3BFTA

Structure of the ligand-binding core of glur2 in complex with the agonist (s)-tdpa at 2.25 a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structures of the ligand-binding core of iGluR2 in complex with the agonists (R)- and (S)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propionic acid explain their unusual equipotency.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-11-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bftA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bftA02
3OENA 2VD3A 3A3UA 1FCKA 4NMYA 1IIWA 1D9YA 3PMVA 4LATA 1I6BA 2XXYA 4DCYA 1R9QA 4HW8A 5EHMA 5TU0A 2X26A 4U21A 4Z7EA 2ZYNA 4N13A 3PUXE 4NF4A 5KCJA 3RTFB 5L9SA 1Y20A 4G2ZA 1ZU0A 2VHAA 3EPEA 3ZSFA 2NWJA 1IITA 5EYFA 5H8FA 4YKIA 1VR5A 4ELOA 3K1MA 4EDPA 4R9FA 3MZ1A 2NXOA 3O6HA 3TDJA 1MPBA 2F78A 2I4BA 4NEDA 3UK4A 3UP9A 4THIA 3PD8A 3C9HA 1IXGA 4ZECA 5I56B 5FHMA 3RNNA 2DQVA 3TTMA 1ZJLA 3FASA 4JBZA 3K02A 2YPNA 3IL1B 1B0LA 2QL3A 2NOOA 4H5GA 3Q28A 1MH3A 4Z0IA 3HPIA 4F29A 1MDQA 3FJ7A 1URDA 1MQGA 3DELB 3M3LA 2W7YA 3EHSA 4QSCA 4NWDA 1XHYA 2XX8A 1AMFA 2G29A 1B5IA 3UA8A 1FQFA 2I48A 4YICA 1GR2A 1O64A 2HCAA 1B6HA 1QKAA 3RUMA 3H7MA 1R6ZA 5H8HB 4FORA 3I5OA 4DXUA 1ZMGA 1B58A 2AYSA 1P1OA 2VP1A 4F1YA 1D4NA 2XX9A 5IAIA 5KCJB 1DPEA 4PFUA 1N04A 4UA8A 3K1PA 2HZKA 2RINA 1LCTA 3BBRA 5B70A 5H8FB 4LZ5A 1MXVA 2V3QA 4OQOA 4XXUA 1OVBA 4LONB 4AQ4A 3CSGA 2QS3A 3N94A 1Y1MA 2Q2CA 3G3FA 1ANFA 1SDXA 2P2AA 3S4UA 4ELPA 5DYHA 2KLFA 1ZTYA 2XXWA 3ECRA 1DOTA 4NF6A 2DYXA 4R75A 1UTHB 1RYXA 2RKMA 1SD3A 4ONYA 4U22A 3W9VA 4WXJA 4X9TA 3FJGA 4H8IA 3KJ7A 4NF5A 3G7WA 2QS1A 3MVWA 2D3IA 3KOSA 1AH5A 2F6GA 3PPRA 3UGWA 1S7YA 4IY5A 4OEVA 2YJPA 5ITOA 1TWYA 1CE2A 1LBBA 3EHUA 2R6GE 3H6WA 4K3FA 4OWDA 3H03A 3I3VA 4FE8A 3E9XA 4BLAA 2Y7WA 3PUZE 4C1UA 3S9MC 4QRZA 4RPNA 1ZKBA 4H0WA 2D21A 3KFMA 2ZYOA 1NH8A 3GBBA 5K2YA 2I58A 3R7XA 4RK9A 2Z23A 3MC2A 3W9WA 1S50A 1QVSA 4ELQA 4U1OA 5JTYA 3UORA 1B9JA 2HXWA 1LAFE 3FVOA 5BUUA 2PMSA 1LGBC 2F35A 4G68A 1A8FA 3RN8A 3VVDA 1ZLQA 2I49A 4PP0A 4GF8A 5DT6A 2UVIA 1S9TA 1N84A 2OJTA 3FD3A 4X1BA 3VE1B 1AIVA 2E0SA 5JEIA 3SESA 1P99A 1ZIUA 2H99A 4NF6B 4QFKA 1I69A 3OO7A 4RJZA 3FJMA 1LLSA 3FUZA 3IAZA 4OERA 2Z8EA 3KSJA 2ZYKA 4OFOA 3B6QA 4BDMA 4JSOA 3Q27A 4NF5B 4GWOA 3LUYA 3H6UA 3OXNA 1B32A 3KG2A 4P0GA 3RT8A 2Q89A 4ZEBA 2XXUA 3MBPA 3T22A 3GBAA 5I58B 3MZ9A 3B6WA 1JEUA 2VD2A 3N5LA 4F3SA 3MZBA 3T9HB 3K6VA 3FXRA 4LQ5A 4ZS9A 1DMBA 2XXXA 2DE4A 4F3BA 3FXQA 2FNCA 1B1XA 1NL5A 4ZDMA 4HCWA 4IO4A 3E4RA 3VV5A 3HHGA 2GHBA 4U2RA 1WVJA 4TLMB 4YB7A 3MP1A 3SDFA 1MXZA 2RF1A 1GGGA 3ONMA 3TQLA 1DTGA 3TCFA 3QIMA 3IOWA 3G3HA 2OCUA 5JTYB 3KEIA 4NTLA 1B3FA 1QUJA 3EQ1A 1IZ1A 2DVCA 3SEYA 4U4SA 4R6YA 3MVXA 1FQBA 3PUWE 2DWAA 3EN3A 4G68B 1SI1A 1M5DA 3OEMA 3AXFA 3TTNA 3H4ZA 3HV1A 3K1NA 3TTRA 1ATGA 3FATA 1B7ZA 2Z22A 1FQCA 2UVHA 1AL3A 1YCJA 4R2BA 1MQJA 2UVJA 4R9GA 1JQFA 5A5XB 3SEWA 2XXPA 4F19A 1A40A 1MM6A 4F1UA 3C31A 2I3WA 3KJTA 4Q5TA 1TXFA 1A55A 1JW1A 4DLDA 1Y4CA 2O51A 4YAHX 4QFNA 3VVFA 1MXXA 1LB9A 3SEUA 2VOZA 1JVYA 1H3DA 4MLVA 3OSQA 1XOCA 4FEDA 4N07A 4TLLB 1JEVA 4EXKA 3FVGA 3RY3A 1B1HA 1B52A 2Y7KA 2DE2A 4R2FA 3QUFA 2QS4A 1FQDA 4KCCA 3M3KA 2GH9A 1LFHA 4RPOA 3FZVA 3KN7A 1P1NA 4IY6A 4O3AA 3D4CA 1QUKA 4YZZA 4O3CA 4DZ1A 2I0CA 3O6GA 3LSFB 5ISUA 4OXVA 4JSDA 3IOVA 2ABHA 4GIZA 3K6WA 4KYSA 2V3UA 2O68A 3VLVA 2XXHA 5I2NA 5CMCA 3C36A 2DXRA 4WKMA 2A5TA 3MP8A 4NE4A 2O1LA 3N6TA 3VFJA 1MY1A 1VSOA 4I9DA 1QW0A 5FTIA 1B51A 3W15C 4M4GA 1LAHE 1GV8A 3KN8A 4XKQA 3S2VA 1B2HA 5I84A 2REGA 4EQBA 3MQ9A 2UVGA 1N76A 1B5JA 3IB2A 3MPLA 4UACA 4KI0E 2H5YA 4F22A 1B4HA 3ZS6A 1OIBA 3C34A 1MY3A 3EHTA 1A54A 3JZJA 3DP8A 4IO5A 1MY0A 1HSLA 3G3KA 2ONRA 5TPAA 3SEXA 4GVOA 3SKPA 2DWJA 5FHOA 3R26A 3VDFA 3VVEA 3CG3A 3IJXB 2M8CA 1LB8A 3RPWA 1TT1A 2Y7RA 4OFJA 2PVUA 1P1QA 2O1MA 2F8DA 3M3FA 3H3GA 3ILTB 4JDFA 2O6AA 5J1DA 3OO9A 3QAXA 4AB6A 2LAOA 4IGTA 2F5XA 1XVYA 5FTHA 1SYHA 3N26A 2Y84A 4FAJA 3RQTA 2V25A 4ZEIA 1O63A 2ZNUA 4NF4B 2RC7A 1OVTA 1RKMA 3I6VA 1UTBA 1POTA 1US5A 3IB0A 4R6HA 3KBRA 5I2NB 1LAXA 1N0TA 2QMXA 3MJNA 2BJJX 3VLWA 1N7XA 2H9BA 3K0VA 3OMBA 2ANJA 4OENA 4DXCA 4ZEKA 3OOAA 3IOUA 3PGFA 4ZE9A 4F39A 5I59A 3H6VA 3O9PA 4F3GA 1RYOA 3ODBA 1LCFA 4MH5A 4BDLA 3VLUA 2XXTA 4DE8A 2XXRA 5FHNA 2XXIA 5ICTA 4YKJA 4F1VA 4JWXA 3IJOB 3MAMA 1J1NA 3FIRA 4F31B 5K2XA 2QS2A 1SBPA 4F18A 2B65A 3CIJA 2Q8JA 3TQWA 5TPAB 1PB7A 4ND9A 1B40A 4I62A 4GD5A 2QMWA 4GXAA 1JETA 3T9VA 1GTKA 4G77A 3LR1A 4Q30B 1MXYA 3BFUA 3S9NC 3V8XB 3H6TA 3TAJA 5I57A 1B3EA 4R73A 5CI5A 4KQPA 4R74A 1DPPA 2Z8FA 4QFOA 5DVFA 3K01A 3DP4A 4LZ8A 2X7QA 4IGRA 1OQGA 3C32A 1A8EA 3FGSA 2A5SA 2THIA 4N6PA 4GQOA 4R72A 3OSRA 1BTJA 3CSBA 2ONSA 4KYEA 1SW1A 5KDTA 3PV0E 2D5WA 4PQJA 1Z7NE 2GHAA 1Q35A 5CMBA 3TTLA 2R71A 3KGCA 2XXQA 2HAUA 2G93A 3HSTA 5I59B 3V83A 2F7AA 4GXSB 3FVKA 1T0KA 1QULA 1USYE 2O7UA 1FTLA 1JW5A 4XKNA 1FTMA 1FTKA 3CR9A 4QSDA 1B5HA 1UIVA 1USYH 4RY1A 1B7UA 4HCYA 4ZZAA 4H1XA 1MS7A 3PD9A 1B3HA 3M8UA 3MWBA 3VXCA 4EXLA 3G3GA 3R6UA 3UIFA 3MVZA 1P1WA 4ZZEA 3USDA 4G68C 4G8NA 3LSLA 3P7IA 2PT1A 3GZGA 4PETA 5CBRA 2ZXTA 5H8NA 4YMAA 3Q26A 1PB8A 2REJA 3IK6B 1R1NA 3LSXA 4X48A 5DVJA 4QFPA 4OTEA 2F6PA 4KCDA 3CI8A 2DWIA 3ILUB 2H25A 5I57B 3TTKA 1NFTA 3C4MA 4G4PA 3TFLA 4EQ7A 3C33A 2QSXA 1A99A 3U93A 5JK4A 1LAGE 1IXIA 1P1UA 1NMUA 3DM0A 2DE3A 4FIMA 2F97A 3LSWA 3TKDA 2OZZA 1FQEA 1R9LA 1OLCA 2OWTA 3BKIB 3PPOA 1US4A 1TFAA 5HM4B 2V93A 4YKKA 2UXAA 2AIXA 2ZNSA 4POXA 1L5TA 3TPAA 2OLBA 3TUSA 1MM7A 1OLAA 1XT8A 5H8QA 2HZLA 4LUBA 2CMOA 1II5A 4BDNA 4XTCQ 1H45A 1PEBA 2Z8DA 3GXAA 4E0WA 3K6XA 2O69A 1I6QA 4GOTA 3T96B 4TQUQ 1QUIA 3E13X 3O29A 4KYDA 3IO6A 4ZE8A 4R6KA 4GL8A 4Q0CA 5F1QA 5CMKA 4XKPA 3T9XB 1NKXA 2F7BA 1YAEA 1QJMA 1MQHA 1KWHA 2I4CA 4JB7A 5H8NB 4MF3A 4OVJA 3CG1A 4POWA 4F2QA 3S9EA 3IO4A 5L9MA 1MQIA 3QK6A 1N7WA 4OMBA 3TEPA 2V3TA 4G8HA 1JVXA 3BFTA 4LP2B 5AA3A 2XD3A 4FECA 1EU8A 1Y1ZA 2GFEA 3PMXA 3A09A 4MBPA 2DP8A 2RCBA 4H5FA 1F9BA 1MXWA 4QF9A 5H8HA 1O7TA 4P11A 1H76A 2DSFA 1Y9UA 1H44A 1M5BA 4RYAA 2XXVA 1I6AA 2DWHA 5H8QB 3QYTA 3PUVE 3HCQA 4KR5A 3QSLA 1MPDA 3O28A 1H43A 1NNPA 1B3GA 3TCGA 3TMGA 4OFLA 4G8MA 3CFZA 1WDNA 3MVYA 1MXUA 1PBPA 2IA4A 1SW2A 4IO7A 2PYYA 1MH4A 3KN3A 4GFRA 3GLBA 3TODA 2AL4A 2F34A 4GRKA 4DCXA 5AE4A 3V5AA 4YB6A 3O66A 4LQ2A 4O3BA 1BKAA 1DTZA 2FA7A 4IB2A 1MRPA 3RLFE 1UTHA 1M5EA 1IXCA 3IOTA 3PU5A 5I2KA 1OMPA 5EHSA 1YTVA 2ESNA 1FTOA 1FTJA 1FW0A 4ZEFA 1OQHA 1QKBA 1MDP1 3MP6A 4GLIA 5DVIA 2YLNA 3SERA 3IB1A 4ESWA 1JW4A 3RGYA 3TZAA 4YB5A 2ONKE 1PC3A 4PE5B 4Q8RA 3THIA 4BDQA 4BDRA 3G3IA 3B7DA 3K4UA 3KSXA 4MFIA 5DTBA 3U92A 1IEJA 1AOVA 4JXIA 4I1DA 1WODA 4XKRA 4IO2A 1XVXA 2FYIA 3PPQA 2A5TB 4H65A 3D4GA 2Q9TA 2O7IA 3E3KA 4ISUA 4H6DA 4DIGA 4OEUA 4TOZA 1NH7A 5AA2A 3T66A 4IO6A 1NNKA 3CFXA 3HO7A 5CBSA 4U1ZA 1PB9A 2Y7IA 5ELVA 5TP9A 3WAFA 2PBWA 3QXMA 4FJPA 1DSNA 4RA1A 2RC8A 1BLFA 5AA1A 2QJEA 2CZLA 2I6EA 3L6GA 4NWCA 3U72A 5L8DA 4QHQA 2HEUA 5F7VA 3DP6A 4U4XA 1MPCA 3UN6A 5BWJA 3O6IA 1B46A 4H8JA 5I2KB 3K2DA 4OESA 4RK2A 3JYRA 5AA4A 3A3CA 1N3WA 3SETA 4P0IA 5ITPA 4OZ9A 1D3KA 5M2VA 1B4ZA 4BDOA 3H06B 2DXYA 3PPNA 2XHDA 1EH3A 5I58A 2IEEA 1Q1KA 1MY4A 1B7HA 4X1DA 4NF8A 4DXBA 3JV9A 1VFDA 3U94A 3IORA 5HPQA 2XD2A 1BIYA 1NNFA 3EF7A 3K00A 3S9LC 4C1TA 1LFGA 3MW0A 2Y7PA 1UTBB 5AA2D 1EZ9A 1Y3QA 5DEXA 5KZTA 3OD7A 4AB5A 5LOMA 3FXUA 4JWOA 1UIUA 2Q2AA 4OETA 3Q25A 1ZBMA 2NUVA 1SW5A 3TCHA 4PFTA 2AL5A 5AA2B 1PBQA 4ELRA 3F11A 4RXLA 1XS5A 3V89B 3T9UA 1ELJA 5TP9B 3RTWB 1UQWA 4KD5A 4WEPA 1TFDA 1A7LA 4HTGA 3B6TA 5CMMA 1LBCA 1FQAA 2QRYA 4OYVA 4YMBA 2HFBA 4H67A 1SYIA 2DS9A 3U1OA 2B3BA 2NVUB 2E1SA 1Y4TA 1EZPA 2H98A 3ZKLA 4QSEA 2ALUA 3MUQA 1SW4A 2ZMBA 4KHZE 5H8SA 1IXHA 5A5XA 5AA4B 1SQYA 1Z7ME 4QFLA 1HSJA 1IQ7A 4GL0A 3KOTA 4F2OA 2O84X 4YKPA 2DOJA 5L9OA 4WEDA 4HS7A 2DVZA 2PX1A 4DDDA 3TELA 2GRVA 1MQDA 1B0HA 1Y3NA 3CFLA 4NF8B 2WKYA 2UYFA 3KZGA 5HBCA 4KFQA 3T93B 2V84A 4IO3A 3FV1A 3Q29A 4EF2A 3HHFA 3IX1A 3OO6A 3SEVA 3VXBA 3TYHA 2OWSA 3L6HA 4L17A 5KDTB 1JNFA 2F36A 5DEXB 5B7DA 1D9VA 3PPPA 3O97A 1Y3PA 3DLNA 3HN0A 4OHNA 1URGA 4EUOA 1VFEA 3C35A 2X7PA 4U23A 4PFYA 1SVXB 2RCAA 3MPKA 1LFIA 3CRBA 2H4IA 3WAEA 2RC9A 3QUJA 4C0RA 3RT6B 3U8QA 1B05A 1HSEA 1VE4A 2OK2A 3LC8A 3FV2A 2OBGA 2VGQA 4XIGQ 5CC2A 2Q88A 1CB6A 1PDAA 2B3FA 1MG1A 4ZEDA 1XC1A 1N3XA 4PFWA 1M5CA 1LSTA 2R9JA 4EF1A 3OO8A 2ZYMA 4ECFA 4YU0A 3ZKKA 1URSA 5CRYA 3LBSA 4LA9A 2PT2A 4LVQA 2HAVA 4M1VA 3G3JA 5I56A 3O2AA 1POY1 2HQ0A 4LZ7A 1NNTA 2I3VA 4E0XA 3PMWA 4FEBA 1BP5A 2UYEA 4F3PA 4KPTA 2P0SA 1GVCA 2I0BA 3N6UA 3K6UA 3PUYE 3IR1A 4ESXA 5ICQA 5CM6A 1EZOA 2ZNTA 4MLQA 2F7CA 3OEKA 4JWYA 3OELA 4RNSA 4I8CA 3CVGA 5IKBA 1YPNA 1MY2A 1IUDA 1SI0A 2QPQA 2P1SA 1B3LA 1M5FA 2XX7A 4EQ9A 4FATA 3FVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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