3VVFA

Crystal structure of ttc0807 complexed with arginine
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
total genus 90
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vvfA02
3DP8A 1Y4TA 3OXNA 4PP0A 3CR9A 3UN6A 3K02A 2D21A 4GLIA 1B0LA 4F29A 4QFNA 1UQWA 1LAHE 3I5OA 3RT6B 5CC2A 5I59B 2XD3A 1II5A 2P1SA 3HHGA 4DXBA 5DT6A 3C4MA 3KN3A 1US5A 4RK9A 1AMFA 2XXYA 4M4GA 4OZ9A 1OVBA 2Y7PA 3QXMA 1JETA 1VFEA 3DP6A 1UTHB 4GOTA 2I6EA 1SDXA 4NF6B 3KSXA 2V25A 3DELB 5I58A 4NF5A 4HCYA 5H8QB 3JYRA 4WEPA 2H99A 4RYAA 4RPNA 2G29A 5I56B 3LSXA 4G8HA 2QS3A 4JBZA 1O64A 1NNTA 3IL1B 2V84A 1B5HA 2OCUA 5I57A 1CE2A 2H25A 3FVOA 1FQFA 4KR5A 1A54A 2R9JA 3TYHA 4BDOA 2DWIA 4EDPA 3G3JA 2YPNA 2YLNA 1MQGA 3U93A 3K00A 2AIXA 2VD2A 1IQ7A 4DLDA 3PUYE 3O6IA 4OESA 1D3KA 4DZ1A 2DOJA 1Y3NA 2CMOA 1JW4A 5KDTA 3GBBA 2UVHA 2ZNUA 3OSQA 3M3FA 1SI0A 1I6BA 3OO6A 4PQJA 3EHSA 3C9HA 1LB9A 3KSJA 1D9VA 4LVQA 4BDQA 4G68A 4DDDA 1SW1A 2DE2A 1LAGE 1D9YA 2OLBA 2O6AA 3O28A 1TT1A 4PFWA 3PMVA 3M3LA 2O68A 1H44A 3TTKA 3I3VA 1B3GA 4EXLA 1Z7NE 4ZZEA 4YB5A 1UTBB 3KN8A 3AXFA 4ZE9A 1GTKA 4NF8A 2RC9A 1NNPA 2IEEA 4YZZA 2RF1A 5CMCA 1LCTA 3TZAA 3CG3A 2XHDA 3GZGA 1FQEA 3R6UA 4MH5A 4RA1A 3TQWA 2I48A 2FYIA 1OIBA 3DLNA 4MBPA 5M2VA 4FATA 2ABHA 3ZS6A 2A5TA 3FASA 4LUBA 4R9GA 3VLUA 5JEIA 2PVUA 4KD5A 3U1OA 4DCYA 4R74A 4QSCA 3IOTA 2ONSA 3CG1A 1WVJA 1GR2A 3VV5A 4JWOA 4R75A 1O7TA 1R9LA 4ESXA 3RPWA 3U94A 1JEUA 4IGTA 1IIWA 3N6UA 4DXUA 2VD3A 2XD2A 3CI8A 5K2XA 2OBGA 4FEBA 4ISUA 4JXIA 4F3SA 2HXWA 2DXRA 4NMYA 4K3FA 1B3FA 4HTGA 4RXLA 5TPAB 1OVTA 2I3WA 1OMPA 1Y9UA 1DPEA 3TCHA 5DTBA 1I69A 4OEVA 1MXZA 3KG2A 2DQVA 4KFQA 2XXIA 4F3BA 2HFBA 4C1UA 3W9WA 1LGBC 4QF9A 3FJMA 1AH5A 2ZXTA 2IA4A 3PMXA 1QJMA 1JW5A 1BP5A 4RK2A 3IO4A 1AIVA 3CFZA 2HQ0A 3PUVE 3T66A 1B58A 2Y7KA 1N0TA 2UYEA 3WAEA 4OWDA 1B32A 2VHAA 2P0SA 1MY4A 3PUWE 3EHTA 3SEUA 1POTA 4KHZE 3H6WA 1MQIA 2HZLA 2XX8A 1UIUA 3C35A 4JB7A 3VVDA 1ZKBA 3FATA 4O3CA 3OO8A 3TQLA 2WKYA 3T9XB 4X48A 1Y4CA 4ONYA 3IOWA 4GL0A 1MPDA 2XXVA 2GH9A 5H8NB 3EHUA 1LLSA 4Q0CA 2E1SA 3G3FA 2QSXA 2F35A 3W15C 4KCCA 1JVYA 4ZEKA 2X26A 3QIMA 5I84A 3Q27A 4EF1A 4Q30B 3CSBA 2I49A 3Q25A 1MDQA 2NXOA 3K2DA 1XC1A 5JTYA 1XOCA 4QFPA 4I62A 1VR5A 1B1XA 1P1OA 2DWHA 2Y84A 4KYDA 2DYXA 1Y1MA 4GF8A 2QS1A 4GWOA 5ITOA 4U4SA 2DE3A 4KCDA 1N3WA 3C31A 4BDNA 3CFLA 1SW2A 3PPOA 4KPTA 5FHOA 4ELQA 3B6TA 4YKJA 3RTWB 3PPRA 2R6GE 2QS2A 1FCKA 3E13X 4YKPA 2QRYA 5I2NA 2AL5A 1NNKA 4X1BA 3BKIB 3S9EA 1YTVA 3F11A 3VXCA 5H8HB 4XXUA 3EQ1A 2QL3A 3M8UA 2O7UA 3IB2A 3MVZA 3ODBA 4OFLA 4L17A 1OLAA 3G7WA 1GVCA 3FIRA 3H6VA 3FXRA 1R1NA 2GRVA 3TCFA 3VLVA 1QULA 2F34A 3EF7A 4EQ9A 2H4IA 2O69A 1MQJA 3RLFE 5I2KB 2B3BA 3O66A 3OO9A 4LONB 4F1VA 1EZ9A 2XXWA 3S4UA 5DVIA 3IR1A 1MS7A 4C1TA 3KBRA 2PMSA 3KEIA 4GXSB 2UVGA 4IO5A 2GHAA 1XVXA 4ECFA 3FGSA 4EXKA 1MM6A 1QKBA 3U72A 2UVJA 4YKIA 3K1PA 2F6GA 3OMBA 3MPLA 4LP2B 1MXUA 1NFTA 2QMXA 4TLMB 4RPOA 3SEVA 2VGQA 3K6VA 4OMBA 2XXPA 3PV0E 4IY5A 1YCJA 5BUUA 2NVUB 4X9TA 4OENA 3HPIA 5I59A 2ONKE 5DEXA 2O7IA 1EH3A 2REJA 3S9LC 2RC7A 3UIFA 4N13A 3G3IA 3N6TA 1R9QA 4NWDA 4FEDA 4I8CA 1D4NA 3SDFA 4Z7EA 3MC2A 1EZPA 3H3GA 2HAVA 3L6HA 1FTJA 1UIVA 5F1QA 3K6WA 1URGA 4H65A 3V89B 5H8QA 4G77A 4IO7A 1NNFA 4FJPA 1J1NA 5I56A 2H5YA 2V3UA 3MZ1A 2ZYMA 1TWYA 5I58B 1URDA 1B05A 4I9DA 2Y7RA 3CRBA 1NH7A 1FTMA 1M5BA 4YKKA 5CMMA 4ELRA 3VVFA 4GQOA 3HHFA 3LBSA 3RTFB 3OEKA 2XXQA 1PC3A 2X7PA 3A3UA 2I4BA 4R6KA 4IO6A 4H8IA 3O97A 3MJNA 1B7HA 1M5CA 3C34A 4Z0IA 1A55A 3K6UA 1TFAA 3TAJA 1B2HA 5F7VA 5DVJA 5A5XA 1P99A 4LZ7A 3K1NA 5KDTB 4ZEIA 3FXUA 5TP9B 1DOTA 2Z22A 4F2QA 3MVYA 4Q8RA 3BFUA 4YAHX 3TELA 4QFKA 4OQOA 5CMKA 5KCJB 2I0BA 4ZE8A 2D5WA 3KFMA 1IXCA 1FTKA 4H1XA 3T96B 1B40A 3BFTA 4NF8B 5CM6A 1DPPA 3TTLA 1ZJLA 3QAXA 4GD5A 4FIMA 2H98A 1B52A 1NKXA 4ND9A 3TODA 1WDNA 3QUJA 4RJZA 2KLFA 2ZNSA 4XIGQ 3CVGA 3SEXA 1JEVA 3FVNA 2I58A 2ESNA 3IO6A 1L5TA 4Q5TA 2UVIA 3KGCA 3LC8A 3IOUA 3WAFA 5AA2B 1YPNA 3C33A 2NOOA 3SKPA 1Q35A 2XXUA 3QYTA 1JVXA 4KI0E 3PPPA 2W7YA 1MDP1 3HO7A 3VDFA 3MVWA 3H6TA 4OYVA 3K01A 4IO4A 3O6GA 1MXWA 3FZVA 3DM0A 3LSFB 3LUYA 3FVGA 5TPAA 4C0RA 2Z23A 4U4XA 2I0CA 1EU8A 3TUSA 1ZIUA 3IJOB 3G3HA 5AA4B 4PFYA 1N7WA 3TPAA 4ZECA 4NF4A 5CRYA 3OO7A 1DTGA 4R72A 3Q26A 2ZYNA 4TQUQ 4LZ8A 4N07A 2F6PA 4EQ7A 5AA2D 4MFIA 4FECA 1IXGA 4P11A 3IB1A 2ZYOA 5BWJA 4OFOA 4ZEFA 5JK4A 4H0WA 2OZZA 4DXCA 1H3DA 5L8DA 1P1QA 5FHNA 1GGGA 3OOAA 5ICQA 1ANFA 1WODA 1RYXA 3TFLA 1B3LA 1LAXA 3N26A 5H8FB 1MY2A 4R6YA 4ZEDA 3CFXA 3OENA 1H43A 2PX1A 3IX1A 1A7LA 4ZZAA 5ICTA 3PU5A 4UA8A 2A5SA 2XXRA 4PETA 1MY3A 3T93B 2M8CA 5L9MA 1B7ZA 3ZKLA 1B3EA 4EUOA 4XKQA 1LSTA 3MZBA 3RGYA 1CB6A 5H8NA 2DXYA 1ZMGA 3B6WA 3IJXB 2O1MA 2Z8EA 1BTJA 5B7DA 3FD3A 3D4CA 1F9BA 3O29A 2XXHA 3UA8A 1MRPA 3P7IA 4F39A 4U1OA 1MXXA 1QUJA 3QUFA 4XKRA 1QW0A 3T9HB 4UACA 1URSA 4AB6A 1SW5A 4AB5A 3MP1A 4OXVA 1N76A 4G8MA 5JTYB 1Y3QA 3V83A 1VSOA 4G68C 3U92A 1MY1A 1MPBA 4BDLA 4YMBA 4OTEA 3V5AA 3OEMA 3EPEA 1SI1A 5L9OA 5AA1A 1ZU0A 4R73A 5AE4A 1P1WA 2F78A 1US4A 3HN0A 2UYFA 4GRKA 4F2OA 3MQ9A 5HBCA 2OWSA 1T0KA 1N04A 5ITPA 3B7DA 2F5XA 2PBWA 2I4CA 1SQYA 3QK6A 4ESWA 2Q89A 3FXQA 3KJ7A 4JWXA 3TEPA 4BLAA 2XX9A 1FQBA 3K4UA 3B6QA 3G3GA 3MPKA 1MH4A 1FQCA 5ELVA 1B1HA 3UK4A 4XTCQ 2OJTA 1DSNA 5ISUA 3MBPA 3K1MA 4EF2A 2VP1A 3LSWA 1Z7ME 2ZNTA 3K6XA 4H5GA 5LOMA 3TMGA 3N94A 1I6AA 4JWYA 2Y7WA 4E0WA 2E0SA 3H06B 3N5LA 3OSRA 1ATGA 2AYSA 2ANJA 5FTIA 3TTNA 4YMAA 1XT8A 1LBBA 2RC8A 1LFHA 3JZJA 4OEUA 5FHMA 3A09A 3E3KA 3KZGA 1A99A 4QRZA 1JQFA 1ELJA 1IUDA 4YB6A 1MH3A 3T9VA 3IAZA 5IKBA 1Y1ZA 1JW1A 1PBQA 1B9JA 1IXIA 2DVCA 4O3AA 1H76A 4R6HA 4X1DA 1Q1KA 3L6GA 4WXJA 1EZOA 3FVKA 5EHMA 1PB9A 4U22A 2F97A 5DEXB 4XKNA 4GL8A 4LATA 3IK6B 3O6HA 4YU0A 4FORA 1XHYA 1MM7A 1VE4A 1MXYA 3C36A 1SD3A 1UTHA 2DSFA 1P1UA 4KYSA 4NF6A 4BDRA 3PUZE 1NH8A 1RYOA 3K0VA 4OHNA 3ZKKA 2B65A 1AL3A 4LQ5A 4HS7A 1BKAA 2Y7IA 1VFDA 4NF5B 1B0HA 2GFEA 4ELOA 4MLQA 4WEDA 1SYHA 2O51A 1S50A 3R7XA 4KYEA 3ILTB 3V8XB 4POWA 5I57B 2DE4A 4QFLA 3LR1A 2BJJX 4NE4A 4YB7A 1FW0A 3PD9A 4POXA 3THIA 2VOZA 2F7AA 1BIYA 3VLWA 3TTMA 5H8SA 4IY6A 2B3FA 2QS4A 3O9PA 2F8DA 3FV2A 4LA9A 4GFRA 3S2VA 4IB2A 2NUVA 3MUQA 1ZBMA 5TP9A 4IGRA 1QKAA 1LFIA 4I1DA 2I3VA 4H8JA 4TLLB 3GLBA 5K2YA 1FQDA 4G68B 4QHQA 5A5XB 5KCJA 3S9MC 1UTBA 1QVSA 1ZTYA 1B4ZA 2YJPA 1I6QA 1B46A 3H03A 3W9VA 3SETA 4ZDMA 1B5JA 5KZTA 3ECRA 3KOTA 3RQTA 4M1VA 3OD7A 3TDJA 4DCXA 3OELA 3ILUB 4MF3A 1HSEA 1SW4A 3IB0A 1Y3PA 4DE8A 3G3KA 4OVJA 4F3GA 2V3QA 3PUXE 1USYE 3T9UA 4U2RA 4IO2A 3PPQA 3VVEA 3JV9A 4RNSA 3H6UA 2RCBA 3T22A 1LAFE 2H9BA 2A5TB 1AOVA 1O63A 4LZ5A 4RY1A 4OETA 3QSLA 2AL4A 4H5FA 4YICA 3CIJA 4EQBA 1P1NA 4FE8A 3IOVA 2RCAA 2FA7A 4F18A 2O1LA 4NWCA 5AA2A 4GXAA 2F7BA 1OLCA 1IEJA 1PDAA 3FUZA 2FNCA 1M5DA 1POY1 2ALUA 1SBPA 2ONRA 1ZLQA 2Z8FA 4P0GA 4ELPA 1HSLA 3UGWA 2DWJA 4XKPA 1FQAA 1QUKA 1B6HA 1N3XA 3A3CA 5CMBA 1XVYA 1Y20A 3BBRA 3SERA 3FV1A 4F1YA 1M5EA 1RKMA 1DMBA 3KJTA 1TXFA 4KQPA 1PBPA 3FJ7A 2Q9TA 4LQ2A 5EHSA 4G2ZA 2NWJA 5AA4A 1LFGA 4JDFA 4AQ4A 4PFTA 2LAOA 2HAUA 4O3BA 3KN7A 3HV1A 3UORA 1N84A 4F1UA 3CSGA 4OERA 1B3HA 1MPCA 2D3IA 1PB7A 4WKMA 4U23A 5HM4B 4NF4B 2XX7A 2X7QA 1M5FA 2OWTA 1MG1A 3TCGA 1N7XA 2Q88A 4HW8A 4MLVA 5TU0A 2DVZA 3VE1B 2GHBA 4IO3A 1MY0A 2PYYA 4GVOA 3ONMA 5H8FA 5CBSA 3M3KA 2O84X 2QMWA 5EYFA 1USYH 4JSOA 4F22A 3ZSFA 4R2FA 1H45A 1TFDA 4FAJA 1MQDA 3SEYA 2REGA 4G4PA 3C32A 4TOZA 4R2BA 4PFUA 5HPQA 4HCWA 2F7CA 2QJEA 3UP9A 1B5IA 3I6VA 3H4ZA 2R71A 2Q2CA 4F3PA 4U21A 4H6DA 1A8EA 5J1DA 1QUIA 2DP8A 3PMWA 2XXTA 1LB8A 4QFOA 1BLFA 3E4RA 3EN3A 1GV8A 3MVXA 3MAMA 2HEUA 4U1ZA 4BDMA 3USDA 1LBCA 3DP4A 3RNNA 3RT8A 3GBAA 2PT1A 3FJGA 4ZEBA 5CI5A 2XXXA 3MP8A 1R6ZA 1IZ1A 3PPNA 1MXVA 1FTOA 1IXHA 2Z8DA 3RUMA 4QSEA 1S9TA 2P2AA 4GIZA 4NEDA 2QPQA 2HCAA 3TTRA 1A40A 1DTZA 2PT2A 3Q29A 4OFJA 1PB8A 5CBRA 4E0XA 2V3TA 3IORA 1B7UA 1YAEA 2G93A 5H8HA 4G8NA 2RINA 2Q8JA 5L9SA 3H7MA 1B51A 2HZKA 5I2NB 2F36A 3TKDA 1OQHA 4THIA 1IITA 4F31B 3PGFA 3HSTA 3MP6A 4ZS9A 5AA3A 5FTHA 3RY3A 4NTLA 2DS9A 4QSDA 2V93A 2OK2A 5IAIA 3RN8A 1XS5A 1S7YA 3R26A 1HSJA 5DYHA 1B4HA 3D4GA 3KOSA 1PEBA 2Q2AA 4PE5B 5I2KA 4N6PA 2ZYKA 1SYIA 1MQHA 2CZLA 3LSLA 3SEWA 3S9NC 3E9XA 3VXBA 3Q28A 3HCQA 2THIA 5DVFA 4DIGA 3O2AA 3GXAA 2DWAA 1NL5A 4JSDA 3SESA 3U8QA 1KWHA 1NMUA 1SVXB 1LCFA 3MW0A 2RKMA 3VFJA 2ZMBA 3MWBA 1OQGA 4R9FA 1JNFA 3MZ9A 1FTLA 2UXAA 4P0IA 5B70A 4H67A 4F19A 1A8FA 3PD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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