3FJ7A

Crystal structure of l-phospholactate bound peb3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
DVNLYGPGGPHTALKDIANKYSEKTGVKVNVNFGPQATWFEKAKKDADILFGASDQSALAIASDFGKDFNVSKIKPLYFREAIILTQKGNPLKIKGLKDLANKKVRIVVPEGAGKSNTSGTGVWEDMIGRTQDIKTIQNFRNNIVAFVPNSGSARKLFAQDQADAWITWIDWSKSNPDIGTAVAIEKDLVVYRTFNVIAKEGASKETQDFIAYLSSKEAKEIFKKYGWREH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Specificity of Campylobacter jejuni adhesin PEB3 for phosphates and structural differences among its ligand complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Campylobacter jejuni
molecule keywords Major antigenic peptide PEB3
total genus 85
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fj7A02
3FXQA 3OENA 3OSRA 4NF6A 4LZ5A 2NUVA 3T9UA 4OVJA 1MY1A 1NFTA 1B7UA 3BBRA 2GHBA 1OLCA 5HBCA 1EZPA 3LR1A 4YKKA 1EZOA 2O69A 3S2VA 3T66A 5CC2A 2H98A 5CMBA 1CB6A 2Z8EA 4GL8A 1Z7ME 3EHUA 4OETA 3A3CA 3EQ1A 3C31A 3RTWB 3T96B 1MY3A 3T9HB 3SDFA 3PPPA 5CMMA 2OJTA 3C32A 1RYXA 1FQBA 2B3BA 3CFZA 1NNFA 4MBPA 3SERA 2ZNUA 3MC2A 5DTBA 4ELOA 3RTFB 5H8FA 4BDLA 2AL4A 1B6HA 4NF4B 1B52A 3K1NA 4HCYA 4WEDA 1JW5A 3VVDA 1FTLA 4ECFA 3M3LA 1FQDA 2REGA 3CG3A 4O3CA 2I0BA 4Z7EA 2ANJA 3DM0A 5LOMA 2OWTA 3D4CA 4YKIA 5H8NB 3TDJA 4U21A 4H8IA 4PFYA 2G29A 1B1XA 3T93B 4QSDA 1LBBA 3S4UA 3C4MA 2DXRA 4BDMA 1MRPA 2HFBA 4MLQA 2GRVA 4K3FA 1Z7NE 3UN6A 1US4A 1DMBA 2ALUA 3S9NC 4TQUQ 5B7DA 3EN3A 1WODA 2V3UA 3VE1B 4MFIA 1UIVA 3TPAA 1II5A 3TKDA 1ZTYA 3C36A 1SW5A 4U4XA 4UACA 4XIGQ 5CM6A 3DP4A 1I6BA 2QS4A 3U93A 2VHAA 1ZJLA 2FYIA 1MXUA 2F35A 4QFOA 1Y20A 1EU8A 3LSXA 1P1QA 1NMUA 2DWHA 2HZKA 4RNSA 4R6HA 2WKYA 4I9DA 3JYRA 2H9BA 4Q8RA 4OWDA 1QUJA 4F2QA 5ITOA 4NF4A 1MQDA 4NF8B 4EF1A 2YPNA 2ONSA 3C35A 1B0LA 3H6VA 4H6DA 2D21A 1FTOA 4H1XA 5AA4B 1B5JA 1B3EA 5CMKA 5ITPA 2DE2A 4KPTA 3GBBA 3PUWE 1PC3A 1MM7A 2REJA 5CMCA 1PB8A 3CR9A 2P1SA 2QMWA 1ZBMA 4U23A 2NOOA 3R26A 4YB6A 5TPAA 2HQ0A 3SESA 3OO9A 3KJ7A 1B4ZA 4ZE9A 1DPPA 2RCBA 5EYFA 3PPNA 3UK4A 1NNTA 3K6WA 4F31B 4HS7A 4EF2A 4RA1A 1LAHE 1LB9A 1T0KA 2OLBA 3VVFA 3G3KA 3TZAA 4YB7A 1SI1A 3H6WA 1LAXA 4PQJA 1QW0A 1NH8A 4NTLA 3G3GA 3P7IA 1H44A 1QVSA 3LUYA 5I59B 1N7WA 4IO2A 4NF8A 5I57B 1B51A 2H25A 4G68A 4AB5A 2CMOA 1YPNA 3ECRA 3ZSFA 2I3WA 1EH3A 2ZXTA 1IITA 2XXYA 1B3FA 4JXIA 1B3LA 4YZZA 3OOAA 4ZEFA 4F39A 2Y7WA 2O7UA 2XXRA 4R74A 3G3HA 2R6GE 5I56A 4IGTA 1BIYA 2XXHA 2O1LA 4I1DA 1ELJA 1D3KA 1NL5A 4GOTA 3OEMA 1MY4A 3QAXA 4KYEA 2Y7PA 3GZGA 2V3QA 1H45A 3TQLA 1JEVA 3RUMA 4QFPA 4QF9A 3TODA 1SYIA 1QULA 3OELA 3O66A 1MQIA 2I6EA 2RC8A 1MXVA 2ZYMA 5IKBA 2O1MA 3JZJA 2QS3A 1PBQA 2Q88A 1J1NA 2B65A 1FW0A 3H3GA 3VXBA 3KGCA 4IO5A 2DE4A 1MXZA 4FATA 1URDA 5HPQA 4EQ7A 2H5YA 3EHSA 4ESWA 2M8CA 2YJPA 2F7CA 2F5XA 5AA1A 2Y7KA 1Q1KA 3QXMA 4FE8A 3VFJA 2UVIA 2Y7RA 3RY3A 2F97A 3CVGA 2CZLA 4R6YA 3WAEA 1JNFA 3IR1A 4R2BA 3MVWA 2DWIA 3RPWA 1LBCA 3TMGA 1B46A 4WXJA 5I84A 5I2KA 4H5FA 4F1UA 3LC8A 4ZZEA 3CFLA 2R9JA 2P2AA 1NH7A 3KOTA 1N0TA 4NMYA 4MLVA 3SEVA 2R71A 4H0WA 4PETA 2XXTA 4IB2A 2I58A 1MQHA 4KQPA 3O97A 3TTKA 1PB9A 3O6GA 3TQWA 4U1ZA 3T9VA 4Q5TA 3LSFB 3O2AA 4DLDA 4H8JA 3CSBA 3QYTA 1MY0A 4G8MA 1D9VA 3RN8A 4C1UA 1MQJA 1FQCA 3HN0A 3QSLA 1LSTA 5H8FB 1FQAA 1NKXA 1EZ9A 2DYXA 2DWAA 5L9SA 1BTJA 1R9QA 2I48A 3MZBA 5B70A 1DPEA 4EQBA 3PPOA 2P0SA 4JDFA 3PV0E 3PD9A 1M5BA 1XOCA 5DYHA 5FHNA 3IB0A 3K1MA 4BDQA 2F7AA 3IAZA 1PDAA 5FHOA 3M3KA 1P99A 2I0CA 3CG1A 1R1NA 3O6IA 3VLWA 3VDFA 2A5SA 5KCJA 1YCJA 2B3FA 4G4PA 5M2VA 4FAJA 4KR5A 1ZLQA 1P1OA 4YICA 3IL1B 4H65A 4ZZAA 3FXRA 2I3VA 3IK6B 4ZEDA 3W9VA 2DVCA 4BDRA 3U1OA 1I6AA 3MWBA 1S50A 1YTVA 2NWJA 4N6PA 3PMWA 3K1PA 4RPOA 3H03A 1N3WA 4E0WA 1IXIA 3FD3A 1FQEA 4EDPA 2ABHA 2DP8A 3HV1A 3F11A 2PVUA 4JSDA 5CRYA 1LFIA 3MZ9A 1Y3PA 3H06B 2XXVA 5ELVA 4LP2B 1POTA 2RINA 5FHMA 3FJGA 5CBRA 2UXAA 4R73A 4LZ7A 1GTKA 4KFQA 1H3DA 5K2XA 2O6AA 3FASA 4KD5A 4XKRA 3V89B 4ZEKA 2OK2A 3V5AA 3FVKA 1JVXA 2V3TA 3V83A 4ESXA 3KJTA 3PGFA 1Q35A 2HZLA 4X1BA 2OWSA 5TPAB 3IO6A 1M5EA 4HW8A 4QRZA 2BJJX 1P1NA 2FNCA 2DS9A 2E1SA 3Q27A 4F18A 4OHNA 1VSOA 2X7QA 3PMVA 3ILUB 1WVJA 4FEBA 1Y1ZA 1MG1A 2ONKE 3N5LA 1ATGA 5AA2B 4R9GA 2Z22A 1P1UA 3OO8A 2Q9TA 3THIA 2UYFA 4DXUA 4LQ2A 3KFMA 4IO4A 1R9LA 4LVQA 1QUKA 2RKMA 1FTJA 4F1YA 1R6ZA 4GVOA 3H6TA 3HPIA 3LSWA 2A5TB 3FATA 3BKIB 1B9JA 3FVGA 4G68B 1B0HA 3KSJA 2VD3A 1QJMA 3N94A 3OO6A 5DT6A 3KN7A 1WDNA 3PPQA 3LSLA 3IJXB 2XXQA 4N07A 1B5HA 4DXCA 3WAFA 2IA4A 2UVGA 3TCGA 4F29A 1B4HA 2E0SA 4WEPA 4OERA 1MXWA 4UA8A 5TU0A 5L8DA 4OYVA 1FCKA 5I56B 1Y4CA 2X7PA 3O29A 2HXWA 1UIUA 4MH5A 4F3BA 1I6QA 1CE2A 3MPLA 3KBRA 2H99A 4U1OA 3BFUA 3K2DA 2IEEA 2F34A 4POXA 1B40A 4GL0A 3K6UA 2KLFA 3OO7A 2QSXA 3S9LC 4DIGA 4X9TA 1Y1MA 2I49A 3B6QA 4NE4A 4OQOA 4DCYA 4ISUA 1O63A 5AA2A 4G77A 1IXHA 3VVEA 4ONYA 1QKAA 2O84X 3L6HA 1ZKBA 4OFOA 1QUIA 4DXBA 2OBGA 3GLBA 3OSQA 5A5XA 2A5TA 4GWOA 1TFAA 4R6KA 2V25A 4TOZA 4FJPA 2XX7A 1TFDA 2PYYA 3CI8A 3G3JA 3GBAA 1GVCA 4R9FA 4EQ9A 1JQFA 1UTHA 2PX1A 1LCTA 3K01A 3K00A 3MQ9A 4YAHX 4M1VA 2QS2A 3FV2A 2F6GA 2PT2A 4Z0IA 1DTZA 1LFGA 1XVXA 2UVHA 1OVBA 1YAEA 5I2KB 1A40A 2ZNSA 2QS1A 3KZGA 3UGWA 4OFLA 2Y7IA 1KWHA 3HO7A 4BDOA 1HSLA 3CSGA 3CRBA 4LZ8A 5H8SA 3E3KA 3U94A 2VOZA 3E9XA 1SDXA 3TUSA 3TFLA 3TCFA 4E0XA 2F36A 5CI5A 2Z8DA 1IUDA 1XT8A 3I5OA 2D5WA 3TTNA 3Q26A 2YLNA 4C1TA 3DP8A 3IOVA 4GXSB 3LBSA 5J1DA 3MP6A 3SEUA 4DE8A 2V84A 4M4GA 1USYH 3MBPA 3FIRA 4POWA 5H8HB 4H67A 1S7YA 3A09A 4IO7A 4YMAA 1VFDA 3DELB 2PT1A 4JWYA 4NWCA 2I4BA 2RCAA 2ESNA 2F78A 1OQGA 1LAFE 1AIVA 4QFKA 3JV9A 5KDTA 3HHGA 4U4SA 5EHSA 1IXCA 5KCJB 4JBZA 4THIA 1FTMA 3VLUA 1A8FA 4X48A 3Q25A 1B1HA 3IB1A 5EHMA 3FJ7A 3HSTA 3EHTA 4F1VA 2QJEA 2HAVA 1JW4A 1JEUA 3D4GA 3TYHA 1O7TA 2O7IA 3G3FA 1M5DA 3TTRA 3TTLA 1GGGA 1Y3QA 3BFTA 3RGYA 2XHDA 5I2NB 3V8XB 4P11A 1PBPA 3IOUA 1MPDA 3FV1A 1M5CA 1B5IA 4ZECA 2XXPA 3K6XA 4OTEA 1LGBC 3HCQA 1N7XA 3OD7A 4ELQA 3MAMA 4HTGA 4ZE8A 1BLFA 4ELRA 2DWJA 1SQYA 3N26A 5H8HA 4G2ZA 4IO3A 5BWJA 4GQOA 1FQFA 1MDP1 5ISUA 4GIZA 3SEXA 1RKMA 3SKPA 4QSEA 3E13X 4PE5B 3K6VA 3GXAA 2DXYA 1MH4A 2HEUA 3HHFA 1O64A 4BDNA 4R2FA 1MY2A 5AE4A 2AIXA 1MXYA 3A3UA 3O28A 3QUFA 1B58A 2XXWA 3B6TA 4GD5A 4RXLA 1MH3A 2Y84A 3PD8A 3FUZA 1FTKA 1XHYA 2O51A 4YMBA 4QFNA 3MVYA 1AH5A 2UYEA 5DEXB 4FECA 5I2NA 1AMFA 4OEUA 4L17A 3E4RA 1LCFA 4I8CA 3IOTA 1B3HA 5TP9B 3W9WA 4F3PA 4RJZA 1NNPA 3I3VA 1XVYA 1IEJA 3Q29A 1LAGE 2FA7A 4G8NA 4GLIA 2OZZA 3RLFE 1HSJA 4X1DA 5I58A 3K02A 4KI0E 4LONB 4XTCQ 1LB8A 3TTMA 1DTGA 5JTYA 4PFTA 4Q30B 1JETA 2XX9A 1LFHA 3PMXA 3T22A 3O6HA 1DSNA 2VP1A 3C9HA 4DDDA 2NVUB 2H4IA 4Q0CA 3OEKA 4QSCA 3PPRA 4PFUA 2DVZA 3ZKLA 4F2OA 3PUVE 4NEDA 3H4ZA 4PFWA 5L9MA 3IX1A 4OEVA 3S9EA 1ZU0A 1LLSA 4KYDA 2AYSA 2AL5A 4OZ9A 4RY1A 3W15C 5HM4B 3KOSA 1URGA 3O9PA 2ONRA 4NF5B 2UVJA 5F1QA 1SI0A 4ZDMA 5DEXA 2QRYA 4XKQA 1JW1A 3U8QA 5AA3A 2DSFA 1SD3A 4JSOA 1A7LA 2XX8A 2Q2AA 4ND9A 1B7ZA 2X26A 5TP9A 4OESA 4C0RA 3TEPA 2XXIA 1A55A 2PBWA 3TAJA 2ZYNA 1I69A 3SEWA 3ODBA 1BP5A 1US5A 3QIMA 4XXUA 4AB6A 2GFEA 3FGSA 1B3GA 2DOJA 4XKNA 2XD2A 5A5XB 2W7YA 1RYOA 1P1WA 1N84A 1H43A 2XXUA 2NXOA 3C33A 3MVZA 3DP6A 1GR2A 4TLLB 3UIFA 5IAIA 3I6VA 3S9MC 2I4CA 1TT1A 5BUUA 2PMSA 5ICQA 3IJOB 1USYE 1UTHB 3K4UA 3MZ1A 1B32A 2VD2A 5H8QB 2QMXA 1IQ7A 5CBSA 3OXNA 3KN3A 4YU0A 5H8NA 3TCHA 3M8UA 1A99A 4ZS9A 1B2HA 2LAOA 3UORA 3UP9A 1D4NA 2GHAA 4NF5A 4OENA 3G7WA 4NWDA 3VXCA 1DOTA 4G68C 4OFJA 1VE4A 2ZMBA 4MF3A 3FZVA 3C34A 1AL3A 2Q2CA 1NNKA 4G8HA 1IIWA 3FXUA 3IOWA 3KN8A 4FIMA 3SEYA 1IXGA 2V93A 4ZEIA 4GF8A 4QFLA 3USDA 1SW2A 2QPQA 4QHQA 1S9TA 1VR5A 4FEDA 3MVXA 4IY6A 2VGQA 1MS7A 2THIA 1XS5A 2F8DA 1AOVA 4EUOA 4KCCA 3RT6B 4PP0A 3RT8A 3MP1A 2XXXA 4YB5A 3AXFA 4YKPA 1B05A 1A8EA 5H8QA 4P0IA 3H6UA 3CFXA 4O3BA 1GV8A 5AA4A 3VV5A 4GXAA 2RF1A 2F6PA 5KDTB 4DCXA 1N76A 1M5FA 3KEIA 4WKMA 4RK2A 1TXFA 4RK9A 2XD3A 4JWOA 1L5TA 2ZNTA 3FVOA 1Y3NA 1URSA 1A54A 3IORA 4KYSA 3T9XB 3B7DA 1MPBA 1IZ1A 4F19A 1Y9UA 4EXLA 1JVYA 3PU5A 4AQ4A 2Q8JA 4ELPA 3K0VA 4RYAA 3N6TA 1VFEA 1OMPA 4TLMB 1UQWA 1UTBB 3MJNA 4DZ1A 4F3GA 3MPKA 4F22A 2QL3A 2DQVA 1OVTA 1TWYA 2O68A 3H7MA 4BLAA 5L9OA 3PUZE 1OQHA 2GH9A 5DVJA 2Q89A 5KZTA 1SBPA 4LA9A 4OMBA 3B6WA 3VLVA 5I59A 1ZMGA 1F9BA 3N6UA 4I62A 1H76A 4R75A 4LATA 5I57A 1ANFA 3PUYE 1SW1A 3ZS6A 2OCUA 4EXKA 2ZYOA 4RPNA 1BKAA 5F7VA 3FVNA 5DVIA 4H5GA 5AA2D 4YKJA 1OLAA 3RQTA 4N13A 3DLNA 5JK4A 1D9YA 3IB2A 1PEBA 3L6GA 3MW0A 2F7BA 3QK6A 1MPCA 3R7XA 4KCDA 3G3IA 3U72A 3IO4A 4HCWA 4OXVA 5JEIA 4NF6B 3QUJA 2Z23A 3RNNA 4IGRA 2HCAA 1MQGA 3KSXA 1XC1A 4ZEBA 4IY5A 1MXXA 3FJMA 3M3FA 4XKPA 3OMBA 4U2RA 1UTBA 1N04A 4P0GA 4LUBA 3EPEA 3MP8A 4IO6A 3SETA 5FTIA 3TELA 1MM6A 3MUQA 1B7HA 1QKBA 3UA8A 1OIBA 1HSEA 3KG2A 5FTHA 5I58B 2RC9A 5JTYB 1SYHA 3ILTB 2ZYKA 2Z8FA 3EF7A 4GRKA 1N3XA 1ZIUA 4F3SA 3PUXE 3U92A 4R72A 2DE3A 4U22A 1SVXB 2D3IA 1Y4TA 4GFRA 1SW4A 1POY1 4KHZE 2G93A 3CIJA 3ZKKA 3R6UA 4LQ5A 2RC7A 4JWXA 5DVFA 5ICTA 1PB7A 4JB7A 4O3AA 3Q28A 2HAUA 5K2YA 4FORA 3ONMA 1MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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