3E9XA

Crystal structure of the complex of c-lobe of lactoferrin with nimesulide at 2.7 a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the Complex of C-lobe of Lactoferrin with Nimesulide at 2.7 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Lactotransferrin'
total genus 110
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2008-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3e9xA02
2P2AA 4H5GA 1HSJA 3DELB 3H7MA 1R1NA 5L9OA 4F29A 2ANJA 3ZKLA 1SD3A 2UVJA 4F1YA 3OEMA 3MBPA 4KYEA 1LAGE 5K2YA 3O6IA 2ABHA 1LBCA 2XD2A 1N3WA 1A40A 1SW2A 4G68C 5F1QA 3H6TA 2CMOA 3ONMA 1NKXA 4O3CA 4KPTA 3CSBA 3PGFA 3RN8A 2XX7A 3QK6A 5KDTA 4PFTA 4F1UA 3D4GA 4U4XA 1JETA 2V25A 2VGQA 4BDNA 3H3GA 1XVXA 1US4A 3U94A 4NF5A 2OK2A 2DWIA 1Y4TA 1PB7A 5IAIA 2F7BA 1US5A 3FD3A 2NOOA 3OO7A 2F6GA 4YZZA 3U93A 2I3WA 2BJJX 3RTFB 3C34A 3E4RA 3A3UA 1OQHA 4H65A 2DE4A 5FHMA 3IORA 3IB1A 1UTHB 3T93B 4FAJA 3V83A 4ZZAA 4GRKA 5I2NB 2R6GE 4I1DA 4EDPA 1URSA 1ZBMA 2E0SA 1FTOA 2F78A 3MP6A 1I6AA 4H6DA 4ZS9A 3FZVA 3TTLA 4U1OA 1LAFE 3VVEA 2V3UA 3CFLA 1M5FA 3ZS6A 3MWBA 1B3FA 4X1BA 2D5WA 4XTCQ 4Z0IA 5L9SA 5H8NB 4OEUA 1XS5A 4R75A 3MZ1A 4F39A 2P0SA 2PT2A 4RPOA 3S9EA 1B3LA 1GR2A 4F22A 1MDP1 2HZKA 1B3EA 4NTLA 3KOSA 3O28A 3P7IA 3LC8A 4O3BA 3M3KA 1FTJA 3PMVA 2Y84A 1RYOA 4OFOA 4I8CA 3PPNA 1DTGA 3KJ7A 1Z7ME 1MRPA 1B3GA 4Z7EA 1SI0A 3PV0E 1D3KA 5DEXB 2NWJA 3FUZA 2GHAA 4BDMA 4WEPA 3K02A 2GFEA 5KCJA 3FV1A 4DXCA 3Q26A 2QPQA 2Z23A 3SKPA 4ZE8A 3T9VA 4R72A 1MXVA 1XC1A 4LZ7A 5AA2B 2ZNUA 1P1NA 1IIWA 2F35A 5EYFA 4MLQA 1N7WA 3Q28A 4ELRA 5I57A 1B7UA 1PC3A 2XXQA 3QUFA 1TT1A 3CIJA 3IR1A 4M1VA 4OESA 1AL3A 2F7AA 1IXHA 4ELPA 1MY4A 3UN6A 3IOTA 3HSTA 4DIGA 5H8QB 3FJMA 3MP1A 4RJZA 4IO6A 3I5OA 3RQTA 1PB9A 3IOUA 3RY3A 3TQLA 2UXAA 5CRYA 5AA3A 1CE2A 1QKBA 2RCBA 3OO9A 3TTNA 1TWYA 3S9NC 3KZGA 4MF3A 1QJMA 4FECA 1MY0A 3VLVA 2ONKE 3FXRA 1SI1A 3AXFA 4TQUQ 2V93A 1MXWA 3Q27A 5AA4B 4R73A 2XX8A 2YPNA 5BUUA 3CI8A 2PVUA 4U1ZA 1N84A 3MJNA 5H8NA 3KSXA 4DE8A 5H8HA 4QFKA 2I4CA 4Q0CA 1EU8A 1UTBA 1A54A 1O64A 1NNPA 2XXIA 3CFXA 3IAZA 1B05A 3IOWA 3CFZA 3RT8A 1NNTA 5TP9A 3FVOA 4IY5A 4ZEFA 3VXBA 4XKNA 2Y7IA 1OVTA 4F3GA 3VLWA 3EHUA 2V84A 2X26A 1B0LA 1MXYA 1LFGA 4ISUA 5DVJA 2R9JA 3DP4A 5K2XA 4ZEDA 3K00A 2ZYNA 1ATGA 2AIXA 3TODA 3R6UA 2DVCA 3JYRA 5FHOA 2DYXA 2OLBA 2I4BA 3LSFB 1QUJA 1YPNA 1MQJA 3PPRA 1UQWA 4BDOA 3R7XA 1LSTA 1MXUA 4EUOA 3EPEA 3VDFA 4QHQA 5DYHA 2A5SA 4EQ7A 3N5LA 3PD9A 3BBRA 5DT6A 1R6ZA 3SEUA 2PX1A 4PFWA 4MBPA 3ZKKA 4Q30B 2QMXA 1O63A 3PUWE 3K6XA 3PU5A 2X7QA 4F3PA 2DXRA 5KDTB 1LBBA 2XXWA 2QMWA 1GTKA 3OO8A 3SESA 3C35A 2D3IA 4NF5B 4OQOA 3HHFA 1LLSA 3HHGA 3G3HA 3C4MA 1WDNA 1ZU0A 3OENA 3QUJA 3LSLA 4DXBA 4NF6A 4R9GA 2H25A 4QFOA 3UIFA 4RNSA 1MDQA 2XXXA 4R9FA 3UP9A 4OETA 3OD7A 4GQOA 2V3TA 4H67A 1FQEA 2P1SA 5AA1A 3A09A 1NMUA 4GVOA 2PT1A 3TEPA 1DSNA 5CMBA 3KSJA 5BWJA 1USYH 3HPIA 3BFTA 3JZJA 4N07A 4KYDA 2I6EA 4H8JA 1EH3A 3N94A 3PMXA 3QSLA 3DLNA 1HSLA 3HN0A 1GVCA 4JB7A 1FTKA 5LOMA 4G77A 2HAVA 2HZLA 1LCTA 1SDXA 1MXXA 2XD3A 4YMBA 1NNFA 1NL5A 1D9VA 1SVXB 4OXVA 2F7CA 1N3XA 2QSXA 2G29A 4RA1A 3UGWA 3O6HA 3H4ZA 4U21A 2ZYKA 2Y7PA 3MVWA 2DWHA 5JEIA 4X1DA 4O3AA 3C33A 3K6WA 3MUQA 4OERA 3OO6A 2M8CA 5KCJB 2XXRA 2X7PA 3CVGA 1LB9A 1SW5A 2XHDA 4K3FA 1LB8A 4H0WA 3VVFA 4P0GA 3N6UA 4H5FA 3S2VA 4GL8A 3B6QA 4PFUA 1I6BA 2ONRA 5I57B 4LZ8A 3RLFE 1Y3QA 3D4CA 1BIYA 4KHZE 4R6KA 4F2OA 4FEDA 5ICQA 4F2QA 1B3HA 2E1SA 1NNKA 4MFIA 4NF4A 1POTA 1H45A 2V3QA 5F7VA 5CBRA 2HQ0A 4WKMA 3MZBA 3DM0A 3GXAA 3U72A 5I2KB 3B7DA 2OZZA 2UVGA 2HCAA 3OEKA 1TXFA 3DP6A 4QFNA 2OCUA 1A8FA 4IO7A 2H98A 5I59B 3TCHA 1QULA 3JV9A 3TPAA 2OWSA 1D9YA 4QRZA 3I6VA 2OJTA 3PUVE 3MP8A 4YMAA 1JW1A 3OSQA 5H8HB 3V8XB 1UTBB 2PBWA 4GFRA 4FJPA 1IZ1A 2AL5A 2FNCA 1LFIA 1MQIA 4MLVA 1MM6A 3KN7A 5TP9B 2DE3A 4AB6A 4G2ZA 3M3FA 4BDRA 1EZOA 3T22A 1MM7A 2Q2CA 4IO5A 4TLLB 3OXNA 3G3KA 3SEVA 4RXLA 3SERA 2B3FA 1PBPA 1VFEA 1OLCA 1LFHA 3K1NA 1UIVA 2I58A 3TKDA 2QS3A 4GD5A 4JWOA 2H9BA 2I3VA 1URGA 3KN3A 1MQGA 4ZECA 3KN8A 2HXWA 3G3IA 3LSWA 3K6UA 5I84A 1MG1A 3GBBA 4ZE9A 3QXMA 4GOTA 3LSXA 2VD2A 2F34A 1DPEA 4EXKA 1N76A 4YICA 4NF8A 3S9MC 3KBRA 2DVZA 3IL1B 3VV5A 3TYHA 2DE2A 3TTKA 3A3CA 2UYEA 1II5A 1FQAA 1WVJA 4IY6A 2ZNSA 4F3BA 5CI5A 2RINA 3U8QA 4QFLA 5ICTA 1CB6A 4U4SA 5I2KA 1MPCA 4R6YA 1M5BA 1QVSA 4ND9A 3MW0A 3UK4A 5CMKA 2IA4A 3FIRA 3FGSA 3KOTA 4N6PA 2H5YA 3FATA 1OMPA 4XKQA 4EXLA 3PUXE 5I59A 4YKKA 1ZLQA 3QAXA 2ZYOA 4I62A 2REGA 2ZNTA 4YAHX 1XOCA 2DWJA 1A7LA 2XXVA 3QIMA 2NUVA 4FEBA 4GWOA 1O7TA 4NF6B 4GF8A 3G3GA 1UIUA 3CG3A 1PBQA 4GXSB 4HCWA 4G68A 4KR5A 3IO4A 3PUZE 4OZ9A 4JSDA 3RT6B 3FVGA 1SQYA 4Q8RA 3IOVA 3EN3A 2B65A 2Z8FA 3TFLA 4NWDA 4E0WA 2F36A 3RPWA 1PEBA 3MVYA 2CZLA 3IB0A 2F97A 1SYIA 1OLAA 1IEJA 4H1XA 3VVDA 1VSOA 3TELA 1MQHA 1SW4A 1IXGA 3K01A 1ZKBA 1HSEA 3N26A 1B7HA 1RKMA 1USYE 3C36A 4DCYA 1POY1 4R2BA 2VP1A 3C9HA 3VLUA 3PMWA 1OQGA 1ANFA 3ODBA 1IITA 5L8DA 1A8EA 1AMFA 2AL4A 2O1MA 3GLBA 3TMGA 2G93A 2QL3A 4OVJA 3U1OA 4OFLA 1PDAA 4ONYA 3K1MA 4ESWA 2H99A 4ZEBA 4XKRA 1DPPA 3SETA 5HPQA 3TTRA 1RYXA 2AYSA 4IGRA 1JEUA 5A5XB 4F18A 2O7UA 1Y4CA 1ZJLA 2THIA 2I49A 1MPDA 3HV1A 1URDA 2Q8JA 1QUKA 3LR1A 2DQVA 3FXQA 1M5EA 2RC9A 1EZ9A 3VXCA 3KFMA 2REJA 5FTHA 4NF4B 1MY2A 3FVNA 3O66A 4OMBA 2I48A 1EZPA 4TOZA 1JVYA 3DP8A 3EHSA 3H6UA 1SBPA 3PPQA 2LAOA 3TQWA 1JW4A 3ZSFA 3L6GA 4QF9A 1JEVA 5AA2D 1S9TA 3S4UA 4LVQA 4THIA 4BLAA 1B1HA 4G8MA 3BFUA 1AOVA 3O9PA 2QS4A 4QFPA 1P1UA 3BKIB 3Q25A 5CMMA 3VFJA 4RK2A 4R74A 1FTLA 5CC2A 3IJOB 3H03A 3RUMA 4F31B 1TFDA 3T66A 3E9XA 3HCQA 2PMSA 1BP5A 5FHNA 4ELQA 1LAHE 3OSRA 3IB2A 3HO7A 1FQDA 3T9UA 4GIZA 1VFDA 5M2VA 3M8UA 1FW0A 4Q5TA 3PUYE 3W15C 1DTZA 4E0XA 5I56A 1MS7A 3ILTB 1Y20A 3TAJA 4AB5A 1H43A 4XKPA 4ZEKA 1WODA 5DVFA 1B4HA 4F3SA 3USDA 2O68A 2YLNA 1B5JA 4LQ2A 2OWTA 1P1WA 2O69A 2QJEA 4NMYA 5ITOA 5HBCA 4ZEIA 4QSDA 1L5TA 3O6GA 1ZTYA 4EQ9A 5IKBA 2W7YA 3TTMA 3PPOA 4NE4A 1F9BA 1GGGA 1VR5A 1ZIUA 2Q88A 5ITPA 3K4UA 3KG2A 1YCJA 3FJGA 5A5XA 2XXUA 4OEVA 2ALUA 3S9LC 1BKAA 1Q1KA 1BTJA 1MXZA 4NF8B 2H4IA 4F1VA 2UVHA 4LATA 2DS9A 4R6HA 3VE1B 2GHBA 4MH5A 4LONB 3QYTA 3T96B 4LQ5A 1B7ZA 3T9HB 2RC7A 5DTBA 2A5TA 2DP8A 3TCGA 4XXUA 1I69A 5FTIA 5I58B 1FQBA 1T0KA 4N13A 1LGBC 3MVXA 4X9TA 4IO3A 4KQPA 5H8FA 1FQCA 1B9JA 2RC8A 4KI0E 4PFYA 4GLIA 2HEUA 4EQBA 1A99A 3CSGA 2ZXTA 3EHTA 4HTGA 5EHMA 2DXYA 1MH4A 3FXUA 2Y7RA 4G68B 1B58A 2O51A 3CRBA 1P99A 1AH5A 4KCDA 3IJXB 3FASA 2Q9TA 1JW5A 5KZTA 3GZGA 1NFTA 1DOTA 3MPLA 1ELJA 3T9XB 1D4NA 3KGCA 2Z8EA 3WAEA 3W9WA 1IXCA 1MH3A 4U23A 3FV2A 3KJTA 4G4PA 1GV8A 1Y1ZA 1MPBA 2XXHA 1LAXA 4FATA 4LZ5A 4LUBA 3IK6B 2F8DA 5CM6A 4C0RA 3RTWB 2GRVA 4L17A 1QKAA 5EHSA 4OYVA 4BDLA 3C31A 1Y3PA 4YU0A 2B3BA 2FA7A 1B6HA 1JQFA 1JVXA 2Q89A 4LP2B 4XIGQ 4WEDA 3TZAA 3SEWA 2ZYMA 4EF2A 2D21A 3C32A 4QSEA 1B1XA 2ZMBA 1N7XA 4ZZEA 3H6VA 4IB2A 4G8NA 4YKPA 3WAFA 2F6PA 3I3VA 3G7WA 1OVBA 3K6VA 3B6TA 4F19A 4JDFA 1DMBA 4ECFA 3K1PA 5J1DA 4G8HA 1YTVA 2GH9A 3O29A 1LCFA 2VOZA 4RK9A 2DWAA 1YAEA 2XXPA 4POXA 1B5IA 3IO6A 3TDJA 4UA8A 3GBAA 2NXOA 3V5AA 5I58A 1UTHA 4POWA 5CBSA 2O1LA 2XXYA 5JTYB 2VHAA 3LUYA 4FORA 3MVZA 1M5CA 1ZMGA 3O2AA 2HAUA 5L9MA 5I2NA 1P1OA 4KFQA 4JWXA 5DVIA 4YB6A 4PQJA 1B40A 1Y3NA 4DZ1A 1P1QA 3TCFA 1FQFA 1H76A 1B4ZA 1NH8A 1BLFA 3E3KA 1Y9UA 4OENA 4DDDA 1KWHA 2UYFA 4OTEA 3EF7A 4HS7A 5AE4A 1VE4A 4PETA 4AQ4A 2RF1A 3SEYA 4ESXA 5JK4A 1MY3A 4RYAA 4NEDA 3CR9A 1FTMA 1B51A 1Y1MA 5CMCA 3FVKA 4X48A 1SYHA 3RNNA 5HM4B 3TUSA 2FYIA 3EQ1A 4HW8A 3CG1A 4DCXA 4R2FA 2Q2AA 2Z22A 2KLFA 3W9VA 4QSCA 5ELVA 2PYYA 4JXIA 1OIBA 4IO4A 3H6WA 1MQDA 4P11A 3V89B 4OHNA 5B70A 5ISUA 3G3FA 1N04A 4TLMB 5DEXA 2I0CA 3SEXA 1B32A 2XXTA 2DOJA 5TPAB 2QRYA 4LA9A 1IQ7A 4NWCA 1FCKA 1J1NA 3B6WA 4IO2A 3OMBA 4RY1A 3H06B 2OBGA 5I56B 1AIVA 2ONSA 2ESNA 1PB8A 5H8SA 3MC2A 3R26A 5AA2A 4OFJA 4H8IA 4RPNA 3M3LA 1Q35A 4PE5B 3OELA 1R9LA 4EF1A 4M4GA 1JNFA 2O7IA 3IX1A 4UACA 2Z8DA 3LBSA 4YKIA 2HFBA 4GL0A 2WKYA 2O6AA 3MPKA 2QS1A 1Z7NE 1I6QA 3RGYA 5H8QA 2XX9A 3K2DA 4IGTA 4WXJA 3E13X 3KEIA 4FIMA 5JTYA 3MAMA 4ZDMA 4C1TA 1N0TA 1S50A 3Q29A 4I9DA 1A55A 4PP0A 5TU0A 3U92A 1R9QA 1H44A 4P0IA 2R71A 1S7YA 1IUDA 2RKMA 2DSFA 1QW0A 2Y7KA 3F11A 3L6HA 3G3JA 4YKJA 3ECRA 3K0VA 5AA4A 2VD3A 5B7DA 4FE8A 4U2RA 2A5TB 1TFAA 4DXUA 1B0HA 1B46A 4JWYA 1QUIA 1XVYA 4YB7A 1XT8A 4C1UA 1B5HA 3UORA 5H8FB 1XHYA 3PPPA 2UVIA 2IEEA 1NH7A 4OWDA 3O97A 2Y7WA 1B2HA 1H3DA 2I0BA 3FJ7A 3THIA 1B52A 4DLDA 1M5DA 1SW1A 1MY1A 2O84X 4JBZA 4ELOA 2QS2A 4HCYA 4KCCA 4JSOA 1IXIA 4BDQA 3ILUB 5TPAA 4KD5A 3SDFA 3PD8A 2YJPA 4GXAA 2F5XA 4YB5A 3MZ9A 3OOAA 3N6TA 2NVUB 3MQ9A 2RCAA 4U22A 4KYSA 3UA8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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