3C33A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with potassium at 1.78 angstrom resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
total genus 80
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c33A02
1PB9A 2QS4A 1IIWA 5HM4B 3H6TA 4EF2A 3MWBA 3HPIA 4JBZA 3LSXA 3QIMA 2H25A 3LSWA 3VVEA 1O63A 4RXLA 1MPCA 5CMBA 1B46A 1F9BA 1LFGA 3QYTA 4UACA 5I58A 4OYVA 3H4ZA 3ECRA 2XXUA 2XXRA 4YKPA 3QSLA 1MH3A 3VXCA 1ZMGA 4PE5B 3VDFA 3LSLA 2O7UA 1FW0A 3BFTA 3HCQA 4ZECA 2VOZA 4H5FA 4LA9A 2GHBA 1N3WA 4EDPA 3O2AA 4KD5A 3EN3A 4U21A 4QFLA 4OHNA 1XS5A 5DT6A 3Q26A 1VFEA 4KI0E 3QUJA 3EF7A 2QSXA 1QKBA 2HCAA 1JNFA 1B5IA 1S7YA 3LSFB 3TFLA 4Z0IA 3UK4A 2GHAA 3PPQA 3V5AA 2B3FA 3GBBA 5FTIA 3PPNA 3TKDA 1II5A 2XXVA 3MC2A 2I3WA 2ONSA 3OENA 3PU5A 1ZIUA 1SW1A 2V3TA 1MY3A 5I56A 3USDA 3TPAA 1UIUA 2PYYA 2VD2A 4NF5A 3IK6B 1EH3A 4AQ4A 1PBQA 3MVWA 4P11A 4F3BA 3U72A 1M5EA 3IJXB 4RK9A 3TCHA 3BFUA 3OMBA 1M5BA 2Z8DA 2ZXTA 4GLIA 3SEUA 4GL8A 3U8QA 3JZJA 1LFIA 3D4CA 3PV0E 3UP9A 4NEDA 4RK2A 4E0WA 1B40A 3PUZE 2F8DA 4QHQA 3W15C 5ICQA 1XVXA 1B3GA 3QXMA 3ZS6A 4DE8A 5H8SA 4POXA 3Q25A 4BDRA 4G68C 3T66A 3MVZA 4EQ9A 1JETA 2ESNA 4GRKA 1O7TA 4F3SA 4H67A 1NNKA 3QK6A 4RPNA 2V84A 3SEYA 1SDXA 5I57B 1L5TA 1N7WA 3GXAA 2VGQA 3ODBA 3T9XB 4L17A 4H6DA 4GIZA 2O7IA 1P1WA 1BTJA 4Q0CA 4KR5A 2Z23A 2NVUB 1MG1A 2RCAA 3K1MA 1EU8A 3K6VA 2QS2A 3RY3A 3M3LA 1JW1A 3VLVA 4NF6B 2AYSA 4GF8A 1N76A 1MPBA 2F78A 1FQAA 1H3DA 4PQJA 4YKJA 1B5JA 4FEDA 1I6BA 4ELRA 3RLFE 3SEWA 3I6VA 4UA8A 1H45A 4LQ2A 4NF4B 3WAFA 2A5TA 1LB8A 1B3LA 1B6HA 2Q88A 1DTZA 3G3HA 2HZKA 2FA7A 4KQPA 1POTA 3E3KA 5AA1A 1DOTA 4LATA 5FHNA 2XXYA 1JQFA 2DVZA 1Y4CA 4XXUA 5KZTA 2Y7RA 5EHMA 4GVOA 4JXIA 3MPLA 3TTLA 3JYRA 4NF8A 3O6IA 3CVGA 4YKIA 1SW4A 4QSEA 2O84X 1BLFA 5AA4B 3UN6A 2ANJA 4I8CA 3K2DA 3S9LC 1TFDA 3TCGA 3T9UA 1UTBA 4X9TA 3O66A 3CFLA 3IOVA 4MF3A 3ILUB 2RKMA 4XKPA 4H5GA 4ESWA 3DM0A 4JSOA 2I3VA 1OMPA 2FNCA 2F5XA 1AH5A 4DXBA 3U92A 3KFMA 5F7VA 3S9NC 1LAGE 4OFLA 5CBRA 3OSQA 1UTHA 4F18A 3RPWA 5DEXB 3SEXA 3MW0A 2PBWA 1N3XA 2WKYA 3B6QA 4YKKA 2XXPA 3MQ9A 1MDQA 4HCYA 1DPEA 1LAFE 5ISUA 4U4SA 4FATA 1Y3QA 5ITOA 4LZ5A 3HHFA 2I6EA 3DP6A 3RNNA 5KCJA 1ANFA 3V89B 4IO2A 4EUOA 2UYEA 5FHOA 1NFTA 3SETA 4Q5TA 3MJNA 4ZE8A 3CFXA 2H4IA 3O6HA 5BUUA 4ZEDA 2V25A 3CSBA 1MQDA 4G68B 2I48A 3IOUA 3CIJA 2F36A 4RNSA 4NTLA 4PP0A 4QFOA 1J1NA 4BDNA 3KEIA 3K1NA 2F7AA 1US4A 4OENA 5DVJA 3K4UA 3KN3A 3C33A 3N6TA 1NH8A 4ZZAA 3C35A 2QMXA 4GL0A 3H7MA 1SW5A 4GD5A 2D3IA 4DXCA 2XXIA 2HZLA 1USYE 2XHDA 2O68A 1MY1A 2ZYNA 2NXOA 1QKAA 2NUVA 3MAMA 1LCTA 1I6QA 3E4RA 5H8FB 1SYIA 2DWAA 4G77A 1SBPA 3MUQA 1B4HA 3RUMA 4KHZE 2B3BA 3TZAA 3RTWB 4ZS9A 3IJOB 5I2NA 1Z7ME 3TMGA 2Y7IA 5CMCA 1FTJA 1R9LA 3SERA 5B70A 2LAOA 2E0SA 4QFNA 4QSCA 2KLFA 2QS3A 3R6UA 2F6GA 3C32A 4OWDA 1P1UA 1URDA 4DCXA 1OQHA 3PD8A 3UGWA 3FVGA 1B0LA 5FTHA 2AIXA 3MP8A 1USYH 1B5HA 1H76A 1CE2A 5H8QB 4XKNA 2X26A 3OO9A 1XHYA 1FQBA 4IGTA 1A8EA 3RQTA 2VP1A 4QRZA 2IEEA 1DTGA 5CC2A 4OFJA 4LVQA 4FECA 1IUDA 4O3AA 3K6WA 3PGFA 1URSA 3MZBA 4HTGA 4FIMA 1Y3NA 4I9DA 3PPOA 1B52A 2RF1A 2XXWA 2Y7KA 3PMVA 2D5WA 2VHAA 1LAXA 1ELJA 5TPAA 4M1VA 4LQ5A 4KCCA 2GRVA 4AB6A 3PMXA 3EHTA 3S9MC 3I5OA 3PMWA 4FORA 4YMAA 3KN8A 3LUYA 3AXFA 1Y1MA 2YPNA 3G7WA 4JSDA 5JTYA 3A09A 4BDMA 2F34A 4JWXA 4R6YA 2Y84A 2RCBA 2QRYA 4OESA 2UVIA 4RPOA 3TYHA 1N04A 3T9HB 1LB9A 3IL1B 1B4ZA 1MH4A 1JEVA 3H6UA 3KN7A 3OOAA 1GR2A 2HXWA 4R72A 2Q89A 3HSTA 2ZNTA 1A8FA 4F19A 2V93A 3V83A 2Y7WA 1B51A 3Q27A 4HCWA 2DWJA 1IEJA 3V8XB 4PFUA 1LLSA 3IR1A 3DELB 5A5XB 1MY4A 4OFOA 5I2KA 5TP9B 3FJMA 2OLBA 1AL3A 5IKBA 4DXUA 4XTCQ 4RJZA 2F7BA 1MDP1 4JDFA 4ELPA 1LCFA 3IO6A 5I59A 4QSDA 1YPNA 3F11A 2UVHA 3C9HA 2ZNSA 4OMBA 1P1NA 2Q2AA 5H8HB 4MH5A 2O1LA 3K02A 2ONRA 5CMMA 1ATGA 3MP1A 2D21A 1HSLA 1VSOA 2DE2A 5AA2B 1D3KA 1SI0A 4U23A 3SEVA 3C34A 5CM6A 3RTFB 4LP2B 4F29A 3B7DA 4OERA 1JEUA 3WAEA 2XXQA 1Q1KA 1ZTYA 3TAJA 2F6PA 4IO7A 4YMBA 4IO4A 4ISUA 5CMKA 1OLCA 4U4XA 1SQYA 4R9FA 4KYDA 1GTKA 4R73A 5TU0A 3PD9A 2I49A 4IGRA 3FGSA 3KOSA 2Z8EA 4R6KA 2RC8A 5K2XA 1A54A 2DOJA 1GGGA 1XOCA 2R6GE 1UIVA 4YU0A 2BJJX 4WXJA 3FVKA 1KWHA 4I1DA 1XC1A 1JW4A 3O97A 4RA1A 3GBAA 1B3HA 4BDOA 3CI8A 3MZ9A 3OEKA 3FXRA 5B7DA 4H1XA 5AA3A 5DYHA 4M4GA 1ZJLA 1PC3A 2I0BA 2ZMBA 5ELVA 1PEBA 1JW5A 3KG2A 3M8UA 2O69A 3FASA 1H44A 2OBGA 4R2BA 4ZEIA 4HW8A 5ICTA 3EHUA 4OZ9A 1URGA 3U1OA 5KDTB 3SESA 4XKQA 4Q30B 1AMFA 3OO6A 1FQFA 3U93A 4G8HA 1QUJA 2ZNUA 1LGBC 1MQJA 4DDDA 3BKIB 3FVNA 5H8NB 1QJMA 4FJPA 3K6UA 1AIVA 3MP6A 1NH7A 4MLQA 3FZVA 4N13A 1GV8A 2PT2A 4WEDA 4GXAA 5I58B 4H65A 1MY0A 2OCUA 2AL5A 5J1DA 3PPRA 1PDAA 1HSEA 3E9XA 1IXIA 1N0TA 1FTOA 3CG1A 2OK2A 1WDNA 4ZE9A 3EPEA 3TODA 2W7YA 3N94A 3N6UA 4HS7A 4H0WA 3UA8A 1QW0A 2O1MA 1SVXB 1VFDA 1NKXA 2VD3A 1TT1A 1OVBA 1SYHA 4ZEKA 4TQUQ 3VE1B 3VV5A 3RGYA 3MVYA 5L8DA 1QVSA 2QPQA 1SD3A 5LOMA 3KBRA 5I57A 4R6HA 1JVXA 4DIGA 3IX1A 1SI1A 3TCFA 4R9GA 4TLMB 2PVUA 4ZZEA 5I56B 4U2RA 4PFYA 1FTKA 2DSFA 2XX9A 4ECFA 1BKAA 3H03A 3FD3A 2G29A 4OETA 2DVCA 5AE4A 3MVXA 2F7CA 3ILTB 1B1XA 1Z7NE 4NF5B 4F3PA 4YZZA 4KPTA 2DXYA 3TEPA 4U1ZA 4NF6A 1TFAA 3S2VA 3QAXA 3FXQA 3B6WA 3B6TA 1VR5A 4FEBA 1NMUA 1LAHE 4N07A 3JV9A 3RT6B 1Y3PA 3M3FA 1MXUA 1I69A 4IB2A 3KGCA 5I84A 1YCJA 4YB6A 2XXHA 3A3UA 4NWDA 4NF4A 4PETA 1NNTA 1MQGA 3VVDA 4LZ7A 2I0CA 3TTMA 5JK4A 3FJGA 3DP4A 3N5LA 1TWYA 1IXHA 1MXZA 3T96B 1MY2A 4P0GA 1LBCA 5M2VA 3VVFA 1B3EA 3Q28A 2E1SA 3KZGA 4R75A 1PBPA 5AA4A 1DPPA 3O28A 4EQ7A 2V3UA 1B0HA 3OD7A 2CMOA 3FV2A 3ZSFA 4XKRA 2XXXA 1M5DA 4F1YA 5HBCA 4G4PA 1EZOA 2Q8JA 4OEVA 2G93A 1Q35A 3VXBA 3S9EA 2OJTA 3FATA 1B1HA 3KSXA 1IQ7A 4YAHX 4FAJA 4PFTA 4X1DA 3TTNA 3C31A 2A5SA 1AOVA 3UORA 4BDQA 4G8NA 5DEXA 2AL4A 3K1PA 2A5TB 3IOTA 1MM7A 4I62A 5L9MA 1OLAA 2RC9A 3VFJA 1HSJA 5FHMA 4ELQA 2YJPA 4F31B 3G3IA 4EXLA 1DSNA 1M5FA 3BBRA 4C0RA 3EQ1A 4GOTA 1FTMA 1MXWA 1EZPA 4QF9A 4IO6A 3H6WA 4NF8B 3GLBA 4NWCA 3ZKLA 4KFQA 3C4MA 4MBPA 2DQVA 3THIA 3DP8A 1B7ZA 3L6GA 3M3KA 4G68A 1B32A 2XX7A 1UTBB 3T9VA 5K2YA 2I4BA 3PUYE 2H99A 3G3KA 2DYXA 3OXNA 4OVJA 2QL3A 3O9PA 5DVFA 1N7XA 3G3FA 2ALUA 1ZKBA 4G8MA 1XVYA 4KYEA 2R71A 1EZ9A 1T0KA 1SW2A 4GQOA 4ZEBA 4MLVA 4ZDMA 1S9TA 1BIYA 2NWJA 1MS7A 3UIFA 3LR1A 1IXCA 2V3QA 4O3BA 5DTBA 1Y1ZA 1A7LA 1POY1 1UTHB 3OSRA 1MXYA 3D4GA 1A99A 1QUIA 4H8JA 3KJTA 4DCYA 1RYXA 4Z7EA 1A40A 4OTEA 4NMYA 5H8FA 2I4CA 4X48A 1NNPA 4U1OA 3MZ1A 4BDLA 2I58A 1B7HA 1XT8A 2Q2CA 5HPQA 5IAIA 5KCJB 4ND9A 3MPKA 4EXKA 5EHSA 2DXRA 2P1SA 1ZBMA 4IO5A 4RY1A 1YAEA 2M8CA 2DP8A 2UVJA 3EHSA 4F22A 4K3FA 1M5CA 4OQOA 2Y7PA 2ABHA 2CZLA 4F1VA 4C1UA 1R9QA 4GFRA 4TLLB 2Q9TA 4KCDA 3TTKA 3H3GA 5H8QA 2HAVA 2Z22A 3HV1A 2HEUA 3R7XA 1DMBA 3KOTA 3L6HA 3U94A 2DS9A 1NL5A 1RYOA 3OO7A 4IY5A 2XD3A 2DWIA 2X7PA 1FTLA 3H06B 3W9WA 3TDJA 2NOOA 1H43A 3T93B 1IXGA 3OELA 1CB6A 4XIGQ 1MQHA 4YICA 1MPDA 3SKPA 2QJEA 1D4NA 3IO4A 4WKMA 1B9JA 3O6GA 1FQDA 2XD2A 2O6AA 1FQEA 3PUVE 4O3CA 3H6VA 1PB7A 5I2NB 1OIBA 2PMSA 1IITA 3HHGA 5ITPA 3N26A 3FUZA 4BLAA 2XXTA 2F35A 4C1TA 2GH9A 2DE3A 1BP5A 4FE8A 1WVJA 4F1UA 1FCKA 2Z8FA 2REJA 3QUFA 1FQCA 2ONKE 4R2FA 3OEMA 4EQBA 1B2HA 2OWTA 1MQIA 2F97A 2QMWA 3TUSA 4AB5A 3SDFA 1S50A 2P2AA 3KJ7A 2HFBA 2HQ0A 3CFZA 4YB5A 4G2ZA 2UVGA 1ZLQA 4DLDA 4Q8RA 5A5XA 4OEUA 2B65A 2DE4A 3IB2A 2UYFA 5TP9A 2XX8A 4P0IA 1Y9UA 1P1OA 1WODA 4N6PA 3O29A 3I3VA 2PT1A 1A55A 1Y20A 4OXVA 3RN8A 3K6XA 2X7QA 5TPAB 3IB0A 4DZ1A 4LONB 4F39A 4GXSB 4ELOA 2UXAA 2IA4A 5H8HA 1OVTA 4POWA 5EYFA 3CR9A 3IOWA 5F1QA 3HN0A 3KSJA 3CRBA 5JTYB 2H9BA 4F2QA 3FV1A 2QS1A 3K01A 4QFKA 5AA2A 1LFHA 2GFEA 3W9VA 4JWYA 4X1BA 2FYIA 3DLNA 4JB7A 3G3GA 3C36A 1O64A 4GWOA 4LUBA 3PPPA 2RC7A 4TOZA 5CRYA 3G3JA 1P1QA 4PFWA 1YTVA 5CBSA 5L9SA 5DVIA 4KYSA 1TXFA 3FVOA 3K0VA 1B3FA 1MRPA 2H98A 3TQLA 1NNFA 1LSTA 3PUWE 3HO7A 4QFPA 4U22A 3IAZA 1B05A 5I2KB 3CSGA 1I6AA 1PB8A 3FJ7A 4JWOA 4IO3A 1D9YA 2YLNA 3Q29A 3ONMA 3LC8A 3OO8A 3VLWA 4RYAA 4F2OA 2ZYOA 1QUKA 1RKMA 5I59B 3R26A 4MFIA 3E13X 1MXXA 4H8IA 5JEIA 4THIA 3GZGA 3TTRA 1MXVA 2O51A 1UQWA 5CI5A 3ZKKA 4EF1A 4WEPA 1B58A 2R9JA 1Y4TA 1B7UA 3RT8A 3S4UA 2H5YA 4R74A 3TQWA 1IZ1A 2PX1A 2OZZA 3P7IA 3FIRA 3FXUA 2RINA 1N84A 1OQGA 3A3CA 5KDTA 2ZYKA 1MM6A 4E0XA 4F3GA 2DWHA 2REGA 2ZYMA 4IY6A 1D9VA 1JVYA 4YB7A 1QULA 1US5A 3K00A 1R1NA 3IB1A 5L9OA 3CG3A 3MBPA 3TELA 5BWJA 4NE4A 4ONYA 1GVCA 2OWSA 2P0SA 2THIA 1LBBA 3LBSA 1ZU0A 3IORA 3T22A 1P99A 4ZEFA 3PUXE 3VLUA 5AA2D 1VE4A 2HAUA 4LZ8A 4ESXA 5H8NA 1R6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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