3FGSA

Crystal structure of g65r/k206e double mutant of the n-lobe human transferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDARLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVEHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords Serotransferrin
publication title Structural and Functional Consequences of the Substitution of Glycine 65 with Arginine in the N-Lobe of Human Transferrin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fgsA02
3M3LA 1Z7ME 3TAJA 3IB2A 4WKMA 3OEKA 4EQ7A 5I2NA 3MUQA 3TTLA 2ZXTA 2A5TB 1LFIA 4I1DA 3HCQA 1OVBA 1YAEA 1N0TA 3C36A 1QUIA 1B5HA 4LQ2A 2RC9A 1H76A 5FTIA 4MH5A 5CC2A 1SD3A 5DEXB 4PQJA 2I4CA 5CMKA 3EHTA 5CI5A 5AA2A 1B1XA 5ICTA 4AB6A 3KBRA 3IB1A 4RK9A 1P1WA 4FEDA 3VLWA 3MP1A 3MVXA 3PPPA 1DMBA 1SW1A 1AH5A 2G29A 2Q88A 2R6GE 2UVIA 2ZMBA 3VXCA 4QFNA 4RPNA 1DPPA 4YZZA 1SI0A 4HTGA 4YU0A 2FA7A 1XS5A 3VLVA 5JEIA 2Z23A 2I3WA 3TELA 2FYIA 3M3FA 1N84A 4U2RA 3FJ7A 2AL4A 1PDAA 1D3KA 3PPOA 1XVXA 3R26A 3H6TA 4F22A 4F3PA 5I56A 3TYHA 3V5AA 1MXUA 4F19A 4BDRA 1B7HA 3KSXA 2XXVA 1OLCA 4OMBA 4NF8B 3RGYA 3VVFA 3SETA 5ITOA 3SKPA 3MAMA 3UA8A 4IY6A 1MQJA 1R9LA 3I5OA 3L6GA 3FXRA 4ZEKA 4KHZE 2QSXA 5I84A 2H99A 3H7MA 5I58A 1EH3A 1PC3A 5CBSA 2GFEA 1IZ1A 1NH8A 4HW8A 2F5XA 5AA4A 3WAEA 3TTMA 1NKXA 3PUZE 3C34A 1QKAA 3KSJA 3G3FA 3ILTB 3O28A 1P1NA 4YB5A 2D5WA 5JTYB 3N94A 4WEDA 4E0WA 3FGSA 3K00A 5H8QB 1M5FA 3QYTA 3VFJA 4JXIA 1SW4A 2HZLA 3T9HB 5I2KA 4KYDA 1AOVA 2VD2A 3GBAA 5DEXA 1MY0A 4R73A 4H5GA 4YAHX 4XTCQ 1FW0A 2HFBA 3TTKA 1IQ7A 2R71A 3QUFA 3G3IA 1IXGA 2NWJA 3G3KA 2VD3A 2AIXA 2RF1A 4IO7A 4BLAA 4ECFA 2AYSA 3TODA 3KG2A 3O2AA 4G8HA 3EHSA 1LFGA 2Y7WA 2YJPA 2DWJA 4GRKA 5L9MA 3W9WA 3IB0A 4EF1A 1Y1ZA 3O6HA 1UIUA 2KLFA 2P1SA 1PBQA 2XXRA 4NE4A 1JEVA 3T66A 4OESA 2O69A 4G4PA 3BKIB 1Q35A 2XX9A 3MBPA 1WDNA 3USDA 1M5BA 2P2AA 4FEBA 2ABHA 3JYRA 1A40A 1LB8A 3VLUA 2QS2A 1UTBB 1MH3A 4KFQA 1PB7A 2GRVA 3UIFA 4F39A 2XXYA 2F97A 1ZJLA 4DXCA 1EZ9A 4RY1A 2H4IA 2XD2A 4EXLA 3G3HA 4BDLA 3M3KA 4DCXA 3PD8A 4ELRA 1IIWA 3IL1B 1FQCA 2I4BA 2QJEA 4MBPA 1B46A 2V3QA 1URGA 1JW4A 2O68A 3HN0A 1MY3A 1JW5A 1MH4A 4R2BA 3RN8A 4C1TA 5HPQA 2Z22A 3RQTA 1BLFA 3OO7A 4PP0A 1LFHA 4XXUA 3T9VA 3CFLA 4EF2A 5H8QA 3KJ7A 2G93A 1EZPA 1AIVA 4FAJA 1LAFE 4GXSB 4NMYA 3QXMA 3TZAA 2XXUA 3H4ZA 1IEJA 3G7WA 5DVIA 4WEPA 3BFUA 5B70A 3MPLA 4WXJA 2Y84A 5EHMA 2I58A 5BUUA 1LSTA 2QMWA 3EHUA 1TT1A 4N13A 4GD5A 3CRBA 4TLLB 3K0VA 2O51A 3SERA 2AL5A 2I0BA 5H8FA 4IO2A 3A09A 5H8NB 4RYAA 4RPOA 1SDXA 5H8HB 2O7IA 2XXQA 4X1DA 1FTJA 2H5YA 2V84A 1XHYA 4LZ8A 4QSDA 1SBPA 1YPNA 1D9VA 4PFWA 3Q26A 1EZOA 1ZTYA 4JB7A 2PT2A 3CFZA 5JK4A 4IB2A 3LSLA 2X7QA 5FHNA 4LUBA 4E0XA 4PFYA 2Y7IA 3RT8A 2H9BA 3OO9A 3T93B 1NL5A 3E4RA 4R6YA 5EHSA 4DCYA 3B6QA 3TUSA 3EQ1A 1JQFA 2O1MA 1MXYA 4TQUQ 1UTBA 3KOSA 3PMVA 4H65A 1NNFA 1ZIUA 1Y3NA 1POY1 2D21A 1QKBA 1QUKA 4QFKA 3K02A 2Y7KA 4BDNA 4Q5TA 1VE4A 4N07A 5KDTB 3D4GA 4QSEA 4ZEDA 3TTRA 2X26A 1R6ZA 3C32A 2O6AA 4H6DA 1ZMGA 3H3GA 2NXOA 4FJPA 4U23A 3VDFA 3K01A 1P1QA 3VE1B 1B2HA 5IAIA 1JVXA 3MQ9A 4RNSA 4GVOA 3QUJA 1DOTA 3IO6A 2Q89A 4LZ7A 1USYE 4X48A 1B32A 1DTZA 2F34A 4KYSA 2F35A 4OFOA 3O9PA 4GQOA 4GL0A 3FV1A 3V83A 4KPTA 3TCHA 3K6UA 1SI1A 2OK2A 1M5DA 4IO3A 4EXKA 2IA4A 1JEUA 2F6GA 2ZNSA 1O64A 1A55A 2DVCA 4NWCA 4DZ1A 1SVXB 2F78A 1USYH 3TQLA 2B3BA 2OLBA 3VVEA 3K1PA 1Y1MA 4ZZAA 2GHBA 3LSFB 2V3UA 4P11A 1FQAA 3VV5A 4KR5A 1NFTA 1NMUA 2F7BA 3U1OA 4HCWA 2PT1A 2VP1A 4F3SA 3ZKLA 3ZSFA 1B3LA 3PMWA 1R1NA 4P0GA 1LLSA 2B3FA 5DVJA 3KN7A 4GLIA 5I57B 5AA1A 4GOTA 1B6HA 1SW2A 1SYIA 3F11A 4YMBA 5B7DA 3Q29A 4LZ5A 4YICA 3RTWB 4R9GA 1B05A 2UVHA 3IJOB 1I6AA 5CMMA 2DYXA 3E9XA 4JWOA 3C4MA 4O3CA 1ZBMA 1N7WA 1FTMA 3PGFA 3DM0A 1A8EA 5IKBA 2DQVA 1VR5A 4ZE8A 2HCAA 3KFMA 1FQEA 4H8JA 2QMXA 1MQGA 5DYHA 1AL3A 1B3HA 4IGRA 2Z8DA 2DE4A 2XXWA 5TP9B 1UTHA 5A5XA 2I49A 1TFDA 2DWIA 1TXFA 4NF6B 3OMBA 1FTKA 4YB6A 1BP5A 1VSOA 1S50A 3EN3A 1B7UA 3PU5A 1FQBA 4LVQA 4NF4B 4ELPA 1OLAA 2H25A 2DWAA 3CG3A 2DE2A 4PFUA 4EQ9A 2ZNTA 4EDPA 3CR9A 1QW0A 4ESXA 4Z0IA 1MQIA 3MW0A 4F29A 4THIA 3PV0E 3GLBA 3O66A 3MP8A 2F7CA 3RY3A 1FTOA 4NWDA 3QIMA 3IAZA 3MZ9A 5K2YA 4G68B 1P1UA 2A5TA 2ONKE 2OZZA 3H6UA 4H67A 3T9UA 3FVOA 1B3FA 4OWDA 2DS9A 4ONYA 4F1YA 2ONRA 5AE4A 3ILUB 3K1NA 4R6KA 3P7IA 1GTKA 2PBWA 1URSA 1IITA 1Y4CA 3IO4A 3QK6A 4U4XA 1MQDA 3HSTA 5HM4B 4IY5A 4MLQA 4MFIA 4FORA 2UYFA 2QL3A 4LP2B 1F9BA 3BBRA 3TKDA 1O63A 4Q8RA 3DP4A 2HZKA 4F1VA 5DVFA 1NNTA 4ND9A 2VHAA 4DIGA 2XXTA 1Y4TA 1XT8A 4GXAA 4AB5A 5CMCA 4QF9A 3MZBA 1H45A 3GXAA 1XOCA 2RC8A 3ECRA 3H06B 3PPQA 3M8UA 1FTLA 2I0CA 3SEYA 1HSEA 4I62A 4ZS9A 1HSJA 4LONB 4N6PA 3OELA 2E0SA 1Y9UA 5KCJB 5I59B 4NF8A 4JWXA 1FQDA 1DSNA 4YKJA 3PPRA 4OYVA 4ZE9A 2XX8A 1CB6A 4KYEA 3RPWA 3FZVA 4FE8A 3TTNA 1UQWA 3FV2A 3VVDA 1Z7NE 3LC8A 4OXVA 3TCFA 3CVGA 2XXHA 4U22A 1B5JA 1Y3PA 3S9MC 1A7LA 3B6TA 3PUVE 1J1NA 1ZKBA 4ISUA 2FNCA 4G8NA 5LOMA 3CSGA 1VFDA 4YB7A 3W15C 3HPIA 4R9FA 3VXBA 1B40A 4ELQA 5JTYA 4O3BA 2PVUA 3CG1A 1I69A 1N04A 4F18A 3PUWE 3B6WA 4JSDA 3O97A 3KOTA 3N5LA 3PD9A 3IOWA 2OBGA 2XX7A 3SEVA 4QFLA 3FATA 4JWYA 3S4UA 1LCFA 1OQGA 5TPAB 3KZGA 3LUYA 4H8IA 3FIRA 4FECA 1P1OA 2D3IA 5F1QA 1IXCA 4NTLA 5DTBA 1IXHA 2NUVA 2DSFA 4OEVA 4RA1A 2GH9A 2V25A 3Q28A 3UGWA 2HQ0A 5I2NB 4KQPA 3S9EA 2RCBA 1B51A 4YKIA 4C1UA 4IGTA 2UXAA 4DXBA 4R75A 1GV8A 2DXRA 4XKQA 1GR2A 4XIGQ 1D4NA 2PMSA 3U93A 2F36A 3IK6B 2DWHA 5AA2B 3DP6A 3H6WA 3W9VA 3MP6A 1I6BA 4Q0CA 2H98A 4KI0E 2W7YA 1GVCA 1JW1A 3FVGA 2XHDA 5DT6A 1M5CA 5L8DA 2O1LA 1US4A 1H43A 3HV1A 3MZ1A 3N26A 2UVJA 2XXIA 2ZYOA 4OQOA 4DE8A 2UVGA 4JDFA 4H5FA 3TFLA 1MXZA 4Q30B 1B58A 2Q2CA 3JZJA 4O3AA 2IEEA 3R7XA 4MLVA 4LA9A 3PUYE 2R9JA 2UYEA 3AXFA 1SW5A 1ANFA 4U1OA 4JBZA 3S2VA 3PUXE 1MRPA 5AA3A 3T22A 3MVZA 3DELB 2YLNA 4QRZA 2DP8A 1LBBA 4OZ9A 4RXLA 2ESNA 2Y7PA 3LSWA 5CBRA 4POXA 3HHFA 3K6XA 4NF5B 1N3XA 3K4UA 3FXQA 3Q25A 1A99A 4OVJA 1L5TA 5F7VA 5HBCA 1DTGA 1BKAA 1B4HA 5AA4B 1MPDA 3ZS6A 3G3GA 2P0SA 5H8NA 1MS7A 3T9XB 3EF7A 3C33A 4G68C 5H8HA 4F1UA 1DPEA 3FASA 3A3CA 4L17A 2F6PA 3S9NC 2I3VA 4RJZA 5I2KB 1B4ZA 2E1SA 3OO6A 1XVYA 3O29A 3UK4A 5AA2D 2QPQA 2WKYA 3OSQA 3CI8A 4BDQA 1LAXA 4QFPA 3O6GA 1OIBA 1H3DA 2XXXA 3TEPA 2QS4A 2QS1A 3TQWA 1LBCA 2QS3A 1B1HA 5H8SA 4K3FA 1B5IA 3KN3A 4ZDMA 1BIYA 3V89B 4IO6A 1I6QA 1M5EA 5ISUA 2V93A 3OD7A 1YTVA 4IO5A 1MPCA 4X1BA 4U4SA 4R2FA 4XKPA 1FQFA 5KDTA 4C0RA 4DLDA 3T96B 2O84X 1HSLA 2ANJA 1A54A 1B3EA 1MY4A 3OEMA 4H0WA 3D4CA 4QSCA 3V8XB 3I6VA 1LAGE 2ONSA 4QFOA 4H1XA 3PMXA 4GL8A 4U21A 5BWJA 3RTFB 3N6UA 1MM6A 4LATA 1B9JA 4PFTA 3LSXA 3U92A 4I9DA 1WVJA 5ITPA 3L6HA 3IX1A 2CMOA 3TDJA 3CFXA 1MXXA 3OXNA 4NF5A 3GZGA 3K2DA 3RT6B 2A5SA 2X7PA 5CM6A 5CMBA 4NEDA 2DXYA 1BTJA 5ELVA 3EPEA 4F31B 1GGGA 5L9OA 2OWTA 2ZYKA 4I8CA 3KGCA 4QHQA 2B65A 3RNNA 4AQ4A 2Y7RA 5KZTA 3C35A 3OSRA 2CZLA 3OENA 3QSLA 4GFRA 4M1VA 4TLMB 2VGQA 2Z8EA 4TOZA 1S9TA 4F2OA 2HAUA 5EYFA 3HO7A 3U72A 1B52A 4ESWA 1NH7A 4ZEBA 3U8QA 3DP8A 1OMPA 4MF3A 4YKPA 3KN8A 3FVKA 1LB9A 5FTHA 5I57A 4RK2A 3IR1A 2NOOA 4JSOA 2XD3A 1Y3QA 2ZYNA 2Q9TA 3MPKA 4GWOA 3FXUA 1B3GA 3KJTA 1MY2A 4EUOA 5H8FB 2V3TA 1O7TA 1MQHA 2DOJA 3SEWA 1B0LA 1D9YA 1RYOA 4KD5A 1Y20A 4GIZA 4POWA 4G77A 1ELJA 2ZNUA 2LAOA 3K6VA 3K6WA 2BJJX 4ZZEA 3BFTA 4OTEA 3Q27A 5TP9A 1ATGA 1N7XA 4XKNA 1MXVA 2XXPA 4NF6A 1P99A 1ZLQA 1US5A 3FUZA 3CSBA 1VFEA 4UACA 1R9QA 4NF4A 1QUJA 2F7AA 3IOTA 3E3KA 2VOZA 4ZEFA 1LGBC 2ZYMA 3IJXB 1T0KA 1KWHA 3OO8A 4DDDA 4G2ZA 3K1MA 3JV9A 5J1DA 3MWBA 5K2XA 1TWYA 1SYHA 4PETA 3TPAA 5CRYA 2HEUA 4YKKA 1B7ZA 1WODA 2F8DA 3R6UA 3RLFE 4G68A 1QVSA 4BDMA 4R72A 1MY1A 1H44A 1PB8A 2YPNA 3SEXA 1JETA 1A8FA 1MDP1 4OERA 4U1ZA 1POTA 3ZKKA 1MM7A 2I48A 1UIVA 3WAFA 3PPNA 3GBBA 4Z7EA 2OWSA 4YMAA 3DLNA 3MC2A 2HXWA 1Q1KA 4PE5B 1S7YA 1XC1A 2RCAA 3S9LC 3B7DA 3U94A 2HAVA 3MVWA 4OEUA 1II5A 3FJMA 1QULA 3IOVA 1YCJA 4ZECA 4F3GA 2Q8JA 4IO4A 1OQHA 3FVNA 2O7UA 1IXIA 5M2VA 3I3VA 4HCYA 3IOUA 5ICQA 1AMFA 1FCKA 2Q2AA 2M8CA 5L9SA 2I6EA 3UN6A 3C31A 4P0IA 1N76A 5TU0A 4F2QA 4X9TA 2ALUA 3ODBA 3SESA 1JVYA 3SEUA 4KCCA 3THIA 2RC7A 4KCDA 5KCJA 5I59A 2DE3A 4OFJA 2PX1A 3FJGA 1B0HA 1RYXA 4OFLA 2REGA 1PEBA 1URDA 3A3UA 3MJNA 4BDOA 4M4GA 1MXWA 3H6VA 3RUMA 4DXUA 5FHMA 1MDQA 2THIA 3IORA 3O6IA 4OHNA 3HHGA 3LR1A 4R6HA 3SDFA 1MPBA 1PB9A 4F3BA 1EU8A 3UP9A 4G8MA 1SQYA 4FATA 5I56B 2RKMA 3UORA 1IUDA 4XKRA 1MG1A 4OENA 3OOAA 4GF8A 4LQ5A 2DVZA 1TFAA 3ONMA 3C9HA 1NNPA 1NNKA 1LAHE 1UTHB 5A5XB 2PYYA 1PBPA 4UA8A 2RINA 4EQBA 2Z8FA 3N6TA 3TMGA 4R74A 1N3WA 2REJA 5I58B 3KEIA 1OVTA 3FD3A 1ZU0A 4ZEIA 3TCGA 4ELOA 2NVUB 1JNFA 3QAXA 1CE2A 3E13X 3G3JA 2QRYA 5TPAA 3MVYA 4OETA 1QJMA 2GHAA 4HS7A 2OJTA 2OCUA 3H03A 4FIMA 3LBSA 1RKMA 5FHOA 1LCTA 3CIJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M3LA 1Z7ME 3TAJA 3BIHA 3IB2A 4WKMA 3OEKA 4EQ7A 5I2NA 3MUQA 3TTLA 2XWVA 2ZXTA 2A5TB 1LFIA 2CEXA 4I1DA 3HCQA 1OVBA 1G0IA 1YAEA 1NV2A 1N0TA 3C36A 5J16A 1QUIA 1B5HA 5EQAA 4LQ2A 2RC9A 1H76A 5FTIA 4MH5A 5CC2A 4PAKA 1SD3A 5DEXB 4PQJA 2I4CA 5CMKA 5IGAA 3EHTA 5CI5A 4H46A 5AA2A 1B1XA 5ICTA 1FPBA 4N15A 4AB6A 3KBRA 3IB1A 4RK9A 1P1WA 4FEDA 3VLWA 4MAGA 3MP1A 2XWIA 3MVXA 3PPPA 1DMBA 1SW1A 1AH5A 2G29A 2Q88A 2R6GE 2UVIA 2ZMBA 3VXCA 4QFNA 4RPNA 1DPPA 4P9KA 4YZZA 1SI0A 4AS5A 4HTGA 4YU0A 2FA7A 1XS5A 3VLVA 5JEIA 2Z23A 2I3WA 5ET8A 3TELA 2FYIA 3M3FA 1N84A 4U2RA 3FJ7A 2AL4A 5EQ7A 1PDAA 1D3KA 2WX9A 3PPOA 1XVXA 3R26A 3H6TA 4F22A 4F3PA 5I56A 3TYHA 3V5AA 1MXUA 4F19A 4BDRA 1B7HA 5IZ3A 3KSXA 2XXVA 1OLCA 4OMBA 4NF8B 3RGYA 3VVFA 3SETA 5ITOA 3SKPA 3MAMA 3UA8A 4IY6A 1MQJA 1R9LA 5T3JA 3I5OA 3L6GA 3FXRA 4ZEKA 4KHZE 2QSXA 5I84A 2H99A 4HE1A 3H7MA 5I58A 4QXDA 1EH3A 1PC3A 5CBSA 2GFEA 1IZ1A 1NH8A 4P1LA 4HW8A 2HHMA 2F5XA 5AA4A 1Q9DA 3WAEA 3TTMA 2KQZA 1NKXA 1YZ0A 3PUZE 3C34A 2Y5LA 1QKAA 3KSJA 3G3FA 3ILTB 3O28A 1P1NA 4YB5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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