3C32A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with sodium at 1.72 angstrom resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 82
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c32A02
4JBZA 3PPPA 5AA2B 4DIGA 2A5TB 3HHFA 3O66A 5FHOA 4TQUQ 1JW5A 3RTFB 4EF2A 2OBGA 3FATA 2O84X 3PMVA 1A8FA 5KDTA 1EZPA 3OMBA 1MXXA 3RN8A 1UTBB 3IOUA 3AXFA 3Q28A 4KD5A 3USDA 3KBRA 3DM0A 3EHUA 3OSQA 5B7DA 5EHSA 1VFEA 4KPTA 2AYSA 4KYSA 3FV1A 3S4UA 1DPEA 4C1UA 3QUJA 3MUQA 3MVZA 1P1QA 2RC9A 4NF6B 2QMWA 1VSOA 1B1HA 4LZ7A 4FE8A 2X26A 4XKPA 3C34A 5H8QA 2IEEA 4QSEA 3U94A 3LR1A 3W9VA 2YPNA 3A3UA 2YLNA 3HPIA 1FCKA 2ESNA 3K4UA 1SYIA 5CRYA 3FJ7A 4LONB 4BDMA 3TELA 1NNTA 2O1LA 1OIBA 1RYOA 4GFRA 1D9YA 3EPEA 3MP6A 1FQFA 2Y7IA 4U2RA 2X7PA 5AA4B 2F6PA 3IJOB 4JWXA 3GXAA 5HM4B 1ZTYA 1MQJA 3VLUA 2I48A 3FD3A 1ANFA 2HQ0A 3E13X 3K2DA 3SEYA 2P0SA 1SBPA 3K1NA 4IO6A 2V84A 3PU5A 3LSLA 1NMUA 5DVJA 1TFAA 5ELVA 4QFLA 5FTHA 1MXWA 3C33A 5DT6A 3KG2A 4PE5B 1MXUA 1M5DA 5CMBA 3VFJA 1R6ZA 3TMGA 1Y9UA 1GTKA 1IITA 1FTOA 1XC1A 3ZKKA 1ZIUA 2KLFA 1GV8A 4C0RA 2YJPA 1TFDA 1QW0A 4IO4A 5H8HB 1OMPA 2Y7RA 2IA4A 2PX1A 4U1ZA 5L9SA 1IXCA 4DXCA 5J1DA 3U1OA 1Y1MA 3O28A 4I9DA 2F78A 2O7UA 2V3TA 2I0CA 3E4RA 4YKJA 5HPQA 2DE3A 1Z7NE 3KN7A 3T66A 1XT8A 1MY4A 4PETA 2DWAA 4ELRA 3OO8A 4LATA 3QAXA 2DE4A 5TP9B 2B3FA 4H5GA 4R2BA 1A40A 4N07A 2I3VA 2Y84A 1B5JA 1JETA 4G2ZA 2PBWA 4GL8A 2OZZA 2O51A 4R9GA 1T0KA 2PMSA 3K0VA 3FXRA 1XOCA 2H5YA 1DMBA 2I6EA 1B3LA 2XHDA 1OQHA 2Y7KA 3QSLA 5DTBA 1FTKA 4OVJA 4EF1A 2NWJA 4H0WA 4NF5A 2REJA 1BIYA 4F3PA 4KHZE 3K6WA 5ITOA 1P1WA 5M2VA 3SETA 2XX8A 1N76A 3V89B 1US5A 1XVYA 3K02A 2Q2AA 1MH3A 3VLWA 4POWA 4FIMA 3CFZA 3PPNA 5ITPA 1J1NA 1B51A 3LSFB 4F2OA 2G93A 3JZJA 5TU0A 4FEDA 5H8SA 3SESA 2DVZA 1LBBA 1US4A 1IZ1A 3SEXA 4F3SA 2PT1A 4KFQA 3QUFA 3RT6B 4YMBA 2RCAA 1UTHA 3TAJA 2VOZA 4OYVA 5L9OA 3T22A 3I5OA 5A5XA 4NF8B 3PMWA 3RT8A 4OESA 3HV1A 3IAZA 4BLAA 1IIWA 3K6XA 4ECFA 1YTVA 3DELB 4POXA 3T9XB 3MAMA 3PMXA 1FTJA 3EHTA 1SW4A 5K2YA 1B9JA 3EN3A 2NVUB 2V93A 3TTRA 3HHGA 4KYDA 3TTKA 4F18A 2ZXTA 2RF1A 3C4MA 3MC2A 4TOZA 5I56A 1LAFE 1NKXA 4JWYA 1LLSA 5I59B 2OWTA 3FVNA 3ZSFA 3OOAA 1EZOA 1MXVA 4ZEBA 1M5BA 1R9QA 3RQTA 5KCJB 3H7MA 3H06B 2XXUA 3KN8A 4E0WA 4UA8A 2Z8FA 4H5FA 4RPOA 3WAEA 4F3BA 3T9VA 3DP6A 1SD3A 3TEPA 3IB2A 4XKQA 1P1OA 5I58A 5IAIA 1MXYA 4U1OA 3N5LA 2QL3A 4DCYA 1Y20A 1S50A 3VV5A 1GVCA 1RYXA 1JVXA 4I62A 1LCFA 2I4CA 1IUDA 5TPAA 3VDFA 1F9BA 4I8CA 4RPNA 4K3FA 3T96B 5I57A 5I2KB 4X1BA 4BDNA 1B5IA 4OFOA 1N3XA 3KGCA 4IY6A 5DYHA 4KYEA 4U23A 4LUBA 2UYEA 3L6GA 4OEUA 3EF7A 3O6IA 3BFUA 2VGQA 1QVSA 2B65A 4KCCA 3PUWE 3Q29A 3UA8A 2DP8A 2ABHA 2P1SA 1YPNA 2ZYKA 3N94A 2DE2A 2R71A 4ZEDA 4R6YA 1O7TA 1MY0A 2XXWA 2QS1A 4TLMB 3PD9A 5AA2A 5K2XA 2XXXA 2OJTA 4OFJA 3OO6A 1PEBA 2AIXA 3I3VA 3O6HA 2VHAA 4QF9A 1A54A 3RPWA 4LQ5A 2R6GE 2OK2A 4F1UA 3L6HA 1A8EA 1BKAA 4DXBA 4IB2A 1UTBA 2E1SA 1B52A 4Z7EA 1MRPA 3S9MC 4ZDMA 4M1VA 1NFTA 4IGTA 2QJEA 2XXRA 4HCYA 1HSJA 4G4PA 3IB0A 2Q9TA 3MQ9A 1D9VA 4NF6A 2OLBA 3MZ1A 1II5A 3V5AA 4O3AA 3IR1A 4F3GA 3B6QA 3RGYA 3CSBA 3GBBA 4XKRA 1QUIA 1I69A 4RYAA 3GLBA 2OCUA 5FHNA 4WEDA 1B3EA 3TYHA 1A55A 4KI0E 4NF4B 3U92A 1MY2A 4NWDA 1O64A 4E0XA 3DP4A 4FORA 1MPDA 4MBPA 4R6KA 1LGBC 3OEKA 3PUXE 1ELJA 5AA4A 5DEXB 2XXQA 1QUJA 1IXHA 3A09A 1SW2A 2QS4A 1M5EA 4R75A 4JSDA 2H98A 1IXGA 3TFLA 4U21A 2XXPA 5H8QB 2THIA 3TPAA 3C36A 4QSDA 2XD2A 4BDLA 1SW1A 4N13A 3CI8A 3F11A 1VFDA 2O6AA 3MZ9A 1USYE 3MJNA 3O6GA 3VVDA 1SQYA 2GHBA 2RINA 3G3JA 2F6GA 1MQHA 3BKIB 4PFUA 5DVIA 3G3HA 1NH7A 3KJ7A 1YAEA 2Z8DA 4OQOA 4FAJA 4MH5A 2XD3A 3TTNA 2UVGA 4F1YA 2ALUA 2Y7PA 4PFTA 3Q25A 4G8NA 4DLDA 1H3DA 2H25A 5CM6A 1B46A 2VD2A 5H8HA 3H6VA 3Q27A 2ZNUA 4KQPA 3G7WA 3KZGA 3T9HB 1LFIA 1M5FA 4ZEIA 4DCXA 3HSTA 2OWSA 3OO7A 2HEUA 3Q26A 4R9FA 2DS9A 2Q89A 3H03A 4WKMA 3B6WA 3EHSA 1B2HA 3IO6A 1ZMGA 3RNNA 4ZECA 1YCJA 5TP9A 4JB7A 3TTMA 1LAXA 2GRVA 1N04A 3R6UA 3FIRA 1TWYA 4EQBA 3FXUA 2R9JA 1DPPA 1PBPA 2HFBA 4ELOA 2H4IA 3P7IA 1P99A 3SEVA 3R7XA 2Z22A 2RKMA 3B7DA 4U4SA 2D3IA 3MBPA 2DQVA 5ISUA 4ZZAA 3KJTA 3KSJA 4OZ9A 3D4GA 1URDA 4GLIA 2XXHA 4G8MA 4X9TA 3VVFA 3IO4A 3ECRA 4R6HA 2A5SA 4ND9A 1WODA 4EQ9A 3UGWA 4ISUA 4H6DA 1CE2A 4JWOA 2Z8EA 2G29A 4G68B 4NTLA 1GR2A 3FV2A 2P2AA 4F29A 1MQIA 5F1QA 1B58A 2PVUA 3E9XA 4FEBA 1N84A 1Z7ME 4PFWA 5BUUA 3TODA 3FVOA 3MP1A 2F7CA 3LC8A 1SI1A 3S9EA 3PPOA 1Q35A 2H9BA 4QRZA 1TT1A 5EHMA 3N6TA 5ICQA 5AA3A 2BJJX 4OMBA 4WXJA 3MW0A 1DOTA 2ANJA 1UIVA 1B5HA 3K1PA 3IOWA 1SI0A 2XXIA 3QIMA 3CG3A 3UORA 4YMAA 3CFLA 4DE8A 5JEIA 2RCBA 3W9WA 4YKPA 4NF8A 5CMMA 5AA1A 4GD5A 5ICTA 2ONSA 1SW5A 2DWJA 4P0GA 1LCTA 2PYYA 4IO2A 1ZBMA 1LFGA 2AL5A 4F22A 4HTGA 4N6PA 5I2NB 2V3QA 1FQAA 3SERA 1QKBA 2PT2A 1IXIA 4OHNA 1GGGA 1H43A 2XXVA 3M3LA 3OELA 1NNPA 5CBSA 1B05A 4YKKA 3RLFE 3MVXA 3G3IA 4G68C 4DDDA 3O9PA 4QFPA 3FGSA 1IQ7A 5FTIA 1EU8A 3U93A 1SDXA 1MM7A 1WDNA 2NXOA 1A7LA 3ILTB 5I59A 3M3KA 3CR9A 3FZVA 4ZZEA 4GRKA 3FVGA 2I49A 2O1MA 4XIGQ 3TZAA 3LSWA 5H8FB 4DZ1A 2CZLA 5KCJA 3FJMA 4KCDA 4ELQA 4AQ4A 4YB7A 3ONMA 2REGA 1Q1KA 4GOTA 3IORA 3UN6A 3D4CA 4IO7A 3VXCA 1S7YA 3K6VA 2GHAA 1B4ZA 3VVEA 1OVBA 4GL0A 4OEVA 1B3FA 1MH4A 1RKMA 4O3BA 1NNKA 3G3FA 1B7HA 4YAHX 4OXVA 3TTLA 1EH3A 1B0LA 3IL1B 2ONKE 2VP1A 2X7QA 4YICA 3PUYE 1URSA 1H76A 1SVXB 4X48A 3UK4A 2M8CA 1B7ZA 5CI5A 3JYRA 5I2KA 3LUYA 5CMKA 4LA9A 1DSNA 3VXBA 3M8UA 3S2VA 1N7XA 2O68A 1LAGE 1POY1 1LBCA 3QK6A 1BTJA 3ZS6A 5JTYB 5I58B 1LB8A 3O29A 3RY3A 4BDQA 2Q2CA 3DP8A 3G3KA 2HZLA 1CB6A 4GVOA 1N7WA 1LB9A 4Z0IA 3IB1A 1JW1A 3VE1B 1PC3A 3OEMA 1S9TA 4Q5TA 3U72A 1JEUA 3TCHA 3K01A 4ESWA 2Q8JA 2VD3A 4DXUA 3S9NC 3MZBA 2UYFA 3WAFA 4YKIA 3PPQA 1B0HA 4OERA 4ESXA 1JNFA 3PD8A 1B7UA 2DXRA 2D21A 5H8NB 2A5TA 4RA1A 3HCQA 3MWBA 3H3GA 5F7VA 1MM6A 1MDQA 3LSXA 4H8IA 1NNFA 1P1NA 3EQ1A 1JW4A 1Y3PA 3OO9A 4Q8RA 4AB6A 1B32A 5AA2D 3PPRA 4TLLB 2GH9A 3W15C 4NE4A 1FQDA 1Y3QA 1MPBA 3FVKA 3IOTA 2HAUA 1PB8A 1DTZA 4YB6A 4G8HA 4OTEA 4NF4A 3N26A 2I4BA 3H4ZA 4R73A 3MPLA 2Y7WA 2ZMBA 4IO3A 3TKDA 3R26A 3S9LC 4PFYA 5KDTB 3N6UA 3MP8A 4BDRA 4ZEKA 3CFXA 2I3WA 2RC7A 1OQGA 3H6TA 1XHYA 1Y4TA 3TQWA 5DEXA 3OSRA 1URGA 1FTLA 3G3GA 2NOOA 3O97A 3KOSA 2FA7A 2QS2A 1B3HA 4YU0A 3QXMA 4YZZA 4R74A 2I58A 2O7IA 4RXLA 3TCGA 2D5WA 1OVTA 1FW0A 2ZNSA 3IX1A 2ZYOA 1R1NA 4P11A 1B40A 3SKPA 1I6BA 3PGFA 1LSTA 3TQLA 1MY1A 4RK9A 3C9HA 3C32A 1MDP1 4X1DA 3CG1A 4QHQA 1ATGA 2NUVA 4UACA 4GXAA 4RJZA 3KOTA 5LOMA 3RTWB 4ELPA 2W7YA 2O69A 3SDFA 5JK4A 5BWJA 1FTMA 2DYXA 5FHMA 1MG1A 2Q88A 1HSLA 3MVWA 2DOJA 2ZYNA 4GWOA 1MQDA 3GZGA 4KR5A 2UVJA 4MFIA 2UVHA 3IOVA 3H6UA 1TXFA 2F97A 1R9LA 4IGRA 3M3FA 3ILUB 2GFEA 4HCWA 2QS3A 2WKYA 5CBRA 2FNCA 3PUZE 4NEDA 4LZ5A 4BDOA 4P0IA 2DVCA 4NWCA 4XTCQ 1LAHE 4R72A 3ZKLA 3MVYA 1A99A 1H45A 2XX7A 1XVXA 4EXKA 1BLFA 1VR5A 1AL3A 1B4HA 1JQFA 4G68A 1M5CA 1JVYA 1PDAA 3E3KA 4M4GA 3TCFA 1SYHA 3T93B 3FJGA 4FJPA 4MLQA 3IK6B 4PQJA 3TUSA 1L5TA 3MPKA 3SEWA 2ONRA 4IO5A 4QFKA 2F5XA 3THIA 4H1XA 2V25A 2QPQA 4FATA 3HN0A 4U22A 3FASA 1AIVA 2B3BA 5KZTA 4OETA 4EXLA 2F8DA 2CMOA 1ZJLA 3V8XB 1XS5A 1Y3NA 2DWHA 4WEPA 3K1MA 1UQWA 5CMCA 3CSGA 3TDJA 1NL5A 4ZE8A 3K00A 5L8DA 4H67A 4F2QA 4I1DA 1Y4CA 1NH8A 5CC2A 3DLNA 4NF5B 4EUOA 1AH5A 4ZEFA 4F39A 3RUMA 3C31A 3BFTA 1B3GA 3HO7A 1PB7A 3FXQA 4F19A 4OWDA 2ZNTA 4Q30B 3O2AA 1MQGA 2F7AA 3ODBA 5I2NA 2XXYA 3PUVE 1JEVA 3KN3A 2RC8A 2Z23A 3SEUA 5I84A 2QMXA 3H6WA 2HCAA 4IY5A 1MXZA 2I0BA 3QYTA 1UIUA 2QSXA 2HZKA 2DXYA 3V83A 1DTGA 4Q0CA 5H8FA 2F34A 4EDPA 3KFMA 1ZLQA 1O63A 3LBSA 1QUKA 1UTHB 1MS7A 1AOVA 1WVJA 4XXUA 4JXIA 4YB5A 4THIA 5A5XB 1FQEA 1B6HA 5EYFA 4OFLA 4F31B 5HBCA 3CRBA 4RK2A 4C1TA 2V3UA 3C35A 4L17A 2DWIA 1Y1ZA 3CVGA 4HW8A 1B1XA 1MY3A 3B6TA 1OLCA 3FUZA 3JV9A 1QKAA 4ONYA 3VLVA 1KWHA 3OXNA 1QJMA 5I56B 1LFHA 1MPCA 1ZU0A 4QFOA 4MF3A 4ZS9A 2FYIA 5IKBA 1PBQA 4QSCA 3OD7A 1QULA 4AB5A 3U8QA 5JTYA 1H44A 4O3CA 4GXSB 5DVFA 4R2FA 2AL4A 2F35A 4HS7A 4F1VA 4ZE9A 3A3CA 4EQ7A 4NMYA 3IJXB 2XXTA 1N0TA 2UXAA 3PV0E 5L9MA 1FQCA 4QFNA 2H99A 4OENA 2HXWA 3UIFA 1EZ9A 2LAOA 2QRYA 4U4XA 2F7BA 1HSEA 4LP2B 1N3WA 3T9UA 3UP9A 1ZKBA 4H65A 4H8JA 3CIJA 5AE4A 4JSOA 5TPAB 3KEIA 2HAVA 3I6VA 3KSXA 4XKNA 4JDFA 5I57B 2F36A 2UVIA 3GBAA 4G77A 4PP0A 1I6AA 2XX9A 5H8NA 1USYH 4RNSA 4FECA 1OLAA 4GIZA 3BBRA 1IEJA 1POTA 2DSFA 4MLVA 2E0SA 2ZYMA 1AMFA 1VE4A 4LVQA 1FQBA 1P1UA 4LQ2A 3K6UA 3OENA 1PB9A 4GQOA 5B70A 4LZ8A 1D3KA 1BP5A 4GF8A 1D4NA 1I6QA 4RY1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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