R7XA 2I4CA 1XVYA 2VP1A 4KR5A 3OOAA 1PB8A 3SKPA 3OD7A 3H03A 4Q8RA 3KJ7A 4H65A 4IGRA 3UP9A 4EQ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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