3F11A

Structure of futa1 with iron(iii)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
QEINLYSSRHYNTDNELYAKFTAETGIKVNLIEGKADELLERIKSEGANSPADVLLTVDLARLWRAEEDGIFQPVQSEILETNVPEYLRSPDGMWFGFTKRARVIMYNKGKVKPEELSTYEELADPKWKGRVIIRSSSNEYNQSLVASLVVADGEESTLAWAKGFVSNFAREPQGNDTAQIEAVSSGEADLTLANTYYMGRLLESEDPAQKAIAENVGVFFPNQEGRGTHVNVSGVGVVKTAPNREGAVKFIEFLVSEPAQAFLAQNNYEYPVLAGVPLNKSVASFGEFKSDTTSLDKLGPALAPATKIMNEAGWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The structure of the iron-binding protein, FutA1, from Synechocystis 6803
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
source organism Synechocystis sp.
molecule keywords Iron transport protein
total genus 124
structure length 316
sequence length 316
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13343 SBP_bac_6 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3f11A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3f11A02
2P0SA 4JBZA 4I9DA 4LATA 1MXZA 5DEXA 1FQBA 2O7UA 4LUBA 1Y4TA 4YKIA 3LC8A 4BDLA 4N07A 1I6AA 1Z7ME 4F3BA 4NF5B 2ESNA 4E0WA 1XC1A 2UXAA 4ZE8A 3I3VA 2QPQA 4EXLA 4PFTA 5TU0A 1OLAA 5F7VA 2O1MA 4GL0A 4YB6A 4NF8A 5CMKA 4DDDA 1WDNA 5H8HA 2DVZA 5KDTB 2KLFA 3PUZE 2QS1A 1B5HA 1MXWA 1L5TA 3M3FA 3S9NC 5KCJA 4WEDA 4ZEKA 2X26A 3MPKA 2ZYMA 3RNNA 2QL3A 3EHSA 1P1OA 1XHYA 5LOMA 2RC8A 3OENA 2A5TA 4U4SA 1TT1A 2QS2A 3U93A 2YPNA 1SW4A 1QKAA 2OWTA 1YAEA 4C1TA 4F18A 1JEVA 3IO6A 4NF8B 1TFAA 1P99A 1XOCA 1PDAA 3CFXA 4ZEBA 1B0HA 3O9PA 1YPNA 1MPCA 2V93A 5KCJB 5TP9B 5CI5A 4X48A 3SESA 2XXXA 2ZYKA 1ZU0A 4OERA 4U22A 1SI1A 1NL5A 1IUDA 2PMSA 3FJGA 1H43A 5I59B 3DP8A 3Q26A 3TTMA 2HCAA 1DOTA 1EZOA 1LFGA 1B0LA 5CMMA 4PFWA 3HV1A 2R9JA 1T0KA 1UTHB 4OZ9A 4TLMB 4YMAA 3MP8A 4LONB 4ECFA 1VR5A 4P0IA 2AIXA 3OD7A 4Q8RA 1SVXB 3CR9A 1BKAA 3BFUA 3CI8A 1OLCA 2FYIA 3WAFA 3HO7A 3ZS6A 4PE5B 1D9YA 4NE4A 1MM7A 4THIA 4U23A 5AA3A 4R6KA 1MY2A 2M8CA 2RC7A 4KR5A 2XXUA 3VLWA 1DMBA 3H06B 3QK6A 1LSTA 4F3GA 5ITPA 3IOWA 4M1VA 3WAEA 5DYHA 2OCUA 3MJNA 2D5WA 2H5YA 4LZ7A 3OO9A 5I2NA 2XXRA 2RCAA 1M5BA 4HCWA 5CMBA 1MY1A 1JW5A 1IZ1A 4G68B 1H3DA 4MLQA 1USYE 3B6WA 5JK4A 4GXSB 1B51A 3S9LC 1FTJA 1P1WA 4OYVA 4ZS9A 3W9VA 3TCHA 1VSOA 3DM0A 4FIMA 3E4RA 3FD3A 4DLDA 1WVJA 3PUXE 2O51A 5EHSA 3JYRA 1QKBA 3H6UA 4KQPA 3T9UA 1Y9UA 3KGCA 4EDPA 1M5DA 2PYYA 1D3KA 5J1DA 3C36A 3VFJA 3GBAA 4AB5A 3DELB 1O64A 3M3KA 3EHTA 3UGWA 2OWSA 2XX8A 3OEMA 3EF7A 5TPAA 3K6VA 2OBGA 4OFOA 3R7XA 5B70A 3SEXA 4OTEA 1QW0A 3A3CA 1AOVA 4PFYA 4Q5TA 4JXIA 1ZIUA 2F6PA 1VE4A 3IB0A 3ZSFA 4IY6A 2F97A 4F1VA 1Y1ZA 1MRPA 3T93B 2FA7A 5ICTA 1IXHA 1OQGA 5AA2D 1YCJA 2XXYA 4YB7A 3TEPA 1ATGA 1H76A 3AXFA 1SW1A 2G29A 2I58A 2ZNTA 1B4HA 4IGRA 3RQTA 3KSXA 3GXAA 3QYTA 5ITOA 2Q89A 4DXCA 4ND9A 4ZEFA 5L9OA 1N7XA 2Q9TA 2OK2A 4DZ1A 1N76A 2V3TA 2HEUA 4XKQA 4H65A 4R2BA 3LSFB 1AL3A 3H3GA 3HCQA 4OFLA 2CZLA 3IO4A 2NOOA 5JTYB 1ZBMA 5FHNA 1LB9A 4JDFA 4FEDA 3K1MA 4FAJA 4G68C 3K6WA 4Z0IA 3HPIA 3K02A 4KHZE 4WKMA 1HSJA 2PBWA 3VLVA 4ZDMA 4RY1A 1ANFA 4LQ2A 1LAXA 4NF6A 3JV9A 2VHAA 4QFNA 4GVOA 2O84X 4RXLA 2CMOA 4K3FA 4EXKA 3SKPA 1MH3A 5AA1A 4KI0E 3A3UA 1FQCA 1FQAA 2Y7RA 2HZKA 1B4ZA 1B9JA 4H8IA 1O63A 3PV0E 4GOTA 1SW5A 1B7HA 1N84A 3M3LA 3FXQA 2DE3A 2XX7A 1ZLQA 2HZLA 3CG1A 4NF6B 3HSTA 4WXJA 4O3CA 3G3GA 4JWYA 2AYSA 1MQJA 3FATA 4ESXA 5FTIA 3K6XA 3EHUA 3MBPA 3IAZA 2Z8FA 3T22A 4AB6A 5IAIA 1TXFA 1QUIA 4H6DA 3PD8A 1QVSA 2F35A 4FORA 2UYEA 1B52A 4OWDA 3JZJA 1A8FA 3BBRA 1EZPA 3SDFA 1Y3QA 2HAUA 3TODA 2Q2AA 5JEIA 4YAHX 2DQVA 5DTBA 1FCKA 2XX9A 4MBPA 4X1DA 1B7ZA 1B5IA 1BIYA 3PPQA 4PFUA 1SI0A 2RINA 3O6IA 1FTOA 1MXXA 3VVDA 3U72A 4QSCA 4G2ZA 3TTNA 3H6WA 3PUVE 4R73A 3VXBA 3IK6B 1NNTA 3N6UA 1MS7A 3MZ9A 1PBQA 5KDTA 3TCFA 1Q35A 2D21A 1GTKA 1N3XA 3KN7A 4ELPA 3RUMA 4QSDA 1A7LA 1AMFA 2GHBA 3MC2A 3W15C 4YB5A 5B7DA 1IITA 4GIZA 1FTLA 3PPPA 3OO7A 2DXRA 3H6TA 1YTVA 2UYFA 3KG2A 1LFHA 2A5SA 1B1XA 4HW8A 3TTRA 3HHFA 5CMCA 1URDA 2HFBA 2DE4A 3PMVA 1LAFE 1MY4A 4MLVA 2YJPA 2Z23A 1LFIA 4LZ8A 2F8DA 1GV8A 3C9HA 1MPBA 5HM4B 4NF4A 4JWXA 1LAGE 5TP9A 3R26A 4BDMA 3GLBA 2DOJA 4MFIA 3O2AA 2VD3A 4F1UA 3PUWE 3H03A 3RT8A 3G3KA 5DVFA 3G7WA 4N6PA 5A5XB 4MH5A 5I59A 1MY3A 3C31A 4P0GA 5DVJA 1ZJLA 1SYIA 1UTHA 2ZNUA 4U2RA 2XXIA 4H5GA 4NF4B 1JW1A 3B6QA 3IORA 1NNPA 2D3IA 3E13X 2QSXA 4RA1A 1OMPA 3EQ1A 2ZXTA 3KN3A 3OMBA 4R2FA 4OFJA 3TCGA 1J1NA 3MAMA 4F3SA 4DCXA 1NNFA 3CG3A 5I58B 2XXTA 2R6GE 5ISUA 2O68A 4OXVA 3DP4A 1LCFA 3DP6A 3MQ9A 2Z22A 2B65A 3USDA 3IOUA 5H8QA 3CFZA 3EN3A 4RPNA 5L8DA 3UP9A 1RYXA 1I6QA 4N13A 4HCYA 3B6TA 3TMGA 3T9HB 1UTBB 4GXAA 4QRZA 3CFLA 1NKXA 1TWYA 4G68A 4R72A 2ZNSA 1LLSA 3FVOA 1FQFA 3Q29A 4FEBA 4F19A 1D4NA 3MZ1A 5H8QB 2GFEA 2O69A 1N3WA 1US4A 5I57B 2IEEA 4IO2A 4XTCQ 4F2QA 3OO6A 3IJXB 4JSDA 3FASA 1GVCA 1IEJA 1B3FA 2F5XA 4HTGA 1GR2A 2OZZA 4YICA 1ELJA 1LB8A 3K1NA 1P1NA 1OQHA 1N7WA 4I8CA 1FW0A 2VOZA 3LBSA 5L9SA 3C32A 3KEIA 4YKKA 3LSXA 3IL1B 5CBSA 3K6UA 2XXHA 4UA8A 3THIA 5I56A 2LAOA 3TAJA 2G93A 2RKMA 3FJ7A 3KSJA 2P1SA 2H99A 3IOVA 4ELQA 1Y4CA 1VFDA 3U94A 1PB8A 2AL5A 3EPEA 3I5OA 5K2YA 5M2VA 4F3PA 2Y7PA 4C1UA 2OLBA 3VVFA 5CBRA 2HAVA 4G8MA 1NH8A 4M4GA 1N0TA 1CB6A 3PUYE 4QFPA 4YZZA 3FV2A 4RPOA 2E0SA 4EF2A 4E0XA 3FIRA 1IXIA 1PB9A 2ONKE 1URSA 1DTZA 5I56B 1JVYA 4H5FA 3KJ7A 1POTA 3RT6B 2WKYA 2I3WA 3GBBA 1WODA 1PEBA 1NH7A 4TQUQ 1B6HA 3LSWA 2F34A 4POWA 1JW4A 3RPWA 4GRKA 4IGTA 2I4BA 5JTYA 3FUZA 1ZKBA 4BLAA 3FVGA 3L6HA 4KCDA 1QJMA 3FZVA 1QUJA 3CRBA 3QUFA 2I3VA 1QULA 2Y7IA 3S4UA 3PD9A 4NTLA 3SEWA 1SDXA 3KN8A 3TUSA 2X7QA 3T9XB 1DPEA 3O6GA 4C0RA 4R6YA 4XXUA 4MF3A 3V83A 1PBPA 1MQDA 2X7PA 1UQWA 2ZYOA 1LGBC 3TFLA 3OO8A 4R9FA 3PPOA 3UN6A 1I6BA 3N26A 4Q30B 2Y84A 2REJA 3ONMA 5CRYA 2HQ0A 2NVUB 1R9QA 4L17A 4QFOA 2F36A 1NNKA 2VGQA 4X1BA 1H44A 1HSLA 1DSNA 4IB2A 5ICQA 2XXWA 1Y3NA 2Z8EA 4ZEIA 4F31B 3IJOB 1AH5A 4Z7EA 4EQ9A 4OENA 2ABHA 4R9GA 4PETA 3TTLA 1S50A 1Y3PA 3TYHA 3CSBA 2B3FA 1MDQA 4QFLA 3BFTA 3RTWB 1US5A 1SBPA 1JQFA 1EZ9A 4GD5A 5EYFA 1XVXA 1OIBA 2XXVA 1R6ZA 1A55A 1AIVA 2B3BA 3KJTA 1A40A 3SETA 3T66A 4GF8A 4ZEDA 3D4GA 4KFQA 1MXYA 4DCYA 3PPNA 2DYXA 1HSEA 1IIWA 1QUKA 3MP6A 2O6AA 2W7YA 4ZZAA 4OMBA 1LBCA 3C4MA 2I49A 1Y20A 4BDOA 2XD2A 2DVCA 3ECRA 5I84A 2VP1A 4GL8A 4LVQA 1F9BA 3MVYA 1NFTA 1S7YA 3D4CA 5ELVA 5H8NB 4ZE9A 4LP2B 3V8XB 2H98A 3OELA 1RYOA 2OJTA 2Q88A 3IR1A 3CSGA 2YLNA 3K0VA 3A09A 3RN8A 3RY3A 1TFDA 3PPRA 4IO6A 5HPQA 1B3HA 2DWJA 4ZECA 4QF9A 1MXVA 5BWJA 1RKMA 1B58A 4DXUA 3MZBA 3SEYA 3PMXA 2HXWA 3E3KA 1LAHE 4IO5A 3MPLA 3MVWA 4KYEA 3VV5A 3V5AA 3FGSA 4JWOA 2V25A 3LUYA 2PT2A 2XXQA 2H25A 2QRYA 2F7CA 4OVJA 4TLLB 5A5XA 3ZKLA 5F1QA 4KCCA 4YMBA 2I4CA 5CM6A 4RYAA 4YKPA 3FXUA 2F6GA 1LBBA 3N6TA 3O66A 4U1OA 4QHQA 3K4UA 4YU0A 1SYHA 4XKNA 3TZAA 1MQIA 1EU8A 4U4XA 3U92A 2AL4A 4LQ5A 3RGYA 3CVGA 4OEUA 3TELA 4DE8A 4LZ5A 5DEXB 2Z8DA 5I58A 5IKBA 3T9VA 2R71A 1FTKA 2REGA 1N04A 3H7MA 2E1SA 3UA8A 4GFRA 4G4PA 2V3QA 3SEVA 4JB7A 4GQOA 2GHAA 2QMWA 1DPPA 5HBCA 3HN0A 2H4IA 2P2AA 5AA4A 4FE8A 2F7BA 4UACA 5H8HB 3B7DA 3IX1A 5L9MA 4PQJA 1B3LA 1UIUA 1UTBA 4RJZA 5FHMA 2I48A 4YKJA 3K00A 1MQGA 3TPAA 1PB7A 2I0BA 1JETA 5KZTA 1MY0A 4G8HA 4POXA 4KYDA 3ODBA 1BTJA 3I6VA 3FJMA 1BP5A 4AQ4A 3MVZA 2A5TB 3QSLA 2DWIA 3MUQA 4GLIA 2ZMBA 4H67A 5I57A 4GWOA 5AA4B 1ZTYA 3OXNA 2ONSA 1FQDA 1II5A 2F78A 3L6GA 2QS3A 1EH3A 3SERA 3Q28A 3ILTB 2FNCA 4RNSA 4Q0CA 3V89B 1FQEA 4X9TA 1JVXA 3C35A 2VD2A 3GZGA 2DS9A 3H4ZA 4F1YA 3TQWA 1B2HA 3O6HA 3ZKKA 1P1QA 4NWDA 2NXOA 4O3BA 2RC9A 1B32A 4XKRA 3RLFE 1A54A 3OSRA 1Z7NE 3O97A 4RK9A 2PVUA 4OESA 4G77A 2Y7WA 2ANJA 3H6VA 2I6EA 2Y7KA 4I1DA 3LSLA 2PX1A 1A8EA 3P7IA 4FATA 3FV1A 4WEPA 3K01A 1MM6A 2GRVA 3MVXA 3FVNA 1PC3A 1P1UA 4F2OA 1XS5A 3FXRA 2XD3A 3CIJA 3OEKA 4DIGA 3TKDA 3KOTA 3TQLA 1H45A 1M5EA 3E9XA 3C33A 3SEUA 1A99A 4EQ7A 4IO3A 5I2NB 4TOZA 1M5FA 3W9WA 3VXCA 3VVEA 2Q8JA 1ZMGA 4H1XA 4BDRA 5AA2A 3IB2A 5CC2A 4F29A 1UIVA 4ONYA 3Q25A 4O3AA 3G3IA 3MWBA 1VFEA 3R6UA 4QSEA 2F7AA 1USYH 2THIA 4IO7A 4ZZEA 2XXPA 3KZGA 1NMUA 1R9LA 2QJEA 4OHNA 5FHOA 2UVHA 3QAXA 1B3GA 4OETA 4IO4A 3O29A 4JSOA 1XVYA 2ZYNA 1Q1KA 5DVIA 3IOTA 3G3JA 2ONRA 3U8QA 5AA2B 4EQBA 1Y1MA 4ISUA 3G3FA 1DTGA 4FECA 2V3UA 2DWAA 4NEDA 4U21A 4ESWA 2NUVA 5I2KA 5EHMA 1GGGA 3S9MC 3C34A 1XT8A 1BLFA 5TPAB 1M5CA 2ALUA 2H9BA 3G3HA 3U1OA 4HS7A 3TTKA 3VLUA 3OSQA 2UVIA 4LA9A 2O1LA 1MDP1 3KOSA 3T96B 2V84A 3VE1B 1D9VA 1MG1A 5DT6A 1JNFA 4ELRA 4F39A 2IA4A 1SD3A 4NMYA 4OQOA 3K1PA 4PP0A 1SQYA 4KPTA 2DP8A 1KWHA 3OOAA 2RF1A 3S9EA 4P11A 3VDFA 1MH4A 5I2KB 4H8JA 3N5LA 4QFKA 3UK4A 3MP1A 2DE2A 2QS4A 2I0CA 3F11A 1OVBA 3LR1A 3M8UA 2NWJA 4F22A 4ELOA 1B5JA 1I69A 4DXBA 1IXCA 1MXUA 1S9TA 3FVKA 2XHDA 3PU5A 1FTMA 2O7IA 4R6HA 3QUJA 3S2VA 1R1NA 3MW0A 4I62A 5H8NA 1SW2A 1B3EA 1B46A 3UORA 2QMXA 5AE4A 4H0WA 3TDJA 4EF1A 3PGFA 1IQ7A 1MPDA 3PMWA 4FJPA 2RCBA 5H8FA 4XIGQ 2DSFA 2Q2CA 3IB1A 2GH9A 4G8NA 1POY1 3DLNA 1B7UA 3RTFB 2DXYA 1B05A 1B1HA 4R75A 3O28A 2DWHA 1OVTA 2PT1A 3ILUB 5K2XA 1MQHA 2UVGA 1URGA 4NWCA 3HHGA 4RK2A 4OEVA 4U1ZA 2BJJX 3UIFA 4KYSA 5H8SA 1JEUA 5H8FB 3QIMA 5FTHA 4BDNA 1O7TA 1B40A 3K2DA 3BKIB 4BDQA 3KFMA 4NF5A 1LCTA 1IXGA 5BUUA 4R74A 2UVJA 4IY5A 3KBRA 3QXMA 4EUOA 4XKPA 3N94A 3Q27A 1CE2A 4KD5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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