3AXFA

Perrhenate binding to a11c/r153c moda mutant
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAACSLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVCGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Binding of ReO(4) (-) with an engineered MoO (4) (2-)-binding protein: towards a new approach in radiopharmaceutical applications.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
total genus 73
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3axfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3axfA02
1SQYA 3SEVA 4LVQA 1MY4A 1SW5A 4GFRA 4LQ2A 2G29A 2QJEA 1UTHA 5ITPA 2DWHA 1MY3A 4G77A 2OLBA 3QAXA 5ISUA 3FGSA 1JW1A 3PD8A 3TMGA 1D9VA 1Y3NA 4P11A 3O97A 5I56B 3KN7A 3Q25A 2OWTA 1USYE 2I58A 5J1DA 3O9PA 4EDPA 3EN3A 3B6QA 3T9VA 1ANFA 1R1NA 1LAGE 1UQWA 2XXTA 2Y7RA 4OYVA 1A8FA 3ZS6A 3KG2A 3CSBA 4R2FA 1B4HA 1S7YA 3S4UA 2NOOA 4KCCA 2DS9A 4OVJA 3KFMA 1B46A 3PUZE 2NUVA 1B7HA 5DEXA 5HBCA 1LFIA 2ESNA 4NWDA 1N7WA 1SVXB 2G93A 4H5GA 3KOSA 3PMXA 3K1MA 1PB7A 2ALUA 4E0XA 3IOTA 3OO6A 3HSTA 3KJ7A 3A3UA 4DXUA 1JNFA 5H8HB 2O51A 2DWJA 3O28A 2GHBA 3B6WA 4OXVA 1LCFA 4R9FA 3UK4A 4GL0A 1SI1A 1ZKBA 1FQBA 2GHAA 3M3LA 3FVOA 1RKMA 4NF5B 3C4MA 3CFZA 4NF6B 4MBPA 1VSOA 2I0CA 1QKBA 1A8EA 3OD7A 4OMBA 5I56A 1N3XA 3ZSFA 4KHZE 3MZ1A 2F7CA 1QKAA 4H1XA 4F2OA 1UTBB 2QS3A 1RYXA 1Z7NE 4BDQA 1B3LA 1P1NA 1XHYA 3H6TA 3IOWA 3N26A 1O7TA 2UVJA 5K2XA 2ANJA 5FHMA 3TPAA 4GWOA 4YB5A 1BKAA 3K1PA 3QYTA 2Z8DA 5F1QA 2AIXA 2PT1A 4OWDA 4YKJA 2ABHA 2XX9A 3OENA 4WXJA 4NMYA 4PFYA 1OMPA 4MH5A 2PT2A 5TPAB 2PYYA 1AH5A 2Y7IA 2ZYOA 3FJ7A 4FEBA 3TDJA 1FQFA 4QF9A 4YU0A 4ZEFA 1N04A 2DVZA 3HCQA 4OETA 1VE4A 1PB8A 2I4CA 3IAZA 2DOJA 3G3GA 1H3DA 4C1TA 1MPDA 3P7IA 3M3FA 5H8HA 3QIMA 4I1DA 4R74A 1JETA 2XD3A 2KLFA 1JVXA 3CFXA 4U4XA 4NWCA 3TKDA 1M5CA 4EXKA 4NF5A 4ECFA 1MY1A 3R26A 1Q1KA 5H8SA 3IX1A 3I3VA 4R72A 1DMBA 2Y7KA 3THIA 1B7UA 3MVZA 1MH3A 1SDXA 1AMFA 1SD3A 2R71A 4XKRA 2RINA 2ONRA 4KPTA 2FA7A 4LA9A 1USYH 3UA8A 3CG1A 4F1UA 1A40A 2WKYA 3VXCA 3FJMA 4P0IA 1MY2A 4R73A 4OESA 1EZOA 4TLMB 3SERA 4YB7A 4F3GA 3L6GA 2ONKE 2R9JA 1N0TA 3SEYA 1KWHA 4BDOA 2XD2A 1FQAA 4G68B 2YLNA 4DCXA 5JTYA 4OERA 3KSXA 3SEXA 1JEUA 3HHFA 2IEEA 2QPQA 4THIA 3MUQA 3T9UA 1URSA 3VLWA 3U94A 3PPPA 4KYDA 3SDFA 3RGYA 2DSFA 4YKKA 3Q29A 1URDA 5EHSA 3W9VA 1D4NA 1OIBA 4DZ1A 4FORA 4IO7A 1QULA 4BDRA 5DVJA 4ZZAA 1FTLA 2F78A 3CR9A 1NH8A 1MM6A 1CE2A 1TWYA 3ILTB 3Q26A 4M1VA 5H8FB 4GVOA 4GXSB 3RTFB 4LP2B 1MS7A 4PE5B 2DXRA 1R9LA 1SI0A 2XXQA 5M2VA 3FVKA 5EHMA 4M4GA 2OBGA 2ZYMA 5EYFA 4YMAA 4BDNA 3DP4A 3QUFA 2B65A 4JDFA 1JW4A 4FJPA 3N94A 2X7QA 5I2KA 2VD3A 4R75A 1D9YA 2P0SA 4ZEIA 2I3VA 1FTJA 1B9JA 5JK4A 4P0GA 2X26A 5I58B 1Y20A 2RC7A 3RLFE 5KZTA 3DELB 1Y4TA 1NH7A 2O6AA 1XVYA 4G68A 4IGTA 1WODA 3HV1A 2PX1A 2RC9A 4R6HA 3O66A 3K6VA 3CI8A 1P1WA 4G68C 5I59B 4XKNA 1TT1A 3W9WA 2ZYKA 3BBRA 4KI0E 4I62A 2V3UA 3PUVE 4FECA 1I6BA 3ODBA 3PMVA 4ZE8A 3OEKA 1POY1 5ELVA 4ZZEA 5AA4B 3EHSA 1MH4A 1DTGA 3U72A 1WVJA 4HCWA 5I84A 3V5AA 4WEDA 1MPBA 3GXAA 4QFPA 3T9XB 1N76A 3HPIA 5CBSA 5KDTA 4N07A 5F7VA 3M3KA 2E0SA 3K02A 1XOCA 3FVNA 2DVCA 2OK2A 1AL3A 2V84A 1EZPA 4POWA 3IB2A 4X1BA 5FHOA 4U22A 1MRPA 3VE1B 1F9BA 2NWJA 4FATA 3LBSA 2O7UA 5DT6A 2QL3A 4Z0IA 1M5BA 3FJGA 1MG1A 3OMBA 5AA3A 1I6QA 3MW0A 3MWBA 4KR5A 1P1QA 4IO4A 3T96B 1QUKA 3MVYA 4BLAA 3S9LC 2QMXA 4ELPA 2H99A 3QSLA 2CZLA 3K6WA 3S9MC 2REGA 5DTBA 3G7WA 5DYHA 2F6PA 3K6UA 3IOVA 4I8CA 5I59A 4QSDA 1H44A 4DXCA 5TU0A 2FNCA 4N13A 1IQ7A 5I2NB 3O6GA 4JWYA 4ELQA 3PUYE 3G3JA 2IA4A 2R6GE 1B3EA 4OFJA 4TOZA 4PFTA 1M5FA 3H4ZA 3UORA 3L6HA 1FTKA 3H3GA 3H6VA 5A5XB 5AA2B 3A09A 1NNFA 3N6UA 3N5LA 3S9NC 4GRKA 4IY5A 5K2YA 4HTGA 4QFLA 3ZKKA 2UXAA 5HM4B 1LB9A 3OSQA 3VV5A 5CMCA 4F2QA 3TTKA 3OSRA 1P1OA 1B05A 4XXUA 4OFLA 4K3FA 1SYIA 4U23A 1IUDA 1B5IA 1QUIA 1S50A 3BFUA 3TYHA 3GLBA 3IOUA 3PPQA 3KN8A 4ESWA 3G3FA 1MXVA 5CBRA 4MFIA 1O64A 5CI5A 2Q8JA 1JVYA 3FIRA 1Y3QA 1PBQA 2I4BA 2ZNTA 5H8NB 4MLVA 3U8QA 3TELA 5CMKA 2F97A 4DXBA 3MP8A 2DWAA 3BKIB 3UN6A 4JBZA 3RN8A 4IO2A 4DIGA 2Q88A 5ICTA 1TXFA 3SKPA 2DE4A 2F6GA 3SETA 5I2NA 2DYXA 4UACA 4LONB 1HSLA 2Z23A 4MF3A 5TP9B 2Y84A 3N6TA 4GQOA 3RUMA 2Q89A 3GZGA 4FAJA 3RT8A 3G3KA 3K01A 4YICA 1SYHA 1O63A 4FIMA 3C31A 4NF4B 3PPRA 1SW2A 3MVXA 2PMSA 4TLLB 4OENA 1AOVA 4OTEA 3JYRA 3MAMA 3PUXE 3K00A 3ILUB 3OXNA 4C0RA 1H45A 2QS4A 3QUJA 2A5TB 3OO7A 1B2HA 1XT8A 2QS2A 1HSEA 1DSNA 3C9HA 2RC8A 4N6PA 4NE4A 4Q0CA 4LQ5A 3IO6A 4YAHX 2AL5A 3FZVA 1OVTA 3KEIA 3TTMA 2VOZA 1IXIA 1XVXA 3FASA 3E13X 4U1OA 2ZXTA 3PMWA 1LGBC 3HHGA 1B51A 4LZ5A 3KZGA 3KSJA 2XXRA 3MVWA 1LFGA 3OO8A 4NTLA 4NF6A 5DVFA 4F19A 1I69A 1WDNA 4FE8A 3K6XA 5I57B 3LSLA 2QRYA 3O6HA 3D4CA 1ZIUA 2F7BA 4JB7A 2H25A 1DPEA 3CSGA 1FQDA 3FXQA 4PFWA 1N3WA 1UTBA 1Y1ZA 1DOTA 3VLUA 4EQ7A 1LAXA 3T9HB 3U1OA 3GBAA 2UVHA 1IITA 1Y4CA 4L17A 2HZLA 5L9OA 3LSFB 3AXFA 2XXYA 3FXUA 1FCKA 2I6EA 1IZ1A 4R9GA 5CM6A 2I48A 5TPAA 2UYEA 1B32A 2O69A 4KD5A 1OVBA 1SW1A 2M8CA 2DE3A 3Q28A 3UIFA 4XKPA 3OO9A 4X48A 4QHQA 3FUZA 2P2AA 2O68A 4F22A 2RCAA 5KCJB 1Y9UA 4OHNA 5CRYA 5B70A 2XHDA 1PC3A 4O3AA 4DE8A 1CB6A 1B7ZA 2W7YA 2Y7WA 3W15C 3PD9A 4AQ4A 4RXLA 2QMWA 1D3KA 1OQHA 3B6TA 3MJNA 1FQCA 3TZAA 2F36A 4O3BA 5DVIA 4U21A 1MY0A 5AA1A 3O2AA 2H4IA 3C33A 2B3FA 1B4ZA 2V3TA 1MXXA 4JSDA 2D21A 2O84X 3FXRA 3VVDA 1MPCA 5L9MA 1GVCA 4U2RA 1H76A 4JXIA 4R6KA 3KBRA 3PGFA 3TFLA 3PPNA 2P1SA 4YB6A 2DWIA 3CIJA 2E1SA 4X9TA 2Z8EA 4NF8B 2HFBA 4G8HA 3R6UA 4YMBA 1OLAA 3OELA 3R7XA 3VFJA 4RA1A 4F1YA 1A99A 4Q8RA 3K0VA 1ATGA 3FV2A 1ZMGA 1UTHB 1BIYA 1A7LA 1XS5A 2HAVA 4AB6A 1Z7ME 3IL1B 3SESA 3H06B 1P99A 1MQDA 1POTA 1VFEA 2B3BA 2Z22A 4XIGQ 3JZJA 1DPPA 3TODA 1GR2A 3C36A 1B0LA 3D4GA 1VR5A 3EHUA 1US4A 3CFLA 5KCJA 2YJPA 4X1DA 1J1NA 1MXWA 2YPNA 3KOTA 4G8MA 1VFDA 5JEIA 4XKQA 4F39A 3E4RA 3MQ9A 3I6VA 4PQJA 4EQ9A 3MZBA 3TTLA 3IORA 4R2BA 5H8FA 4BDMA 2VHAA 3A3CA 4LZ7A 3V83A 3H6UA 3ONMA 4G4PA 4RK2A 1NFTA 5CMMA 4F31B 1B5JA 5IKBA 4F18A 1N84A 4IO3A 2OCUA 5BUUA 1A54A 2GRVA 4H6DA 3RT6B 1NMUA 4R6YA 4I9DA 4GXAA 2DXYA 3DM0A 3O29A 1US5A 4NEDA 1S9TA 1MXUA 1GV8A 2OZZA 1Q35A 4GOTA 1B52A 4KQPA 5I58A 1B3GA 4ISUA 1B3HA 4AB5A 1GGGA 3MC2A 5ITOA 4YZZA 2H9BA 3F11A 3K1NA 4EQBA 4GLIA 5FTIA 4F29A 1LSTA 3PUWE 4ELRA 3K4UA 2BJJX 5BWJA 3TTNA 1B58A 1UIVA 1LBCA 2XXHA 4HW8A 3KN3A 4DDDA 1HSJA 1FTMA 3KGCA 1TFAA 5CC2A 3CG3A 5AA4A 1BLFA 4ZS9A 2REJA 3G3HA 3ECRA 1B3FA 1Y3PA 2QSXA 3VVFA 4ZEBA 1GTKA 3T93B 3IR1A 3V89B 1II5A 1ZLQA 1QVSA 3FATA 2F8DA 3FV1A 4OFOA 2O7IA 3EPEA 4WEPA 1B1HA 3K2DA 3RQTA 3TCGA 4G2ZA 4ESXA 4HCYA 3DLNA 4C1UA 4IGRA 4FEDA 2XXPA 2DP8A 2VP1A 2AL4A 4GL8A 2H98A 2Z8FA 1YCJA 4KYEA 4MLQA 2Y7PA 2I3WA 1OQGA 2Q9TA 3MBPA 4Z7EA 4IY6A 1QJMA 3RPWA 1H43A 2DQVA 2ZYNA 2XXUA 4KYSA 2Q2CA 4QSEA 2LAOA 1NKXA 3S9EA 4H8IA 3IO4A 4H5FA 4IO5A 3U93A 2HZKA 2ZNUA 4G8NA 1I6AA 1IXCA 4O3CA 1EZ9A 3SEWA 3IB0A 1P1UA 1ZBMA 2H5YA 2OWSA 4E0WA 4ZEKA 1ZTYA 1YTVA 3EQ1A 3EHTA 2HQ0A 5A5XA 3WAFA 3IK6B 3PU5A 1MM7A 5AA2A 3OOAA 4RJZA 2GH9A 4DCYA 3IJOB 4TQUQ 3E9XA 2THIA 4OEVA 4GF8A 2Q2AA 2ZMBA 5L9SA 3T22A 2NXOA 2UVGA 4F3SA 2F5XA 1T0KA 4H0WA 1M5EA 4JWXA 5JTYB 4PP0A 1MQIA 1MDQA 3T66A 4OEUA 1MXYA 2VD2A 2O1MA 1LLSA 1YPNA 4PFUA 1QW0A 4F3PA 3E3KA 1PDAA 2I49A 1UIUA 3MZ9A 1R6ZA 2V93A 4RPNA 2RKMA 1IEJA 4KCDA 4QRZA 1LBBA 1SW4A 5H8QB 5IAIA 4Q5TA 3TAJA 5AE4A 3C35A 5H8NA 1URGA 3GBBA 1OLCA 5HPQA 5LOMA 4JWOA 3O6IA 3PPOA 3MPKA 3QXMA 2ONSA 3EF7A 1BP5A 2A5SA 5CMBA 1PBPA 1IXGA 3RY3A 1XC1A 2UVIA 3CRBA 3QK6A 2VGQA 3G3IA 1BTJA 1LB8A 3HO7A 4ZDMA 3TQWA 1ZJLA 1MQGA 4EF2A 4RY1A 5TP9A 5AA2D 4U1ZA 2QS1A 5I2KB 3MPLA 1JEVA 4F1VA 4WKMA 4IB2A 3VDFA 1MQHA 4NF4A 1JW5A 2F35A 2FYIA 1NNPA 3IJXB 1MDP1 4POXA 1ZU0A 3HN0A 5ICQA 4ELOA 3UP9A 1QUJA 2A5TA 1LAFE 5B7DA 2D3IA 3TEPA 2DE2A 4LZ8A 4ND9A 4KFQA 3LR1A 4RPOA 4RYAA 3TUSA 4F3BA 2XXVA 3VXBA 2F34A 4DLDA 3TCFA 1B5HA 2OJTA 4ZECA 1NNTA 1MQJA 5H8QA 3U92A 1MXZA 1L5TA 2HXWA 3FD3A 3ZKLA 2I0BA 4H65A 4LUBA 2PBWA 4YKIA 3USDA 2NVUB 1Y1MA 3IB1A 3FVGA 4UA8A 5I57A 2V3QA 1ELJA 2GFEA 1N7XA 2ZNSA 5KDTB 1M5DA 4U4SA 3V8XB 1R9QA 1IXHA 1DTZA 3OEMA 3Q27A 3VVEA 4XTCQ 2XXIA 3MP1A 3JV9A 1LFHA 3PV0E 1JQFA 2X7PA 3LSWA 3I5OA 4IO6A 3SEUA 4YKPA 3M8UA 3S2VA 3BFTA 4QSCA 4ZE9A 2RF1A 1EH3A 4RNSA 4H67A 3TTRA 3DP8A 4GIZA 4OQOA 5L8DA 1NNKA 4BDLA 1FW0A 2HAUA 4JSOA 4OZ9A 3DP6A 2XX8A 2PVUA 1EU8A 2O1LA 2V25A 4EUOA 1LAHE 2HCAA 4Q30B 2CMOA 3WAEA 1B40A 3TCHA 3CVGA 2XXWA 1TFDA 4GD5A 2RCBA 5FHNA 4EF1A 4LATA 4ONYA 1FTOA 4EXLA 4QFKA 2XX7A 3LC8A 1PB9A 5FTHA 2AYSA 4QFOA 1FQEA 2D5WA 3MP6A 4QFNA 2XXXA 1B0HA 4HS7A 1RYOA 3LSXA 1AIVA 2UYFA 4PETA 4H8JA 1B1XA 3H6WA 3LUYA 1NL5A 4ZEDA 3RNNA 3KJTA 3RTWB 3C34A 5DEXB 1SBPA 3H7MA 2F7AA 1YAEA 3H03A 3TQLA 3UGWA 4RK9A 3B7DA 1B6HA 1PEBA 2HEUA 1A55A 3C32A 3VLVA 1LCTA 1IIWA 4NF8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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