3ZSFA

Crystal structure of the l-cystine solute receptor of neisseria gonorrhoeae in the unliganded open conformation
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GSLIERINNKGTVTVGTEGTYAPFTYHDKDGKLTGYDVEVTRAVAEKLGVKVEFKETQWDSMMAGLKAGRFDVVANQVGLTSPERQATFDKSEPYSWSGAVLVAHNDSNIKSIADIKGVKTAQSLTSNYGEKAKAAGAQLVPVDGLAQSLTLIEQKRADATLNDELAVLDYLKKNPNAGVKIVWSAPADEKVGSGLIVNKGNDEAVAKFSTAINELKADGTLKKLGEQFFGKDISVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Two Solute Receptors for L-Cystine and L-Cysteine, Respectively, of the Human Pathogen Neisseria Gonorrhoeae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ABC TRANSPORTER, PERIPLASMIC BINDING PROTEIN, AMINO ACID
molecule tags Transport protein
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 76
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3zsfA02
1GV8A 3SEUA 1IZ1A 1I6AA 2H9BA 4ZEKA 4QSDA 1JVXA 1JW5A 1CE2A 3TAJA 3O28A 1NNFA 3LUYA 1LCTA 2RC9A 5A5XB 1NMUA 4RY1A 1KWHA 5H8QB 1LAFE 2B3BA 4FEDA 1B3HA 3Q25A 1B5IA 5I2NB 5H8HB 4YKIA 3VDFA 2DVCA 3E4RA 3H6UA 1ZLQA 4EDPA 3CIJA 1MY1A 3IB2A 2VGQA 1Y3NA 3U92A 5I57B 2X26A 4XIGQ 1QKBA 1IXHA 3ZKKA 1SD3A 1YAEA 1M5FA 3DP6A 3DM0A 3S9MC 5KCJA 4Q5TA 2UVIA 4R75A 2Y7KA 3GZGA 2VHAA 2AL4A 3IO6A 3ZKLA 3CVGA 5H8FA 4WXJA 2A5SA 3RQTA 1OMPA 2OZZA 2OWSA 3EN3A 1VE4A 3H06B 2DE3A 3MUQA 1B5JA 3I3VA 1B40A 3H4ZA 4RK2A 4NF6B 2I4BA 3S2VA 3AXFA 3D4CA 2ANJA 2KLFA 3B6QA 1POY1 4PFYA 1LB9A 1MXVA 1B51A 1FQBA 1QW0A 2F34A 3FVNA 2RF1A 5BUUA 2HEUA 1JQFA 1QKAA 4YB5A 3VE1B 5I56A 3RT8A 3N5LA 4DZ1A 2VD2A 3O29A 1OVTA 4IY5A 4F1YA 3O6GA 2GHAA 5IAIA 3FVOA 2X7QA 2GH9A 4G8MA 4XKQA 2XXYA 3C35A 3PPOA 2ZXTA 4H65A 1IEJA 4GL0A 2H4IA 1QVSA 1B1HA 3ECRA 5I59B 3ODBA 2I4CA 1B1XA 3K4UA 3VVDA 4BDQA 1D4NA 4FECA 3FV2A 3IL1B 4BDRA 5H8NA 3KG2A 3IK6B 4GF8A 1IIWA 5CRYA 2BJJX 1LSTA 5KDTA 1FQAA 4LZ8A 3RGYA 2DE4A 1MPDA 1LBCA 1IXIA 4R73A 3SEXA 3FGSA 2QMXA 4UACA 1SI1A 1BLFA 2CMOA 1SBPA 4LZ7A 1MS7A 3UIFA 2FYIA 1DOTA 2ONRA 1MM6A 1RYXA 2DXYA 2XD2A 3MJNA 4F18A 3IOVA 3A09A 3PUZE 5DEXB 3I5OA 1JEVA 2F78A 4NE4A 1RYOA 2R9JA 1B58A 4ZEFA 1DMBA 4OZ9A 3SERA 2XXRA 1ZKBA 4Q8RA 1LFGA 1IXGA 3UK4A 2QSXA 1LFIA 1LAGE 5LOMA 3EHSA 4ZE8A 3FUZA 3Q27A 4YKKA 3TMGA 3T9UA 3GLBA 2ESNA 4IO5A 3HHFA 5TPAA 3CFZA 3FXRA 3MQ9A 3FZVA 4OVJA 4OYVA 1NH7A 2B65A 3ZS6A 1A8FA 1OQGA 4F3SA 3GXAA 1H43A 2AYSA 1SW4A 2RC7A 2I3VA 4GOTA 3RTFB 1A54A 3RPWA 1QUIA 5ELVA 5AA4A 2ALUA 4O3CA 1Y3PA 2A5TA 4MBPA 4NEDA 2DXRA 3I6VA 4OETA 4ZE9A 3K6XA 2Y7RA 1GGGA 4OERA 4EQ9A 1USYH 4G68C 3QK6A 4MFIA 2F6GA 2OWTA 1PDAA 1AMFA 3LR1A 3SEVA 3VVEA 3UA8A 1IQ7A 3K6WA 4MLQA 1PB9A 4AB6A 3FJ7A 5IKBA 3MVZA 1R9LA 1XC1A 3PD9A 2YPNA 1B7UA 5JK4A 5AA1A 1YPNA 4QSEA 3JZJA 4NF5B 3SDFA 1MXXA 1B3GA 3CFLA 4EQBA 1I69A 1ATGA 1B2HA 1BP5A 3VLUA 1O64A 4RXLA 2F5XA 4TOZA 3LSLA 4YICA 4GLIA 3DLNA 2I49A 1GR2A 3VFJA 1MY2A 5I58A 1MH3A 2WKYA 4G68A 1FTJA 1AOVA 1QJMA 3MZBA 2UXAA 1II5A 3T9HB 2ZYNA 4Z7EA 2XHDA 2NXOA 2ZMBA 5CBRA 3S9NC 1MPCA 3O2AA 4GIZA 4U22A 3UN6A 4K3FA 1B0LA 2GHBA 4XXUA 1D9YA 1SI0A 3TCFA 1D3KA 2GFEA 1M5DA 4IO4A 1R6ZA 4KPTA 3TQWA 3V83A 2I6EA 3K00A 3MPKA 2ZNTA 2DP8A 4F39A 4NWDA 2I0CA 1B4HA 3QXMA 1EU8A 4R72A 5ICTA 2X7PA 2P2AA 4EF1A 1Y3QA 3B6WA 4GWOA 3K1PA 3B7DA 3C31A 4NTLA 2Q2CA 5FTHA 3TTKA 5HPQA 4LQ2A 4QFNA 3IB1A 1PBPA 2HAUA 2F6PA 3FXUA 3L6GA 3SEYA 3R26A 5J1DA 1DTZA 3QUFA 5FHNA 3E9XA 4YB6A 2QS2A 4F3BA 1J1NA 3RNNA 1NL5A 2D5WA 2DWJA 2Z23A 1N84A 4QF9A 2O1LA 2XXTA 1MQHA 2XX8A 3OSQA 2AL5A 1H44A 1O63A 3RY3A 3FATA 4C1UA 2E0SA 3OOAA 1ZMGA 1LBBA 1SW2A 2DYXA 3FJGA 3IJXB 4ELRA 3U72A 3TPAA 1P1WA 3LBSA 3LC8A 3MP8A 4H8IA 5KCJB 5ITOA 3U94A 1AH5A 3N6UA 2IEEA 2Y7WA 3CSGA 3SKPA 5CMMA 2F7AA 4R2BA 4BLAA 1MXUA 5H8FB 1M5BA 4ZS9A 4M4GA 4F3PA 3FVGA 3V89B 3RTWB 3TEPA 1ANFA 4KYEA 4I62A 4YMAA 1MXWA 3C34A 3C4MA 2G93A 4LA9A 3MVYA 4LONB 2V3UA 3RN8A 2DQVA 3KSJA 3THIA 1CB6A 4DXCA 1MQDA 4H0WA 4NWCA 2QRYA 4ELPA 1S9TA 3OELA 4KHZE 3FASA 2H25A 2NWJA 4DE8A 1H3DA 3EQ1A 1D9VA 3TZAA 1NNTA 4RPNA 2PT2A 3OXNA 1B46A 1UIUA 1MPBA 2V84A 5FHMA 4ISUA 4ZEIA 1FTMA 4FATA 4DXBA 3CG3A 2DOJA 5DTBA 5BWJA 5I56B 3O6IA 4ZZAA 3HV1A 4F2QA 3H6TA 2DWIA 5I2KA 2XXVA 5F1QA 1LB8A 3S9LC 3R6UA 4KI0E 4EF2A 3FXQA 4F1VA 4LP2B 4ZEDA 1B05A 4BDMA 1JEUA 1SW5A 2RKMA 3TYHA 5CBSA 2FNCA 3OO8A 4U1OA 2F36A 3QSLA 4TLMB 4KD5A 5H8NB 2UVGA 4H8JA 1URSA 4MF3A 4L17A 1N0TA 4Q0CA 3K2DA 5KDTB 1POTA 4I8CA 3MW0A 4OFLA 3T96B 2HFBA 3MVXA 4U21A 3PMWA 4TLLB 3TELA 1WVJA 5DT6A 2YLNA 1S7YA 2HCAA 4QFKA 1XVXA 5CMBA 4RJZA 1H45A 3QUJA 3TTNA 1ZTYA 4PQJA 3PGFA 1B52A 4G4PA 3BBRA 1Q1KA 1A55A 3CFXA 4R6KA 2Y7PA 4R74A 3FD3A 3G3HA 2H98A 1MM7A 1MXZA 2I3WA 3KN3A 4N13A 2P1SA 5CMKA 1BKAA 3OMBA 2D3IA 3TCHA 3D4GA 3KOTA 5AA3A 4XTCQ 3QYTA 3SETA 4GFRA 1MQGA 2CZLA 5TPAB 1R9QA 2I58A 1N04A 3M3FA 3VV5A 1DSNA 3P7IA 1P1NA 2XX7A 1MY4A 4Z0IA 1RKMA 3PPPA 4YB7A 2Z8EA 2O1MA 3OO6A 3F11A 3T66A 3OSRA 3HSTA 1OIBA 5H8SA 5AA4B 1MDP1 4ZZEA 2A5TB 1ZIUA 2HZLA 3A3UA 1FQDA 3UP9A 2DE2A 4EXLA 4DCXA 2UYFA 5JEIA 3USDA 3T9XB 3K1NA 2ZYOA 3HCQA 4JSDA 4JWXA 1JW4A 4OEUA 1Y4TA 1DPEA 1NFTA 4WEPA 3BFTA 4H5FA 3TKDA 4X1DA 3E3KA 5HBCA 2DWHA 2Z8DA 1AL3A 3ONMA 3VVFA 1MRPA 1N7WA 4RA1A 4BDLA 4OENA 4OXVA 1N3XA 4F1UA 1B7ZA 1B3FA 4R9FA 2ABHA 3PUWE 4R2FA 4JWYA 4JB7A 2Y7IA 3PV0E 3MZ1A 3TUSA 1EH3A 2VD3A 4M1VA 1QUKA 1L5TA 1OVBA 2ZNUA 1OLCA 2REJA 2DSFA 2PVUA 1A8EA 3KJ7A 5I58B 4YAHX 2Q89A 3M8UA 4G68B 5AA2A 2YJPA 1PC3A 4KYSA 4PFUA 2UVHA 2ZYMA 2G29A 3KN7A 3EPEA 3CSBA 1GVCA 4IB2A 4PP0A 3TQLA 1B9JA 1JNFA 3PU5A 2PYYA 3H6VA 3G3KA 1B5HA 4N6PA 3C36A 2OLBA 4QFLA 4NF4A 4F31B 3WAFA 2OK2A 5DYHA 3W15C 3CI8A 5B70A 4POXA 1SW1A 1I6BA 4IGRA 1PB7A 2PMSA 3KFMA 4YU0A 3KZGA 2RC8A 4OHNA 1Z7NE 1P1UA 3IOUA 1LCFA 4R9GA 3G3FA 4UA8A 1M5EA 3MBPA 3T9VA 1UTBA 1URDA 5TU0A 4HCYA 2F7BA 3VXBA 2XXIA 4HCWA 3R7XA 5I84A 2I0BA 1M5CA 3TFLA 2VOZA 4PFTA 1VR5A 2R6GE 2OBGA 3C33A 1QUJA 4C0RA 2W7YA 4JSOA 1IUDA 4H6DA 4ZEBA 3OO7A 2PBWA 4LQ5A 1URGA 2UVJA 5ITPA 4N07A 2ONSA 3DELB 4R6HA 3MP6A 3HN0A 3GBBA 4IGTA 5EYFA 1EZPA 4TQUQ 3H7MA 3G3IA 1AIVA 4XKRA 2V3QA 4X1BA 4F22A 1IXCA 2I48A 4QSCA 1P1QA 1P1OA 3IR1A 3PD8A 4IY6A 3SESA 1US4A 2REGA 3MP1A 5FTIA 3N26A 4NF8A 5CC2A 3FVKA 2OCUA 4LVQA 4GXAA 1EZOA 4YKPA 3UGWA 1Y1ZA 3KSXA 3Q29A 1XS5A 1LAHE 1WDNA 4KCDA 1XOCA 2QPQA 5DVFA 1I6QA 4X48A 4H5GA 1B7HA 1ZU0A 1LAXA 2O84X 3W9VA 1UTHA 1XVYA 2Q8JA 1B4ZA 1XT8A 3EHUA 1FTLA 2XXUA 4O3BA 1VFEA 4WEDA 4FAJA 1ZBMA 3KGCA 4ESXA 2HAVA 2V25A 4WKMA 1B32A 1FTOA 4U1ZA 3T93B 1VSOA 5I2KB 2NUVA 5JTYA 4FEBA 1NKXA 4F2OA 3OEKA 1A40A 3PUVE 2ONKE 3A3CA 1Y1MA 2FA7A 2M8CA 1HSEA 3CG1A 2PT1A 4KYDA 5CMCA 1BIYA 4GL8A 4I1DA 1B6HA 1Z7ME 3IOWA 5AE4A 5KZTA 2F97A 2RCBA 3O6HA 4OFJA 2HZKA 1B3LA 1JETA 2O69A 3PUXE 4Q30B 3MPLA 5K2YA 2RINA 1OQHA 4PETA 3FIRA 5TP9A 4DXUA 4JXIA 3TCGA 2E1SA 3S4UA 1N76A 4G8NA 1EZ9A 2VP1A 2DVZA 3HHGA 1MQJA 4BDNA 1LLSA 3M3KA 5CI5A 4JBZA 4DIGA 2V3TA 1DPPA 2HQ0A 3PPQA 5A5XA 4H1XA 4DLDA 4THIA 4KQPA 5H8QA 3V8XB 4P0GA 5L9MA 1R1NA 4YZZA 3QAXA 3B6TA 5I2NA 1US5A 4KR5A 1IITA 5H8HA 3PPRA 4E0WA 1TXFA 3H6WA 1GTKA 1NH8A 4MH5A 2H99A 3Q28A 3O9PA 3RT6B 5I57A 2NOOA 3W9WA 4ZDMA 1YTVA 5EHMA 1A99A 3G3JA 1FQEA 5DVIA 4P0IA 4HTGA 4U4SA 1MXYA 2NVUB 4IO6A 3M3LA 1QULA 3H3GA 1O7TA 2Q2AA 3K1MA 3G3GA 3G7WA 3KN8A 4U23A 3MAMA 3LSFB 3MZ9A 2Z22A 4RNSA 2PX1A 4U2RA 4JWOA 1BTJA 1UQWA 4IO3A 3JYRA 5HM4B 3EF7A 4NF6A 3OENA 2O6AA 4X9TA 3PMVA 2THIA 4HW8A 4HS7A 1FQFA 3K02A 3ILTB 3N94A 4FIMA 3U8QA 4H67A 5AA2D 1SDXA 4F29A 3OD7A 1JW1A 3OO9A 2B3FA 3MC2A 2RCAA 4ZECA 4O3AA 2XXPA 3N6TA 1A7LA 1FQCA 2D21A 3TDJA 2O7IA 1SQYA 1TFDA 2F7CA 3C9HA 4IO2A 4QFPA 1MY0A 4U4XA 4G77A 5L9OA 4RPOA 4OEVA 3PPNA 4I9DA 2XX9A 3K01A 4ESWA 2LAOA 5ISUA 2OJTA 5I59A 1MQIA 1N3WA 4QHQA 5M2VA 4XKPA 1HSLA 4IO7A 4OTEA 3O66A 4QRZA 3BFUA 2F8DA 4ELQA 4BDOA 1PB8A 2Z8FA 2QS3A 3O97A 5AA2B 2Q9TA 3OEMA 4FORA 1TT1A 1S50A 4MLVA 2XXWA 4PE5B 4R6YA 3SEWA 3UORA 5L8DA 4OFOA 3TTRA 3U1OA 1F9BA 3VLWA 3KOSA 1B0HA 1SYIA 2QJEA 4LUBA 4NF4B 1N7XA 1TWYA 2R71A 5FHOA 5DEXA 2QS1A 3IX1A 4AQ4A 1SYHA 1H76A 2O68A 1FCKA 3CR9A 1JVYA 4XKNA 1MDQA 1LFHA 2QS4A 1Y4CA 2XXHA 4RK9A 3JV9A 3FV1A 3IO4A 1YCJA 2Q88A 4FE8A 4C1TA 3L6HA 4F3GA 3MVWA 4GQOA 1UTBB 3EHTA 1MH4A 3H03A 2H5YA 2ZNSA 3T22A 4YKJA 3ZSFA 3IJOB 3GBAA 2QMWA 3HO7A 4KFQA 1Y20A 4DDDA 4EQ7A 3IAZA 2ZYKA 1ELJA 4GVOA 3IB0A 4QFOA 3DP8A 1PBQA 4RYAA 1FTKA 3LSWA 4LZ5A 4OESA 4KCCA 3FJMA 3Q26A 4ECFA 1XHYA 4EUOA 2DS9A 4YMBA 4F19A 3KEIA 5F7VA 2GRVA 1T0KA 1MG1A 4ONYA 1FW0A 3LSXA 4GRKA 3K6UA 4LATA 1TFAA 3E13X 3BKIB 1NNKA 1OLAA 3VLVA 1Y9UA 4GD5A 4OMBA 2XXQA 3TTMA 1P99A 4NF8B 1Q35A 4P11A 1HSJA 3HPIA 3WAEA 5DVJA 3K6VA 4GXSB 1LGBC 4OQOA 3C32A 1ZJLA 4ELOA 4NF5A 3DP4A 2IA4A 3KJTA 3IORA 4ND9A 5L9SA 4JDFA 4DCYA 3S9EA 2Y84A 3ILUB 2DWAA 3KBRA 5EHSA 2O7UA 2P0SA 3K0VA 2HXWA 2O51A 4G2ZA 1UTHB 3CRBA 4POWA 3V5AA 3PUYE 5CM6A 1DTGA 4PFWA 5JTYB 2XXXA 3QIMA 3PMXA 2F35A 1PEBA 2QL3A 1SVXB 3MWBA 1MY3A 2UYEA 1WODA 1UIVA 4NMYA 4OWDA 2XD3A 3VXCA 2V93A 1VFDA 4E0XA 4EXKA 3U93A 5K2XA 5B7DA 4FJPA 3IOTA 3RUMA 3TODA 3RLFE 4AB5A 2AIXA 1USYE 3TTLA 4G8HA 5ICQA 1B3EA 5TP9B 1NNPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GV8A 3SEUA 1IZ1A 1I6AA 2H9BA 4NX1A 4OANA 1G0IA 4ZEKA 4QSDA 1JVXA 1JW5A 1FBEA 1CE2A 3TAJA 3O28A 1NNFA 3LUYA 1LCTA 2RC9A 2V4CA 5A5XB 1NMUA 2Y5KA 4RY1A 1KWHA 5H8QB 1YZ0A 1LAFE 2B3BA 2CEYA 4FEDA 1B3HA 3Q25A 1NV2A 1FPLA 1B5IA 5I2NB 5H8HB 1NUZA 4YKIA 3VDFA 2DVCA 3E4RA 5EQ8A 4HE0A 3H6UA 1ZLQA 4QBAA 4N17A 4EDPA 3CIJA 1MY1A 3IB2A 2PFYA 2VGQA 1Y3NA 3U92A 5I57B 2X26A 4XIGQ 1QKBA 2KR0A 1IXHA 3ZKKA 1SD3A 1YAEA 1M5FA 3DP6A 3DM0A 3S9MC 5KCJA 4Q5TA 4GWUA 2UVIA 4HE2A 4R75A 2Y7KA 3GZGA 2VHAA 2AL4A 3IO6A 3ZKLA 3CVGA 1FTAA 5H8FA 4WXJA 2A5SA 3RQTA 1OMPA 2OZZA 2OWSA 3EN3A 4MIJA 1VE4A 3H06B 2DE3A 3MUQA 1B5JA 3I3VA 1NUYA 1B40A 3H4ZA 4RK2A 4NF6B 2I4BA 1FRPA 3S2VA 3AXFA 3D4CA 2ANJA 2KLFA 3B6QA 5EQ7A 2B4MA 1POY1 4PFYA 1LB9A 1MXVA 1B51A 1FQBA 1QW0A 2F34A 3FVNA 2RF1A 5BUUA 2HEUA 2P3VA 1JQFA 1QKAA 4YB5A 3VE1B 5I56A 5ET5A 3RT8A 3N5LA 4DZ1A 2VD2A 3O29A 1OVTA 4IY5A 4F1YA 3O6GA 2GHAA 1FPIA 3NOHA 5IAIA 3FVOA 2X7QA 2GH9A 4G8MA 4XKQA 2XXYA 3C35A 3PPOA 1IMEA 2ZXTA 4H65A 2F3BA 1IEJA 4GL0A 2H4IA 4KXPA 1QVSA 1B1HA 3ECRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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