3FD3A

Structure of the c-terminal domains of a lysr family protein from agrobacterium tumefaciens str. c58.
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
RVTLNIATNADSLGTWFLDAVSKFTGGSDYLVNIAVDDQDHTVEWLRGGRVLAAVTAHDKPVQGCRVTPLGVLRYHATASPDFMARHFADGVTPAALARAPGLTFNQKDRLQASWIRTALGEDVSYPTHWLPSTDGFVKASLAGMGWGLNPVQLVAEHLAAGRLVELMPGTPLDIPLYWQVNRLAAERLAGLTANMVGTARVVLMPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure of the C-terminal domains of a LysR family protein from Agrobacterium tumefaciens str. C58.
rcsb
molecule tags Transcription regulator
source organism Agrobacterium tumefaciens str.
molecule keywords chromosome replication initiation inhibitor protein
total genus 61
structure length 207
sequence length 207
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fd3A02
4LATA 2Z8DA 3UP9A 4PQJA 3K01A 2Z23A 5DT6A 4JBZA 2QJEA 3EQ1A 3O66A 4Q8RA 1LAGE 1NNFA 2OLBA 4U4XA 2I6EA 1S50A 2XXXA 2F78A 1B5HA 3OO7A 3FVGA 4IO2A 3MAMA 4GXAA 2OWTA 4OWDA 5I84A 1B3FA 1NNKA 3T22A 1KWHA 1EH3A 2F7AA 2OWSA 1GGGA 1WODA 1UTHA 2FNCA 3MW0A 1JNFA 2OJTA 2OBGA 2XXRA 4C1UA 3LR1A 3U94A 2DWHA 3UA8A 2XXIA 4OXVA 1VE4A 1MG1A 4LZ7A 4AB5A 1MQJA 1MQIA 3B6TA 2REGA 3C35A 4F3BA 1JEVA 4XTCQ 3KOSA 3TEPA 5I56A 4JB7A 4ESWA 3KGCA 1B0LA 3EN3A 4LP2B 5I58A 4IGRA 3KJ7A 4X1DA 3FGSA 3G3IA 3PU5A 5H8FB 1DOTA 4GXSB 3O29A 5DYHA 3QAXA 1Y3PA 5ELVA 1Q1KA 5CBSA 3VLVA 2F6PA 4OENA 1P1UA 4L17A 1FTKA 4YKPA 2BJJX 3MBPA 2QSXA 2PVUA 3PPRA 3GBBA 5TPAB 2V3QA 3G3HA 3TTMA 1UIVA 2H9BA 3O28A 4NE4A 3N26A 2XD3A 5DVJA 4DDDA 3HHFA 4YU0A 1QULA 5DVFA 3IAZA 4GRKA 1XT8A 3U1OA 4FEBA 4OFOA 1SW5A 3D4GA 1HSLA 2RINA 4IY5A 1R9LA 3PUXE 3TTKA 4K3FA 1A7LA 4HW8A 3UIFA 1LSTA 4F2OA 3JV9A 3HCQA 2XD2A 1O63A 2NWJA 2Y7PA 3U72A 1EZOA 3KN8A 2VD3A 2UVIA 2A5SA 1B3GA 2Z22A 3VVEA 3OSQA 3ZS6A 1BTJA 3IB1A 3Q29A 1YAEA 2ZYKA 3CI8A 1H45A 3LSFB 2ZNUA 3LUYA 4YKIA 1MQGA 3BBRA 1IQ7A 1EU8A 1URGA 4MFIA 3H03A 4PFTA 5F7VA 1MXZA 2D5WA 4JWYA 1OVBA 3RLFE 4BDQA 3MZ1A 2HZKA 5H8FA 4EXKA 3A09A 2ZNTA 4E0XA 4N07A 5IAIA 3PMWA 2HAUA 1OMPA 2HFBA 2AL5A 1Y3NA 3DP6A 1H43A 5DEXB 1MXWA 4OETA 1NH7A 5F1QA 3C4MA 2RC7A 3IB0A 1P99A 3BFTA 3B7DA 5JK4A 2XXPA 1A8EA 4POXA 5TPAA 1AOVA 2QPQA 3VV5A 1SYHA 4H8IA 1B4HA 1B5IA 3T96B 2UYEA 1IZ1A 1MY1A 4GD5A 2I3VA 3H6WA 3THIA 4R6KA 2VP1A 2O6AA 3VVFA 4ELQA 3FVNA 1BLFA 2F5XA 1XOCA 4MLVA 3RGYA 2A5TB 1XHYA 3UK4A 3JYRA 5I2KB 5A5XB 3MVYA 4KPTA 3Q26A 4P0GA 4C1TA 3CIJA 2X7PA 2HXWA 5I59B 4OEVA 1BKAA 3H6VA 4YB6A 2V93A 4QFPA 1O7TA 2RKMA 1FTOA 1B58A 2FYIA 5CRYA 2NUVA 5K2XA 4Z0IA 3OENA 4R9FA 4OEUA 3I3VA 5AA4B 1I6AA 4ZEDA 1MPDA 2QMWA 2UXAA 4X1BA 3Q28A 2QMXA 3CFXA 2VOZA 3DP8A 1ZBMA 3A3UA 4OQOA 2XXQA 4DXBA 1JQFA 1PDAA 4U1ZA 1IIWA 5EYFA 4U1OA 4MLQA 4I9DA 3RT6B 2VD2A 3FJ7A 2H4IA 3M3LA 3TQLA 1ANFA 2Y7WA 2XX9A 3WAFA 1M5EA 4YAHX 1USYH 3QXMA 2P1SA 4NWDA 3R7XA 5DEXA 3RY3A 5H8HB 5JEIA 2YJPA 5EHMA 4H1XA 4BLAA 3VXBA 1SW2A 3LC8A 4MH5A 1FQBA 1O64A 5HPQA 1B3EA 4PE5B 3B6QA 3ZSFA 3I6VA 3FXUA 2O1LA 1MXUA 4H5GA 1MS7A 4JSDA 1TFAA 3K6WA 3TFLA 3CSBA 3RTWB 3SKPA 3PV0E 3H3GA 4XKRA 1N84A 2QS3A 3N94A 3UN6A 5CMMA 5B7DA 3C32A 1DSNA 1UTHB 2P0SA 3U8QA 1JVYA 1GV8A 3FIRA 3IO6A 4RJZA 2A5TA 2I0BA 1PEBA 1H44A 3OXNA 3HHGA 5FHOA 3K1NA 5A5XA 4R9GA 1Y1ZA 4G8MA 3O97A 1I6QA 1ZLQA 1A55A 1POY1 5AA3A 3GBAA 5I56B 3TODA 4OFLA 5TP9A 3KSXA 5AA2A 5I58B 1B7ZA 3GLBA 1MPBA 3TCGA 3K6XA 4KFQA 2V25A 5AA4A 2DVZA 1PC3A 2Y7KA 3K4UA 1IUDA 4LVQA 2DS9A 4OMBA 2ABHA 3L6GA 1URSA 3QUFA 3SEYA 4KCCA 3EF7A 1AMFA 1FQAA 5DVIA 3TDJA 4NEDA 4F22A 2HQ0A 4ZZEA 3PUZE 4RPOA 2ONSA 1TWYA 1MY0A 4EUOA 4UACA 3BFUA 3SESA 1XVXA 1B4ZA 2UVGA 1B5JA 3MVXA 2W7YA 1II5A 1DPPA 1MY4A 4Q0CA 4X48A 1S7YA 2H5YA 2Q2AA 1A99A 4FATA 2HCAA 2IEEA 5H8HA 5L9MA 3FUZA 4FJPA 4GL0A 1AH5A 1HSEA 1LAHE 3MVZA 5CM6A 3H7MA 5JTYB 5M2VA 4O3BA 4EQ9A 2ZMBA 4FECA 4GF8A 1ZMGA 3TAJA 1QKBA 3T9XB 4QFKA 4NF4A 3K00A 1AL3A 4KI0E 1QKAA 1QUJA 3JZJA 3GZGA 1F9BA 1FW0A 4RXLA 2R71A 1LAXA 1P1WA 3M8UA 3QIMA 3OO8A 3LSWA 4G2ZA 4G4PA 4BDMA 1YTVA 2DXYA 3KEIA 1Y20A 3PUWE 3EHTA 1MPCA 2LAOA 4EDPA 3VLWA 2ESNA 2UVHA 5CC2A 3FVKA 4E0WA 2THIA 3RUMA 2DOJA 2O1MA 1MXYA 1P1QA 3TTNA 2ZYOA 1HSJA 4NWCA 1IEJA 2F34A 4HCWA 2R6GE 2I48A 1JW4A 1B32A 1LFGA 2PT2A 1OQGA 3ODBA 2Z8EA 4HCYA 2XX7A 1MM6A 4OERA 2NVUB 1B40A 1LGBC 2H25A 5ICQA 3USDA 1B3LA 3ZKKA 4POWA 4XIGQ 1I6BA 1B05A 2QL3A 4FORA 4QSDA 3MJNA 2HEUA 3UGWA 5ISUA 1MH3A 3MZBA 4U4SA 3M3KA 1Y4TA 4I1DA 4DE8A 5FHNA 1GVCA 4C0RA 4OYVA 4LUBA 4QHQA 4YMBA 3TYHA 3IOUA 1TFDA 1B0HA 1ZU0A 1VR5A 3MVWA 2O7UA 4O3CA 3FD3A 2Q9TA 1OQHA 4GQOA 2I3WA 3G3JA 1N04A 3ECRA 3IX1A 4ZE8A 2X7QA 2FA7A 3V89B 3E3KA 2DE3A 5JTYA 4QFLA 3QYTA 1P1NA 1NNPA 4IGTA 4I8CA 5H8QA 1DPEA 4P11A 2ALUA 4NF6A 1RYOA 1Q35A 3QK6A 4M1VA 5AE4A 3VDFA 1Y9UA 3RQTA 3K1PA 3IR1A 3VLUA 1Y1MA 1ZJLA 4OZ9A 1R6ZA 2XXVA 2CZLA 2NXOA 2DVCA 3K6VA 1B6HA 3OOAA 3W15C 3FJGA 3HSTA 4YMAA 2Y7RA 4DXCA 3RNNA 1MXXA 4EQBA 2GRVA 2RCAA 1POTA 4ZZAA 2DWAA 2YLNA 3SETA 4OFJA 3D4CA 4TQUQ 1US5A 2I4BA 4KCDA 3L6HA 4GWOA 1NFTA 3PD9A 4F1YA 2XXUA 4ECFA 5BUUA 4DCXA 4KR5A 3K6UA 3ILTB 1GR2A 3PPQA 2F8DA 1ATGA 4R75A 3HV1A 4WXJA 1RKMA 1JW5A 5H8NB 5IKBA 5I57A 3QUJA 3U92A 3KFMA 4H67A 1A8FA 3MQ9A 1FCKA 4ELPA 4BDLA 1FQFA 4IO4A 5KDTB 3C36A 1B9JA 3GXAA 2ZYNA 3H4ZA 4GIZA 4RK2A 3PMXA 3BKIB 3OMBA 3LSXA 3TELA 4Q5TA 1TXFA 3C33A 2OZZA 3I5OA 4YICA 1IXHA 4RYAA 3T93B 5ICTA 5TP9B 5AA2B 1LCFA 2QS1A 1QW0A 3KBRA 1B52A 4ZDMA 3QSLA 1N7WA 3FV1A 5I2NA 1B51A 4F3SA 1USYE 2H98A 3G3FA 4LONB 1NMUA 1MY2A 1OLCA 4AB6A 4LZ5A 1YPNA 1SBPA 2O7IA 4JXIA 4FIMA 3SEUA 1OVTA 1SI0A 3SEXA 1D3KA 4ZS9A 3DM0A 3E4RA 3MPKA 3SDFA 3RN8A 2RC8A 3S4UA 2ANJA 3ZKLA 4PFWA 1DTGA 2GH9A 4X9TA 1FQEA 4F1UA 1FTJA 5HM4B 5H8SA 3H6TA 3LSLA 1JVXA 4GOTA 1J1NA 2O69A 3K02A 2Z8FA 2F7CA 5H8NA 1B46A 3TPAA 5BWJA 3MUQA 4RPNA 2DE4A 3TMGA 1TT1A 2XXWA 3OO9A 4FEDA 1PB7A 4IO6A 1M5CA 2X26A 3N6UA 2UVJA 3TTRA 1DTZA 1FQCA 3WAEA 4PETA 4ND9A 4NF4B 2O68A 4R2FA 5AA2D 5KDTA 4YZZA 2Y7IA 4XKNA 2WKYA 1IXIA 5FTHA 4H6DA 3O6IA 3R6UA 1URDA 2I58A 3FV2A 4THIA 1M5FA 4G68A 4P0IA 1SVXB 2O51A 1Z7ME 1MQHA 1M5BA 4U21A 2VGQA 1M5DA 3HO7A 5CMCA 4GVOA 2ONRA 4U2RA 5TU0A 1YCJA 4ZEBA 4MBPA 2XX8A 4H5FA 4F3GA 4DCYA 1MY3A 3K0VA 4N13A 4RY1A 4JSOA 1B1HA 4NF5B 2DWIA 4KQPA 4ELRA 1XVYA 1ZIUA 1IITA 2F35A 3SERA 3T9VA 1D9VA 1IXCA 3ILUB 3T9UA 3DELB 4R6HA 1MRPA 4KD5A 2OCUA 4H65A 2R9JA 4QF9A 1SW1A 2Q8JA 4IO3A 5ITOA 4ZEIA 4RK9A 4U22A 5L8DA 1WVJA 5H8QB 1B3HA 5K2YA 3ONMA 4XXUA 2QS2A 4NF6B 3RT8A 3V8XB 4YB7A 1OLAA 4PFUA 1QJMA 2HZLA 4DLDA 3C9HA 4EF1A 3FJMA 4AQ4A 1B7UA 2RC9A 1LBBA 2XXTA 3O2AA 3CFLA 3MC2A 3FVOA 3TTLA 4ZECA 3KSJA 4BDRA 4PP0A 4KYSA 3S9MC 4LZ8A 2GFEA 4BDNA 5CBRA 4TLMB 4OESA 5CMKA 3IOTA 2XHDA 4KYDA 1OIBA 4U23A 3LBSA 3E9XA 1MXVA 2OK2A 1N3XA 4QFOA 4G8HA 3KZGA 3PMVA 3CR9A 3TZAA 3TQWA 1ELJA 3V5AA 4ZE9A 4NF8B 5L9OA 3V83A 4LQ5A 4ZEKA 3N6TA 4O3AA 1FTMA 3N5LA 3HN0A 3FXQA 2P2AA 2QRYA 4NF5A 1PB8A 2HAVA 2XXHA 1N7XA 5L9SA 4IO7A 3G3KA 3IOWA 1UTBB 3OO6A 4DXUA 3IK6B 1H76A 5I57B 1D4NA 4F29A 2F97A 2G93A 3MWBA 2V3UA 3EPEA 4WEPA 5AA1A 4YB5A 4RNSA 5KCJA 2DXRA 4NTLA 3IL1B 1LB8A 2ONKE 2ZYMA 1A40A 3HPIA 4KHZE 4H8JA 3H06B 4XKQA 1FQDA 1EZ9A 4FE8A 2NOOA 3CRBA 3W9WA 2ZNSA 3SEWA 1LCTA 2F36A 3C31A 2Q2CA 1B2HA 3Q27A 1Y3QA 5CMBA 3FZVA 3KJTA 1SW4A 1VFEA 2DSFA 4R72A 5EHSA 3EHUA 2E1SA 1CB6A 3FXRA 2H99A 4M4GA 4OHNA 1LB9A 4ESXA 1EZPA 4KYEA 1XS5A 2AIXA 4PFYA 3M3FA 5I2NB 1UIUA 1NL5A 4FAJA 1Y4CA 4MF3A 3T9HB 1BP5A 4XKPA 2DWJA 3VE1B 2B65A 3H6UA 2E0SA 4OVJA 1GTKA 2V84A 4F1VA 4QRZA 4F31B 4F18A 1VSOA 4NF8A 3CFZA 3IJXB 3MZ9A 2D21A 4R74A 3IJOB 4WKMA 1T0KA 2AL4A 1UTBA 4EXLA 3TCFA 4LQ2A 1S9TA 2I0CA 4GLIA 3IORA 3TKDA 2AYSA 4YKJA 2XXYA 4Q30B 2DE2A 2V3TA 2DP8A 2PX1A 3OEMA 3P7IA 2DQVA 4F19A 3S2VA 1JEUA 3SEVA 4F39A 2D3IA 2PT1A 1R1NA 4ISUA 3IB2A 3C34A 4JWOA 3Q25A 4IY6A 1JETA 2Q88A 2KLFA 3O6HA 3PD8A 3DP4A 3VXCA 3DLNA 5HBCA 1MH4A 1P1OA 4RA1A 4G68B 5FTIA 5B70A 3S9LC 4BDOA 4N6PA 4HTGA 1VFDA 2I4CA 3CSGA 1MM7A 3EHSA 1MDQA 3OSRA 4GFRA 3OEKA 3U93A 1LBCA 5J1DA 1H3DA 1A54A 5DTBA 2YPNA 4QSCA 3W9VA 2F7BA 4H0WA 1DMBA 4LA9A 1XC1A 4R2BA 1Z7NE 3O9PA 2F6GA 3E13X 1QVSA 3FATA 3PPOA 4R73A 4ONYA 2G29A 4G8NA 5ITPA 5LOMA 4NMYA 1I69A 3IO4A 1CE2A 2GHBA 1D9YA 4OTEA 1UQWA 1QUIA 4UA8A 4DIGA 4IO5A 3PPNA 1SD3A 3MP8A 1BIYA 3PUYE 3VVDA 1AIVA 4F2QA 1LAFE 3TCHA 1N3WA 3IOVA 2O84X 2REJA 3CG3A 3MP6A 3KN7A 1B1XA 4IB2A 3TUSA 3OELA 4G68C 1WDNA 5FHMA 4ZEFA 4ELOA 4R6YA 1JW1A 2Q89A 1PBPA 1N76A 1MDP1 4F3PA 4G77A 4Z7EA 3UORA 2IA4A 1SDXA 3R26A 3VFJA 2PMSA 1QUKA 2I49A 3O6GA 3F11A 2VHAA 4DZ1A 1LFIA 4EF2A 1R9QA 1NNTA 1SI1A 3CG1A 4TLLB 3RPWA 1PBQA 3KN3A 5KZTA 4HS7A 2DYXA 4JDFA 1L5TA 2PBWA 3PUVE 3B6WA 4I62A 3OD7A 3T66A 3A3CA 4EQ7A 2B3BA 5I2KA 3FASA 1US4A 2RF1A 2RCBA 2B3FA 5I59A 3K2DA 1NH8A 4GL8A 3KG2A 1IXGA 2M8CA 1N0TA 2QS4A 4QFNA 3K1MA 3S9NC 4JWXA 3KOTA 1PB9A 1B7HA 3PPPA 2ZXTA 3G7WA 3MPLA 3G3GA 4WEDA 2Y84A 1NKXA 2CMOA 2UYFA 3AXFA 3PGFA 2PYYA 4QSEA 1ZTYA 4YKKA 3S9EA 5CI5A 4TOZA 3CVGA 1RYXA 5KCJB 1SYIA 1MQDA 1FTLA 1ZKBA 3MP1A 1LLSA 3RTFB 1SQYA 1LFHA 2GHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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