3W15C

Structure of peroxisomal targeting signal 2 (pts2) of saccharomyces cerevisiae 3-ketoacyl-coa thiolase in complex with pex7p and pex21p
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
GSMSQRLQSIKDHLVESRSKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of peroxisomal targeting signal-2 bound to its receptor complex Pex7p-Pex21p
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxisomal targeting signal 2 receptor
molecule tags Protein transport
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 135
structure length 389
sequence length 389
ec nomenclature ec 2.3.1.16: Acetyl-CoA C-acyltransferase.
pdb deposition date 2012-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3w15C00
5H8FA 3N6UA 2F6GA 3IJXB 4G4PA 4FAJA 1MQDA 3T96B 5FHNA 3TPAA 5AA4A 4OXVA 4F31B 1FCKA 2X7PA 3S9MC 1SW2A 1QJMA 3T9HB 1IQ7A 1Y1ZA 3JV9A 4DDDA 1VE4A 4FIMA 5CMKA 1NNKA 4ZEFA 4G68B 2ZYNA 3I3VA 4FJPA 1URDA 5TPAA 4JBZA 3K0VA 5F1QA 1D3KA 3H6VA 5JEIA 3RTFB 3KSXA 1LGBC 2DVZA 1M5CA 4FEBA 3MQ9A 3CI8A 4XXUA 1B9JA 3OO8A 4HTGA 4WEPA 5B70A 3U93A 3PV0E 1I6BA 1Y4TA 4BDOA 3I5OA 3N5LA 2Y84A 5JTYA 3D4GA 2OWSA 4R9GA 3VVFA 4IO6A 4RK2A 4YICA 5I2NA 2I58A 3TQLA 1B5HA 5ITPA 4H8IA 2XXIA 3FJMA 5H8HA 4NWDA 2ALUA 4WEDA 4ONYA 1MXZA 3IAZA 1IXGA 3O6GA 5I84A 3O97A 3TCGA 2H9BA 2F34A 3KSJA 1NFTA 1OQHA 4NF8A 2A5SA 2ZNTA 1TFAA 1EH3A 3HSTA 4DCYA 4ELPA 2PYYA 3O6HA 1P1QA 3SEXA 3GXAA 3FASA 4IO7A 4BDNA 2GHAA 3LUYA 3E3KA 4LZ8A 4QSCA 4R73A 2ONKE 3EHTA 1H43A 3FIRA 4IO4A 2VD2A 1II5A 3DP6A 1VFDA 3SEYA 1B58A 4ELQA 3TCHA 1QW0A 5BWJA 4IY5A 4FATA 2O7IA 4R72A 3K6UA 5L8DA 3T93B 4G8NA 4YKIA 5DEXB 1OMPA 3PD9A 5KCJB 1OLAA 3SEVA 1DTZA 1R1NA 4PETA 4BDQA 3LBSA 2O68A 3DELB 2DE3A 3IR1A 5LOMA 3U8QA 1RYOA 4OTEA 3CVGA 2F5XA 3RGYA 4YMBA 2D3IA 3O6IA 3VE1B 3CSGA 4OHNA 1J1NA 4HS7A 1JNFA 2Q89A 4IB2A 2UVGA 4O3BA 4THIA 3W15C 1NH8A 1USYE 2PVUA 3H3GA 3KN3A 1OVBA 4L17A 1EZOA 4R74A 1MXUA 5KDTA 2DWAA 2FA7A 2A5TA 4IO3A 1FQBA 3U94A 1MY0A 1LB8A 3FVNA 4U1OA 4GXSB 2GH9A 4JXIA 2V25A 3T22A 3TODA 3LSLA 3IK6B 1MDP1 1N3XA 3JZJA 3O66A 5H8SA 4EUOA 1P1NA 3K02A 1QULA 2F7AA 1GR2A 3FVKA 4JWOA 5CBRA 2RCAA 1QVSA 5IAIA 4GLIA 4R6HA 1DMBA 4ESWA 3RN8A 3G7WA 3PPQA 2PMSA 3H6TA 4DXBA 2ESNA 2YPNA 1D9YA 1SDXA 4Q30B 2XXYA 3K00A 1B40A 4H0WA 3KN7A 3K1MA 3FV2A 3OD7A 3FXUA 4XKNA 4E0WA 1H76A 4U4SA 3IB1A 2RC8A 1WDNA 4KCDA 4H8JA 3ZKKA 5DTBA 3UK4A 4JSDA 3O2AA 4NWCA 3TTRA 5L9MA 1OIBA 1LBBA 3EPEA 3UORA 2V84A 3KFMA 2XXXA 4X48A 3OSQA 4POWA 1S9TA 3OO6A 4U4XA 2NOOA 1SYHA 2YJPA 2AYSA 2ZYOA 4MH5A 3FXRA 4XTCQ 1D9VA 3OO9A 4DIGA 1N76A 1US4A 3CFZA 2XHDA 1ZIUA 3H4ZA 4ND9A 3WAEA 5L9SA 3ECRA 2X7QA 4EDPA 1SI1A 4BDLA 2HEUA 2Y7IA 4QFKA 4O3AA 3QIMA 4K3FA 3VLUA 5H8FB 1B5IA 4U22A 2UVJA 1Q1KA 4QSDA 2XXUA 5AA4B 4XKQA 2XXVA 2HXWA 1MY3A 3VLVA 4I1DA 2P0SA 4XKPA 4FORA 4YB6A 3K6WA 5FTHA 3V5AA 4X9TA 5JK4A 1MRPA 3LSWA 2ANJA 5TPAB 2ZXTA 1PEBA 1QUKA 2F7CA 1HSLA 4R6YA 3C36A 3FD3A 5I57B 4F3PA 1M5EA 1LSTA 1O63A 2Y7WA 4OERA 3PPOA 3RT8A 4ZDMA 4NF6A 2XX7A 2XD3A 1ZU0A 4F2OA 1US5A 2G93A 4EF2A 3H03A 2QMXA 1B52A 1B1XA 3B6WA 2F36A 1PB8A 3PMXA 3PUZE 4G8HA 2GHBA 2X26A 3G3FA 1B05A 3Q28A 3KJ7A 1IZ1A 4ZEIA 3C31A 4DXUA 1I6AA 3D4CA 5CBSA 2REJA 2F6PA 5I2NB 4GRKA 2V3TA 5AA2A 4DZ1A 5A5XA 1B4HA 2XXHA 3LSXA 1QUIA 5H8HB 5CM6A 2Z23A 4OWDA 2DE2A 2AL4A 1FQDA 3HCQA 1FW0A 1N84A 3TFLA 3K01A 1SBPA 1MG1A 2F35A 2B3BA 4NF8B 1MM7A 1NKXA 2B65A 2OWTA 3PUYE 1VSOA 1R6ZA 2NXOA 3PMWA 1ZMGA 1LFIA 1H44A 1AH5A 1NH7A 4WXJA 2REGA 4H1XA 3H7MA 3MVYA 1A8FA 3UA8A 4POXA 2ZNSA 1B46A 3A09A 1B7UA 3OEMA 4C1TA 1JW1A 3T9XB 1JVXA 3T66A 3SEWA 3H6UA 1LLSA 3KN8A 1QKAA 1URGA 5DT6A 1YCJA 4EXLA 2QS3A 2I4CA 4PE5B 1MQJA 1TT1A 4RPNA 2QSXA 1JW4A 1FQFA 4EF1A 1DOTA 5HBCA 1Q35A 1RKMA 4Z7EA 1O7TA 4RJZA 3C34A 4QFOA 1FTOA 4IGRA 4JWXA 1I6QA 4NEDA 4OVJA 2P2AA 4GXAA 5M2VA 2CMOA 4QFPA 1MY2A 2UXAA 2DWJA 1B3GA 4XIGQ 2IEEA 2QJEA 3B6TA 3TZAA 3FVOA 1IXCA 2O69A 3MUQA 2HCAA 4OEVA 2HAVA 4F1UA 2RKMA 3V8XB 3MPKA 1OQGA 3PGFA 4EQBA 4LP2B 1A7LA 1LFHA 5KDTB 3RUMA 4PFWA 4UACA 2RC7A 4LZ5A 4AB6A 2I0CA 1XVYA 5F7VA 4JSOA 3MPLA 1MDQA 3DM0A 5FHOA 3V83A 4EQ7A 1ZKBA 4IO5A 1MY1A 2RCBA 1BLFA 3TTKA 1T0KA 1IIWA 4LA9A 5CMBA 1EZ9A 2D5WA 2V93A 1B7HA 1MXXA 5I59A 1Y3QA 4WKMA 2O1LA 4X1DA 1B5JA 4KFQA 3T9VA 1MXYA 2HFBA 3IB2A 3MP1A 5DVIA 2OCUA 5AA3A 1MXVA 4YB5A 5K2XA 4I9DA 1B7ZA 4P0GA 1PBQA 2ZMBA 4PFUA 2OJTA 1MPBA 3SERA 2XXWA 2UYEA 1BP5A 2ZYMA 3FV1A 3C9HA 5TP9A 1AIVA 2CZLA 4KQPA 4PFTA 3RTWB 1A55A 1N3WA 4N07A 3H06B 3LC8A 1B3HA 3KBRA 1UTHA 2AIXA 2ZYKA 4PFYA 4JWYA 2RF1A 4YAHX 3VXCA 4YKJA 4GIZA 2QS4A 4DLDA 3O28A 3QYTA 4DCXA 4RPOA 2FNCA 2F7BA 3RT6B 4F22A 4OFJA 4F39A 2G29A 2H25A 2XXRA 4LZ7A 1UIUA 1HSEA 2VP1A 4KI0E 1MQGA 3L6GA 3CRBA 5ISUA 2NVUB 2DVCA 2E1SA 3MWBA 3RY3A 2DS9A 3KOSA 1LAGE 4QRZA 5I2KA 1DPPA 1DTGA 4R9FA 4PQJA 3WAFA 3TTMA 3MZBA 2V3QA 4G77A 3QK6A 2NWJA 5H8NB 4LATA 4NTLA 1M5BA 4R6KA 2PT1A 4NF5B 1FTKA 1IXHA 1MQHA 3TCFA 4ISUA 3HV1A 1P1WA 4YKKA 1LAFE 3FGSA 1OVTA 3KZGA 4ZE8A 4NF6B 2I48A 2NUVA 4ZE9A 4JDFA 3TYHA 1Y4CA 2HZLA 3K1PA 4OZ9A 2XX9A 4BLAA 1TFDA 1Y9UA 3TAJA 2I49A 3U72A 4R75A 3M3KA 3TDJA 3KG2A 2QRYA 1JQFA 1ELJA 3IB0A 1PB7A 4EQ9A 5L9OA 3I6VA 4QF9A 3MJNA 4F3GA 2H4IA 3ODBA 3FJGA 4F19A 2D21A 4H5GA 5CC2A 3R26A 1FTLA 1ZLQA 5AA2B 2BJJX 1H45A 5A5XB 1A99A 3P7IA 4N13A 3TQWA 3U92A 3EHUA 1GTKA 4I62A 2DE4A 2H98A 4X1BA 3C4MA 4Q8RA 3PPNA 2V3UA 1MH3A 2QS2A 4H5FA 1Z7NE 4KYEA 4QSEA 3B6QA 1A8EA 1OLCA 2PT2A 4G8MA 3S9LC 3PUWE 1DPEA 2O1MA 4ZZAA 3VVEA 4OYVA 1P1OA 4KPTA 1SW5A 2VHAA 1NNFA 1DSNA 4ELRA 3A3CA 3SDFA 1UTBA 5I58A 3TKDA 2LAOA 3K6VA 1MS7A 3MZ1A 1WVJA 4GOTA 1B0LA 3IOTA 3SKPA 1XHYA 4R2FA 3RQTA 3C33A 1JEUA 1VFEA 4ZECA 1BTJA 4QHQA 4AB5A 1B1HA 3L6HA 3VFJA 4KD5A 3OOAA 2HAUA 5H8QA 2QL3A 1NMUA 3OENA 4LQ5A 3IX1A 3HHFA 3ZKLA 3VV5A 4MLQA 5JTYB 2RINA 1GGGA 3DP4A 3R7XA 3HN0A 1B0HA 1Y3NA 2DQVA 5IKBA 3S9EA 5EHSA 4PP0A 1EU8A 5EHMA 4H65A 3G3IA 2XD2A 3UGWA 2DXYA 4G68C 1FTJA 4F29A 1WODA 3F11A 4JB7A 3QUFA 3IL1B 3G3GA 2WKYA 5KZTA 3OEKA 3PUXE 4ELOA 2O7UA 5CMCA 3K6XA 4DE8A 2E0SA 1MY4A 1I69A 3FUZA 2B3FA 5I59B 2DXRA 3BBRA 4TOZA 1S50A 1SYIA 3S4UA 3Q26A 3N6TA 3FJ7A 3PU5A 4GF8A 1CB6A 4U23A 3K1NA 3CR9A 5I56A 3QAXA 1ZBMA 4IY6A 2XXTA 2QS1A 1XOCA 3IORA 4BDRA 1JETA 2Q8JA 3A3UA 2OLBA 1S7YA 4KYDA 3USDA 3R6UA 4HW8A 4NE4A 2ABHA 2DP8A 3UIFA 1ZJLA 1D4NA 2RC9A 2OBGA 5I57A 1AOVA 3IO4A 3MAMA 1SQYA 1B3EA 4IGTA 1BKAA 4GQOA 5TP9B 2Z8DA 2O84X 3ZS6A 3W9VA 3C32A 4LUBA 4YB7A 4YZZA 2F78A 3DLNA 4EXKA 3UP9A 1UTHB 4RA1A 3CSBA 3C35A 4KR5A 4LVQA 3HHGA 3FXQA 1HSJA 3N94A 1EZPA 4KYSA 3O9PA 2ONSA 4GFRA 4NF4A 3G3HA 4H67A 4F3SA 5ICQA 1F9BA 5AE4A 4KCCA 4MF3A 1MPDA 4RNSA 4F2QA 3M8UA 1B4ZA 2I0BA 3Q29A 2Z8FA 5HM4B 3GLBA 2A5TB 5ITOA 1JVYA 1FQCA 1LAXA 1MXWA 3EF7A 4C1UA 1AMFA 3CG1A 3BFUA 4OENA 1PDAA 4OEUA 1MQIA 2Y7KA 3LSFB 4R2BA 4FECA 1XT8A 3E9XA 5I2KB 4ESXA 4O3CA 1NL5A 2OZZA 4OFOA 2OK2A 4BDMA 3MBPA 3E4RA 4RY1A 4F18A 2AL5A 3Q25A 1LB9A 1SI0A 4GVOA 4G68A 2YLNA 4YMAA 4ZS9A 3G3JA 3PD8A 1MM6A 1IEJA 4U1ZA 2HQ0A 4OFLA 4E0XA 1VR5A 1O64A 5TU0A 4KHZE 2UVIA 3PPRA 4M1VA 3B7DA 3MVXA 4GL0A 5AA1A 3CFXA 1IITA 5EYFA 2UVHA 3MVZA 4HCWA 3OSRA 1CE2A 1H3DA 4IO2A 4MLVA 3IOUA 2Y7PA 2I6EA 4TLMB 5FTIA 2THIA 2VD3A 2P1SA 1AL3A 4AQ4A 2I3WA 5CRYA 3ONMA 3Q27A 1R9LA 1B3FA 3W9WA 2GRVA 3GBAA 4FE8A 1P1UA 3IJOB 3TEPA 3CG3A 1A40A 2PX1A 2DYXA 4P11A 2XXPA 5CI5A 3OELA 2H5YA 3SEUA 2H99A 3IOWA 4LQ2A 1FQAA 3U1OA 3H6WA 1URSA 3EHSA 1TXFA 1UIVA 3VVDA 4QFLA 3TTLA 2O6AA 1B32A 2DOJA 2VGQA 4ZEKA 3AXFA 2R6GE 2Q88A 1POTA 4F3BA 3PUVE 3QXMA 3EN3A 3MP8A 1R9QA 2ONRA 2O51A 1N04A 2DWHA 3CFLA 3VXBA 3LR1A 1NNPA 1B51A 2ZNUA 5DVJA 1N7WA 4MFIA 5K2YA 3DP8A 3IOVA 1UTBB 1YPNA 2QPQA 5I58B 1MH4A 1B6HA 4XKRA 3FZVA 3K4UA 4FEDA 2HZKA 1LCFA 3TUSA 4OMBA 2UYFA 1Y3PA 2FYIA 5DEXA 4Q5TA 3OMBA 3N26A 5KCJA 4YU0A 2Z22A 1LBCA 3V89B 3QSLA 3E13X 5H8QB 1PC3A 3FVGA 3MZ9A 3VLWA 3OXNA 5DYHA 1JEVA 4MBPA 2PBWA 4OQOA 5B7DA 1YTVA 1N0TA 3T9UA 3MC2A 4NMYA 3S9NC 3KOTA 1BIYA 3RLFE 1USYH 2Y7RA 3S2VA 1SW1A 2M8CA 4C0RA 2DWIA 1ZTYA 1IXIA 5FHMA 2R71A 3MP6A 3PMVA 1QUJA 3GBBA 4F1YA 2VOZA 3FATA 1TWYA 3GZGA 3KJTA 4U2RA 4Q0CA 3ZSFA 4GL8A 4ZZEA 2W7YA 1ATGA 3RNNA 3TELA 3BFTA 1SVXB 3K2DA 1LFGA 5J1DA 3ILTB 2KLFA 1Y20A 3BKIB 1RYXA 4F1VA 1P99A 2XXQA 1A54A 4ECFA 3KGCA 4Z0IA 1GVCA 4DXCA 1LCTA 4GD5A 3SESA 5ICTA 5AA2D 3O29A 2GFEA 5I56B 4M4GA 4OESA 4RK9A 5H8NA 1UQWA 1IUDA 4GWOA 1MPCA 4RXLA 1FTMA 3TMGA 4TQUQ 1GV8A 1JW5A 5HPQA 4OETA 1KWHA 3HO7A 3RPWA 3SETA 4NF5A 1M5DA 4ZEBA 1FQEA 3THIA 1B2HA 1SD3A 3KEIA 1ANFA 2Q2CA 2DSFA 3QUJA 3PPPA 3M3FA 4N6PA 5BUUA 4H6DA 4YKPA 1XC1A 3MW0A 2I4BA 2Q2AA 4P0IA 3JYRA 3ILUB 4UA8A 1M5FA 1PBPA 5DVFA 3M3LA 3IO6A 2F97A 2Q9TA 1PB9A 1L5TA 2Z8EA 1POY1 1QKBA 1NNTA 1Y1MA 1XVXA 2XX8A 4NF4B 3HPIA 4ZEDA 1SW4A 5CMMA 4HCYA 2IA4A 3MVWA 3EQ1A 4U21A 3UN6A 1YAEA 4QFNA 1LAHE 1Z7ME 4TLLB 1B3LA 2QMWA 3G3KA 4LONB 3VDFA 2F8DA 5ELVA 1XS5A 2R9JA 3CIJA 2I3VA 4G2ZA 4I8CA 4RYAA 3OO7A 3TTNA 1N7XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H8FA 3N6UA 2F6GA 3IJXB 4G4PA 4FAJA 1MQDA 3T96B 5FHNA 3TPAA 5AA4A 4OXVA 4F31B 1Q9DA 1FCKA 2X7PA 3S9MC 1SW2A 1QJMA 3T9HB 1IQ7A 1Y1ZA 2FIXA 3JV9A 4DDDA 1VE4A 4FIMA 5CMKA 1NNKA 4ZEFA 4G68B 1FBHA 2ZYNA 1RDZA 3I3VA 4FJPA 1URDA 5TPAA 5IZ1A 5EQ7A 4JBZA 4PC9A 3K0VA 5F1QA 1D3KA 3H6VA 3KC0A 5JEIA 3RTFB 3KSXA 1LGBC 2DVZA 1M5CA 4FEBA 3MQ9A 4P3LA 3CI8A 3FXBA 4XXUA 1SPIA 1B9JA 3OO8A 4HTGA 4WEPA 5B70A 3U93A 3PV0E 1I6BA 1Y4TA 4BDOA 3I5OA 4NQ8A 3N5LA 3LUZA 4PBHA 2Y84A 5JTYA 3D4GA 2OWSA 4R9GA 3VVFA 4IO6A 4RK2A 4N8YA 3T1BA 1FBPA 4YICA 5I2NA 2I58A 3TQLA 1B5HA 5ITPA 4H8IA 2XXIA 3FJMA 5H8HA 5I3SA 4JVCA 4NWDA 2ALUA 4WEDA 4ONYA 1MXZA 1FTAA 3IAZA 4NGUA 4NN3A 1IXGA 3O6GA 5I84A 3O97A 3TCGA 2H9BA 2F34A 3KSJA 1NFTA 1OQHA 4NF8A 2A5SA 2B4MA 1NV2A 2ZNTA 1TFAA 1EH3A 3HSTA 4DCYA 4ELPA 2PYYA 3O6HA 1P1QA 3SEXA 3GXAA 3FASA 4IO7A 4BDNA 2GHAA 3LUYA 3E3KA 4LZ8A 4QSCA 4R73A 2ONKE 3EHTA 1H43A 2VPNA 3FIRA 4IO4A 2VD2A 4GBVA 1II5A 3DP6A 1D9QA 1VFDA 4PFRA 3SEYA 1LBYA 4I40A 1B58A 4ELQA 3TCHA 1QW0A 4PF6A 5BWJA 4IY5A 4FATA 3EKIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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