3E13X

Iron reconstituted ferric binding protein from campylobacter jejuni
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
SELNIYSARHYNADFEIIKKFEEKTGIKVNHTQAKASELIKRLSLEGSNSPADIFITADISNLTEAKNLGLLSPVSSKYLEEFIPAHLRDKDKEWFAITKRARIIAYNKNTNIDISKMKNYEDLAKAEFKGEIVMRSATAPYSKTLLASIIANDGNKEAKAWAKGVLENLATNPKGGDRDQARQVFAGEAKFAVMNTYYIGLLKNSKNPKDVEVGNSLGIIFPNQDNRGTHINISGIAMTKSSKNQDAAKKFMEFMLSPEIQKILTDSNYEFPIRNDVELSQTVKDFGTFKEDQIPVSKIAENIKEAVKIYDEVGFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Small hinge motion by the anion-independent ferric binding protein from Campylobacter jejuni
rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Campylobacter jejuni
molecule keywords Putative iron-uptake ABC transport system,periplasmic iron-b
total genus 122
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e13X02
1FQAA 2Y7RA 1N7XA 4E0XA 1LLSA 1LBCA 2HEUA 3RY3A 1A99A 3TKDA 4MLVA 4KCDA 4F31B 3MZBA 1B9JA 2REJA 4OEUA 1Y1ZA 3KG2A 4YMAA 1IITA 4F3SA 4FATA 2OJTA 2Y7KA 4GL0A 3C9HA 1I6QA 1FQDA 4YAHX 3RTFB 1DSNA 4OZ9A 5DEXA 2I4CA 5HM4B 4PE5B 1ZLQA 2RCBA 2NOOA 4KD5A 1UTBB 2O7IA 1JVYA 5KCJA 3LSFB 3EN3A 3TMGA 4EXKA 1P1QA 1LFHA 3B6QA 3H7MA 4G77A 2QPQA 3CFLA 2FYIA 2DWJA 2DOJA 3K1PA 4QFNA 4QSEA 3IR1A 3V5AA 2ZNTA 3T66A 4LQ5A 3QAXA 2DVCA 4IO7A 4H8IA 1O7TA 4H8JA 1XS5A 2GRVA 5FHOA 5TP9A 1TT1A 2QL3A 1B1HA 4U23A 2V25A 3FVGA 1MS7A 4OXVA 1LSTA 5B7DA 3K02A 4GOTA 4ESWA 1IUDA 1ZIUA 2DWAA 4JWOA 2PBWA 4IO5A 4ELOA 1GV8A 4OVJA 3RUMA 4F19A 4ISUA 3JZJA 3IO6A 5BUUA 3LR1A 1QKBA 2I3WA 2OLBA 3E13X 4HS7A 4XXUA 5CM6A 1B52A 1FQBA 4R2BA 3KJ7A 3T9VA 1XHYA 3H6VA 3VXCA 3OEMA 2UYEA 4F29A 1SI0A 1BKAA 2F7CA 3HO7A 1NKXA 4F2OA 5CRYA 1Y1MA 1I69A 4NF8B 1MY4A 1H3DA 4X1BA 4C1UA 2XXTA 1O63A 5L9SA 4X9TA 2UVIA 4G8HA 4ZS9A 4TLLB 3ILUB 1D9VA 3FASA 1PEBA 2D3IA 2D21A 1ANFA 4PFYA 3THIA 4F39A 5DTBA 3A3UA 1IZ1A 4JB7A 3I6VA 2GFEA 4HCYA 5I58B 2ZYMA 3R6UA 3VV5A 4PFTA 3EF7A 3UA8A 4Z0IA 4GD5A 5CBSA 4G8NA 4BDLA 1P1WA 3C32A 1SYIA 5CMBA 2QMWA 1LAFE 3IOVA 4NMYA 4GLIA 4NF6B 1WDNA 2YJPA 1Y4TA 4XKRA 4MLQA 4UACA 3HPIA 4XKPA 3F11A 1D3KA 3CFXA 2QRYA 3DLNA 2RF1A 5CMKA 4JWXA 1GGGA 4KYSA 2X7PA 1IXHA 4QHQA 1A8EA 4KCCA 4FAJA 4RK2A 1I6AA 3O6HA 1O64A 3C31A 4KHZE 2XX7A 5A5XA 1URSA 1OQGA 3MP6A 4N13A 3IOUA 4O3CA 3TZAA 3C4MA 2IEEA 1YPNA 1MG1A 4IGRA 4P0GA 4QF9A 1MDP1 4R72A 1M5DA 3VVEA 4ZEFA 5CC2A 3PU5A 3PGFA 1Q1KA 4OWDA 3H6WA 4LATA 5I59B 4N07A 2VP1A 3N6UA 4FEDA 2ZNUA 5DYHA 3VE1B 1LFGA 2RC8A 1B3GA 5H8FB 4YKJA 4THIA 1JEUA 1FTLA 2B65A 3KEIA 3PD8A 1LB9A 5ICQA 2PVUA 4YKIA 2NVUB 4LZ8A 3M3KA 3O66A 3MW0A 4M1VA 4G68A 3OO6A 5K2XA 2F6PA 3FJGA 1MQJA 3JYRA 1D9YA 3L6HA 2HZKA 2O7UA 2AIXA 1MQIA 3CIJA 2ALUA 3T96B 1A40A 3TCGA 2XHDA 1FQCA 1ZJLA 2Q88A 1SI1A 1AMFA 1JETA 4DXUA 4XTCQ 3SESA 2H25A 3SERA 4KFQA 5AA4B 1XT8A 3IX1A 3M3LA 2OBGA 1MPBA 5TPAB 4ZZAA 2DE3A 5HPQA 1FTKA 2DXRA 1N0TA 1H76A 1Y3PA 3KSJA 4QSDA 3TFLA 2THIA 4E0WA 4F3PA 2XX9A 1AIVA 5DVIA 2QS3A 1A55A 3W9VA 2RCAA 4KR5A 3W15C 4PFUA 3ECRA 3U94A 4NF4B 2H99A 1B6HA 4NWCA 4RJZA 1Z7ME 2OWTA 4ZEBA 4PQJA 5ITPA 3PV0E 2XXIA 2G29A 2V3TA 1MRPA 4ZDMA 3N94A 2Z22A 4DCXA 3OELA 3KN3A 1CE2A 2E1SA 2XX8A 3O28A 4RK9A 2P1SA 1MY3A 3BKIB 3SETA 4RYAA 3SKPA 4R6YA 3QXMA 2XD3A 4O3BA 3MPLA 1QKAA 3H6TA 1SVXB 1IXCA 3IB0A 4QFPA 3OEKA 4OFLA 1VR5A 2Y7IA 1MM7A 4LUBA 4GIZA 4ZE8A 5DVFA 1VFDA 3K6WA 1Y4CA 3GBBA 3LSLA 5F7VA 1Z7NE 2P0SA 1MH4A 2W7YA 5K2YA 1B3LA 4AB5A 2OZZA 5L9OA 1SQYA 5ELVA 3RLFE 1FTOA 3OOAA 1ZKBA 4DCYA 3HSTA 1F9BA 1UTHB 2HXWA 2Y84A 3ODBA 1P99A 4IO4A 3DP6A 4FJPA 3E3KA 2Y7WA 4ZEIA 4R9GA 2ANJA 2UVJA 2XXVA 1PB9A 4N6PA 2ZYKA 2I3VA 2XXHA 2VHAA 3A09A 1P1OA 2A5TA 2E0SA 3QIMA 4BDQA 3IB2A 1M5FA 2I0CA 1B0LA 4NEDA 2XXQA 5IKBA 2ZXTA 4G8MA 3TTRA 1H43A 3T93B 1TWYA 4QRZA 4R6HA 2NWJA 1JNFA 1S50A 3A3CA 4L17A 3TTMA 3UP9A 3EQ1A 2NUVA 1B7HA 1JW4A 4RNSA 4LA9A 3LC8A 2A5SA 4GFRA 5I56B 2VD3A 4NF5B 4TLMB 5KDTB 3E9XA 2XXXA 4OENA 5AA2B 2OK2A 2UVGA 3GBAA 4FE8A 4QFOA 3D4GA 3DM0A 3QYTA 3UIFA 5HBCA 4WEDA 2O68A 3B6TA 5H8NB 3O6GA 4H5FA 3C35A 1URDA 2HQ0A 1MXUA 2UVHA 2WKYA 3O97A 2R6GE 2Q2AA 4RA1A 3FIRA 3KGCA 1HSLA 3LBSA 3FD3A 3PD9A 5JEIA 1B3FA 3TUSA 3SDFA 4ELRA 1HSJA 3TELA 3HN0A 4JSDA 3FGSA 3QUJA 3K00A 3K4UA 2ONKE 1PBPA 1N04A 5AA3A 3OXNA 1NH7A 1R6ZA 4MH5A 2DP8A 4I62A 3FJMA 2RINA 4BDNA 4YZZA 4R2FA 1MQGA 1LAXA 3G3HA 3MQ9A 3T22A 1Y3QA 3PUVE 4NF8A 1PC3A 2F8DA 4GF8A 1LAGE 1EZPA 1DPEA 2DQVA 4IY6A 1OVTA 2D5WA 4WKMA 3VDFA 3RN8A 2QJEA 2HZLA 3FUZA 2X26A 3UK4A 2F5XA 1GTKA 5EHMA 5L9MA 1II5A 1QUJA 3S9NC 1B3EA 1Y3NA 5I58A 1AH5A 4YKKA 3O29A 3FZVA 3K01A 3Q26A 3SEWA 1Y9UA 5I57A 1B1XA 3FVOA 4OMBA 3S9MC 2O51A 1BP5A 4ELPA 5EYFA 3TPAA 4OESA 1US4A 3UGWA 5KZTA 4XKQA 3LSWA 3KJTA 3K1MA 4NF6A 2Q9TA 4OEVA 1NL5A 4YU0A 3CFZA 1H45A 3EHTA 1TXFA 5B70A 4ELQA 1P1UA 1N84A 5CMCA 2OWSA 3MAMA 1IIWA 3H3GA 1POTA 2NXOA 5A5XB 1MXWA 3OO8A 2PT1A 2H5YA 4EDPA 4GVOA 4MFIA 2H4IA 3MVZA 3O9PA 5FTIA 5CBRA 2VOZA 3V8XB 1R1NA 3SEXA 1QUIA 2Z8DA 3BFTA 4H65A 2ZNSA 3U92A 5I59A 2GHBA 3RPWA 3PUZE 3N26A 1B51A 3PUYE 2Q89A 3WAEA 1USYH 5H8QA 3TQWA 3MUQA 1LAHE 4U4SA 3G3JA 5DVJA 3LUYA 2AL4A 2UYFA 5FHNA 3Q29A 3E4RA 2O84X 5I2KB 1VSOA 4OFOA 3K2DA 1UIUA 1MQHA 5JK4A 4H0WA 1S9TA 3TTKA 3Q25A 4OYVA 1A7LA 3PUWE 1LCTA 3RT8A 2I58A 2B3FA 4BDRA 3FV1A 3OSQA 4JWYA 3PMVA 3UN6A 4Q5TA 3ZKKA 5I2NB 3MVYA 2H9BA 3H06B 4PP0A 3MP8A 1IXGA 3KOTA 4FECA 1NH8A 4EF2A 2F34A 4PFWA 5AA4A 1MPDA 2G93A 4GWOA 5H8HB 5CI5A 4OERA 2FNCA 2M8CA 1XVYA 3VFJA 3EPEA 1MY2A 4JDFA 2HAUA 4LQ2A 4LZ7A 5JTYB 1WODA 3U1OA 2I0BA 1QULA 3MWBA 4IO6A 4G4PA 1JQFA 1MXXA 4P0IA 1URGA 1AL3A 1MXYA 3G7WA 4EUOA 3H4ZA 2I48A 4OHNA 4R73A 2YPNA 3GZGA 4F2QA 2VGQA 2DVZA 3Q27A 3VLUA 4ND9A 1ATGA 3T9UA 3BBRA 4DE8A 1XC1A 2F78A 2ESNA 5ICTA 3H6UA 1GR2A 2DS9A 1H44A 3PPNA 1VFEA 4YB6A 3FXUA 3MVWA 4H67A 3OMBA 3HHGA 3KOSA 4TQUQ 3ILTB 4ZZEA 3AXFA 3CG3A 3IK6B 1MY0A 4DZ1A 2ZYNA 3FV2A 1IQ7A 5AA1A 2ONSA 2I49A 3VLWA 2Z23A 1MXZA 3P7IA 3PMWA 1A54A 2DWHA 3T9HB 1LCFA 3WAFA 4QSCA 3MJNA 4H5GA 1LGBC 3MPKA 3VVFA 1ELJA 4U1OA 1FCKA 3DELB 2KLFA 4G68C 4C1TA 3QUFA 5TU0A 4JBZA 2F6GA 1A8FA 1SDXA 1JVXA 1OLCA 1DTGA 4R9FA 4UA8A 2XXYA 5H8SA 3S2VA 1B3HA 5IAIA 4JXIA 1MY1A 2PX1A 1CB6A 3IB1A 1ZMGA 2I6EA 2H98A 3T9XB 3N5LA 4NTLA 2A5TB 1L5TA 2V93A 4QFKA 4JSOA 1NNPA 1B05A 1JW1A 3LSXA 4GXSB 1IXIA 1BTJA 4Z7EA 3TTLA 3IAZA 3UORA 3TQLA 1HSEA 4F1VA 3MZ9A 3CVGA 3V83A 2F97A 3N6TA 3EHUA 4RY1A 2Z8EA 4RPNA 3K0VA 2XXUA 5DEXB 1NNFA 1M5BA 3I3VA 1IEJA 1B5IA 1B7UA 2Y7PA 3I5OA 5KCJB 4R6KA 4Q30B 1SW2A 1UTBA 3K1NA 4HCWA 4G2ZA 3RQTA 5I56A 4ZEDA 4NF5A 2XXWA 5KDTA 3G3KA 4U22A 4F1YA 5AA2A 2QS1A 3DP4A 3SEYA 3CSBA 4FIMA 1FW0A 3USDA 5TP9B 4M4GA 3SEVA 5H8NA 1R9QA 2ONRA 1T0KA 3C34A 2RKMA 4F18A 4P11A 4LONB 2QMXA 1LFIA 5CMMA 4DXBA 2LAOA 4X1DA 1JW5A 1YTVA 1ZBMA 3PUXE 1FQEA 3IJXB 5I84A 2B3BA 1J1NA 4TOZA 4IB2A 4WEPA 4BDOA 3M3FA 3TCHA 3FXQA 1LBBA 1MQDA 1XOCA 2IA4A 1B5HA 1RKMA 3V89B 3ZS6A 3O6IA 3PPQA 4DDDA 2HFBA 2RC9A 4LP2B 1AOVA 1MPCA 4R75A 4ESXA 3U72A 1N3XA 4GXAA 3GLBA 1POY1 3MVXA 2UXAA 4EQ7A 4MBPA 3Q28A 3M8UA 4C0RA 1NNKA 2DYXA 4H6DA 5L8DA 3IOTA 4OFJA 2V3UA 1QVSA 4AB6A 5I57B 1M5CA 4RXLA 4Q8RA 2DXYA 4I9DA 1EU8A 2AYSA 5FTHA 3MBPA 3JV9A 2F36A 4I1DA 2F35A 1B7ZA 3KSXA 5AE4A 4K3FA 4KYDA 2ZMBA 1Q35A 2Q2CA 1SW1A 4WXJA 2ABHA 2DWIA 4H1XA 1B4ZA 1ZTYA 1S7YA 1N76A 5M2VA 4U1ZA 1GVCA 1MM6A 1MXVA 4Q0CA 4OQOA 2O1LA 1DPPA 1UQWA 3CSGA 2O6AA 3MZ1A 3PPRA 3FXRA 1EZ9A 1SD3A 1FQFA 1DOTA 2V3QA 1OVBA 3C36A 4KYEA 5FHMA 1OMPA 2GHAA 2VD2A 3K6UA 1B0HA 3D4CA 5LOMA 1N3WA 2R71A 3O2AA 4YB7A 4DIGA 3TCFA 3TTNA 3VVDA 3U8QA 4EQBA 2ZYOA 2RC7A 3S4UA 3PPOA 3RNNA 3OD7A 3RT6B 2FA7A 3R7XA 5J1DA 1DMBA 5H8FA 1P1NA 3OSRA 4IGTA 4LZ5A 3RTWB 1PB8A 4G68B 4U2RA 2X7QA 4BDMA 5H8QB 3ZSFA 4NWDA 1PBQA 4KI0E 3VLVA 1SW5A 1RYXA 3FJ7A 3U93A 1DTZA 3ZKLA 4FEBA 4GL8A 2F7AA 1OQHA 3K6XA 1MDQA 2P2AA 4F22A 1USYE 3MC2A 4YMBA 4F1UA 2OCUA 5ISUA 4R74A 2XXPA 5I2KA 1TFAA 3KBRA 1Y20A 1D4NA 4X48A 3SEUA 5BWJA 2I4BA 3PMXA 3OO7A 3OENA 3G3IA 5DT6A 4ONYA 1QUKA 3HV1A 3H03A 5AA2D 1TFDA 3C33A 3IO4A 3PPPA 3IORA 2PT2A 1SBPA 3TEPA 1EH3A 5I2NA 2XD2A 3GXAA 4POXA 1ZU0A 2REGA 2CMOA 4U21A 1NFTA 5TPAA 2DSFA 4LVQA 4ZECA 3K6VA 1EZOA 1OLAA 4BLAA 3MP1A 4KQPA 2QS2A 1B46A 5H8HA 4DXCA 5ITOA 3FVKA 3HCQA 1RYOA 1FTJA 4YICA 1B58A 2AL5A 1PB7A 1B5JA 4KPTA 1SYHA 3B7DA 1YCJA 4MF3A 3BFUA 5JTYA 2QSXA 3KZGA 1M5EA 4NF4A 3S9LC 4ZEKA 2PYYA 4IY5A 2HAVA 1VE4A 2CZLA 1XVXA 4POWA 3CI8A 4EF1A 4YKPA 1B4HA 1KWHA 4OTEA 3OO9A 4EXLA 3IL1B 3QSLA 3G3GA 1WVJA 2GH9A 2YLNA 4F3BA 1N7WA 2O1MA 3ONMA 4U4XA 2XXRA 3L6GA 2Q8JA 2BJJX 2PMSA 1QJMA 1I6BA 3RGYA 3CR9A 4PETA 4OETA 2DE2A 1BIYA 1QW0A 3KFMA 4XKNA 4XIGQ 3TODA 4I8CA 1US5A 4DLDA 4GQOA 4IO3A 1UIVA 3KN7A 3DP8A 1B32A 2HCAA 2O69A 3IOWA 1NMUA 3W9WA 1FTMA 3CRBA 4FORA 2V84A 4QFLA 4O3AA 3IJOB 4IO2A 3G3FA 3FVNA 3TYHA 1B40A 1SW4A 5F1QA 3TDJA 1MH3A 4HW8A 1JEVA 4GRKA 4HTGA 3B6WA 1NNTA 1LB8A 3R26A 4F3GA 3CG1A 1B2HA 4RPOA 1UTHA 5EHSA 3FATA 2F7BA 3HHFA 2R9JA 1PDAA 2Z8FA 3KN8A 3VXBA 4EQ9A 3EHSA 1BLFA 4ECFA 2QS4A 3QK6A 4AQ4A 4ZE9A 2DE4A 1OIBA 4NE4A 3TAJA 3S9EA 4YB5A 1YAEA 1R9LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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