3BKIB

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fqx at 1.87 angstroms
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title 6-Azido-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione (ANQX) forms an irreversible bond to the active site of the GluR2 AMPA receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence C, D, P
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3bkiB02
3DLNA 3O66A 3Q29A 2GHAA 4TLMB 3G3IA 3FUZA 4P0GA 4QSCA 3TDJA 3MWBA 4K3FA 1FW0A 1Y20A 1CB6A 5B70A 5H8FB 4JWXA 1XHYA 2F97A 5ICTA 1HSEA 1JVXA 2QRYA 5KDTB 4FIMA 1B5HA 1B0HA 3IORA 4G8NA 3S2VA 2O7UA 4F3BA 1LB9A 2F8DA 5I57A 3OENA 3USDA 2UVHA 3VXBA 4QFKA 2HZLA 4G4PA 4H6DA 5M2VA 1SD3A 3T22A 3O6HA 4RNSA 1A7LA 3MP1A 2XX7A 3KSXA 3QAXA 3SESA 4F1VA 1JW4A 3TTMA 3HHGA 4GFRA 2Z8EA 4XTCQ 3V83A 3TTKA 1SW2A 4OENA 3C36A 2GHBA 1IXIA 3H6WA 4BDRA 2B65A 2F78A 4TOZA 5FHOA 4U1OA 3UORA 3E13X 3K0VA 2DXYA 3DP4A 1NL5A 1LBBA 3V5AA 3Q25A 4MBPA 1MM7A 3KSJA 4IY6A 3VVEA 4EF2A 4H5FA 4L17A 4RY1A 3ZKKA 2F35A 3IB1A 5K2YA 4XXUA 1YCJA 3GXAA 4O3CA 4OXVA 1OQHA 4NF5A 4IY5A 4GQOA 1Y3NA 3IL1B 3K2DA 1B3FA 1DOTA 3S4UA 5BWJA 2XHDA 1MXWA 3PD9A 3ODBA 1IZ1A 2Y7KA 3C34A 3HCQA 3IOTA 4OFOA 1A8EA 3BBRA 3VFJA 4OYVA 2QJEA 4ZE8A 1S9TA 1FTJA 1QUKA 1D4NA 2XXIA 1HSJA 1SW4A 2ZYKA 3N6UA 2Z8FA 2HXWA 4FEDA 2PMSA 3TTNA 1MQHA 3GBBA 4HTGA 3TUSA 3EPEA 2I48A 3CSGA 4F3PA 3R7XA 5I59B 4QHQA 1D9VA 1B0LA 2NWJA 2Q89A 1IEJA 4ZEIA 3L6HA 1PB9A 3T93B 2LAOA 3S9EA 1SQYA 3KN8A 3KGCA 2DYXA 4OEUA 3QUFA 4R73A 2QMWA 1ZLQA 4GXAA 1Z7ME 1LAFE 3SEYA 4POXA 4X1DA 2XD3A 4PP0A 5TU0A 4G68B 1B1XA 1NNKA 1QVSA 1PDAA 3FXUA 3TYHA 2RC7A 2AL5A 3PPNA 1DMBA 3EHTA 2I3WA 3PV0E 1UTBA 2AL4A 4YU0A 3MVWA 4R6KA 3K1PA 1MXXA 4FECA 1D3KA 2V84A 4DXUA 3MBPA 5CRYA 4NF8B 2UVJA 4KD5A 4KI0E 4R2BA 1OLAA 2FYIA 4R74A 3W15C 1MPDA 4RPNA 4LP2B 3CG3A 1QJMA 3IO4A 3RTFB 1Q35A 1JEUA 3FGSA 3Q27A 2I4CA 2DP8A 1UTHB 1NNFA 3L6GA 4MLVA 3IOVA 4H5GA 4ECFA 4NEDA 1DPEA 5CM6A 2AYSA 3F11A 5DEXA 5L8DA 1QKBA 2CZLA 2QS1A 3SETA 3CRBA 4G8MA 3C32A 3SDFA 5I2NA 3M3KA 3THIA 1GGGA 3UA8A 1LAHE 2O7IA 3VE1B 3VLWA 2ONKE 1POTA 2XXPA 2DE4A 4ZZEA 3SEWA 4ELPA 3DM0A 3OOAA 3HHFA 3T9UA 4YICA 3FVOA 4KQPA 3V89B 2YPNA 1VFDA 3RQTA 3PUZE 3JYRA 2REGA 2XXRA 1HSLA 1MXVA 5H8QA 2RCAA 3E4RA 1M5BA 4PE5B 2XXTA 4U1ZA 4YZZA 3SKPA 3KFMA 1FTKA 3FVGA 4GL0A 3CSBA 1IIWA 1ELJA 3DP8A 2O69A 2XXVA 3T9XB 4NMYA 5CI5A 1TT1A 1ZBMA 2O84X 3B7DA 3MZ1A 3G3JA 2W7YA 4THIA 3FATA 4F31B 4OESA 1P1NA 5HPQA 4GD5A 4RYAA 3PD8A 3RT8A 4NWCA 5ICQA 4PFUA 4E0WA 2D3IA 5JTYA 2DWJA 5I57B 1B7UA 3TFLA 1GVCA 4BDOA 5TPAA 3RY3A 4AQ4A 4HCWA 3K1NA 1BLFA 3RUMA 4F3SA 2R6GE 3KEIA 2VD2A 4DXBA 3EHUA 3MP8A 3CI8A 4N13A 3IAZA 3C31A 3O9PA 1MY2A 3TEPA 3OEMA 4R9FA 1KWHA 2DXRA 1NNTA 4PFTA 4X9TA 2RC9A 2DQVA 2GFEA 3JV9A 1SYIA 1LGBC 4GLIA 3TMGA 2BJJX 1MY1A 1BIYA 1NNPA 2I0CA 1B3LA 4QFPA 5F7VA 3O28A 1JVYA 2PT1A 1B32A 5ISUA 2XXXA 4FE8A 1Y1MA 1DTGA 3B6QA 1RKMA 3ZKLA 3FV2A 4PFYA 2ZXTA 2UXAA 3I3VA 2OWTA 3OELA 4LATA 1B7HA 4GF8A 4HCYA 2O1MA 2ZYNA 4F19A 1YAEA 4DCXA 3MAMA 3CFXA 2A5SA 4RXLA 3LC8A 3W9VA 1R1NA 2OWSA 3OSQA 3M3LA 3FIRA 2G29A 3N26A 3O6IA 2QL3A 3ILUB 5AA1A 4NF5B 5EHMA 1O7TA 3G3HA 4F1UA 2OBGA 4YKKA 4EXLA 2Z22A 1QW0A 2X26A 1A54A 5ELVA 4JXIA 4F2QA 4ESWA 3QUJA 3N6TA 4H0WA 4JWYA 4ZECA 1SYHA 4G2ZA 1II5A 1AL3A 2QS4A 1ZIUA 1QKAA 3LUYA 4Z0IA 5LOMA 2HQ0A 1IXGA 5ITOA 4LZ8A 2HEUA 4F29A 2P0SA 4KYSA 4H67A 5KCJA 2F7CA 2F6PA 1MM6A 5EHSA 3MW0A 1POY1 1B1HA 2VHAA 3PMXA 1XVYA 4FORA 3PPOA 2ABHA 1QUIA 4LQ5A 3JZJA 4GRKA 1XVXA 3SEXA 1JQFA 1IUDA 2VD3A 2HCAA 4DCYA 3TCGA 2FA7A 1GTKA 3H7MA 4OVJA 3UIFA 4MF3A 3M8UA 2DVZA 3VXCA 5H8NA 1PBQA 3KOSA 2OK2A 4PETA 5B7DA 1MPBA 3GLBA 3FVKA 4F1YA 5FHMA 3LBSA 1AH5A 1UTBB 4U2RA 2O68A 3MVYA 5CBRA 3TPAA 4U23A 5L9SA 3HPIA 3IO6A 3MZ9A 4DLDA 4ELRA 4AB5A 3FJMA 2D21A 3FASA 3FJ7A 2DS9A 3SEVA 3VDFA 4RJZA 2P2AA 1LB8A 4I9DA 4IO4A 3ONMA 1VSOA 1Z7NE 4NE4A 4I62A 2NVUB 4NWDA 5AA3A 5IAIA 4F2OA 4OERA 3TZAA 2VOZA 3PUYE 1JETA 4R6HA 3LSXA 1PEBA 1P99A 5I2KA 1B40A 2PVUA 3FV1A 1TWYA 3PUVE 4P0IA 2XXHA 2IEEA 1Y3QA 1MXYA 1M5EA 4NF6A 1B52A 1OMPA 5DEXB 3MVXA 1ZJLA 2V3TA 5I2NB 2THIA 4UA8A 5CMKA 1B05A 2F7BA 3H06B 5FTHA 3VV5A 1Y1ZA 4KYDA 2V3QA 2DVCA 1B9JA 1N0TA 1US4A 1XC1A 1R9LA 3AXFA 4MH5A 1WDNA 1Y9UA 3T66A 5H8QB 3K1MA 3CG1A 1SW1A 4Q30B 4YKPA 3MZBA 3CFZA 1DPPA 1MDP1 1I6AA 3KJTA 3MJNA 1ATGA 3B6TA 3S9LC 3H4ZA 5A5XA 1SDXA 3B6WA 3HSTA 4IO6A 2Y7RA 1AOVA 3K02A 4LVQA 3T9HB 2VP1A 4KCDA 2DE2A 5AA4B 4ZEBA 3WAEA 1A99A 3BFTA 3O6GA 3U92A 2QS3A 5JTYB 5TPAB 1Q1KA 3FZVA 4BLAA 5DTBA 3U93A 1EZPA 4KPTA 3MP6A 5L9MA 5IKBA 1P1QA 2Q9TA 3MC2A 1I69A 1LAXA 2I3VA 4IB2A 4OFJA 3PMWA 4IO7A 1N7XA 3H6UA 1H43A 4R75A 1SVXB 4R2FA 1MQGA 4LZ5A 3PPPA 1OIBA 3O2AA 3EF7A 3ILTB 5CMBA 1R6ZA 3OD7A 4QSEA 1MQIA 3MPKA 2HAVA 2F7AA 1Y4CA 4RA1A 1N3WA 1B58A 1US5A 3UN6A 3TELA 2E0SA 2F34A 2PX1A 2HFBA 4IO2A 1MPCA 2OCUA 2UYFA 1LLSA 2UYEA 4YKIA 2XXQA 3RPWA 4YMAA 2Q2AA 4XKPA 3I6VA 2GH9A 2H5YA 3W9WA 1XT8A 5F1QA 4G77A 1MY3A 5H8SA 2Z23A 3O29A 4LONB 4GL8A 4H8IA 1MY4A 2DSFA 2RINA 4Q5TA 4R9GA 2YLNA 2I49A 3KBRA 3LR1A 1A55A 3HV1A 1LSTA 5KZTA 5AA4A 4ZEKA 1FTMA 2XD2A 1LFIA 1M5CA 5KCJB 2PYYA 4DXCA 4RK9A 1B4ZA 1B5IA 3A09A 4KYEA 4FEBA 1IITA 1FTOA 1FTLA 4N07A 3PU5A 4KHZE 1ANFA 1TFDA 2KLFA 2V93A 1QUJA 4F3GA 4YKJA 4P11A 4ZEFA 3H6VA 1TXFA 2G93A 2ESNA 2RCBA 2GRVA 1B4HA 1N7WA 2D5WA 2M8CA 4U21A 5I58A 3C4MA 1N76A 3IOUA 1PBPA 2Y84A 2E1SA 5H8NB 1EU8A 2P1SA 3A3UA 4GXSB 1H3DA 5FTIA 4EQ9A 4ELQA 1B6HA 2IA4A 1R9QA 1P1WA 3HO7A 1SBPA 3PPQA 4I8CA 3K6UA 1AIVA 4IO5A 3TQWA 3BFUA 1PB8A 3FJGA 2XXUA 2ONRA 3VVDA 1PB7A 4PQJA 5EYFA 1MH3A 3U1OA 3LSWA 3DP6A 1B3GA 3I5OA 1JW5A 5I2KB 3OO9A 4DDDA 3C35A 1BP5A 3TKDA 2O51A 3VLVA 3Q28A 1EH3A 5H8HA 2A5TA 4NF6B 1Y4TA 4RK2A 5DVIA 1FCKA 3TTRA 4OQOA 4IGTA 1USYH 1B5JA 4EDPA 3R26A 4DE8A 1XOCA 4MLQA 4ONYA 1H44A 4H1XA 3K6WA 2H9BA 4BDQA 1N04A 3S9NC 1JNFA 4F22A 2I58A 4BDNA 2HAUA 1S50A 2ZNUA 3T96B 4G8HA 1TFAA 4LA9A 4OEVA 4NF4A 1O63A 4EQ7A 4C1UA 3G3KA 3QYTA 4ELOA 3U94A 5A5XB 2FNCA 1LAGE 2ONSA 2O6AA 3RNNA 4RPOA 4EF1A 2DWIA 4OWDA 1MH4A 4EQBA 2F36A 4KCCA 4M1VA 4HW8A 1JEVA 4M4GA 1H45A 4ISUA 5L9OA 1RYOA 4PFWA 1B2HA 4WEDA 1WODA 2H4IA 3EHSA 3S9MC 4YB7A 3V8XB 1MXZA 2ANJA 3ZSFA 5AA2A 1VE4A 3OSRA 2XXYA 5BUUA 3TODA 2RC8A 4YB6A 3CVGA 3WAFA 2X7PA 2ZNTA 4TLLB 3K4UA 3T9VA 3VVFA 4WEPA 1GR2A 2REJA 1L5TA 1NFTA 2X7QA 2I6EA 1M5DA 1FQEA 1LCFA 1MDQA 1XS5A 3C33A 4XKNA 3ECRA 5I56B 3P7IA 3SERA 1P1UA 2ZNSA 1OVBA 3E9XA 3CIJA 1UIUA 1SI0A 1QULA 2V3UA 3D4CA 4ZZAA 2UVIA 3N5LA 1DSNA 5I84A 3OO7A 4EUOA 3UGWA 4JDFA 3OMBA 5AA2D 4O3AA 5CBSA 5DVFA 2YJPA 1T0KA 4Q8RA 5HBCA 4YAHX 1ZMGA 2R71A 2Y7WA 1RYXA 3TAJA 2I4BA 3E3KA 5TP9A 4ESXA 4U4XA 3K01A 2H98A 3FXRA 3TCFA 3QXMA 3ZS6A 3SEUA 3KN3A 3H03A 4OMBA 1P1OA 5HM4B 5DVJA 1I6BA 2OLBA 3K6VA 1FQBA 3RT6B 2OZZA 3DELB 4LUBA 3MQ9A 3TQLA 1OVTA 2I0BA 1MRPA 5H8FA 3O97A 1S7YA 4HS7A 1MXUA 2DWAA 4OTEA 5KDTA 2PT2A 3OXNA 4F39A 4QFLA 2ZYOA 3A3CA 2ZMBA 3KN7A 1FQFA 5K2XA 3IK6B 3RLFE 3H3GA 1WVJA 1BTJA 2NXOA 4ND9A 1VR5A 3EN3A 1Y3PA 2O1LA 2QS2A 1B7ZA 4ZE9A 4FATA 3PMVA 4LQ2A 4BDLA 2RF1A 3PUWE 4O3BA 3KJ7A 3K6XA 3MPLA 4H8JA 4GVOA 1BKAA 1LFHA 3QK6A 3RN8A 4FAJA 3IJXB 3KZGA 3N94A 4XKQA 1DTZA 1UQWA 1JW1A 5JK4A 1FQCA 4F18A 2UVGA 4GIZA 4ZS9A 5CMMA 3LSFB 3H6TA 3VLUA 1EZ9A 4WXJA 1IXHA 4X1BA 5I56A 4Q0CA 1A40A 2XXWA 1MY0A 4KR5A 3IOWA 3M3FA 4R72A 5I58B 3MUQA 3LSLA 1MG1A 1B3EA 3U72A 4OETA 4NTLA 4OHNA 4POWA 4I1DA 3QIMA 5DT6A 4C0RA 2DOJA 4LZ7A 1URGA 1URSA 3IR1A 5CC2A 2XX9A 1CE2A 4H65A 2Y7IA 2XX8A 3TTLA 1ZTYA 3R6UA 4DIGA 1B3HA 3IB0A 4WKMA 3HN0A 3IJOB 1OLCA 3GZGA 1LCTA 4OFLA 3IX1A 1OQGA 2Q88A 2QSXA 4XIGQ 4ZDMA 4DZ1A 4U22A 2DWHA 5H8HB 3U8QA 4GOTA 2Y7PA 2A5TB 2F6GA 1YPNA 4FJPA 4JWOA 1A8FA 2HZKA 1AMFA 5J1DA 3OEKA 1LBCA 1FQDA 5DYHA 5I59A 5JEIA 1SW5A 4BDMA 2Q2CA 1VFEA 3G3FA 3K00A 4JB7A 2AIXA 5FHNA 1B46A 1YTVA 2B3FA 1IQ7A 2B3BA 4QF9A 4QFNA 2Q8JA 1I6QA 1EZOA 1MQDA 2F5XA 1N3XA 2H25A 3OO8A 1B51A 2QMXA 3GBAA 5CMCA 1UIVA 3MVZA 1URDA 1IXCA 4NF4B 4YMBA 2V25A 3G7WA 1O64A 3CR9A 3EQ1A 3RGYA 4G68A 1H76A 3UK4A 2ALUA 4IO3A 4UACA 4U4SA 1F9BA 3D4GA 3CFLA 2VGQA 1MQJA 1USYE 2WKYA 2DE3A 2RKMA 4JBZA 1J1NA 4G68C 4KFQA 1MS7A 4IGRA 2CMOA 3PGFA 4AB6A 4N6PA 3KOTA 5AA2B 4NF8A 3FVNA 4R6YA 1D9YA 3Q26A 1ZKBA 4QSDA 3RTWB 1NKXA 4Z7EA 2R9JA 4XKRA 4ZEDA 2PBWA 4YB5A 2NOOA 1N84A 3PPRA 1UTHA 1FQAA 3BKIB 2NUVA 3OO6A 4QFOA 5AE4A 2Z8DA 1NH7A 3KG2A 1PC3A 3TCHA 2QPQA 3PUXE 2H99A 1SI1A 4E0XA 3UP9A 1NH8A 1GV8A 3FXQA 4EXKA 2OJTA 4MFIA 1LFGA 3IB2A 1M5FA 4JSOA 4QRZA 1NMUA 4X48A 2ZYMA 4OZ9A 5TP9B 4TQUQ 4JSDA 3QSLA 4GWOA 3G3GA 4C1TA 1ZU0A 3FD3A 3C9HA 5ITPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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