3DP4A

Crystal structure of the binding domain of the ampa subunit glur3 bound to ampa
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the S1S2 glutamate binding domain of GLuR3.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dp4A02
1URDA 2RCAA 5ICQA 4ZZAA 4DXCA 3FGSA 1VSOA 4XXUA 1PBPA 1MDQA 3PMXA 3OEMA 4G2ZA 5I2KA 2BJJX 3SESA 2YPNA 1FTJA 1FTOA 1MXVA 4NF5B 4KCDA 3UIFA 1JEVA 4RJZA 1QULA 3MPKA 1ZIUA 5I57B 3T9XB 2P2AA 1JW4A 5AA2B 3SEXA 2O7UA 1B58A 1MRPA 4Q5TA 5AA2D 4OWDA 4BDMA 3EN3A 3IB0A 3KFMA 5DTBA 1IXIA 4LATA 1B2HA 1B3FA 1AMFA 4C1UA 4GWOA 1F9BA 3K02A 2R9JA 3E4RA 4POXA 2I3WA 4DDDA 3CVGA 2ZMBA 5CMBA 3EQ1A 1NNKA 3HHFA 3RN8A 5M2VA 4PE5B 3VFJA 3JV9A 3IOVA 1MH4A 4FEDA 3TQWA 4YB7A 4E0XA 1SW4A 2G93A 2OK2A 4MH5A 2XXTA 2NUVA 3WAFA 5H8NB 3MVYA 1M5CA 4BDQA 2NVUB 3Q28A 2UYFA 3FVOA 4DXUA 4KPTA 2V25A 2H9BA 1IIWA 3IB2A 1DMBA 1SW5A 1GR2A 1IZ1A 1DTGA 4XKRA 4GF8A 4AB6A 1MQDA 2UXAA 2PYYA 4RXLA 2DE4A 4KQPA 1BTJA 5EHSA 2OWSA 1PB9A 1P1UA 4GXAA 1TWYA 1B32A 1FQCA 1SQYA 4BLAA 1B4HA 5I56B 3K0VA 3QUFA 3CFZA 4XTCQ 1Z7ME 1N7WA 3VLVA 3KZGA 1N04A 1IEJA 4NF6B 3UGWA 3DP8A 1B0HA 3LR1A 4OXVA 3IO6A 2QS4A 3K6UA 2Z8DA 1DSNA 2ZNUA 3FV2A 1FTKA 4QSEA 1P99A 4HTGA 4H5GA 2WKYA 4TOZA 4AB5A 1TFDA 1MY1A 1A7LA 2FNCA 1A99A 4LQ5A 5AA3A 4L17A 4H0WA 2Q8JA 3I6VA 3FV1A 5TP9A 1MQHA 2M8CA 3M8UA 4PFUA 3SKPA 3RLFE 3TTRA 2HEUA 2Y84A 3FVKA 5JTYA 4QRZA 4RNSA 2AIXA 4R72A 2QS1A 5A5XA 4RYAA 1Y3QA 1NFTA 3H6TA 3C31A 5KDTA 5ELVA 3IOTA 1GGGA 2OWTA 4JWXA 1B1HA 2DWIA 3K6XA 3HSTA 2THIA 4FORA 1JVXA 3TTLA 2XXRA 2E0SA 1J1NA 2VD2A 2OJTA 3KJTA 5L9SA 1A40A 4MLVA 2PVUA 3O66A 4ONYA 1OLCA 3SDFA 2H25A 3TCFA 4GL0A 3MZ9A 4H1XA 4EXKA 4IO4A 1UTBB 1NKXA 2HZKA 4Q30B 1XVXA 2ANJA 2GRVA 1M5FA 2DOJA 3H6VA 4LVQA 5JEIA 4U4XA 1B5IA 2QJEA 3TTKA 4PP0A 4F29A 3C9HA 1SD3A 3G3KA 4F1UA 3MBPA 2GFEA 1UIVA 3U92A 2F5XA 3F11A 3A09A 5H8HA 5IAIA 1IXHA 3U72A 2DSFA 1N7XA 4ZEBA 4R6KA 4X9TA 5B7DA 3VV5A 3SEYA 4MLQA 4KYDA 1M5BA 3UA8A 1FQAA 2Y7WA 3E13X 3T9UA 2XX9A 1I6QA 1UTHA 4U1OA 4H67A 4G8HA 1UQWA 3PGFA 1M5DA 4F3SA 1H45A 2QSXA 2Z22A 1DTZA 1QKAA 1DOTA 4IO2A 4PQJA 4G4PA 2DXYA 2QL3A 3M3FA 4WEPA 1XS5A 4GVOA 3PD8A 1B3EA 3EHUA 1B7UA 4ISUA 1BIYA 2DWJA 3HHGA 1D4NA 5DVIA 3FASA 4H8JA 1IITA 3C32A 3TQLA 3UP9A 5I58A 4U21A 1L5TA 1MM7A 4MFIA 3MZBA 1Z7NE 1ANFA 4GRKA 4JB7A 3H4ZA 2H5YA 2PBWA 4YB5A 2D21A 4OTEA 1EZPA 2DE3A 3GBBA 4ZS9A 4OHNA 5ISUA 3KN8A 2W7YA 3IJXB 1MQIA 4IY5A 1H44A 1QUIA 3UK4A 1H76A 2Z23A 4QFLA 2QS3A 2O7IA 1LBBA 1AH5A 1II5A 3RTFB 4LP2B 3USDA 3PU5A 3VXBA 3KEIA 5DEXB 3K4UA 4GD5A 3ZS6A 1MH3A 1XT8A 3HPIA 3O97A 2KLFA 4NWDA 3FJMA 4EXLA 4NF8A 3ZKKA 1ZMGA 3N6TA 1R9LA 2A5TA 1N0TA 4EDPA 4I62A 3O2AA 2I58A 3FATA 5AE4A 3G3GA 3BFTA 3K01A 2F36A 4OQOA 4H65A 3LSLA 1VFEA 3PPRA 1MXYA 3SEVA 2XHDA 3EHSA 3A3UA 2Q9TA 5EYFA 3W9VA 1MY0A 2OBGA 2X7PA 2I4CA 4M1VA 3HV1A 4ZE9A 4JWYA 5DVJA 4NF4A 1P1WA 2E1SA 2G29A 1YPNA 3VLUA 3MAMA 5ITOA 2HXWA 5AA4A 4FATA 3IORA 3FJGA 3VE1B 1OVBA 3V8XB 3E3KA 3T93B 2O1MA 5IKBA 1LAFE 4PFTA 1IQ7A 4H8IA 3CIJA 3HCQA 3T9HB 4UA8A 3EF7A 1B4ZA 4U1ZA 2OLBA 2XXYA 1IUDA 1ZLQA 3B6QA 4Q8RA 1O7TA 3MVZA 4YMAA 4ZEIA 1LLSA 1EZ9A 4LUBA 3PPNA 4KHZE 5I59B 1N76A 4AQ4A 2O51A 3K00A 4EQBA 4O3BA 5CBSA 4N13A 3MP6A 3MJNA 1GVCA 1MY4A 4HW8A 4ZEFA 4BDOA 4OZ9A 1LB8A 2NOOA 2B65A 3G3IA 1NNTA 1Y3PA 5I57A 1Y9UA 3TODA 5CM6A 5ITPA 5AA2A 4ECFA 2F8DA 4OENA 4ZEDA 2Q89A 3Q27A 3CI8A 1Y4CA 1Y1MA 2REGA 1UIUA 3EHTA 4FJPA 4OVJA 2XX8A 1A8EA 3OO8A 3PPQA 1SDXA 3MP1A 3L6HA 4LZ5A 3TTNA 3TTMA 4TLMB 1ZTYA 4NE4A 4KD5A 2F35A 2UVIA 3PD9A 1HSEA 2OZZA 3TMGA 3LSFB 3S9NC 1ZBMA 4P0GA 1SBPA 1VR5A 2I6EA 1NH8A 2GHBA 3TZAA 3D4GA 1H3DA 4KYEA 5H8NA 5JK4A 3VLWA 2GH9A 3P7IA 3DP6A 3DELB 4RPNA 4F1VA 4DIGA 2Q88A 3IOWA 3CG3A 5I84A 1URGA 3OXNA 3VVDA 3S2VA 3FXRA 5H8QB 2XD2A 2H4IA 3PV0E 3N5LA 3KBRA 1RKMA 1ZKBA 4GFRA 4MF3A 3O6HA 1SW1A 5CRYA 1Y3NA 3DM0A 3V5AA 3DP4A 1MPDA 4WXJA 2ZNSA 5CBRA 2XXVA 4JSDA 1LAXA 4IB2A 2ONSA 1Y1ZA 5I56A 2DS9A 3N6UA 4KFQA 1JW1A 4KI0E 3CSBA 1JETA 2O69A 1QW0A 3FD3A 2XXWA 1EU8A 2I3VA 2GHAA 3H06B 2PT2A 4EF1A 3G7WA 4NF6A 1PDAA 3PUWE 2VD3A 3QAXA 3VXCA 1FCKA 3PUXE 4I9DA 4OFJA 3O9PA 3PUVE 2ABHA 4R6YA 2ZYOA 3MC2A 1R1NA 3FJ7A 3QIMA 2H98A 4BDRA 3T9VA 1MG1A 5LOMA 3RT6B 3S9EA 4POWA 1OIBA 5DT6A 1KWHA 3RNNA 1P1OA 3C34A 3LSXA 1MQGA 3C4MA 4GL8A 2D3IA 3EPEA 1A8FA 1RYOA 3IJOB 1JNFA 1FTMA 3I3VA 2NXOA 4YKIA 4XKPA 4U2RA 5H8HB 2AL4A 2DQVA 4R9FA 3A3CA 3KOTA 3UORA 1XHYA 3K6VA 4PFWA 1N3WA 2DVCA 1UTBA 3LC8A 4KYSA 1LFGA 3TELA 3JZJA 1NL5A 2YJPA 5TPAA 2P1SA 1B7ZA 4GOTA 5TU0A 1P1QA 3FIRA 1QJMA 2V3UA 4F39A 4C1TA 4OERA 4ELQA 1LCTA 5ICTA 1MPCA 3LSWA 1A55A 3FZVA 3QSLA 2ONKE 2F6PA 5BUUA 1ZU0A 1SYIA 3SERA 4F3PA 5FHOA 3ONMA 4F2QA 5KZTA 2DYXA 1POY1 3FVGA 3FXQA 1MXXA 1TFAA 3B6WA 3T66A 4K3FA 2Y7PA 4ZE8A 4X1BA 3IR1A 2XXQA 2RC7A 1NNFA 2F34A 1LCFA 2HFBA 3H03A 4RK9A 3RY3A 3IL1B 1N84A 5HPQA 4YKKA 2XXPA 3S4UA 3MWBA 5I2NB 2QMXA 3C33A 1B7HA 3GBAA 4F3GA 1IXCA 3Q29A 4NEDA 4NWCA 1PBQA 4ELPA 5KCJB 1LSTA 4YB6A 3C35A 1IXGA 1Q35A 4QFOA 4R75A 2VOZA 1B6HA 4EQ7A 5L9MA 3O6IA 1USYE 3K2DA 4DCXA 1B9JA 2ZYNA 3TAJA 5F1QA 3K1NA 3O6GA 3OO7A 5F7VA 3CFXA 3T96B 1NMUA 4G68B 3RT8A 4G8NA 1JEUA 3QK6A 4FEBA 4P0IA 2F7CA 5CMMA 1O63A 3KSJA 4HCYA 3TFLA 4XKNA 4RPOA 4ZECA 4HCWA 3RGYA 3KOSA 4OETA 3VVFA 4DZ1A 4OEUA 4F18A 4G77A 3IX1A 3W15C 1SW2A 3M3LA 3R6UA 3K1PA 1DPEA 2HZLA 1LBCA 2DE2A 1B52A 5H8FB 3H7MA 4MBPA 5FTHA 4LZ8A 3VDFA 5EHMA 1MY3A 5DEXA 2CZLA 3PPPA 3MW0A 2RF1A 1FQFA 5I2KB 1B05A 4G8MA 1LGBC 4LA9A 1ATGA 4Q0CA 2ESNA 3TCHA 2DVZA 1PB8A 2V3TA 1HSLA 3CG1A 3IB1A 4G68C 5CI5A 1URSA 2HAUA 3THIA 1SYHA 2RC9A 3CRBA 3PPOA 1O64A 2LAOA 2XXHA 1T0KA 5FHMA 2RINA 2REJA 1ELJA 3AXFA 2DP8A 4ELRA 4Z7EA 1OQHA 2A5SA 4ZZEA 2OCUA 4FE8A 2HQ0A 3RUMA 3ECRA 3FXUA 1CB6A 1NNPA 2X26A 1WDNA 3TDJA 3K1MA 3ODBA 3Q25A 3TKDA 1EZOA 5AA1A 5K2YA 2VGQA 4E0WA 3IK6B 3OD7A 4YKPA 5J1DA 4N6PA 1VFDA 4NF5A 3OEKA 1MPBA 4RK2A 2RC8A 3LUYA 2DXRA 1EH3A 3CFLA 1US5A 3O28A 5I59A 2PX1A 4I8CA 1WVJA 3N94A 3KSXA 2V3QA 3OO9A 1B0LA 4RA1A 4F22A 4ND9A 3TEPA 3DLNA 4JXIA 4Z0IA 4LQ2A 3MQ9A 3E9XA 1JQFA 2Y7KA 1LB9A 1YAEA 1MXWA 2DWHA 3B6TA 3QUJA 4JSOA 1B5HA 3U93A 4EF2A 3WAEA 4R2BA 4OMBA 4YMBA 4QF9A 2UVGA 5HM4B 4TLLB 4ESWA 1JVYA 4YU0A 4GIZA 2F6GA 1I6BA 2NWJA 2RCBA 4BDLA 1MDP1 3PMVA 1OLAA 3MVXA 4R9GA 3SETA 5H8SA 1S50A 4DCYA 1BLFA 2QPQA 5L8DA 1MXZA 4F2OA 1GTKA 1S7YA 1I69A 1R9QA 1BP5A 4JDFA 3U8QA 4I1DA 2ZYKA 3I5OA 1XC1A 1FQDA 4IO6A 4DXBA 3OELA 3PUYE 1QUJA 3H6UA 3V89B 5K2XA 1XOCA 2XD3A 3N26A 2QRYA 3JYRA 4IO5A 5TP9B 1TT1A 1LFIA 1FTLA 2B3FA 3M3KA 1PB7A 5DYHA 4DLDA 3GLBA 3MPLA 5JTYB 3TYHA 4YZZA 2Z8FA 4OEVA 3ILTB 1Q1KA 5H8QA 4IGTA 2UVJA 3D4CA 4R2FA 5A5XB 4M4GA 4N07A 1N3XA 1B46A 2Z8EA 5KDTB 3PUZE 3KJ7A 4ZDMA 1BKAA 3BKIB 3UN6A 1SI1A 4XIGQ 4IO3A 2O68A 4HS7A 5B70A 1PEBA 1D9YA 2HCAA 2FA7A 3GZGA 2VP1A 3OO6A 1AL3A 2YLNA 2I0BA 4IY6A 5BWJA 4IO7A 1USYH 4RY1A 2I0CA 4XKQA 1QVSA 1FW0A 4JBZA 1GV8A 4H5FA 2AYSA 2B3BA 4EQ9A 4FIMA 4F31B 4X48A 1FQEA 1MS7A 2XXIA 2O1LA 1FQBA 4X1DA 3BBRA 3ZKLA 4U23A 4C0RA 4OESA 1M5EA 4QFKA 4F3BA 3TUSA 2RKMA 2O84X 3BFUA 1ZJLA 3C36A 1B3HA 1B5JA 1R6ZA 3MUQA 3MP8A 5TPAB 3V83A 1B3LA 3ZSFA 1DPPA 4JWOA 3IO4A 4GLIA 4QSCA 2R6GE 4GXSB 4PETA 5CMCA 4EUOA 2F7BA 4IGRA 1UTHB 4H6DA 5FHNA 4NMYA 1MY2A 3OSRA 2Y7RA 4LONB 3CR9A 1SI0A 3H6WA 1LAGE 5CMKA 5FTIA 1CE2A 1A54A 1MM6A 1WODA 1HSJA 3B7DA 3QXMA 1AOVA 2CMOA 4GQOA 1D9VA 2Y7IA 2X7QA 3O29A 1SVXB 3G3HA 4FAJA 2O6AA 2FYIA 3RPWA 2Q2AA 2R71A 1B40A 2F97A 4O3AA 3VVEA 2UVHA 3S9LC 2AL5A 2ALUA 3RTWB 3IAZA 1YTVA 3ILUB 2PT1A 2I48A 3OOAA 1OMPA 4BDNA 3S9MC 3IOUA 5I58B 1B3GA 3OENA 1S9TA 1D3KA 2QS2A 2XX7A 3TCGA 2ONRA 4ESXA 1MXUA 4ELOA 2HAVA 1B1XA 4QSDA 3R7XA 1B51A 2UYEA 3PMWA 4THIA 1QKBA 1MQJA 4R73A 4R6HA 3U1OA 4YICA 4WKMA 2XXXA 4UACA 5HBCA 1XVYA 3TPAA 1QUKA 3MVWA 3CSGA 1NH7A 2F7AA 1JW5A 4U4SA 4KCCA 3KG2A 4NTLA 5I2NA 1YCJA 3G3FA 2PMSA 1Y20A 2F78A 4YKJA 4OYVA 3Q26A 4NF8B 4QFPA 1RYXA 2ZNTA 4YAHX 5DVFA 2A5TB 5KCJA 1OQGA 2I4BA 2IA4A 2ZXTA 3KN7A 3SEUA 2H99A 2V84A 3KN3A 1PC3A 3H3GA 2IEEA 4TQUQ 1Y4TA 1H43A 3GXAA 2DWAA 2QMWA 3HN0A 4QFNA 4LZ7A 4OFLA 3W9WA 3SEWA 1I6AA 1LAHE 4U22A 1AIVA 4F1YA 3HO7A 1LFHA 2V93A 2ZYMA 1P1NA 4WEDA 4NF4B 2I49A 3LBSA 4PFYA 4G68A 3K6WA 5L9OA 4F19A 4OFOA 2XXUA 3QYTA 3RQTA 3MZ1A 5AA4B 4KR5A 3OMBA 1VE4A 3L6GA 2VHAA 4ZEKA 2P0SA 2Q2CA 3T22A 3R26A 4FECA 3U94A 3OSQA 4O3CA 3KGCA 4QHQA 1OVTA 3FVNA 2D5WA 3FUZA 1POTA 4P11A 3G3JA 1TXFA 4DE8A 1US4A 4R74A 5CC2A 5H8FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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