3EN3A

Crystal structure of the glur4 ligand-binding domain in complex with kainate
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
TVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYTEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Correlating AMPA receptor activation and cleft closure across subunits: crystal structures of the GluR4 ligand-binding domain in complex with full and partial agonists
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 4,Glutamate receptor
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3en3A02
4F22A 4U4SA 5CRYA 5AA2A 3H03A 5DVFA 1N7XA 3UGWA 3QIMA 2I4BA 3O28A 3TAJA 1JQFA 4KPTA 3O9PA 5L9SA 4M4GA 3N6TA 2DYXA 3LUYA 1MH3A 1IIWA 1AOVA 3OO6A 3S9EA 4POXA 4LQ5A 3TPAA 2VP1A 4YB7A 1EZ9A 4XIGQ 5LOMA 1A54A 4U23A 2V84A 5FHOA 1JEVA 3H7MA 3O97A 1MXUA 1N84A 3M8UA 2Q88A 4R73A 3R6UA 2XX8A 4OFJA 3TCGA 2PT1A 1B0HA 1B58A 3U1OA 3QUFA 4KYEA 3IB1A 2Z8EA 5FTIA 3H6UA 2F34A 3IR1A 5H8FB 1POTA 1WVJA 4HTGA 2GRVA 4GRKA 2GH9A 3QSLA 1DOTA 3S9LC 3TEPA 1EZOA 1VE4A 3MWBA 1ZIUA 1B7UA 1NMUA 2OCUA 2QL3A 3CFXA 3EHTA 1PBQA 3O29A 2GFEA 3VLUA 4N07A 1N76A 1B7ZA 2VOZA 4MBPA 1DPPA 4ELRA 2P0SA 2ZMBA 4YMAA 3GLBA 4I9DA 3T93B 3BFTA 2XD2A 4OHNA 1RKMA 5CMBA 1QULA 2AL4A 4RK2A 1OQHA 4NF4A 3OD7A 1IXHA 1USYH 5TPAB 4JB7A 3IOTA 1QUJA 3E13X 5KDTA 2CMOA 4H8JA 3MP1A 1Z7ME 4EQ7A 1JNFA 1LCTA 4MLQA 3ZKKA 3M3FA 3IL1B 5ELVA 2ONSA 3PMXA 1P99A 1B3FA 3FXQA 3TTMA 4KD5A 4PFUA 4EXLA 4F2QA 4OVJA 3FJMA 4ELPA 3ILTB 3DP4A 4PP0A 5I2KB 5AE4A 2RCBA 4FEBA 1YAEA 3OO9A 2QS4A 4QFOA 1SW4A 3K4UA 1XHYA 2I3WA 3SESA 1RYXA 4G8HA 1B9JA 4I8CA 3T96B 2VD2A 1NKXA 3O2AA 2DE2A 1NNTA 2QMWA 4QSDA 4GFRA 4QFPA 3KFMA 1H76A 2CZLA 1GR2A 3LSLA 2ABHA 4O3CA 4F2OA 1SI0A 3PMWA 2FYIA 2PYYA 3U93A 4U1OA 4BDNA 3WAEA 4KCCA 2RF1A 1PEBA 3G3JA 4OWDA 4F18A 3V83A 5BUUA 5CC2A 3MZBA 4THIA 5KZTA 4RNSA 5H8FA 3IO4A 3T9XB 1VR5A 3PD9A 1ZTYA 4POWA 3RN8A 5J1DA 2X7PA 3RGYA 2DWJA 1NNPA 2HZKA 4U21A 3AXFA 1MPDA 2I6EA 2R6GE 4OEVA 1MQHA 1XT8A 3TTRA 4FE8A 3UA8A 1M5DA 4ESWA 3KN8A 4RPOA 1FQFA 1ZU0A 4BDLA 4IO5A 3RTFB 4U2RA 3T9VA 2DWIA 4ELOA 2I48A 1NL5A 4F29A 3SDFA 3VVFA 5TPAA 2E1SA 4X48A 2Q2CA 3H06B 1IXCA 3OSQA 2UYFA 1IXGA 4OZ9A 4YICA 3FVKA 4YAHX 1ZJLA 4H5FA 4PE5B 3MVYA 5TP9B 2PBWA 3F11A 1NH7A 2G93A 1UQWA 1SW1A 3MC2A 1XVXA 1R9LA 3IJOB 1B51A 4JSDA 1H45A 2DP8A 4LATA 5L9MA 3O6IA 1B3EA 1FCKA 4DXCA 3DELB 3IORA 1US5A 3ZS6A 5I2KA 2F7CA 4N6PA 2Q89A 4H8IA 4LA9A 2DOJA 4R2BA 4KCDA 1B1HA 5B70A 3IOVA 3JV9A 4C1UA 1YCJA 2ZNUA 2V3QA 1GTKA 2Y7IA 3QK6A 4G68B 2REJA 1P1UA 2REGA 1B05A 3KG2A 1Y20A 1D9VA 2ZYNA 1MQGA 1Y1MA 4Q0CA 4YKJA 4BDOA 1LFIA 2O1MA 1KWHA 3G7WA 1MQIA 1AMFA 3LSFB 2D5WA 5FHNA 3W15C 1B32A 3A3CA 4KI0E 3TODA 1LAGE 5I2NB 3U92A 5JK4A 2O1LA 4HS7A 1H3DA 3OOAA 2OLBA 3D4CA 2IEEA 3PUZE 4XKQA 2GHAA 4NEDA 1ZMGA 4QSCA 1P1OA 5DT6A 4DE8A 4LP2B 4ONYA 2HFBA 3RT8A 1XC1A 1EH3A 4H0WA 1ANFA 1SW2A 3C34A 3K00A 5M2VA 3Q29A 5I59B 4XKRA 5EHMA 3PPPA 4BDMA 3HO7A 3FASA 3C31A 4TLLB 1HSJA 4WEPA 4H6DA 5H8QB 1UIUA 3SEUA 3QUJA 2X26A 4Q30B 4FEDA 1LBCA 2B3BA 4EQ9A 5I84A 3I5OA 4Q8RA 5FHMA 2H98A 1HSEA 2H99A 3IOWA 4UA8A 1M5EA 3PPOA 3MVXA 5L9OA 5IAIA 1LB9A 3MPLA 2ZNSA 3S9NC 3A09A 1LB8A 3OO7A 5HM4B 1QUIA 3HHFA 1B5IA 4PFYA 3KOSA 2Y7WA 4HW8A 5TP9A 1IZ1A 4YKIA 5KCJB 4G8NA 4ECFA 1XOCA 3K6WA 3E3KA 5AA1A 4LZ5A 1Y9UA 5I58B 4NWCA 1F9BA 4QFKA 1WDNA 3I3VA 5DVJA 3ODBA 4BDQA 5CBRA 5K2YA 2XX7A 1N7WA 3CFZA 5ITOA 3LSWA 2OWTA 3TQWA 4YKKA 3RUMA 1XS5A 1BIYA 2PMSA 4JWYA 4G68A 1IQ7A 2VGQA 1M5FA 3KGCA 3HN0A 4R9FA 3UP9A 2F7AA 2R71A 4BDRA 3TCHA 4NF5B 3WAFA 4ELQA 1SI1A 3T9HB 4U4XA 2YJPA 2HAUA 3N6UA 4DXBA 2DQVA 2Q2AA 5AA4B 1FQDA 2NXOA 2XXHA 5I2NA 3UK4A 4ZECA 3K0VA 3SEXA 2OK2A 1VFDA 3O6HA 1ZBMA 4OFLA 1FQAA 1LAXA 5JTYB 2LAOA 2QS1A 4OFOA 4RJZA 1SQYA 2ESNA 1FQBA 2F35A 1OMPA 4QFNA 1TWYA 2XXYA 4Q5TA 3W9WA 2XXTA 4G77A 1A99A 4ZS9A 3FV2A 3RT6B 1Y3QA 2HZLA 1JVXA 5I59A 3TMGA 3TELA 3R7XA 1MG1A 4IGRA 1B3LA 2XXWA 1Q35A 4HCYA 2YPNA 3H6WA 3MVWA 4JWXA 3TQLA 2F8DA 1I6QA 2M8CA 3KZGA 3K6VA 3DLNA 3U8QA 4DZ1A 3Q25A 4YMBA 5A5XB 3T9UA 5DEXB 1MXWA 4OENA 3N94A 1MXVA 4FJPA 1LGBC 2OWSA 3C9HA 3LBSA 3HPIA 3IX1A 4FORA 3FUZA 2PT2A 5CI5A 3CR9A 3Q28A 4E0XA 4H65A 5KCJA 4FIMA 1N3WA 5CMMA 3G3GA 1USYE 1SBPA 4ZEBA 4EDPA 3ILUB 2HXWA 1ATGA 4F1VA 4NMYA 5I58A 1O7TA 3A3UA 1N0TA 4JXIA 4GL0A 2I0CA 4ZEIA 2H9BA 3TTKA 1EZPA 4R2FA 1R9QA 2W7YA 1D9YA 3Q26A 3RQTA 2D3IA 4Z7EA 2RCAA 1BTJA 1FTLA 5I56B 4ZZEA 4TQUQ 5H8NB 3H6TA 2XXVA 1UTBB 2QS3A 3OSRA 3N5LA 4YKPA 5H8SA 3RLFE 5ISUA 4P11A 2Z8DA 3ZSFA 4R9GA 3IK6B 4NF5A 4H67A 4IY6A 3K02A 4RA1A 4PETA 4P0IA 4TOZA 3B6TA 5AA4A 4XKPA 4LQ2A 2I49A 4XTCQ 4R6KA 4GOTA 3C4MA 4EF1A 2D21A 4NE4A 4IO4A 2F6PA 3USDA 2DWHA 4K3FA 2DE3A 2F5XA 3LC8A 4R6HA 4DLDA 5F1QA 5BWJA 3K2DA 4YB6A 4IO3A 3H6VA 4X9TA 4IY5A 4OTEA 5ITPA 5HBCA 1P1NA 1Y3PA 3K6UA 3LSXA 3P7IA 1B6HA 4FECA 1BP5A 1DTZA 2UVHA 3IB0A 4ESXA 4R74A 1MDQA 2UXAA 2RKMA 4Z0IA 1LCFA 1H43A 4OMBA 2E0SA 4KHZE 3DP8A 3MP6A 4ZE8A 4F19A 5A5XA 4OERA 4F1YA 3PGFA 3HV1A 3BKIB 1SVXB 2O7IA 3RNNA 5I57B 2UVJA 4R72A 1QVSA 1A55A 1B4ZA 5IKBA 1MXYA 1Z7NE 3C33A 2HEUA 3KBRA 4NF6B 4GXAA 3VFJA 1GGGA 2V93A 3TTLA 1MS7A 3K1PA 4RY1A 1I6BA 2O6AA 1URDA 4TLMB 3MUQA 4C0RA 4L17A 1B4HA 3UORA 2IA4A 2PX1A 3PUWE 4GVOA 1JETA 4N13A 4GLIA 3SEWA 4GD5A 3FZVA 1B52A 1LAHE 4YU0A 3FJ7A 3LR1A 5AA2D 3N26A 2XXRA 4UACA 1JW5A 5I56A 1FTKA 5B7DA 1QUKA 3PPRA 5H8NA 3QYTA 2UVGA 3FVGA 1FQCA 3R26A 1MXZA 1MQDA 4IB2A 1UTBA 2V25A 3G3KA 4H5GA 3MQ9A 3M3LA 2RC7A 1B2HA 2F36A 5EHSA 2RC9A 4QSEA 3HHGA 4MF3A 4EQBA 4ZE9A 1P1WA 1D3KA 1OIBA 4NTLA 1R1NA 1B3GA 3KSJA 4QHQA 3KEIA 1DMBA 4GF8A 1B40A 1TFAA 3V89B 3MVZA 2XXPA 4O3BA 2DXRA 2H5YA 3IB2A 3VVDA 4KQPA 1QJMA 3ONMA 2F7BA 2DVCA 3EQ1A 1Q1KA 1GVCA 4DXUA 3T22A 1MM7A 4EUOA 4QFLA 3V5AA 2I0BA 4F3PA 2KLFA 4ZEKA 4NF4B 4FATA 1B3HA 1URSA 2V3TA 1AL3A 1YPNA 2DE4A 2HAVA 5DYHA 2NUVA 2X7QA 1H44A 3EHSA 3S4UA 3VXCA 3V8XB 3M3KA 3OO8A 4QF9A 1PBPA 4JDFA 3PUXE 1AH5A 3W9VA 2F97A 1SW5A 3PMVA 2QMXA 4C1TA 4RXLA 3GBBA 3IO6A 5I57A 1MXXA 3KJ7A 2G29A 3MJNA 3T66A 3FVOA 4GL8A 3RPWA 1LSTA 3MBPA 1MPCA 1ZKBA 4NF6A 1AIVA 3FD3A 2Z22A 2Z23A 1FTJA 2H25A 4KYSA 3GXAA 1UTHB 2WKYA 3MP8A 4ND9A 3O66A 5TU0A 5JEIA 3G3IA 3H3GA 1SD3A 4LUBA 5EYFA 2P1SA 3TFLA 2FA7A 3VVEA 4EF2A 3CI8A 1URGA 3TDJA 1FQEA 4YB5A 4WEDA 3QAXA 3DP6A 1B7HA 3CFLA 1A8EA 2I4CA 4JBZA 3TCFA 2O84X 3UN6A 1DSNA 2Y7RA 4LZ7A 1R6ZA 3FATA 4MFIA 3FXRA 3E9XA 2O69A 1J1NA 2XD3A 4AB6A 2ALUA 1DTGA 2DS9A 4LZ8A 4NF8B 3EF7A 1Y4TA 4MLVA 4M1VA 1L5TA 5L8DA 2ZYOA 2QPQA 1JEUA 4IO7A 1N04A 3KN3A 4ZEDA 2H4IA 3EN3A 3PUVE 4GXSB 4OYVA 5ICTA 3KJTA 1OLAA 4ZZAA 5H8QA 1NFTA 2ZYMA 4XXUA 3VLWA 1FTOA 1IEJA 3EPEA 2P2AA 2NOOA 4PFTA 4DDDA 3JZJA 2Q8JA 2DSFA 3S2VA 2A5SA 1Y4CA 1CB6A 1MPBA 4DIGA 3VXBA 3GBAA 1MY4A 3FXUA 2UYEA 1Y3NA 4GWOA 1A7LA 3MZ1A 1LLSA 2R9JA 5K2XA 1B5HA 3G3HA 1MQJA 3SETA 1NNFA 5AA3A 3FV1A 3K6XA 3K1MA 3C35A 2O51A 5CBSA 4PFWA 1FW0A 2B65A 2XXIA 2DXYA 3GZGA 1MH4A 3FJGA 1ZLQA 3TZAA 4RPNA 4F3BA 5ICQA 4U22A 2Y7PA 1QKBA 3PUYE 3S9MC 3RY3A 1O64A 5H8HB 2FNCA 5CMKA 3SERA 4R6YA 2Y7KA 1VSOA 1PC3A 4G8MA 4DCXA 3H4ZA 3K01A 1NNKA 3CRBA 2XXQA 2Z8FA 2ONKE 2HQ0A 3MZ9A 4G4PA 4RK9A 1UTHA 1UIVA 3G3FA 4E0WA 1FTMA 4YZZA 4NWDA 3MPKA 2O7UA 2DVZA 3OENA 1BKAA 3RTWB 4OQOA 2VD3A 3FIRA 2XXXA 2ZXTA 5HPQA 1TT1A 2I3VA 4AQ4A 4IGTA 2A5TB 1MDP1 1WODA 1NH8A 3VLVA 3MW0A 1B0LA 1SYIA 1IITA 1I69A 4WXJA 3FGSA 5JTYA 4I1DA 1RYOA 4NF8A 3CG3A 1PDAA 4LVQA 3UIFA 1OVBA 1S7YA 5FTHA 1PB7A 3K1NA 1Y1ZA 1DPEA 2F78A 3CSGA 1A8FA 3SKPA 2ZNTA 1A40A 4JWOA 1XVYA 3TYHA 1MY0A 4KYDA 4QRZA 3KN7A 3THIA 3ECRA 3HSTA 2XHDA 1LFGA 2I58A 4F39A 4I62A 2AYSA 1QKAA 4PQJA 5DEXA 2Y84A 4FAJA 1IXIA 2Q9TA 4F31B 4F1UA 3Q27A 5DVIA 1HSLA 2OJTA 2RC8A 1LAFE 5CM6A 4U1ZA 3OELA 4G2ZA 3L6HA 4ZDMA 3PV0E 3U94A 3TUSA 3B7DA 2AL5A 3QXMA 2NVUB 2QSXA 3BBRA 3CSBA 4WKMA 2QRYA 1T0KA 3OEKA 5AA2B 1B46A 3VDFA 1POY1 3PD8A 1M5BA 4G68C 3CIJA 1US4A 5H8HA 1MY2A 1P1QA 2XX9A 1SYHA 4IO2A 1B5JA 3PU5A 1JW1A 4H1XA 4OESA 2PVUA 4O3AA 1PB9A 1MY3A 4X1BA 3VE1B 4X1DA 3O6GA 2NWJA 3E4RA 4OETA 1OVTA 4KFQA 4DCYA 1JVYA 3HCQA 2F6GA 5DTBA 3OMBA 3DM0A 4RYAA 1II5A 2ONRA 1YTVA 3D4GA 2THIA 4BLAA 1OLCA 2OBGA 3L6GA 3BFUA 1LFHA 1D4NA 4LONB 2QJEA 1B1XA 1OQGA 2YLNA 4ZEFA 3U72A 2ZYKA 3B6QA 3C32A 2A5TA 3IAZA 3EHUA 3SEYA 3FVNA 3OXNA 4OXVA 2AIXA 4EXKA 2DWAA 1BLFA 2OZZA 3MAMA 4GIZA 2XXUA 3C36A 2V3UA 5F7VA 3IJXB 2O68A 1MM6A 3VV5A 1GV8A 3CG1A 3PPNA 4XKNA 1VFEA 3IOUA 1S9TA 4OEUA 4F3GA 3TKDA 1QW0A 4R75A 2HCAA 1SDXA 3TTNA 4HCWA 5KDTB 4KR5A 4GQOA 1I6AA 5CMCA 1PB8A 3SEVA 1TFDA 4AB5A 3B6WA 2BJJX 1MRPA 3OEMA 1IUDA 2ANJA 2GHBA 1EU8A 3CVGA 1MY1A 1ELJA 2UVIA 3JYRA 1CE2A 4F3SA 3I6VA 4JSOA 1LBBA 2QS2A 1TXFA 1M5CA 2VHAA 3PPQA 1O63A 2RINA 4P0GA 4IO6A 4MH5A 3KOTA 4ISUA 1JW4A 2B3FA 1N3XA 3ZKLA 1S50A 3KSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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